Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
AES-1R,ASMDM+
AG1,ciproflaxin
D+7bld
DK2
E01
LB
LB,log
LB,untreated
PA1201
PA14
PA14,0.25xMIC G3KL
PA14,0.25xMIC T7
PA14,0.25xMIC polymyxin-B
PA14,LB
PA14,LB,log
PA14,WT
PA14,ciproflaxin
PA14,cmrA+
PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,late stat,untreated
PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,untreated
PA212
PA2596
PA558
PA580
PAK,LB
PAK,WT
PAK,WT,LB
PAK,pilR
PAK,pmrB6,LB
PAO1
PAO1,0.56mg/mL farnesol
PAO1,ABTGC
PAO1,DDS
PAO1,GUN,LB,glucose
PAO1,HapZ,early stat
PAO1,LB
PAO1,LB,glucose
PAO1,LB,untreated
PAO1,M9-CA,early stat
PAO1,M9-CA,log
PAO1,RsmN+
PAO1,SagS,early stat
PAO1,WT
PAO1,WT,BHI
PAO1,WT,LB
PAO1,WT,MOPS acetate
PAO1,WT,MOPS glycerol
PAO1,early stat
PAO1,ersA,BHI
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log
PAO1,liquid culture
PAO1,mexZ,LB
PAO1,oxylipin-
PAO1,pBAD-yhjH
PAO1,pUCP18::msr(E)
PAO1,qslA,M9-CA,early stat
PAO1,qslA,M9-CA,log
PAO1,qteE,M9-CA,early stat
PAO1,qteE,M9-CA,log
PAO1,untreated
PAO1,wspFpelApslBCD,LB
PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated
Y31,LB
Y71,LB
Y82,LB
Y89,LB
ciproflaxin
liquid culture
m pheno
mexT
nirS
pHerdB20T-gp68
untreated
CRN63349 (virS_1)
-0.54 -0.51 0.44 -0.63 0.87 0.07 0.51 -0.89 -1.06 -0.59 -0.61 -0.59 -0.69 -1.17 -0.35 -0.64 -0.04 -0.19 -1.08 0.19 -0.71 -0.5 -0.03 -2.12 1.4 1.75 -1.02 -0.07 -0.6 -1.05 -0.61 -0.06 0.59 -0.55 0.6 -0.32 -2.53 -0.49 -1.13 -0.68 -0.07 -0.06 -1.64 -2.54 -0.01 1.0 -0.49 -0.08 -0.26 -2.36 1.73 0.24 0.13 -0.27 -0.37 -2.75 0.4 -1.77 0.2 -0.15 0.28 0.06 -1.27 -2.25 -2.5 1.18 1.83 1.03 1.02 1.14 -0.94 -0.09 -0.22 0.16 1.03 -1.41
CRN66379 (yfiH_1)
0.85 -0.54 -0.01 0.37 0.6 -0.41 -1.41 -2.41 -1.07 -0.06 0.18 0.38 0.31 -2.12 -1.76 1.15 -0.34 -0.06 0.2 0.9 0.22 -0.04 -0.53 -1.4 1.21 1.23 -0.19 -0.9 -0.69 -1.27 0.03 -0.17 1.5 0.26 -0.41 -2.63 -3.38 -0.41 -3.96 -4.33 0.36 1.31 -1.05 -3.44 -1.0 -0.15 -0.42 -0.35 0.04 -3.55 0.11 0.42 1.14 0.28 -0.22 -4.45 1.1 -2.38 0.15 1.08 -0.09 1.22 -2.01 -3.1 -2.7 0.91 1.09 0.6 0.86 0.44 -2.17 -0.39 -0.01 -0.7 0.81 -2.97
CRN70466 (bmrA)
1.12 -0.45 -0.27 0.25 0.98 -0.13 -0.6 -1.43 -1.02 0.66 0.71 0.82 0.86 0.09 0.43 0.79 -0.43 0.52 0.79 0.99 0.82 0.48 -0.5 -0.62 0.73 0.74 0.16 -0.51 -0.85 -0.65 0.08 -0.06 -0.11 -0.35 -1.21 -1.22 0.04 -0.6 -1.18 -1.65 -0.61 -0.55 -0.14 0.08 -0.33 -0.41 -0.25 -1.11 -0.36 0.21 -0.33 -1.04 -0.62 -0.29 -0.39 -2.67 0.48 -1.03 -0.42 -0.8 -0.43 -0.59 -0.91 -1.67 -1.24 1.17 1.23 0.91 0.63 -0.17 -0.61 -0.39 0.47 -0.67 0.63 -1.38
-0.76 -0.98 -1.6 -1.47 0.75 -1.38 -2.29 -0.09 -1.17 0.17 0.11 0.02 -0.04 -1.94 -1.22 -0.79 -0.2 1.0 -1.01 -1.97 -0.25 -0.4 -0.52 -1.01 0.65 1.26 0.31 0.13 -1.51 -1.17 0.06 -0.0 -0.31 -0.9 -1.33 -3.0 -0.76 -0.35 -1.91 -3.24 -0.69 2.28 -0.64 -0.61 0.48 -0.52 0.29 -1.3 -1.09 -0.8 -0.39 -0.34 1.81 -0.8 0.51 -6.85 -0.18 -2.0 -0.74 2.06 -0.94 1.94 -1.69 -3.43 -2.97 -0.33 2.1 0.69 0.93 0.96 -2.94 -1.79 1.08 -0.02 1.12 -1.83
CRN75164 (phnR_1)
0.94 -0.54 0.27 -0.2 1.5 1.0 -0.03 -0.01 -0.34 -0.05 -0.02 0.13 0.01 -0.3 0.05 0.1 -0.13 0.25 -0.34 0.61 -0.03 0.05 -0.69 -0.73 0.8 0.89 0.13 -0.24 -0.44 -0.99 0.18 -0.2 0.87 0.13 -0.22 -0.58 -2.26 -0.72 -0.85 -0.9 0.21 -0.46 -1.4 -2.28 -1.01 0.49 -0.31 0.55 0.48 -1.96 1.13 0.14 -0.48 0.17 -0.32 -1.24 0.67 -1.14 -0.24 -0.56 -0.17 -0.55 -1.07 -1.1 -1.59 -0.05 0.58 0.03 0.24 0.99 -0.18 -0.09 0.24 0.09 0.53 -0.42
0.58 0.56 0.28 0.46 0.75 0.45 0.14 -0.86 -0.72 -0.12 -0.88 -0.66 -0.59 -0.85 -0.63 0.1 0.32 -1.35 0.33 1.14 0.52 -0.48 0.11 - 1.71 2.15 0.07 -0.25 -0.5 -0.18 0.65 0.38 0.64 -0.07 0.86 0.11 -1.83 -1.12 -0.94 -0.48 -0.67 -2.07 -1.28 -1.67 -0.22 -0.99 -0.36 0.58 0.82 -1.84 0.1 -0.9 -1.96 0.11 -0.24 -5.83 0.83 -1.07 -0.85 -1.56 -0.9 -1.68 -0.76 -1.79 -1.21 0.8 0.93 0.74 0.36 0.52 -1.09 -0.45 -1.12 -0.33 1.31 -0.07
0.08 -0.11 -0.9 0.1 0.05 0.07 -0.41 -0.77 -1.44 -0.1 0.21 0.24 0.15 -0.76 -0.32 0.25 -1.58 -0.38 -0.49 0.62 0.1 -0.29 -0.39 -0.64 1.42 1.72 -0.27 -0.44 -1.28 0.31 -0.21 -0.13 1.59 -0.45 -0.7 -1.64 -1.97 -0.36 -1.54 -1.96 0.52 0.67 -0.72 -1.86 -0.75 0.24 -1.91 0.63 0.66 -2.03 0.34 0.72 0.84 0.14 -0.97 -6.82 0.7 -2.46 0.3 0.52 0.18 0.68 -2.17 -3.58 -3.3 0.36 0.63 0.44 0.36 1.36 -1.31 -0.35 -0.36 1.08 0.93 -1.24
CRN98769 (nsrR)
0.41 -0.07 1.32 -1.0 1.72 -0.58 -0.91 -2.91 -0.99 -0.26 -0.06 -0.04 -0.16 -1.11 -1.74 1.07 -0.29 -0.61 -1.0 1.42 -1.08 -0.1 -1.35 1.8 0.85 1.37 -0.74 -1.03 -0.66 -1.52 -0.51 0.24 0.91 0.32 0.96 -2.33 -0.78 -0.96 -2.86 -2.21 -0.85 -1.62 -0.66 -1.12 0.33 0.29 -0.97 -0.16 0.02 -0.91 0.33 -1.15 -1.75 0.5 -0.97 -1.2 1.1 -0.31 -1.04 -1.93 -1.35 -1.75 -0.44 -0.06 -0.64 0.19 1.0 0.58 1.1 1.87 -1.62 -0.91 -0.65 0.84 0.82 -3.08
-0.39 -0.32 0.14 0.79 0.84 0.22 -0.3 -0.05 0.81 -0.22 0.33 0.09 -0.26 -0.23 -1.22 -0.65 2.21 -2.66 -0.38 -1.54 -0.22 -0.06 0.9 -0.3 0.0 0.26 -1.27 -0.04 -0.63 0.36 -0.95 0.74 1.24 -0.33 0.53 0.74 0.62 -0.87 0.17 0.02 -0.42 -3.22 -0.1 0.4 0.42 -0.39 -2.24 0.56 1.1 0.87 -0.16 -1.2 -1.61 0.05 -2.01 -3.08 0.54 -0.04 -0.46 -2.23 -0.68 -2.02 0.28 -0.45 -0.43 -1.83 -1.48 -0.79 -1.56 0.44 -0.1 -0.76 -2.6 0.37 1.67 -0.52
0.11 -0.82 -0.51 -0.02 1.53 0.14 -0.3 -1.23 -0.24 -0.08 0.18 0.27 0.18 -0.51 -0.76 0.9 0.32 -0.19 -0.43 -0.09 -0.2 -0.04 -1.68 -0.81 -0.01 -0.09 -0.63 0.32 -0.73 0.04 -0.61 -0.28 -0.32 -0.08 -0.96 -0.16 -1.26 -0.22 -0.66 -0.29 1.29 0.36 -0.87 -1.6 -0.76 0.49 -1.45 0.33 0.23 -1.34 0.74 0.76 0.58 0.66 -1.5 -3.67 0.7 -0.98 1.11 0.7 1.08 0.76 -1.18 -1.87 -1.62 0.72 0.11 0.35 0.27 -0.35 -0.39 -0.13 -0.36 -0.1 1.26 -1.29
-0.19 -0.83 0.06 0.6 1.39 -0.28 -0.98 -2.33 -0.09 -0.09 0.02 -0.07 -0.06 -1.63 -1.5 1.14 0.87 -0.33 0.16 1.63 0.43 -0.33 -1.43 -1.67 1.2 1.22 -1.47 0.38 -0.76 0.4 -0.96 -0.27 0.27 0.21 -0.4 -1.24 -3.52 -0.7 -1.7 -1.98 0.71 0.32 0.02 -3.56 -0.69 -0.91 -2.83 0.97 0.96 -3.3 -0.75 0.24 0.21 0.75 -2.12 -5.65 1.03 -2.2 0.64 0.21 0.28 0.37 -2.21 -3.31 -3.32 0.61 0.36 0.71 0.26 -0.3 -0.39 -0.62 -0.61 -0.2 2.18 -2.25
0.02 -1.04 -0.46 0.54 0.99 -0.41 -0.93 -0.7 1.08 -0.19 0.33 0.33 0.19 -0.22 -0.67 0.32 1.28 -0.89 0.42 0.34 0.96 0.2 0.05 -0.38 0.91 0.23 -1.22 0.84 -0.9 0.88 -1.02 0.12 -0.1 -0.07 -0.51 0.67 -0.58 -1.2 0.71 0.91 -1.26 -2.43 1.23 -0.25 0.08 0.07 -0.74 0.27 0.51 -0.41 0.38 -1.82 -2.76 -0.17 -1.17 -1.46 0.15 0.46 -1.26 -2.45 -1.46 -2.29 -0.28 -0.86 -0.06 -0.59 0.39 -0.58 -0.0 0.34 0.22 -0.73 -0.87 0.26 1.0 -0.19
CRO09039 (rnfB)
0.84 -0.22 -0.65 -0.7 1.49 0.26 -0.37 -0.38 -0.86 0.53 0.6 0.65 0.6 0.15 1.36 0.9 0.26 0.94 -0.1 0.26 0.25 0.23 -1.41 -1.45 1.28 1.22 0.45 -0.66 -0.08 -0.33 0.76 -0.49 0.86 -0.38 -1.13 -2.72 -2.58 -0.91 -1.21 -1.01 -0.74 -0.28 -0.14 -2.8 -1.5 -1.19 -1.21 -0.38 -0.33 -2.41 -0.99 -0.89 -0.4 0.09 -0.92 -3.91 1.11 -2.39 -1.24 -0.7 -1.33 -0.32 -1.9 -3.06 -2.49 0.81 1.39 0.87 0.95 0.19 -0.38 -0.44 0.75 -0.31 1.19 -0.49
-0.01 0.41 0.56 0.87 1.03 -0.61 -0.15 -1.1 -1.22 0.23 0.34 0.43 0.52 -0.14 0.22 0.51 -0.58 -0.52 0.88 1.23 0.78 0.2 -0.71 -0.76 1.93 2.21 -0.29 -0.34 -0.58 -0.63 0.2 0.05 0.71 -0.84 -0.37 -1.54 -1.41 -0.9 -1.88 -1.97 -1.7 -2.41 -1.6 -1.51 -1.04 -0.47 -2.32 0.11 0.41 -1.31 0.19 -2.15 -2.78 -0.34 -2.13 -6.35 0.14 -2.0 -2.02 -2.27 -2.21 -2.31 -1.76 -2.86 -2.2 0.88 1.59 1.09 1.39 0.48 -1.28 -0.03 -0.23 0.35 1.86 -1.64
CRO12894 (truD)
0.89 -0.18 0.38 -0.52 0.23 -0.27 -0.77 -1.44 -0.79 0.37 0.49 0.54 0.66 -0.81 -0.49 1.15 0.37 0.75 -0.22 1.21 -0.13 0.35 -0.85 -0.35 0.54 0.47 0.36 -0.26 -0.29 -0.72 0.48 -0.31 0.55 0.14 -1.2 -1.83 -3.31 -0.38 -1.57 -1.42 -0.18 0.23 -0.99 -3.26 -0.7 0.05 0.5 0.15 -0.15 -2.94 0.73 -0.2 -0.13 0.6 0.74 -2.48 0.81 -2.21 -0.63 -0.11 -0.53 0.02 -1.53 -2.29 -2.59 0.84 1.18 0.8 1.11 0.08 -0.4 0.09 0.63 -0.91 0.56 -1.56
CRO14235 (leuE_1)
0.43 -0.44 0.76 -0.24 1.74 0.1 -0.72 -1.5 -1.3 0.07 0.07 0.21 0.14 -0.35 -0.54 0.42 0.75 0.61 -0.52 -0.18 -0.25 0.07 -0.99 -0.4 -0.17 0.0 -0.22 -0.02 -0.27 -0.42 -0.1 -0.32 0.32 0.07 -0.23 -1.15 -2.96 -0.41 -1.46 -1.3 0.97 0.63 -0.83 -3.16 -0.85 -0.46 -0.7 0.29 0.27 -2.88 0.33 0.85 0.58 0.67 -0.45 -5.32 1.02 -1.92 0.48 0.38 0.4 0.52 -1.51 -1.8 -2.29 0.26 0.98 1.02 1.18 0.37 -0.09 -0.38 0.5 -1.33 0.69 -2.56
CRO14846 (gcp_1)
0.46 -1.33 0.01 -0.99 0.04 0.15 -0.44 -2.63 -2.9 0.13 -0.29 -0.13 -0.15 -0.71 -0.2 0.53 -0.07 0.05 -0.44 1.09 -0.39 -0.18 0.04 -1.97 1.64 2.06 -0.02 -1.16 -0.59 -1.34 0.07 -0.27 0.93 -0.07 0.83 -2.0 -4.64 -0.93 -1.06 -1.25 0.08 1.33 -2.26 -5.02 -1.68 -1.87 -1.63 0.13 0.19 -4.58 -1.19 0.01 1.47 0.46 -1.42 -8.24 1.13 -4.72 -0.58 1.36 -0.67 1.43 -3.62 -6.16 -4.99 0.76 1.36 0.99 1.24 0.69 -0.66 -0.61 -0.12 -1.97 1.22 -2.31
-0.14 -1.17 0.47 0.7 0.85 0.31 -0.63 -1.16 0.29 0.17 0.13 0.1 -0.14 -0.02 0.03 0.06 0.61 -0.05 0.22 0.51 0.37 0.17 -0.83 -0.93 0.94 0.85 -0.65 0.76 -0.73 0.61 -0.44 -0.04 0.06 0.32 -1.02 0.35 -1.9 -0.87 -0.25 -0.01 -0.07 -1.07 -0.02 -1.94 -0.37 0.42 -0.99 0.98 1.02 -2.05 0.93 -0.36 -0.76 0.22 -1.27 -2.91 -0.13 -0.7 -0.34 -1.28 -0.35 -0.94 -0.57 -1.1 -1.54 0.21 1.36 -0.43 0.61 0.6 0.0 -0.59 -0.15 -0.13 1.17 -0.79
0.6 -1.22 0.15 -0.26 1.33 -0.57 -1.09 -2.1 -1.62 0.22 0.63 0.78 0.89 -1.05 -0.92 1.97 0.08 -0.51 0.72 0.14 0.83 0.32 -0.75 -0.9 1.84 1.31 -0.71 -0.37 -0.5 0.05 -0.2 -0.25 1.17 -0.35 -0.04 -1.3 -3.34 -0.61 -1.28 -1.5 -0.5 -0.25 -1.48 -2.97 -1.83 -0.46 -1.42 0.55 0.68 -3.22 -0.39 -0.4 -0.13 0.42 -1.09 -4.31 0.95 -3.12 -0.58 -0.13 -0.85 0.4 -2.4 -4.49 -3.87 1.61 0.46 1.15 0.4 -1.01 -0.37 0.15 -0.35 -1.61 1.5 -2.73
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CRO21634 (gluQ)
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CRO23226 (thiL)
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CRO26738 (ubiC)
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CRO27292 (adaA)
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CRO42889 (dus_2)
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CRO43585 (cvpA)
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CRO47272 (tmk)
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CRO47945 (bchI)
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CRO51204 (dsbD_1)
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CRO52111 (dnaK_2)
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CRO54503 (nnr)
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CRO54923 (ybcI)
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CRO55696 (waaA)
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CRO55806 (yhdN_1)
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CRO66968 (dehH1)
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CRO67380 (yqaA)
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CRO72226 (xseA)
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CRO80777 (marR_1)
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CRO83675 (gcp_2)
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CRO85928 (bioD1)
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CRO85968 (bioC)
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CRO86044 (bioF)
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CRO86077 (bioB)
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CRO88485 (rsmE)
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CRO90474 (yxaF_2)
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CRO94549 (sugE_2)
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CRP03687 (pyrF)
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CRP17947 (yfbT)
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CRP19281 (virS_7)
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CRP21442 (lipL)
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0.05 -0.31 -0.57 0.39 -0.1 0.09 1.4 0.29 -0.83 0.14 1.43 1.36 0.84 -0.45 1.09 0.02 -1.29 -0.42 -1.05 -0.22 -0.61 0.76 -1.57 -0.88 0.1 0.59 0.36 -0.5 -0.75 -0.94 0.56 -0.2 0.91 -0.2 -0.37 -0.72 -2.11 -0.54 -1.61 -0.86 0.08 -0.87 -0.81 -2.14 0.01 -1.19 -1.04 -0.2 0.47 -1.93 -1.35 0.04 -0.55 -0.26 -1.18 -2.04 0.38 -1.72 -0.15 -0.72 -0.72 -0.51 -1.15 -2.45 -1.94 0.35 2.28 0.53 0.81 1.42 -0.72 -0.53 -0.43 -0.51 0.61 0.99
2.04 -1.22 -0.78 0.6 1.8 0.85 -0.78 -0.62 0.96 0.01 -0.0 0.11 0.13 -0.88 -0.93 0.55 -0.44 -0.48 -0.14 0.9 0.28 -0.2 0.54 -1.46 3.06 1.08 -0.3 -0.41 -1.1 -0.24 -0.02 -0.2 0.37 -0.29 -1.28 -1.3 -1.68 -1.41 -1.86 -1.66 -1.0 -1.94 -0.38 -2.04 -1.28 -0.22 -1.27 0.11 0.56 -2.0 0.01 -1.31 -2.19 -0.32 -1.18 -3.83 0.41 -2.4 -1.35 -1.95 -1.71 -1.85 -1.43 -2.61 -2.05 0.17 0.99 0.36 0.37 0.32 -1.25 -0.24 -0.42 0.02 1.79 -0.89
CRP24530 (pbpG_2)
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1.11 0.23 0.64 -0.76 1.72 0.93 0.99 -2.06 -0.86 -0.14 -0.06 0.1 -0.07 -1.42 -0.65 0.23 -0.4 0.16 0.08 0.05 0.43 -0.35 -0.16 -1.26 0.75 1.0 0.08 -0.43 -0.98 -0.8 0.37 -0.2 -0.66 -0.51 -0.84 -1.16 -2.69 -0.46 -1.07 -1.41 -0.69 -0.79 -1.86 -2.54 0.18 0.06 1.18 -0.38 -0.32 -2.65 0.52 -0.5 -0.78 -0.02 0.94 0.5 -0.0 -1.57 -0.62 -0.88 -0.67 -0.57 -1.28 -2.08 -1.54 1.65 1.07 1.0 0.81 0.73 -0.93 0.06 0.05 -2.49 1.45 -1.25
CRP28578 (barA_5)
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CRP29033 (panB_2)
0.33 -0.56 -0.37 -0.81 1.94 -1.05 -1.2 -1.75 -0.6 0.51 1.26 1.45 1.37 -1.09 -0.45 2.15 0.33 0.23 0.46 0.06 0.25 1.44 -0.59 -0.81 2.26 0.35 -0.85 -0.57 -0.96 -0.69 -0.15 -0.09 0.44 0.46 -1.66 -0.83 -2.98 -1.16 -0.7 -1.38 -1.16 -3.34 -0.88 -3.08 -1.37 0.97 -1.24 0.53 0.56 -2.83 -0.05 -1.93 -3.47 0.12 -1.27 -1.54 1.16 -1.61 -1.54 -3.65 -1.86 -3.29 -1.07 -2.96 -2.07 -0.37 0.52 0.01 0.61 -0.69 -0.95 0.3 0.3 0.03 1.41 -1.53
CRP32263 (dmlR_28)
0.72 0.02 0.1 0.79 1.88 -0.19 -1.75 -1.06 -1.37 -0.2 0.61 0.71 0.71 -0.85 -1.53 0.99 -1.03 -0.73 -0.16 0.32 -0.17 0.33 -1.11 -0.63 2.77 1.05 -0.64 -0.82 -1.29 -0.23 -0.36 0.19 1.67 -0.39 -0.47 -0.59 -0.8 -0.78 -2.0 -1.92 -0.64 -1.67 0.22 -0.96 -1.21 0.12 -0.59 -0.27 0.58 -0.84 0.02 -1.27 -1.35 -0.4 -0.74 -3.33 0.32 -0.25 -0.87 -1.28 -0.68 -1.43 -0.8 -0.58 -1.24 0.44 0.91 -0.23 1.07 -0.58 -2.02 0.22 -0.54 0.17 1.32 -2.21
1.58 0.26 0.94 0.71 1.7 -0.65 -0.48 -1.13 -1.42 0.17 0.18 0.21 0.1 -1.53 -1.18 1.54 -0.46 -1.39 0.16 0.96 0.26 -0.17 -0.78 -1.0 1.13 1.77 0.05 0.64 -1.34 -0.03 0.46 0.26 1.74 -0.55 -0.16 -1.49 -0.63 -1.03 -1.93 -2.18 -0.78 -2.4 -0.69 -0.74 -0.97 -1.84 -2.55 0.54 0.32 -0.96 -1.33 -0.67 -2.24 0.15 -2.24 -4.49 1.2 -1.89 -1.31 -2.85 -1.81 -2.39 -1.78 -2.96 -2.99 1.48 1.56 0.56 0.63 -0.03 -1.07 -1.05 -1.29 -1.05 1.87 -2.86
1.12 1.59 -0.0 -0.87 -1.61 -0.79 0.01 0.05 -0.86 -0.01 0.5 0.54 0.41 -0.04 -0.68 1.38 -2.7 -0.69 0.98 1.11 0.91 0.35 -2.01 -0.63 0.12 0.86 0.83 0.62 -2.07 -0.0 0.99 -0.58 1.4 0.16 -2.25 -0.81 -1.45 -0.21 -2.63 -1.34 1.43 -0.74 -0.36 -1.36 -0.85 -0.99 -1.52 -0.81 -0.81 -1.44 -1.2 1.07 -0.45 -1.33 -2.03 -0.17 0.55 -3.14 1.09 -0.3 0.74 -0.71 -1.83 -3.24 -3.74 1.13 1.49 0.45 0.39 -0.77 -0.23 -1.2 -0.77 -1.03 -1.5 -0.83
CRP34503 (copA_4)
2.08 0.93 1.09 -1.42 0.38 -0.33 -0.7 0.44 -1.62 0.02 0.35 0.4 0.42 -0.07 -0.81 1.09 0.91 -1.16 -0.54 -0.23 -0.72 0.19 -1.75 -1.28 0.25 1.01 0.42 0.86 -1.25 -0.63 0.84 -0.37 1.08 -0.76 -0.93 -1.13 -2.15 -0.26 -0.71 -0.36 1.11 -1.0 -0.75 -2.05 -0.85 -1.24 -1.58 0.11 -0.64 -2.35 -0.53 1.13 -1.02 0.18 -1.44 -1.43 0.77 -2.82 0.5 -1.13 0.34 -0.96 -1.73 -4.1 -3.88 1.62 1.3 0.7 0.68 -0.39 -0.21 -1.67 -1.21 -0.46 0.8 -1.22
CRP34804 (rlmM)
0.61 0.16 -0.42 -0.22 1.0 0.58 -0.28 -1.44 -0.21 0.22 0.54 0.6 0.47 -0.51 0.06 0.13 -0.15 0.84 -0.81 -0.06 -0.48 0.27 -0.13 -0.85 1.0 1.24 -0.01 0.22 -0.19 0.12 -0.14 0.11 1.03 0.13 -0.12 -0.48 -1.11 -0.45 -0.74 -1.03 -0.3 -0.44 0.16 -1.49 -0.99 0.03 -0.56 0.4 0.16 -1.07 0.56 -0.43 -0.56 0.09 -0.74 -2.71 1.08 -1.16 -0.61 -0.47 -0.72 -0.34 -0.95 -1.54 -1.59 0.28 0.44 0.03 0.21 0.54 -0.43 0.06 0.78 0.18 0.98 -0.91
CRP40759 (ccmA)
1.34 -0.77 -0.13 0.13 0.82 0.19 0.2 -0.67 -1.87 0.02 0.11 0.09 -0.33 -0.74 0.12 0.19 -0.78 0.32 -0.54 1.82 -0.52 -0.19 -0.8 -1.97 1.35 1.87 0.82 -0.36 -1.35 -0.47 0.75 -0.16 0.98 -0.47 -0.29 -1.75 -3.45 -0.63 -1.93 -2.24 -0.13 0.14 -1.25 -3.4 -1.09 -0.59 -0.57 -0.08 0.42 -3.39 -0.19 0.17 0.12 -0.55 -0.51 -5.44 0.28 -2.84 -0.87 -0.21 -0.93 0.18 -2.13 -3.85 -3.37 1.35 1.63 1.03 1.1 0.71 -1.06 -0.58 0.16 -1.44 1.13 -0.15
CRP40786 (ccmB)
1.61 -0.39 1.68 0.14 -0.47 0.08 -0.4 -1.76 -1.01 0.18 0.04 0.15 -0.04 -0.7 -1.11 0.22 -1.39 -0.66 -0.82 2.71 -1.02 -0.39 -0.01 -0.61 0.79 1.22 0.84 -0.0 -2.09 -0.04 1.02 -0.3 1.14 -1.11 0.13 -0.91 -2.81 0.31 -1.68 -1.85 1.18 -0.16 -0.32 -2.8 -1.52 -1.2 -1.1 0.07 -0.32 -3.08 -0.46 1.63 -0.02 -0.64 -1.1 -2.77 -0.22 -2.82 0.69 -0.29 0.96 -0.23 -1.71 -3.31 -1.85 0.71 0.23 0.24 -0.02 0.5 -0.88 -1.19 -0.69 -1.48 -0.06 -1.83
CRP40813 (ccmC)
1.96 0.21 1.03 -0.37 -1.14 0.48 0.12 -0.48 -1.03 -0.01 0.05 0.09 0.02 -0.22 -0.04 0.29 -1.16 -0.26 -0.0 0.9 0.11 -0.33 -0.58 -1.52 0.45 0.91 1.01 -0.15 -1.04 -0.58 1.09 -0.32 1.53 -0.33 -0.42 -0.51 -1.71 -0.14 -0.15 -0.12 0.73 0.12 -0.15 -2.15 -0.89 -0.5 -0.83 0.47 -0.03 -1.48 0.19 0.95 0.04 -0.55 -0.64 -0.74 0.01 -2.69 0.41 -0.01 0.26 0.06 -1.62 -3.25 -2.06 0.49 0.12 0.36 -0.08 0.44 -0.42 -0.97 -0.33 -0.58 -0.23 -0.22
CRP40889 (ccmF)
2.39 -0.11 0.77 -0.44 -0.03 0.02 -0.46 -0.7 -0.91 0.54 0.67 0.76 0.58 -0.32 -0.69 0.31 0.78 0.06 0.23 0.14 0.27 0.24 -1.76 -1.02 -0.27 0.23 0.82 0.02 -0.31 -0.51 0.99 -0.46 0.44 -0.55 -0.83 -0.89 -4.24 -0.38 -0.86 -0.87 0.17 0.25 0.26 -4.15 -0.62 -1.2 -0.9 1.09 0.48 -4.12 -0.93 0.68 0.01 0.2 -0.84 -1.72 -0.09 -2.68 0.17 -0.03 -0.0 0.2 -1.07 -3.77 -2.91 1.12 -0.02 0.36 -0.0 0.12 0.03 -0.43 -0.12 0.15 0.52 -0.62
CRP40950 (ccmH)
2.2 -0.15 0.86 -1.22 -1.19 0.56 0.09 -0.7 -0.52 0.47 0.81 0.85 0.67 0.03 -0.21 0.22 0.26 0.12 0.37 0.38 0.5 0.2 -1.26 -0.7 -0.06 0.46 0.93 0.25 -0.29 -0.2 1.08 -0.3 0.88 -0.12 -0.94 -0.2 -4.07 -0.61 -0.31 -0.11 -1.15 -1.38 0.06 -4.19 -0.29 -0.49 -0.25 1.04 0.21 -3.92 0.17 -1.34 -1.39 0.56 -0.14 0.86 0.37 -2.2 -1.64 -1.57 -1.58 -1.26 -0.96 -3.0 -1.77 0.85 -0.49 0.25 -0.28 0.33 0.15 -0.54 -0.02 0.05 0.27 -0.13
CRP40975 (nrfG)
1.59 -0.17 1.24 -0.8 -0.13 1.06 -0.18 -0.88 -1.27 0.33 0.68 0.81 0.66 -0.19 -0.65 0.55 0.65 0.07 -0.06 -0.47 -0.17 0.2 -0.86 -1.39 1.18 1.46 0.51 -0.63 -0.47 -1.08 0.63 -0.24 1.13 -0.12 -0.51 -0.67 -4.45 -0.42 -0.28 -0.03 0.12 0.08 -0.47 -5.19 -1.25 -0.3 -0.26 0.42 0.01 -4.39 0.75 0.03 -0.02 0.33 -0.18 -3.21 0.42 -3.05 -0.35 -0.12 -0.4 0.06 -1.58 -4.34 -3.15 0.65 -0.17 0.22 -0.06 -0.33 0.21 -0.66 0.06 0.06 0.59 -0.57
-0.51 -0.14 -0.05 0.37 0.51 -0.32 -0.81 -1.47 -0.94 -0.22 -0.02 -0.08 -0.35 -0.26 -0.53 -0.43 0.9 -0.96 -0.71 0.31 0.13 -0.29 1.13 -1.02 1.14 0.9 -1.5 0.35 -0.92 0.58 -1.07 0.17 0.76 -0.54 -0.46 -0.31 0.03 -0.17 -0.82 -0.69 0.7 -0.71 1.24 -0.16 -0.27 -0.43 -1.96 0.36 0.54 0.01 -0.42 0.5 -0.71 0.03 -1.29 -1.82 0.28 -0.08 0.95 -0.72 0.67 -0.65 -0.44 -0.45 -0.51 0.12 0.68 -0.14 0.27 1.32 -0.22 -0.73 -0.96 -0.64 1.27 -1.08
0.4 -0.08 -0.12 0.23 0.64 -0.21 -0.78 -0.13 -1.5 0.43 0.52 0.6 0.75 0.37 0.12 0.44 1.25 -0.28 0.06 1.68 0.12 0.33 -1.2 -0.44 1.13 1.43 -0.03 0.44 -0.41 0.23 0.15 0.01 -0.18 -0.1 -0.67 -0.62 -0.1 -1.09 -1.1 -0.93 -2.39 -2.4 -1.06 -0.21 -0.26 0.31 -0.51 0.02 0.12 -0.07 0.69 -2.75 -2.52 0.2 -0.4 -5.09 0.24 -0.74 -2.99 -2.61 -3.0 -2.71 -0.73 -1.08 -0.96 0.26 0.85 0.57 0.56 0.44 -0.67 -0.73 -0.19 1.56 0.59 -0.55
CRP47211 (cynR_7)
-0.56 -0.39 -0.65 0.73 1.17 0.71 -0.67 -0.47 -1.24 -0.01 0.9 0.9 0.96 -0.29 -0.07 0.81 0.6 -0.91 -0.09 2.09 -0.03 0.56 -0.9 -1.11 1.3 1.59 -1.2 0.5 -0.48 0.16 -0.7 -0.14 0.32 0.01 -0.43 -1.54 -1.57 -1.38 -1.53 -1.11 -2.42 -3.43 -1.54 -1.89 -0.55 -0.43 -1.4 -0.13 0.36 -1.56 0.45 -2.9 -3.02 0.19 -1.46 -4.29 0.91 -1.33 -2.32 -3.01 -3.04 -2.97 -1.5 -2.03 -2.4 0.94 1.58 1.05 1.4 0.63 -0.65 -0.06 -0.78 0.12 1.74 -1.51
-0.62 -1.1 0.11 0.56 0.76 0.12 -0.23 -2.31 -1.18 0.11 -0.34 -0.23 -0.38 -1.44 -0.8 0.7 -0.19 -0.61 -0.2 1.19 0.26 -0.78 -0.04 -1.88 2.4 2.77 -1.58 -0.59 -0.75 -0.93 -1.23 0.16 0.7 -0.17 0.15 -2.9 -2.82 -1.19 -2.93 -2.11 -1.36 -0.98 -1.67 -2.79 -0.92 -0.45 -1.08 0.95 0.73 -2.81 -0.28 -0.99 -0.96 1.21 -0.67 - 0.51 -2.32 -1.72 -1.19 -1.83 -1.03 -2.62 -2.93 -2.83 1.2 1.34 1.07 1.05 1.02 -1.08 0.65 -0.44 -1.14 2.08 -2.35
CRP51890 (walR_2)
0.24 -0.16 0.13 0.0 0.48 0.07 -0.89 -0.46 -0.65 -0.05 0.48 0.5 0.48 0.24 -0.53 0.23 -0.74 -0.33 -0.07 -0.36 0.09 0.33 -0.81 -0.5 1.5 1.52 -0.13 0.0 -1.24 -0.36 0.11 -0.06 0.97 -0.01 -0.51 -0.63 -1.34 -0.22 -0.84 -0.71 0.25 -0.67 -0.64 -1.61 -0.39 0.73 -0.03 0.24 0.89 -1.28 1.41 0.0 -0.76 0.14 0.04 -1.0 0.27 -1.12 -0.11 -0.86 -0.15 -0.72 -0.8 -0.83 -1.39 -0.56 0.68 -0.52 0.19 0.66 -1.23 -0.19 -0.15 0.89 0.89 -0.59
CRP53193 (rluA_2)
0.63 -0.51 -0.06 -0.15 2.54 -0.1 -0.91 -1.01 -1.15 0.53 0.51 0.72 0.59 -1.26 -0.37 0.62 -0.55 0.36 0.12 1.02 0.42 0.19 -0.24 -1.56 1.24 1.38 0.7 -0.85 -0.66 -0.26 0.82 -0.16 0.68 -0.07 -0.31 -1.71 -4.45 -0.8 -2.06 -1.99 -1.1 -0.62 -1.8 -4.49 -1.17 -0.01 -0.23 -0.43 -0.38 -4.01 0.53 -1.36 -0.77 0.32 -0.27 -5.77 1.1 -2.23 -1.47 -0.71 -1.62 -0.65 -2.02 -3.27 -2.5 1.62 0.83 0.91 0.58 -0.54 -1.05 -0.14 0.42 -0.2 1.39 -1.53
0.82 -0.15 0.63 0.65 2.14 0.66 -0.57 - -1.46 -0.18 0.07 0.26 0.11 -0.8 -0.91 0.5 0.53 -0.88 -0.37 0.48 -0.17 -0.2 -0.7 -1.41 1.26 1.42 -0.48 -0.23 -1.1 -0.83 -0.06 0.06 1.05 -0.03 0.07 -1.15 -2.13 -1.39 -0.93 -1.14 -0.99 -2.95 -1.26 -2.01 -0.59 -0.3 -1.08 0.23 0.79 -1.65 -0.06 -1.1 -1.87 0.64 -1.52 -4.37 0.87 -1.62 -1.59 -2.25 -1.53 -2.36 -1.49 -1.42 -1.93 1.28 1.34 1.21 0.95 1.64 -1.1 -0.26 -0.86 0.32 2.0 -
CRP63214 (ompR_5)
0.27 -1.09 -0.65 -0.91 1.17 0.65 0.01 -0.97 -1.96 -0.03 0.44 0.4 0.22 -0.37 0.44 0.05 -0.66 0.36 -0.6 0.68 -0.44 -0.04 -0.7 -1.67 1.74 2.23 0.06 -0.52 -1.12 -0.73 0.05 -0.03 0.52 -0.28 -0.21 -0.56 -2.82 -0.34 -0.67 -0.23 0.07 0.41 -1.1 -3.32 -1.09 -0.12 -0.92 0.39 0.47 -2.76 0.49 0.45 0.38 -0.18 -0.76 -4.12 0.57 -2.31 -0.16 0.01 -0.12 0.26 -1.83 -2.85 -2.7 0.5 0.92 0.15 0.36 1.5 -0.42 -0.86 0.44 -0.97 0.85 -0.72
0.08 -1.06 -0.12 0.13 1.01 -0.89 -1.96 -3.32 -0.55 -0.63 -1.47 -1.34 -1.62 -2.23 -1.52 -0.03 -0.44 -1.8 0.01 1.84 0.32 -1.05 -0.31 -1.47 0.88 1.15 -1.33 -0.21 -2.11 -0.96 -0.74 0.06 0.18 0.32 -0.62 -3.0 -2.28 -0.13 -3.1 -2.91 2.43 0.06 -1.13 -2.34 -1.45 0.31 0.23 0.26 0.21 -1.94 1.1 1.87 0.89 0.51 0.17 -3.25 0.09 -1.29 1.66 0.65 1.69 0.32 -1.19 -1.23 -1.6 0.08 1.16 0.36 0.39 -0.34 -1.86 -2.5 -1.59 -2.11 1.25 -3.06
CRP69529 (rimN_2)
0.95 -0.39 0.19 -0.23 0.31 0.84 -0.15 -1.13 -0.31 0.13 0.24 0.18 0.02 -0.16 0.68 0.34 -0.13 -0.01 -0.35 0.94 -0.27 -0.11 -0.53 -0.43 1.22 1.5 -0.46 0.08 -0.7 0.04 -0.55 0.16 0.89 0.18 0.42 0.2 -3.17 -0.99 0.2 -0.01 -0.8 -1.05 -0.77 -3.27 -0.5 0.58 -0.74 0.54 0.22 -2.91 0.77 -0.81 -0.95 0.44 -0.61 -2.66 0.44 -0.84 -1.04 -1.15 -1.18 -0.98 -0.64 -1.78 -1.43 -0.13 0.97 0.03 0.46 0.71 -0.3 0.02 -0.02 0.62 0.88 0.04
0.23 -0.31 0.18 -0.99 0.68 0.77 -0.05 -0.55 -1.15 0.19 -0.34 -0.23 -0.27 -0.2 -0.21 -0.05 0.94 -1.19 1.3 1.48 1.41 -0.28 -0.09 -1.23 0.63 1.04 -1.22 0.5 -1.15 -2.03 -0.59 0.15 -0.59 0.33 -0.14 -0.4 -1.62 -0.42 -1.45 -1.07 0.35 -0.75 -2.33 -1.63 -0.29 -0.38 -1.04 -0.39 0.1 -1.3 -0.28 -0.08 -0.53 0.46 -1.04 -4.01 0.17 -1.15 -0.0 -0.48 -0.21 -0.75 -1.62 -2.48 -3.03 1.02 2.3 0.91 1.32 1.17 -1.13 -1.2 -1.45 -1.04 1.4 -1.51
-0.28 -1.77 -0.51 0.02 0.78 0.19 0.62 -0.34 -1.69 -0.41 -0.66 -0.55 -0.49 -2.32 0.34 -1.78 1.28 -0.39 -0.02 0.76 -0.13 -0.04 -0.2 -1.54 1.17 1.54 -0.49 -0.34 -0.64 -1.85 -0.04 -0.03 0.13 -0.76 0.45 -0.55 -2.0 -0.32 -0.72 -0.4 0.79 1.29 -1.8 -1.93 -0.16 -0.72 0.39 -0.68 -0.07 -1.75 -0.79 0.44 1.49 0.2 0.17 -2.8 0.65 -1.75 0.16 1.17 -0.37 1.41 -1.75 -2.93 -2.37 0.69 0.28 0.58 -0.2 1.36 -0.72 -1.53 -0.48 -1.38 0.55 0.4
0.37 -0.95 -0.36 1.23 2.04 -0.51 -1.59 -0.75 -1.42 0.11 0.64 0.65 0.32 -2.26 -1.28 0.05 -1.67 0.52 0.07 -0.02 0.72 -0.04 -0.09 -2.04 1.33 1.02 0.05 0.65 -0.35 0.51 0.01 0.51 1.33 -0.81 -1.11 -1.44 -0.47 -0.75 -2.55 -2.6 -0.7 -1.33 0.29 0.21 -0.38 0.01 -0.22 0.52 0.37 -0.18 -0.28 -0.52 -0.9 -0.12 -0.47 -3.6 0.9 -2.0 -1.36 -1.1 -1.32 -1.3 -0.61 -2.29 -2.58 0.57 1.05 -0.19 0.09 -0.07 -1.75 -0.39 0.37 0.53 1.89 -0.48
CRP77624 (rsmC)
0.12 -1.52 -1.24 -0.21 1.17 0.43 0.69 -1.93 -2.18 0.46 -0.06 -0.1 -0.24 -0.02 0.38 0.66 0.54 0.65 0.02 0.72 0.07 -0.37 -1.69 -2.03 1.54 1.34 0.11 -0.48 -1.39 -2.02 0.11 -0.29 -0.57 -0.13 -0.51 -0.36 -1.93 -0.51 0.22 0.31 -0.15 1.18 -1.42 -2.16 -0.62 -1.81 -0.33 -0.41 -0.04 -1.83 -1.54 -0.11 0.99 0.5 -0.24 -4.05 0.98 -3.22 -0.88 0.95 -0.95 1.15 -2.25 -3.76 -3.28 0.06 1.2 0.18 0.63 1.27 -0.6 -0.68 0.51 -1.06 1.34 -1.14
0.44 -0.8 -0.18 0.3 1.21 0.12 -2.08 -0.54 -0.78 0.18 0.67 0.64 0.74 -0.87 -0.71 1.07 0.24 0.14 0.24 1.6 0.49 0.34 -0.02 -0.83 0.75 1.47 0.36 0.27 -0.63 0.26 0.6 -0.09 -0.05 -0.86 -1.38 -0.09 -0.89 -1.28 -0.63 -1.43 -1.99 -2.81 -1.71 -1.11 -0.4 -0.72 -0.28 -0.95 -0.95 -1.08 -0.51 -2.52 -3.3 -0.51 -0.29 -4.08 0.37 -1.16 -3.22 -3.86 -2.58 -3.56 -1.01 -1.88 -1.46 2.02 2.04 1.58 1.64 0.28 -1.52 -1.47 0.23 -0.54 0.93 -1.48
CRP79377 (rluF)
0.91 -0.07 0.38 0.5 1.88 -0.03 -0.45 -0.5 -1.01 0.05 0.24 0.33 0.28 -0.45 -0.13 0.89 -1.67 -0.25 0.22 1.67 0.26 -0.03 0.08 -0.72 0.78 0.94 0.32 0.17 -0.55 -0.63 0.52 0.06 1.06 0.52 -0.12 -0.99 -2.13 -0.96 -1.24 -1.46 -0.36 -1.08 -0.88 -1.93 -0.51 -0.38 -1.17 0.03 0.23 -1.85 0.07 -0.7 -0.73 0.68 -1.21 -2.6 1.06 -1.34 -0.82 -0.64 -0.93 -1.2 -1.32 -1.57 -1.58 0.86 0.65 0.3 0.37 0.29 -0.97 -0.17 -0.19 0.23 1.13 -0.67
CRP80981 (garK)
0.15 -0.22 1.23 1.2 1.37 -0.16 -1.71 -2.35 -1.86 0.05 -0.29 -0.12 0.11 -1.21 -1.63 0.86 0.98 -1.06 -0.2 0.56 0.01 -0.51 -1.24 -1.89 1.19 1.5 0.19 -0.07 -0.66 0.26 0.78 -0.13 0.89 -0.4 0.39 -2.1 -1.13 -0.58 -2.17 -1.88 -0.7 -1.12 -0.71 -0.86 -1.67 -0.83 -2.39 -0.45 0.48 -1.02 -1.32 -1.02 -1.15 1.87 -1.48 -5.38 0.8 -2.66 -0.76 -1.23 -1.29 -1.08 -1.26 -3.35 -3.45 1.88 1.48 0.89 1.3 0.16 -0.56 -0.62 -1.01 -0.19 1.88 -3.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.