View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19099 (yacA) | 0.88 | 0.44 | 0.44 | 0.3 | 0.43 | 0.28 | 0.25 | 0.64 | 0.6 | 0.43 | 0.65 | 1.0 | 0.67 | 0.91 | 0.41 | 0.16 | 0.26 | 0.23 | 0.3 | 0.31 | 0.11 | 0.2 | 0.21 | 0.46 | 0.15 | 0.41 | 0.56 | 0.64 | 0.32 | 0.06 | 0.27 | 0.58 | 0.4 | 0.15 | 0.39 | 0.56 | 0.39 | 0.34 | 0.84 |
AAL19115 (pdhR) | 1.0 | 0.12 | 0.18 | 0.08 | 0.03 | 0.03 | 0.13 | 0.18 | 0.16 | 0.09 | 0.57 | 0.01 | 0.19 | 0.28 | 0.25 | 0.04 | 0.05 | 0.1 | 0.1 | 0.14 | 0.03 | 0.17 | 0.02 | 0.21 | 0.05 | 0.11 | 0.25 | 0.3 | 0.11 | 0.06 | 0.11 | 0.24 | 0.11 | 0.03 | 0.04 | 0.22 | 0.28 | 0.08 | 0.28 |
AAL19151 (sfsA) | 0.3 | 0.41 | 0.76 | 0.17 | 0.31 | 0.09 | 0.19 | 0.37 | 0.27 | 0.28 | 0.37 | 0.19 | 1.0 | 0.51 | 0.29 | 0.4 | 0.11 | 0.18 | 0.17 | 0.2 | 0.36 | 0.27 | 0.18 | 0.19 | 0.55 | 0.31 | 0.17 | 0.53 | 0.23 | 0.08 | 0.24 | 0.44 | 0.17 | 0.42 | 0.14 | 0.22 | 0.24 | 0.43 | 0.64 |
AAL19266 (yafH) | 0.05 | 0.25 | 0.9 | 0.11 | 0.1 | 0.09 | 0.07 | 0.2 | 0.15 | 0.27 | 0.23 | 0.02 | 0.46 | 0.15 | 0.08 | 0.08 | 0.7 | 0.19 | 0.15 | 0.23 | 0.05 | 0.15 | 0.03 | 0.28 | 0.06 | 0.23 | 0.05 | 0.18 | 0.07 | 0.02 | 0.11 | 0.1 | 0.06 | 0.05 | 1.0 | 0.04 | 0.51 | 0.3 | 0.1 |
AAL19326 (hemB) | 0.68 | 0.52 | 0.49 | 0.6 | 0.56 | 0.34 | 0.55 | 0.76 | 0.42 | 0.49 | 0.36 | 0.6 | 0.78 | 0.66 | 0.72 | 0.3 | 0.2 | 0.44 | 0.52 | 0.57 | 0.17 | 0.25 | 0.28 | 0.49 | 0.23 | 0.44 | 0.63 | 0.72 | 0.94 | 0.05 | 0.52 | 0.69 | 0.93 | 0.26 | 0.17 | 0.55 | 0.54 | 0.44 | 1.0 |
AAL19353 (brnQ) | 0.83 | 0.7 | 0.2 | 0.35 | 0.19 | 0.4 | 0.31 | 0.88 | 0.41 | 0.39 | 0.39 | 0.75 | 0.21 | 1.0 | 0.34 | 0.27 | 0.13 | 0.56 | 0.67 | 0.72 | 0.31 | 0.52 | 0.12 | 0.61 | 0.65 | 0.5 | 0.71 | 0.41 | 0.77 | 0.21 | 0.42 | 0.22 | 0.8 | 0.16 | 0.14 | 0.34 | 0.67 | 0.18 | 0.18 |
AAL19412 (cof) | 0.19 | 0.32 | 0.18 | 0.18 | 0.24 | 0.05 | 0.09 | 0.26 | 0.19 | 0.1 | 0.2 | 0.06 | 0.46 | 0.19 | 0.2 | 0.26 | 0.12 | 0.2 | 0.23 | 0.26 | 0.07 | 0.11 | 0.38 | 0.71 | 0.16 | 0.09 | 0.16 | 0.3 | 0.27 | 0.02 | 0.14 | 0.52 | 0.23 | 0.33 | 0.13 | 0.1 | 1.0 | 0.1 | 0.67 |
AAL19429 (acrB) | 0.81 | 0.5 | 0.85 | 0.58 | 0.6 | 0.6 | 0.37 | 0.53 | 0.51 | 0.44 | 0.39 | 1.0 | 0.72 | 0.7 | 0.47 | 0.4 | 0.32 | 0.28 | 0.35 | 0.33 | 0.32 | 0.3 | 0.27 | 0.43 | 0.36 | 0.98 | 0.51 | 0.67 | 0.65 | 0.11 | 0.24 | 0.51 | 0.58 | 0.31 | 0.29 | 0.34 | 0.51 | 0.76 | 0.51 |
AAL19430 (acrA) | 0.92 | 0.45 | 0.65 | 0.49 | 0.48 | 0.33 | 0.47 | 0.6 | 0.46 | 0.49 | 0.55 | 0.93 | 0.81 | 0.81 | 0.98 | 0.37 | 0.26 | 0.41 | 0.45 | 0.44 | 0.29 | 0.27 | 0.22 | 0.34 | 0.4 | 1.0 | 0.47 | 0.86 | 0.59 | 0.12 | 0.34 | 0.56 | 0.55 | 0.33 | 0.27 | 0.3 | 0.37 | 0.44 | 0.83 |
AAL19454 (ybbJ) | 0.31 | 0.7 | 0.76 | 0.43 | 0.27 | 0.26 | 0.19 | 0.46 | 0.56 | 0.66 | 1.0 | 0.37 | 0.63 | 0.47 | 0.33 | 0.12 | 0.18 | 0.59 | 0.6 | 0.69 | 0.35 | 0.46 | 0.04 | 0.36 | 0.39 | 0.53 | 0.33 | 0.48 | 0.75 | 0.05 | 0.28 | 0.39 | 0.78 | 0.07 | 0.21 | 0.37 | 0.44 | 0.66 | 0.37 |
AAL19630 (glnS) | 0.51 | 0.48 | 0.3 | 0.67 | 0.59 | 0.27 | 0.53 | 0.74 | 0.56 | 0.54 | 0.51 | 0.97 | 0.5 | 0.84 | 0.56 | 0.32 | 0.45 | 0.43 | 0.5 | 0.53 | 0.12 | 0.36 | 0.57 | 0.62 | 0.2 | 0.77 | 0.73 | 0.73 | 0.92 | 0.14 | 0.37 | 0.57 | 1.0 | 0.36 | 0.65 | 0.61 | 0.66 | 0.45 | 0.98 |
AAL19751 (ybhQ) | 0.06 | 0.26 | 0.16 | 0.1 | 0.11 | 0.03 | 0.04 | 0.25 | 0.07 | 0.17 | 0.07 | 0.04 | 0.12 | 0.03 | 0.34 | 0.15 | 0.18 | 0.31 | 0.25 | 0.37 | 0.19 | 1.0 | 0.1 | 0.09 | 0.24 | 0.06 | 0.05 | 0.09 | 0.02 | 0.02 | 0.1 | 0.09 | 0.02 | 0.13 | 0.19 | 0.05 | 0.09 | 0.08 | 0.06 |
AAL20053 (ycdC) | 0.13 | 0.62 | 0.25 | 0.1 | 0.18 | 0.05 | 0.31 | 0.26 | 0.14 | 0.21 | 0.19 | 0.15 | 0.36 | 0.28 | 0.26 | 0.1 | 0.19 | 0.28 | 0.26 | 0.35 | 0.16 | 1.0 | 0.03 | 0.31 | 0.29 | 0.22 | 0.16 | 0.14 | 0.1 | 0.04 | 0.11 | 0.21 | 0.09 | 0.07 | 0.43 | 0.17 | 0.44 | 0.11 | 0.19 |
AAL20209 (yeaH) | 0.1 | 0.23 | 0.88 | 0.11 | 0.13 | 0.26 | 0.26 | 0.2 | 0.09 | 0.15 | 0.13 | 0.03 | 1.0 | 0.16 | 0.11 | 0.4 | 0.06 | 0.4 | 0.31 | 0.41 | 0.49 | 0.38 | 0.05 | 0.14 | 0.45 | 0.21 | 0.08 | 0.43 | 0.18 | 0.01 | 0.15 | 0.15 | 0.11 | 0.38 | 0.04 | 0.07 | 0.22 | 0.2 | 0.33 |
AAL20288 (ydiK) | 0.41 | 0.67 | 0.84 | 0.42 | 0.4 | 0.24 | 0.34 | 0.59 | 0.43 | 0.43 | 0.47 | 0.37 | 1.0 | 0.64 | 0.62 | 0.27 | 0.4 | 0.72 | 0.55 | 0.71 | 0.49 | 0.57 | 0.12 | 0.67 | 0.73 | 0.7 | 0.54 | 0.59 | 0.48 | 0.12 | 0.39 | 0.38 | 0.46 | 0.3 | 0.27 | 0.31 | 0.89 | 0.45 | 0.62 |
AAL20313 (orf319) | 0.14 | 0.19 | 1.0 | 0.11 | 0.19 | 0.09 | 0.21 | 0.24 | 0.07 | 0.16 | 0.09 | 0.05 | 0.97 | 0.39 | 0.09 | 0.42 | 0.05 | 0.24 | 0.26 | 0.27 | 0.22 | 0.1 | 0.05 | 0.12 | 0.42 | 0.32 | 0.03 | 0.25 | 0.22 | 0.01 | 0.16 | 0.23 | 0.13 | 0.45 | 0.04 | 0.04 | 0.12 | 0.38 | 0.33 |
AAL20347 (ydhE) | 0.26 | 0.55 | 0.56 | 0.3 | 0.39 | 0.15 | 0.21 | 0.31 | 0.47 | 0.28 | 0.62 | 0.24 | 0.87 | 0.6 | 0.1 | 0.32 | 0.15 | 0.41 | 0.42 | 0.48 | 0.22 | 0.48 | 0.19 | 0.68 | 0.73 | 1.0 | 0.47 | 0.45 | 0.55 | 0.17 | 0.26 | 0.24 | 0.68 | 0.42 | 0.07 | 0.18 | 0.89 | 0.81 | 0.36 |
AAL20356 (rnt) | 0.65 | 0.52 | 0.24 | 0.36 | 0.41 | 0.13 | 0.33 | 0.6 | 0.62 | 0.46 | 0.91 | 0.85 | 0.64 | 1.0 | 0.28 | 0.36 | 0.16 | 0.4 | 0.38 | 0.47 | 0.26 | 0.46 | 0.33 | 0.58 | 0.55 | 0.82 | 0.63 | 0.92 | 0.68 | 0.18 | 0.33 | 0.33 | 0.75 | 0.32 | 0.21 | 0.52 | 0.55 | 0.25 | 0.66 |
AAL20397 (ydgH) | 0.38 | 0.47 | 0.27 | 0.4 | 0.63 | 0.25 | 0.29 | 0.58 | 0.42 | 0.54 | 0.44 | 0.58 | 0.34 | 0.75 | 0.47 | 0.14 | 0.26 | 0.24 | 0.32 | 0.3 | 0.09 | 0.27 | 0.29 | 0.4 | 0.17 | 0.6 | 0.78 | 0.38 | 0.35 | 0.1 | 0.24 | 0.58 | 0.43 | 0.16 | 0.21 | 0.6 | 0.48 | 0.35 | 1.0 |
AAL20569 (nifJ) | 0.25 | 0.29 | 0.56 | 0.19 | 0.19 | 0.16 | 0.35 | 0.28 | 0.12 | 0.16 | 0.11 | 0.17 | 1.0 | 0.21 | 0.2 | 0.34 | 0.06 | 0.71 | 0.67 | 0.69 | 0.35 | 0.27 | 0.13 | 0.33 | 0.4 | 0.29 | 0.28 | 0.47 | 0.21 | 0.03 | 0.23 | 0.27 | 0.15 | 0.32 | 0.06 | 0.22 | 0.45 | 0.25 | 0.37 |
AAL20690 (hemK) | 0.63 | 0.42 | 0.21 | 0.37 | 0.48 | 0.11 | 0.1 | 0.57 | 0.16 | 0.24 | 0.22 | 0.97 | 0.25 | 1.0 | 0.09 | 0.13 | 0.07 | 0.18 | 0.39 | 0.23 | 0.13 | 0.22 | 0.11 | 0.39 | 0.13 | 0.67 | 0.41 | 0.31 | 0.77 | 0.08 | 0.16 | 0.31 | 0.75 | 0.06 | 0.18 | 0.26 | 0.33 | 0.31 | 0.48 |
AAL20691 (prfA) | 0.55 | 0.41 | 0.3 | 0.5 | 0.75 | 0.12 | 0.34 | 0.55 | 0.19 | 0.4 | 0.26 | 0.96 | 0.66 | 0.82 | 0.53 | 0.18 | 0.23 | 0.59 | 0.94 | 0.74 | 0.14 | 0.17 | 0.22 | 0.39 | 0.2 | 0.82 | 0.5 | 0.51 | 0.98 | 0.13 | 0.23 | 0.63 | 0.9 | 0.2 | 0.84 | 0.29 | 0.35 | 0.55 | 1.0 |
AAL20734 (slp) | 0.29 | 0.28 | 0.24 | 0.25 | 0.14 | 0.11 | 0.16 | 0.28 | 0.24 | 0.25 | 0.26 | 0.4 | 0.15 | 0.45 | 0.07 | 0.13 | 0.06 | 0.09 | 0.12 | 0.1 | 0.59 | 0.53 | 0.12 | 0.29 | 0.52 | 0.24 | 0.37 | 0.18 | 0.56 | 0.09 | 0.16 | 0.13 | 1.0 | 0.08 | 0.06 | 0.33 | 0.28 | 0.14 | 0.18 |
AAL20823 (cutC) | 0.23 | 0.28 | 0.24 | 0.23 | 0.19 | 0.27 | 0.23 | 0.72 | 0.13 | 0.22 | 0.15 | 0.11 | 0.13 | 0.54 | 1.0 | 0.43 | 0.19 | 0.45 | 0.44 | 0.53 | 0.71 | 0.91 | 0.72 | 0.52 | 0.43 | 0.17 | 0.23 | 0.44 | 0.19 | 0.05 | 0.38 | 0.14 | 0.29 | 0.42 | 0.27 | 0.19 | 0.92 | 0.21 | 0.09 |
AAL20906 (cspB) | 0.62 | 0.09 | 0.11 | 0.19 | 0.12 | 0.0 | 0.01 | 0.12 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.15 | 0.11 | 0.02 | 0.07 | 0.03 | 0.02 | 0.06 | 0.05 | 0.05 | 0.0 | 0.12 | 1.0 | 0.18 | 0.01 | 0.05 | 0.32 | 0.58 | 0.01 | 0.06 | 0.18 | 0.83 | 0.06 | 0.05 | 0.02 | 0.18 | 0.1 | 0.24 |
AAL20973 (yeeY) | 0.14 | 0.34 | 0.6 | 0.16 | 0.14 | 0.09 | 0.42 | 0.28 | 0.09 | 0.1 | 0.14 | 0.07 | 0.71 | 0.17 | 0.15 | 0.31 | 0.08 | 0.27 | 0.27 | 0.33 | 0.99 | 0.24 | 0.13 | 0.67 | 0.79 | 0.15 | 0.13 | 0.21 | 0.33 | 0.01 | 0.15 | 0.17 | 0.39 | 0.36 | 0.11 | 0.07 | 1.0 | 0.23 | 0.27 |
AAL21057 (mrp) | 0.49 | 0.62 | 0.48 | 0.9 | 0.93 | 0.46 | 0.87 | 0.9 | 0.6 | 0.74 | 0.54 | 0.79 | 0.56 | 0.98 | 0.65 | 0.24 | 0.45 | 0.49 | 0.61 | 0.59 | 0.2 | 0.45 | 0.29 | 0.66 | 0.32 | 0.94 | 0.69 | 0.57 | 1.0 | 0.13 | 0.52 | 0.82 | 0.98 | 0.17 | 0.53 | 0.92 | 0.63 | 0.81 | 0.93 |
AAL21073 (yohC) | 0.08 | 0.56 | 0.86 | 0.06 | 0.06 | 0.09 | 0.19 | 0.29 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.64 | 0.09 | 0.05 | 0.31 | 0.08 | 0.14 | 0.16 | 0.19 | 0.93 | 0.17 | 0.03 | 0.62 | 1.0 | 0.06 | 0.06 | 0.1 | 0.1 | 0.01 | 0.12 | 0.1 | 0.07 | 0.24 | 0.21 | 0.03 | 0.82 | 0.16 | 0.17 |
AAL21166 (alkB) | 0.17 | 0.44 | 0.81 | 0.13 | 0.28 | 0.22 | 0.17 | 0.28 | 0.29 | 0.28 | 0.35 | 0.24 | 1.0 | 0.35 | 0.07 | 0.17 | 0.09 | 0.25 | 0.2 | 0.24 | 0.56 | 0.21 | 0.03 | 0.41 | 0.49 | 0.21 | 0.31 | 0.34 | 0.2 | 0.04 | 0.31 | 0.45 | 0.15 | 0.11 | 0.07 | 0.22 | 0.59 | 0.34 | 0.68 |
AAL21167 (ada) | 0.18 | 0.54 | 0.84 | 0.14 | 0.32 | 0.2 | 0.14 | 0.33 | 0.33 | 0.38 | 0.3 | 0.34 | 1.0 | 0.5 | 0.07 | 0.12 | 0.06 | 0.17 | 0.18 | 0.21 | 0.7 | 0.29 | 0.02 | 0.24 | 0.57 | 0.26 | 0.38 | 0.34 | 0.2 | 0.07 | 0.3 | 0.42 | 0.17 | 0.09 | 0.04 | 0.23 | 0.33 | 0.42 | 0.57 |
AAL21238 (ackA) | 0.37 | 0.36 | 0.12 | 0.33 | 0.17 | 0.15 | 0.35 | 0.38 | 0.27 | 0.26 | 0.31 | 1.0 | 0.29 | 0.36 | 0.59 | 0.2 | 0.11 | 0.15 | 0.18 | 0.21 | 0.04 | 0.13 | 0.34 | 0.36 | 0.05 | 0.23 | 0.4 | 0.41 | 0.51 | 0.06 | 0.21 | 0.25 | 0.56 | 0.26 | 0.05 | 0.33 | 0.27 | 0.11 | 0.33 |
AAL21239 (pta) | 0.22 | 0.32 | 0.09 | 0.32 | 0.1 | 0.14 | 0.18 | 0.34 | 0.26 | 0.2 | 0.22 | 1.0 | 0.1 | 0.39 | 0.33 | 0.04 | 0.05 | 0.08 | 0.09 | 0.1 | 0.03 | 0.1 | 0.06 | 0.28 | 0.03 | 0.16 | 0.34 | 0.27 | 0.43 | 0.03 | 0.17 | 0.15 | 0.54 | 0.03 | 0.03 | 0.27 | 0.19 | 0.08 | 0.16 |
AAL21251 (yfcH) | 0.31 | 0.42 | 0.68 | 0.2 | 0.27 | 0.19 | 0.14 | 0.47 | 0.23 | 0.26 | 0.21 | 0.12 | 1.0 | 0.52 | 0.16 | 0.17 | 0.11 | 0.25 | 0.24 | 0.29 | 0.52 | 0.21 | 0.08 | 0.35 | 0.62 | 0.25 | 0.15 | 0.35 | 0.41 | 0.03 | 0.27 | 0.43 | 0.37 | 0.15 | 0.14 | 0.17 | 0.6 | 0.37 | 0.52 |
AAL21301 (ddg) | 0.58 | 0.22 | 0.09 | 0.13 | 0.14 | 0.01 | 0.04 | 0.42 | 0.06 | 0.02 | 0.13 | 0.05 | 0.24 | 0.33 | 0.08 | 0.24 | 0.05 | 0.11 | 0.31 | 0.15 | 0.26 | 0.11 | 0.72 | 0.32 | 0.2 | 0.09 | 0.24 | 0.31 | 0.23 | 0.0 | 0.25 | 0.19 | 0.37 | 0.22 | 0.05 | 0.04 | 1.0 | 0.05 | 0.25 |
AAL21305 (STM2405) | 0.12 | 0.39 | 0.86 | 0.12 | 0.21 | 0.04 | 0.1 | 0.18 | 0.17 | 0.19 | 0.23 | 0.08 | 1.0 | 0.15 | 0.22 | 0.08 | 0.08 | 0.29 | 0.28 | 0.31 | 0.08 | 0.13 | 0.02 | 0.24 | 0.13 | 0.28 | 0.17 | 0.34 | 0.09 | 0.03 | 0.18 | 0.28 | 0.07 | 0.11 | 0.1 | 0.17 | 0.34 | 0.3 | 0.34 |
AAL21313 (gltX) | 0.35 | 0.46 | 0.21 | 0.57 | 0.4 | 0.26 | 0.84 | 0.54 | 0.49 | 0.48 | 0.52 | 1.0 | 0.33 | 0.69 | 0.58 | 0.2 | 0.43 | 0.52 | 0.6 | 0.6 | 0.12 | 0.27 | 0.21 | 0.48 | 0.17 | 0.79 | 0.7 | 0.45 | 0.67 | 0.13 | 0.33 | 0.34 | 0.65 | 0.21 | 0.63 | 0.53 | 0.6 | 0.35 | 0.49 |
AAL21380 (STM2486) | 0.27 | 0.38 | 0.88 | 0.22 | 0.3 | 0.12 | 0.23 | 0.59 | 0.28 | 0.27 | 0.28 | 0.18 | 1.0 | 0.94 | 0.28 | 0.33 | 0.14 | 0.36 | 0.34 | 0.41 | 0.58 | 0.27 | 0.14 | 0.32 | 0.5 | 0.35 | 0.25 | 0.34 | 0.3 | 0.03 | 0.39 | 0.42 | 0.31 | 0.23 | 0.17 | 0.22 | 0.46 | 0.48 | 0.55 |
AAL21417 (gcpE) | 1.0 | 0.77 | 0.81 | 0.77 | 0.68 | 0.5 | 0.63 | 0.93 | 0.48 | 0.68 | 0.34 | 0.73 | 0.85 | 0.95 | 0.68 | 0.5 | 0.24 | 0.78 | 0.92 | 0.92 | 0.82 | 0.52 | 0.36 | 0.68 | 0.52 | 0.67 | 0.8 | 0.84 | 0.96 | 0.07 | 0.74 | 0.76 | 0.86 | 0.35 | 0.29 | 0.65 | 0.75 | 0.76 | 0.97 |
AAL21418 (yfgA) | 0.99 | 0.52 | 0.39 | 0.5 | 0.29 | 0.24 | 0.4 | 0.78 | 0.37 | 0.36 | 0.35 | 0.57 | 0.51 | 1.0 | 0.62 | 0.17 | 0.26 | 0.53 | 0.68 | 0.71 | 0.46 | 0.39 | 0.14 | 0.45 | 0.6 | 0.57 | 0.64 | 0.5 | 0.76 | 0.1 | 0.33 | 0.47 | 0.79 | 0.14 | 0.32 | 0.45 | 0.48 | 0.26 | 0.48 |
AAL21704 (yqaA) | 0.4 | 0.32 | 0.14 | 0.24 | 0.2 | 0.07 | 0.25 | 0.29 | 0.27 | 0.2 | 0.6 | 0.41 | 0.26 | 0.46 | 0.53 | 0.11 | 0.12 | 0.36 | 0.3 | 0.36 | 0.1 | 0.25 | 0.17 | 0.47 | 0.15 | 0.23 | 0.35 | 0.4 | 0.29 | 0.03 | 0.14 | 0.21 | 0.32 | 0.14 | 1.0 | 0.37 | 0.46 | 0.18 | 0.34 |
AAL21705 (yqaB) | 0.38 | 0.26 | 0.15 | 0.26 | 0.13 | 0.05 | 0.21 | 0.29 | 0.24 | 0.29 | 0.4 | 0.33 | 0.18 | 0.34 | 0.35 | 0.09 | 0.14 | 0.37 | 0.36 | 0.41 | 0.04 | 0.21 | 0.12 | 0.23 | 0.15 | 0.22 | 0.24 | 0.36 | 0.42 | 0.05 | 0.15 | 0.2 | 0.46 | 0.09 | 1.0 | 0.3 | 0.23 | 0.14 | 0.25 |
AAL21915 (lysS) | 0.49 | 0.49 | 0.28 | 0.91 | 0.69 | 0.93 | 0.91 | 0.78 | 0.71 | 0.72 | 0.39 | 1.0 | 0.29 | 0.89 | 0.94 | 0.34 | 0.31 | 0.43 | 0.54 | 0.49 | 0.13 | 0.2 | 0.49 | 0.59 | 0.19 | 0.71 | 0.84 | 0.5 | 0.72 | 0.11 | 0.34 | 0.55 | 0.76 | 0.27 | 0.35 | 0.86 | 0.56 | 0.74 | 0.54 |
AAL21935 (ygfE) | 0.98 | 0.23 | 0.73 | 0.23 | 0.38 | 0.11 | 0.38 | 0.79 | 0.55 | 0.33 | 0.91 | 0.18 | 1.0 | 0.74 | 0.35 | 0.34 | 0.17 | 0.26 | 0.24 | 0.31 | 0.32 | 0.09 | 0.28 | 0.3 | 0.15 | 0.3 | 0.31 | 0.66 | 0.25 | 0.48 | 0.74 | 0.67 | 0.24 | 0.34 | 0.22 | 0.38 | 0.34 | 0.51 | 0.77 |
AAL22081 (ygiH) | 0.84 | 0.76 | 0.62 | 0.31 | 0.17 | 0.18 | 0.43 | 0.64 | 0.83 | 0.56 | 1.0 | 0.54 | 0.69 | 0.72 | 0.39 | 0.21 | 0.26 | 0.41 | 0.38 | 0.42 | 0.36 | 0.64 | 0.17 | 0.63 | 0.75 | 0.54 | 0.63 | 0.64 | 0.49 | 0.16 | 0.69 | 0.51 | 0.56 | 0.15 | 0.33 | 0.72 | 0.95 | 0.38 | 0.6 |
AAL22091 (oat) | 0.03 | 0.12 | 0.62 | 0.03 | 0.02 | 0.08 | 0.07 | 0.12 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.55 | 0.02 | 0.02 | 0.08 | 0.01 | 0.1 | 0.1 | 0.11 | 1.0 | 0.13 | 0.0 | 0.11 | 0.61 | 0.04 | 0.01 | 0.07 | 0.04 | 0.0 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.17 | 0.04 | 0.04 |
AAL22152 (deaD) | 0.77 | 0.16 | 0.03 | 0.37 | 0.11 | 0.05 | 0.11 | 0.27 | 0.26 | 0.03 | 0.38 | 0.25 | 0.13 | 0.32 | 0.07 | 0.12 | 0.03 | 0.25 | 0.49 | 0.3 | 0.06 | 0.02 | 0.07 | 0.18 | 0.18 | 0.22 | 0.27 | 0.2 | 0.89 | 0.03 | 0.24 | 0.11 | 1.0 | 0.06 | 0.06 | 0.08 | 0.24 | 0.05 | 0.16 |
AAL22171 (yhbZ) | 0.35 | 0.23 | 0.11 | 0.26 | 0.21 | 0.07 | 0.43 | 0.35 | 0.85 | 0.14 | 1.0 | 0.43 | 0.25 | 0.34 | 0.22 | 0.18 | 0.19 | 0.65 | 0.71 | 0.7 | 0.12 | 0.1 | 0.15 | 0.54 | 0.15 | 0.38 | 0.39 | 0.17 | 0.38 | 0.04 | 0.15 | 0.18 | 0.45 | 0.12 | 0.21 | 0.22 | 0.81 | 0.18 | 0.23 |
AAL22210 (sspB) | 0.86 | 0.56 | 0.16 | 0.5 | 0.28 | 0.19 | 0.36 | 0.46 | 0.46 | 0.51 | 0.55 | 1.0 | 0.32 | 0.63 | 0.25 | 0.16 | 0.29 | 0.34 | 0.6 | 0.49 | 0.13 | 0.58 | 0.19 | 0.57 | 0.22 | 0.6 | 0.68 | 0.65 | 0.71 | 0.16 | 0.3 | 0.32 | 0.77 | 0.14 | 0.3 | 0.62 | 0.51 | 0.18 | 0.58 |
AAL22271 (sun) | 0.71 | 0.53 | 0.41 | 0.45 | 0.31 | 0.15 | 0.66 | 0.56 | 0.29 | 0.29 | 0.24 | 0.68 | 0.94 | 0.78 | 0.63 | 0.29 | 0.17 | 0.87 | 1.0 | 0.82 | 0.23 | 0.13 | 0.26 | 0.65 | 0.19 | 0.44 | 0.47 | 0.63 | 0.44 | 0.05 | 0.31 | 0.55 | 0.47 | 0.26 | 0.22 | 0.28 | 0.94 | 0.26 | 0.88 |
AAL22387 (glpD) | 0.18 | 1.0 | 0.33 | 0.32 | 0.0 | 0.27 | 0.54 | 0.1 | 0.57 | 0.01 | 0.41 | 0.21 | 0.67 | 0.02 | 0.92 | 0.09 | 0.36 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.16 | 0.68 | 0.02 | 0.38 | 0.24 | 0.61 | 0.02 | 0.28 | 0.01 | 0.07 | 0.74 | 0.31 | 0.02 | 0.0 | 0.55 | 0.23 | 0.19 | 0.15 | 0.29 |
AAL22436 (zntA) | 0.19 | 0.14 | 0.12 | 0.06 | 0.07 | 0.04 | 0.08 | 0.2 | 0.14 | 0.09 | 0.12 | 0.26 | 0.05 | 0.17 | 0.07 | 0.23 | 0.06 | 0.04 | 0.04 | 0.04 | 0.28 | 0.09 | 0.0 | 0.08 | 1.0 | 0.11 | 0.16 | 0.18 | 0.06 | 0.03 | 0.02 | 0.11 | 0.05 | 0.01 | 0.1 | 0.08 | 0.18 | 0.07 | 0.11 |
AAL22509 (cspA) | 1.0 | 0.1 | 0.03 | 0.14 | 0.15 | 0.02 | 0.18 | 0.25 | 0.06 | 0.0 | 0.09 | 0.19 | 0.04 | 0.29 | 0.07 | 0.41 | 0.36 | 0.06 | 0.18 | 0.1 | 0.05 | 0.0 | 0.86 | 0.4 | 0.18 | 0.15 | 0.29 | 0.26 | 0.27 | 0.13 | 0.06 | 0.18 | 0.36 | 0.42 | 0.46 | 0.19 | 0.34 | 0.05 | 0.15 |
AAL22559 (gpsA) | 0.55 | 0.5 | 0.3 | 0.55 | 0.7 | 0.26 | 0.32 | 0.47 | 0.37 | 0.62 | 0.28 | 1.0 | 0.42 | 0.6 | 0.61 | 0.16 | 0.29 | 0.3 | 0.3 | 0.35 | 0.26 | 0.34 | 0.16 | 0.43 | 0.17 | 0.52 | 0.55 | 0.45 | 0.41 | 0.14 | 0.15 | 0.56 | 0.4 | 0.11 | 0.39 | 0.55 | 0.37 | 0.5 | 0.97 |
AAL22570 (rfaF) | 0.41 | 0.54 | 0.28 | 0.47 | 0.38 | 0.18 | 0.4 | 0.56 | 0.35 | 0.55 | 0.32 | 1.0 | 0.45 | 0.7 | 0.53 | 0.13 | 0.32 | 0.39 | 0.43 | 0.46 | 0.14 | 0.3 | 0.13 | 0.34 | 0.11 | 0.53 | 0.32 | 0.58 | 0.74 | 0.07 | 0.32 | 0.52 | 0.64 | 0.11 | 0.36 | 0.32 | 0.32 | 0.32 | 0.77 |
AAL22571 (rfaC) | 0.41 | 0.48 | 0.37 | 0.4 | 0.46 | 0.18 | 0.41 | 0.5 | 0.27 | 0.41 | 0.31 | 1.0 | 0.43 | 0.62 | 0.8 | 0.17 | 0.24 | 0.43 | 0.48 | 0.47 | 0.13 | 0.25 | 0.19 | 0.44 | 0.1 | 0.41 | 0.37 | 0.49 | 0.46 | 0.07 | 0.24 | 0.59 | 0.41 | 0.13 | 0.3 | 0.33 | 0.6 | 0.4 | 0.97 |
AAL22694 (gyrB) | 0.66 | 0.51 | 0.33 | 0.6 | 0.48 | 0.3 | 0.55 | 0.78 | 0.43 | 0.43 | 0.31 | 0.85 | 0.62 | 1.0 | 0.63 | 0.25 | 0.41 | 0.54 | 0.6 | 0.61 | 0.17 | 0.34 | 0.33 | 0.52 | 0.16 | 0.69 | 0.68 | 0.62 | 0.78 | 0.12 | 0.39 | 0.57 | 0.76 | 0.26 | 0.72 | 0.45 | 0.59 | 0.47 | 0.7 |
AAL22763 (gppA) | 1.0 | 0.46 | 0.24 | 0.4 | 0.37 | 0.09 | 0.31 | 0.51 | 0.2 | 0.23 | 0.26 | 0.62 | 0.25 | 0.75 | 0.48 | 0.12 | 0.2 | 0.29 | 0.4 | 0.34 | 0.13 | 0.3 | 0.16 | 0.39 | 0.15 | 0.46 | 0.41 | 0.41 | 0.73 | 0.07 | 0.2 | 0.42 | 0.66 | 0.1 | 0.15 | 0.32 | 0.43 | 0.29 | 0.53 |
AAL22764 (rhlB) | 1.0 | 0.53 | 0.32 | 0.51 | 0.5 | 0.12 | 0.34 | 0.44 | 0.35 | 0.37 | 0.45 | 0.78 | 0.56 | 0.52 | 0.86 | 0.18 | 0.09 | 0.36 | 0.46 | 0.45 | 0.14 | 0.27 | 0.23 | 0.52 | 0.24 | 0.68 | 0.7 | 0.57 | 0.92 | 0.1 | 0.29 | 0.65 | 0.84 | 0.17 | 0.04 | 0.56 | 0.49 | 0.29 | 0.93 |
AAL22766 (rho) | 0.43 | 0.18 | 0.13 | 0.22 | 0.2 | 0.07 | 0.2 | 0.3 | 0.2 | 0.12 | 0.23 | 0.25 | 0.35 | 0.43 | 0.3 | 0.36 | 0.2 | 0.3 | 0.38 | 0.35 | 0.16 | 0.11 | 0.37 | 0.16 | 0.21 | 0.26 | 0.18 | 0.25 | 0.35 | 0.04 | 0.19 | 0.19 | 0.34 | 0.33 | 1.0 | 0.11 | 0.14 | 0.13 | 0.3 |
AAL22822 (yigC) | 0.9 | 0.55 | 0.39 | 0.49 | 0.33 | 0.19 | 0.51 | 0.58 | 0.37 | 0.56 | 0.43 | 0.39 | 0.45 | 1.0 | 0.49 | 0.22 | 0.4 | 0.53 | 0.6 | 0.64 | 0.19 | 0.42 | 0.21 | 0.52 | 0.22 | 0.7 | 0.6 | 0.67 | 0.58 | 0.14 | 0.34 | 0.42 | 0.64 | 0.21 | 0.52 | 0.66 | 0.53 | 0.35 | 0.51 |
AAL22835 (yihE) | 0.62 | 0.45 | 0.47 | 0.34 | 0.32 | 0.12 | 0.35 | 0.56 | 0.22 | 0.25 | 0.3 | 0.22 | 0.78 | 0.48 | 0.57 | 0.41 | 0.26 | 0.35 | 0.46 | 0.47 | 0.09 | 0.23 | 1.0 | 0.37 | 0.16 | 0.28 | 0.28 | 0.8 | 0.51 | 0.09 | 0.25 | 0.61 | 0.42 | 0.52 | 0.4 | 0.24 | 0.7 | 0.3 | 0.77 |
AAL22900 (cpxP) | 0.97 | 0.2 | 0.3 | 0.06 | 0.04 | 0.01 | 0.08 | 0.52 | 0.01 | 0.25 | 0.21 | 0.01 | 0.33 | 0.34 | 0.1 | 0.16 | 0.09 | 0.11 | 0.12 | 0.14 | 0.01 | 0.34 | 1.0 | 0.38 | 0.01 | 0.12 | 0.01 | 0.42 | 0.09 | 0.07 | 0.09 | 0.13 | 0.04 | 0.65 | 0.21 | 0.01 | 0.51 | 0.09 | 0.2 |
AAL23013 (yjbB) | 0.36 | 0.67 | 0.57 | 0.34 | 0.27 | 0.21 | 0.3 | 0.43 | 0.3 | 0.31 | 0.32 | 0.3 | 0.83 | 0.5 | 0.55 | 0.18 | 0.35 | 0.38 | 0.33 | 0.41 | 0.31 | 0.95 | 0.22 | 0.62 | 0.42 | 0.28 | 0.32 | 0.57 | 0.46 | 0.07 | 0.3 | 0.41 | 0.46 | 0.15 | 0.34 | 0.35 | 1.0 | 0.4 | 0.69 |
AAL23059 (plsB) | 0.5 | 0.53 | 0.33 | 0.42 | 0.4 | 0.16 | 0.42 | 0.54 | 0.46 | 0.64 | 0.39 | 1.0 | 0.39 | 0.76 | 0.63 | 0.17 | 0.41 | 0.4 | 0.43 | 0.46 | 0.1 | 0.51 | 0.29 | 0.45 | 0.09 | 0.58 | 0.49 | 0.48 | 0.48 | 0.15 | 0.24 | 0.48 | 0.44 | 0.17 | 0.51 | 0.48 | 0.49 | 0.4 | 0.71 |
AAL23186 (purA) | 0.34 | 0.63 | 0.24 | 0.59 | 0.29 | 0.45 | 0.6 | 0.7 | 0.56 | 0.5 | 0.7 | 1.0 | 0.28 | 0.79 | 0.36 | 0.25 | 0.17 | 0.48 | 0.59 | 0.62 | 0.1 | 0.72 | 0.32 | 0.6 | 0.11 | 0.85 | 0.85 | 0.46 | 0.97 | 0.08 | 0.45 | 0.31 | 0.96 | 0.24 | 0.14 | 0.83 | 0.43 | 0.23 | 0.33 |
AAL23187 (yjeB) | 1.0 | 0.25 | 0.27 | 0.14 | 0.16 | 0.04 | 0.11 | 0.31 | 0.25 | 0.13 | 0.48 | 0.11 | 0.29 | 0.4 | 0.18 | 0.29 | 0.09 | 0.09 | 0.09 | 0.11 | 0.06 | 0.1 | 0.27 | 0.16 | 0.1 | 0.14 | 0.15 | 0.23 | 0.2 | 0.06 | 0.13 | 0.22 | 0.24 | 0.33 | 0.37 | 0.16 | 0.2 | 0.2 | 0.23 |
AAL23189 (yjfH) | 1.0 | 0.42 | 0.34 | 0.42 | 0.34 | 0.28 | 0.13 | 0.38 | 0.42 | 0.32 | 0.39 | 0.45 | 0.54 | 0.61 | 0.17 | 0.2 | 0.13 | 0.09 | 0.12 | 0.13 | 0.19 | 0.27 | 0.13 | 0.37 | 0.21 | 0.73 | 0.59 | 0.43 | 0.8 | 0.06 | 0.17 | 0.36 | 0.74 | 0.12 | 0.59 | 0.42 | 0.34 | 0.32 | 0.51 |
AAL23209 (yjfY) | 0.16 | 0.16 | 0.32 | 0.08 | 0.09 | 0.07 | 0.22 | 0.32 | 0.12 | 0.11 | 0.2 | 0.07 | 0.4 | 0.23 | 0.02 | 0.32 | 0.07 | 0.06 | 0.05 | 0.07 | 1.0 | 0.26 | 0.14 | 0.15 | 0.75 | 0.07 | 0.07 | 0.16 | 0.06 | 0.1 | 0.27 | 0.17 | 0.07 | 0.31 | 0.08 | 0.07 | 0.3 | 0.19 | 0.24 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)