View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19046 (STM0082) | 0.08 | 0.11 | 0.21 | 0.07 | 0.05 | 0.85 | 0.21 | 0.53 | 0.06 | 0.04 | 0.11 | 0.01 | 0.11 | 0.08 | 0.05 | 0.24 | 0.08 | 0.12 | 0.15 | 0.15 | 0.5 | 0.26 | 0.07 | 0.14 | 1.0 | 0.07 | 0.03 | 0.11 | 0.14 | 0.04 | 0.11 | 0.04 | 0.13 | 0.2 | 0.05 | 0.02 | 0.3 | 0.09 | 0.05 |
AAL19132 (cueO) | 0.06 | 0.13 | 0.17 | 0.32 | 0.09 | 0.24 | 0.07 | 1.0 | 0.11 | 0.08 | 0.12 | 0.06 | 0.14 | 0.44 | 0.09 | 0.1 | 0.02 | 0.06 | 0.06 | 0.07 | 0.06 | 0.06 | 0.04 | 0.13 | 0.07 | 0.12 | 0.38 | 0.2 | 0.99 | 0.01 | 0.05 | 0.08 | 0.36 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.44 | 0.12 | 0.11 |
AAL19161 (stfD) | 0.07 | 0.47 | 0.11 | 0.05 | 0.03 | 0.1 | 0.1 | 0.37 | 0.05 | 0.04 | 0.09 | 0.01 | 0.07 | 0.19 | 0.02 | 0.15 | 0.05 | 0.07 | 0.07 | 0.08 | 1.0 | 0.92 | 0.04 | 0.03 | 0.64 | 0.06 | 0.07 | 0.07 | 0.09 | 0.01 | 0.12 | 0.04 | 0.07 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.05 | 0.05 | 0.06 |
AAL19307 (STM0353) | 0.1 | 0.8 | 0.17 | 0.13 | 0.05 | 0.04 | 0.07 | 1.0 | 0.14 | 0.13 | 0.23 | 0.02 | 0.15 | 0.27 | 0.08 | 0.1 | 0.1 | 0.14 | 0.11 | 0.14 | 0.16 | 0.13 | 0.02 | 0.08 | 0.13 | 0.07 | 0.24 | 0.11 | 0.3 | 0.01 | 0.06 | 0.06 | 0.1 | 0.03 | 0.14 | 0.12 | 0.19 | 0.1 | 0.09 |
AAL19308 (STM0354) | 0.25 | 0.54 | 1.0 | 0.23 | 0.24 | 0.24 | 0.17 | 0.97 | 0.33 | 0.23 | 0.45 | 0.07 | 0.7 | 0.49 | 0.12 | 0.19 | 0.18 | 0.14 | 0.16 | 0.16 | 0.41 | 0.67 | 0.09 | 0.17 | 0.46 | 0.21 | 0.28 | 0.39 | 0.57 | 0.06 | 0.24 | 0.32 | 0.26 | 0.14 | 0.16 | 0.24 | 0.38 | 0.35 | 0.34 |
AAL19452 (copA) | 0.02 | 0.04 | 0.03 | 0.07 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 1.0 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.03 | 0.16 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.11 | 0.05 | 0.25 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.09 | 0.02 | 0.02 |
AAL19568 (rna) | 0.22 | 0.31 | 0.95 | 0.19 | 0.27 | 0.26 | 0.17 | 1.0 | 0.17 | 0.19 | 0.15 | 0.1 | 0.48 | 0.9 | 0.1 | 0.48 | 0.08 | 0.12 | 0.15 | 0.14 | 0.7 | 0.65 | 0.25 | 0.1 | 0.66 | 0.33 | 0.13 | 0.25 | 0.48 | 0.03 | 0.66 | 0.33 | 0.41 | 0.29 | 0.07 | 0.12 | 0.13 | 0.26 | 0.29 |
AAL19695 (nadA) | 0.1 | 0.24 | 0.04 | 0.08 | 0.01 | 0.21 | 0.05 | 1.0 | 0.07 | 0.06 | 0.07 | 0.02 | 0.07 | 0.76 | 0.08 | 0.1 | 0.05 | 0.06 | 0.04 | 0.06 | 0.19 | 0.12 | 0.01 | 0.27 | 0.09 | 0.44 | 0.14 | 0.06 | 0.21 | 0.01 | 0.04 | 0.03 | 0.21 | 0.02 | 0.08 | 0.08 | 0.43 | 0.03 | 0.03 |
AAL19696 (pnuC) | 0.1 | 0.43 | 0.31 | 0.14 | 0.11 | 0.32 | 0.12 | 1.0 | 0.13 | 0.16 | 0.12 | 0.03 | 0.38 | 0.88 | 0.17 | 0.32 | 0.09 | 0.2 | 0.21 | 0.26 | 0.45 | 0.31 | 0.08 | 0.4 | 0.25 | 0.68 | 0.22 | 0.2 | 0.27 | 0.07 | 0.15 | 0.15 | 0.26 | 0.26 | 0.13 | 0.15 | 0.66 | 0.24 | 0.17 |
AAL19806 (STM0870) | 0.62 | 0.6 | 0.62 | 0.41 | 0.43 | 0.08 | 0.39 | 0.98 | 0.42 | 0.22 | 0.6 | 0.7 | 0.93 | 0.99 | 0.46 | 0.28 | 0.31 | 0.78 | 0.81 | 0.97 | 0.25 | 0.19 | 0.29 | 0.68 | 0.38 | 0.68 | 0.64 | 0.75 | 0.75 | 0.24 | 0.83 | 0.53 | 0.83 | 0.24 | 0.37 | 0.17 | 1.0 | 0.47 | 0.58 |
AAL19944 (STM1010) | 0.15 | 0.68 | 1.0 | 0.2 | 0.11 | 0.23 | 0.11 | 0.42 | 0.08 | 0.08 | 0.18 | 0.02 | 0.65 | 0.09 | 0.14 | 0.0 | 0.07 | 0.15 | 0.19 | 0.22 | 0.11 | 0.07 | 0.0 | 0.0 | 0.48 | 0.07 | 0.0 | 0.29 | 0.25 | 0.15 | 0.3 | 0.38 | 0.42 | 0.0 | 0.11 | 0.0 | 0.0 | 0.31 | 0.25 |
AAL19985 (sseI) | 0.03 | 0.19 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.21 | 0.11 | 0.94 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.1 | 0.04 | 0.05 | 0.11 | 0.09 | 0.1 | 0.62 | 1.0 | 0.05 | 0.01 | 0.27 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.07 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.08 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.02 |
AAL19986 (STM1053) | 0.19 | 0.74 | 0.63 | 0.41 | 0.12 | 0.17 | 0.2 | 0.88 | 0.16 | 0.13 | 0.38 | 0.04 | 0.93 | 0.19 | 0.12 | 0.3 | 0.04 | 1.0 | 0.39 | 0.98 | 0.73 | 0.72 | 0.11 | 0.04 | 0.66 | 0.15 | 0.0 | 0.29 | 0.12 | 0.03 | 0.16 | 0.23 | 0.13 | 0.37 | 0.08 | 0.0 | 0.06 | 0.18 | 0.28 |
AAL20096 (yceL) | 0.2 | 0.47 | 0.16 | 0.13 | 0.16 | 0.07 | 0.23 | 0.92 | 0.16 | 0.16 | 0.25 | 0.11 | 0.33 | 0.44 | 0.11 | 0.12 | 0.08 | 0.22 | 0.22 | 0.29 | 0.27 | 0.21 | 0.14 | 0.51 | 0.47 | 0.19 | 0.42 | 0.31 | 0.33 | 0.03 | 0.33 | 0.22 | 0.34 | 0.13 | 0.12 | 0.1 | 1.0 | 0.12 | 0.42 |
AAL20189 (aadA) | 0.35 | 0.46 | 0.33 | 0.14 | 0.13 | 0.08 | 0.13 | 0.31 | 0.12 | 0.13 | 0.2 | 0.07 | 0.42 | 0.56 | 0.12 | 0.07 | 0.12 | 0.2 | 0.19 | 0.29 | 0.17 | 0.29 | 0.03 | 0.52 | 0.37 | 0.27 | 0.29 | 0.19 | 0.25 | 0.09 | 0.15 | 0.19 | 0.25 | 0.05 | 0.07 | 0.15 | 1.0 | 0.19 | 0.28 |
AAL20205 (yeaL) | 0.37 | 0.64 | 0.49 | 0.24 | 0.43 | 0.16 | 0.23 | 0.86 | 0.34 | 0.36 | 0.63 | 0.29 | 0.6 | 0.86 | 0.15 | 0.23 | 0.11 | 0.41 | 0.45 | 0.48 | 0.17 | 0.41 | 0.31 | 0.65 | 0.39 | 0.42 | 0.64 | 0.57 | 0.43 | 0.05 | 0.43 | 0.5 | 0.57 | 0.34 | 0.24 | 0.31 | 1.0 | 0.35 | 0.69 |
AAL20207 (yeaK) | 0.25 | 0.68 | 0.53 | 0.4 | 0.22 | 0.32 | 0.59 | 0.47 | 0.26 | 0.51 | 0.4 | 0.65 | 0.33 | 0.28 | 0.69 | 0.3 | 0.23 | 0.59 | 0.69 | 0.71 | 0.41 | 0.48 | 0.3 | 0.66 | 0.42 | 0.61 | 0.51 | 0.62 | 0.67 | 0.05 | 0.36 | 0.28 | 0.83 | 0.28 | 0.24 | 0.3 | 1.0 | 0.18 | 0.4 |
AAL20291 (ydiH) | 0.3 | 0.22 | 0.59 | 0.12 | 0.11 | 0.18 | 0.18 | 0.67 | 0.06 | 0.26 | 0.07 | 0.06 | 1.0 | 0.17 | 0.06 | 0.24 | 0.01 | 0.3 | 0.29 | 0.34 | 0.1 | 0.17 | 0.32 | 0.13 | 0.09 | 0.08 | 0.12 | 0.31 | 0.33 | 0.1 | 0.75 | 0.26 | 0.34 | 0.35 | 0.01 | 0.14 | 0.15 | 0.2 | 0.3 |
AAL20441 (ydeA) | 0.18 | 0.38 | 0.1 | 0.15 | 0.08 | 0.1 | 0.43 | 0.64 | 0.11 | 0.09 | 0.15 | 0.13 | 0.29 | 1.0 | 0.12 | 0.12 | 0.07 | 0.3 | 0.31 | 0.39 | 0.16 | 0.3 | 0.05 | 0.52 | 0.28 | 0.24 | 0.16 | 0.22 | 0.33 | 0.04 | 0.26 | 0.12 | 0.41 | 0.1 | 0.15 | 0.07 | 0.65 | 0.09 | 0.26 |
AAL20492 (smvA) | 1.0 | 0.36 | 0.38 | 0.13 | 0.35 | 0.06 | 0.08 | 0.13 | 0.18 | 0.13 | 0.22 | 0.25 | 0.72 | 0.18 | 0.22 | 0.04 | 0.09 | 0.29 | 0.39 | 0.44 | 0.09 | 0.27 | 0.06 | 0.47 | 0.15 | 0.3 | 0.25 | 0.42 | 0.11 | 0.05 | 0.06 | 0.29 | 0.15 | 0.05 | 0.19 | 0.1 | 0.72 | 0.29 | 0.57 |
AAL20614 (STM1697) | 0.26 | 0.22 | 0.08 | 0.14 | 0.08 | 0.03 | 0.07 | 1.0 | 0.27 | 0.31 | 0.58 | 0.05 | 0.11 | 0.73 | 0.14 | 0.1 | 0.22 | 0.5 | 0.47 | 0.68 | 0.05 | 0.1 | 0.14 | 0.16 | 0.33 | 0.16 | 0.1 | 0.41 | 0.2 | 0.04 | 0.45 | 0.1 | 0.29 | 0.12 | 0.21 | 0.09 | 0.26 | 0.08 | 0.11 |
AAL20659 (STM1741) | 0.2 | 0.42 | 0.44 | 0.12 | 0.21 | 0.08 | 0.23 | 0.86 | 0.14 | 0.19 | 0.25 | 0.19 | 0.5 | 1.0 | 0.27 | 0.34 | 0.12 | 0.2 | 0.24 | 0.29 | 0.15 | 0.28 | 0.23 | 0.59 | 0.16 | 0.21 | 0.24 | 0.23 | 0.2 | 0.09 | 0.17 | 0.25 | 0.23 | 0.32 | 0.21 | 0.14 | 0.79 | 0.17 | 0.38 |
AAL20660 (oppF) | 0.07 | 0.23 | 0.52 | 0.1 | 0.14 | 0.1 | 0.05 | 0.97 | 0.07 | 0.21 | 0.07 | 0.11 | 0.3 | 1.0 | 0.16 | 0.14 | 0.11 | 0.1 | 0.11 | 0.13 | 0.13 | 0.16 | 0.04 | 0.33 | 0.07 | 0.13 | 0.06 | 0.12 | 0.13 | 0.01 | 0.09 | 0.13 | 0.16 | 0.06 | 0.14 | 0.04 | 0.59 | 0.15 | 0.17 |
AAL20661 (oppD) | 0.06 | 0.19 | 0.5 | 0.13 | 0.14 | 0.06 | 0.06 | 1.0 | 0.06 | 0.21 | 0.05 | 0.09 | 0.28 | 0.97 | 0.16 | 0.21 | 0.1 | 0.12 | 0.12 | 0.15 | 0.1 | 0.16 | 0.1 | 0.28 | 0.05 | 0.14 | 0.05 | 0.11 | 0.17 | 0.01 | 0.07 | 0.12 | 0.18 | 0.13 | 0.13 | 0.02 | 0.41 | 0.14 | 0.16 |
AAL20662 (oppC) | 0.08 | 0.2 | 0.39 | 0.1 | 0.12 | 0.05 | 0.06 | 0.95 | 0.05 | 0.13 | 0.04 | 0.09 | 0.26 | 1.0 | 0.15 | 0.18 | 0.2 | 0.11 | 0.12 | 0.15 | 0.08 | 0.13 | 0.08 | 0.46 | 0.06 | 0.14 | 0.05 | 0.11 | 0.11 | 0.01 | 0.04 | 0.11 | 0.13 | 0.11 | 0.2 | 0.02 | 0.57 | 0.11 | 0.19 |
AAL20663 (oppB) | 0.06 | 0.21 | 0.4 | 0.07 | 0.11 | 0.05 | 0.03 | 1.0 | 0.04 | 0.15 | 0.04 | 0.07 | 0.25 | 0.91 | 0.09 | 0.11 | 0.15 | 0.05 | 0.06 | 0.07 | 0.06 | 0.2 | 0.05 | 0.22 | 0.06 | 0.15 | 0.04 | 0.09 | 0.12 | 0.01 | 0.04 | 0.13 | 0.15 | 0.07 | 0.12 | 0.01 | 0.31 | 0.12 | 0.2 |
AAL20664 (oppA) | 0.06 | 0.15 | 0.55 | 0.07 | 0.09 | 0.09 | 0.03 | 1.0 | 0.04 | 0.16 | 0.04 | 0.03 | 0.33 | 0.7 | 0.14 | 0.08 | 0.23 | 0.07 | 0.08 | 0.09 | 0.04 | 0.23 | 0.05 | 0.19 | 0.1 | 0.11 | 0.02 | 0.09 | 0.1 | 0.01 | 0.05 | 0.12 | 0.1 | 0.05 | 0.18 | 0.01 | 0.35 | 0.13 | 0.19 |
AAL20701 (STM1786) | 0.07 | 0.19 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.24 | 0.05 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.03 | 0.12 | 0.01 | 0.22 | 0.23 | 0.23 | 0.02 | 0.02 | 0.05 | 0.39 | 0.03 | 0.01 | 0.05 | 0.04 | 0.02 | 0.0 | 1.0 | 0.03 | 0.03 | 0.18 | 0.01 | 0.02 | 0.82 | 0.02 | 0.03 |
AAL20702 (STM1787) | 0.05 | 0.11 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.15 | 0.06 | 0.03 | 0.04 | 0.05 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.05 | 0.11 | 0.01 | 0.19 | 0.22 | 0.21 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | 0.2 | 0.02 | 0.01 | 0.04 | 0.03 | 0.02 | 0.0 | 1.0 | 0.02 | 0.02 | 0.14 | 0.02 | 0.02 | 0.29 | 0.01 | 0.03 |
AAL20703 (STM1788) | 0.07 | 0.18 | 0.05 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.24 | 0.09 | 0.05 | 0.04 | 0.08 | 0.05 | 0.07 | 0.09 | 0.07 | 0.14 | 0.03 | 0.25 | 0.21 | 0.29 | 0.01 | 0.07 | 0.07 | 0.46 | 0.04 | 0.02 | 0.05 | 0.05 | 0.03 | 0.01 | 1.0 | 0.06 | 0.03 | 0.18 | 0.07 | 0.03 | 0.57 | 0.03 | 0.07 |
AAL20704 (STM1789) | 0.09 | 0.23 | 0.03 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.36 | 0.09 | 0.03 | 0.07 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.17 | 0.02 | 0.44 | 0.41 | 0.49 | 0.06 | 0.04 | 0.07 | 0.43 | 0.06 | 0.03 | 0.07 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 1.0 | 0.03 | 0.04 | 0.22 | 0.06 | 0.03 | 0.61 | 0.03 | 0.05 |
AAL20705 (STM1790) | 0.06 | 0.2 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.13 | 0.06 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.11 | 0.01 | 0.18 | 0.12 | 0.15 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.22 | 0.04 | 0.01 | 0.06 | 0.05 | 0.03 | 0.0 | 1.0 | 0.03 | 0.04 | 0.16 | 0.03 | 0.02 | 0.35 | 0.01 | 0.03 |
AAL20706 (STM1791) | 0.08 | 0.3 | 0.06 | 0.05 | 0.03 | 0.03 | 0.28 | 0.13 | 0.07 | 0.05 | 0.09 | 0.06 | 0.09 | 0.13 | 0.06 | 0.11 | 0.05 | 0.39 | 0.38 | 0.42 | 0.12 | 0.1 | 0.06 | 0.59 | 0.1 | 0.03 | 0.08 | 0.07 | 0.07 | 0.0 | 1.0 | 0.04 | 0.07 | 0.11 | 0.11 | 0.04 | 0.77 | 0.03 | 0.08 |
AAL20707 (STM1792) | 0.06 | 0.2 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.02 | 0.21 | 0.08 | 0.05 | 0.04 | 0.08 | 0.04 | 0.05 | 0.07 | 0.06 | 0.09 | 0.03 | 0.19 | 0.18 | 0.22 | 0.02 | 0.05 | 0.06 | 0.78 | 0.04 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.04 | 0.0 | 1.0 | 0.04 | 0.04 | 0.16 | 0.09 | 0.03 | 0.68 | 0.04 | 0.04 |
AAL20708 (STM1793) | 0.12 | 0.35 | 0.08 | 0.07 | 0.05 | 0.03 | 0.3 | 0.19 | 0.08 | 0.06 | 0.12 | 0.04 | 0.11 | 0.15 | 0.08 | 0.17 | 0.06 | 0.29 | 0.28 | 0.36 | 0.04 | 0.08 | 0.14 | 0.8 | 0.08 | 0.04 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.01 | 0.84 | 0.06 | 0.1 | 0.23 | 0.25 | 0.04 | 1.0 | 0.08 | 0.07 |
AAL20809 (znuB) | 0.46 | 0.73 | 0.31 | 0.33 | 0.32 | 0.07 | 0.26 | 0.63 | 0.23 | 0.17 | 0.31 | 0.38 | 0.49 | 0.78 | 0.35 | 0.2 | 0.18 | 0.4 | 0.4 | 0.43 | 0.12 | 0.52 | 0.21 | 0.82 | 0.21 | 0.32 | 0.25 | 0.32 | 0.66 | 0.03 | 0.28 | 0.38 | 0.91 | 0.24 | 0.32 | 0.2 | 1.0 | 0.37 | 0.42 |
AAL21085 (yohJ) | 0.09 | 0.21 | 0.77 | 0.21 | 0.1 | 0.04 | 0.27 | 0.76 | 0.06 | 0.04 | 0.13 | 0.09 | 1.0 | 0.21 | 0.36 | 0.15 | 0.07 | 0.12 | 0.09 | 0.13 | 0.06 | 0.16 | 0.15 | 0.64 | 0.13 | 0.1 | 0.11 | 0.15 | 0.65 | 0.02 | 0.07 | 0.87 | 0.63 | 0.18 | 0.15 | 0.22 | 0.79 | 0.26 | 0.91 |
AAL21086 (yohK) | 0.12 | 0.32 | 0.37 | 0.29 | 0.15 | 0.13 | 0.19 | 0.93 | 0.09 | 0.12 | 0.16 | 0.22 | 1.0 | 0.35 | 0.16 | 0.07 | 0.06 | 0.12 | 0.11 | 0.12 | 0.17 | 0.26 | 0.05 | 0.3 | 0.15 | 0.15 | 0.23 | 0.16 | 0.82 | 0.02 | 0.15 | 0.4 | 0.88 | 0.06 | 0.1 | 0.39 | 0.37 | 0.21 | 0.4 |
AAL21135 (STM2233) | 0.22 | 0.68 | 0.11 | 0.09 | 0.07 | 0.09 | 0.28 | 0.61 | 0.37 | 0.05 | 1.0 | 0.05 | 0.17 | 0.27 | 0.2 | 0.0 | 0.45 | 0.2 | 0.18 | 0.25 | 0.04 | 0.57 | 0.0 | 0.0 | 0.16 | 0.11 | 0.15 | 0.08 | 0.08 | 0.11 | 0.01 | 0.09 | 0.1 | 0.0 | 0.36 | 0.1 | 0.0 | 0.09 | 0.11 |
AAL21136 (STM2234) | 0.09 | 0.55 | 0.2 | 0.07 | 0.1 | 0.14 | 0.09 | 0.71 | 0.26 | 0.14 | 0.81 | 0.03 | 0.14 | 0.16 | 0.03 | 0.0 | 0.04 | 0.09 | 0.06 | 0.09 | 0.06 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.18 | 0.11 | 0.11 | 0.13 | 0.09 | 0.1 | 0.14 | 0.07 | 0.1 | 0.0 | 0.03 | 0.11 | 0.0 | 0.1 | 0.11 |
AAL21138 (STM2236) | 0.05 | 0.53 | 0.09 | 0.25 | 0.05 | 0.12 | 0.02 | 0.5 | 0.05 | 0.03 | 0.1 | 0.01 | 0.18 | 0.07 | 0.0 | 0.06 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.75 | 0.0 | 0.0 | 0.11 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.44 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 1.0 | 0.05 | 0.02 | 0.05 | 0.0 | 0.26 | 0.07 |
AAL21139 (STM2237) | 0.04 | 0.6 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.09 | 0.02 | 0.78 | 0.07 | 0.01 | 0.12 | 0.01 | 0.07 | 0.09 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.06 | 0.05 | 0.04 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.06 | 0.03 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.01 | 0.03 | 0.03 | 0.07 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.05 |
AAL21141 (STM2239) | 0.05 | 0.56 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.57 | 0.15 | 0.81 | 0.11 | 0.04 | 0.17 | 0.03 | 0.06 | 0.17 | 0.05 | 0.0 | 0.13 | 0.07 | 0.05 | 0.07 | 0.79 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.37 | 0.04 | 0.06 | 0.05 | 0.05 | 0.01 | 0.05 | 0.04 | 0.07 | 0.0 | 0.24 | 0.06 | 0.0 | 0.04 | 0.06 |
AAL21143 (sspH2) | 0.06 | 0.16 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.29 | 0.07 | 0.45 | 0.06 | 0.04 | 0.09 | 0.02 | 0.08 | 0.11 | 0.06 | 0.03 | 0.06 | 0.1 | 0.09 | 0.1 | 0.43 | 1.0 | 0.04 | 0.17 | 0.19 | 0.04 | 0.03 | 0.05 | 0.04 | 0.01 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.1 | 0.03 | 0.32 | 0.05 | 0.07 |
AAL21535 (nadB) | 0.19 | 0.33 | 0.09 | 0.07 | 0.05 | 0.17 | 0.08 | 0.95 | 0.13 | 0.07 | 0.23 | 0.07 | 0.1 | 1.0 | 0.07 | 0.06 | 0.06 | 0.07 | 0.08 | 0.08 | 0.18 | 0.24 | 0.02 | 0.32 | 0.08 | 0.36 | 0.13 | 0.1 | 0.15 | 0.02 | 0.06 | 0.09 | 0.17 | 0.02 | 0.14 | 0.09 | 0.57 | 0.05 | 0.12 |
AAL21722 (hypF) | 0.18 | 0.49 | 0.25 | 0.15 | 0.17 | 0.13 | 0.17 | 1.0 | 0.46 | 0.26 | 0.53 | 0.64 | 0.25 | 0.86 | 0.18 | 0.05 | 0.16 | 0.57 | 0.63 | 0.51 | 0.13 | 0.26 | 0.06 | 0.43 | 0.11 | 0.3 | 0.5 | 0.19 | 0.21 | 0.05 | 0.47 | 0.2 | 0.2 | 0.03 | 0.16 | 0.36 | 0.97 | 0.31 | 0.29 |
AAL21723 (hydN) | 0.05 | 0.22 | 0.01 | 0.08 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.92 | 0.06 | 0.02 | 0.07 | 0.41 | 0.02 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.36 | 0.41 | 0.33 | 0.02 | 0.02 | 0.09 | 0.13 | 0.02 | 0.02 | 0.37 | 0.03 | 0.24 | 0.01 | 1.0 | 0.02 | 0.22 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.92 | 0.02 | 0.02 |
AAL21724 (STM2844) | 0.09 | 0.33 | 0.11 | 0.07 | 0.06 | 0.06 | 0.13 | 0.56 | 0.09 | 0.06 | 0.11 | 0.14 | 0.08 | 0.14 | 0.07 | 0.07 | 0.03 | 0.82 | 1.0 | 0.85 | 0.13 | 0.33 | 0.11 | 0.49 | 0.09 | 0.07 | 0.18 | 0.06 | 0.05 | 0.01 | 0.87 | 0.08 | 0.04 | 0.09 | 0.05 | 0.06 | 0.83 | 0.09 | 0.08 |
AAL21725 (hycI) | 0.05 | 0.14 | 0.1 | 0.05 | 0.04 | 0.1 | 0.1 | 0.39 | 0.08 | 0.04 | 0.1 | 0.04 | 0.06 | 0.11 | 0.07 | 0.02 | 0.02 | 0.75 | 0.74 | 0.68 | 0.11 | 0.11 | 0.03 | 0.23 | 0.05 | 0.05 | 0.1 | 0.04 | 0.03 | 0.0 | 1.0 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.41 | 0.08 | 0.04 |
AAL21726 (hycH) | 0.04 | 0.13 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.05 | 0.07 | 0.35 | 0.07 | 0.03 | 0.1 | 0.06 | 0.05 | 0.1 | 0.03 | 0.01 | 0.03 | 0.67 | 1.0 | 0.71 | 0.07 | 0.18 | 0.02 | 0.2 | 0.05 | 0.04 | 0.17 | 0.03 | 0.02 | 0.0 | 0.72 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.03 | 0.55 | 0.05 | 0.03 |
AAL21727 (hycG) | 0.07 | 0.26 | 0.07 | 0.06 | 0.05 | 0.1 | 0.06 | 0.71 | 0.11 | 0.07 | 0.16 | 0.19 | 0.05 | 0.15 | 0.02 | 0.01 | 0.03 | 0.53 | 0.65 | 0.5 | 0.17 | 0.2 | 0.02 | 0.3 | 0.1 | 0.1 | 0.5 | 0.05 | 0.06 | 0.01 | 0.91 | 0.05 | 0.05 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 1.0 | 0.07 | 0.04 |
AAL21728 (hycF) | 0.04 | 0.19 | 0.04 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.36 | 0.06 | 0.03 | 0.07 | 0.16 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.01 | 0.03 | 0.57 | 0.69 | 0.54 | 0.04 | 0.11 | 0.01 | 0.15 | 0.03 | 0.04 | 0.17 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 1.0 | 0.03 | 0.02 | 0.0 | 0.05 | 0.01 | 0.47 | 0.04 | 0.03 |
AAL21729 (hycE) | 0.05 | 0.19 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.57 | 0.07 | 0.04 | 0.07 | 0.2 | 0.04 | 0.08 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.63 | 0.85 | 0.65 | 0.03 | 0.12 | 0.03 | 0.21 | 0.03 | 0.04 | 0.4 | 0.04 | 0.03 | 0.0 | 1.0 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.75 | 0.03 | 0.02 |
AAL21730 (hycD) | 0.04 | 0.21 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.05 | 0.47 | 0.06 | 0.02 | 0.06 | 0.24 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.98 | 1.0 | 0.86 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.28 | 0.03 | 0.02 | 0.37 | 0.03 | 0.03 | 0.0 | 0.77 | 0.02 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.98 | 0.02 | 0.01 |
AAL21731 (hycC) | 0.05 | 0.25 | 0.02 | 0.05 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.6 | 0.11 | 0.02 | 0.14 | 0.4 | 0.02 | 0.09 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.55 | 0.71 | 0.53 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.22 | 0.02 | 0.02 | 0.59 | 0.03 | 0.07 | 0.01 | 0.94 | 0.01 | 0.08 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 1.0 | 0.02 | 0.02 |
AAL21732 (hycB) | 0.03 | 0.18 | 0.01 | 0.06 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.39 | 0.07 | 0.01 | 0.11 | 0.35 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.57 | 0.44 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.15 | 0.03 | 0.01 | 0.53 | 0.02 | 0.13 | 0.0 | 0.42 | 0.0 | 0.12 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 1.0 | 0.0 | 0.01 |
AAL21733 (hycA) | 0.04 | 0.16 | 0.01 | 0.06 | 0.0 | 0.0 | 0.09 | 0.45 | 0.05 | 0.01 | 0.09 | 0.32 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.0 | 0.94 | 0.94 | 0.86 | 0.0 | 0.01 | 0.19 | 0.12 | 0.01 | 0.0 | 0.3 | 0.02 | 0.16 | 0.0 | 1.0 | 0.01 | 0.15 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.79 | 0.01 | 0.01 |
AAL21734 (hypA) | 0.07 | 0.1 | 0.09 | 0.06 | 0.44 | 0.03 | 0.03 | 0.31 | 0.34 | 0.17 | 0.27 | 0.12 | 0.25 | 0.03 | 0.05 | 0.04 | 0.0 | 0.39 | 0.3 | 0.28 | 0.01 | 0.01 | 0.14 | 0.29 | 0.01 | 0.01 | 0.07 | 0.64 | 0.14 | 0.01 | 0.3 | 0.61 | 0.12 | 0.06 | 0.01 | 0.25 | 0.35 | 0.22 | 1.0 |
AAL21816 (iap) | 0.17 | 0.29 | 0.14 | 0.15 | 0.22 | 0.04 | 0.52 | 0.45 | 0.15 | 0.14 | 0.21 | 0.19 | 0.21 | 0.34 | 0.26 | 0.2 | 0.41 | 0.32 | 1.0 | 0.37 | 0.12 | 0.08 | 0.3 | 0.48 | 0.14 | 0.16 | 0.35 | 0.3 | 0.23 | 0.02 | 0.22 | 0.24 | 0.26 | 0.27 | 0.28 | 0.14 | 0.76 | 0.14 | 0.31 |
AAL22058 (yqiB) | 0.36 | 0.37 | 0.68 | 0.25 | 0.55 | 0.13 | 0.51 | 0.61 | 0.59 | 0.45 | 0.64 | 0.27 | 0.98 | 0.72 | 0.56 | 0.34 | 0.48 | 0.33 | 0.43 | 0.38 | 0.17 | 0.19 | 0.42 | 0.45 | 0.23 | 0.44 | 0.34 | 1.0 | 0.29 | 0.07 | 0.49 | 0.76 | 0.3 | 0.35 | 0.66 | 0.3 | 0.59 | 0.62 | 0.85 |
AAL22803 (rhtC) | 0.71 | 0.61 | 0.22 | 0.21 | 0.21 | 0.14 | 0.26 | 0.51 | 0.21 | 0.13 | 0.26 | 0.25 | 0.41 | 0.73 | 0.23 | 0.13 | 0.12 | 0.22 | 0.26 | 0.29 | 0.22 | 0.41 | 0.08 | 0.65 | 0.51 | 0.17 | 0.4 | 0.46 | 0.44 | 0.04 | 0.26 | 0.38 | 0.49 | 0.07 | 0.14 | 0.24 | 1.0 | 0.19 | 0.58 |
AAL22804 (rthB) | 0.33 | 0.42 | 0.08 | 0.13 | 0.11 | 0.07 | 0.13 | 0.47 | 0.09 | 0.07 | 0.13 | 0.07 | 0.16 | 0.69 | 0.13 | 0.07 | 0.1 | 0.09 | 0.11 | 0.12 | 0.07 | 0.17 | 0.08 | 0.84 | 0.18 | 0.09 | 0.18 | 0.16 | 0.3 | 0.01 | 0.08 | 0.14 | 0.32 | 0.05 | 0.19 | 0.11 | 1.0 | 0.08 | 0.27 |
AAL22877 (fdhD) | 0.51 | 0.6 | 0.35 | 0.3 | 0.32 | 0.08 | 0.95 | 0.61 | 0.27 | 0.32 | 0.33 | 0.42 | 0.62 | 0.53 | 0.29 | 0.25 | 0.17 | 0.4 | 0.41 | 0.46 | 0.18 | 0.6 | 0.25 | 0.5 | 0.33 | 0.36 | 0.31 | 0.5 | 0.57 | 0.05 | 0.35 | 0.66 | 0.64 | 0.22 | 0.26 | 0.27 | 1.0 | 0.26 | 0.67 |
AAL23020 (STM4196) | 0.11 | 0.42 | 0.07 | 0.13 | 0.1 | 0.01 | 0.1 | 0.24 | 0.16 | 0.17 | 0.33 | 0.37 | 0.15 | 0.03 | 1.0 | 0.05 | 0.14 | 0.18 | 0.18 | 0.23 | 0.07 | 0.16 | 0.26 | 0.06 | 0.11 | 0.03 | 0.2 | 0.14 | 0.25 | 0.03 | 0.05 | 0.14 | 0.33 | 0.08 | 0.06 | 0.13 | 0.16 | 0.07 | 0.4 |
AAL23109 (fdhF) | 0.07 | 0.21 | 0.1 | 0.15 | 0.11 | 0.04 | 0.06 | 0.95 | 0.21 | 0.18 | 0.33 | 0.6 | 0.13 | 0.08 | 0.27 | 0.06 | 0.03 | 0.72 | 1.0 | 0.75 | 0.05 | 0.08 | 0.16 | 0.17 | 0.04 | 0.04 | 0.36 | 0.25 | 0.25 | 0.01 | 0.75 | 0.17 | 0.22 | 0.08 | 0.07 | 0.16 | 0.67 | 0.08 | 0.24 |
AAL23118 (yjdE) | 0.16 | 0.36 | 0.19 | 0.08 | 0.06 | 0.03 | 0.67 | 0.21 | 0.18 | 0.14 | 0.34 | 0.24 | 0.16 | 0.12 | 0.23 | 0.09 | 0.08 | 0.26 | 0.17 | 0.28 | 0.06 | 0.15 | 0.05 | 0.51 | 0.07 | 0.08 | 0.15 | 0.16 | 0.05 | 0.02 | 0.89 | 0.1 | 0.06 | 0.09 | 0.09 | 0.2 | 1.0 | 0.08 | 0.1 |
AAL23169 (yjeO) | 0.47 | 0.98 | 0.65 | 0.14 | 0.39 | 0.15 | 0.5 | 0.55 | 0.29 | 0.2 | 0.39 | 0.25 | 0.56 | 0.35 | 0.39 | 0.25 | 0.25 | 0.11 | 0.22 | 0.26 | 0.12 | 1.0 | 0.34 | 0.11 | 0.16 | 0.18 | 0.0 | 0.32 | 0.15 | 0.32 | 0.19 | 0.45 | 0.14 | 0.2 | 0.66 | 0.0 | 0.11 | 0.44 | 0.38 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)