1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL16919 (BN171_10007)
 0.6 0.37 0.67 0.47 1.0 0.21 0.53 0.32 0.22 0.68 0.59 0.65 0.46 0.81 0.51 0.45 0.33 0.49 0.5 0.54 0.26 0.36 0.36 0.22 0.19 0.31 0.12 0.19 0.48
CCL16922 (rsbW)
 0.59 0.45 0.59 0.5 0.56 0.2 0.58 0.46 0.2 0.53 0.42 0.5 0.5 1.0 0.52 0.6 0.15 0.48 0.35 0.47 0.39 0.24 0.24 0.3 0.26 0.3 0.15 0.3 0.47
CCL16923 (sigB)
 0.54 0.43 0.44 0.38 0.44 0.29 0.9 0.5 0.29 1.0 0.76 0.89 0.79 0.55 0.44 0.98 0.3 0.46 0.41 0.33 0.26 0.61 0.29 0.52 0.42 0.25 0.25 0.47 0.75
CCL17000 (BN171_1070002)
 0.51 0.96 0.32 0.29 0.6 0.17 1.0 0.44 0.13 0.77 0.67 0.54 0.62 0.51 0.65 0.94 0.3 0.48 0.1 0.62 0.2 0.17 0.12 0.13 0.33 0.71 0.19 0.47 0.64
CCL17031 (BN171_1090012)
 1.0 0.22 0.83 0.51 0.48 0.25 0.63 0.35 0.66 0.68 0.4 0.53 0.73 0.87 0.36 0.8 0.39 0.88 0.42 0.85 0.35 0.39 0.51 0.48 0.43 0.36 0.17 0.82 0.46
CCL17032 (BN171_1090013)
 0.5 0.19 0.52 0.31 0.34 0.23 1.0 0.3 0.4 0.88 0.69 0.71 0.7 0.58 0.34 0.69 0.32 0.46 0.34 0.56 0.23 0.76 0.4 0.36 0.33 0.24 0.28 0.58 0.59
CCL17174 (BN171_1330035)
 0.58 0.22 0.58 0.57 0.87 0.09 0.78 0.63 0.11 0.52 0.52 0.61 0.79 0.54 0.21 1.0 0.31 0.51 0.19 0.09 0.08 0.26 0.7 0.2 0.09 0.08 0.16 0.22 0.56
CCL17175 (BN171_1330036)
 0.28 0.06 0.35 0.32 0.32 0.1 0.82 0.11 0.14 0.71 0.62 0.63 1.0 0.27 0.08 0.82 0.26 0.22 0.16 0.06 0.06 0.11 0.63 0.14 0.11 0.04 0.23 0.18 0.65
CCL17176 (BN171_1330037)
 0.1 0.06 0.21 0.2 0.21 0.04 1.0 0.08 0.15 0.62 0.53 0.52 0.94 0.21 0.05 0.61 0.26 0.11 0.17 0.1 0.14 0.48 0.57 0.16 0.16 0.03 0.3 0.23 0.46
CCL17177 (mnaA)
 0.32 0.17 0.33 0.49 0.37 0.1 1.0 0.19 0.2 0.34 0.34 0.51 0.65 0.27 0.18 0.44 0.19 0.28 0.16 0.13 0.25 0.51 0.38 0.16 0.15 0.09 0.23 0.13 0.36
CCL17278 (polA)
 0.77 0.28 0.58 0.33 0.48 0.39 1.0 0.38 0.2 0.75 0.6 0.63 0.82 0.8 0.27 0.89 0.31 0.47 0.26 0.39 0.18 0.39 0.36 0.34 0.39 0.25 0.39 0.21 0.52
CCL17280 (BN171_1430007)
 0.7 0.25 0.54 0.29 0.44 0.57 1.0 0.32 0.14 0.71 0.65 0.62 0.9 0.69 0.29 0.94 0.32 0.39 0.31 0.32 0.17 0.48 0.43 0.34 0.37 0.23 0.43 0.21 0.38
CCL17281 (BN171_1430008)
 0.57 0.26 0.43 0.25 0.35 0.35 1.0 0.32 0.11 0.82 0.62 0.69 0.76 0.51 0.24 0.81 0.28 0.33 0.23 0.27 0.11 0.34 0.36 0.34 0.36 0.19 0.48 0.26 0.55
CCL17490 (BN171_1520008)
 0.42 0.15 0.47 0.23 0.25 0.51 1.0 0.15 0.21 0.59 0.4 0.47 0.78 0.4 0.12 0.77 0.21 0.25 0.29 0.39 0.12 0.27 0.6 0.23 0.39 0.14 0.36 0.31 0.35
CCL17492 (dapG)
 0.88 0.29 0.65 0.42 0.45 0.54 1.0 0.36 0.05 0.6 0.46 0.52 0.63 0.53 0.25 0.75 0.22 0.52 0.3 0.59 0.16 0.82 0.47 0.27 0.47 0.38 0.33 0.29 0.41
CCL17493 (tepA)
 0.86 0.32 0.68 0.47 0.53 0.57 1.0 0.36 0.04 0.59 0.48 0.55 0.63 0.63 0.26 0.8 0.26 0.55 0.32 0.5 0.16 0.64 0.47 0.31 0.58 0.3 0.55 0.37 0.37
CCL17695 (BN171_1680010)
 0.04 0.02 0.12 0.08 0.1 0.07 1.0 0.01 0.15 0.94 0.8 0.76 0.55 0.22 0.08 0.62 0.37 0.07 0.11 0.05 0.04 0.0 0.08 0.04 0.06 0.01 0.08 0.07 0.73
CCL17998 (BN171_2000001)
 0.09 0.04 0.13 0.15 0.1 0.12 0.87 0.04 0.24 0.75 0.59 0.65 0.67 0.11 0.06 1.0 0.29 0.1 0.12 0.15 0.28 0.09 0.03 0.15 0.38 0.1 0.11 0.06 0.58
CCL18092 (spsI)
 0.23 0.14 0.45 0.52 0.49 0.0 0.36 0.16 0.16 1.0 0.7 0.42 0.42 0.28 0.3 0.4 0.35 0.42 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.55
CCL18093 (rmlC)
 0.17 0.09 0.39 0.39 0.35 0.0 0.36 0.1 0.11 1.0 0.67 0.53 0.43 0.22 0.22 0.34 0.53 0.3 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.55
CCL18094 (spsJ)
 0.29 0.15 0.63 0.87 0.76 0.0 0.41 0.13 0.16 1.0 0.73 0.5 0.61 0.41 0.49 0.67 0.41 0.57 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.69
CCL18109 (BN171_210045)
 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.13 0.27 0.0 0.06 1.0 0.73 0.28 0.31 0.01 0.0 0.39 0.19 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.11 0.01 0.0 0.02 0.56
CCL18110 (BN171_210046)
 0.04 0.01 0.22 0.16 0.3 0.0 0.29 0.02 0.12 1.0 0.74 0.36 0.48 0.14 0.07 0.59 0.35 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.61
CCL18111 (BN171_210047)
 0.04 0.03 0.15 0.14 0.27 0.0 0.28 0.03 0.05 1.0 0.81 0.42 0.42 0.08 0.07 0.54 0.23 0.16 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.59
CCL18112 (BN171_210048)
 0.03 0.02 0.06 0.07 0.08 0.0 0.33 0.02 0.03 1.0 0.83 0.48 0.34 0.04 0.03 0.42 0.17 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.78
CCL18113 (BN171_210049)
 0.07 0.1 0.15 0.17 0.24 0.0 0.32 0.09 0.03 1.0 0.85 0.94 0.41 0.08 0.12 0.51 0.23 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.71
CCL18114 (BN171_210050)
 0.13 0.06 0.11 0.11 0.15 0.0 0.36 0.08 0.21 1.0 0.87 0.8 0.68 0.09 0.09 0.67 0.28 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.8
CCL18115 (BN171_210051)
 0.11 0.12 0.17 0.21 0.25 0.0 0.42 0.11 0.56 0.88 1.0 0.88 0.44 0.13 0.16 0.54 0.38 0.22 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
CCL18116 (eryC)
 0.11 0.09 0.24 0.28 0.43 0.0 0.44 0.09 0.44 1.0 0.86 0.75 0.53 0.13 0.2 0.62 0.27 0.24 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85
CCL18572 (csdA)
 0.5 0.16 0.59 0.44 0.52 0.38 1.0 0.32 0.26 0.45 0.52 0.57 0.63 0.69 0.19 0.65 0.29 0.39 0.21 0.36 0.1 0.18 0.29 0.12 0.22 0.21 0.05 0.24 0.42
CCL19430 (BN171_3140002)
 0.07 0.06 0.13 0.12 0.26 0.27 0.56 0.15 0.12 0.66 0.58 0.53 0.53 0.07 0.08 1.0 0.26 0.17 0.21 0.06 0.04 0.09 0.2 0.24 0.35 0.09 0.05 0.15 0.43
CCL19431 (BN171_3140003)
 0.05 0.04 0.1 0.08 0.18 0.26 0.5 0.09 0.11 0.66 0.53 0.4 0.48 0.05 0.04 1.0 0.21 0.13 0.21 0.07 0.03 0.1 0.22 0.27 0.4 0.06 0.09 0.11 0.35
CCL19432 (BN171_3140004)
 0.07 0.04 0.19 0.12 0.37 0.43 0.59 0.18 0.14 0.85 0.61 0.58 0.45 0.08 0.04 1.0 0.21 0.19 0.26 0.15 0.05 0.25 0.19 0.24 0.34 0.2 0.11 0.16 0.41
CCL19509 (BN171_3180033)
 0.15 0.12 0.19 0.17 0.16 0.0 0.92 0.1 0.22 1.0 0.79 0.76 0.51 0.17 0.14 0.7 0.24 0.13 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64
CCL19510 (BN171_3180034)
 0.16 0.36 0.18 0.29 0.29 0.0 0.77 0.21 0.07 1.0 0.78 0.9 0.43 0.1 0.28 0.51 0.26 0.17 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69
CCL19511 (BN171_3180035)
 0.09 0.13 0.15 0.14 0.29 0.0 0.66 0.1 0.08 0.84 0.87 1.0 0.57 0.15 0.11 0.53 0.44 0.13 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64
CCL19512 (BN171_3180036)
 0.13 0.15 0.14 0.13 0.14 0.0 1.0 0.08 0.08 0.9 0.87 1.0 0.56 0.11 0.14 0.55 0.26 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69
CCL19513 (BN171_3180037)
 0.19 0.14 0.18 0.14 0.23 0.0 0.78 0.2 0.05 1.0 0.94 0.92 0.56 0.11 0.14 0.45 0.16 0.14 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85
CCL19514 (BN171_3180038)
 0.29 0.31 0.45 0.4 0.65 0.0 0.44 0.24 0.46 0.66 0.92 0.74 1.0 0.37 0.27 0.72 0.96 0.27 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85
CCL19515 (BN171_3180039)
 0.4 0.32 0.41 0.29 0.57 0.0 0.68 0.36 0.3 1.0 0.85 0.75 0.63 0.36 0.37 0.7 0.38 0.38 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83
CCL19556 (BN171_3260007)
 0.22 0.12 0.2 0.15 0.22 0.11 0.43 0.2 0.21 0.72 0.69 0.69 0.87 0.22 0.17 1.0 0.44 0.27 0.23 0.1 0.09 0.03 0.34 0.18 0.22 0.06 0.04 0.36 0.56
CCL19604 (BN171_3290017)
 0.28 0.27 0.26 0.24 0.17 0.0 0.62 0.22 0.32 0.5 0.59 0.77 0.49 0.16 0.1 1.0 0.35 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45
CCL19677 (dapA)
 0.33 0.43 0.33 0.37 0.29 0.26 1.0 0.24 0.15 0.71 0.65 0.8 0.62 0.28 0.78 0.7 0.24 0.44 0.24 0.32 0.56 0.37 0.16 0.43 0.37 0.23 0.25 0.32 0.57
CCL20129 (BN171_370003)
 0.26 0.14 0.22 0.19 0.23 0.35 1.0 0.15 0.25 0.93 0.66 0.64 0.7 0.24 0.18 0.9 0.23 0.38 0.34 0.28 0.2 0.29 0.32 0.4 0.62 0.23 0.25 0.24 0.54
CCL20130 (BN171_370004)
 0.31 0.18 0.28 0.33 0.4 0.31 0.89 0.28 0.26 0.97 0.64 0.65 0.9 0.33 0.22 1.0 0.34 0.52 0.45 0.27 0.2 0.38 0.41 0.54 0.67 0.26 0.46 0.37 0.54
CCL20131 (BN171_370005)
 0.19 0.05 0.17 0.13 0.19 0.08 0.81 0.06 0.24 0.89 0.77 0.85 0.79 0.17 0.1 1.0 0.43 0.24 0.39 0.09 0.05 0.1 0.42 0.26 0.28 0.05 0.07 0.28 0.74
CCL20132 (BN171_370006)
 0.35 0.16 0.33 0.27 0.35 0.11 0.55 0.22 0.39 1.0 0.73 0.74 0.73 0.28 0.21 0.73 0.53 0.47 0.41 0.13 0.08 0.15 0.4 0.22 0.25 0.09 0.09 0.16 0.49
CCL20133 (BN171_370007)
 0.11 0.07 0.12 0.08 0.08 0.1 0.65 0.07 0.3 1.0 0.69 0.7 0.75 0.08 0.08 0.79 0.35 0.11 0.28 0.04 0.03 0.01 0.29 0.07 0.11 0.02 0.03 0.16 0.62
CCL20174 (BN171_3740003)
 0.04 0.08 0.14 0.12 0.3 0.0 0.64 0.14 0.08 0.67 0.66 0.67 0.54 0.13 0.04 1.0 0.15 0.11 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46
CCL20175 (BN171_3740004)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.55 0.01 0.0 0.28 0.19 0.14 0.39 0.02 0.02 1.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
CCL20178 (BN171_3740007)
 0.02 0.05 0.06 0.03 0.05 0.0 0.35 0.06 0.07 0.64 0.63 0.47 0.46 0.06 0.02 1.0 0.12 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47
CCL20249 (BN171_390003)
 0.1 0.06 0.12 0.13 0.09 0.0 1.0 0.06 0.18 0.93 0.47 0.48 0.77 0.08 0.08 0.96 0.43 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34
CCL20541 (BN171_620002)
 0.03 0.02 0.02 0.01 0.05 0.0 0.51 0.03 0.1 1.0 0.87 0.93 0.63 0.04 0.02 0.71 0.24 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73
CCL20542 (BN171_620003)
 0.56 0.26 0.52 0.35 0.39 0.05 0.56 0.41 0.3 0.59 0.64 0.63 0.67 0.44 0.25 1.0 0.29 0.49 0.32 0.14 0.09 0.03 0.3 0.22 0.21 0.08 0.12 0.38 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)