Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16933 (BN171_1010004)	0.33	0.74	0.27	0.38	0.28	0.16	1.0	0.36	0.34	0.86	0.59	0.74	0.24	0.08	0.19	0.38	0.15	0.12	0.25	0.44	0.29	0.2	0.23	0.39	0.4	0.26	0.16	0.14	0.3
CCL17019 (BN171_1080011)	0.11	0.2	0.18	0.39	0.32	0.29	0.76	0.14	0.15	1.0	0.53	0.51	0.21	0.09	0.12	0.26	0.23	0.1	0.15	0.36	0.22	0.32	0.15	0.21	0.24	0.16	0.23	0.32	0.11
CCL17143 (BN171_1330004)	0.03	0.04	0.06	0.08	0.09	0.13	0.47	0.04	0.12	1.0	0.69	0.95	0.52	0.08	0.08	0.76	0.17	0.08	0.22	0.1	0.29	0.18	0.13	0.2	0.37	0.07	0.04	0.27	0.91
CCL17144 (BN171_1330005)	0.01	0.0	0.05	0.05	0.05	0.12	0.4	0.01	0.07	1.0	0.82	0.93	0.44	0.03	0.03	0.7	0.1	0.03	0.16	0.04	0.09	0.2	0.09	0.12	0.25	0.02	0.04	0.24	0.74
CCL17288 (rnfD)	0.1	0.15	0.09	0.11	0.08	0.06	0.52	0.08	0.04	0.89	1.0	0.72	0.36	0.07	0.25	0.55	0.17	0.17	0.15	0.06	0.25	0.79	0.07	0.09	0.24	0.04	0.07	0.29	1.0
CCL17290 (rnfE)	0.1	0.18	0.09	0.12	0.1	0.09	0.44	0.12	0.03	0.74	0.92	0.62	0.46	0.1	0.3	0.79	0.19	0.2	0.15	0.07	0.31	0.48	0.06	0.11	0.34	0.05	0.12	0.48	1.0
CCL17291 (rnfA)	0.11	0.24	0.18	0.18	0.2	0.13	0.48	0.14	0.03	0.97	1.0	0.71	0.36	0.13	0.37	0.64	0.23	0.24	0.16	0.13	0.39	0.45	0.06	0.09	0.28	0.09	0.1	0.38	0.75
CCL17299 (minC)	0.06	0.05	0.07	0.06	0.05	0.12	1.0	0.03	0.02	0.91	0.26	0.48	0.16	0.07	0.07	0.13	0.06	0.05	0.07	0.08	0.07	0.31	0.06	0.1	0.11	0.04	0.09	0.06	0.16
CCL17413 (brnQ)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.73	0.05	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
CCL17438 (BN171_1500014)	0.11	0.1	0.16	0.16	0.12	0.05	1.0	0.09	0.08	0.64	0.4	0.51	0.26	0.11	0.1	0.23	0.14	0.12	0.08	0.04	0.04	0.13	0.13	0.05	0.04	0.03	0.06	0.14	0.3
CCL17441 (codY)	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.12	0.01	0.01	1.0	0.74	0.37	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04
CCL17508 (exoA)	0.33	0.67	0.39	0.5	0.32	0.09	0.95	0.45	0.16	0.72	0.69	1.0	0.25	0.08	0.38	0.1	0.24	0.37	0.11	0.08	0.07	0.05	0.23	0.21	0.06	0.05	0.04	0.33	0.74
CCL17509 (BN171_1520027)	0.1	0.04	0.09	0.07	0.07	0.05	0.55	0.03	0.14	1.0	0.64	0.93	0.29	0.09	0.06	0.22	0.14	0.08	0.16	0.1	0.06	0.07	0.26	0.21	0.12	0.04	0.04	0.22	0.59
CCL17566 (BN171_1560004)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.76	0.0	0.01	1.0	0.59	0.52	0.23	0.01	0.0	0.22	0.04	0.0	0.07	0.0	0.01	0.02	0.19	0.04	0.04	0.0	0.09	0.49	0.65
CCL17614 (BN171_1640004)	0.14	0.22	0.16	0.67	0.05	0.13	1.0	0.06	0.16	0.67	0.39	0.33	0.14	0.11	0.17	0.17	0.09	0.05	0.1	0.13	0.13	0.03	0.12	0.12	0.09	0.06	0.07	0.09	0.17
CCL17817 (BN171_1810024)	0.13	0.07	0.12	0.09	0.08	0.1	1.0	0.04	0.19	0.89	0.42	0.64	0.13	0.04	0.02	0.17	0.12	0.03	0.23	0.16	0.04	0.56	0.18	0.35	0.17	0.05	0.35	0.07	0.24
CCL17870 (BN171_1900002)	0.15	0.06	0.19	0.1	0.13	0.04	1.0	0.18	0.11	0.41	0.19	0.21	0.15	0.17	0.03	0.23	0.17	0.11	0.09	0.21	0.06	0.05	0.18	0.13	0.15	0.08	0.01	0.51	0.13
CCL17872 (BN171_1900004)	0.07	0.1	0.32	0.67	0.28	0.08	1.0	0.08	0.12	0.51	0.39	0.34	0.23	0.11	0.11	0.2	0.11	0.1	0.19	0.11	0.19	0.05	0.21	0.17	0.14	0.06	0.06	0.81	0.37
CCL18004 (BN171_2000007)	0.36	0.04	0.28	0.17	0.15	0.17	0.47	0.1	0.02	0.78	1.0	0.83	0.27	0.62	0.08	0.43	0.11	0.19	0.08	0.22	0.29	0.01	0.11	0.09	0.23	0.1	0.03	0.18	0.98
CCL18005 (BN171_2000008)	0.08	0.16	0.09	0.11	0.1	0.12	1.0	0.09	0.22	0.94	0.5	0.38	0.12	0.07	0.05	0.17	0.1	0.07	0.11	0.12	0.09	0.06	0.13	0.25	0.12	0.07	0.08	0.17	0.27
CCL18006 (BN171_2000009)	0.07	0.1	0.08	0.11	0.09	0.18	0.92	0.05	0.25	1.0	0.53	0.42	0.17	0.07	0.04	0.23	0.17	0.06	0.15	0.11	0.12	0.06	0.19	0.36	0.14	0.08	0.15	0.25	0.21
CCL18044 (BN171_2050004)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	1.0	0.0	0.02	0.49	0.09	0.12	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.0	0.05	0.02	0.03
CCL18045 (cwp)	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	1.0	0.01	0.04	0.55	0.11	0.21	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.08	0.0	0.04
CCL18248 (BN171_2190008)	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04	0.13	0.39	0.02	0.06	1.0	0.78	0.47	0.18	0.03	0.01	0.31	0.09	0.02	0.09	0.06	0.04	0.0	0.11	0.02	0.04	0.02	0.01	0.27	0.47
CCL18345 (ilvD)	0.03	0.13	0.04	0.12	0.04	0.04	1.0	0.03	0.07	0.79	0.2	0.54	0.07	0.02	0.04	0.09	0.06	0.03	0.1	0.07	0.11	0.24	0.05	0.1	0.07	0.04	0.23	0.04	0.07
CCL18417 (pyrD)	0.23	0.31	0.27	0.46	0.3	0.25	0.95	0.21	0.37	0.61	0.59	0.78	0.55	0.3	0.48	0.52	0.44	0.32	0.29	0.37	0.33	1.0	0.3	0.19	0.24	0.27	0.19	0.51	0.75
CCL18418 (BN171_2310003)	0.07	0.12	0.09	0.27	0.1	0.09	0.83	0.09	0.42	0.86	0.63	0.79	0.58	0.11	0.23	0.37	0.28	0.14	0.21	0.07	0.15	0.66	0.2	0.15	0.16	0.05	0.14	0.41	1.0
CCL18419 (xdhA)	0.11	0.17	0.17	0.28	0.15	0.09	1.0	0.13	0.23	0.78	0.65	0.7	0.45	0.1	0.27	0.31	0.24	0.19	0.18	0.12	0.12	0.69	0.22	0.15	0.14	0.08	0.14	0.36	0.67
CCL18420 (BN171_2310005)	0.09	0.15	0.21	0.23	0.21	0.13	0.83	0.11	0.06	1.0	0.61	0.69	0.37	0.1	0.19	0.33	0.22	0.16	0.17	0.07	0.09	0.45	0.15	0.08	0.09	0.05	0.08	0.39	0.54
CCL18421 (xdhC)	0.22	0.29	0.33	0.31	0.26	0.07	1.0	0.23	0.09	0.35	0.37	0.51	0.3	0.11	0.44	0.33	0.19	0.2	0.15	0.12	0.09	0.6	0.12	0.08	0.08	0.08	0.07	0.24	0.58
CCL18422 (BN171_2310007)	0.19	0.22	0.22	0.23	0.22	0.12	1.0	0.19	0.08	0.83	0.78	0.63	0.38	0.11	0.24	0.45	0.19	0.27	0.2	0.12	0.12	0.95	0.19	0.07	0.12	0.08	0.12	0.47	0.54
CCL18423 (BN171_2310008)	0.14	0.12	0.2	0.25	0.14	0.09	1.0	0.07	0.04	0.68	0.65	0.54	0.35	0.14	0.16	0.34	0.13	0.15	0.24	0.18	0.19	0.62	0.24	0.08	0.11	0.08	0.12	0.42	0.67
CCL18442 (BN171_2340002)	0.26	0.3	0.26	0.4	0.37	0.37	0.4	0.35	0.13	0.71	0.58	0.57	0.53	0.2	0.23	0.95	0.36	0.37	0.3	0.26	0.19	1.0	0.13	0.14	0.29	0.31	0.3	0.48	0.26
CCL18443 (BN171_2340003)	0.22	0.18	0.24	0.24	0.3	0.28	0.96	0.26	0.17	1.0	0.8	0.67	0.52	0.22	0.19	0.8	0.28	0.33	0.29	0.23	0.17	0.9	0.16	0.17	0.4	0.19	0.29	0.57	0.72
CCL18444 (xdhC)	0.12	0.07	0.11	0.21	0.09	0.19	1.0	0.09	0.14	0.78	0.52	0.76	0.5	0.1	0.11	0.81	0.21	0.13	0.21	0.13	0.23	0.51	0.11	0.12	0.35	0.12	0.31	0.61	0.37
CCL18445 (BN171_2340005)	0.23	0.27	0.18	0.38	0.22	0.25	1.0	0.16	0.12	0.63	0.53	0.9	0.43	0.17	0.28	0.57	0.23	0.24	0.3	0.26	0.31	0.86	0.14	0.12	0.23	0.15	0.23	0.7	0.69
CCL18543 (BN171_2420010)	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.11	0.84	0.05	0.47	0.93	0.84	0.76	0.34	0.06	0.08	0.32	0.23	0.06	0.29	0.08	0.09	0.01	0.19	0.07	0.09	0.05	0.35	0.64	1.0
CCL18557 (BN171_2430003)	0.26	0.08	0.22	0.12	0.21	0.13	0.3	0.09	0.33	0.75	0.94	1.0	0.34	0.22	0.06	0.51	0.14	0.16	0.15	0.19	0.08	0.19	0.3	0.15	0.16	0.09	0.07	0.07	0.51
CCL18559 (BN171_2430005)	0.15	0.01	0.14	0.01	0.32	0.04	0.12	0.14	0.01	0.59	0.76	1.0	0.14	0.15	0.02	0.26	0.14	0.19	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.08	0.0	0.09	0.47
CCL18659 (BN171_2480034)	0.07	0.13	0.11	0.47	0.2	0.14	0.42	0.11	0.1	0.76	0.62	1.0	0.28	0.07	0.2	0.4	0.16	0.14	0.07	0.13	0.12	0.13	0.01	0.15	0.2	0.11	0.08	0.21	0.33
CCL18756 (BN171_2600015)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.63	0.02	0.05	1.0	0.76	0.99	0.21	0.02	0.01	0.09	0.22	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.15	0.12	0.01	0.23	0.03	0.12
CCL18794 (BN171_2620017)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.15	0.74	0.01	0.06	1.0	0.7	0.67	0.38	0.01	0.0	0.53	0.15	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.13	0.06	0.1	0.01	0.01	0.32	0.56
CCL18795 (BN171_2620018)	0.07	0.03	0.19	0.07	0.21	0.19	1.0	0.06	0.05	0.58	0.99	0.78	0.47	0.19	0.05	0.86	0.29	0.11	0.1	0.21	0.08	0.01	0.12	0.04	0.27	0.1	0.02	0.37	0.98
CCL18853 (BN171_2690010)	0.19	0.21	0.16	0.21	0.16	0.22	1.0	0.16	0.32	0.78	0.67	0.67	0.32	0.2	0.2	0.27	0.2	0.18	0.25	0.27	0.22	0.23	0.31	0.13	0.18	0.17	0.08	0.18	0.55
CCL19102 (BN171_2870032)	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	1.0	0.04	0.05	0.46	0.3	0.35	0.11	0.03	0.05	0.1	0.03	0.06	0.09	0.07	0.04	0.11	0.1	0.03	0.04	0.07	0.08	0.04	0.21
CCL19161 (BN171_2900016)	0.15	0.06	0.16	0.14	0.15	0.15	0.76	0.07	0.31	1.0	0.71	0.91	0.41	0.08	0.04	0.66	0.17	0.07	0.17	0.17	0.09	0.33	0.15	0.24	0.23	0.07	0.17	0.29	0.42
CCL19162 (BN171_2900017)	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	1.0	0.01	0.0	0.83	0.6	0.56	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.41
CCL19163 (BN171_2900018)	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	1.0	0.01	0.0	0.87	0.62	0.55	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.31
CCL19164 (BN171_2900019)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.7	0.52	0.52	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.51
CCL19168 (BN171_2910003)	0.05	0.01	0.08	0.08	0.08	0.21	0.64	0.02	0.11	1.0	0.66	0.8	0.4	0.13	0.04	0.59	0.16	0.05	0.15	0.06	0.03	0.14	0.21	0.06	0.12	0.02	0.01	0.32	0.53
CCL19797 (hydA)	0.06	0.26	0.08	0.22	0.05	0.12	1.0	0.04	0.04	0.92	0.47	0.69	0.18	0.02	0.16	0.18	0.07	0.03	0.26	0.09	0.27	0.65	0.12	0.08	0.09	0.05	0.08	0.05	0.3
CCL19800 (fdhD)	0.02	0.07	0.04	0.1	0.03	0.04	0.85	0.01	0.07	1.0	0.45	0.66	0.14	0.01	0.05	0.11	0.06	0.01	0.12	0.05	0.19	0.1	0.06	0.03	0.05	0.02	0.03	0.03	0.3
CCL20172 (BN171_3740001)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	0.45	0.01	0.02	1.0	0.87	0.67	0.19	0.01	0.01	0.2	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)