Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL17018 (BN171_1080010)	0.12	0.15	0.14	0.26	0.21	0.31	0.55	0.11	0.14	1.0	0.67	0.59	0.27	0.05	0.07	0.4	0.16	0.07	0.35	0.2	0.14	0.72	0.18	0.23	0.36	0.14	0.12	0.28	0.32
CCL17035 (BN171_1090016)	0.04	0.0	0.16	0.13	0.02	0.18	1.0	0.02	0.09	0.65	0.42	0.4	0.5	0.09	0.0	0.79	0.14	0.01	0.25	0.42	0.26	0.12	0.26	0.17	0.2	0.02	0.11	0.12	0.3
CCL17179 (BN171_1360001)	0.14	0.1	0.34	0.18	0.1	0.45	0.71	0.03	0.46	1.0	0.79	0.81	0.81	0.31	0.09	0.79	0.29	0.04	0.38	0.66	0.4	0.06	0.68	0.31	0.39	0.12	0.37	0.42	0.81
CCL17271 (BN171_1420014)	0.22	0.31	0.33	0.36	0.33	0.62	1.0	0.25	0.55	1.0	0.67	0.86	0.86	0.21	0.23	0.7	0.16	0.19	0.44	0.52	0.35	0.19	0.57	0.24	0.2	0.35	0.38	0.24	0.66
CCL17272 (BN171_1420015)	0.22	0.33	0.28	0.33	0.39	0.67	0.68	0.4	0.18	0.94	0.62	0.89	0.79	0.23	0.26	1.0	0.28	0.29	0.51	0.76	0.56	0.7	0.74	0.63	0.46	0.5	0.18	0.3	0.41
CCL17285 (BN171_1430012)	0.31	0.49	0.32	0.4	0.33	0.75	0.71	0.31	0.19	0.84	0.6	0.62	0.72	0.2	0.47	0.97	0.35	0.35	0.68	0.38	0.62	1.0	0.67	0.71	0.67	0.34	0.33	0.27	0.48
CCL17308 (BN171_1430035)	0.69	0.24	0.53	0.29	0.46	0.6	0.81	0.35	0.2	0.94	0.84	0.91	0.7	0.54	0.23	0.74	0.39	0.43	0.71	0.67	0.35	0.75	0.62	0.54	0.51	0.31	0.21	0.45	1.0
CCL17309 (BN171_1430036)	0.28	0.09	0.22	0.12	0.16	0.67	0.75	0.15	0.13	0.91	0.79	0.92	0.77	0.19	0.11	0.74	0.36	0.19	0.72	0.29	0.18	0.5	0.73	0.44	0.46	0.13	0.36	0.43	1.0
CCL17310 (rng)	0.29	0.05	0.34	0.2	0.25	0.49	0.87	0.07	0.09	1.0	0.85	0.9	0.73	0.36	0.08	0.68	0.32	0.17	0.57	0.37	0.25	0.48	0.6	0.42	0.44	0.17	0.31	0.39	0.97
CCL17373 (BN171_1450034)	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.21	1.0	0.01	0.03	0.99	0.72	0.63	0.62	0.03	0.01	0.67	0.13	0.01	0.17	0.03	0.05	0.03	0.44	0.19	0.27	0.01	0.09	0.18	0.58
CCL17374 (BN171_1450035)	0.1	0.04	0.09	0.06	0.09	0.31	1.0	0.05	0.05	0.91	0.62	0.62	0.56	0.13	0.06	0.68	0.19	0.11	0.25	0.16	0.13	0.3	0.54	0.28	0.36	0.09	0.1	0.27	0.5
CCL17403 (BN171_1480015)	0.18	0.15	0.28	0.26	0.2	0.31	0.89	0.1	0.18	1.0	0.8	0.99	0.76	0.18	0.13	0.7	0.26	0.13	0.4	0.31	0.3	0.58	0.56	0.42	0.43	0.12	0.26	0.34	0.7
CCL17404 (smc)	0.15	0.08	0.22	0.21	0.17	0.34	0.74	0.06	0.1	1.0	0.79	0.95	0.57	0.18	0.09	0.54	0.19	0.1	0.28	0.19	0.16	0.29	0.4	0.23	0.27	0.09	0.12	0.26	0.72
CCL17405 (ftsY)	0.41	0.31	0.37	0.47	0.38	0.51	0.99	0.21	0.11	1.0	0.72	0.86	0.51	0.27	0.29	0.47	0.21	0.26	0.29	0.35	0.24	0.9	0.27	0.23	0.25	0.2	0.31	0.19	0.6
CCL17449 (BN171_1500025)	0.37	0.25	0.31	0.4	0.33	0.63	0.56	0.13	0.74	0.78	0.82	0.82	0.89	0.3	0.3	0.99	0.37	0.36	0.71	0.37	0.56	0.27	1.0	0.81	0.67	0.21	0.49	0.37	0.75
CCL17616 (BN171_1640006)	0.24	0.17	0.26	0.23	0.22	0.76	0.81	0.18	0.64	0.95	0.8	0.73	0.89	0.32	0.22	1.0	0.3	0.24	0.53	0.4	0.31	0.2	0.74	0.52	0.43	0.22	0.11	0.54	0.69
CCL17629 (BN171_1640019)	0.62	0.52	0.77	0.92	0.65	0.47	0.81	0.43	0.66	0.78	0.77	0.77	0.82	0.69	0.57	0.7	0.29	0.39	0.57	1.0	0.62	0.92	0.52	0.48	0.38	0.49	0.18	0.41	0.75
CCL17630 (BN171_1640020)	0.37	0.24	0.38	0.4	0.29	0.45	0.99	0.16	0.59	1.0	0.78	0.77	0.94	0.35	0.28	0.65	0.2	0.29	0.48	0.42	0.32	0.75	0.56	0.52	0.4	0.23	0.35	0.3	0.86
CCL17631 (pabA)	0.31	0.24	0.38	0.43	0.28	0.2	0.71	0.17	0.33	1.0	0.8	0.68	0.44	0.3	0.32	0.35	0.15	0.25	0.34	0.33	0.33	0.53	0.29	0.33	0.21	0.2	0.1	0.12	0.39
CCL17632 (pabB)	0.39	0.35	0.46	0.52	0.41	0.5	0.96	0.22	0.5	0.98	0.94	1.0	0.75	0.33	0.39	0.66	0.23	0.31	0.5	0.45	0.4	0.72	0.49	0.54	0.37	0.25	0.17	0.29	0.91
CCL17633 (pabC)	0.04	0.04	0.08	0.08	0.04	0.43	0.64	0.02	0.26	0.92	0.9	1.0	0.75	0.05	0.05	0.78	0.19	0.03	0.42	0.04	0.07	0.17	0.54	0.44	0.35	0.02	0.11	0.33	0.81
CCL17634 (BN171_1640024)	0.22	0.11	0.59	0.57	0.33	0.31	0.69	0.06	0.35	0.92	0.89	0.89	0.83	0.43	0.25	0.63	0.31	0.14	0.46	0.59	0.71	0.06	0.55	0.33	0.3	0.2	0.09	0.29	1.0
CCL17644 (wrbA)	0.6	0.58	0.4	0.54	0.46	0.29	0.62	0.34	0.3	1.0	0.64	0.86	0.58	0.41	0.57	0.53	0.3	0.56	0.34	0.45	0.35	0.75	0.33	0.43	0.33	0.39	0.32	0.21	0.43
CCL17692 (BN171_1680007)	0.31	0.53	0.21	0.22	0.27	0.12	0.86	0.3	0.38	1.0	0.87	0.86	0.46	0.29	0.38	0.57	0.4	0.38	0.21	0.11	0.1	0.15	0.13	0.05	0.08	0.05	0.55	0.01	0.79
CCL17694 (BN171_1680009)	0.24	0.22	0.18	0.23	0.27	0.04	0.68	0.12	0.18	1.0	0.83	0.69	0.5	0.34	0.33	0.67	0.24	0.32	0.12	0.12	0.06	0.06	0.08	0.04	0.07	0.04	0.13	0.08	0.63
CCL17820 (BN171_1810027)	0.06	0.05	0.08	0.11	0.08	0.47	0.49	0.04	0.32	0.57	0.45	0.55	0.56	0.05	0.05	1.0	0.27	0.06	0.43	0.11	0.16	0.17	0.46	0.38	0.61	0.07	0.25	0.27	0.38
CCL17842 (BN171_1840002)	0.12	0.09	0.15	0.16	0.13	0.41	0.66	0.07	0.48	1.0	0.82	0.89	0.5	0.18	0.1	0.6	0.21	0.1	0.41	0.19	0.21	0.26	0.28	0.37	0.35	0.08	0.1	0.31	0.66
CCL17893 (BN171_1930005)	0.11	0.03	0.19	0.1	0.19	0.55	0.79	0.05	0.37	1.0	0.81	0.96	0.58	0.27	0.05	0.89	0.32	0.11	0.42	0.3	0.16	0.14	0.59	0.35	0.39	0.13	0.07	0.42	0.84
CCL17894 (BN171_1930006)	0.38	0.27	0.37	0.36	0.42	0.66	1.0	0.34	0.6	0.99	0.84	0.89	0.75	0.51	0.26	0.94	0.41	0.37	0.64	0.43	0.28	0.46	0.76	0.62	0.54	0.32	0.18	0.49	0.99
CCL17895 (BN171_1930007)	0.24	0.14	0.24	0.26	0.24	0.56	1.0	0.12	0.46	0.94	0.84	0.83	0.74	0.25	0.18	0.72	0.31	0.22	0.49	0.26	0.23	0.33	0.66	0.54	0.45	0.16	0.2	0.48	0.91
CCL17896 (BN171_1930008)	0.18	0.08	0.27	0.3	0.27	0.38	0.81	0.06	0.39	1.0	0.81	0.82	0.73	0.26	0.16	0.75	0.27	0.17	0.47	0.4	0.25	0.37	0.62	0.6	0.49	0.2	0.26	0.42	0.77
CCL17954 (BN171_1970023)	0.23	0.33	0.31	0.35	0.23	0.19	0.88	0.16	0.26	1.0	0.66	0.74	0.65	0.25	0.24	0.74	0.17	0.18	0.31	0.32	0.41	0.55	0.4	0.3	0.3	0.16	0.19	0.25	0.42
CCL17955 (BN171_1970024)	0.1	0.16	0.12	0.18	0.11	0.34	0.73	0.05	0.16	1.0	0.64	0.71	0.55	0.13	0.11	0.62	0.14	0.08	0.35	0.2	0.24	0.51	0.45	0.28	0.26	0.1	0.19	0.25	0.34
CCL18012 (ogt)	0.44	0.23	0.7	0.41	0.52	0.21	0.74	0.19	0.24	0.89	0.67	0.83	0.6	0.35	0.15	0.36	0.31	0.31	0.32	0.58	0.15	0.21	0.33	0.17	0.16	0.24	0.07	0.39	1.0
CCL18187 (BN171_2150001)	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.27	0.74	0.0	0.15	1.0	0.8	0.68	0.67	0.05	0.01	0.66	0.2	0.01	0.28	0.05	0.03	0.06	0.39	0.21	0.33	0.01	0.08	0.35	0.67
CCL18188 (BN171_2150002)	0.31	0.04	0.37	0.23	0.2	0.26	0.99	0.02	0.43	0.73	0.79	0.75	0.78	0.32	0.09	0.88	0.37	0.17	0.5	0.47	0.29	0.23	0.71	0.73	1.0	0.21	0.36	0.51	0.65
CCL18190 (accA)	0.43	0.11	0.4	0.22	0.37	0.52	0.5	0.27	0.08	0.62	0.64	0.55	0.51	0.22	0.25	1.0	0.29	0.43	0.43	0.42	0.09	0.79	0.49	0.38	0.45	0.32	0.23	0.27	0.53
CCL18191 (accD)	0.36	0.08	0.37	0.18	0.29	0.36	0.52	0.19	0.12	0.62	0.66	0.55	0.6	0.18	0.2	1.0	0.27	0.32	0.47	0.34	0.08	0.75	0.56	0.38	0.46	0.26	0.17	0.21	0.54
CCL18192 (accC)	0.24	0.03	0.28	0.11	0.17	0.25	0.52	0.06	0.17	0.68	0.66	0.55	0.62	0.17	0.1	1.0	0.26	0.19	0.48	0.23	0.05	0.6	0.61	0.39	0.46	0.15	0.14	0.31	0.54
CCL18227 (BN171_2170014)	0.06	0.05	0.11	0.14	0.09	0.11	0.57	0.05	0.48	0.73	1.0	0.58	0.4	0.08	0.06	0.36	0.18	0.06	0.32	0.13	0.12	0.2	0.46	0.4	0.33	0.08	0.17	0.23	0.54
CCL18228 (BN171_2170015)	0.3	0.16	0.4	0.27	0.44	0.27	0.89	0.25	0.09	0.73	1.0	0.69	0.7	0.29	0.2	0.72	0.28	0.36	0.34	0.5	0.19	0.51	0.34	0.51	0.42	0.35	0.59	0.36	0.72
CCL18449 (BN171_2350001)	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.23	0.59	0.01	0.03	0.74	0.7	0.7	0.46	0.03	0.01	1.0	0.19	0.01	0.23	0.01	0.01	0.02	0.51	0.14	0.15	0.01	0.03	0.32	0.67
CCL18523 (frr)	0.4	0.77	0.37	0.51	0.48	0.49	1.0	0.5	0.2	0.91	0.82	0.92	0.65	0.57	0.64	0.95	0.4	0.57	0.34	0.44	0.58	0.78	0.34	0.66	0.38	0.4	0.6	0.35	0.94
CCL18569 (BN171_2440010)	0.06	0.04	0.08	0.08	0.08	0.3	0.87	0.04	0.3	1.0	0.69	0.69	0.67	0.1	0.06	0.54	0.3	0.08	0.31	0.13	0.11	0.1	0.69	0.49	0.37	0.07	0.13	0.52	0.59
CCL18656 (BN171_2480031)	0.07	0.12	0.13	0.17	0.1	0.36	0.84	0.05	0.23	1.0	0.63	0.58	0.59	0.06	0.08	0.91	0.19	0.06	0.42	0.2	0.31	0.28	0.55	0.48	0.33	0.1	0.37	0.29	0.55
CCL18662 (BN171_2480037)	0.08	0.05	0.1	0.07	0.12	0.46	0.55	0.1	0.16	1.0	0.89	0.85	0.45	0.13	0.05	0.94	0.24	0.09	0.29	0.18	0.11	0.09	0.5	0.21	0.34	0.11	0.02	0.28	0.81
CCL18914 (BN171_2720014)	0.12	0.23	0.13	0.15	0.14	0.29	0.69	0.14	0.17	1.0	0.82	0.86	0.76	0.13	0.18	0.94	0.26	0.15	0.29	0.18	0.2	0.29	0.48	0.45	0.48	0.13	0.21	0.39	0.74
CCL18958 (BN171_2770009)	0.22	0.22	0.39	0.53	0.42	0.37	0.87	0.23	0.48	1.0	0.79	0.78	0.7	0.2	0.23	0.95	0.44	0.22	0.46	0.23	0.34	0.25	0.74	0.56	0.46	0.18	0.29	0.38	0.52
CCL18960 (BN171_2770011)	0.09	0.08	0.18	0.19	0.17	0.53	0.93	0.09	0.37	1.0	0.71	0.72	0.77	0.15	0.09	0.99	0.27	0.11	0.49	0.21	0.23	0.24	0.77	0.31	0.34	0.14	0.09	0.34	0.51
CCL19031 (BN171_2820001)	0.19	0.23	0.24	0.33	0.32	0.21	1.0	0.21	0.3	0.9	0.8	0.84	0.76	0.25	0.25	0.95	0.3	0.21	0.3	0.32	0.29	0.21	0.6	0.44	0.43	0.24	0.29	0.4	0.53
CCL19034 (BN171_2830002)	0.18	0.19	0.19	0.18	0.14	0.42	0.54	0.09	0.12	1.0	0.73	0.66	0.55	0.41	0.19	0.64	0.14	0.15	0.27	0.29	0.3	0.05	0.33	0.21	0.23	0.1	0.13	0.39	0.6
CCL19085 (BN171_2870015)	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.16	0.77	0.01	0.31	1.0	0.82	0.61	0.6	0.02	0.01	0.7	0.28	0.01	0.29	0.05	0.08	0.06	0.41	0.22	0.3	0.01	0.11	0.2	0.41
CCL19098 (BN171_2870028)	0.23	0.22	0.3	0.21	0.31	0.23	1.0	0.24	0.25	0.76	0.62	0.67	0.61	0.35	0.18	0.48	0.22	0.21	0.34	0.68	0.22	0.41	0.43	0.3	0.33	0.35	0.33	0.2	0.45
CCL19099 (BN171_2870029)	0.15	0.07	0.25	0.13	0.16	0.44	1.0	0.06	0.32	0.52	0.45	0.44	0.58	0.31	0.09	0.37	0.14	0.12	0.32	0.4	0.2	0.24	0.4	0.28	0.3	0.12	0.31	0.2	0.36
CCL19100 (BN171_2870030)	0.21	0.14	0.24	0.15	0.15	0.44	1.0	0.12	0.31	0.54	0.43	0.46	0.63	0.29	0.13	0.43	0.15	0.13	0.34	0.37	0.19	0.49	0.37	0.24	0.3	0.21	0.4	0.25	0.41
CCL19101 (nrdR)	0.27	0.14	0.3	0.19	0.29	0.58	1.0	0.12	0.42	0.73	0.62	0.75	0.65	0.36	0.15	0.48	0.13	0.2	0.38	0.56	0.26	0.27	0.46	0.24	0.34	0.36	0.39	0.3	0.6
CCL19122 (BN171_2870052)	0.17	0.11	0.2	0.12	0.24	0.32	1.0	0.12	0.07	0.6	0.56	0.61	0.53	0.15	0.13	0.55	0.29	0.21	0.23	0.3	0.12	0.24	0.32	0.46	0.4	0.14	0.67	0.35	0.68
CCL19123 (BN171_2870053)	0.17	0.15	0.19	0.12	0.23	0.26	1.0	0.18	0.11	0.65	0.61	0.8	0.52	0.12	0.14	0.56	0.27	0.19	0.25	0.24	0.1	0.23	0.37	0.42	0.34	0.14	0.35	0.33	0.73
CCL19149 (BN171_2900004)	0.27	0.1	0.33	0.14	0.25	0.38	0.76	0.15	0.27	0.95	0.77	0.72	0.79	0.22	0.11	1.0	0.24	0.2	0.47	0.32	0.21	0.24	0.67	0.29	0.35	0.15	0.08	0.58	0.62
CCL19182 (BN171_2920003)	0.08	0.05	0.17	0.09	0.12	0.43	0.53	0.07	0.13	1.0	0.89	0.89	0.72	0.13	0.06	0.96	0.23	0.1	0.34	0.16	0.1	0.06	0.63	0.29	0.29	0.09	0.13	0.51	0.85
CCL19187 (BN171_2930002)	0.36	0.13	0.26	0.25	0.23	0.21	0.69	0.19	0.26	0.79	0.71	0.75	0.87	0.37	0.3	1.0	0.3	0.28	0.46	0.28	0.15	0.65	0.79	0.46	0.41	0.14	0.37	0.44	0.63
CCL19188 (BN171_2930003)	0.26	0.08	0.3	0.21	0.2	0.41	0.83	0.09	0.37	0.92	0.82	1.0	0.94	0.44	0.2	0.97	0.32	0.18	0.44	0.48	0.19	0.1	0.77	0.27	0.27	0.14	0.12	0.46	0.8
CCL19227 (BN171_2970006)	0.04	0.06	0.05	0.08	0.04	0.22	1.0	0.04	0.28	0.99	0.88	0.91	0.62	0.07	0.05	0.6	0.17	0.04	0.36	0.06	0.14	0.11	0.64	0.14	0.16	0.03	0.06	0.43	0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)