View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19174 (cdaR) | 0.08 | 0.31 | 0.12 | 0.14 | 1.0 | 0.06 | 0.03 | 0.16 | 0.41 | 0.16 | 0.37 | 0.08 | 0.18 | 0.08 | 0.54 | 0.12 | 0.74 | 0.12 | 0.1 | 0.15 | 0.1 | 0.1 | 0.44 | 0.3 | 0.08 | 0.07 | 0.11 | 0.39 | 0.1 | 0.02 | 0.07 | 0.11 | 0.08 | 0.16 | 0.6 | 0.18 | 0.45 | 0.12 | 0.15 |
AAL19569 (citT) | 0.06 | 0.17 | 0.05 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.07 | 0.17 | 0.12 | 0.03 | 0.26 | 0.04 | 0.08 | 0.32 | 0.05 | 0.08 | 0.04 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.06 | 0.24 | 0.08 | 0.3 | 0.06 | 0.06 | 1.0 | 0.18 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.06 | 0.12 | 0.12 | 0.61 | 0.03 | 0.06 |
AAL19570 (citG) | 0.05 | 0.17 | 0.07 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.06 | 0.13 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.07 | 0.02 | 0.06 | 0.01 | 0.12 | 0.04 | 0.03 | 1.0 | 0.17 | 0.03 | 0.0 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.09 | 0.17 | 0.44 | 0.02 | 0.04 |
AAL19571 (citX) | 0.06 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.06 | 0.04 | 0.01 | 0.1 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.1 | 0.0 | 0.0 | 0.15 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.14 | 0.41 | 0.0 | 0.01 |
AAL19572 (citF) | 0.03 | 0.05 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.14 | 0.01 | 0.0 | 1.0 | 0.09 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.18 | 0.46 | 0.0 | 0.02 |
AAL19573 (citE) | 0.07 | 0.07 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.04 | 0.07 | 0.02 | 0.11 | 0.02 | 0.01 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.12 | 0.02 | 0.01 | 1.0 | 0.1 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.25 | 0.4 | 0.01 | 0.03 |
AAL19574 (citD) | 0.07 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.01 | 0.13 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.14 | 0.02 | 0.0 | 1.0 | 0.09 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.3 | 0.46 | 0.0 | 0.02 |
AAL19575 (citC) | 0.19 | 0.12 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.0 | 0.05 | 0.12 | 0.07 | 0.01 | 0.16 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | 0.53 | 0.04 | 0.01 | 0.45 | 0.1 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.32 | 1.0 | 0.01 | 0.02 |
AAL19577 (dpiA) | 0.11 | 0.17 | 0.12 | 0.13 | 0.11 | 0.02 | 0.14 | 0.21 | 0.14 | 0.22 | 0.17 | 0.29 | 0.12 | 0.12 | 0.13 | 0.08 | 0.13 | 0.2 | 0.16 | 0.2 | 0.06 | 0.11 | 0.06 | 0.32 | 0.07 | 0.09 | 0.24 | 0.14 | 0.26 | 0.02 | 0.06 | 0.11 | 0.31 | 0.09 | 0.11 | 0.13 | 1.0 | 0.1 | 0.28 |
AAL19684 (cydA) | 0.22 | 0.65 | 0.69 | 0.58 | 0.49 | 0.26 | 0.2 | 0.41 | 0.7 | 1.0 | 0.32 | 0.39 | 0.69 | 0.12 | 0.91 | 0.58 | 0.1 | 0.75 | 0.74 | 0.9 | 0.11 | 0.31 | 0.57 | 0.43 | 0.09 | 0.19 | 0.52 | 0.66 | 0.8 | 0.03 | 0.53 | 0.54 | 0.61 | 0.65 | 0.08 | 0.45 | 0.51 | 0.39 | 0.58 |
AAL19685 (cydB) | 0.19 | 0.55 | 1.0 | 0.51 | 0.4 | 0.31 | 0.17 | 0.38 | 0.58 | 0.83 | 0.2 | 0.48 | 0.89 | 0.17 | 0.76 | 0.48 | 0.04 | 0.37 | 0.35 | 0.5 | 0.12 | 0.18 | 0.38 | 0.42 | 0.08 | 0.17 | 0.48 | 0.43 | 0.61 | 0.02 | 0.56 | 0.49 | 0.44 | 0.39 | 0.04 | 0.44 | 0.47 | 0.38 | 0.42 |
AAL19687 (ybgE) | 0.3 | 0.8 | 0.65 | 0.45 | 0.46 | 0.26 | 0.23 | 0.37 | 0.22 | 0.68 | 0.11 | 0.45 | 0.88 | 0.2 | 0.33 | 0.7 | 0.06 | 0.37 | 0.49 | 0.49 | 0.23 | 0.95 | 0.61 | 0.58 | 0.22 | 0.15 | 0.68 | 0.61 | 1.0 | 0.11 | 0.23 | 0.54 | 0.8 | 0.54 | 0.07 | 0.53 | 0.59 | 0.2 | 0.6 |
AAL19899 (dmsA) | 0.03 | 0.24 | 0.11 | 0.24 | 0.09 | 0.02 | 0.02 | 0.17 | 0.22 | 0.58 | 0.2 | 0.46 | 0.2 | 0.01 | 1.0 | 0.27 | 0.01 | 0.45 | 0.39 | 0.57 | 0.01 | 0.01 | 0.46 | 0.17 | 0.01 | 0.01 | 0.08 | 0.75 | 0.03 | 0.0 | 0.45 | 0.14 | 0.02 | 0.46 | 0.01 | 0.1 | 0.14 | 0.08 | 0.14 |
AAL19900 (dmsB) | 0.04 | 0.27 | 0.09 | 0.33 | 0.05 | 0.01 | 0.03 | 0.19 | 0.16 | 0.57 | 0.12 | 0.65 | 0.17 | 0.01 | 1.0 | 0.15 | 0.0 | 0.81 | 0.72 | 0.98 | 0.01 | 0.0 | 0.26 | 0.19 | 0.01 | 0.01 | 0.07 | 0.68 | 0.03 | 0.0 | 0.41 | 0.07 | 0.02 | 0.24 | 0.01 | 0.04 | 0.22 | 0.03 | 0.11 |
AAL19901 (dmsC) | 0.06 | 0.36 | 0.08 | 0.16 | 0.03 | 0.01 | 0.04 | 0.17 | 0.17 | 0.39 | 0.11 | 1.0 | 0.15 | 0.03 | 0.58 | 0.35 | 0.01 | 0.6 | 0.48 | 0.73 | 0.23 | 0.1 | 0.57 | 0.35 | 0.09 | 0.01 | 0.14 | 0.82 | 0.06 | 0.0 | 0.45 | 0.05 | 0.05 | 0.43 | 0.02 | 0.09 | 0.53 | 0.03 | 0.09 |
AAL20353 (sodB) | 0.18 | 0.36 | 0.54 | 0.33 | 0.35 | 0.01 | 0.3 | 0.26 | 0.26 | 0.92 | 0.16 | 0.16 | 0.52 | 0.03 | 0.57 | 0.57 | 0.19 | 0.51 | 0.56 | 0.68 | 0.03 | 0.17 | 1.0 | 0.16 | 0.13 | 0.09 | 0.15 | 0.61 | 0.22 | 0.1 | 0.81 | 0.38 | 0.24 | 0.87 | 0.14 | 0.18 | 0.1 | 0.46 | 0.4 |
AAL20411 (STM1492) | 0.06 | 0.11 | 0.25 | 0.06 | 0.06 | 0.02 | 0.27 | 0.07 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.01 | 0.2 | 0.07 | 0.02 | 0.16 | 0.02 | 0.11 | 0.08 | 0.09 | 0.03 | 0.11 | 0.02 | 1.0 | 0.05 | 0.08 | 0.02 | 0.1 | 0.03 | 0.01 | 0.1 | 0.05 | 0.03 | 0.1 | 0.05 | 0.03 | 0.55 | 0.13 | 0.05 |
AAL20473 (STM1555) | 0.27 | 0.76 | 0.53 | 0.23 | 0.44 | 0.1 | 0.16 | 0.57 | 0.2 | 0.52 | 0.33 | 0.28 | 0.54 | 0.97 | 0.35 | 0.8 | 0.21 | 0.37 | 0.35 | 0.46 | 0.19 | 0.49 | 1.0 | 0.19 | 0.4 | 0.52 | 0.27 | 0.47 | 0.3 | 0.07 | 0.4 | 0.48 | 0.33 | 0.61 | 0.21 | 0.25 | 0.24 | 0.45 | 0.54 |
AAL20650 (ompW) | 0.13 | 0.26 | 0.6 | 0.1 | 0.04 | 0.01 | 0.03 | 0.14 | 0.14 | 0.09 | 0.11 | 0.27 | 0.75 | 0.01 | 0.46 | 0.42 | 0.03 | 0.55 | 0.5 | 0.82 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.07 | 0.01 | 0.02 | 0.17 | 0.66 | 0.1 | 0.0 | 0.56 | 0.08 | 0.13 | 0.75 | 0.01 | 0.2 | 0.06 | 0.1 | 0.05 |
AAL20934 (cbiT) | 0.03 | 0.15 | 0.11 | 0.16 | 0.06 | 0.02 | 0.01 | 0.12 | 0.06 | 0.24 | 0.05 | 0.31 | 0.21 | 0.02 | 1.0 | 0.08 | 0.02 | 0.06 | 0.04 | 0.07 | 0.02 | 0.02 | 0.23 | 0.08 | 0.02 | 0.02 | 0.11 | 0.31 | 0.18 | 0.0 | 0.13 | 0.07 | 0.26 | 0.12 | 0.02 | 0.02 | 0.13 | 0.05 | 0.12 |
AAL20935 (cbiE) | 0.04 | 0.27 | 0.18 | 0.25 | 0.13 | 0.05 | 0.02 | 0.23 | 0.11 | 0.39 | 0.08 | 0.48 | 0.31 | 0.04 | 1.0 | 0.1 | 0.03 | 0.08 | 0.06 | 0.1 | 0.03 | 0.03 | 0.2 | 0.12 | 0.04 | 0.04 | 0.23 | 0.57 | 0.34 | 0.0 | 0.19 | 0.14 | 0.48 | 0.13 | 0.02 | 0.04 | 0.18 | 0.08 | 0.3 |
AAL20936 (cbiD) | 0.06 | 0.27 | 0.29 | 0.33 | 0.19 | 0.05 | 0.03 | 0.29 | 0.14 | 0.42 | 0.12 | 0.5 | 0.42 | 0.07 | 1.0 | 0.2 | 0.04 | 0.11 | 0.09 | 0.14 | 0.03 | 0.06 | 0.63 | 0.17 | 0.04 | 0.05 | 0.21 | 0.63 | 0.34 | 0.01 | 0.23 | 0.24 | 0.46 | 0.35 | 0.03 | 0.05 | 0.29 | 0.12 | 0.64 |
AAL20937 (cbiC) | 0.07 | 0.34 | 0.33 | 0.32 | 0.23 | 0.06 | 0.03 | 0.21 | 0.15 | 0.54 | 0.11 | 0.54 | 0.38 | 0.05 | 0.79 | 0.2 | 0.04 | 0.1 | 0.08 | 0.12 | 0.04 | 0.05 | 0.56 | 0.15 | 0.07 | 0.06 | 0.26 | 0.58 | 0.42 | 0.0 | 0.22 | 0.35 | 0.58 | 0.32 | 0.03 | 0.07 | 0.21 | 0.14 | 1.0 |
AAL20938 (cibB) | 0.08 | 0.27 | 0.2 | 0.18 | 0.23 | 0.02 | 0.02 | 0.16 | 0.12 | 0.25 | 0.11 | 0.29 | 0.25 | 0.06 | 0.54 | 0.08 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.07 | 0.04 | 0.07 | 0.11 | 0.22 | 0.06 | 0.05 | 0.16 | 0.4 | 0.22 | 0.01 | 0.18 | 0.33 | 0.3 | 0.08 | 0.04 | 0.04 | 0.25 | 0.12 | 1.0 |
AAL20939 (cbiA) | 0.04 | 0.18 | 0.15 | 0.19 | 0.34 | 0.01 | 0.02 | 0.18 | 0.13 | 0.27 | 0.1 | 0.2 | 0.27 | 0.03 | 0.85 | 0.14 | 0.04 | 0.07 | 0.06 | 0.09 | 0.03 | 0.03 | 0.25 | 0.15 | 0.06 | 0.03 | 0.12 | 0.32 | 0.23 | 0.0 | 0.17 | 0.48 | 0.38 | 0.21 | 0.03 | 0.04 | 0.2 | 0.12 | 1.0 |
AAL21104 (lysP) | 0.22 | 0.21 | 0.09 | 0.16 | 0.08 | 0.09 | 0.17 | 0.45 | 0.09 | 0.06 | 0.05 | 0.19 | 0.16 | 1.0 | 0.14 | 0.1 | 0.1 | 0.55 | 0.6 | 0.64 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.26 | 0.08 | 0.12 | 0.27 | 0.17 | 0.32 | 0.04 | 0.1 | 0.1 | 0.36 | 0.09 | 0.12 | 0.13 | 0.35 | 0.07 | 0.19 |
AAL21185 (glpA) | 0.14 | 0.61 | 0.14 | 0.27 | 0.0 | 0.08 | 0.03 | 0.04 | 0.35 | 0.0 | 0.25 | 0.87 | 0.33 | 0.0 | 1.0 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.15 | 0.03 | 0.34 | 0.06 | 0.06 | 0.05 | 0.11 | 0.02 | 0.0 | 0.85 | 0.18 | 0.02 | 0.0 | 0.04 | 0.33 | 0.25 | 0.16 | 0.15 |
AAL21793 (STM2913) | 0.06 | 0.26 | 0.25 | 0.25 | 0.07 | 0.16 | 0.05 | 0.16 | 0.21 | 0.19 | 0.12 | 0.03 | 0.19 | 0.15 | 0.08 | 0.09 | 0.24 | 0.7 | 0.44 | 1.0 | 0.11 | 0.09 | 0.1 | 0.33 | 0.07 | 0.08 | 0.06 | 0.96 | 0.07 | 0.09 | 0.09 | 0.07 | 0.07 | 0.06 | 0.92 | 0.08 | 0.62 | 0.11 | 0.1 |
AAL21794 (STM2914) | 0.01 | 0.14 | 0.14 | 0.16 | 0.02 | 0.12 | 0.01 | 0.05 | 0.13 | 0.15 | 0.05 | 0.0 | 0.06 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.2 | 0.42 | 0.35 | 0.63 | 0.04 | 0.04 | 0.08 | 0.19 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | 0.41 | 0.02 | 0.05 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 1.0 | 0.05 | 0.38 | 0.04 | 0.02 |
AAL21795 (ygbM) | 0.03 | 0.22 | 0.25 | 0.33 | 0.04 | 0.21 | 0.01 | 0.12 | 0.32 | 0.15 | 0.14 | 0.02 | 0.11 | 0.06 | 0.09 | 0.07 | 0.27 | 0.76 | 0.56 | 0.9 | 0.08 | 0.08 | 0.11 | 0.2 | 0.05 | 0.15 | 0.06 | 0.48 | 0.05 | 0.07 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.04 | 1.0 | 0.06 | 0.27 | 0.11 | 0.04 |
AAL21796 (ygbL) | 0.01 | 0.05 | 0.06 | 0.13 | 0.01 | 0.06 | 0.01 | 0.04 | 0.1 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.29 | 0.54 | 0.44 | 0.59 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.1 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.13 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.01 | 0.19 | 0.02 | 0.01 |
AAL21797 (ygbK) | 0.02 | 0.13 | 0.18 | 0.29 | 0.02 | 0.21 | 0.0 | 0.1 | 0.38 | 0.12 | 0.11 | 0.02 | 0.19 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | 0.36 | 0.67 | 0.65 | 0.72 | 0.06 | 0.05 | 0.04 | 0.07 | 0.04 | 0.16 | 0.03 | 0.38 | 0.06 | 0.11 | 0.01 | 0.02 | 0.06 | 0.02 | 1.0 | 0.04 | 0.11 | 0.07 | 0.05 |
AAL21798 (ygbJ) | 0.02 | 0.1 | 0.18 | 0.24 | 0.02 | 0.11 | 0.0 | 0.07 | 0.29 | 0.07 | 0.06 | 0.01 | 0.26 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.38 | 0.91 | 0.74 | 1.0 | 0.07 | 0.03 | 0.03 | 0.08 | 0.05 | 0.13 | 0.03 | 0.35 | 0.12 | 0.06 | 0.01 | 0.03 | 0.12 | 0.01 | 0.8 | 0.03 | 0.12 | 0.04 | 0.08 |
AAL21839 (STM2959) | 0.23 | 0.63 | 0.53 | 0.34 | 0.67 | 0.14 | 0.25 | 0.41 | 0.37 | 0.3 | 0.25 | 0.21 | 0.71 | 0.37 | 0.29 | 0.2 | 0.21 | 0.36 | 0.27 | 0.4 | 0.54 | 0.24 | 0.23 | 0.2 | 0.52 | 0.16 | 0.43 | 1.0 | 0.26 | 0.03 | 0.37 | 0.41 | 0.24 | 0.16 | 0.14 | 0.38 | 0.25 | 0.29 | 0.58 |
AAL21840 (gudD) | 0.03 | 0.12 | 0.09 | 0.17 | 1.0 | 0.08 | 0.05 | 0.07 | 0.23 | 0.18 | 0.1 | 0.04 | 0.08 | 0.07 | 0.18 | 0.04 | 0.18 | 0.09 | 0.07 | 0.09 | 0.04 | 0.03 | 0.18 | 0.03 | 0.05 | 0.04 | 0.13 | 0.6 | 0.05 | 0.01 | 0.04 | 0.07 | 0.04 | 0.02 | 0.07 | 0.07 | 0.05 | 0.07 | 0.12 |
AAL21841 (ygcY) | 0.02 | 0.09 | 0.03 | 0.08 | 1.0 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.11 | 0.06 | 0.08 | 0.01 | 0.04 | 0.03 | 0.19 | 0.01 | 0.14 | 0.05 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.09 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.06 | 0.31 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.08 |
AAL21842 (gudT) | 0.01 | 0.09 | 0.02 | 0.03 | 1.0 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.09 | 0.03 | 0.07 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.1 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.25 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.2 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.04 |
AAL21889 (lysA) | 0.29 | 0.18 | 0.05 | 0.12 | 0.01 | 0.09 | 0.12 | 0.46 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.78 | 0.11 | 0.03 | 0.04 | 0.83 | 1.0 | 0.89 | 0.04 | 0.05 | 0.01 | 0.15 | 0.25 | 0.06 | 0.04 | 0.34 | 0.35 | 0.0 | 0.04 | 0.06 | 0.33 | 0.01 | 0.06 | 0.03 | 0.31 | 0.04 | 0.07 |
AAL22017 (hybG) | 0.12 | 0.15 | 0.06 | 0.15 | 0.07 | 0.02 | 0.14 | 0.24 | 0.14 | 0.25 | 0.1 | 0.43 | 0.14 | 0.09 | 0.83 | 0.25 | 0.08 | 0.66 | 0.47 | 0.8 | 0.03 | 0.07 | 1.0 | 0.14 | 0.03 | 0.03 | 0.13 | 0.41 | 0.15 | 0.02 | 0.24 | 0.11 | 0.17 | 0.64 | 0.14 | 0.04 | 0.21 | 0.04 | 0.12 |
AAL22018 (hybF) | 0.14 | 0.3 | 0.1 | 0.2 | 0.12 | 0.04 | 0.11 | 0.28 | 0.23 | 0.33 | 0.24 | 1.0 | 0.29 | 0.17 | 0.57 | 0.14 | 0.04 | 0.52 | 0.45 | 0.68 | 0.05 | 0.1 | 0.35 | 0.15 | 0.04 | 0.05 | 0.24 | 0.55 | 0.29 | 0.01 | 0.44 | 0.19 | 0.35 | 0.2 | 0.09 | 0.08 | 0.18 | 0.08 | 0.19 |
AAL22019 (hybE) | 0.14 | 0.24 | 0.11 | 0.23 | 0.1 | 0.04 | 0.06 | 0.29 | 0.3 | 0.47 | 0.23 | 1.0 | 0.22 | 0.14 | 0.55 | 0.26 | 0.03 | 0.35 | 0.39 | 0.59 | 0.02 | 0.06 | 0.87 | 0.21 | 0.03 | 0.06 | 0.23 | 0.62 | 0.45 | 0.01 | 0.46 | 0.17 | 0.48 | 0.55 | 0.05 | 0.08 | 0.42 | 0.08 | 0.17 |
AAL22020 (hybD) | 0.13 | 0.24 | 0.14 | 0.19 | 0.12 | 0.03 | 0.06 | 0.23 | 0.22 | 0.46 | 0.18 | 0.58 | 0.24 | 0.08 | 0.41 | 0.25 | 0.06 | 0.35 | 0.46 | 0.56 | 0.02 | 0.11 | 1.0 | 0.1 | 0.02 | 0.05 | 0.12 | 0.48 | 0.26 | 0.01 | 0.34 | 0.18 | 0.29 | 0.53 | 0.09 | 0.05 | 0.12 | 0.11 | 0.2 |
AAL22021 (hybC) | 0.14 | 0.31 | 0.16 | 0.32 | 0.18 | 0.04 | 0.1 | 0.32 | 0.35 | 0.68 | 0.27 | 0.87 | 0.27 | 0.13 | 0.79 | 0.26 | 0.08 | 0.65 | 0.69 | 0.89 | 0.03 | 0.11 | 1.0 | 0.18 | 0.03 | 0.07 | 0.22 | 0.6 | 0.45 | 0.01 | 0.52 | 0.24 | 0.45 | 0.51 | 0.13 | 0.1 | 0.23 | 0.16 | 0.31 |
AAL22022 (hybB) | 0.06 | 0.13 | 0.05 | 0.12 | 0.11 | 0.01 | 0.02 | 0.08 | 0.12 | 0.22 | 0.06 | 0.39 | 0.12 | 0.02 | 0.36 | 0.25 | 0.01 | 0.24 | 0.22 | 0.3 | 0.0 | 0.02 | 1.0 | 0.23 | 0.01 | 0.01 | 0.09 | 0.25 | 0.2 | 0.0 | 0.2 | 0.12 | 0.2 | 0.54 | 0.03 | 0.03 | 0.2 | 0.08 | 0.18 |
AAL22023 (hybA) | 0.06 | 0.1 | 0.04 | 0.16 | 0.08 | 0.01 | 0.02 | 0.1 | 0.09 | 0.25 | 0.04 | 0.24 | 0.15 | 0.01 | 0.55 | 0.28 | 0.01 | 0.53 | 0.47 | 0.6 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.06 | 0.01 | 0.01 | 0.06 | 0.23 | 0.15 | 0.0 | 0.18 | 0.1 | 0.17 | 0.75 | 0.02 | 0.03 | 0.09 | 0.07 | 0.17 |
AAL22024 (hypO) | 0.09 | 0.12 | 0.12 | 0.17 | 0.13 | 0.02 | 0.03 | 0.14 | 0.14 | 0.37 | 0.13 | 0.27 | 0.23 | 0.01 | 0.47 | 0.36 | 0.02 | 0.61 | 0.65 | 0.77 | 0.0 | 0.02 | 1.0 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.07 | 0.26 | 0.17 | 0.0 | 0.28 | 0.16 | 0.19 | 0.7 | 0.02 | 0.05 | 0.12 | 0.12 | 0.16 |
AAL22117 (tdcB) | 0.02 | 0.03 | 0.0 | 0.12 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.12 | 0.1 | 0.04 | 0.13 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.18 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.17 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.11 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.04 | 0.01 | 0.34 |
AAL22118 (tdcA) | 0.09 | 0.19 | 0.04 | 0.21 | 0.67 | 0.02 | 0.01 | 0.56 | 0.75 | 0.42 | 0.79 | 0.07 | 0.06 | 0.01 | 0.88 | 0.14 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.05 | 0.01 | 0.03 | 1.0 | 0.21 | 0.06 | 0.01 | 0.03 | 0.52 | 0.01 | 0.02 | 0.13 | 0.44 | 0.01 | 0.25 | 0.06 | 0.02 | 0.35 | 0.16 | 0.51 |
AAL22119 (garK) | 0.02 | 0.19 | 0.08 | 0.26 | 1.0 | 0.05 | 0.02 | 0.06 | 0.2 | 0.12 | 0.11 | 0.03 | 0.06 | 0.04 | 0.42 | 0.02 | 0.31 | 0.1 | 0.08 | 0.12 | 0.05 | 0.02 | 0.09 | 0.19 | 0.06 | 0.03 | 0.09 | 0.7 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.1 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.06 | 0.54 | 0.05 | 0.26 |
AAL22120 (garR) | 0.01 | 0.13 | 0.11 | 0.32 | 1.0 | 0.1 | 0.01 | 0.04 | 0.39 | 0.24 | 0.2 | 0.02 | 0.06 | 0.02 | 0.4 | 0.01 | 0.57 | 0.06 | 0.04 | 0.07 | 0.03 | 0.02 | 0.06 | 0.05 | 0.05 | 0.03 | 0.09 | 0.63 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.11 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.06 | 0.17 | 0.06 | 0.18 |
AAL22121 (garL) | 0.01 | 0.13 | 0.05 | 0.11 | 1.0 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.25 | 0.1 | 0.14 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.12 | 0.01 | 0.17 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.07 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.07 | 0.28 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.12 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.1 | 0.04 | 0.15 |
AAL22122 (garD) | 0.01 | 0.1 | 0.04 | 0.07 | 1.0 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.1 | 0.05 | 0.09 | 0.01 | 0.04 | 0.02 | 0.08 | 0.01 | 0.07 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.04 | 0.01 | 0.09 | 0.2 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.11 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.11 | 0.04 | 0.11 |
AAL22375 (malQ) | 0.03 | 0.12 | 0.15 | 0.22 | 0.11 | 0.03 | 0.03 | 0.23 | 0.1 | 0.06 | 0.07 | 0.24 | 0.16 | 0.06 | 0.46 | 0.04 | 0.48 | 0.07 | 0.06 | 0.07 | 0.09 | 0.04 | 0.1 | 0.5 | 0.06 | 0.06 | 0.07 | 0.08 | 0.1 | 0.01 | 0.05 | 0.06 | 0.08 | 0.04 | 1.0 | 0.06 | 0.28 | 0.08 | 0.13 |
AAL22376 (malP) | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.16 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.25 | 0.06 | 0.03 | 0.04 | 0.12 | 0.03 | 0.03 | 0.42 | 0.02 | 0.54 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.08 | 0.31 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 1.0 | 0.01 | 0.18 | 0.02 | 0.08 |
AAL22377 (malT) | 0.1 | 0.2 | 0.36 | 0.24 | 0.92 | 0.04 | 0.06 | 0.42 | 0.27 | 0.27 | 0.19 | 0.24 | 0.45 | 0.23 | 0.57 | 0.14 | 0.49 | 0.09 | 0.08 | 0.14 | 0.09 | 0.06 | 0.14 | 0.19 | 0.09 | 0.11 | 0.05 | 0.43 | 0.13 | 0.02 | 0.13 | 0.71 | 0.21 | 0.18 | 0.85 | 0.1 | 0.12 | 0.44 | 1.0 |
AAL22452 (yhiP) | 0.13 | 0.25 | 0.19 | 0.36 | 0.78 | 0.07 | 0.03 | 0.08 | 0.63 | 0.36 | 0.46 | 0.1 | 0.25 | 0.02 | 0.82 | 0.34 | 0.27 | 0.25 | 0.26 | 0.33 | 0.0 | 0.08 | 0.64 | 0.2 | 0.01 | 0.04 | 0.07 | 0.64 | 0.01 | 0.03 | 0.22 | 0.88 | 0.01 | 0.79 | 0.48 | 0.08 | 0.3 | 0.33 | 1.0 |
AAL22653 (ilvN) | 0.14 | 0.12 | 0.21 | 0.12 | 0.38 | 0.21 | 0.03 | 0.19 | 0.14 | 0.18 | 0.18 | 0.04 | 0.17 | 0.28 | 0.06 | 0.14 | 0.08 | 0.23 | 0.26 | 0.34 | 0.04 | 0.08 | 0.07 | 0.2 | 0.04 | 0.27 | 0.05 | 0.19 | 0.26 | 0.02 | 0.06 | 0.11 | 0.14 | 0.08 | 0.12 | 0.06 | 0.42 | 1.0 | 0.11 |
AAL22654 (ilvB) | 0.13 | 0.14 | 0.23 | 0.14 | 0.41 | 0.23 | 0.02 | 0.21 | 0.15 | 0.15 | 0.18 | 0.02 | 0.22 | 0.31 | 0.11 | 0.07 | 0.06 | 0.46 | 0.48 | 0.65 | 0.03 | 0.08 | 0.03 | 0.19 | 0.04 | 0.41 | 0.05 | 0.21 | 0.24 | 0.01 | 0.05 | 0.11 | 0.15 | 0.04 | 0.09 | 0.05 | 0.32 | 1.0 | 0.14 |
AAL23051 (malG) | 0.14 | 0.24 | 0.14 | 0.2 | 0.24 | 0.09 | 0.12 | 0.49 | 0.28 | 0.07 | 0.26 | 0.12 | 0.13 | 0.36 | 0.47 | 0.06 | 0.75 | 0.07 | 0.09 | 0.09 | 0.16 | 0.36 | 0.34 | 0.46 | 0.2 | 0.09 | 0.06 | 0.1 | 0.12 | 0.01 | 0.05 | 0.1 | 0.11 | 0.05 | 1.0 | 0.07 | 0.33 | 0.05 | 0.15 |
AAL23052 (malF) | 0.04 | 0.13 | 0.04 | 0.29 | 0.14 | 0.02 | 0.03 | 0.45 | 0.24 | 0.05 | 0.19 | 0.11 | 0.06 | 0.06 | 1.0 | 0.03 | 0.77 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.02 | 0.04 | 0.79 | 0.57 | 0.03 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.05 | 0.02 | 0.15 | 0.98 | 0.03 | 0.38 | 0.02 | 0.13 |
AAL23053 (malE) | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.18 | 0.07 | 0.01 | 0.0 | 0.37 | 0.14 | 0.03 | 0.11 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.66 | 0.0 | 0.73 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.21 | 0.23 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.03 | 1.0 | 0.01 | 0.11 | 0.0 | 0.06 |
AAL23054 (malK) | 0.0 | 0.06 | 0.0 | 0.18 | 0.19 | 0.01 | 0.0 | 0.33 | 0.3 | 0.01 | 0.19 | 0.12 | 0.02 | 0.02 | 1.0 | 0.0 | 0.51 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.32 | 0.9 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.01 | 0.05 | 0.62 | 0.02 | 0.32 | 0.0 | 0.22 |
AAL23055 (lamB) | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.28 | 0.23 | 0.03 | 0.0 | 0.33 | 0.25 | 0.02 | 0.08 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.76 | 0.0 | 0.62 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.47 | 0.24 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.0 | 0.03 | 1.0 | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.18 |
AAL23056 (malM) | 0.01 | 0.04 | 0.02 | 0.34 | 0.1 | 0.03 | 0.01 | 0.34 | 0.16 | 0.03 | 0.09 | 0.06 | 0.04 | 0.02 | 1.0 | 0.0 | 0.55 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.3 | 0.28 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.64 | 0.02 | 0.17 | 0.01 | 0.07 |
AAL23124 (fumB) | 0.05 | 0.26 | 0.03 | 0.35 | 0.31 | 0.02 | 0.09 | 0.25 | 0.2 | 0.33 | 0.25 | 0.64 | 0.06 | 0.04 | 1.0 | 0.09 | 0.03 | 0.06 | 0.06 | 0.08 | 0.01 | 0.02 | 0.15 | 0.15 | 0.01 | 0.04 | 0.15 | 0.29 | 0.16 | 0.01 | 0.08 | 0.25 | 0.21 | 0.23 | 0.05 | 0.06 | 0.24 | 0.03 | 0.44 |
AAL23125 (dcuB) | 0.06 | 0.41 | 0.03 | 0.38 | 0.89 | 0.05 | 0.04 | 0.19 | 0.42 | 0.44 | 0.45 | 1.0 | 0.04 | 0.02 | 0.98 | 0.22 | 0.01 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.03 | 0.26 | 0.28 | 0.02 | 0.05 | 0.17 | 0.52 | 0.29 | 0.01 | 0.08 | 0.69 | 0.39 | 0.55 | 0.02 | 0.07 | 0.56 | 0.02 | 0.94 |
AAL23126 (STM4302) | 0.02 | 0.25 | 0.04 | 0.14 | 1.0 | 0.02 | 0.09 | 0.19 | 0.28 | 0.47 | 0.33 | 0.09 | 0.03 | 0.0 | 0.35 | 0.14 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.44 | 0.15 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.17 | 0.06 | 0.05 | 0.02 | 0.84 | 0.07 | 0.29 | 0.01 | 0.01 | 0.54 | 0.01 | 0.42 |
AAL23148 (dcuA) | 0.07 | 0.17 | 0.1 | 0.31 | 0.19 | 0.06 | 0.02 | 0.08 | 0.21 | 0.5 | 0.15 | 0.46 | 0.19 | 0.01 | 1.0 | 0.26 | 0.01 | 0.23 | 0.22 | 0.37 | 0.01 | 0.04 | 0.78 | 0.11 | 0.02 | 0.04 | 0.12 | 0.39 | 0.07 | 0.0 | 0.23 | 0.31 | 0.07 | 0.45 | 0.01 | 0.06 | 0.15 | 0.1 | 0.4 |
AAL23149 (aspA) | 0.07 | 0.18 | 0.16 | 0.26 | 0.52 | 0.04 | 0.03 | 0.14 | 0.33 | 0.47 | 0.28 | 0.37 | 0.2 | 0.01 | 0.87 | 0.3 | 0.17 | 0.22 | 0.22 | 0.3 | 0.02 | 0.05 | 1.0 | 0.08 | 0.03 | 0.04 | 0.11 | 0.61 | 0.05 | 0.03 | 0.32 | 0.5 | 0.04 | 0.63 | 0.3 | 0.09 | 0.07 | 0.27 | 0.47 |
AAL23163 (frdD) | 0.09 | 0.34 | 0.23 | 0.4 | 0.31 | 0.04 | 0.02 | 0.14 | 0.38 | 0.39 | 0.36 | 1.0 | 0.33 | 0.02 | 0.44 | 0.12 | 0.02 | 0.11 | 0.12 | 0.15 | 0.01 | 0.05 | 0.33 | 0.26 | 0.01 | 0.08 | 0.25 | 0.71 | 0.77 | 0.01 | 0.25 | 0.35 | 0.89 | 0.21 | 0.03 | 0.28 | 0.18 | 0.16 | 0.51 |
AAL23164 (frdC) | 0.06 | 0.4 | 0.14 | 0.46 | 0.19 | 0.04 | 0.04 | 0.19 | 0.3 | 0.4 | 0.33 | 1.0 | 0.18 | 0.02 | 0.75 | 0.19 | 0.05 | 0.23 | 0.2 | 0.27 | 0.01 | 0.03 | 0.52 | 0.2 | 0.01 | 0.07 | 0.19 | 0.53 | 0.66 | 0.01 | 0.23 | 0.22 | 0.69 | 0.4 | 0.06 | 0.21 | 0.13 | 0.12 | 0.34 |
AAL23165 (frdB) | 0.07 | 0.34 | 0.2 | 0.38 | 0.27 | 0.04 | 0.03 | 0.15 | 0.39 | 0.41 | 0.39 | 1.0 | 0.24 | 0.01 | 0.73 | 0.17 | 0.01 | 0.14 | 0.16 | 0.2 | 0.0 | 0.04 | 0.48 | 0.2 | 0.01 | 0.07 | 0.2 | 0.67 | 0.59 | 0.01 | 0.28 | 0.36 | 0.69 | 0.35 | 0.02 | 0.21 | 0.13 | 0.17 | 0.54 |
AAL23282 (STM4463) | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.06 | 0.03 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.04 | 0.02 | 0.02 | 0.72 | 0.46 | 1.0 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.22 | 0.0 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.01 | 0.01 |
AAL23283 (STM4464) | 0.06 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.78 | 0.49 | 1.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.35 | 0.01 | 0.0 | 0.16 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.08 | 0.01 | 0.02 |
AAL23284 (STM4465) | 0.03 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.69 | 0.52 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.0 | 0.0 | 0.11 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.01 |
AAL23285 (STM4466) | 0.05 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.06 | 0.04 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.74 | 0.33 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.45 | 0.0 | 0.0 | 0.13 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.04 |
AAL23286 (STM4467) | 0.04 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.07 | 0.03 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.05 | 0.01 | 0.0 | 0.67 | 0.32 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.43 | 0.0 | 0.0 | 0.16 | 0.04 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.08 | 0.01 | 0.04 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)