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Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
ATCC_14028
SL1344
ATCC_14028,E-stationary,WT
14028s
ATCC_14028,Log,rpsL*_mut
14028s,mLPM
opgGH_mut
LT2
Florfenicol
NCTC_12023,37_C
Chlortetracycline
SL1344,NarS_defic
ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut
LT2,ridA
fliA_del
High-patho
LT2,Cell_susp_cult
14028s,hilC_del,pBAD24
14028s,sprB_del,pBAD24
14028s,pBAD24
gastro
hfq_mut
Low-patho,42C
plank_cells
ATCC_14028,gastro
Typh_14028s,Expo_phase
biofilm,cpxR_mut
14028s,typhoid
14028s,rtcR
Typh_14028s
infection
ATCC_14028,Log,WT
14028s,rtcB
High-patho,42C
LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C
plank_cells,cpxR_mut
biofilm
ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut
ATCC_14028,Log,rpsD*_mut
AAL18971 (talB)
 -0.28 0.13 -0.32 0.31 0.33 0.34 -0.21 0.08 0.58 0.62 0.24 0.14 -0.23 -0.25 0.82 -0.87 0.82 -0.29 -0.08 -0.01 -2.04 -0.55 -0.67 -0.41 -0.93 -0.24 -0.81 0.23 0.11 -2.48 -0.5 0.74 -0.13 -1.82 0.86 -0.07 -0.82 -0.05 1.14
AAL18972 (mog)
 0.74 0.76 0.52 -0.27 0.82 -2.3 -1.23 -0.48 0.67 0.64 0.89 0.61 0.52 -0.66 0.06 -1.11 -0.79 -1.07 -1.11 -0.83 -2.31 -0.26 -1.01 0.17 -1.61 0.02 0.27 -0.09 -0.24 -2.03 -0.61 0.79 -0.47 -1.15 0.49 0.33 0.25 0.38 1.11
AAL19068 (araC)
 -1.61 0.63 1.37 -1.46 -0.91 -2.48 -1.41 -0.25 0.93 1.2 0.68 -1.0 0.83 0.03 -0.36 -0.45 0.38 0.88 0.74 1.22 -0.61 -0.17 -1.58 0.09 -0.13 -0.25 -1.05 -0.35 -2.27 -3.39 -0.8 0.12 -2.58 -0.83 -0.09 -0.66 0.69 0.64 0.1
AAL19069 (yabI)
 -0.45 0.55 -0.55 1.3 -1.3 -3.04 -0.53 -0.42 0.48 -0.66 0.93 -0.41 -0.29 0.01 0.29 -1.56 0.46 0.56 0.96 0.84 -0.69 0.88 -1.83 0.95 -0.45 -0.34 0.76 -0.67 -1.48 -2.58 -1.84 -0.92 -1.49 -1.82 0.29 0.56 1.4 -1.03 -0.51
AAL19082 (fruR)
 -0.33 0.13 -0.37 0.06 0.21 -1.82 -0.94 0.01 -0.04 0.89 0.14 0.67 -0.32 -0.77 1.29 -0.94 0.49 -0.03 0.15 0.3 -1.98 -0.76 -0.09 -0.06 -1.5 0.46 0.41 0.34 -0.23 -2.55 -0.27 0.37 -0.02 -0.65 0.45 0.23 0.07 -0.64 0.74
AAL19100 (secA)
 -0.14 0.05 -0.84 0.53 -0.29 -0.59 -0.45 0.27 -0.05 -0.42 -0.39 1.49 -0.63 0.66 2.14 -0.96 -0.08 -0.57 -0.13 -0.31 -2.48 -0.73 0.54 0.01 -2.85 0.26 0.03 -0.14 0.38 -2.19 -1.47 -0.34 0.18 -0.95 0.75 -0.24 -0.29 -0.45 -0.1
AAL19103 (yacF)
 0.11 0.28 -0.01 -0.24 -0.18 -1.26 0.24 0.22 -0.0 0.43 0.15 0.56 0.08 0.63 0.89 -0.49 -0.49 -0.23 -0.1 0.17 -1.97 -0.75 -0.49 0.5 -1.39 0.34 -0.39 0.4 -0.26 -2.4 -1.0 0.33 -0.52 -0.52 0.28 -0.15 0.86 0.18 0.64
AAL19104 (yacE)
 0.02 0.49 0.22 -0.41 -0.19 -1.45 -0.22 0.21 0.01 0.53 0.48 0.49 0.84 0.61 0.74 -1.06 -0.12 -0.39 -0.49 -0.14 -1.7 0.02 -1.34 -0.38 -0.56 0.1 -0.07 0.5 -0.19 -1.24 -1.14 0.8 -0.19 -1.45 0.21 0.12 -0.27 -0.4 1.15
AAL19272 (pepD)
 -0.19 0.18 -0.66 0.51 -0.14 0.35 1.37 -0.04 -0.16 0.63 -0.47 0.22 -0.35 -0.44 1.57 -0.97 -1.19 -0.34 -0.32 -0.14 -1.61 -0.49 -0.43 0.2 -1.93 -0.46 0.63 0.2 0.25 -3.09 -0.5 -0.06 0.08 -1.26 -0.98 0.82 0.15 -0.22 0.69
AAL19274 (yafA)
 -0.5 0.5 0.7 -0.21 -0.24 -0.71 -0.4 -0.02 0.29 0.47 0.34 0.23 1.0 -0.07 0.13 -0.74 -1.24 -0.23 0.11 -0.04 -0.47 -0.24 -1.11 0.37 -0.34 0.37 -0.25 0.53 0.15 -2.86 -0.47 0.18 -0.15 -1.06 -1.09 -0.0 0.74 0.36 0.64
AAL19367 (tsx)
 -2.09 -0.02 -1.07 1.06 0.35 -2.07 -1.73 -0.7 1.44 0.88 0.11 1.08 -1.85 -2.13 2.26 -1.89 1.82 -1.07 -1.26 -0.94 -5.35 -2.16 1.25 -0.6 -5.25 0.27 -1.54 -0.41 -1.98 -2.4 -1.0 0.79 -2.3 -1.25 1.44 0.37 -1.45 -0.36 -1.09
AAL19491 (cysS)
 -0.3 0.1 -0.45 0.31 -0.46 -1.84 0.16 0.24 -0.12 -0.35 0.3 0.97 0.09 0.33 1.15 -1.21 -0.68 0.37 0.5 0.56 -1.97 -0.96 -0.93 0.19 -0.15 0.27 0.39 0.03 0.59 -1.94 -0.8 0.02 0.52 -1.09 -0.65 0.0 0.34 -0.61 0.56
AAL19584 (lipA)
 0.62 0.37 -0.86 0.19 -0.51 -1.6 0.54 -0.48 0.11 -0.05 0.32 0.21 0.37 -0.34 0.65 -1.73 -0.29 0.04 0.31 0.26 -2.34 -0.47 -2.14 0.18 -0.84 0.47 0.61 0.67 0.36 -1.6 -0.11 0.12 0.62 -1.63 0.46 0.36 0.1 -0.53 0.4
AAL19611 (STM0660)
 -1.36 0.19 0.46 0.66 0.46 -1.58 -2.01 0.2 0.48 0.55 0.07 -0.23 0.34 -0.9 1.8 -1.28 0.34 0.3 0.36 0.56 -1.93 -0.57 -1.42 -0.69 -2.07 -0.06 -2.24 -0.0 -1.5 -3.94 -0.38 1.19 -1.95 -1.35 1.54 -1.36 -0.76 0.29 1.09
AAL19612 (ybeK)
 -1.2 0.14 0.78 0.31 0.6 -1.16 -3.34 0.03 1.0 1.08 0.49 0.53 0.58 -0.87 0.91 -2.12 -0.21 -0.38 -0.39 -0.27 -1.93 -1.37 -1.61 -0.05 -2.14 0.58 -1.73 0.03 -1.1 -4.46 0.41 1.42 -1.36 -2.81 0.67 -0.64 0.07 0.73 1.07
AAL19641 (seqA)
 -0.06 0.05 -0.35 -0.21 0.27 -1.44 0.55 0.03 -0.04 0.44 0.03 0.72 0.53 0.01 0.84 -0.68 -0.6 -0.36 -0.03 0.14 -1.84 -0.88 0.05 -0.02 -1.15 0.37 -0.05 0.43 -0.32 -1.0 -0.59 0.51 -0.09 -0.5 -0.12 -0.09 -0.4 -0.45 1.39
AAL19642 (pgm)
 -0.19 0.1 -0.04 0.33 0.42 -0.19 -0.06 -0.04 0.17 0.53 -0.18 0.79 0.04 0.12 1.06 -1.39 -0.13 -0.24 -0.01 -0.07 -1.2 -0.57 -1.26 -0.05 -0.92 0.74 0.18 0.09 0.17 -2.56 -0.65 0.02 0.12 -1.64 -0.3 0.04 -0.03 0.48 0.82
AAL19827 (ybjP)
 -0.8 0.24 1.38 -0.34 0.16 -0.12 -0.07 0.39 0.04 0.48 -0.01 -0.27 1.28 0.3 0.55 -0.87 -0.08 -0.03 0.04 0.29 -0.87 -1.24 -2.08 -0.99 -0.33 0.76 -0.96 0.26 -0.66 -3.93 0.33 0.59 -0.81 -1.31 -0.24 -0.9 -0.91 0.58 0.79
AAL19898 (serS)
 -0.42 -0.19 -1.25 0.56 -0.03 -0.52 0.14 0.04 -0.3 -0.03 -0.36 0.83 -0.24 -0.09 1.42 -0.53 -0.5 0.29 0.43 0.43 -1.77 -1.13 -0.08 -0.0 -1.0 0.05 -0.03 0.69 0.51 -2.93 -0.52 0.13 0.38 -0.41 0.09 -0.28 -0.06 -0.27 0.75
AAL20090 (solA)
 -0.5 0.2 0.26 0.3 -0.32 -1.59 -0.22 0.28 -0.15 -0.06 -0.05 -0.04 -0.17 0.42 1.35 -1.76 0.33 0.54 0.55 0.7 -2.5 -0.37 -2.31 -0.13 -0.54 0.7 0.01 0.29 0.65 -3.32 -0.86 0.05 0.5 -2.21 0.53 0.03 0.13 -0.64 0.19
AAL20217 (yeaC)
 -0.89 0.09 0.84 -0.23 0.77 0.22 -0.87 -0.38 -0.4 1.62 -0.97 -1.77 0.75 0.12 -1.08 -0.6 0.26 -0.13 -0.08 0.19 -1.24 -0.45 -0.77 -0.75 -0.41 0.81 -2.45 -0.3 -1.28 -0.68 1.2 0.39 -1.68 -0.34 -0.12 -1.03 -1.37 1.66 0.35
AAL20222 (selD)
 -0.48 0.17 -0.07 0.11 0.08 -0.98 0.12 0.04 0.09 0.52 -0.1 0.41 -0.04 0.21 0.6 -1.99 0.48 0.19 0.89 0.28 -1.36 -0.92 -2.07 0.55 -1.02 0.06 0.23 0.21 -0.36 -3.38 -0.33 0.05 -0.37 -2.05 0.17 0.76 0.52 0.2 0.65
AAL20223 (topB)
 -0.13 0.36 -0.25 -0.02 0.17 -1.48 0.28 0.41 -0.1 0.12 -0.08 0.46 0.07 0.84 0.8 -1.53 0.1 0.15 0.81 0.4 -1.44 -0.25 -1.78 0.48 -1.58 -0.11 -0.14 0.33 -0.25 -2.26 -0.61 0.01 -0.36 -1.75 0.06 0.3 0.51 0.14 0.6
AAL20227 (xthA)
 -0.92 0.21 0.33 -0.26 -0.11 -1.35 0.16 0.01 -0.24 0.29 -0.33 -0.65 1.18 0.19 0.04 -1.28 -0.66 0.18 0.78 0.46 -2.0 -0.49 -1.26 0.27 -0.44 -0.13 -0.26 0.12 -0.14 -3.04 -1.04 1.01 -0.07 -1.14 -0.41 0.05 0.26 0.1 1.77
AAL20361 (ydhF)
 -0.18 0.12 -0.35 -0.39 0.7 -1.89 -0.95 0.02 -0.04 -0.02 -0.11 0.03 0.49 -0.56 0.96 -1.19 -1.0 -0.35 -0.6 -0.21 -1.32 -1.36 -0.18 1.05 -0.67 -0.27 0.87 -0.19 -0.3 -2.48 -0.74 0.45 -0.26 -0.65 -1.07 0.99 1.02 -0.47 1.73
AAL20687 (kdsA)
 -0.5 -0.17 0.25 0.32 0.9 0.49 0.03 -0.01 0.11 0.76 -0.33 0.24 -0.26 -0.05 0.74 -0.96 -0.56 -0.21 -0.14 -0.08 -1.39 -0.65 -0.36 -0.14 -1.65 0.5 -0.08 -0.65 0.32 -1.93 -1.11 0.6 0.36 -1.49 0.76 -0.02 -0.14 0.29 0.67
AAL20729 (minC)
 -0.12 0.14 -0.67 -0.2 -0.51 -1.91 0.11 0.13 0.04 0.87 0.36 -0.24 -0.39 0.61 0.56 -0.61 0.88 0.12 0.96 0.6 -2.27 -0.45 -0.7 -0.14 -1.56 0.21 -0.12 0.38 -0.19 -1.25 -0.76 -0.24 0.09 -0.4 1.06 0.0 0.13 -0.48 -0.15
AAL21087 (cdd)
 -2.24 -0.22 0.36 1.32 -1.65 -1.45 -1.65 -0.33 -0.66 -1.51 -0.25 0.48 1.03 -1.47 -0.21 -3.31 -0.96 -2.69 -2.65 -2.46 -2.11 -1.47 -2.98 0.19 -2.25 3.06 -0.95 -1.46 1.86 -4.96 -1.61 0.69 1.81 -4.18 -1.83 0.27 -0.83 -0.08 0.36
AAL21117 (spr)
 0.75 0.01 -1.79 -0.08 -0.77 -2.92 -0.67 0.32 -0.04 1.23 0.13 0.03 -0.31 1.05 0.81 -0.15 0.04 0.28 -0.04 0.72 -2.99 0.02 0.02 -0.42 -1.87 0.24 0.13 0.34 -0.28 0.13 -0.64 -0.53 0.23 0.35 0.22 -0.13 -0.42 -1.36 0.02
AAL21130 (yejL)
 -0.07 -0.26 -0.08 -0.68 -0.01 -2.29 1.04 0.23 -0.77 -0.49 -0.04 0.01 1.04 0.26 0.3 -0.31 0.55 -0.09 0.28 0.68 -2.01 -0.33 -0.01 -0.46 -1.43 -0.56 -0.11 0.0 -1.06 -0.59 0.26 0.35 -0.48 0.11 0.92 -0.21 -0.38 -0.19 0.91
AAL21246 (STM2345)
 -0.52 0.58 -0.36 0.02 -0.08 -1.81 -0.76 0.43 0.27 0.4 0.8 -0.18 0.09 0.3 0.9 -0.72 -0.43 0.15 0.21 0.46 -1.49 0.51 -0.54 0.12 -0.81 -0.94 -0.61 0.03 0.06 -3.28 0.07 0.55 0.09 -0.56 0.4 -0.28 0.43 -0.55 0.72
AAL21303 (glk)
 -0.65 0.79 -0.13 -0.15 -0.15 -0.82 -0.46 0.38 0.3 0.55 0.14 0.91 0.22 0.63 0.57 -0.75 -0.37 -0.02 0.28 0.27 -0.59 0.12 -0.95 0.07 -0.45 0.71 -0.39 0.3 -0.53 -1.95 -0.25 -0.12 -0.72 -0.95 -0.13 0.05 0.23 -0.4 0.36
AAL21309 (nupC)
 -1.6 -0.01 -1.04 0.62 -0.86 -0.28 -0.74 -0.85 0.76 -0.32 0.24 1.5 0.29 -0.6 0.05 -0.77 1.32 -0.75 -1.01 -0.82 -1.46 -0.65 -0.08 0.24 -1.66 1.86 0.13 -0.22 -0.29 -1.73 -1.33 -0.21 -0.64 -0.64 1.25 0.4 0.36 -0.7 -0.57
AAL21376 (yffB)
 -0.6 0.24 -0.05 0.06 -0.06 -1.4 0.58 -0.72 0.47 0.57 0.81 0.22 0.4 -2.0 1.06 -1.27 -0.39 0.25 0.44 0.68 -2.24 -0.82 -1.87 0.38 -0.36 0.73 0.35 0.48 -1.47 -3.17 -0.58 0.43 -1.46 -1.68 -0.78 0.87 0.69 -0.11 0.44
AAL21383 (dapA)
 -0.39 -0.13 -0.92 0.38 -0.5 -1.0 0.65 0.64 0.15 -0.15 0.33 0.46 -0.42 0.7 1.71 -1.73 0.09 0.55 0.62 0.76 -1.42 -0.18 -1.34 -0.43 -0.64 0.02 -0.01 0.08 -0.0 -1.87 -0.29 -0.37 -0.03 -2.0 0.27 -0.38 -0.19 -1.12 0.37
AAL21384 (gcvR)
 -0.31 0.62 0.34 -0.13 -0.46 -1.33 -0.04 0.78 -0.19 0.54 -0.06 -0.19 -0.16 1.17 0.95 -0.76 -0.63 -0.33 -0.36 0.15 -1.56 0.0 -0.91 0.07 -0.17 0.41 -0.21 0.44 0.41 -2.21 -0.54 0.44 0.14 -0.98 -0.77 0.12 0.17 -0.46 0.48
AAL21395 (ppk)
 -0.34 0.38 0.78 0.01 -0.62 -1.24 0.62 0.42 -0.36 0.07 -0.32 -0.31 0.33 0.9 0.64 -0.11 -0.31 0.12 0.28 0.33 -1.21 -0.46 -0.57 -0.02 -0.96 0.75 -0.36 0.43 0.04 -2.05 -0.76 -0.17 0.01 0.06 -0.08 -0.66 0.6 -0.23 -0.08
AAL21427 (sseA)
 -0.86 0.5 0.99 -0.48 0.75 -0.81 -2.7 -0.41 0.53 0.92 0.31 -0.74 1.71 -0.66 -0.15 -1.9 -0.86 -1.07 -0.89 -0.75 -0.2 -0.55 -2.67 -0.81 -0.26 -0.05 -0.9 -0.19 -0.62 -3.65 -0.53 1.24 -1.15 -2.26 -0.93 -0.75 -0.56 1.1 2.29
AAL21541 (ung)
 0.19 0.49 0.01 0.07 -0.7 -1.56 0.02 0.28 0.44 0.06 0.66 -0.13 0.33 0.52 1.37 -1.4 -0.4 0.4 0.45 0.6 -1.52 0.09 -2.01 0.11 -0.71 0.18 -0.32 0.18 0.06 -2.98 -0.3 0.06 -0.18 -1.87 -0.47 0.16 0.33 -0.43 0.37
AAL21718 (gutQ)
 -1.0 0.61 0.61 -0.2 -0.31 -1.4 -1.72 -0.13 0.57 0.53 0.56 1.24 0.18 0.32 0.45 -1.15 -1.09 -1.11 -1.2 -0.91 -0.46 0.01 -1.6 0.9 -0.48 -0.1 0.3 0.31 0.21 -3.43 -1.03 0.41 -0.29 -1.64 -1.26 1.13 0.4 -0.06 1.11
AAL21847 (yqcD)
 -0.51 0.22 0.17 -0.13 -0.27 -1.46 0.15 0.42 -0.07 -0.13 0.24 0.89 0.3 0.81 1.06 -0.61 0.17 -0.09 -0.28 0.02 -0.8 -0.11 -0.79 0.19 -0.78 0.17 -0.64 -0.08 -0.18 -1.84 -1.13 0.21 -0.52 -0.91 0.7 -0.21 0.78 -0.48 0.58
AAL21848 (ygdH)
 -0.8 0.34 -0.13 0.78 0.55 -0.51 -1.17 0.18 0.13 0.05 -0.05 0.07 -0.06 -0.2 1.67 -1.09 0.48 -0.93 -0.74 -0.66 -1.12 -0.37 -0.8 -0.67 -0.72 -0.05 -0.54 -0.06 0.4 -2.85 -0.83 1.05 0.14 -1.24 0.55 -0.39 -0.23 -0.17 1.47
AAL21877 (thyA)
 0.03 0.12 -0.88 0.67 -0.32 -0.24 0.03 0.81 -0.73 -0.3 -0.8 1.0 -0.51 1.39 0.68 -0.82 -0.15 -0.74 -0.37 -0.4 -1.49 -0.51 -0.56 0.07 -1.89 0.76 0.72 0.38 0.26 -1.75 -1.18 0.03 0.26 -1.05 0.31 0.26 -0.08 -0.72 0.59
AAL21887 (galR)
 -0.34 0.25 0.34 -0.09 -0.29 -1.71 -1.09 0.34 0.79 0.25 0.96 -0.44 0.38 0.38 1.29 -1.08 -0.22 0.34 0.47 0.79 -1.29 -0.46 -1.52 0.08 -0.76 -0.02 -0.71 -0.04 -0.62 -2.36 -0.13 0.57 -0.81 -1.32 -0.06 -0.3 0.52 -0.0 0.57
AAL21918 (dsbC)
 -0.34 0.09 0.1 0.01 -0.35 -1.28 0.55 0.37 0.38 0.08 0.64 -0.26 -0.04 0.95 1.53 -0.45 -0.12 0.01 -0.01 0.17 -1.72 -0.59 -0.05 -0.17 -0.9 0.13 -0.06 0.02 -0.25 -3.0 -0.64 -0.17 -0.3 -0.51 0.12 -0.2 0.21 0.02 0.26
AAL22053 (mdaB)
 0.09 0.28 0.01 -0.34 -0.85 -1.08 0.71 0.45 0.07 -0.26 0.25 0.28 -0.52 0.86 0.92 -0.09 -0.26 -0.26 -0.29 -0.05 -1.06 -0.3 -0.34 0.98 -0.75 -0.03 0.03 0.0 -0.9 -2.64 -1.43 -0.36 -1.0 -0.68 0.31 0.51 1.51 -0.8 0.14
AAL22070 (yqiC)
 -0.16 0.0 0.66 -0.08 0.1 -1.42 0.84 0.48 -0.38 -0.01 -0.36 -0.64 0.9 -0.45 1.11 -0.43 -0.24 -0.23 -0.38 0.01 -0.67 -0.45 -0.85 -0.02 -0.09 -0.24 0.02 -0.13 -0.09 -1.62 -0.48 0.44 -0.42 -0.78 0.04 0.02 0.4 0.26 0.96
AAL22211 (sspA)
 0.46 -0.04 -1.15 0.16 -0.51 -1.64 1.01 0.06 -0.0 0.18 0.36 0.37 0.14 0.05 -0.19 -0.41 -0.42 0.19 0.58 0.54 -2.76 -0.52 0.1 -0.16 -1.5 0.06 -0.04 0.63 0.46 -1.01 -0.29 0.07 0.51 -0.03 -0.32 -0.11 0.27 -1.33 0.58
AAL22262 (yrdA)
 -0.29 0.13 0.1 -0.42 -0.17 -0.14 0.2 0.75 -0.52 -0.09 -0.14 -0.93 0.24 1.15 0.4 0.0 0.1 -0.46 -0.11 0.05 -0.32 -0.4 0.25 0.06 -0.2 0.39 -1.14 -0.01 -0.45 -1.85 -0.92 0.22 -0.65 0.24 0.42 -1.02 1.05 -0.12 0.43
AAL22472 (kdgK)
 -0.84 0.56 0.2 0.09 -0.79 -1.81 -0.83 -0.38 0.54 0.96 0.16 0.25 -0.78 -1.13 1.92 -2.27 0.55 0.35 0.0 0.4 -1.27 0.71 -2.64 0.37 -1.37 -0.74 -0.39 0.57 -1.47 -2.5 -0.75 0.1 -1.56 -2.4 1.05 0.64 1.08 -0.98 0.02
AAL22683 (torR)
 -1.0 0.95 1.03 -0.38 -0.73 -1.67 -0.75 0.32 0.79 1.55 0.97 -0.33 0.31 0.12 0.96 -1.49 0.44 0.12 -0.12 0.4 -1.36 0.77 -2.54 -0.03 -1.43 -0.09 -1.37 -0.29 -1.12 -2.77 -0.27 0.34 -1.49 -2.24 0.28 -0.49 0.08 0.69 -0.64
AAL22719 (glmS)
 0.36 0.17 -0.32 0.27 0.14 -0.99 -0.47 0.19 0.18 0.52 -0.18 1.45 -0.12 0.71 0.22 -1.2 -0.78 -0.58 -0.54 -0.26 -2.77 -0.92 -1.06 0.06 -1.93 -0.06 0.52 0.78 0.66 -1.47 -1.14 0.38 0.5 -1.15 -1.51 0.56 -0.0 0.97 0.15
AAL22720 (glmU)
 -0.0 0.28 -1.05 0.24 -0.69 -1.61 0.32 0.03 -0.04 0.41 0.19 1.3 -0.66 0.51 1.58 -1.74 0.1 0.45 0.29 0.61 -2.79 -0.32 -0.96 -0.15 -1.67 0.52 0.38 0.2 0.15 -1.44 -1.18 -0.24 -0.05 -1.23 -0.24 0.51 -0.21 -0.9 0.13
AAL22812 (udp)
 -1.95 -0.72 0.86 1.14 -1.13 -0.99 -2.28 -1.81 0.15 -0.22 -0.19 -0.1 1.24 -3.26 -0.06 -2.71 -0.68 -3.36 -3.45 -2.98 -2.57 -2.13 -2.25 0.85 -2.47 2.72 -0.79 -0.78 1.62 -3.4 -1.38 0.68 1.45 -3.25 -2.1 1.48 -0.79 -0.17 0.63
AAL22829 (yigZ)
 0.36 0.86 -0.09 0.11 -0.21 -1.23 0.19 0.51 -0.36 -0.3 0.14 0.25 0.04 0.69 1.26 -1.51 -0.55 -0.27 0.05 0.01 -1.75 0.93 -0.99 0.19 -2.0 -0.23 0.04 -0.0 0.19 -2.0 -1.18 0.3 -0.1 -1.5 -0.44 -0.15 0.89 -0.42 0.7
AAL22843 (hemN)
 -0.4 0.2 0.11 -0.19 0.23 -2.08 -0.05 -0.29 -0.19 0.71 0.21 0.3 0.47 0.01 0.9 -0.59 -0.76 -0.08 0.04 0.13 -1.64 0.26 -0.29 0.26 -1.44 -0.37 0.5 -0.02 0.02 -2.57 -1.0 0.32 -0.33 -0.37 -0.2 0.39 0.77 0.48 0.67
AAL22864 (yihW)
 -0.48 0.55 1.22 -0.0 0.46 -1.65 -0.62 0.14 0.22 0.31 0.09 -0.22 0.53 -0.33 0.84 -0.67 -0.24 -0.53 -0.52 -0.12 -0.55 0.01 -0.65 0.33 -0.52 -0.08 -0.54 -0.06 -0.88 -2.73 -0.7 0.6 -0.94 -0.75 -0.09 -0.09 1.25 0.52 0.49
AAL22934 (cytR)
 -0.31 0.28 0.02 0.12 -0.32 -1.85 -1.15 -0.15 0.53 0.28 0.59 0.58 0.42 -0.53 1.37 -1.05 0.75 -0.7 -0.48 -0.35 -2.01 -0.41 -0.6 0.28 -1.62 0.77 -0.47 0.1 -0.78 -3.47 -0.7 0.77 -0.73 -1.14 0.74 -0.0 0.48 0.35 0.87
AAL22963 (oxyR)
 -0.08 0.04 0.13 0.69 0.1 0.52 -0.9 0.21 0.07 0.62 0.46 0.14 -0.1 0.45 1.26 -1.7 -0.42 -0.15 0.03 0.34 -2.03 -0.68 -1.57 -0.3 -1.16 0.27 -0.36 0.14 0.73 -3.41 -1.04 0.31 0.6 -2.1 -0.47 0.27 -0.42 0.58 0.2
AAL23236 (mpl)
 -0.31 0.31 -0.97 0.1 -0.68 -1.55 0.04 0.37 0.23 0.17 -0.52 1.33 -0.37 0.73 1.01 -2.3 -0.15 -0.11 0.37 0.14 -1.45 -0.59 -1.97 0.66 -0.7 0.1 0.88 -0.31 0.01 -2.07 -0.86 -0.31 0.17 -2.7 -0.19 0.79 0.99 -0.49 0.42
AAL23367 (STM4549)
 -0.58 0.33 -0.14 -0.71 -1.46 -0.9 1.5 0.45 -0.65 0.17 -0.08 -0.43 -0.13 1.02 1.29 -0.89 1.11 -0.32 -0.4 0.09 -0.27 0.3 -1.59 -0.36 -0.2 0.47 -0.13 -0.68 -0.98 -2.64 -1.19 -0.88 -1.02 -1.75 1.41 0.15 0.59 -1.03 0.19
AAL23382 (deoC)
 -1.24 -0.43 0.73 1.3 -0.76 0.16 -0.44 -0.8 0.18 -0.57 0.36 0.63 0.63 -1.98 0.8 -0.5 1.2 -1.58 -1.62 -1.46 0.28 -0.79 -1.32 0.69 -0.35 0.19 -0.87 -0.25 0.59 -3.59 -1.22 0.88 0.26 -1.14 -0.65 0.62 -0.09 0.32 0.56
AAL23383 (deoA)
 -0.7 -0.05 0.8 1.05 -0.38 0.22 -1.69 -0.98 0.26 -0.5 0.42 0.63 1.22 -1.11 0.34 -0.65 -0.8 -1.34 -1.54 -1.32 -0.38 -0.34 -1.33 0.41 -0.86 0.46 -0.99 0.41 0.59 -4.01 -0.81 1.55 -0.06 -1.36 -2.31 -0.01 -0.25 -0.02 1.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.