1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL16916 (recF)
 0.08 0.02 0.12 0.06 0.1 0.31 0.77 0.03 0.05 0.93 0.91 0.88 0.95 0.17 0.03 1.0 0.24 0.07 0.51 0.16 0.07 0.18 0.44 0.21 0.52 0.06 0.06 0.43 0.83
CCL17004 (BN171_1070006)
 0.35 0.21 0.34 0.12 0.49 0.2 0.44 0.78 0.66 0.79 1.0 0.93 0.97 0.3 0.13 0.4 0.47 0.47 0.33 0.39 0.07 0.68 0.26 0.71 0.53 0.3 0.08 0.15 0.92
CCL17005 (BN171_1070007)
 0.16 0.08 0.15 0.07 0.25 0.15 0.41 0.24 0.27 0.82 0.93 0.87 0.74 0.16 0.06 0.38 0.34 0.22 0.25 0.21 0.05 0.46 0.2 0.61 0.47 0.18 0.08 0.21 1.0
CCL17008 (BN171_1070010)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.98 0.0 0.47 0.93 0.66 0.64 1.0 0.01 0.0 0.35 0.13 0.0 0.29 0.0 0.01 0.08 0.55 0.07 0.03 0.0 0.13 0.26 0.75
CCL17016 (BN171_1080008)
 0.19 0.04 0.52 0.39 0.27 0.27 0.37 0.06 0.35 1.0 0.38 0.59 0.61 0.31 0.06 0.7 0.17 0.11 0.43 0.48 0.2 0.15 0.35 0.33 0.28 0.13 0.03 0.32 0.24
CCL17017 (BN171_1080009)
 0.19 0.08 0.34 0.27 0.2 0.44 1.0 0.1 0.34 0.86 0.84 0.97 0.69 0.23 0.08 0.91 0.16 0.11 0.59 0.27 0.14 0.15 0.45 0.46 0.32 0.13 0.07 0.42 0.44
CCL17062 (BN171_1170004)
 0.05 0.03 0.72 0.26 0.28 0.37 1.0 0.03 0.23 0.91 0.7 0.9 0.75 0.23 0.07 0.73 0.22 0.09 0.28 0.61 0.61 0.04 0.48 0.32 0.33 0.13 0.05 0.69 0.92
CCL17198 (BN171_140001)
 0.02 0.01 0.07 0.01 0.04 0.43 0.81 0.02 0.35 0.91 0.74 0.82 0.92 0.14 0.01 1.0 0.13 0.02 0.5 0.08 0.03 0.03 0.43 0.05 0.16 0.02 0.04 0.27 0.76
CCL17235 (BN171_1400007)
 0.26 0.19 0.26 0.15 0.18 0.18 0.89 0.16 1.0 0.71 0.47 0.66 0.75 0.27 0.12 0.64 0.34 0.21 0.18 0.33 0.18 0.4 0.22 0.24 0.32 0.18 0.33 0.28 0.42
CCL17277 (BN171_1430004)
 0.14 0.22 0.43 0.87 0.32 0.11 0.23 0.24 0.43 0.15 0.27 0.31 1.0 0.14 0.22 0.8 0.41 0.2 0.19 0.16 0.15 0.24 0.2 0.37 0.39 0.1 0.2 0.4 0.28
CCL17325 (BN171_1440009)
 0.05 0.01 0.08 0.05 0.07 0.13 0.7 0.02 0.19 1.0 0.48 0.5 0.76 0.07 0.02 0.41 0.2 0.04 0.17 0.1 0.05 0.08 0.4 0.19 0.22 0.05 0.07 0.57 0.33
CCL17390 (BN171_1480002)
 0.54 0.22 0.37 0.25 0.19 0.1 0.43 0.29 0.52 0.47 0.33 0.31 0.83 0.43 0.15 1.0 0.7 0.22 0.12 0.12 0.05 0.0 0.15 0.09 0.1 0.08 0.04 0.0 0.23
CCL17424 (BN171_150011)
 0.05 0.03 0.08 0.05 0.05 0.06 0.69 0.02 0.1 1.0 0.82 0.64 0.32 0.08 0.03 0.18 0.03 0.05 0.13 0.09 0.15 0.04 0.12 0.18 0.13 0.03 0.04 0.1 0.4
CCL17503 (BN171_1520021)
 0.1 0.23 0.1 0.21 0.09 0.26 0.9 0.08 0.53 1.0 0.91 0.83 0.55 0.11 0.28 0.52 0.31 0.13 0.38 0.17 0.31 0.25 0.27 0.26 0.34 0.07 0.3 0.27 0.87
CCL17593 (BN171_160009)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.41 0.17 0.59 0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0
CCL17600 (BN171_1600004)
 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.24 0.74 0.01 0.01 0.61 0.76 0.56 0.56 0.06 0.01 1.0 0.05 0.01 0.1 0.01 0.01 0.01 0.27 0.02 0.04 0.0 0.06 0.11 0.97
CCL17603 (BN171_1600007)
 0.13 0.05 0.19 0.21 0.14 0.09 0.48 0.04 0.46 0.21 0.34 0.3 1.0 0.19 0.07 0.64 0.29 0.09 0.25 0.11 0.09 0.09 0.67 0.55 0.27 0.04 0.17 0.69 0.28
CCL17645 (BN171_1640035)
 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.03 0.13 0.8 0.77 0.85 0.29 0.1 0.04 0.02 0.59 0.04 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.98
CCL17711 (cfa)
 0.17 0.06 0.13 0.06 0.05 0.12 0.13 0.03 0.54 0.15 0.15 0.12 0.48 0.16 0.09 0.29 0.07 0.09 0.24 0.14 0.06 1.0 0.15 0.62 0.2 0.04 0.11 0.11 0.1
CCL17715 (BN171_1700002)
 0.22 0.28 0.36 0.48 0.39 0.4 0.9 0.19 0.47 1.0 0.74 0.9 0.82 0.32 0.38 0.56 0.37 0.33 0.49 0.35 0.57 0.74 0.63 0.92 0.56 0.21 0.44 0.62 0.59
CCL17760 (sigV)
 0.24 0.3 0.2 0.15 0.14 0.53 0.8 0.22 0.2 1.0 0.72 0.87 0.88 0.31 0.17 0.63 0.29 0.22 0.31 0.29 0.15 0.1 0.36 0.34 0.33 0.12 0.06 0.19 0.74
CCL17761 (BN171_1770005)
 0.14 0.09 0.23 0.13 0.15 0.36 0.86 0.06 0.13 1.0 0.9 0.96 0.96 0.32 0.09 0.86 0.3 0.14 0.3 0.15 0.1 0.11 0.45 0.31 0.32 0.06 0.06 0.25 0.89
CCL17802 (BN171_1810009)
 0.01 0.06 0.08 0.14 0.08 0.03 1.0 0.02 0.46 0.89 0.78 0.65 0.75 0.05 0.05 0.72 0.6 0.02 0.13 0.02 0.03 0.06 0.07 0.12 0.17 0.0 0.41 0.15 0.51
CCL17803 (BN171_1810010)
 0.03 0.02 0.14 0.12 0.08 0.17 1.0 0.0 0.29 0.67 0.67 0.68 0.44 0.11 0.04 0.44 0.18 0.03 0.16 0.03 0.08 0.0 0.22 0.15 0.22 0.07 0.18 0.16 0.33
CCL17855 (BN171_1840015)
 0.1 0.21 0.08 0.24 0.12 0.14 0.56 0.13 0.38 1.0 0.75 0.91 0.47 0.12 0.17 0.53 0.22 0.13 0.14 0.14 0.22 0.08 0.11 0.17 0.21 0.12 0.07 0.12 0.61
CCL17947 (BN171_1970016)
 0.14 0.15 0.17 0.12 0.15 0.46 0.85 0.16 0.26 0.82 0.72 0.82 0.89 0.26 0.16 1.0 0.31 0.22 0.22 0.2 0.18 0.15 0.21 0.43 0.38 0.09 0.03 0.23 0.92
CCL17972 (BN171_1990001)
 0.04 0.03 0.12 0.22 0.08 0.02 0.12 0.01 1.0 0.13 0.1 0.09 0.34 0.03 0.03 0.14 0.38 0.03 0.06 0.02 0.03 0.02 0.09 0.1 0.06 0.01 0.02 0.11 0.09
CCL17973 (BN171_1990002)
 0.09 0.05 0.31 1.0 0.31 0.01 0.08 0.02 0.41 0.09 0.07 0.07 0.26 0.08 0.07 0.06 0.21 0.04 0.05 0.04 0.09 0.01 0.07 0.04 0.03 0.02 0.01 0.08 0.08
CCL17974 (BN171_1990003)
 0.02 0.0 0.05 0.19 0.04 0.01 0.21 0.0 0.86 0.27 0.13 0.24 1.0 0.03 0.01 0.22 0.35 0.01 0.08 0.0 0.04 0.04 0.12 0.05 0.04 0.0 0.03 0.18 0.26
CCL17975 (BN171_1990004)
 0.03 0.02 0.13 0.38 0.1 0.03 0.14 0.0 0.49 0.24 0.16 0.19 1.0 0.04 0.02 0.21 0.36 0.01 0.08 0.02 0.05 0.04 0.13 0.06 0.05 0.0 0.03 0.15 0.13
CCL17978 (BN171_1990007)
 0.02 0.01 0.13 0.26 0.07 0.25 0.91 0.01 0.36 1.0 0.73 0.82 0.97 0.03 0.01 0.56 0.3 0.02 0.29 0.01 0.05 0.02 0.41 0.12 0.17 0.01 0.06 0.49 0.54
CCL18055 (BN171_2080001)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.87 0.0 0.05 0.96 1.0 0.72 0.67 0.01 0.0 0.54 0.1 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.26 0.07 0.08 0.0 0.0 0.39 1.0
CCL18107 (BN171_210043)
 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.0 0.38 0.0 0.06 1.0 0.72 0.33 0.35 0.03 0.02 0.29 0.27 0.03 0.08 0.0 0.01 0.0 0.05 0.12 0.15 0.0 0.04 0.04 0.67
CCL18186 (BN171_2140028)
 0.21 0.17 0.23 0.33 0.32 0.38 0.55 0.22 0.52 0.59 0.56 0.61 0.92 0.17 0.19 0.65 0.44 0.3 0.44 0.24 0.19 1.0 0.42 0.57 0.41 0.22 0.22 0.56 0.54
CCL18218 (BN171_2170005)
 0.09 0.01 0.19 0.28 0.16 0.1 0.71 0.01 0.72 0.67 0.85 0.55 1.0 0.19 0.03 0.38 0.21 0.05 0.26 0.1 0.09 0.08 0.29 0.2 0.17 0.02 0.06 0.42 0.48
CCL18358 (BN171_2230008)
 0.31 0.01 0.15 0.03 0.02 0.16 0.36 0.01 0.03 1.0 0.64 0.39 0.69 0.24 0.01 0.38 0.06 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.14 0.63
CCL18382 (BN171_2270005)
 0.02 0.01 0.09 0.03 0.04 0.25 0.52 0.01 0.2 1.0 0.73 0.77 0.76 0.06 0.01 0.65 0.38 0.03 0.2 0.02 0.02 0.01 0.39 0.2 0.44 0.01 0.1 0.2 0.59
CCL18458 (BN171_2350010)
 0.44 0.08 0.41 0.26 0.33 0.24 0.2 0.36 0.11 0.2 0.77 0.09 0.91 0.66 0.08 0.91 0.15 0.52 0.43 0.59 0.13 0.9 0.36 0.9 0.57 0.35 0.29 0.43 1.0
CCL18547 (BN171_2420014)
 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.13 0.32 0.01 0.03 0.78 0.81 0.46 0.39 0.01 0.0 0.43 0.13 0.01 0.11 0.01 0.0 0.03 0.16 0.09 0.06 0.0 0.03 0.14 1.0
CCL18640 (BN171_2480015)
 0.3 0.04 0.44 0.15 0.22 0.26 0.51 0.06 0.17 0.53 0.54 0.41 0.72 0.4 0.09 1.0 0.36 0.12 0.21 0.84 0.19 0.22 0.24 0.4 0.53 0.15 0.16 0.45 0.51
CCL18695 (BN171_2520002)
 0.06 0.05 0.37 0.44 0.23 0.39 0.57 0.03 1.0 0.62 0.51 0.47 0.75 0.13 0.21 0.27 0.37 0.11 0.41 0.05 0.04 0.41 0.49 0.33 0.27 0.04 0.28 0.0 0.24
CCL18764 (BN171_2610004)
 0.11 0.03 0.12 0.08 0.14 0.24 0.54 0.07 0.25 1.0 0.75 0.82 0.45 0.14 0.07 0.84 0.24 0.15 0.16 0.17 0.08 0.1 0.17 0.26 0.29 0.11 0.03 0.14 0.68
CCL18847 (recO)
 0.07 0.06 0.07 0.04 0.03 0.26 1.0 0.04 0.08 0.84 0.7 0.66 0.75 0.1 0.04 0.52 0.21 0.04 0.3 0.08 0.06 0.04 0.49 0.19 0.27 0.03 0.35 0.62 0.7
CCL18852 (BN171_2690009)
 0.12 0.11 0.07 0.09 0.06 0.19 1.0 0.09 0.31 0.74 0.76 0.65 0.73 0.09 0.12 0.71 0.24 0.15 0.3 0.09 0.1 0.48 0.39 0.53 0.62 0.09 0.2 0.58 0.77
CCL18898 (BN171_2710003)
 0.03 0.01 0.07 0.04 0.06 0.39 0.56 0.04 0.09 0.59 0.67 0.86 0.63 0.06 0.02 0.95 0.17 0.04 0.16 0.06 0.03 0.04 0.44 0.27 0.17 0.05 0.23 0.18 1.0
CCL19025 (BN171_2800004)
 0.26 0.31 0.39 1.0 0.38 0.09 0.35 0.1 0.92 0.26 0.22 0.18 0.79 0.22 0.25 0.33 0.25 0.15 0.17 0.32 0.56 0.31 0.32 0.22 0.15 0.12 0.2 0.27 0.13
CCL19026 (BN171_2810001)
 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.06 0.73 0.01 0.1 1.0 0.79 0.58 0.36 0.02 0.02 0.32 0.18 0.01 0.16 0.02 0.06 0.02 0.2 0.08 0.08 0.02 0.05 0.32 0.57
CCL19074 (BN171_2870004)
 0.2 0.35 0.28 0.35 0.26 0.28 0.18 0.19 0.1 0.23 0.28 0.48 0.94 0.22 0.54 1.0 0.26 0.34 0.08 0.32 0.32 0.19 0.01 0.17 0.48 0.26 0.05 0.31 0.28
CCL19137 (BN171_2880004)
 0.21 0.22 0.26 0.3 0.3 0.48 0.34 0.24 0.59 0.36 0.38 0.35 0.99 0.24 0.28 0.69 0.24 0.27 0.27 0.52 0.2 0.1 0.54 1.0 0.47 0.33 0.32 0.32 0.28
CCL19319 (BN171_3020031)
 0.27 0.09 0.35 0.5 0.31 0.33 0.45 0.23 1.0 0.37 0.47 0.41 0.96 0.23 0.07 0.75 0.23 0.25 0.35 0.32 0.12 0.85 0.8 0.79 0.49 0.18 0.25 0.36 0.29
CCL19320 (BN171_3020032)
 0.15 0.08 0.27 0.31 0.21 0.09 0.3 0.2 0.69 0.33 0.27 0.27 0.45 0.22 0.05 0.35 0.18 0.15 0.18 0.18 0.08 1.0 0.41 0.27 0.19 0.11 0.05 0.17 0.23
CCL19340 (BN171_3070006)
 0.02 0.02 0.23 0.32 0.15 0.21 0.37 0.01 0.82 0.47 0.45 0.43 1.0 0.03 0.02 0.56 0.19 0.01 0.24 0.03 0.06 0.12 0.28 0.11 0.11 0.01 0.05 0.36 0.32
CCL19397 (BN171_3100003)
 0.32 0.11 0.34 0.12 0.15 0.32 1.0 0.19 0.36 0.6 0.6 0.58 0.8 0.33 0.13 1.0 0.21 0.26 0.37 0.73 0.19 0.58 0.43 0.68 0.4 0.28 0.32 0.25 0.39
CCL19493 (BN171_3180017)
 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.08 0.54 0.0 0.02 1.0 0.53 0.49 0.22 0.0 0.01 0.29 0.13 0.01 0.12 0.01 0.07 0.03 0.14 0.06 0.03 0.01 0.04 0.21 0.49
CCL19508 (BN171_3180032)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.32 1.0 0.75 0.62 0.02 0.0 0.46 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91
CCL19540 (bglG)
 0.07 0.01 0.15 0.03 0.12 0.63 0.33 0.12 0.11 0.65 0.61 1.0 0.37 0.11 0.03 0.7 0.12 0.1 0.49 0.41 0.04 0.12 0.47 0.34 0.29 0.23 0.01 0.33 0.4
CCL19902 (BN171_3590023)
 0.26 0.15 0.28 0.36 0.25 0.47 0.34 0.15 1.0 0.51 0.42 0.39 0.72 0.28 0.28 0.81 0.26 0.34 0.48 0.48 0.29 0.32 0.53 0.47 0.48 0.38 0.12 0.27 0.36
CCL19972 (BN171_3610015)
 0.03 0.0 0.08 0.07 0.05 0.51 0.52 0.02 0.11 0.72 0.57 0.4 0.63 0.1 0.02 1.0 0.17 0.04 0.36 0.06 0.05 0.19 0.35 0.23 0.37 0.05 0.06 0.36 0.29
CCL20001 (phnI)
 0.08 0.11 0.13 0.15 0.13 0.25 0.47 0.07 0.45 0.74 0.49 0.6 0.61 0.06 0.14 1.0 0.16 0.1 0.59 0.24 0.21 0.32 0.58 0.22 0.3 0.19 0.12 0.0 0.11
CCL20002 (phnH)
 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.23 0.75 0.0 0.84 0.76 0.55 0.64 1.0 0.0 0.03 1.0 0.16 0.0 0.63 0.02 0.09 0.13 0.61 0.29 0.39 0.0 0.11 0.0 0.0
CCL20003 (phnG)
 0.11 0.02 0.14 0.04 0.21 0.67 0.26 0.03 0.67 0.11 0.22 0.73 0.68 0.26 0.08 1.0 0.15 0.07 0.48 0.72 0.51 0.44 0.49 0.3 0.51 0.28 0.08 0.02 0.0
CCL20141 (BN171_3700002)
 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.13 0.38 0.01 0.01 0.53 0.55 0.9 0.73 0.02 0.01 0.38 0.1 0.01 0.19 0.0 0.0 0.01 0.22 0.02 0.03 0.0 0.02 0.32 1.0
CCL20272 (BN171_3990001)
 0.02 0.0 0.13 0.16 0.04 0.0 0.25 0.02 1.0 0.04 0.62 0.49 0.39 0.03 0.04 0.17 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28
CCL20622 (BN171_750006)
 0.07 0.01 0.1 0.07 0.04 0.09 0.15 0.01 0.07 0.31 0.3 0.49 1.0 0.08 0.03 0.94 0.19 0.07 0.23 0.04 0.02 0.0 0.24 0.3 0.27 0.0 0.05 0.05 0.48
CCL20634 (cdu)
 0.54 0.18 0.47 0.44 0.5 0.46 0.48 0.32 0.59 0.53 0.38 0.43 0.81 0.32 0.19 0.46 0.33 0.41 0.63 0.56 0.16 0.75 1.0 0.64 0.48 0.29 0.22 0.0 0.21
CCL20710 (BN171_960002)
 0.05 0.02 0.08 0.06 0.07 0.28 0.58 0.02 0.04 1.0 0.92 0.87 0.76 0.1 0.03 0.76 0.18 0.06 0.3 0.05 0.05 0.05 0.38 0.09 0.23 0.02 0.03 0.35 0.73

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)