1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
ATCC_14028
SL1344
ATCC_14028,E-stationary,WT
14028s
ATCC_14028,Log,rpsL*_mut
14028s,mLPM
opgGH_mut
LT2
Florfenicol
NCTC_12023,37_C
Chlortetracycline
SL1344,NarS_defic
ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut
LT2,ridA
fliA_del
High-patho
LT2,Cell_susp_cult
14028s,hilC_del,pBAD24
14028s,sprB_del,pBAD24
14028s,pBAD24
gastro
hfq_mut
Low-patho,42C
plank_cells
ATCC_14028,gastro
Typh_14028s,Expo_phase
biofilm,cpxR_mut
14028s,typhoid
14028s,rtcR
Typh_14028s
infection
ATCC_14028,Log,WT
14028s,rtcB
High-patho,42C
LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C
plank_cells,cpxR_mut
biofilm
ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut
ATCC_14028,Log,rpsD*_mut
AAL19045 (STM0081)
 0.23 0.18 0.74 0.07 0.05 0.05 0.13 0.26 0.07 0.09 0.08 0.01 0.12 0.21 0.15 0.54 0.07 0.27 0.23 0.28 1.0 0.6 0.08 0.12 0.6 0.11 0.03 0.16 0.12 0.0 0.22 0.05 0.11 0.1 0.04 0.03 0.34 0.15 0.04
AAL19262 (STM0305)
 0.03 0.14 0.03 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03 0.05 0.01 0.08 0.0 0.02 0.05 0.0 0.13 0.04 0.02 0.01 0.02 0.33 1.0 0.01 0.12 0.06 0.03 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.26 0.01 0.0
AAL19263 (STM0306)
 0.07 0.18 0.56 0.06 0.03 1.0 0.09 0.11 0.05 0.1 0.08 0.01 0.07 0.1 0.06 0.76 0.1 0.07 0.08 0.09 0.99 0.72 0.1 0.09 0.43 0.13 0.03 0.05 0.04 0.03 0.06 0.03 0.03 0.12 0.06 0.07 0.23 0.04 0.02
AAL19276 (phoE)
 0.66 0.19 0.74 0.05 0.06 0.02 0.32 0.14 0.11 0.05 0.24 0.03 0.16 0.12 0.11 0.46 0.11 0.13 0.14 0.2 0.04 0.09 0.05 0.45 0.07 0.46 0.08 0.11 0.06 0.05 0.07 0.09 0.04 0.09 0.48 0.06 1.0 0.09 0.13
AAL19351 (phoB)
 0.16 0.22 1.0 0.11 0.06 0.17 0.38 0.29 0.24 0.14 0.3 0.07 0.15 0.31 0.21 0.13 0.24 0.36 0.33 0.4 0.15 0.51 0.06 0.14 0.17 0.56 0.17 0.19 0.11 0.08 0.19 0.09 0.1 0.07 0.24 0.12 0.26 0.16 0.13
AAL19352 (phoR)
 0.25 0.38 1.0 0.14 0.09 0.22 0.35 0.34 0.39 0.14 0.47 0.13 0.15 0.53 0.14 0.19 0.21 0.25 0.3 0.29 0.18 0.62 0.11 0.32 0.22 0.98 0.25 0.27 0.22 0.12 0.18 0.1 0.16 0.12 0.29 0.16 0.51 0.19 0.13
AAL19370 (ribD)
 0.12 0.33 0.16 0.14 0.1 0.26 0.11 0.32 0.23 0.31 0.28 0.14 0.15 0.45 0.21 0.19 0.1 0.2 0.22 0.22 0.47 1.0 0.06 0.1 0.3 0.27 0.14 0.13 0.18 0.04 0.09 0.12 0.17 0.07 0.09 0.15 0.12 0.13 0.13
AAL19579 (pagP)
 0.34 0.41 0.5 0.19 0.14 0.12 0.18 0.4 0.23 0.36 0.48 0.32 0.39 0.58 0.48 1.0 0.18 0.17 0.18 0.22 0.6 0.84 0.44 0.27 0.74 0.64 0.29 0.22 0.4 0.28 0.14 0.23 0.33 0.7 0.14 0.34 0.24 0.11 0.27
AAL19580 (cspE)
 0.15 0.08 0.08 0.11 0.15 0.16 0.12 0.12 0.04 0.19 0.04 0.1 0.08 0.08 0.11 0.84 0.65 0.05 0.09 0.09 0.11 0.12 1.0 0.69 0.1 0.19 0.2 0.18 0.24 0.52 0.16 0.12 0.28 0.88 0.62 0.22 0.12 0.06 0.13
AAL19647 (kdpD)
 0.28 0.77 0.57 0.24 0.21 0.26 0.24 0.8 0.44 0.41 0.54 0.25 0.59 1.0 0.22 1.0 0.17 0.27 0.29 0.32 0.48 0.64 0.09 0.53 0.42 0.41 0.23 0.36 0.41 0.1 0.32 0.27 0.31 0.18 0.19 0.19 0.85 0.33 0.37
AAL19648 (kdpC)
 0.16 0.5 0.26 0.16 0.12 0.11 0.09 0.53 0.2 0.15 0.26 0.09 0.28 0.5 0.09 0.95 0.09 0.1 0.08 0.12 0.22 0.16 0.04 0.68 0.25 0.23 0.21 0.12 0.3 0.02 0.13 0.13 0.25 0.03 0.11 0.18 1.0 0.13 0.28
AAL19649 (kdpB)
 0.09 0.34 0.08 0.11 0.03 0.04 0.03 0.26 0.09 0.05 0.13 0.03 0.08 0.15 0.03 1.0 0.03 0.03 0.04 0.05 0.06 0.08 0.03 0.45 0.08 0.05 0.13 0.06 0.27 0.01 0.04 0.05 0.26 0.02 0.06 0.1 0.61 0.04 0.08
AAL19650 (kdpA)
 0.05 0.19 0.03 0.08 0.01 0.01 0.02 0.17 0.03 0.01 0.06 0.01 0.04 0.04 0.01 1.0 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.35 0.05 0.02 0.03 0.02 0.24 0.0 0.02 0.02 0.28 0.01 0.03 0.03 0.59 0.01 0.03
AAL19795 (STM0859)
 0.1 0.16 0.09 0.03 0.03 0.08 0.17 0.26 0.03 0.03 0.07 0.01 0.05 0.09 0.06 1.0 0.05 0.14 0.15 0.16 0.55 0.2 0.17 0.01 0.21 0.05 0.02 0.06 0.04 0.03 0.1 0.02 0.04 0.16 0.04 0.01 0.01 0.03 0.03
AAL19866 (STM0930)
 0.25 0.35 0.31 0.21 0.12 0.2 0.55 0.54 0.18 0.3 0.17 0.13 0.22 0.26 0.38 0.58 0.33 0.41 0.43 0.49 1.0 0.5 0.37 0.24 0.78 0.2 0.21 0.3 0.2 0.03 0.46 0.19 0.18 0.46 0.24 0.21 0.34 0.15 0.17
AAL19906 (STM0972)
 0.02 0.15 0.04 0.01 0.01 0.41 0.05 0.44 0.02 0.06 0.04 0.01 0.01 0.01 0.1 0.1 0.04 0.03 0.02 0.05 1.0 0.59 0.07 0.07 0.56 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.41 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.24 0.01 0.01
AAL19978 (sodC)
 0.04 0.09 0.27 0.07 0.05 1.0 0.18 0.16 0.03 0.08 0.02 0.01 0.11 0.05 0.09 0.3 0.01 0.06 0.06 0.08 0.44 0.35 0.29 0.02 0.31 0.05 0.04 0.09 0.06 0.02 0.13 0.06 0.04 0.16 0.02 0.04 0.02 0.06 0.07
AAL20020 (pipB)
 0.03 0.21 0.06 0.01 0.0 0.17 0.01 0.32 0.02 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0 0.01 0.18 0.04 0.04 0.08 0.06 0.86 1.0 0.02 0.11 0.83 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.23 0.01 0.0 0.1 0.01 0.01 0.37 0.01 0.0
AAL20151 (potD)
 0.04 0.09 0.06 0.1 0.06 1.0 0.06 0.09 0.05 0.09 0.05 0.13 0.05 0.1 0.09 0.02 0.04 0.05 0.07 0.06 0.07 0.14 0.02 0.08 0.03 0.12 0.06 0.06 0.05 0.02 0.03 0.05 0.05 0.02 0.04 0.09 0.09 0.1 0.06
AAL20159 (phoQ)
 0.2 0.38 0.58 0.14 0.13 0.15 0.33 0.43 0.08 0.25 0.11 0.09 0.22 0.61 0.26 0.34 0.16 0.32 0.44 0.39 0.33 1.0 0.16 0.13 0.28 0.32 0.09 0.26 0.19 0.05 0.16 0.18 0.14 0.2 0.19 0.11 0.14 0.18 0.12
AAL20160 (phoP)
 0.19 0.45 0.86 0.27 0.13 0.79 0.22 0.38 0.21 0.7 0.19 0.11 0.21 0.39 0.26 0.51 0.18 0.28 0.36 0.31 0.6 1.0 0.19 0.12 0.6 0.66 0.21 0.34 0.34 0.06 0.32 0.16 0.25 0.24 0.11 0.32 0.12 0.28 0.1
AAL20173 (pagD)
 0.03 0.05 0.23 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.35 0.01 0.0 0.0 0.0 0.81 0.22 0.02 0.03 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
AAL20174 (pagC)
 0.05 0.07 0.28 0.02 0.0 1.0 0.01 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.31 0.12 0.01 0.01 0.01 0.93 0.19 0.04 0.02 0.99 0.05 0.0 0.01 0.02 0.01 0.11 0.01 0.01 0.07 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0
AAL20175 (STM1249)
 0.1 0.17 0.57 0.11 0.25 0.22 0.33 0.17 0.07 0.29 0.11 0.03 0.25 0.04 0.12 0.65 0.2 0.16 0.15 0.2 0.46 0.07 1.0 0.12 0.36 0.19 0.14 0.26 0.08 0.18 0.25 0.19 0.07 0.68 0.08 0.07 0.31 0.29 0.17
AAL20179 (STM1253)
 0.04 0.16 0.09 0.05 0.04 0.17 0.06 0.08 0.03 0.08 0.06 0.01 0.02 0.05 0.09 0.05 0.06 0.07 0.07 0.09 0.05 1.0 0.12 0.12 0.07 0.05 0.04 0.08 0.03 0.03 0.04 0.05 0.02 0.04 0.03 0.04 0.21 0.02 0.03
AAL20194 (STM1269)
 0.14 0.3 0.3 0.05 0.04 0.32 0.03 0.18 0.02 0.08 0.02 0.0 0.04 0.29 0.04 0.26 0.12 0.03 0.04 0.05 0.49 1.0 0.03 0.05 0.35 0.23 0.09 0.05 0.05 0.07 0.03 0.04 0.07 0.03 0.09 0.07 0.16 0.02 0.03
AAL20255 (STM1330)
 0.07 0.2 0.15 0.02 0.02 0.13 0.04 0.1 0.04 0.11 0.1 0.01 0.07 0.13 0.01 0.22 0.06 0.08 0.06 0.14 0.6 1.0 0.02 0.07 0.65 0.08 0.02 0.05 0.03 0.01 0.39 0.03 0.02 0.09 0.02 0.09 0.12 0.04 0.03
AAL20315 (ssrB)
 0.04 0.23 0.58 0.03 0.02 0.44 0.1 0.17 0.07 0.16 0.15 0.01 0.08 0.09 0.04 0.47 0.04 0.11 0.09 0.12 1.0 0.66 0.1 0.16 0.61 0.04 0.02 0.1 0.02 0.04 0.71 0.07 0.02 0.11 0.02 0.05 0.31 0.02 0.02
AAL20320 (ssaE)
 0.01 0.05 0.02 0.0 0.0 1.0 0.01 0.17 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02 0.02 0.56 0.21 0.02 0.08 0.14 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.01 0.0
AAL20348 (ribE)
 0.26 0.44 0.47 0.31 0.35 0.27 0.89 0.54 0.27 0.45 0.2 0.49 0.34 0.56 0.8 0.95 0.92 0.63 0.44 0.63 0.86 0.59 0.59 0.61 0.67 0.42 0.73 0.44 0.42 0.13 0.34 0.25 0.46 0.48 1.0 0.85 0.88 0.48 0.39
AAL20366 (slyA)
 0.22 0.3 0.2 0.18 0.17 0.22 0.36 0.45 0.09 0.29 0.1 0.09 0.15 0.18 0.67 0.44 0.86 0.32 0.6 0.34 0.67 1.0 0.2 0.13 0.61 0.12 0.15 0.21 0.11 0.14 0.29 0.17 0.1 0.26 0.35 0.17 0.14 0.18 0.14
AAL20374 (ydgR)
 0.5 0.47 0.38 0.34 0.63 0.17 0.46 0.61 0.47 0.39 0.49 0.6 0.37 0.6 0.42 0.72 0.35 0.71 0.78 0.81 0.56 1.0 0.46 0.41 0.53 0.57 0.48 0.42 0.32 0.13 0.46 0.37 0.35 0.5 0.49 0.31 0.44 0.55 0.41
AAL20382 (ydgK)
 0.27 0.22 0.13 0.09 0.18 0.09 0.16 0.2 0.14 0.12 0.2 0.14 0.29 0.24 0.17 0.31 0.07 0.16 0.13 0.21 0.11 1.0 0.26 0.13 0.13 0.15 0.11 0.21 0.14 0.02 0.09 0.21 0.17 0.26 0.08 0.08 0.19 0.12 0.28
AAL20404 (STM1485)
 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
AAL20459 (STM1540)
 0.01 0.06 0.06 0.02 0.01 1.0 0.11 0.03 0.03 0.04 0.03 0.01 0.03 0.02 0.04 0.05 0.04 0.02 0.02 0.03 0.06 0.09 0.02 0.04 0.13 0.02 0.01 0.05 0.01 0.01 0.06 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.08 0.02 0.01
AAL20467 (STM1548)
 0.02 0.06 0.08 0.01 0.0 0.32 0.1 0.07 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.23 0.01 0.02 0.01 0.02 1.0 0.23 0.02 0.04 0.92 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.14 0.01 0.0
AAL20501 (STM1583)
 0.07 0.22 0.5 0.11 0.08 0.08 0.6 0.21 0.05 0.17 0.05 0.01 0.1 0.03 0.23 0.75 0.24 0.23 0.18 0.24 0.54 1.0 0.42 0.13 0.46 0.1 0.02 0.14 0.03 0.04 0.3 0.1 0.02 0.43 0.15 0.02 0.16 0.11 0.07
AAL20515 (ydcW)
 0.09 0.26 0.69 0.07 0.12 0.68 0.08 0.23 0.05 0.1 0.05 0.03 0.81 0.26 0.09 0.18 0.1 0.18 0.16 0.19 0.8 1.0 0.03 0.12 0.5 0.16 0.04 0.12 0.07 0.01 0.09 0.1 0.05 0.11 0.13 0.05 0.14 0.21 0.2
AAL20516 (ydcR)
 0.05 0.16 0.23 0.04 0.04 0.32 0.04 0.13 0.03 0.07 0.04 0.03 0.07 0.26 0.03 0.12 0.03 0.05 0.05 0.05 0.44 1.0 0.03 0.06 0.23 0.1 0.03 0.06 0.05 0.01 0.05 0.03 0.04 0.03 0.04 0.06 0.08 0.07 0.03
AAL20517 (pdgL)
 0.03 0.16 0.23 0.03 0.02 0.35 0.07 0.07 0.02 0.09 0.02 0.01 0.06 0.08 0.04 0.17 0.02 0.05 0.06 0.07 0.36 1.0 0.04 0.07 0.26 0.09 0.01 0.05 0.02 0.0 0.06 0.02 0.01 0.04 0.02 0.02 0.15 0.03 0.02
AAL20518 (STM1600)
 0.02 0.17 0.16 0.01 0.01 0.1 0.07 0.06 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02 0.03 0.38 1.0 0.01 0.13 0.48 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.47 0.01 0.01
AAL20519 (ugtL)
 0.07 0.25 0.37 0.03 0.01 0.38 0.15 0.24 0.01 0.08 0.04 0.0 0.07 0.1 0.01 0.28 0.05 0.07 0.1 0.09 0.96 0.62 0.05 0.2 1.0 0.08 0.01 0.04 0.02 0.02 0.86 0.02 0.01 0.13 0.03 0.02 0.58 0.04 0.01
AAL20548 (STM1630)
 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.01 0.01 0.01 0.01 0.95 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AAL20551 (STM1633)
 0.03 0.1 0.02 0.02 0.01 1.0 0.08 0.09 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.07 0.01 0.04 0.11 0.01 0.01 0.02 0.41 0.28 0.02 0.25 0.31 0.03 0.14 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.13 0.03 0.55 0.01 0.01
AAL20589 (STM1672)
 0.1 0.28 1.0 0.07 0.02 0.06 0.24 0.32 0.04 0.16 0.05 0.01 0.09 0.39 0.07 0.72 0.03 0.24 0.22 0.27 0.17 0.33 0.29 0.1 0.32 0.17 0.01 0.13 0.17 0.07 0.26 0.07 0.13 0.27 0.02 0.03 0.2 0.06 0.02
AAL20597 (ycjI)
 0.12 0.27 0.23 0.07 0.08 0.11 0.08 0.25 0.09 0.1 0.13 0.05 0.21 0.35 0.09 0.16 0.07 0.13 0.13 0.15 0.9 1.0 0.04 0.1 0.49 0.15 0.08 0.1 0.13 0.02 0.1 0.12 0.12 0.05 0.05 0.09 0.15 0.11 0.13
AAL20617 (ycjE)
 0.11 0.15 0.28 0.04 0.3 0.53 0.03 0.25 0.12 0.1 0.22 0.03 0.88 0.21 0.01 0.1 0.03 0.02 0.04 0.05 0.76 1.0 0.07 0.57 0.31 0.06 0.18 0.29 0.06 0.03 0.21 0.29 0.07 0.14 0.01 0.19 0.94 0.3 0.67
AAL20643 (trpC)
 0.05 0.09 0.03 0.11 0.02 0.08 0.01 0.13 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.24 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.04 0.44 1.0 0.03 0.02 0.51 0.0 0.01 0.02 0.3 0.0 0.0 0.02 0.06 0.03 0.03
AAL20644 (trpB)
 0.04 0.12 0.05 0.14 0.03 0.21 0.01 0.14 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.28 0.02 0.04 0.01 0.02 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0 0.03 0.51 1.0 0.03 0.02 0.57 0.0 0.02 0.03 0.45 0.0 0.01 0.02 0.05 0.03 0.03
AAL20645 (trpA)
 0.02 0.1 0.05 0.15 0.02 0.22 0.01 0.1 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.19 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.03 0.17 1.0 0.03 0.02 0.49 0.0 0.02 0.02 0.46 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.02
AAL20744 (STM1829)
 0.07 0.23 0.15 0.05 0.16 0.05 0.09 0.26 0.08 0.07 0.08 0.02 0.21 0.16 0.18 0.42 0.06 0.2 0.2 0.24 0.19 1.0 0.42 0.7 0.16 0.04 0.05 0.11 0.05 0.03 0.14 0.2 0.05 0.23 0.17 0.05 0.43 0.11 0.27
AAL20752 (cspC)
 0.19 0.1 0.23 0.18 0.57 0.14 0.13 0.29 0.12 0.2 0.09 0.14 0.3 0.18 0.06 0.56 0.07 0.03 0.04 0.04 0.42 0.09 1.0 0.16 0.24 0.25 0.3 0.38 0.42 0.8 0.17 0.38 0.37 0.79 0.06 0.27 0.14 0.26 0.6
AAL20769 (STM1854)
 0.02 0.01 0.07 0.0 0.01 0.18 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.04 0.03 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
AAL20777 (pagO)
 0.08 0.23 0.2 0.03 0.01 0.24 0.04 0.17 0.03 0.02 0.1 0.0 0.06 0.24 0.03 0.83 0.05 0.04 0.04 0.05 1.0 0.8 0.1 0.18 0.85 0.13 0.03 0.04 0.05 0.02 0.04 0.02 0.05 0.22 0.02 0.05 0.48 0.02 0.01
AAL20778 (STM1863)
 0.06 0.15 0.04 0.0 0.0 0.16 0.01 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.07 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01
AAL20779 (STM1864)
 0.09 0.15 0.15 0.03 0.01 0.31 0.02 0.08 0.02 0.01 0.05 0.0 0.02 0.08 0.01 0.51 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.36 0.05 0.12 0.49 0.09 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.03 0.07 0.0 0.03 0.35 0.01 0.01
AAL20781 (pagK)
 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AAL20855 (STM1940)
 0.11 0.3 0.75 0.12 0.11 0.08 0.18 0.24 0.17 0.17 0.37 0.05 0.09 0.1 0.44 0.81 0.35 0.3 0.28 0.34 0.88 0.46 0.14 0.41 0.95 0.2 0.11 0.12 0.11 0.02 0.27 0.13 0.1 0.26 0.39 0.12 1.0 0.11 0.1
AAL21098 (yeiG)
 0.08 0.17 0.21 0.14 0.07 1.0 0.1 0.23 0.1 0.28 0.09 0.06 0.15 0.31 0.16 0.07 0.08 0.1 0.09 0.11 0.2 0.39 0.02 0.1 0.19 0.39 0.11 0.13 0.13 0.02 0.1 0.09 0.13 0.03 0.06 0.17 0.07 0.08 0.1
AAL21146 (STM2244)
 0.02 0.09 0.08 0.01 0.01 0.07 0.0 0.02 0.03 0.0 0.06 0.0 0.04 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.65 0.14 0.04 0.13 1.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.06 0.0 0.01 0.26 0.01 0.01
AAL21147 (STM2245)
 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.04 0.02 0.11 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0
AAL21188 (STM2287)
 0.01 0.1 0.03 0.01 0.0 0.37 0.02 0.34 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.15 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.88 0.61 0.02 0.11 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.22 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0
AAL21204 (STM2303)
 0.17 0.37 0.6 0.09 0.09 0.13 0.22 0.45 0.07 0.16 0.11 0.08 0.2 0.5 0.15 0.38 0.07 0.2 0.31 0.28 0.49 1.0 0.12 0.1 0.35 0.15 0.1 0.11 0.15 0.04 0.42 0.15 0.14 0.16 0.08 0.1 0.19 0.11 0.11
AAL21205 (pmrD)
 0.21 0.25 0.35 0.14 0.05 0.12 0.42 0.42 0.08 0.19 0.09 0.11 0.09 0.61 0.14 1.0 0.19 0.22 0.27 0.27 0.91 0.46 0.35 0.09 0.97 0.29 0.06 0.1 0.16 0.07 0.51 0.08 0.14 0.71 0.15 0.1 0.07 0.08 0.06
AAL21231 (lrhA)
 0.15 0.34 0.16 0.18 0.15 0.16 0.08 0.59 0.58 0.14 0.67 0.21 0.15 0.87 0.24 0.75 0.21 0.17 0.21 0.24 0.43 0.48 1.0 0.14 0.67 0.18 0.07 0.18 0.33 0.02 0.34 0.11 0.42 0.45 0.08 0.07 0.38 0.21 0.13
AAL21295 (pgtE)
 0.04 0.11 0.17 0.01 0.01 0.29 0.04 0.1 0.02 0.04 0.06 0.0 0.02 0.03 0.01 0.19 0.03 0.06 0.06 0.07 1.0 0.85 0.02 0.12 0.74 0.04 0.0 0.03 0.01 0.01 0.16 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.25 0.01 0.01
AAL21412 (yfgJ)
 0.52 0.4 0.32 0.32 0.27 1.0 0.17 0.36 0.13 0.16 0.16 0.32 0.34 0.37 0.07 0.26 0.04 0.07 0.08 0.07 0.84 0.4 0.22 0.26 0.59 0.3 0.52 0.22 0.27 0.06 0.04 0.17 0.31 0.12 0.03 0.24 0.43 0.23 0.23
AAL21479 (STM2585)
 0.01 0.04 0.13 0.01 0.0 0.3 0.06 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.82 0.08 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
AAL21480 (STM2585A)
 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.46 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.22 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
AAL21481 (STM2586)
 0.01 0.19 0.03 0.01 0.01 0.03 0.04 0.04 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.05 0.05 0.15 0.15 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
AAL21506 (STM2611)
 0.2 0.21 0.24 0.14 0.06 0.08 0.02 0.05 0.04 0.05 0.07 0.02 0.21 0.03 0.03 0.0 0.0 0.07 0.08 0.1 0.91 0.03 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.13 0.34 0.01 0.06 0.09 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1
AAL21551 (yfiH)
 0.53 0.53 0.69 0.35 0.3 0.2 0.6 0.73 0.36 0.26 0.48 0.29 0.67 0.95 0.59 0.65 0.6 0.68 0.55 0.65 1.0 0.91 0.22 0.34 0.54 0.55 0.41 0.39 0.52 0.07 0.34 0.36 0.44 0.4 0.69 0.34 0.42 0.45 0.44
AAL21552 (rluD)
 0.1 0.21 0.18 0.08 0.07 0.07 0.13 0.21 0.1 0.08 0.14 0.11 0.13 0.34 0.13 0.12 0.12 0.1 0.11 0.11 0.23 1.0 0.06 0.1 0.15 0.18 0.12 0.11 0.09 0.03 0.11 0.09 0.09 0.06 0.11 0.11 0.12 0.06 0.11
AAL21666 (virK)
 0.18 0.24 0.32 0.05 0.01 0.19 0.23 0.37 0.05 0.08 0.09 0.01 0.01 0.73 0.05 0.78 0.13 0.08 0.1 0.09 0.23 1.0 0.23 0.05 0.15 0.38 0.04 0.07 0.08 0.11 0.15 0.02 0.06 0.26 0.06 0.06 0.09 0.01 0.0
AAL21667 (mig-14)
 0.24 0.59 0.38 0.15 0.04 0.54 0.57 0.57 0.08 0.26 0.16 0.04 0.04 0.96 0.18 0.93 0.3 0.15 0.22 0.19 0.31 1.0 0.4 0.11 0.37 0.59 0.06 0.1 0.17 0.29 0.17 0.08 0.11 0.29 0.24 0.09 0.2 0.04 0.03
AAL21837 (ygcA)
 0.14 0.33 0.36 0.12 0.18 0.16 0.1 0.35 0.15 0.15 0.18 0.11 0.25 0.47 0.15 0.17 0.12 0.1 0.08 0.11 0.34 1.0 0.1 0.12 0.27 0.2 0.13 0.18 0.24 0.05 0.28 0.3 0.19 0.09 0.12 0.14 0.15 0.18 0.29
AAL21909 (STM3033)
 0.38 0.44 0.83 0.26 0.65 0.09 0.16 0.64 0.38 0.32 1.0 0.17 0.59 0.66 0.19 1.0 0.21 0.11 0.11 0.13 0.13 0.43 0.56 0.19 0.41 0.34 0.0 0.39 0.37 0.77 0.22 0.64 0.42 0.98 0.48 0.0 0.69 0.73 0.59
AAL21910 (STM3034)
 0.12 0.15 0.09 0.11 0.06 0.02 0.09 0.24 0.09 0.11 0.23 0.05 0.06 0.14 0.28 1.0 0.33 0.07 0.09 0.1 0.05 0.09 0.49 0.1 0.19 0.07 0.0 0.1 0.1 0.15 0.1 0.05 0.11 0.79 0.79 0.0 0.55 0.09 0.04
AAL21912 (STM3036)
 0.22 0.13 0.22 0.05 0.12 0.09 0.06 0.21 0.08 0.07 0.27 0.02 0.12 0.1 0.11 0.62 0.06 0.13 0.14 0.16 0.99 0.36 0.27 0.17 0.75 0.06 0.0 0.1 0.05 0.01 0.22 0.06 0.05 0.44 1.0 0.0 0.48 0.14 0.07
AAL21942 (yggB)
 0.15 0.33 0.38 0.32 0.16 0.33 0.36 0.19 0.24 0.32 0.3 0.3 0.3 0.27 0.18 0.31 0.12 0.32 0.29 0.32 0.18 0.25 0.1 0.41 0.28 1.0 0.37 0.51 0.26 0.11 0.22 0.2 0.3 0.24 0.1 0.31 0.55 0.38 0.19
AAL22274 (STM3411)
 0.1 0.55 0.12 0.05 0.03 0.01 0.69 0.15 0.03 0.11 0.08 0.03 0.14 0.03 0.32 0.87 0.34 0.57 0.42 0.7 0.05 1.0 0.47 0.17 0.05 0.06 0.04 0.1 0.04 0.05 0.01 0.06 0.04 0.43 0.64 0.03 0.31 0.06 0.09
AAL22417 (ugpB)
 0.26 0.16 1.0 0.06 0.03 0.14 0.1 0.11 0.05 0.1 0.06 0.01 0.42 0.02 0.13 0.45 0.1 0.15 0.12 0.17 0.04 0.11 0.02 0.12 0.09 0.3 0.03 0.09 0.02 0.01 0.05 0.04 0.01 0.25 0.12 0.02 0.21 0.09 0.05
AAL22455 (STM3595)
 0.06 0.18 0.17 0.03 0.01 0.61 0.07 0.15 0.05 0.06 0.07 0.02 0.06 0.23 0.03 0.29 0.04 0.03 0.02 0.03 0.77 1.0 0.04 0.03 0.41 0.1 0.05 0.05 0.04 0.02 0.06 0.03 0.03 0.03 0.03 0.08 0.03 0.03 0.03
AAL22619 (slsA)
 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.06 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0
AAL22620 (cigR)
 0.15 0.1 1.0 0.08 0.07 0.1 0.24 0.37 0.14 0.11 0.19 0.03 0.19 0.11 0.13 0.59 0.17 0.13 0.19 0.15 0.24 0.03 0.05 0.13 0.26 0.14 0.22 0.11 0.1 0.01 0.1 0.08 0.09 0.12 0.09 0.07 0.38 0.11 0.05
AAL22621 (mgtB)
 0.1 0.04 1.0 0.01 0.01 0.05 0.04 0.02 0.06 0.02 0.12 0.0 0.11 0.02 0.01 0.62 0.01 0.01 0.01 0.01 0.16 0.02 0.01 0.04 0.15 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.09 0.02 0.0
AAL22622 (mgtC)
 0.25 0.27 1.0 0.05 0.01 0.17 0.12 0.18 0.29 0.03 0.75 0.01 0.12 0.19 0.01 0.77 0.02 0.03 0.03 0.04 0.53 0.12 0.07 0.24 0.73 0.23 0.09 0.08 0.07 0.01 0.06 0.02 0.09 0.25 0.06 0.03 0.85 0.02 0.01
AAL22711 (phoU)
 0.18 0.11 0.98 0.12 0.08 0.17 0.13 0.15 0.15 0.07 0.15 0.04 0.07 0.2 0.11 0.18 0.1 0.09 0.08 0.09 0.03 0.12 0.02 0.09 0.03 1.0 0.12 0.24 0.12 0.05 0.04 0.09 0.08 0.01 0.09 0.08 0.14 0.23 0.1
AAL22712 (pstB)
 0.15 0.08 1.0 0.07 0.05 0.09 0.16 0.12 0.13 0.07 0.13 0.03 0.07 0.16 0.08 0.21 0.09 0.08 0.07 0.09 0.02 0.06 0.03 0.15 0.04 0.93 0.07 0.22 0.07 0.05 0.05 0.09 0.04 0.03 0.11 0.05 0.23 0.22 0.08
AAL22713 (pstA)
 0.12 0.09 1.0 0.05 0.02 0.06 0.06 0.08 0.14 0.03 0.13 0.02 0.07 0.14 0.02 0.09 0.03 0.05 0.05 0.05 0.03 0.07 0.01 0.13 0.06 0.95 0.1 0.15 0.07 0.04 0.03 0.05 0.03 0.01 0.04 0.04 0.28 0.19 0.05
AAL22714 (pstC)
 0.09 0.08 1.0 0.04 0.02 0.04 0.06 0.09 0.19 0.03 0.19 0.02 0.07 0.15 0.02 0.05 0.04 0.05 0.04 0.05 0.01 0.08 0.01 0.08 0.09 0.84 0.09 0.16 0.07 0.04 0.04 0.04 0.03 0.01 0.05 0.03 0.14 0.16 0.04
AAL22715 (pstS)
 0.11 0.03 0.86 0.04 0.01 0.09 0.05 0.04 0.13 0.02 0.18 0.01 0.03 0.03 0.01 0.08 0.02 0.04 0.04 0.04 0.01 0.03 0.01 0.04 0.11 1.0 0.11 0.18 0.09 0.03 0.02 0.01 0.06 0.01 0.02 0.02 0.08 0.06 0.02
AAL22841 (STM4002)
 0.01 0.01 0.08 0.01 0.04 0.01 0.0 0.04 0.02 0.04 0.02 0.02 0.22 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.01 0.0 0.04 0.02 0.12 0.02 0.04 1.0 0.04 0.01 0.25 0.0 0.03 0.01 0.07 0.12
AAL22865 (yihX)
 0.22 0.41 0.43 0.24 0.11 0.51 0.37 0.34 0.2 0.3 0.22 0.16 0.24 0.41 0.42 0.33 0.44 0.19 0.18 0.23 0.48 1.0 0.2 0.22 0.46 0.52 0.26 0.27 0.17 0.05 0.11 0.2 0.15 0.21 0.4 0.38 0.33 0.2 0.23
AAL22866 (rbn)
 0.16 0.37 0.42 0.11 0.12 0.31 0.12 0.27 0.13 0.19 0.16 0.12 0.28 0.37 0.18 0.36 0.12 0.08 0.06 0.09 0.26 1.0 0.22 0.3 0.2 0.33 0.19 0.23 0.17 0.03 0.09 0.2 0.12 0.29 0.19 0.21 0.65 0.2 0.2
AAL22904 (ushB)
 0.09 0.24 0.56 0.12 0.07 1.0 0.13 0.21 0.14 0.18 0.16 0.08 0.08 0.29 0.09 0.08 0.14 0.05 0.06 0.07 0.16 0.64 0.02 0.1 0.19 0.46 0.15 0.07 0.11 0.05 0.06 0.09 0.11 0.02 0.11 0.27 0.16 0.16 0.06
AAL23111 (phnO)
 0.28 0.24 0.28 0.08 0.04 0.11 0.29 0.3 0.04 0.04 0.07 0.02 0.23 0.31 0.13 0.87 0.15 0.23 0.21 0.26 0.66 1.0 0.18 0.21 0.47 0.07 0.06 0.09 0.06 0.02 0.09 0.08 0.05 0.26 0.19 0.08 0.42 0.07 0.1
AAL23143 (phoN)
 0.08 0.19 0.17 0.03 0.01 0.75 0.17 0.08 0.03 0.05 0.04 0.01 0.02 0.06 0.06 0.21 0.08 0.05 0.05 0.06 1.0 0.97 0.03 0.05 0.64 0.06 0.02 0.03 0.03 0.01 0.09 0.02 0.02 0.03 0.05 0.05 0.14 0.01 0.01
AAL23246 (srfJ)
 0.03 0.19 0.04 0.02 0.02 1.0 0.04 0.08 0.05 0.02 0.07 0.01 0.06 0.06 0.04 0.0 0.04 0.04 0.04 0.05 0.25 0.42 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.04
AAL23247 (STM4427)
 0.09 0.45 0.23 0.07 0.08 1.0 0.12 0.27 0.2 0.13 0.19 0.07 0.17 0.33 0.12 0.0 0.14 0.15 0.11 0.15 0.37 0.63 0.0 0.0 0.19 0.09 0.0 0.11 0.09 0.02 0.1 0.11 0.07 0.0 0.14 0.0 0.0 0.13 0.15
AAL23275 (mgtA)
 0.06 0.05 1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.1 0.01 0.14 0.13 0.23 0.03 0.01 0.06 0.01 0.02 0.02 0.04 0.06 0.01 0.01 0.07 0.11 0.1 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.11 0.22 0.01
AAL23276 (STM4457)
 0.21 0.26 1.0 0.12 0.14 0.03 0.18 0.17 0.16 0.13 0.2 0.17 0.32 0.1 0.72 0.33 0.16 0.25 0.29 0.36 0.1 0.16 0.21 0.2 0.14 0.17 0.19 0.13 0.07 0.07 0.05 0.23 0.07 0.16 0.23 0.18 0.33 0.43 0.23
AAL23322 (STM4504)
 0.02 0.1 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.36 0.01 0.01 0.01 0.02 0.35 1.0 0.05 0.09 0.32 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.26 0.0 0.02
AAL23528 (spvD)
 0.07 0.46 0.06 0.03 0.01 1.0 0.88 0.08 0.01 0.01 0.06 0.0 0.99 0.04 0.02 0.24 0.1 0.04 0.06 0.06 0.82 0.28 0.02 0.01 0.75 0.02 0.0 0.04 0.01 0.03 0.06 0.04 0.01 0.24 0.02 0.0 0.02 0.01 0.1
AAL23529 (spvC)
 0.02 0.16 0.05 0.02 0.01 0.72 0.35 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.05 0.06 0.05 0.5 0.15 0.0 0.0 0.4 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.04 0.02 0.01 0.14 0.01 0.0 0.01 0.01 0.06
AAL23530 (spvB)
 0.02 0.15 0.08 0.02 0.01 0.61 0.2 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.03 0.02 0.09 0.02 0.08 0.08 0.08 0.45 0.36 0.0 0.0 0.37 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.03 0.01 0.06 0.02 0.0 0.0 0.01 0.09
AAL23531 (spvA)
 0.01 0.05 0.09 0.01 0.01 0.74 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.04 0.01 0.02 0.03 0.03 0.39 0.15 0.0 0.0 0.4 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)