Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL17422 (BN171_150009)	0.07	0.28	0.13	0.58	0.13	0.17	0.74	0.05	0.21	0.5	0.47	0.55	0.67	0.09	0.18	0.3	0.29	0.12	0.75	0.09	0.4	1.0	0.74	0.57	0.39	0.06	0.44	0.4	0.55
CCL17987 (BN171_200008)	0.14	0.1	0.18	0.23	0.21	0.43	0.57	0.14	0.13	0.52	0.56	0.5	0.83	0.09	0.1	0.99	0.31	0.14	0.9	0.18	0.24	0.34	0.66	0.44	1.0	0.18	0.3	0.22	0.41
CCL18082 (BN171_210018)	0.35	0.21	0.16	0.1	0.15	0.07	0.28	0.21	1.0	0.57	0.36	0.31	0.47	0.29	0.2	0.71	0.17	0.29	0.85	0.17	0.18	0.19	0.42	0.41	0.31	0.06	0.1	0.79	0.31
CCL18740 (BN171_260009)	0.36	0.35	0.49	0.4	0.48	0.38	0.71	0.29	0.65	0.75	0.77	0.72	0.61	0.29	0.43	0.63	0.25	0.42	0.99	0.49	0.46	0.17	1.0	0.25	0.19	0.28	0.13	0.19	0.61
CCL18741 (BN171_260010)	0.24	0.21	0.33	0.26	0.38	0.47	0.76	0.2	0.55	0.89	0.8	0.74	0.68	0.25	0.33	0.66	0.22	0.3	0.92	0.37	0.4	0.2	1.0	0.31	0.28	0.25	0.14	0.26	0.59
CCL18872 (cbiQ)	0.01	0.0	0.04	0.0	0.07	0.13	0.44	0.0	0.29	0.78	0.59	0.56	0.35	0.01	0.0	0.28	0.13	0.01	0.85	0.01	0.0	0.09	1.0	0.29	0.16	0.01	0.04	0.77	0.36
CCL18873 (cbiO)	0.01	0.0	0.05	0.0	0.08	0.12	0.51	0.02	0.33	0.78	0.65	0.69	0.32	0.01	0.0	0.34	0.17	0.02	0.91	0.07	0.01	0.39	1.0	0.8	0.46	0.09	0.08	0.65	0.37
CCL19002 (BN171_280017)	0.15	0.08	0.17	0.19	0.17	0.36	1.0	0.18	0.23	0.57	0.44	0.5	0.73	0.2	0.1	0.68	0.19	0.16	0.66	0.17	0.1	0.17	0.68	0.19	0.29	0.13	0.4	0.33	0.35
CCL19396 (BN171_3100002)	0.28	0.16	0.22	0.18	0.15	0.09	0.23	0.1	0.25	0.29	0.29	0.29	0.25	0.21	0.2	0.3	0.14	0.19	0.69	0.4	0.22	0.18	1.0	0.76	0.25	0.19	0.32	0.5	0.26
CCL19398 (BN171_3100004)	0.06	0.13	0.06	0.11	0.04	0.18	0.51	0.05	0.18	0.54	0.41	0.52	0.17	0.04	0.08	0.2	0.12	0.05	0.69	0.14	0.25	0.12	1.0	0.4	0.29	0.08	0.22	0.43	0.31
CCL19485 (BN171_3180009)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.88	0.0	0.04	0.7	0.71	0.66	0.57	0.01	0.01	0.46	0.13	0.01	0.67	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.06	0.0	0.03	0.49	0.95
CCL19500 (xylR)	0.24	0.06	0.17	0.11	0.18	0.11	0.35	0.08	0.15	0.48	0.46	0.5	0.36	0.15	0.08	0.5	0.21	0.24	0.68	0.24	0.12	0.17	1.0	0.24	0.34	0.13	0.05	0.53	0.31
CCL19501 (xynA)	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.02	0.08	0.04	0.02	0.07	0.1	0.12	0.05	0.03	0.07	0.02	0.1	0.05	0.55	0.03	0.03	0.01	1.0	0.11	0.02	0.02	0.14	0.16	0.12
CCL19502 (xynB)	0.05	0.09	0.06	0.08	0.05	0.02	0.09	0.06	0.02	0.09	0.1	0.13	0.05	0.03	0.1	0.02	0.09	0.06	0.57	0.04	0.03	0.02	1.0	0.15	0.03	0.03	0.16	0.25	0.13
CCL19503 (xynD)	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.17	0.01	0.02	0.1	0.15	0.19	0.06	0.01	0.02	0.03	0.11	0.02	0.57	0.01	0.01	0.04	1.0	0.15	0.03	0.01	0.15	0.25	0.21
CCL19507 (BN171_3180031)	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.36	0.07	0.03	0.02	0.12	0.14	0.18	0.09	0.03	0.03	0.12	0.08	0.05	0.7	0.08	0.1	0.07	1.0	0.22	0.54	0.08	0.11	0.27	0.09
CCL19564 (BN171_3270002)	0.07	0.16	0.07	0.17	0.13	0.21	0.8	0.18	0.34	0.71	0.81	1.0	0.68	0.1	0.27	0.88	0.38	0.23	0.88	0.25	0.26	0.22	0.94	0.52	0.45	0.19	0.49	0.78	0.55
CCL19567 (BN171_3270005)	0.45	0.2	0.32	0.23	0.39	0.37	0.42	0.3	0.5	0.47	0.33	0.25	0.57	0.45	0.26	0.57	0.29	0.45	1.0	0.53	0.37	0.09	0.82	0.5	0.64	0.26	0.36	0.57	0.22
CCL19612 (BN171_3290025)	0.31	0.18	0.33	0.27	0.44	0.42	0.44	0.14	0.55	0.87	0.57	0.55	0.65	0.27	0.25	0.7	0.45	0.34	1.0	0.8	0.48	0.34	0.87	0.96	0.81	0.47	0.48	0.0	0.37
CCL19613 (BN171_3290026)	0.27	0.19	0.25	0.22	0.46	0.5	0.92	0.28	0.58	1.0	0.96	0.96	0.88	0.18	0.3	0.95	0.61	0.41	0.82	0.2	0.18	0.11	0.79	0.71	0.7	0.14	0.4	0.0	0.85
CCL19614 (BN171_3290027)	0.06	0.05	0.09	0.13	0.04	0.31	0.0	0.04	0.52	0.0	0.0	0.0	0.16	0.09	0.05	0.1	0.13	0.03	0.94	0.26	0.35	0.28	1.0	0.46	0.37	0.13	0.54	0.49	0.0
CCL19639 (cwp)	0.39	0.63	0.45	0.44	0.34	0.38	0.76	0.25	0.54	0.78	0.66	0.64	0.7	0.39	0.65	0.76	0.35	0.38	0.94	0.69	1.0	0.17	0.83	0.51	0.31	0.27	0.36	0.57	0.5
CCL19647 (BN171_3340014)	0.4	0.15	0.32	0.2	0.27	0.19	0.7	0.14	0.63	0.78	0.57	0.59	0.51	0.3	0.19	0.39	0.28	0.37	1.0	0.47	0.27	0.4	0.8	0.5	0.42	0.23	0.18	0.28	0.54
CCL19648 (BN171_3340015)	0.31	0.12	0.19	0.12	0.23	0.14	1.0	0.16	0.36	0.89	0.68	0.66	0.48	0.18	0.19	0.37	0.26	0.35	0.99	0.34	0.21	0.85	0.53	0.52	0.32	0.17	0.19	0.22	0.53
CCL19649 (BN171_3340016)	0.08	0.02	0.05	0.04	0.06	0.2	0.24	0.03	0.09	0.22	0.19	0.16	0.14	0.05	0.04	0.11	0.12	0.07	1.0	0.2	0.17	0.43	0.99	0.42	0.31	0.12	0.18	0.09	0.17
CCL19650 (BN171_3340017)	0.12	0.03	0.07	0.03	0.09	0.23	0.32	0.06	0.06	0.16	0.21	0.21	0.15	0.09	0.06	0.09	0.13	0.12	1.0	0.27	0.17	0.34	1.0	0.39	0.3	0.2	0.16	0.11	0.2
CCL19669 (BN171_3370003)	0.1	0.17	0.11	0.13	0.15	0.02	0.16	0.14	0.01	0.19	0.25	0.33	0.16	0.01	0.11	0.05	0.07	0.11	0.51	0.03	0.02	0.03	1.0	0.35	0.04	0.03	0.03	0.01	0.23
CCL19673 (BN171_3380004)	0.33	0.14	0.51	0.89	0.86	0.62	0.6	0.25	0.23	0.63	0.6	0.82	0.99	0.47	0.23	0.56	0.35	0.45	1.0	0.38	0.22	0.5	0.94	0.12	0.26	0.35	0.27	0.35	0.67
CCL19686 (BN171_340003)	0.16	0.14	0.23	0.18	0.17	0.21	0.36	0.16	0.92	0.44	0.45	0.27	0.57	0.23	0.19	0.44	0.34	0.21	1.0	0.28	0.32	0.46	0.7	0.38	0.29	0.14	0.41	0.42	0.43
CCL19766 (BN171_3470004)	0.13	0.17	0.13	0.12	0.1	0.06	0.27	0.18	1.0	0.17	0.16	0.16	0.42	0.21	0.14	0.29	0.12	0.08	0.79	0.37	0.1	0.39	0.13	0.4	0.25	0.09	0.28	0.16	0.12
CCL19773 (BN171_3470011)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.95	0.0	0.04	0.78	0.77	1.0	0.25	0.0	0.01	0.06	0.07	0.0	0.39	0.0	0.01	0.0	0.58	0.12	0.02	0.0	0.01	0.21	0.87
CCL19781 (BN171_3470019)	0.05	0.07	0.05	0.16	0.09	0.08	0.14	0.04	0.86	0.13	0.07	0.08	0.27	0.05	0.12	0.1	0.11	0.1	1.0	0.07	0.17	0.2	0.48	0.32	0.21	0.06	0.19	0.11	0.06
CCL19828 (BN171_3520014)	0.13	0.04	0.08	0.16	0.09	0.15	1.0	0.09	0.07	0.92	0.57	0.63	0.63	0.1	0.06	0.54	0.17	0.13	0.61	0.04	0.04	0.04	0.49	0.08	0.14	0.03	0.18	0.55	0.29
CCL19857 (hprK)	0.09	0.1	0.11	0.1	0.11	0.08	0.11	0.09	0.13	0.13	0.17	0.21	0.16	0.05	0.1	0.12	0.16	0.09	0.77	0.09	0.05	0.11	1.0	0.16	0.06	0.06	0.05	0.11	0.25
CCL19858 (uvrC)	0.09	0.08	0.11	0.09	0.08	0.08	0.15	0.05	0.14	0.15	0.21	0.24	0.15	0.04	0.07	0.08	0.14	0.07	0.8	0.06	0.04	0.05	1.0	0.19	0.04	0.03	0.06	0.13	0.25
CCL19903 (BN171_3590024)	0.51	0.39	0.46	0.54	0.56	0.39	0.38	0.45	0.92	0.5	0.49	0.47	0.71	0.46	0.6	1.0	0.42	0.72	0.93	0.53	0.38	0.57	0.99	0.86	0.76	0.45	0.22	0.45	0.43
CCL19921 (BN171_360015)	0.23	0.07	0.22	0.11	0.21	0.31	0.18	0.14	0.04	0.18	0.21	0.15	0.27	0.22	0.1	0.35	0.1	0.22	0.76	0.39	0.11	0.98	1.0	0.69	0.73	0.31	0.09	0.25	0.17
CCL19922 (BN171_360016)	0.15	0.04	0.15	0.13	0.21	0.33	0.19	0.12	0.02	0.19	0.21	0.21	0.21	0.14	0.09	0.22	0.11	0.2	0.77	0.54	0.11	0.78	1.0	0.77	0.6	0.41	0.09	0.29	0.19
CCL19973 (BN171_3610016)	0.07	0.09	0.08	0.15	0.08	0.27	0.31	0.05	0.35	0.44	0.37	0.41	0.55	0.06	0.12	0.55	0.22	0.09	0.91	0.09	0.2	0.23	1.0	0.62	0.44	0.08	0.18	0.47	0.24
CCL19997 (phnM)	0.07	0.04	0.09	0.16	0.11	0.13	0.37	0.03	0.16	0.21	0.3	0.37	0.38	0.05	0.06	0.43	0.11	0.07	0.75	0.11	0.11	0.11	1.0	0.2	0.18	0.06	0.08	0.0	0.33
CCL19998 (phnL)	0.06	0.05	0.06	0.12	0.07	0.11	0.22	0.03	0.19	0.3	0.27	0.39	0.34	0.03	0.06	0.42	0.12	0.1	0.8	0.07	0.08	0.12	1.0	0.21	0.14	0.04	0.08	0.0	0.21
CCL19999 (phnK)	0.12	0.09	0.15	0.19	0.14	0.1	0.48	0.09	0.11	0.3	0.36	0.32	0.27	0.06	0.11	0.43	0.13	0.15	0.75	0.1	0.08	0.12	1.0	0.19	0.14	0.09	0.06	0.0	0.19
CCL20000 (phnJ)	0.11	0.1	0.1	0.19	0.16	0.12	0.46	0.07	0.23	0.65	0.32	0.46	0.36	0.07	0.1	0.48	0.12	0.16	0.76	0.13	0.09	0.15	1.0	0.19	0.15	0.1	0.08	0.0	0.31
CCL20047 (BN171_3670030)	0.22	0.1	0.31	0.31	0.29	0.25	0.93	0.1	0.24	0.45	1.0	0.56	0.32	0.32	0.16	0.45	0.17	0.26	0.71	0.6	0.54	0.03	0.63	0.45	0.3	0.34	0.03	0.37	0.93
CCL20081 (BN171_3690025)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.0	0.05	0.32	0.29	0.37	0.19	0.0	0.01	0.03	0.08	0.01	0.78	0.01	0.02	0.01	1.0	0.28	0.04	0.0	0.18	0.21	0.2
CCL20092 (BN171_3690036)	0.08	0.01	0.08	0.04	0.08	0.22	1.0	0.01	0.23	0.71	0.67	0.64	0.66	0.2	0.05	0.68	0.13	0.04	0.7	0.08	0.1	0.03	0.74	0.2	0.19	0.04	0.07	0.3	0.57
CCL20135 (BN171_370009)	0.01	0.01	0.06	0.02	0.05	0.23	0.55	0.01	0.31	0.97	0.72	0.83	0.62	0.06	0.02	0.59	0.27	0.03	0.81	0.09	0.06	0.04	1.0	0.31	0.3	0.04	0.03	0.0	0.73
CCL20136 (BN171_370010)	0.35	0.29	0.39	0.34	0.31	0.14	0.68	0.42	0.74	0.74	0.71	0.74	0.64	0.4	0.34	0.59	0.46	0.43	0.91	0.3	0.35	0.2	1.0	0.67	0.51	0.17	0.13	0.0	0.6
CCL20139 (BN171_370013)	0.07	0.11	0.22	0.99	0.26	0.07	0.27	0.06	0.33	0.4	0.37	0.51	0.38	0.09	0.22	0.35	0.25	0.11	1.0	0.24	0.55	0.22	0.75	0.38	0.26	0.13	0.25	0.0	0.49
CCL20211 (BN171_380006)	0.02	0.01	0.08	0.06	0.02	0.1	0.44	0.0	0.48	0.55	0.38	0.24	0.52	0.04	0.03	0.31	0.26	0.03	1.0	0.04	0.12	0.02	0.77	0.45	0.23	0.01	0.17	0.84	0.34
CCL20213 (BN171_380008)	0.11	0.03	0.15	0.1	0.09	0.19	0.75	0.11	0.66	0.56	0.55	0.59	1.0	0.16	0.04	0.89	0.44	0.11	0.72	0.18	0.12	0.07	0.94	0.87	0.65	0.08	0.09	0.04	0.5
CCL20282 (BN171_400001)	0.02	0.0	0.04	0.02	0.03	0.35	0.15	0.01	0.06	0.1	0.07	0.09	0.16	0.04	0.01	0.24	0.07	0.01	0.75	0.47	0.16	0.06	1.0	0.5	0.63	0.26	0.19	0.01	0.06
CCL20447 (nfo)	0.11	0.25	0.16	0.2	0.14	0.02	0.38	0.15	0.12	0.3	0.29	0.48	0.15	0.02	0.19	0.04	0.19	0.13	0.9	0.05	0.04	0.07	1.0	0.53	0.06	0.03	0.08	0.39	0.35
CCL20460 (radA)	0.13	0.09	0.12	0.15	0.13	0.19	0.31	0.11	0.91	0.34	0.34	0.34	0.42	0.12	0.11	0.35	0.2	0.13	1.0	0.14	0.17	0.67	0.76	0.3	0.26	0.1	0.1	0.17	0.37
CCL20461 (disA)	0.15	0.12	0.15	0.17	0.21	0.19	0.37	0.15	0.68	0.34	0.31	0.34	0.37	0.13	0.14	0.3	0.14	0.18	1.0	0.18	0.26	0.42	0.66	0.14	0.17	0.15	0.04	0.07	0.29
CCL20524 (BN171_60015)	0.45	0.25	0.38	0.3	0.4	0.41	0.56	0.21	0.38	0.65	0.55	0.64	0.68	0.6	0.26	0.85	0.24	0.36	1.0	0.43	0.44	0.06	1.0	0.6	0.54	0.14	0.25	0.49	0.38
CCL20543 (BN171_630001)	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.15	0.01	0.07	0.22	0.24	0.33	0.12	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.87	0.02	0.03	0.02	1.0	0.24	0.05	0.01	0.03	0.86	0.23
CCL20545 (BN171_640001)	0.07	0.03	0.11	0.08	0.07	0.02	0.21	0.02	0.11	0.21	0.19	0.26	0.1	0.02	0.05	0.05	0.1	0.05	0.87	0.05	0.06	0.01	1.0	0.4	0.05	0.03	0.16	0.0	0.24
CCL20614 (BN171_740002)	0.14	0.04	0.18	0.15	0.14	0.45	0.37	0.05	0.5	0.27	0.32	0.3	0.44	0.12	0.11	0.46	0.2	0.12	1.0	0.22	0.25	0.09	0.77	0.38	0.29	0.16	0.27	0.32	0.16
CCL20621 (BN171_750005)	0.01	0.0	0.04	0.02	0.02	0.32	0.4	0.01	0.06	1.0	0.52	0.54	0.49	0.03	0.02	0.53	0.23	0.02	0.62	0.04	0.05	0.03	0.75	0.43	0.36	0.01	0.08	0.0	0.41
CCL20655 (BN171_830005)	0.18	0.11	0.16	0.11	0.13	0.45	0.35	0.1	0.2	0.22	0.25	0.39	0.14	0.1	0.09	0.11	0.21	0.12	0.83	0.1	0.05	0.15	1.0	0.2	0.11	0.05	0.1	0.09	0.36
CCL20675 (BN171_90001)	0.26	0.29	0.26	0.37	0.18	0.05	0.36	0.14	0.19	0.15	0.19	0.24	0.16	0.09	0.24	0.08	0.3	0.18	1.0	0.17	0.15	0.24	1.0	0.89	0.15	0.07	0.52	0.27	0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)