View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19003 (nhaA) | 0.32 | 0.52 | 0.58 | 0.43 | 0.5 | 0.47 | 0.45 | 0.59 | 0.37 | 0.88 | 0.37 | 0.28 | 0.87 | 0.95 | 0.21 | 0.24 | 0.41 | 0.6 | 0.18 | 0.36 | 0.36 | 0.49 | 0.12 | 0.45 | 0.37 | 1.0 | 0.37 | 0.42 | 0.33 | 0.14 | 0.17 | 0.52 | 0.28 | 0.18 | 0.31 | 0.45 | 0.67 | 0.64 | 0.62 |
AAL19004 (nhaR) | 0.39 | 0.53 | 0.44 | 0.44 | 0.42 | 0.36 | 0.56 | 0.56 | 0.37 | 1.0 | 0.41 | 0.24 | 0.51 | 0.78 | 0.28 | 0.43 | 0.76 | 0.72 | 0.3 | 0.49 | 0.36 | 0.37 | 0.29 | 0.48 | 0.24 | 0.7 | 0.33 | 0.48 | 0.34 | 0.14 | 0.16 | 0.41 | 0.26 | 0.44 | 0.65 | 0.39 | 0.76 | 0.58 | 0.45 |
AAL19173 (htrA) | 0.03 | 0.16 | 0.24 | 0.11 | 0.05 | 0.15 | 0.06 | 0.1 | 0.1 | 0.15 | 0.11 | 0.09 | 0.08 | 0.11 | 0.13 | 0.05 | 0.07 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 1.0 | 0.17 | 0.07 | 0.07 | 0.19 | 0.06 | 0.24 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.07 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.05 | 0.16 | 0.06 | 0.05 |
AAL19317 (STM0363) | 0.12 | 0.33 | 0.1 | 0.04 | 0.03 | 0.07 | 0.15 | 0.28 | 0.05 | 0.04 | 0.08 | 0.01 | 0.09 | 0.46 | 0.02 | 0.08 | 0.05 | 0.04 | 0.05 | 0.06 | 0.41 | 1.0 | 0.01 | 0.08 | 0.19 | 0.07 | 0.04 | 0.1 | 0.08 | 0.01 | 0.05 | 0.13 | 0.04 | 0.01 | 0.07 | 0.05 | 0.17 | 0.05 | 0.19 |
AAL19459 (ybbO) | 0.51 | 0.59 | 0.39 | 0.44 | 0.32 | 0.21 | 0.41 | 0.62 | 0.32 | 0.38 | 0.4 | 0.4 | 0.66 | 1.0 | 0.7 | 0.32 | 0.3 | 0.39 | 0.43 | 0.46 | 0.18 | 0.41 | 0.16 | 0.57 | 0.21 | 0.64 | 0.45 | 0.55 | 0.51 | 0.05 | 0.27 | 0.41 | 0.5 | 0.26 | 0.59 | 0.3 | 0.72 | 0.33 | 0.77 |
AAL19460 (tesA) | 0.28 | 0.37 | 0.4 | 0.22 | 0.2 | 0.15 | 0.27 | 0.56 | 0.24 | 0.33 | 0.29 | 0.18 | 0.62 | 1.0 | 0.38 | 0.24 | 0.25 | 0.23 | 0.25 | 0.29 | 0.19 | 0.37 | 0.19 | 0.41 | 0.24 | 0.46 | 0.27 | 0.63 | 0.36 | 0.08 | 0.18 | 0.44 | 0.32 | 0.23 | 0.3 | 0.24 | 0.5 | 0.27 | 0.61 |
AAL19461 (ybbA) | 0.26 | 0.42 | 0.54 | 0.3 | 0.18 | 0.15 | 0.12 | 0.54 | 0.24 | 0.29 | 0.24 | 0.2 | 0.65 | 1.0 | 0.24 | 0.14 | 0.14 | 0.33 | 0.32 | 0.35 | 0.46 | 0.28 | 0.14 | 0.43 | 0.35 | 0.49 | 0.27 | 0.73 | 0.64 | 0.05 | 0.2 | 0.24 | 0.43 | 0.15 | 0.13 | 0.19 | 0.74 | 0.31 | 0.39 |
AAL19558 (dsbG) | 0.39 | 0.65 | 0.8 | 0.45 | 0.41 | 0.41 | 0.63 | 0.55 | 0.25 | 0.45 | 0.33 | 0.15 | 0.91 | 0.4 | 0.71 | 0.18 | 0.5 | 0.46 | 0.55 | 0.52 | 0.46 | 0.81 | 0.26 | 0.54 | 0.55 | 0.72 | 0.31 | 0.6 | 0.37 | 0.06 | 0.27 | 0.41 | 0.36 | 0.19 | 0.47 | 0.28 | 1.0 | 0.47 | 0.59 |
AAL19588 (dacA) | 0.55 | 0.55 | 0.2 | 0.52 | 0.35 | 0.44 | 0.76 | 0.52 | 0.37 | 0.41 | 0.39 | 0.91 | 0.47 | 0.79 | 0.73 | 0.26 | 0.63 | 0.38 | 0.42 | 0.44 | 0.11 | 0.38 | 0.42 | 0.46 | 0.25 | 0.87 | 0.79 | 0.58 | 0.4 | 0.34 | 0.26 | 0.47 | 0.38 | 0.28 | 1.0 | 0.55 | 0.47 | 0.26 | 0.67 |
AAL19592 (ybeA) | 0.85 | 0.48 | 0.25 | 0.43 | 0.41 | 0.1 | 0.5 | 0.54 | 0.54 | 0.3 | 0.74 | 0.87 | 0.6 | 0.77 | 0.53 | 0.15 | 0.47 | 0.9 | 0.99 | 1.0 | 0.18 | 0.42 | 0.19 | 0.77 | 0.28 | 0.73 | 0.98 | 0.54 | 0.61 | 0.19 | 0.22 | 0.44 | 0.64 | 0.12 | 0.72 | 0.88 | 0.59 | 0.36 | 0.95 |
AAL19593 (ybeB) | 0.98 | 0.63 | 0.26 | 0.43 | 0.39 | 0.13 | 0.31 | 0.61 | 0.68 | 0.36 | 0.9 | 0.84 | 0.66 | 1.0 | 0.3 | 0.21 | 0.14 | 0.42 | 0.43 | 0.49 | 0.19 | 0.39 | 0.24 | 0.81 | 0.42 | 0.84 | 0.99 | 0.8 | 0.71 | 0.2 | 0.28 | 0.41 | 0.69 | 0.14 | 0.17 | 0.95 | 0.65 | 0.33 | 0.93 |
AAL19631 (ybfM) | 0.02 | 0.15 | 0.04 | 0.02 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.05 | 0.06 | 0.03 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.09 | 0.05 | 0.03 | 0.06 | 0.0 | 1.0 | 0.12 | 0.05 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.07 | 0.0 | 0.07 | 0.02 | 0.04 |
AAL19632 (ybfN) | 0.04 | 0.13 | 0.06 | 0.02 | 0.06 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.07 | 0.09 | 0.05 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 1.0 | 0.13 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.06 | 0.01 | 0.04 | 0.1 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.04 | 0.04 | 0.04 |
AAL19730 (bioA) | 0.22 | 0.2 | 0.13 | 0.04 | 0.01 | 0.19 | 0.01 | 0.49 | 0.03 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.08 | 1.0 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.33 | 0.31 | 0.0 | 0.09 | 0.02 | 0.38 | 0.23 | 0.05 | 0.14 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.07 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.14 | 0.06 | 0.02 |
AAL19931 (ycbL) | 0.19 | 0.49 | 0.28 | 0.25 | 0.24 | 0.18 | 0.31 | 0.49 | 0.2 | 0.47 | 0.18 | 0.45 | 0.25 | 1.0 | 0.29 | 0.11 | 0.13 | 0.3 | 0.38 | 0.38 | 0.34 | 0.98 | 0.19 | 0.24 | 0.34 | 0.46 | 0.42 | 0.38 | 0.4 | 0.07 | 0.22 | 0.16 | 0.36 | 0.09 | 0.21 | 0.3 | 0.29 | 0.2 | 0.29 |
AAL20024 (orfX) | 0.08 | 0.41 | 0.35 | 0.02 | 0.17 | 0.01 | 0.01 | 0.08 | 0.09 | 0.11 | 0.05 | 0.05 | 0.21 | 0.01 | 0.0 | 0.16 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.39 | 0.5 | 0.24 | 0.24 | 0.12 | 0.02 | 0.2 | 0.22 | 0.01 | 0.08 | 0.17 | 0.13 | 0.01 | 0.22 | 0.01 | 1.0 | 0.5 | 0.13 | 0.09 |
AAL20176 (STM1250) | 0.07 | 0.02 | 0.09 | 0.01 | 0.03 | 0.32 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.0 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.06 | 1.0 | 0.08 | 0.05 | 0.03 | 0.11 | 0.01 | 0.04 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 0.01 | 0.18 | 0.03 | 0.05 |
AAL20180 (STM1254) | 0.01 | 0.06 | 0.2 | 0.02 | 0.02 | 0.14 | 0.04 | 0.14 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.88 | 1.0 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.0 | 0.16 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.07 | 0.05 | 0.02 | 0.0 |
AAL20202 (yeaO) | 0.66 | 0.61 | 0.95 | 0.29 | 0.42 | 0.09 | 0.48 | 0.6 | 0.47 | 0.73 | 0.73 | 0.44 | 1.0 | 0.68 | 0.51 | 0.67 | 0.18 | 0.42 | 0.37 | 0.49 | 0.47 | 0.96 | 0.49 | 0.38 | 0.67 | 0.39 | 0.37 | 0.67 | 0.56 | 0.09 | 0.52 | 0.63 | 0.54 | 0.72 | 0.21 | 0.45 | 0.49 | 0.51 | 0.74 |
AAL20270 (ydiU) | 0.49 | 0.4 | 0.57 | 0.21 | 0.41 | 0.12 | 0.33 | 0.52 | 0.14 | 0.11 | 0.19 | 0.04 | 0.83 | 1.0 | 0.12 | 0.31 | 0.14 | 0.18 | 0.16 | 0.18 | 0.68 | 0.3 | 0.05 | 0.33 | 0.49 | 0.37 | 0.16 | 0.42 | 0.26 | 0.03 | 0.14 | 0.51 | 0.23 | 0.28 | 0.22 | 0.22 | 0.4 | 0.48 | 0.69 |
AAL20293 (sufA) | 0.24 | 0.33 | 0.37 | 0.09 | 0.04 | 0.25 | 1.0 | 0.27 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.35 | 0.49 | 0.08 | 0.83 | 0.15 | 0.49 | 0.26 | 0.38 | 0.24 | 0.54 | 0.01 | 0.2 | 0.21 | 0.1 | 0.03 | 0.7 | 0.05 | 0.0 | 0.07 | 0.21 | 0.02 | 0.7 | 0.21 | 0.05 | 0.41 | 0.13 | 0.17 |
AAL20294 (sufB) | 0.19 | 0.44 | 0.33 | 0.08 | 0.06 | 0.33 | 0.62 | 0.31 | 0.03 | 0.05 | 0.04 | 0.01 | 0.4 | 0.67 | 0.05 | 0.78 | 0.07 | 0.26 | 0.22 | 0.23 | 0.22 | 1.0 | 0.02 | 0.19 | 0.17 | 0.17 | 0.05 | 0.74 | 0.08 | 0.01 | 0.08 | 0.12 | 0.03 | 0.71 | 0.09 | 0.07 | 0.42 | 0.12 | 0.2 |
AAL20295 (sufC) | 0.14 | 0.38 | 0.13 | 0.06 | 0.03 | 0.28 | 0.28 | 0.13 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.13 | 0.32 | 0.03 | 0.39 | 0.02 | 0.14 | 0.12 | 0.12 | 0.13 | 1.0 | 0.01 | 0.1 | 0.1 | 0.08 | 0.03 | 0.19 | 0.07 | 0.01 | 0.04 | 0.03 | 0.03 | 0.29 | 0.03 | 0.04 | 0.16 | 0.05 | 0.04 |
AAL20296 (sufD) | 0.17 | 0.4 | 0.29 | 0.09 | 0.07 | 0.53 | 0.31 | 0.23 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.29 | 0.61 | 0.05 | 0.51 | 0.03 | 0.16 | 0.17 | 0.16 | 0.2 | 1.0 | 0.02 | 0.07 | 0.14 | 0.12 | 0.05 | 0.4 | 0.1 | 0.01 | 0.07 | 0.07 | 0.04 | 0.37 | 0.04 | 0.06 | 0.12 | 0.11 | 0.1 |
AAL20297 (sufS) | 0.17 | 0.44 | 0.4 | 0.09 | 0.09 | 0.8 | 0.25 | 0.24 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.03 | 0.37 | 0.67 | 0.05 | 0.45 | 0.03 | 0.2 | 0.17 | 0.19 | 0.34 | 1.0 | 0.01 | 0.17 | 0.21 | 0.13 | 0.07 | 0.44 | 0.13 | 0.01 | 0.09 | 0.08 | 0.05 | 0.24 | 0.04 | 0.08 | 0.2 | 0.12 | 0.12 |
AAL20298 (ynhA) | 0.21 | 0.5 | 0.44 | 0.09 | 0.11 | 0.75 | 0.41 | 0.26 | 0.05 | 0.05 | 0.08 | 0.03 | 0.45 | 0.65 | 0.06 | 0.83 | 0.05 | 0.18 | 0.24 | 0.22 | 0.53 | 1.0 | 0.05 | 0.22 | 0.31 | 0.1 | 0.1 | 0.44 | 0.13 | 0.01 | 0.12 | 0.11 | 0.05 | 0.63 | 0.07 | 0.09 | 0.31 | 0.14 | 0.17 |
AAL20299 (ynhG) | 0.16 | 0.36 | 1.0 | 0.19 | 0.15 | 0.54 | 0.2 | 0.25 | 0.14 | 0.23 | 0.19 | 0.07 | 0.92 | 0.32 | 0.21 | 0.31 | 0.16 | 0.26 | 0.25 | 0.27 | 0.34 | 0.35 | 0.03 | 0.19 | 0.39 | 0.36 | 0.16 | 0.37 | 0.21 | 0.03 | 0.16 | 0.17 | 0.15 | 0.25 | 0.16 | 0.16 | 0.32 | 0.34 | 0.29 |
AAL20627 (yciS) | 0.55 | 0.47 | 0.65 | 0.41 | 0.33 | 0.1 | 0.51 | 0.66 | 0.21 | 0.47 | 0.18 | 0.36 | 1.0 | 0.62 | 0.25 | 0.67 | 0.2 | 0.56 | 0.58 | 0.79 | 0.44 | 0.63 | 0.62 | 0.53 | 0.71 | 0.46 | 0.44 | 0.61 | 0.83 | 0.13 | 0.51 | 0.54 | 0.98 | 0.56 | 0.21 | 0.39 | 0.59 | 0.39 | 0.67 |
AAL20743 (yoaE) | 0.28 | 0.39 | 0.41 | 0.22 | 0.24 | 0.2 | 0.17 | 0.47 | 0.14 | 0.24 | 0.16 | 0.17 | 0.46 | 0.55 | 0.29 | 0.41 | 0.19 | 0.51 | 0.43 | 0.57 | 0.61 | 0.59 | 0.21 | 0.62 | 0.4 | 0.18 | 0.23 | 0.3 | 0.32 | 0.02 | 0.19 | 0.38 | 0.28 | 0.18 | 0.3 | 0.21 | 1.0 | 0.18 | 0.53 |
AAL20783 (STM1868A) | 0.06 | 0.02 | 1.0 | 0.0 | 0.19 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.38 | 0.01 | 0.0 | 0.12 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.07 | 0.0 | 0.02 | 0.04 | 0.0 | 0.11 | 0.0 | 0.55 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.06 | 0.38 | 0.71 |
AAL20794 (exoX) | 0.35 | 0.7 | 0.68 | 0.38 | 0.29 | 0.18 | 0.62 | 0.68 | 0.42 | 0.59 | 0.57 | 0.29 | 0.82 | 0.87 | 0.62 | 0.78 | 0.38 | 0.77 | 0.67 | 0.85 | 0.4 | 0.76 | 0.32 | 0.6 | 0.71 | 0.63 | 0.28 | 0.67 | 0.65 | 0.13 | 0.47 | 0.42 | 0.76 | 1.0 | 0.51 | 0.37 | 0.74 | 0.39 | 0.61 |
AAL20819 (yecE) | 0.31 | 0.73 | 0.62 | 0.22 | 0.18 | 0.3 | 0.4 | 0.6 | 0.31 | 0.39 | 0.43 | 0.38 | 0.59 | 1.0 | 0.32 | 0.21 | 0.23 | 0.39 | 0.29 | 0.38 | 0.41 | 0.69 | 0.1 | 0.56 | 0.47 | 0.52 | 0.66 | 0.38 | 0.31 | 0.07 | 0.23 | 0.22 | 0.39 | 0.16 | 0.22 | 0.51 | 0.77 | 0.21 | 0.36 |
AAL20820 (yecN) | 0.33 | 0.66 | 0.39 | 0.3 | 0.27 | 0.15 | 0.23 | 0.52 | 0.34 | 0.47 | 0.46 | 0.54 | 0.46 | 0.86 | 0.2 | 0.44 | 0.16 | 0.2 | 0.14 | 0.21 | 0.53 | 1.0 | 0.54 | 0.41 | 0.83 | 0.52 | 0.29 | 0.33 | 0.7 | 0.46 | 0.44 | 0.31 | 0.81 | 0.53 | 0.13 | 0.28 | 0.39 | 0.27 | 0.44 |
AAL20850 (ftn) | 0.07 | 0.39 | 0.12 | 0.26 | 0.31 | 0.05 | 0.13 | 0.16 | 0.4 | 0.38 | 0.3 | 0.43 | 0.07 | 0.03 | 1.0 | 0.08 | 0.21 | 0.18 | 0.14 | 0.23 | 0.01 | 0.24 | 0.2 | 0.2 | 0.04 | 0.22 | 0.73 | 0.2 | 0.25 | 0.04 | 0.14 | 0.19 | 0.52 | 0.13 | 0.1 | 0.66 | 0.2 | 0.12 | 0.17 |
AAL21148 (narP) | 0.16 | 0.66 | 0.25 | 0.4 | 0.46 | 0.07 | 0.2 | 0.44 | 0.45 | 0.58 | 0.53 | 0.6 | 0.35 | 0.2 | 0.93 | 0.18 | 0.39 | 0.49 | 0.44 | 0.57 | 0.13 | 1.0 | 0.34 | 0.38 | 0.18 | 0.24 | 0.27 | 0.37 | 0.43 | 0.07 | 0.25 | 0.3 | 0.69 | 0.23 | 0.13 | 0.23 | 0.61 | 0.57 | 0.28 |
AAL21308 (mntH) | 0.08 | 0.16 | 0.36 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.05 | 0.1 | 0.05 | 0.02 | 0.06 | 0.01 | 0.46 | 0.11 | 0.01 | 0.06 | 0.02 | 0.12 | 0.09 | 0.14 | 0.12 | 0.3 | 0.01 | 0.1 | 0.08 | 0.09 | 0.04 | 0.22 | 0.03 | 0.01 | 0.05 | 0.59 | 0.03 | 0.06 | 0.05 | 0.04 | 0.2 | 0.12 | 1.0 |
AAL21344 (amiA) | 0.42 | 0.41 | 0.29 | 0.27 | 0.27 | 0.07 | 0.59 | 0.5 | 0.19 | 0.23 | 0.19 | 0.17 | 0.37 | 0.47 | 0.68 | 0.14 | 0.5 | 0.61 | 0.64 | 0.75 | 0.07 | 0.25 | 0.3 | 0.7 | 0.11 | 0.26 | 0.27 | 0.42 | 0.33 | 0.21 | 0.26 | 0.36 | 0.32 | 0.14 | 0.68 | 0.32 | 1.0 | 0.3 | 0.41 |
AAL21345 (hemF) | 0.61 | 0.58 | 0.32 | 0.31 | 0.32 | 0.12 | 0.51 | 0.72 | 0.23 | 0.28 | 0.22 | 0.37 | 0.49 | 0.89 | 0.46 | 0.16 | 0.19 | 0.65 | 0.79 | 0.75 | 0.2 | 0.36 | 0.15 | 0.68 | 0.28 | 0.42 | 0.44 | 0.37 | 0.49 | 0.11 | 0.28 | 0.46 | 0.5 | 0.12 | 0.25 | 0.49 | 1.0 | 0.38 | 0.6 |
AAL21389 (yfgD) | 0.3 | 0.53 | 0.59 | 0.42 | 0.28 | 0.91 | 0.37 | 0.32 | 0.25 | 0.53 | 0.29 | 0.38 | 0.42 | 0.32 | 0.85 | 0.14 | 0.12 | 0.49 | 0.38 | 0.53 | 0.37 | 1.0 | 0.09 | 0.38 | 0.31 | 0.38 | 0.33 | 0.35 | 0.35 | 0.04 | 0.25 | 0.31 | 0.23 | 0.06 | 0.19 | 0.44 | 0.38 | 0.32 | 0.37 |
AAL21438 (yfhP) | 0.37 | 0.25 | 0.21 | 0.09 | 0.06 | 0.26 | 0.24 | 0.3 | 0.22 | 0.11 | 0.41 | 0.09 | 0.11 | 0.75 | 0.02 | 0.06 | 0.06 | 0.08 | 0.08 | 0.08 | 0.33 | 0.59 | 0.03 | 0.18 | 1.0 | 0.41 | 0.28 | 0.45 | 0.1 | 0.03 | 0.14 | 0.08 | 0.12 | 0.03 | 0.1 | 0.27 | 0.36 | 0.07 | 0.08 |
AAL21659 (iroB) | 0.21 | 1.0 | 0.06 | 0.06 | 0.02 | 0.42 | 0.52 | 0.19 | 0.04 | 0.03 | 0.11 | 0.01 | 0.05 | 0.22 | 0.01 | 0.09 | 0.04 | 0.02 | 0.11 | 0.07 | 0.21 | 0.38 | 0.01 | 0.15 | 0.06 | 0.03 | 0.12 | 0.21 | 0.03 | 0.0 | 0.03 | 0.09 | 0.04 | 0.01 | 0.48 | 0.04 | 0.63 | 0.03 | 0.1 |
AAL21660 (iroC) | 0.17 | 1.0 | 0.06 | 0.07 | 0.03 | 0.48 | 0.19 | 0.17 | 0.08 | 0.04 | 0.14 | 0.03 | 0.06 | 0.21 | 0.03 | 0.06 | 0.06 | 0.03 | 0.06 | 0.05 | 0.17 | 0.37 | 0.01 | 0.23 | 0.06 | 0.04 | 0.1 | 0.14 | 0.05 | 0.01 | 0.05 | 0.07 | 0.05 | 0.01 | 0.31 | 0.07 | 0.49 | 0.04 | 0.07 |
AAL21661 (iroD) | 0.2 | 1.0 | 0.07 | 0.09 | 0.06 | 0.85 | 0.11 | 0.17 | 0.11 | 0.06 | 0.18 | 0.08 | 0.07 | 0.26 | 0.08 | 0.05 | 0.05 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.3 | 0.38 | 0.01 | 0.39 | 0.11 | 0.09 | 0.21 | 0.12 | 0.08 | 0.01 | 0.05 | 0.06 | 0.08 | 0.01 | 0.19 | 0.1 | 0.78 | 0.06 | 0.09 |
AAL21662 (iroE) | 0.21 | 1.0 | 0.06 | 0.07 | 0.06 | 0.89 | 0.23 | 0.19 | 0.07 | 0.05 | 0.15 | 0.05 | 0.05 | 0.26 | 0.04 | 0.11 | 0.05 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.26 | 0.46 | 0.03 | 0.26 | 0.09 | 0.08 | 0.15 | 0.1 | 0.06 | 0.02 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.03 | 0.44 | 0.07 | 0.53 | 0.05 | 0.07 |
AAL21663 (iroN) | 0.23 | 0.6 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 1.0 | 0.28 | 0.19 | 0.04 | 0.02 | 0.11 | 0.01 | 0.02 | 0.16 | 0.01 | 0.15 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.26 | 0.35 | 0.01 | 0.14 | 0.09 | 0.02 | 0.07 | 0.09 | 0.02 | 0.01 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.46 | 0.01 | 0.06 |
AAL21690 (nrdH) | 0.12 | 0.34 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.43 | 0.06 | 0.1 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.27 | 0.01 | 0.07 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.2 | 1.0 | 0.0 | 0.06 | 0.06 | 0.07 | 0.01 | 0.16 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.14 | 0.01 | 0.19 | 0.0 | 0.01 |
AAL21691 (nrdI) | 0.02 | 0.26 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.15 | 0.04 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.14 | 0.0 | 0.01 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 1.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.18 | 0.01 | 0.05 | 0.0 | 0.0 |
AAL21692 (nrdE) | 0.04 | 0.29 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.34 | 0.07 | 0.1 | 0.02 | 0.01 | 0.05 | 0.0 | 0.02 | 0.26 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.06 | 1.0 | 0.01 | 0.09 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.09 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.16 | 0.02 | 0.2 | 0.01 | 0.02 |
AAL21693 (nrdF) | 0.15 | 0.36 | 0.06 | 0.05 | 0.02 | 0.6 | 0.15 | 0.14 | 0.08 | 0.04 | 0.22 | 0.01 | 0.05 | 0.33 | 0.03 | 0.12 | 0.18 | 0.05 | 0.04 | 0.06 | 0.1 | 1.0 | 0.01 | 0.16 | 0.08 | 0.11 | 0.03 | 0.15 | 0.03 | 0.05 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.6 | 0.02 | 0.39 | 0.03 | 0.03 |
AAL21741 (sitA) | 0.1 | 0.37 | 0.06 | 0.02 | 0.0 | 0.21 | 0.31 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.05 | 0.15 | 0.0 | 0.06 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.67 | 1.0 | 0.0 | 0.04 | 0.34 | 0.05 | 0.03 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.14 | 0.02 | 0.07 |
AAL21742 (sitB) | 0.09 | 0.33 | 0.06 | 0.02 | 0.0 | 0.09 | 0.29 | 0.06 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.05 | 0.1 | 0.01 | 0.08 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.57 | 1.0 | 0.0 | 0.05 | 0.18 | 0.02 | 0.02 | 0.08 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.15 | 0.02 | 0.04 |
AAL21743 (sitC) | 0.05 | 0.31 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.11 | 0.08 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.04 | 0.08 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.52 | 1.0 | 0.0 | 0.08 | 0.17 | 0.03 | 0.02 | 0.07 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.14 | 0.03 | 0.01 |
AAL21744 (sitD) | 0.09 | 0.28 | 0.06 | 0.02 | 0.01 | 0.18 | 0.22 | 0.05 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.04 | 0.06 | 0.02 | 0.07 | 0.05 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.45 | 1.0 | 0.01 | 0.08 | 0.18 | 0.03 | 0.02 | 0.06 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.27 | 0.02 | 0.01 |
AAL21804 (rpoS) | 0.4 | 0.51 | 0.8 | 0.53 | 0.35 | 0.58 | 0.82 | 0.46 | 0.35 | 0.98 | 0.37 | 0.08 | 0.87 | 0.71 | 0.2 | 0.3 | 0.23 | 0.69 | 0.88 | 0.9 | 0.28 | 0.5 | 0.22 | 0.42 | 0.24 | 0.81 | 0.25 | 1.0 | 0.57 | 0.17 | 0.39 | 0.23 | 0.62 | 0.27 | 0.25 | 0.4 | 0.41 | 0.79 | 0.25 |
AAL22036 (yghB) | 0.44 | 0.49 | 1.0 | 0.2 | 0.42 | 0.13 | 0.14 | 0.62 | 0.32 | 0.32 | 0.38 | 0.44 | 0.9 | 0.66 | 0.14 | 0.62 | 0.08 | 0.14 | 0.15 | 0.2 | 0.42 | 0.39 | 0.45 | 0.26 | 0.54 | 0.31 | 0.28 | 0.44 | 0.48 | 0.03 | 0.54 | 0.68 | 0.5 | 0.56 | 0.08 | 0.29 | 0.28 | 0.54 | 0.46 |
AAL22103 (yqjE) | 0.21 | 0.33 | 0.67 | 0.4 | 0.25 | 0.39 | 0.23 | 0.3 | 0.12 | 0.27 | 0.12 | 0.12 | 1.0 | 0.2 | 0.37 | 0.34 | 0.11 | 0.41 | 0.47 | 0.5 | 0.29 | 0.6 | 0.09 | 0.19 | 0.38 | 0.56 | 0.19 | 0.63 | 0.57 | 0.05 | 0.24 | 0.26 | 0.39 | 0.33 | 0.17 | 0.18 | 0.2 | 0.41 | 0.5 |
AAL22104 (yqjK) | 0.05 | 0.14 | 0.13 | 0.1 | 0.05 | 0.17 | 0.02 | 0.07 | 0.04 | 0.11 | 0.04 | 0.04 | 0.19 | 0.05 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.13 | 1.0 | 0.01 | 0.05 | 0.16 | 0.17 | 0.07 | 0.18 | 0.12 | 0.02 | 0.04 | 0.05 | 0.08 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.05 | 0.07 | 0.11 |
AAL22334 (ppiA) | 0.33 | 0.52 | 0.24 | 0.43 | 0.17 | 0.13 | 1.0 | 0.51 | 0.24 | 0.66 | 0.46 | 0.64 | 0.47 | 0.75 | 0.54 | 0.3 | 0.39 | 0.6 | 0.65 | 0.75 | 0.05 | 0.39 | 0.89 | 0.64 | 0.1 | 0.89 | 0.26 | 0.97 | 0.41 | 0.44 | 0.32 | 0.31 | 0.29 | 0.46 | 0.7 | 0.23 | 0.68 | 0.15 | 0.45 |
AAL22363 (envZ) | 0.3 | 0.6 | 0.45 | 0.34 | 0.37 | 0.19 | 0.7 | 0.43 | 0.29 | 0.41 | 0.35 | 0.47 | 0.56 | 0.44 | 1.0 | 0.2 | 0.58 | 0.73 | 0.63 | 0.73 | 0.23 | 0.66 | 0.17 | 0.57 | 0.23 | 0.44 | 0.57 | 0.61 | 0.23 | 0.13 | 0.24 | 0.45 | 0.2 | 0.14 | 0.73 | 0.6 | 0.76 | 0.31 | 0.89 |
AAL22428 (rpoH) | 0.9 | 0.43 | 0.3 | 0.35 | 0.2 | 0.19 | 0.24 | 0.54 | 0.44 | 0.36 | 0.66 | 0.3 | 0.5 | 0.55 | 0.28 | 0.38 | 0.24 | 0.23 | 0.26 | 0.3 | 0.38 | 1.0 | 0.39 | 0.23 | 0.78 | 0.35 | 0.19 | 0.57 | 0.56 | 0.08 | 0.33 | 0.35 | 0.62 | 0.48 | 0.31 | 0.22 | 0.42 | 0.26 | 0.4 |
AAL22495 (yhjW) | 0.3 | 0.25 | 0.1 | 0.13 | 0.12 | 0.03 | 0.08 | 0.2 | 0.09 | 0.1 | 0.12 | 0.07 | 0.18 | 0.2 | 0.34 | 0.16 | 0.2 | 0.14 | 0.13 | 0.16 | 0.19 | 0.86 | 1.0 | 0.38 | 0.14 | 0.06 | 0.12 | 0.21 | 0.12 | 0.04 | 0.09 | 0.18 | 0.12 | 0.18 | 0.19 | 0.11 | 0.77 | 0.09 | 0.29 |
AAL22505 (yiaD) | 0.17 | 0.25 | 0.12 | 0.2 | 0.15 | 0.59 | 0.28 | 0.18 | 0.17 | 0.14 | 0.19 | 0.17 | 0.08 | 0.2 | 0.11 | 0.02 | 0.16 | 0.05 | 0.06 | 0.08 | 0.06 | 1.0 | 0.07 | 0.35 | 0.08 | 0.3 | 0.46 | 0.1 | 0.08 | 0.05 | 0.04 | 0.19 | 0.09 | 0.01 | 0.09 | 0.39 | 0.6 | 0.14 | 0.16 |
AAL22607 (yicH) | 0.34 | 0.7 | 0.74 | 0.33 | 0.26 | 0.23 | 0.26 | 0.6 | 0.57 | 0.61 | 0.68 | 0.23 | 0.51 | 1.0 | 0.71 | 0.13 | 0.79 | 0.28 | 0.2 | 0.28 | 0.15 | 0.74 | 0.09 | 0.49 | 0.22 | 0.73 | 0.41 | 0.56 | 0.43 | 0.1 | 0.24 | 0.39 | 0.36 | 0.09 | 0.71 | 0.37 | 0.92 | 0.6 | 0.5 |
AAL22898 (cpxA) | 0.46 | 0.45 | 0.35 | 0.31 | 0.23 | 0.18 | 0.25 | 0.51 | 0.28 | 0.37 | 0.38 | 0.53 | 0.31 | 1.0 | 0.31 | 0.1 | 0.27 | 0.19 | 0.21 | 0.23 | 0.13 | 0.58 | 0.14 | 0.45 | 0.14 | 0.8 | 0.71 | 0.39 | 0.48 | 0.12 | 0.11 | 0.26 | 0.34 | 0.08 | 0.41 | 0.52 | 0.52 | 0.31 | 0.36 |
AAL22899 (cpxR) | 0.43 | 0.56 | 0.55 | 0.34 | 0.34 | 0.21 | 0.39 | 0.62 | 0.44 | 0.77 | 0.55 | 0.52 | 0.53 | 0.84 | 0.47 | 0.18 | 0.42 | 0.22 | 0.24 | 0.27 | 0.19 | 0.61 | 0.3 | 0.57 | 0.27 | 1.0 | 0.0 | 0.56 | 0.45 | 0.15 | 0.2 | 0.45 | 0.34 | 0.13 | 0.53 | 0.0 | 0.59 | 0.45 | 0.59 |
AAL22965 (yijC) | 0.72 | 0.72 | 0.62 | 0.49 | 0.4 | 0.16 | 0.42 | 0.92 | 0.63 | 0.53 | 0.98 | 0.45 | 0.58 | 1.0 | 0.85 | 0.25 | 0.82 | 0.37 | 0.33 | 0.43 | 0.19 | 0.54 | 0.34 | 0.51 | 0.3 | 0.41 | 0.66 | 0.73 | 0.54 | 0.14 | 0.42 | 0.69 | 0.53 | 0.2 | 0.71 | 0.74 | 0.55 | 0.48 | 0.67 |
AAL22966 (yijD) | 0.37 | 0.47 | 0.51 | 0.21 | 0.34 | 0.24 | 0.16 | 0.31 | 0.35 | 0.64 | 0.46 | 0.25 | 0.48 | 0.35 | 0.27 | 0.27 | 0.13 | 0.13 | 0.15 | 0.16 | 0.24 | 1.0 | 0.6 | 0.42 | 0.32 | 0.27 | 0.56 | 0.48 | 0.29 | 0.21 | 0.31 | 0.57 | 0.27 | 0.32 | 0.19 | 0.56 | 0.49 | 0.28 | 0.64 |
AAL23073 (aphA) | 0.13 | 0.4 | 0.31 | 0.15 | 0.14 | 0.05 | 0.18 | 0.16 | 0.22 | 0.78 | 0.27 | 0.08 | 0.19 | 0.13 | 0.37 | 0.15 | 0.3 | 0.19 | 0.17 | 0.26 | 0.02 | 1.0 | 0.68 | 0.17 | 0.06 | 0.18 | 0.13 | 0.23 | 0.07 | 0.05 | 0.17 | 0.17 | 0.08 | 0.23 | 0.4 | 0.2 | 0.25 | 0.34 | 0.14 |
AAL23171 (psd) | 0.42 | 0.6 | 0.62 | 0.31 | 0.35 | 0.16 | 0.5 | 0.58 | 0.34 | 0.83 | 0.39 | 0.48 | 0.75 | 0.78 | 0.76 | 0.42 | 0.29 | 0.62 | 0.48 | 0.63 | 0.24 | 0.67 | 0.54 | 0.67 | 0.17 | 0.68 | 0.51 | 0.71 | 0.45 | 0.08 | 0.36 | 0.49 | 0.35 | 0.45 | 0.52 | 0.42 | 1.0 | 0.67 | 0.79 |
AAL23231 (ytfP) | 0.44 | 0.55 | 0.83 | 0.31 | 0.43 | 0.41 | 0.45 | 0.83 | 0.67 | 0.69 | 0.68 | 0.54 | 0.64 | 1.0 | 0.39 | 0.49 | 0.42 | 0.29 | 0.28 | 0.39 | 0.52 | 0.88 | 0.38 | 0.54 | 0.57 | 0.62 | 0.52 | 0.55 | 0.51 | 1.0 | 0.29 | 0.63 | 0.5 | 0.42 | 0.41 | 0.61 | 0.54 | 0.39 | 0.73 |
AAL23370 (STM4552) | 0.65 | 0.46 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | 0.53 | 0.17 | 0.19 | 0.01 | 0.58 | 0.02 | 0.05 | 0.11 | 0.03 | 0.16 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.59 | 1.0 | 0.04 | 0.14 | 0.13 | 0.02 | 0.04 | 0.06 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.11 | 0.02 | 0.03 | 0.6 | 0.01 | 0.61 | 0.02 | 0.11 |
AAL23397 (slt) | 0.43 | 0.81 | 0.61 | 0.42 | 0.38 | 0.18 | 0.36 | 0.65 | 0.41 | 0.53 | 0.51 | 0.35 | 1.0 | 0.66 | 0.93 | 0.18 | 0.68 | 0.53 | 0.61 | 0.59 | 0.26 | 0.72 | 0.21 | 0.6 | 0.32 | 0.82 | 0.29 | 0.93 | 0.43 | 0.11 | 0.27 | 0.56 | 0.3 | 0.19 | 0.75 | 0.24 | 0.82 | 0.47 | 0.94 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)