Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
AES-1R,ASMDM+
AG1,ciproflaxin
D+7bld
DK2
E01
LB
LB,log
LB,untreated
PA1201
PA14
PA14,0.25xMIC G3KL
PA14,0.25xMIC T7
PA14,0.25xMIC polymyxin-B
PA14,LB
PA14,LB,log
PA14,WT
PA14,ciproflaxin
PA14,cmrA+
PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,late stat,untreated
PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,untreated
PA212
PA2596
PA558
PA580
PAK,LB
PAK,WT
PAK,WT,LB
PAK,pilR
PAK,pmrB6,LB
PAO1
PAO1,0.56mg/mL farnesol
PAO1,ABTGC
PAO1,DDS
PAO1,GUN,LB,glucose
PAO1,HapZ,early stat
PAO1,LB
PAO1,LB,glucose
PAO1,LB,untreated
PAO1,M9-CA,early stat
PAO1,M9-CA,log
PAO1,RsmN+
PAO1,SagS,early stat
PAO1,WT
PAO1,WT,BHI
PAO1,WT,LB
PAO1,WT,MOPS acetate
PAO1,WT,MOPS glycerol
PAO1,early stat
PAO1,ersA,BHI
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log
PAO1,liquid culture
PAO1,mexZ,LB
PAO1,oxylipin-
PAO1,pBAD-yhjH
PAO1,pUCP18::msr(E)
PAO1,qslA,M9-CA,early stat
PAO1,qslA,M9-CA,log
PAO1,qteE,M9-CA,early stat
PAO1,qteE,M9-CA,log
PAO1,untreated
PAO1,wspFpelApslBCD,LB
PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated
Y31,LB
Y71,LB
Y82,LB
Y89,LB
ciproflaxin
liquid culture
m pheno
mexT
nirS
pHerdB20T-gp68
untreated
1.11 -0.46 -0.15 -0.83 -1.16 0.4 -0.12 -0.55 -0.51 0.36 0.39 0.36 0.29 0.23 0.18 0.97 0.6 0.3 -0.76 -0.2 -0.2 0.22 -2.1 -0.02 -0.53 -0.61 -0.3 0.41 0.19 0.32 -0.31 -0.34 -0.96 0.26 -1.05 0.73 -2.51 -0.56 0.75 0.5 -0.3 -0.52 1.95 -2.56 -0.56 -0.68 -0.62 0.71 -0.01 -2.46 -0.73 -0.4 -0.51 0.62 -0.58 -1.43 -0.01 0.08 -0.5 -0.62 -0.67 -0.53 -0.28 -0.78 -1.46 0.21 0.14 -0.13 0.5 0.16 1.23 0.36 0.2 -0.21 -0.18 0.86
-1.29 -0.61 0.38 -1.71 -2.85 1.09 0.78 -0.12 -0.19 -0.15 -0.3 -0.24 -0.16 1.35 1.29 -0.57 1.14 -0.56 -0.25 -1.83 -0.39 -0.33 -3.22 -1.73 0.4 0.62 -0.08 1.77 0.52 0.18 -0.29 -0.12 -2.32 -0.37 -1.42 1.1 -4.75 -0.88 1.13 0.91 -2.02 -3.81 -2.14 -4.57 -0.78 -0.64 0.25 1.46 0.14 -4.43 -1.16 -1.97 -3.69 1.01 0.17 1.42 -0.2 0.03 -2.91 -3.82 -2.89 -3.7 -0.06 -1.72 -2.02 0.17 -0.17 -0.14 0.23 1.15 1.38 -0.04 -0.65 1.11 0.08 0.8
0.06 -1.82 -0.18 -0.59 -0.29 0.82 0.69 -0.1 -0.99 0.49 0.53 0.68 0.63 0.74 0.83 0.39 -0.41 0.42 0.4 0.47 0.34 0.43 -2.7 -0.29 0.19 0.31 0.09 -0.83 -0.17 -1.12 0.03 -0.05 -1.69 0.09 -1.1 0.83 -1.93 -1.17 0.88 0.95 -1.83 -0.51 0.03 -2.2 0.07 0.38 0.55 0.45 0.56 -1.97 0.46 -1.83 -0.69 0.08 0.5 -3.12 -0.04 -0.7 -2.65 -0.26 -2.78 -0.37 -0.54 -1.83 -1.6 0.68 1.22 0.24 0.8 -0.71 0.8 -0.4 0.43 -0.51 -0.29 0.36
CRN66244 (thiO)
0.73 -0.8 -0.46 0.45 -0.15 0.62 0.7 -0.17 -1.66 0.39 0.48 0.6 0.62 1.25 0.73 0.95 1.13 -0.31 -0.14 0.33 -0.26 0.3 -1.34 -0.24 0.04 0.37 -0.21 -0.21 -0.44 -0.44 -0.06 -0.36 0.52 -0.76 -0.89 0.57 -3.35 -0.79 0.84 0.87 -0.17 -1.4 -0.86 -3.46 -1.38 0.91 -0.42 1.11 -0.04 -2.87 1.7 0.08 -1.56 -0.31 -0.45 -3.68 -0.44 -2.13 -0.58 -1.75 -0.8 -1.57 -0.88 -2.85 -2.79 -0.38 0.33 -0.13 -0.2 -0.54 0.82 -0.55 -0.4 0.13 0.24 1.32
CRN70612 (hpd_1)
0.68 0.24 -1.35 -2.77 2.14 0.19 -0.58 -0.55 -0.01 -0.24 -0.63 -0.47 -0.44 -0.57 1.13 -3.53 0.24 0.89 -6.23 -4.03 -5.97 -0.21 -1.58 0.96 -0.92 -1.47 -3.11 -0.88 -1.58 -0.52 -2.96 -0.47 -0.8 -1.75 -6.2 2.39 0.58 -0.52 1.25 1.42 -0.59 -0.78 0.34 0.6 -0.17 1.68 -0.71 -5.47 -4.87 0.82 0.93 -0.13 -0.85 -0.58 -0.91 -3.51 -3.21 1.64 0.25 -0.84 0.68 -1.0 -0.49 0.5 0.28 -0.27 -0.75 -0.19 -0.39 -1.7 0.28 1.67 0.59 -2.07 -1.25 -1.93
CRN70728 (aspC_1)
1.22 0.39 0.22 -1.33 0.64 0.64 -1.7 -1.54 -0.07 0.39 0.65 0.83 1.01 0.39 0.08 -1.22 2.33 0.69 -2.69 -2.64 -2.04 0.62 -1.64 0.45 0.22 -0.2 -1.2 -0.42 -0.35 -0.44 -0.85 -0.59 0.11 -0.99 -4.06 0.76 -1.51 -0.68 0.23 0.3 0.74 -0.5 0.8 -1.56 -1.05 -0.86 -2.14 -2.74 -2.06 -1.56 -1.27 0.89 -0.56 0.95 -2.2 -4.27 -0.6 0.43 0.74 -0.55 0.4 -0.64 -0.62 -0.9 -0.72 1.03 0.28 0.65 0.56 -0.85 0.11 1.44 0.49 -0.96 -0.14 -1.73
0.66 0.28 -0.26 -2.63 1.53 1.17 -0.54 -0.6 0.11 0.61 0.41 0.59 0.82 1.11 1.12 -2.45 0.88 0.66 -2.77 -3.0 -2.35 0.53 -2.7 0.33 -0.96 -1.5 -1.77 -0.69 -0.21 -0.42 -1.58 -0.9 -0.45 -1.85 -4.83 1.43 -1.5 -0.28 0.76 0.74 1.4 -0.06 -0.47 -1.54 -1.32 -0.26 -0.63 -3.36 -2.9 -1.6 -1.16 1.57 0.17 0.21 -0.75 -3.58 -1.3 0.77 1.25 0.15 0.9 -0.02 -0.54 -0.51 -0.77 0.48 -0.97 0.4 -0.63 -0.92 0.79 0.55 0.51 -1.1 -0.82 -0.42
CRN72746 (arsC_1)
-0.08 0.19 0.04 -0.72 -0.5 1.23 0.01 0.28 -1.54 -0.17 0.02 0.09 0.13 1.2 0.45 -0.32 -1.52 0.4 -0.71 0.34 -0.52 -0.1 -0.83 -1.01 0.29 0.61 0.05 -0.01 -0.46 -0.11 0.07 0.02 0.58 -0.05 -0.13 0.86 -1.41 -0.93 1.0 1.3 -0.13 -0.63 -0.42 -1.65 -0.89 0.19 -0.34 0.42 0.15 -1.4 0.92 -0.29 -0.51 0.03 -0.27 -0.26 0.56 -0.59 -0.85 -0.51 -0.83 -0.55 -0.64 -0.36 -0.66 0.06 0.11 0.14 -0.12 0.41 0.73 -0.42 0.19 -0.83 -0.12 0.71
CRN72909 (proS)
-0.15 -0.72 -0.75 -0.44 -0.85 0.19 0.22 -0.16 -1.2 0.39 0.45 0.49 0.27 0.55 0.57 0.1 0.62 0.97 -0.26 0.54 -0.12 0.46 -1.53 -0.84 -0.53 -0.14 0.47 -0.47 0.16 -1.01 0.53 -0.26 -1.01 0.35 -1.14 0.03 -2.91 -0.46 0.55 0.7 -0.11 0.16 -1.01 -3.1 0.43 -1.64 0.37 0.42 0.31 -2.93 -1.2 0.13 0.07 0.46 0.36 0.55 0.44 -1.68 -0.6 -0.07 -0.58 0.05 -0.76 -2.74 -2.44 0.8 0.51 1.04 0.39 0.83 0.54 -0.27 0.77 -1.37 -0.12 0.45
CRN78675 (acoR_1)
-0.29 0.03 -0.12 1.04 1.51 1.35 0.35 -0.37 -1.54 -0.12 -0.53 -0.27 -0.1 0.77 0.45 -0.22 0.84 -1.6 0.07 0.29 0.24 -0.53 -1.44 -1.04 -0.02 -0.32 -1.43 0.18 -0.64 0.69 -1.35 -0.08 0.11 -0.52 -1.98 1.01 -0.03 -1.13 0.9 1.04 0.36 -1.71 -0.64 -0.42 -0.68 1.16 -2.5 0.3 0.43 0.08 1.18 -0.15 -1.52 0.28 -2.22 -2.39 -0.51 -0.8 0.21 -1.68 -0.53 -1.6 -0.77 -1.26 -1.21 -0.37 0.37 -0.18 0.15 -0.65 1.43 0.61 -1.73 0.06 0.77 -0.45
CRN96869 (icd_1)
0.18 0.12 0.09 -0.26 -0.07 0.54 0.22 0.51 -0.35 0.01 -0.34 -0.3 -0.33 0.34 0.21 0.29 0.38 -0.04 0.22 -0.87 0.05 -0.23 -2.4 0.23 -0.99 -1.08 -0.78 0.65 -0.13 0.6 -0.74 -0.32 -0.29 0.43 -1.28 0.98 -2.18 -0.52 1.08 1.19 0.39 -1.71 0.17 -1.85 -0.5 0.03 -1.14 1.26 0.25 -2.33 -0.32 0.58 -1.66 0.38 -0.9 -0.09 -0.79 0.84 -0.02 -1.86 -0.56 -1.75 0.18 0.12 -0.29 -1.45 -1.35 -1.1 -0.77 -0.44 1.39 0.44 -0.15 1.26 0.05 1.08
CRN96901 (icd_2)
-0.69 0.08 -0.32 0.2 -0.6 0.3 0.37 1.61 -2.02 0.1 -0.28 -0.17 -0.03 -0.36 -0.56 1.28 1.32 0.42 -1.63 0.26 -1.64 -0.31 -2.67 0.91 -1.73 -1.58 0.08 -0.12 0.37 -1.82 0.32 -0.62 -1.38 0.69 -1.39 -0.16 -3.91 -0.7 1.15 0.77 -1.11 -0.45 -1.23 -4.13 0.44 -1.69 0.37 0.9 -0.55 -3.92 -1.86 -0.87 -0.48 1.09 0.35 -0.58 -1.11 -2.32 -1.88 -0.43 -2.23 -0.21 -0.75 -3.57 -3.69 0.53 0.66 0.89 0.97 1.23 1.69 -0.28 0.17 0.6 -0.76 1.55
CRN97320 (nuoC)
-0.72 -0.89 -1.02 -1.21 -2.23 0.17 -0.13 0.39 -1.44 0.29 -0.17 -0.11 -0.17 0.47 0.1 0.81 0.91 0.43 0.26 1.17 0.47 -0.22 -3.03 -1.06 -1.33 -1.39 -0.62 -1.12 -0.45 -1.3 -0.31 -1.17 -1.48 -0.67 -2.36 -0.07 -3.32 -0.08 0.67 0.64 0.85 1.48 -0.36 -3.56 0.01 -1.79 0.28 0.14 0.01 -3.28 -1.96 1.2 1.44 0.36 0.28 0.78 -0.74 -2.59 1.31 1.55 0.69 1.5 -0.96 -3.77 -3.91 0.19 -0.07 -0.12 -0.06 0.16 0.69 -0.44 0.19 -1.45 -1.33 0.53
CRN99217 (cysK_2)
-0.18 -0.56 -0.86 0.42 0.73 0.48 2.14 0.23 -0.14 -0.02 -0.1 -0.05 -0.05 0.49 0.45 0.79 1.44 -0.69 0.18 -0.05 -0.09 -0.09 -1.19 -0.13 -1.15 -1.48 -1.08 -0.07 -0.16 -0.23 -0.83 -0.38 -0.25 0.41 -0.39 1.49 -2.05 -1.05 0.51 0.43 0.24 -1.29 -0.04 -2.07 -1.05 0.34 -1.16 0.6 0.24 -2.13 0.18 -0.06 -1.19 0.37 -1.06 -0.84 -0.08 -0.38 -0.13 -1.37 -0.27 -1.43 -0.6 -0.96 -0.94 -0.38 -0.13 -0.4 0.33 -0.51 0.81 0.7 -0.93 0.19 0.66 0.79
CRO01663 (hcnC_2)
0.08 -0.96 -0.32 -1.64 1.48 0.81 -0.12 -0.86 -1.94 0.09 1.1 1.22 1.38 0.5 0.04 -0.3 0.58 0.08 -1.14 -1.5 -1.34 0.66 -2.17 -1.18 -0.67 -0.54 -1.56 -1.05 -0.06 -0.85 -1.62 -0.25 -0.63 -0.58 -1.51 0.17 -1.8 -0.84 1.62 0.72 0.2 -0.77 -0.45 -1.8 -1.83 0.22 -1.28 -1.36 -0.79 -1.77 -0.06 -0.5 -0.73 0.59 -0.97 -4.19 2.11 -1.82 0.76 -0.93 0.42 -0.69 0.32 -2.71 -3.99 0.26 1.78 0.62 0.74 -0.89 1.01 -0.05 0.14 -2.01 1.5 -1.06
-0.36 -1.08 0.07 -1.07 1.22 0.86 -0.08 -1.7 -1.89 0.26 -0.1 0.06 0.04 0.78 0.61 -0.38 0.31 0.72 -0.16 -1.72 0.16 -0.4 -1.97 -2.66 -0.27 -0.34 -0.86 -0.43 0.79 -0.76 -0.53 -0.1 -0.8 0.18 -1.32 1.26 -1.5 -0.71 1.19 1.66 0.32 0.33 -2.41 -1.61 -0.51 -0.01 -0.5 1.11 0.19 -1.54 -0.15 0.12 0.24 0.9 -0.59 -0.26 -0.51 -0.75 -0.28 0.17 -0.42 0.13 -0.74 -1.94 -2.01 0.51 0.8 0.41 0.73 0.21 0.67 -0.49 0.49 -0.98 0.31 -0.66
-0.86 -1.06 -0.24 -1.04 -1.23 1.74 0.1 -0.68 -1.0 -0.07 -0.15 -0.09 -0.12 1.12 0.92 -0.48 0.63 -0.23 -0.06 -1.01 0.07 -0.33 -1.91 -2.01 -0.71 -1.06 -1.25 0.33 0.25 0.26 -1.07 -0.51 -1.69 0.04 -1.6 2.25 -2.71 -1.27 1.76 2.12 -0.81 -1.99 -1.76 -2.75 -0.62 1.45 -1.24 1.58 0.33 -2.61 1.03 -0.71 -1.71 0.32 -1.09 -1.06 -0.79 -0.49 -1.12 -1.84 -1.14 -1.98 -1.09 -1.97 -2.06 0.15 0.34 0.12 0.43 -0.62 1.46 -0.42 -0.42 0.49 0.23 0.37
CRO02535 (valS)
0.67 -0.74 -0.7 -0.56 -0.44 0.63 0.63 -0.51 -0.78 0.21 0.15 0.18 0.03 -0.16 0.18 0.69 0.52 0.73 -0.04 -0.01 0.4 -0.05 -1.99 -0.94 -0.45 -0.26 -0.15 -0.66 0.25 -1.46 0.05 -0.39 -1.45 0.72 -1.11 0.65 -3.16 -0.63 1.49 1.23 -0.64 0.45 -0.32 -3.41 0.52 -1.52 0.2 0.55 0.45 -3.17 -1.34 -0.37 0.31 0.65 0.15 -0.36 -0.0 -1.96 -1.0 0.23 -0.86 0.26 -0.79 -3.04 -2.59 0.45 0.65 0.47 0.59 0.67 0.82 -0.0 0.52 -0.64 -0.3 0.62
0.0 -1.31 -1.23 1.3 1.57 0.94 0.82 1.26 -0.4 -0.09 -0.32 -0.25 -0.33 1.34 0.14 0.02 -1.53 -0.86 1.08 0.75 1.1 -0.36 -2.17 -0.95 -0.48 -1.06 -1.24 0.66 -0.76 1.33 -1.26 -0.06 -1.68 0.72 -2.15 1.66 -0.98 -1.63 1.25 1.16 -1.25 -1.89 1.26 -0.91 0.28 -2.04 -2.48 0.1 0.27 -1.0 -1.92 -1.55 -2.13 0.18 -2.45 -3.37 -0.59 -0.09 -1.16 -2.14 -1.76 -1.88 -0.16 -1.98 -1.52 -0.42 -0.13 -0.16 -0.26 -0.06 1.41 0.26 -1.28 -1.19 0.67 0.83
CRO04571 (sttH_1)
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CRO07448 (ppsA)
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CRO08902 (metG)
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CRO14266 (dapD)
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CRO28562 (dadA_1)
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CRO28595 (yabJ_2)
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CRO28628 (dadX)
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CRO30512 (puuA_2)
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CRO31899 (phnD_2)
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CRO37611 (adiA)
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CRO37996 (fabI)
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CRO39348 (gltI_1)
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CRO39378 (glnM_2)
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CRO39408 (gltK)
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CRO39434 (glnQ_1)
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CRO39464 (ggt_1)
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CRO39498 (ansB)
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CRO40173 (nemR_3)
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CRO42964 (ble)
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CRO47581 (etfB)
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CRO51823 (ureD)
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CRO51854 (ureA)
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CRO51887 (yncA)
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CRO51924 (ureB)
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CRO51956 (ureC)
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CRO53179 (isfD_2)
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CRO56588 (msrA)
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CRO59216 (mmgC_2)
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CRO59827 (alsS)
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CRO61367 (yfgC_2)
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CRO61618 (mqo_1)
-0.28 -0.29 -0.57 -0.21 -1.6 -0.45 0.57 -0.19 -1.33 0.04 0.14 0.08 -0.0 -0.19 0.88 0.74 0.08 0.85 -0.67 -0.91 -0.42 -0.16 -2.16 -1.63 -0.16 0.25 -0.23 -0.1 0.63 -1.15 -0.02 -0.37 0.3 0.37 -1.48 0.37 -3.46 -0.35 1.21 1.39 0.05 0.19 -0.56 -3.87 -0.32 -0.59 0.04 1.46 -0.1 -3.48 -0.48 0.51 0.03 0.5 -0.09 0.24 -0.33 -1.95 -0.58 0.0 -1.03 0.15 -0.95 -2.0 -2.54 -0.02 0.74 0.2 0.46 0.27 1.26 0.5 0.72 -0.34 0.12 0.79
CRO64105 (dgt_1)
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CRO67672 (oprD_3)
-0.78 -0.59 -0.42 -2.14 -3.02 0.23 -0.1 -0.93 -1.72 -0.25 -0.54 -0.59 -0.55 -0.22 0.84 -0.51 0.81 0.93 -0.48 -1.41 -0.56 -0.52 -3.32 -3.39 -1.56 -1.12 0.07 0.04 1.2 -0.39 0.16 -0.63 -1.8 0.17 -3.07 1.33 -3.89 -0.62 1.77 2.07 0.26 0.18 -2.39 -4.02 -0.92 -0.08 1.4 1.08 0.26 -3.76 -0.36 0.55 0.27 1.18 1.3 1.66 0.13 -1.59 -0.73 0.35 -1.03 0.4 -1.0 -2.62 -3.07 -0.16 0.39 0.64 0.42 0.01 -0.36 -1.79 0.74 -0.54 -0.88 -0.41
CRO67863 (yfeX)
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CRO68248 (puuB_4)
1.03 -0.23 -0.84 0.62 1.31 0.61 0.25 0.27 -0.38 0.34 -0.4 -0.2 -0.04 0.67 -0.11 0.77 -0.21 -0.85 -1.19 -0.57 -0.92 -0.43 -2.12 0.69 -0.11 -0.43 -0.98 0.44 -1.43 0.83 -0.19 -0.01 -1.08 0.7 -0.81 -0.14 1.07 0.13 -0.61 -0.24 -0.61 -2.27 -0.01 0.04 -0.07 -0.77 -1.95 -1.65 -1.19 0.86 -1.57 -0.96 -2.3 -0.81 -1.96 -3.45 -0.27 -0.26 -0.75 -2.32 -1.04 -2.59 0.07 -0.49 -1.64 0.02 2.06 1.3 1.85 0.41 0.7 0.52 -1.43 -0.27 1.05 -0.03
-0.46 -0.81 0.48 -1.62 -0.27 1.42 0.4 0.14 -2.02 0.01 -0.23 -0.15 -0.24 0.96 0.38 -0.58 -1.88 -0.24 -0.87 -0.22 -0.73 -0.26 -0.6 -1.27 0.21 0.14 -0.17 -0.77 -0.09 -2.42 -0.1 -0.25 0.59 -0.56 0.73 0.85 -2.85 -0.61 0.79 0.73 0.97 0.56 -1.36 -3.1 -1.11 0.5 0.79 0.17 -0.14 -2.52 1.05 0.96 0.81 -0.09 0.71 -2.61 -0.32 -1.36 0.7 0.65 0.55 0.59 -0.8 -1.34 -1.81 -0.36 0.27 -0.31 -0.16 0.07 0.34 -0.83 -0.24 -0.06 -0.27 0.79
-0.04 -0.58 -0.19 -0.86 1.64 0.13 -0.88 0.29 -0.26 0.02 0.05 0.14 0.21 0.7 -0.21 0.29 -0.04 -1.15 -0.21 0.59 -0.07 0.01 -0.54 -0.2 0.09 0.38 -0.78 1.07 -0.19 1.29 -0.67 0.2 0.35 -0.23 0.31 0.48 -1.13 -1.32 -0.39 0.2 -1.63 -4.05 -0.58 -1.15 -0.44 0.42 -1.58 0.86 0.14 -1.23 0.47 -2.1 -3.32 0.28 -1.68 -1.38 0.55 -0.07 -2.07 -3.41 -2.48 -3.37 -0.47 -0.96 -1.26 0.48 1.43 0.26 1.55 0.13 0.6 -0.19 -1.15 0.59 1.53 -0.02
CRO84583 (tktA)
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-1.14 -0.96 -0.12 -1.94 0.56 1.34 0.19 0.49 -0.77 0.27 0.77 0.87 1.01 0.78 1.01 0.37 0.09 0.51 -0.77 -0.1 -1.51 0.58 -2.52 -0.48 -1.26 -1.14 -0.44 0.3 0.74 -1.03 -0.36 -0.45 -1.1 -0.09 -0.95 0.46 -5.1 -1.12 1.2 0.98 -0.97 -1.22 -0.68 -5.22 -0.46 -0.28 -0.55 0.18 -0.26 -5.85 -0.14 -1.15 -1.09 1.14 -0.22 -2.4 1.06 -2.17 -1.57 -1.12 -1.84 -1.21 -1.27 -3.17 -3.02 1.06 0.89 0.92 1.29 0.76 0.97 -0.42 0.45 0.58 0.53 0.36
CRO86622 (glcB_2)
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CRO86900 (yibF_2)
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CRO88000 (rutR_2)
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CRO90363 (nicP_9)
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CRO90601 (mobA_2)
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CRO91424 (gap)
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CRO91700 (sthA)
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CRO91732 (ugpQ)
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CRO92267 (puuD)
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CRO92297 (puuA_3)
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CRO92350 (potF_4)
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CRO92378 (potF_5)
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CRO96571 (cueR_2)
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CRO96598 (mmgC_7)
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CRO96791 (hmgA)
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CRP05297 (cfiA)
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CRP05321 (cfiB_1)
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CRP06216 (fumA)
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CRP08844 (gmhA)
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CRP09231 (trpS)
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CRP11994 (dppA_3)
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CRP19426 (exsA_4)
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CRP22364 (tesA)
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CRP47025 (dtd)
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CRP49267 (occP)
-0.96 -1.54 -1.04 -2.49 -0.9 0.72 1.8 0.64 -1.9 0.2 -0.27 -0.23 -0.51 0.85 2.18 -1.72 -0.21 -0.86 -0.59 -0.96 -0.56 -0.47 -2.13 -2.47 -0.62 -0.65 -1.29 0.49 0.06 0.29 -1.15 -0.17 -1.76 -0.74 -2.04 1.89 -1.04 -1.22 1.74 3.41 -1.39 -1.46 -1.44 -0.86 -0.6 -0.43 -0.67 -0.11 -0.8 -0.88 0.08 -1.38 -1.06 0.02 -0.74 -0.41 -1.45 -1.5 -1.47 -1.17 -1.4 -1.42 -1.56 -2.49 -2.45 0.15 -0.04 -0.15 0.07 0.46 1.26 0.18 -0.81 -1.54 -0.72 1.31
CRP49296 (artJ)
-1.01 -0.59 0.02 -2.75 -0.92 0.53 -1.05 -1.68 -1.32 -0.32 -0.29 -0.28 -0.25 -0.1 0.51 -1.1 0.05 -0.73 -0.17 -2.4 -0.03 -0.47 -1.48 -1.91 -0.94 -1.22 -1.72 0.91 0.61 0.7 -1.78 -0.29 -1.54 -0.16 -2.25 0.34 -0.59 -0.84 -0.21 1.08 -1.32 -2.28 -0.77 -0.25 -0.1 3.47 -0.4 1.58 -0.69 -0.42 2.9 -0.83 -1.99 0.34 -0.54 1.06 -1.99 -0.19 -1.48 -2.24 -1.29 -2.37 -0.81 -1.71 -2.13 -0.21 -0.5 -0.33 -0.21 -0.6 0.69 0.7 -0.88 -0.16 0.31 -1.3
CRP50039 (dctP_3)
-0.19 -0.85 -1.22 -1.07 -0.71 1.13 -1.08 -0.18 -1.13 -0.09 0.27 0.35 0.34 1.25 -0.22 1.11 -0.95 -0.12 1.02 0.9 1.38 -0.06 -2.54 -0.38 -1.3 -1.19 -0.54 0.17 0.61 0.26 -0.25 -0.36 -1.47 0.82 -3.43 0.11 -1.08 -0.5 0.77 0.59 0.08 -2.38 -0.68 -1.38 0.61 0.04 -1.29 1.9 -0.88 -1.0 -0.84 1.83 -2.45 0.04 -1.43 -2.19 -0.8 0.14 0.67 -2.73 0.22 -2.58 -0.36 -2.36 -2.23 0.2 0.75 0.12 0.32 -1.26 0.74 -0.55 -0.47 0.59 0.77 -0.41
-0.38 -0.36 -0.47 0.14 1.02 1.06 0.64 -1.16 -1.38 -0.07 -0.21 -0.16 -0.38 0.69 0.37 0.91 0.2 -0.39 -0.97 -0.6 -0.75 -0.66 -1.81 -1.46 0.53 0.31 -0.62 -0.47 -1.0 -0.56 -0.56 0.04 0.02 -0.18 -1.1 0.68 -1.55 -0.92 0.95 0.94 0.36 -0.44 -0.75 -1.9 -0.95 0.99 -0.68 0.56 0.68 -1.65 1.39 -0.05 -0.24 0.04 -0.73 -0.14 0.25 -1.09 0.0 -0.41 -0.17 -0.38 -0.75 -1.79 -1.72 0.19 1.35 0.45 0.57 0.63 0.31 -0.16 -0.5 -0.36 0.93 0.04
CRP52836 (fadD_2)
0.04 -0.82 -0.26 -1.1 -0.67 0.16 -0.09 -0.64 -1.21 0.2 0.7 0.42 0.08 0.44 0.69 -0.29 0.87 0.66 -0.74 -0.96 -0.51 0.23 -1.24 -1.53 -0.17 -0.2 0.21 -0.16 0.62 -0.6 0.05 -0.51 -0.27 0.12 -1.31 0.51 -3.22 -0.12 0.35 0.26 0.02 0.61 -0.93 -3.28 0.08 -0.04 0.43 0.44 -0.05 -3.1 -0.11 0.22 0.42 0.49 0.37 0.52 0.03 -1.32 -0.25 0.39 -0.13 0.49 -0.83 -1.65 -2.39 0.23 0.34 0.5 0.48 0.63 0.67 -0.16 0.54 0.37 0.47 0.39
CRP52898 (ytpA_3)
0.64 -0.92 -0.51 -0.23 1.5 0.33 -0.47 0.16 0.08 -0.07 0.18 0.13 0.14 0.42 -0.19 0.23 0.04 -0.17 -0.3 0.64 0.31 0.04 -1.39 -0.71 0.31 0.25 -0.5 0.47 -0.48 0.71 -0.45 -0.27 -0.96 0.18 -1.34 0.46 -2.39 -0.77 0.31 0.37 -0.7 -1.41 -0.14 -2.68 0.16 -0.3 0.37 0.1 0.05 -2.19 0.15 -1.01 -1.5 0.36 0.56 1.05 0.23 -0.61 -0.68 -1.59 -1.03 -1.5 -0.84 -1.08 -1.41 1.13 1.22 1.09 1.23 -0.19 0.1 -0.33 -0.26 -0.75 0.78 -0.5
CRP52934 (phaJ)
0.31 -0.18 0.12 -0.61 -0.54 0.84 -0.62 0.19 1.23 0.04 0.08 0.05 0.07 0.09 0.18 0.19 0.2 0.15 -0.05 0.01 0.48 -0.03 -1.24 -0.11 0.17 0.13 -0.13 0.87 0.27 1.01 -0.3 0.02 -0.3 0.27 -0.47 0.11 -2.32 -0.63 -0.12 -0.05 -2.09 -2.76 0.01 -2.35 -0.2 -0.16 -0.15 1.04 0.26 -2.24 -0.31 -1.99 -2.74 0.82 -0.15 -0.1 -0.05 0.23 -2.1 -2.72 -2.34 -2.57 -0.16 -0.19 -0.33 0.37 0.16 0.29 0.43 1.04 0.62 0.12 0.03 0.85 0.86 0.3
CRP53099 (puuA_5)
0.62 0.6 -1.14 1.32 0.94 1.71 1.06 2.11 -0.31 -0.29 -0.93 -0.83 -0.75 0.08 -0.19 0.53 -2.74 -1.24 -1.44 -0.18 -1.47 -1.11 -1.62 0.24 0.06 -0.68 -1.05 -0.33 -1.47 0.16 0.16 -0.21 0.76 0.95 -1.55 -0.14 -1.48 -0.5 -0.08 0.08 -1.53 -2.48 -0.27 -1.49 -0.06 0.56 -1.46 -1.93 -1.49 -1.44 -0.59 -2.15 -2.41 -0.84 -1.42 -1.5 -0.15 -0.56 -1.61 -2.84 -1.98 -2.55 -0.4 -0.94 -1.3 0.92 1.52 1.76 1.4 -1.39 1.16 1.53 -1.69 0.57 0.3 0.88
-0.75 -1.38 -1.02 0.07 1.48 0.73 0.39 0.39 0.26 0.11 0.2 0.19 0.01 1.28 0.35 -0.56 1.26 -0.68 -0.6 -0.55 -0.51 0.32 -0.79 -0.2 -0.14 -0.09 -2.16 0.48 -0.9 0.72 -1.84 -0.13 -0.03 0.02 -0.82 1.11 -2.39 -0.73 0.83 0.84 -0.07 -1.16 -0.76 -2.22 -0.38 -0.23 -0.79 0.39 0.53 -2.43 -0.42 -0.32 -1.12 -0.16 -1.04 1.25 0.15 -0.69 -0.34 -1.12 -0.41 -1.04 -0.81 -1.95 -2.07 0.18 0.29 -0.08 0.19 0.92 1.1 -0.3 -0.72 -0.28 0.69 1.04
CRP54914 (prlC)
1.42 0.48 -0.32 -0.6 0.33 0.75 0.12 0.13 -0.34 0.23 0.06 0.04 -0.03 0.79 -0.1 0.61 1.36 0.18 -0.15 -0.29 -0.03 -0.17 -2.08 0.01 -0.77 -0.73 -1.04 -0.08 -0.08 -0.32 -1.0 -0.44 -0.56 -0.16 -1.58 0.32 -1.64 -0.07 0.71 0.56 0.29 -0.12 -0.52 -1.8 -0.76 0.59 -1.13 0.19 0.05 -1.64 0.17 -0.04 -0.09 0.86 -0.97 -0.82 -0.67 -0.66 -0.25 -0.2 0.07 0.02 -0.64 -0.87 -1.41 -0.02 0.3 0.59 0.56 -0.32 0.81 0.65 0.04 0.62 -0.07 -0.13
CRP56454 (pykA)
-0.41 -0.81 -0.28 -0.54 -0.86 0.7 0.47 0.47 -1.03 0.31 0.64 0.68 0.83 0.52 0.31 0.75 1.45 0.65 -0.4 0.27 -0.52 0.48 -2.55 -1.04 -1.03 -0.99 -0.38 0.36 0.38 -0.14 -0.29 -0.5 -1.44 0.12 -1.55 0.36 -2.95 -0.56 0.86 0.58 0.45 0.05 -1.55 -3.0 -0.57 -0.54 -0.54 0.47 0.07 -2.91 -1.07 0.1 -0.12 0.87 -0.46 -0.99 0.4 -1.28 -0.13 -0.14 -0.51 -0.27 -0.55 -3.0 -2.74 0.66 0.26 0.46 0.48 -0.38 0.96 0.08 0.38 0.44 0.24 0.99
CRP56781 (sbcB)
0.78 -0.35 -0.67 -0.52 -0.07 0.39 -0.16 0.18 -0.82 0.25 0.59 0.72 0.73 1.1 0.65 0.81 0.18 -0.0 -0.13 0.88 0.19 0.44 -1.35 -0.44 -0.71 -0.32 -0.09 0.48 -0.13 0.14 0.07 -0.39 -0.44 0.26 -1.0 0.53 -1.97 -0.5 0.18 0.34 0.24 -0.21 -0.85 -2.17 0.01 -0.14 -0.68 0.25 0.15 -2.0 0.2 -0.08 -0.41 0.4 -0.66 -0.53 0.16 -0.97 -0.26 -0.35 -0.3 -0.35 -0.76 -1.29 -1.79 0.66 0.56 0.69 0.39 0.42 0.16 -0.42 -0.1 -0.99 0.34 0.15
CRP57493 (glnS)
0.47 -0.46 -0.56 -0.78 -0.16 0.44 0.27 -0.79 -0.85 0.23 0.03 0.05 -0.07 0.17 0.02 0.75 0.68 0.78 -0.44 -0.76 -0.19 -0.06 -2.01 -0.39 -1.06 -0.86 0.19 -0.49 0.26 -0.88 0.38 -0.6 -1.29 0.45 -1.41 0.23 -3.64 -0.32 0.71 0.57 0.62 0.71 -0.54 -3.6 -0.24 -0.19 0.78 0.22 0.12 -3.59 -0.23 0.56 0.68 0.46 0.8 -0.03 -0.33 -1.57 0.26 0.62 0.44 0.56 -0.96 -1.79 -1.97 0.78 0.38 0.38 0.51 0.12 0.6 -0.08 0.6 -1.17 -0.51 0.17
CRP69507 (qorA_6)
0.44 -0.63 -0.31 0.15 0.44 0.76 -0.3 -0.66 0.73 0.31 -0.12 -0.06 -0.2 0.46 -0.02 0.67 -0.08 -0.6 -0.21 -0.54 -0.11 -0.46 -1.48 0.51 -0.09 -0.41 -0.83 0.28 -0.55 0.39 -0.66 0.03 0.27 0.05 -1.2 0.91 -2.33 -0.91 0.34 0.47 -0.61 -2.04 0.14 -2.51 -0.3 1.12 -0.88 0.84 0.47 -2.28 1.06 -0.8 -1.91 0.18 -0.74 -1.15 -0.12 0.47 -0.73 -2.09 -0.73 -2.02 -0.13 -0.41 -0.14 0.03 0.87 0.29 0.7 -0.31 0.93 0.79 -0.66 1.01 0.52 0.47
-0.04 -1.0 -1.4 -0.9 -0.26 -0.23 1.1 0.78 -1.41 -0.11 -0.02 0.03 0.02 0.49 0.91 -1.36 -1.23 -0.65 -0.27 1.34 0.23 -0.16 -2.09 -0.3 0.45 0.32 -0.52 -0.03 -0.36 -0.1 -0.55 -0.23 0.24 -1.42 -0.08 2.45 -0.83 -0.92 1.95 2.41 -0.75 -1.89 -1.45 -0.37 -0.27 -2.02 -0.98 -1.16 -0.96 -0.58 -2.31 -1.2 -1.58 -1.19 -0.98 2.1 0.54 -0.78 -1.2 -1.53 -1.39 -2.09 -0.58 -1.38 -1.4 -1.33 -0.9 -0.56 -1.03 -0.23 0.15 -1.0 -0.68 0.62 0.25 1.35
CRP69851 (glyQ)
0.48 -1.14 -1.58 -2.02 -0.93 0.42 0.09 -0.58 -1.66 0.24 -0.49 -0.56 -0.69 0.75 0.73 0.28 0.39 1.07 -0.77 -0.6 -0.51 -0.58 -3.2 -1.17 -0.99 -0.63 0.03 -0.59 0.28 -1.78 -0.01 -0.59 -2.94 0.1 -1.89 0.27 -4.74 -0.42 0.89 1.05 0.8 1.66 -1.28 -4.95 -0.16 -3.34 -0.07 0.19 -0.11 -4.62 -2.89 1.05 1.65 0.55 -0.11 -0.71 0.0 -2.89 0.19 1.67 0.24 1.62 -1.24 -3.94 -4.22 0.36 0.61 0.29 0.58 0.39 0.74 -0.66 0.94 -1.81 -0.74 0.99
-0.18 -0.84 -0.21 -0.65 0.64 0.45 -1.15 -1.91 -0.69 0.22 0.67 0.84 0.76 0.24 0.49 0.37 0.81 -0.01 0.4 -0.76 0.43 0.44 -1.51 -0.9 -0.59 -0.23 -0.81 -0.27 -0.21 -0.77 -0.11 -0.3 -0.7 0.41 -1.77 0.71 -1.7 -0.18 0.85 0.92 0.46 -0.18 -1.75 -1.91 -0.07 0.91 -0.55 0.73 -0.47 -1.79 0.15 0.4 0.14 0.2 -0.25 0.21 0.07 -0.09 0.0 -0.02 -0.0 -0.04 -0.56 -1.4 -1.47 0.53 0.73 0.49 0.46 -0.72 0.24 0.43 -0.07 -0.79 0.61 -1.15
0.48 -0.94 -0.3 -0.83 0.51 1.01 -0.18 -1.6 -1.6 0.24 0.55 0.67 0.56 1.07 0.71 0.2 0.67 0.1 0.62 -1.38 0.74 0.29 -1.72 -1.32 -0.32 -0.1 -1.34 -0.12 -0.52 -0.78 -0.93 -0.56 -0.85 0.58 -2.72 0.66 -3.59 -0.52 0.48 0.88 0.21 0.06 -1.94 -3.46 -0.13 0.73 -0.52 0.43 -0.21 -3.24 0.76 0.36 0.2 0.47 -0.5 0.23 -0.15 -0.96 -0.03 0.07 -0.14 0.11 -1.0 -1.43 -1.96 0.74 1.06 0.8 0.76 -0.5 0.69 0.16 -0.06 -1.77 0.18 -0.91
CRP77149 (pal)
-0.45 -0.42 0.59 0.12 -1.83 1.06 0.3 -0.32 -0.82 0.24 -0.13 -0.11 -0.12 0.53 0.68 -0.13 0.15 0.72 -0.01 -0.23 -0.22 -0.14 -1.78 -1.23 0.31 0.91 0.47 -0.39 0.47 -1.02 0.4 -0.02 -1.1 0.68 -0.49 -0.18 -1.89 -0.65 0.22 0.57 -1.85 -1.77 -1.04 -1.94 -0.6 0.68 0.66 0.96 0.26 -1.92 0.95 -1.35 -1.86 0.73 0.71 -0.29 0.15 -1.01 -2.5 -1.89 -2.48 -1.58 -0.26 -1.74 -1.11 0.67 0.08 0.53 0.3 0.73 0.91 -0.24 0.67 0.83 -0.25 0.94
CRP79055 (psaB)
0.16 0.42 -0.02 -0.9 -0.54 1.54 -0.13 0.5 -0.49 0.21 0.58 0.52 0.38 1.0 -0.35 0.0 1.18 -0.87 0.03 -0.7 0.16 0.84 -1.65 0.64 -0.6 -0.46 -1.25 0.1 -0.83 -0.4 -1.17 -0.42 -1.12 0.63 -1.95 1.62 -2.25 -0.99 1.67 1.87 -0.3 -1.76 0.25 -1.99 -0.0 -1.57 -1.07 0.87 -0.12 -2.16 -1.99 -0.8 -1.99 -0.5 -1.16 -0.23 -0.56 -0.88 -0.63 -1.95 -0.74 -1.88 -0.91 -1.71 -0.76 0.19 -0.47 -0.34 -0.85 0.45 2.21 -0.27 -0.92 -1.71 -0.13 1.07
CRP80364 (braC)
-1.21 -0.79 -0.86 -1.38 -0.49 0.74 -0.47 -1.01 -1.19 -0.68 -1.11 -0.94 -0.94 -0.32 0.33 -0.71 0.38 -0.59 -0.23 -2.45 -0.25 -1.01 -2.76 -2.16 -1.6 -1.12 0.89 2.07 2.2 2.13 0.98 -0.65 -1.48 -0.24 -2.85 0.61 -0.61 -0.75 0.59 1.12 0.71 0.23 -0.86 -0.74 -0.56 0.81 -0.62 0.82 -0.51 -0.41 -0.09 1.0 0.13 0.6 -0.61 -0.32 -1.4 0.55 0.53 0.29 0.37 -0.12 -0.52 -1.0 -1.03 -0.66 -0.72 -0.79 -0.38 -0.84 0.88 -0.71 -0.77 -0.05 -0.24 -0.65
CRP80448 (lptB_3)
-0.64 -1.23 -0.01 -1.89 -0.58 -0.22 -1.46 -2.25 -2.68 -0.39 -0.65 -0.39 -0.6 -0.24 0.2 -0.96 0.41 0.24 -0.7 -1.83 -0.78 -0.97 -2.96 -2.52 -1.16 -0.76 1.33 1.39 1.77 1.28 1.54 -0.94 -1.75 -0.17 -3.66 0.54 -2.29 -0.34 0.84 1.77 1.19 0.85 -1.73 -2.11 -0.86 0.63 -0.08 0.13 -1.01 -2.05 -0.15 1.56 0.78 0.67 -0.36 0.73 -1.13 0.02 0.66 0.72 0.71 0.61 -0.87 -1.42 -1.59 -0.35 -0.29 -0.53 -0.04 -1.11 0.54 -0.55 -0.05 -0.85 0.01 -1.42
CRP80477 (livF_3)
-0.7 -0.09 0.8 -2.29 -0.81 0.26 -1.0 -2.0 -2.4 -0.26 -0.52 -0.21 -0.34 -0.2 0.94 -0.42 0.55 0.31 -0.49 -1.75 -0.56 -0.81 -1.69 -2.14 -0.55 0.06 1.62 1.45 1.72 1.17 1.72 -0.32 -1.11 -0.78 -2.48 1.06 -2.21 0.1 1.33 1.74 0.04 -0.27 -1.6 -2.22 -0.68 1.38 0.29 0.08 -1.51 -2.17 0.4 0.41 -0.26 0.47 0.31 -3.13 -0.75 0.48 -0.53 -0.26 -0.52 -0.42 -0.51 -0.98 -0.82 -0.99 -0.95 -0.38 -0.79 -1.38 0.29 -0.25 0.17 0.19 -0.25 -0.75
CRP81507 (yfcG_5)
-0.08 -0.5 -0.67 0.48 0.46 0.29 -0.08 -0.12 -0.17 0.3 0.05 0.09 0.12 0.91 -0.23 -0.0 0.81 -0.35 1.01 0.63 1.1 0.12 -1.83 0.27 -0.74 -0.79 -0.95 0.79 -0.71 0.85 -0.73 -0.15 -0.98 0.08 -1.49 0.77 0.68 -0.97 -0.08 -0.03 -0.77 -1.78 0.25 0.15 -0.04 -1.13 -1.58 0.91 0.73 0.63 -1.44 -0.95 -1.97 -0.48 -1.52 -1.01 -0.8 0.94 -0.58 -1.98 -0.87 -1.95 0.51 -0.04 -0.31 0.26 0.66 0.28 0.04 -0.27 0.26 0.99 -0.54 -0.65 0.26 0.37
0.59 -0.78 -0.86 -0.75 -1.05 1.53 0.19 -0.47 -1.62 -0.33 -0.12 -0.04 -0.2 -0.15 0.48 0.4 -0.69 0.21 -0.78 -0.93 -0.63 -0.33 -2.33 -1.24 0.11 0.37 -0.06 -1.32 -0.58 -1.65 0.01 -0.66 -0.51 0.34 -1.65 -0.05 -5.53 -0.18 0.7 0.92 1.46 1.31 -1.47 -5.71 -1.02 -0.29 -0.59 -0.05 -0.44 -5.43 -0.04 1.53 1.29 0.39 -0.54 -1.22 0.57 -2.26 1.06 1.3 0.9 1.41 -1.42 -3.01 -2.7 0.56 -0.01 0.14 0.16 -0.31 0.8 -0.18 0.17 -1.33 -0.55 0.34
CRP82362 (yfgC_3)
0.92 -0.64 -0.26 -0.27 0.35 0.77 0.7 -0.22 -0.18 0.08 0.13 0.27 0.17 0.69 0.46 0.54 0.56 -0.52 -0.1 -0.23 0.28 0.11 -0.55 -0.19 0.12 0.1 -0.62 0.06 -0.54 -0.15 -0.25 -0.25 -0.02 0.39 -0.94 1.07 -3.33 -0.89 0.93 1.03 -0.02 -1.21 -0.66 -3.3 -0.18 0.59 -1.4 0.26 0.18 -3.4 0.96 -0.33 -1.26 0.15 -1.17 0.43 0.43 -0.74 -0.17 -1.38 -0.06 -1.36 -0.94 -1.01 -1.29 0.63 0.46 0.25 0.27 0.05 0.71 0.18 -0.68 -0.76 0.09 0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.