1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
ATCC_14028
SL1344
ATCC_14028,E-stationary,WT
14028s
ATCC_14028,Log,rpsL*_mut
14028s,mLPM
opgGH_mut
LT2
Florfenicol
NCTC_12023,37_C
Chlortetracycline
SL1344,NarS_defic
ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut
LT2,ridA
fliA_del
High-patho
LT2,Cell_susp_cult
14028s,hilC_del,pBAD24
14028s,sprB_del,pBAD24
14028s,pBAD24
gastro
hfq_mut
Low-patho,42C
plank_cells
ATCC_14028,gastro
Typh_14028s,Expo_phase
biofilm,cpxR_mut
14028s,typhoid
14028s,rtcR
Typh_14028s
infection
ATCC_14028,Log,WT
14028s,rtcB
High-patho,42C
LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C
plank_cells,cpxR_mut
biofilm
ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut
ATCC_14028,Log,rpsD*_mut
AAL19007 (rpsT)
 0.11 0.07 0.01 0.08 0.04 0.03 0.15 0.06 0.08 0.05 0.09 0.16 0.04 0.08 0.08 0.05 0.16 0.04 0.05 0.05 0.01 0.06 0.07 0.1 0.02 0.14 0.13 0.05 0.09 1.0 0.02 0.03 0.11 0.05 0.15 0.12 0.09 0.02 0.06
AAL19125 (kdgT)
 0.01 0.11 0.02 0.08 0.01 0.01 0.0 0.02 0.25 0.05 0.3 0.01 0.04 0.01 1.0 0.02 0.08 0.03 0.02 0.03 0.0 0.01 0.09 0.09 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.36 0.01 0.16 0.01 0.04
AAL19126 (STM0162)
 0.01 0.08 0.03 0.06 0.01 0.01 0.0 0.02 0.18 0.06 0.22 0.01 0.04 0.01 1.0 0.01 0.04 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.08 0.06 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.25 0.01 0.09 0.03 0.04
AAL19127 (STM0163)
 0.01 0.04 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.08 0.05 0.16 0.01 0.04 0.01 1.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.12 0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 0.01 0.02 0.1 0.01 0.04 0.04 0.04
AAL19128 (STM0164)
 0.16 0.25 0.25 0.19 0.14 0.04 0.13 0.33 0.27 0.29 0.31 0.13 0.22 0.33 1.0 0.14 0.16 0.16 0.17 0.21 0.05 0.23 0.3 0.19 0.08 0.13 0.15 0.22 0.27 0.08 0.16 0.26 0.23 0.14 0.22 0.25 0.22 0.2 0.24
AAL19144 (panD)
 0.22 0.59 0.24 0.28 0.17 0.4 0.26 0.3 0.33 0.5 0.32 0.67 0.27 0.51 0.14 0.48 0.11 0.11 0.09 0.12 0.29 0.54 0.38 0.31 1.0 0.89 0.75 0.32 0.44 0.37 0.14 0.23 0.42 0.3 0.21 0.51 0.3 0.23 0.29
AAL19189 (hlpA)
 0.3 0.51 0.35 0.48 0.6 0.73 0.48 0.41 0.28 0.3 0.21 0.5 0.26 0.33 0.44 0.37 0.44 0.11 0.12 0.14 0.22 1.0 0.77 0.34 0.19 0.4 0.88 0.28 0.45 0.23 0.22 0.59 0.5 0.22 0.29 0.61 0.58 0.4 0.52
AAL19340 (proC)
 0.38 0.68 1.0 0.87 0.47 0.68 0.67 0.82 0.46 0.84 0.44 0.41 0.6 0.93 0.78 0.22 0.41 0.48 0.59 0.63 0.23 0.45 0.09 0.64 0.39 0.72 0.49 0.84 0.98 0.04 0.46 0.54 0.95 0.09 0.46 0.84 0.65 0.62 0.47
AAL19345 (yaiE)
 0.4 0.54 0.53 0.28 0.26 0.21 0.23 0.45 0.45 0.41 0.46 0.25 0.41 0.48 1.0 0.27 0.23 0.25 0.3 0.34 0.47 0.46 0.19 0.6 0.66 0.41 0.77 0.42 0.45 0.08 0.24 0.49 0.46 0.2 0.18 0.79 0.81 0.24 0.58
AAL19406 (hupB)
 0.23 0.38 0.41 0.49 0.57 0.96 0.21 0.23 0.34 1.0 0.23 0.4 0.42 0.31 0.41 0.36 0.52 0.2 0.14 0.26 0.28 0.8 0.75 0.26 0.21 0.65 0.42 0.42 0.19 0.22 0.18 0.35 0.12 0.45 0.42 0.56 0.26 0.58 0.47
AAL19449 (ybaK)
 0.43 1.0 0.49 0.38 0.43 0.26 0.52 0.59 0.36 0.66 0.43 0.96 0.49 0.64 0.46 0.26 0.21 0.23 0.21 0.28 0.31 0.94 0.2 0.6 0.4 0.81 0.74 0.62 0.52 0.47 0.49 0.41 0.51 0.24 0.29 0.66 0.76 0.34 0.53
AAL19495 (ybcJ)
 0.33 0.43 0.24 0.21 0.25 0.19 0.11 0.42 0.41 0.25 0.33 0.47 0.2 0.64 0.06 0.1 0.04 0.1 0.12 0.12 0.27 0.33 0.05 0.53 0.45 0.59 1.0 0.32 0.43 0.15 0.17 0.34 0.48 0.04 0.02 0.74 0.49 0.21 0.34
AAL19643 (STM0699)
 0.03 0.06 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.01 0.02 1.0 0.01 0.01 0.45 0.02 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.04 0.15 0.02 0.04 0.0 0.05
AAL19644 (potE)
 0.05 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.02 1.0 0.01 0.0 0.14 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.0 0.03
AAL19645 (speF)
 0.05 0.1 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.03 1.0 0.01 0.0 0.6 0.02 0.0 0.04 0.06 0.05 0.0 0.0 0.18 0.03 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.02 0.06 0.07 0.02 0.0 0.11
AAL19652 (ybfA)
 0.16 0.04 0.44 0.05 0.1 0.02 0.01 0.16 0.05 0.34 0.04 0.03 0.18 0.13 0.0 0.49 0.0 0.01 0.02 0.01 0.5 0.05 0.4 0.04 1.0 0.12 0.07 0.22 0.21 0.03 0.27 0.1 0.16 0.38 0.0 0.06 0.1 0.19 0.06
AAL19723 (ybhE)
 0.21 0.34 1.0 0.38 0.28 0.78 0.2 0.17 0.3 0.35 0.25 0.26 0.78 0.2 0.31 0.23 0.07 0.13 0.12 0.16 0.51 0.22 0.08 0.47 0.44 0.53 0.43 0.37 0.33 0.03 0.19 0.26 0.28 0.1 0.15 0.37 0.6 0.41 0.36
AAL19769 (ompX)
 0.39 0.54 0.81 0.42 0.29 0.37 0.83 0.39 0.24 0.12 0.35 0.45 0.38 0.58 0.49 0.39 0.44 0.24 0.25 0.23 0.21 0.82 0.31 0.82 0.37 0.91 0.75 0.75 0.75 0.15 0.24 0.32 0.59 0.27 0.34 1.0 0.55 0.28 0.27
AAL19872 (hcr)
 0.04 0.08 0.07 0.12 0.04 0.01 0.03 0.07 0.15 1.0 0.15 0.05 0.06 0.1 0.07 0.01 0.03 0.04 0.04 0.05 0.03 0.05 0.01 0.05 0.04 0.03 0.03 0.14 0.05 0.01 0.04 0.04 0.05 0.01 0.06 0.03 0.07 0.05 0.05
AAL19873 (hcp)
 0.01 0.05 0.02 0.08 0.02 0.0 0.02 0.04 0.06 1.0 0.05 0.03 0.02 0.06 0.05 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.09 0.01 0.01 0.01 0.09 0.02 0.0 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.13 0.02 0.03
AAL19888 (infA)
 0.15 0.06 0.03 0.06 0.09 0.04 0.11 0.15 0.08 0.1 0.13 0.28 0.11 0.24 0.1 0.11 0.01 0.07 0.13 0.11 0.11 0.04 0.15 0.19 0.05 0.26 0.31 0.1 0.09 1.0 0.04 0.08 0.1 0.14 0.02 0.31 0.12 0.04 0.15
AAL20003 (ompA)
 0.25 0.34 0.74 0.61 0.59 0.71 0.38 0.36 0.36 0.32 0.3 0.31 0.97 0.43 0.28 0.41 0.21 0.25 0.22 0.24 0.09 0.31 0.11 0.28 0.14 1.0 0.32 0.6 0.52 0.05 0.23 0.55 0.35 0.29 0.12 0.34 0.2 0.9 0.3
AAL20095 (grxB)
 0.12 0.26 0.66 0.19 0.12 0.51 0.39 0.21 0.07 0.42 0.06 0.05 1.0 0.09 0.2 0.29 0.16 0.17 0.18 0.24 0.36 0.23 0.1 0.15 0.39 0.2 0.03 0.36 0.21 0.03 0.18 0.2 0.14 0.19 0.12 0.06 0.15 0.24 0.23
AAL20125 (acpP)
 0.62 0.32 0.22 0.33 0.36 0.31 0.24 0.31 0.26 0.41 0.23 0.37 0.24 0.15 0.45 0.34 0.25 0.12 0.1 0.14 0.18 0.25 0.52 0.41 0.19 0.44 0.61 0.36 0.4 1.0 0.1 0.32 0.34 0.36 0.22 0.67 0.31 0.25 0.42
AAL20140 (ndh)
 0.69 0.47 0.49 0.52 0.14 0.07 0.29 0.66 0.47 0.2 0.69 0.7 0.6 0.93 0.7 0.28 0.17 0.26 0.25 0.29 0.4 0.33 0.16 0.83 0.38 0.23 1.0 0.4 0.85 0.03 0.22 0.37 0.74 0.16 0.09 0.69 0.9 0.28 0.53
AAL20196 (yeaR)
 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.22 0.02 0.02 1.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.01 0.06 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.05 0.0 0.14 0.03 0.03
AAL20197 (yoaG)
 0.05 0.12 0.1 0.09 0.07 0.04 0.56 0.12 0.09 1.0 0.09 0.01 0.03 0.05 0.2 0.03 0.34 0.22 0.17 0.23 0.04 0.23 0.03 0.21 0.05 0.0 0.04 0.07 0.02 0.1 0.11 0.06 0.01 0.02 0.25 0.04 0.41 0.08 0.06
AAL20251 (pfkB)
 0.11 0.4 1.0 0.32 0.2 0.46 0.26 0.27 0.2 0.39 0.17 0.16 0.91 0.21 0.28 0.14 0.08 0.24 0.24 0.29 0.24 0.22 0.03 0.17 0.29 0.51 0.22 0.66 0.38 0.02 0.31 0.24 0.25 0.06 0.06 0.19 0.31 0.4 0.3
AAL20264 (himA)
 0.35 0.39 0.91 0.41 0.67 0.91 0.57 0.58 0.32 0.51 0.27 0.26 0.63 0.57 0.28 0.53 0.42 0.39 0.54 0.46 1.0 0.47 0.29 0.28 0.59 0.5 0.36 0.77 0.36 0.41 0.39 0.41 0.31 0.56 0.31 0.38 0.38 0.86 0.48
AAL20272 (aroH)
 0.22 0.25 0.11 0.19 0.11 0.07 0.42 0.31 0.12 0.13 0.14 0.15 0.18 0.39 0.37 0.11 0.27 0.38 0.44 0.4 0.06 0.13 0.08 0.3 1.0 0.65 0.19 0.21 0.45 0.03 0.14 0.11 0.29 0.12 0.46 0.14 0.41 0.11 0.21
AAL20301 (lpp)
 0.19 0.39 0.27 0.31 0.2 0.74 0.09 0.18 0.15 0.44 0.12 0.21 0.28 0.19 0.1 0.45 0.12 0.06 0.08 0.09 0.51 0.83 0.45 0.2 0.44 0.34 0.3 0.21 0.4 1.0 0.27 0.21 0.33 0.4 0.07 0.35 0.21 0.18 0.21
AAL20355 (ydhD)
 0.25 0.31 0.43 0.34 0.47 0.17 0.2 0.35 0.23 0.53 0.27 0.22 0.19 0.41 0.15 0.31 0.15 0.07 0.08 0.1 0.14 0.33 0.35 0.37 0.52 0.67 0.38 0.38 0.34 1.0 0.28 0.46 0.31 0.26 0.11 0.7 0.21 0.68 0.39
AAL20419 (ynfD)
 0.17 0.27 1.0 0.16 0.21 0.17 0.1 0.2 0.17 0.3 0.13 0.14 0.6 0.15 0.31 0.19 0.09 0.14 0.15 0.18 0.26 0.23 0.1 0.22 0.37 0.33 0.16 0.39 0.24 0.03 0.11 0.28 0.15 0.15 0.09 0.25 0.19 0.24 0.36
AAL20484 (sfcA)
 0.25 0.52 0.42 0.45 0.93 0.27 0.32 0.51 0.46 0.65 0.34 0.3 0.49 0.53 0.37 0.21 0.2 0.33 0.41 0.38 0.17 0.87 0.34 0.34 0.22 0.64 0.32 0.43 0.4 0.07 0.3 0.83 0.38 0.23 0.16 0.33 0.48 0.98 1.0
AAL20485 (adhP)
 0.1 0.13 0.62 0.22 0.08 1.0 0.78 0.21 0.04 0.09 0.03 0.03 0.59 0.05 0.16 0.27 0.04 0.43 0.4 0.48 0.52 0.05 0.03 0.17 0.5 0.19 0.22 0.39 0.11 0.02 0.16 0.1 0.05 0.12 0.08 0.27 0.31 0.18 0.1
AAL20486 (fdnI)
 0.02 0.19 0.08 0.11 0.13 0.02 0.07 0.19 0.2 1.0 0.13 0.31 0.1 0.21 0.58 0.1 0.16 0.28 0.17 0.35 0.02 0.06 0.25 0.02 0.03 0.03 0.14 0.09 0.02 0.03 0.42 0.13 0.02 0.11 0.06 0.1 0.03 0.15 0.09
AAL20487 (fdnH)
 0.02 0.1 0.06 0.06 0.12 0.01 0.02 0.06 0.17 1.0 0.06 0.46 0.07 0.05 0.15 0.05 0.02 0.12 0.11 0.18 0.01 0.02 0.14 0.02 0.02 0.02 0.15 0.08 0.02 0.01 0.05 0.1 0.02 0.05 0.01 0.1 0.03 0.14 0.07
AAL20488 (fdnG)
 0.01 0.1 0.05 0.06 0.12 0.01 0.02 0.05 0.11 1.0 0.06 0.43 0.05 0.03 0.29 0.04 0.02 0.12 0.1 0.19 0.01 0.05 0.1 0.03 0.01 0.02 0.14 0.09 0.02 0.01 0.06 0.08 0.02 0.04 0.01 0.12 0.04 0.14 0.07
AAL20490 (nmpC)
 0.14 0.34 0.24 0.71 0.5 0.29 0.03 0.44 0.6 1.0 0.46 0.43 0.13 0.41 0.69 0.11 0.37 0.27 0.27 0.36 0.0 0.23 0.34 0.09 0.0 0.44 0.16 0.39 0.39 0.1 0.17 0.9 0.39 0.25 0.2 0.39 0.04 0.66 0.23
AAL20583 (STM1665)
 0.21 0.34 0.16 0.19 0.05 0.04 0.07 0.1 0.89 0.14 1.0 0.11 0.09 0.09 0.39 0.06 0.08 0.12 0.1 0.14 0.03 0.15 0.02 0.46 0.07 0.21 0.16 0.57 0.06 0.04 0.12 0.08 0.07 0.05 0.05 0.32 0.69 0.07 0.08
AAL20599 (tpx)
 0.42 0.38 0.32 0.19 0.23 0.2 0.18 0.37 0.21 0.35 0.21 0.1 0.11 0.71 0.16 0.25 0.24 0.1 0.14 0.13 0.06 1.0 0.38 0.36 0.12 0.42 0.36 0.38 0.2 0.33 0.18 0.27 0.2 0.21 0.18 0.73 0.16 0.21 0.15
AAL20631 (cysB)
 0.53 0.51 1.0 0.45 0.29 0.14 0.4 0.68 0.34 0.47 0.43 0.19 0.8 0.79 0.4 0.28 0.34 0.57 0.58 0.8 0.16 0.36 0.22 0.44 0.95 0.91 0.5 0.87 0.63 0.05 0.33 0.53 0.81 0.24 0.2 0.49 0.89 0.55 0.52
AAL20641 (trpE)
 0.02 0.08 0.01 0.06 0.01 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 1.0 0.65 0.01 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
AAL20642 (trpD)
 0.03 0.1 0.02 0.08 0.01 0.05 0.0 0.1 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.2 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.84 1.0 0.01 0.01 0.41 0.0 0.0 0.01 0.16 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01
AAL20656 (yciI)
 0.45 0.46 0.39 0.34 0.4 0.27 0.39 0.44 0.21 0.66 0.18 0.36 0.37 0.37 1.0 0.27 0.25 0.36 0.36 0.52 0.16 0.3 0.68 0.42 0.29 0.22 0.63 0.48 0.4 0.07 0.26 0.43 0.48 0.33 0.31 0.63 0.61 0.24 0.5
AAL20676 (narI)
 0.01 0.09 0.07 0.27 0.08 0.01 0.08 0.02 0.13 1.0 0.07 0.91 0.31 0.02 0.45 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.17 0.21 0.03 0.02 0.09 0.05 0.03 0.0 0.01 0.12 0.02 0.01 0.01 0.09 0.1 0.2 0.27
AAL20677 (narJ)
 0.0 0.04 0.02 0.41 0.08 0.0 0.02 0.01 0.08 0.64 0.04 0.42 0.17 0.0 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.12 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.13 0.3
AAL20678 (narH)
 0.0 0.08 0.03 0.52 0.28 0.01 0.02 0.01 0.13 1.0 0.07 0.83 0.23 0.0 0.74 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.17 0.0 0.0 0.07 0.03 0.03 0.0 0.01 0.36 0.01 0.0 0.0 0.09 0.05 0.21 0.68
AAL20679 (narG)
 0.0 0.07 0.02 0.43 0.72 0.02 0.01 0.03 0.16 0.91 0.06 0.61 0.13 0.0 0.64 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.21 0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.04 0.29 0.99
AAL20680 (narK)
 0.01 0.07 0.02 0.35 0.66 0.02 0.02 0.04 0.21 0.73 0.1 0.0 0.03 0.01 1.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.15 0.37 0.01 0.0 0.12 0.01 0.02 0.01 0.0 0.79 0.0 0.01 0.0 0.37 0.15 0.37 0.63
AAL20681 (narX)
 0.07 0.09 0.13 0.18 0.5 0.03 0.07 0.14 0.18 0.15 0.18 0.03 0.15 0.19 0.22 0.08 0.16 0.06 0.06 0.07 0.04 0.09 0.07 0.17 0.07 0.06 0.08 0.07 0.11 0.04 0.05 0.65 0.08 0.03 0.19 0.09 0.2 0.27 1.0
AAL20682 (narL)
 0.09 0.1 0.21 0.38 0.65 0.12 0.09 0.13 0.19 0.37 0.14 0.04 0.18 0.15 0.2 0.11 0.19 0.08 0.09 0.1 0.1 0.05 0.15 0.34 0.1 0.11 0.15 0.11 0.19 0.04 0.04 0.66 0.12 0.04 0.23 0.25 0.19 0.41 1.0
AAL20737 (yoaB)
 0.49 0.53 0.23 0.44 0.3 0.22 0.45 0.56 0.19 0.5 0.26 0.73 0.25 0.51 0.43 0.33 0.54 0.26 0.26 0.28 0.25 0.56 0.44 0.42 0.31 0.34 0.39 0.32 0.76 1.0 0.39 0.34 0.77 0.33 0.4 0.57 0.37 0.24 0.41
AAL20741 (sdaA)
 0.26 0.42 0.58 0.41 0.49 0.07 0.17 0.27 0.52 0.49 0.41 0.43 0.67 0.29 0.59 0.12 0.49 0.37 0.3 0.38 0.08 0.38 0.26 0.35 0.09 0.81 1.0 0.33 0.51 0.06 0.09 0.48 0.69 0.2 0.68 0.72 0.37 0.64 0.53
AAL20866 (fliY)
 0.13 0.29 0.36 0.2 0.09 0.27 0.44 0.46 0.11 0.26 0.09 0.11 0.26 0.62 0.29 0.21 0.37 0.28 0.24 0.29 0.15 0.11 0.08 0.33 1.0 0.39 0.28 0.29 0.28 0.01 0.08 0.26 0.33 0.28 0.42 0.25 0.33 0.17 0.18
AAL20985 (gnd)
 0.23 0.34 0.19 0.73 0.31 1.0 0.92 0.36 0.21 0.44 0.14 0.39 0.22 0.53 0.74 0.31 0.25 0.33 0.32 0.38 0.08 0.17 0.26 0.47 0.13 0.35 0.4 0.35 0.46 0.06 0.16 0.24 0.58 0.22 0.36 0.36 0.39 0.4 0.29
AAL21071 (dld)
 0.13 0.35 0.98 0.26 0.51 0.34 0.3 0.37 0.15 0.36 0.15 0.14 1.0 0.4 0.31 0.21 0.1 0.19 0.21 0.21 0.16 0.35 0.14 0.3 0.25 0.65 0.25 0.3 0.3 0.02 0.23 0.4 0.27 0.14 0.09 0.23 0.49 0.62 0.59
AAL21169 (ompC)
 0.08 0.32 0.23 0.28 0.14 1.0 0.37 0.14 0.45 0.3 0.32 0.51 0.63 0.1 0.32 0.27 0.14 0.08 0.08 0.09 0.04 0.23 0.21 0.18 0.07 0.19 0.38 0.29 0.05 0.08 0.14 0.52 0.03 0.11 0.05 0.41 0.15 0.11 0.48
AAL21237 (STM2336)
 0.37 0.53 0.85 0.38 0.31 0.15 0.31 0.72 0.27 0.35 0.41 0.23 0.84 0.94 0.33 0.27 0.18 0.44 0.48 0.55 0.36 0.36 0.14 0.32 1.0 0.49 0.26 0.55 0.84 0.08 0.73 0.49 0.78 0.21 0.24 0.18 0.71 0.35 0.5
AAL21281 (yfcL)
 0.45 0.52 0.2 0.35 0.36 0.47 0.52 0.61 0.18 0.27 0.17 0.5 0.18 1.0 0.25 0.13 0.41 0.1 0.13 0.14 0.25 0.6 0.14 0.48 0.23 0.51 0.71 0.19 0.36 0.97 0.25 0.33 0.32 0.07 0.5 0.57 0.55 0.21 0.43
AAL21302 (yfdZ)
 0.36 0.41 0.55 0.25 0.25 0.16 0.27 0.54 0.29 0.37 0.31 0.49 0.51 1.0 0.32 0.26 0.2 0.4 0.3 0.43 0.41 0.29 0.11 0.41 0.73 0.46 0.32 0.43 0.24 0.03 0.17 0.38 0.2 0.17 0.38 0.3 0.49 0.49 0.45
AAL21431 (yfhJ)
 0.29 0.44 0.59 0.31 1.0 0.46 0.37 0.27 0.33 0.17 0.25 0.28 0.31 0.7 0.13 0.13 0.09 0.1 0.09 0.09 0.59 0.95 0.16 0.24 0.99 0.32 0.38 0.45 0.14 0.11 0.25 0.74 0.14 0.1 0.12 0.33 0.31 0.77 0.61
AAL21452 (cadB)
 0.03 0.14 0.0 0.33 0.71 0.02 0.03 0.04 0.25 0.05 0.15 0.22 0.01 0.0 1.0 0.27 0.01 0.04 0.02 0.02 0.05 0.01 0.1 0.1 0.09 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.1 0.5 0.0 0.1 0.0 0.13 0.08 0.01 0.81
AAL21453 (cadA)
 0.01 0.11 0.0 0.27 0.21 0.01 0.05 0.02 0.11 0.03 0.06 0.51 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.12 0.08 0.04 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.07 0.16 0.0 0.07 0.0 0.06 0.08 0.0 0.44
AAL21454 (yjdL)
 0.06 0.15 0.03 0.23 0.09 0.02 0.04 0.06 0.06 0.04 0.06 0.11 0.04 0.07 1.0 0.07 0.02 0.04 0.03 0.04 0.02 0.06 0.05 0.19 0.04 0.02 0.07 0.05 0.04 0.01 0.04 0.12 0.04 0.02 0.07 0.09 0.2 0.02 0.4
AAL21702 (luxS)
 0.12 0.17 0.13 0.23 0.1 0.38 0.15 0.11 0.09 0.16 0.1 0.2 0.13 0.11 0.07 0.13 0.12 0.04 0.04 0.04 0.16 0.12 0.04 0.14 0.15 0.24 0.17 0.15 0.37 0.07 0.06 0.09 0.3 0.08 1.0 0.19 0.16 0.14 0.09
AAL21849 (sdaC)
 0.07 0.26 0.15 0.14 0.2 0.03 0.02 0.08 0.56 0.57 0.42 1.0 0.12 0.02 0.46 0.08 0.19 0.17 0.15 0.19 0.01 0.29 0.43 0.14 0.01 0.32 0.26 0.22 0.02 0.08 0.12 0.21 0.02 0.17 0.21 0.31 0.08 0.13 0.14
AAL21850 (sdaB)
 0.07 0.24 0.19 0.24 0.3 0.08 0.02 0.1 0.42 0.62 0.31 1.0 0.14 0.02 0.47 0.07 0.23 0.15 0.16 0.19 0.01 0.24 0.26 0.14 0.01 0.4 0.22 0.17 0.02 0.06 0.13 0.28 0.02 0.16 0.32 0.26 0.1 0.27 0.21
AAL21963 (yqgC)
 0.14 0.03 0.04 0.09 0.27 0.22 0.01 0.02 0.07 0.03 0.11 0.15 0.18 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01 0.22 0.06 0.03 1.0 0.1 0.01 0.12 0.06 0.15 0.01 0.0 0.01 0.51 0.3 0.21 0.25
AAL22014 (yghU)
 0.26 0.41 0.67 0.33 0.3 0.53 0.45 0.48 0.25 0.27 0.29 0.17 1.0 0.38 0.62 0.2 0.31 0.27 0.27 0.34 0.44 0.19 0.08 0.34 0.45 0.44 0.42 0.34 0.4 0.04 0.22 0.4 0.37 0.12 0.25 0.46 0.45 0.44 0.72
AAL22054 (ygiN)
 0.43 0.45 0.53 0.32 0.31 0.61 0.17 0.45 0.31 0.54 0.29 0.5 0.32 0.5 0.33 0.37 0.15 0.1 0.16 0.15 0.32 0.51 0.31 0.53 0.38 0.52 0.8 0.51 0.44 0.07 0.21 0.38 0.44 0.2 0.13 1.0 0.65 0.31 0.43
AAL22083 (rpsU)
 0.1 0.07 0.01 0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.04 0.05 0.04 0.18 0.02 0.07 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.16 0.02 0.07 0.02 0.08 0.11 0.03 0.05 1.0 0.03 0.02 0.07 0.02 0.02 0.12 0.07 0.01 0.02
AAL22107 (yhaH)
 0.23 0.59 0.74 0.2 0.32 0.19 0.13 0.48 0.32 0.53 0.35 0.26 0.59 0.74 0.27 0.38 0.19 0.21 0.2 0.24 0.35 0.94 0.14 0.33 0.57 1.0 0.33 0.6 0.23 0.08 0.14 0.31 0.2 0.34 0.12 0.29 0.46 0.39 0.41
AAL22139 (yraP)
 0.15 0.34 0.44 0.19 0.2 0.38 0.12 0.31 0.21 0.34 0.19 0.18 0.25 0.48 0.27 0.13 0.14 0.09 0.13 0.12 0.22 1.0 0.08 0.19 0.19 0.36 0.29 0.26 0.22 0.04 0.12 0.26 0.17 0.06 0.11 0.36 0.31 0.28 0.23
AAL22151 (mtr)
 0.04 0.07 0.01 0.06 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.05 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.0 0.11 0.76 1.0 0.01 0.01 0.26 0.0 0.01 0.01 0.1 0.0 0.02 0.01 0.19 0.0 0.01
AAL22155 (rpsO)
 0.3 0.09 0.01 0.1 0.07 0.09 0.09 0.09 0.19 0.1 0.19 0.13 0.02 0.1 0.03 0.04 0.04 0.02 0.03 0.03 0.02 0.12 0.08 0.15 0.02 0.1 0.21 0.06 0.14 1.0 0.02 0.05 0.15 0.05 0.03 0.27 0.11 0.04 0.04
AAL22178 (yrbB)
 0.5 0.74 0.76 0.4 0.6 0.61 0.56 0.58 0.3 0.4 0.31 0.45 0.74 0.62 0.36 0.1 0.51 0.18 0.23 0.22 0.57 1.0 0.05 0.46 0.67 0.76 0.69 0.38 0.43 0.11 0.2 0.49 0.51 0.04 0.44 0.45 0.8 0.6 0.57
AAL22196 (yhbL)
 0.16 0.44 1.0 0.43 0.21 0.36 0.25 0.34 0.3 0.42 0.3 0.35 0.51 0.39 0.61 0.12 0.36 0.24 0.22 0.28 0.28 0.21 0.06 0.28 0.26 0.33 0.32 0.29 0.41 0.04 0.18 0.42 0.35 0.06 0.28 0.43 0.39 0.22 0.39
AAL22317 (slyX)
 0.52 0.4 0.74 0.15 0.37 0.27 0.27 0.35 0.64 0.63 1.0 0.27 0.64 0.34 0.18 0.3 0.21 0.09 0.11 0.16 0.28 0.43 0.27 0.51 0.19 0.28 0.65 0.41 0.14 0.57 0.22 0.47 0.16 0.21 0.26 0.48 0.79 0.52 0.62
AAL22543 (yibF)
 0.15 0.38 1.0 0.23 0.2 0.32 0.24 0.43 0.2 0.31 0.2 0.1 0.98 0.17 0.5 0.13 0.21 0.25 0.22 0.3 0.45 0.25 0.04 0.24 0.56 0.55 0.23 0.48 0.21 0.03 0.14 0.29 0.15 0.13 0.19 0.24 0.28 0.43 0.46
AAL22560 (secB)
 0.52 0.57 0.42 0.76 0.55 0.66 0.31 0.53 0.58 0.79 0.61 0.63 0.43 0.63 1.0 0.47 0.7 0.22 0.22 0.27 0.27 0.44 0.63 0.47 0.29 0.76 0.6 0.57 0.64 0.43 0.23 0.43 0.59 0.52 0.62 0.62 0.53 0.57 0.54
AAL22567 (tdh)
 0.14 0.42 0.35 0.4 0.7 0.15 0.11 0.13 0.75 0.49 0.57 0.53 0.31 0.18 0.6 0.1 0.21 0.08 0.07 0.09 0.08 0.23 0.2 0.24 0.08 0.48 0.42 0.21 0.13 0.07 0.05 0.69 0.11 0.07 0.27 0.43 0.28 0.56 1.0
AAL22568 (kbl)
 0.19 0.44 0.24 0.5 0.61 0.13 0.17 0.15 0.65 0.59 0.53 0.69 0.25 0.13 1.0 0.09 0.42 0.14 0.15 0.17 0.05 0.21 0.22 0.34 0.07 0.44 0.53 0.26 0.17 0.05 0.09 0.62 0.16 0.08 0.58 0.56 0.42 0.43 0.96
AAL22739 (rbsD)
 0.02 0.04 0.18 0.04 0.02 0.0 0.04 0.06 0.5 0.02 0.28 0.04 0.15 0.02 0.09 0.04 0.1 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.07 0.04 0.02 0.02 0.02 0.01 1.0 0.01 0.08 0.01 0.03 0.03 0.03 0.05 0.22 0.02
AAL22740 (rbsA)
 0.04 0.12 0.12 0.1 0.03 0.01 0.04 0.07 1.0 0.03 0.58 0.14 0.23 0.04 0.02 0.05 0.04 0.01 0.01 0.02 0.05 0.03 0.02 0.22 0.07 0.03 0.07 0.04 0.02 0.52 0.01 0.14 0.02 0.02 0.03 0.07 0.35 0.18 0.08
AAL22741 (rbsC)
 0.05 0.42 0.08 0.11 0.07 0.03 0.04 0.09 1.0 0.06 0.59 0.14 0.07 0.09 0.08 0.02 0.07 0.02 0.02 0.03 0.05 0.05 0.01 0.18 0.04 0.06 0.1 0.09 0.03 0.44 0.03 0.11 0.03 0.01 0.07 0.1 0.27 0.1 0.11
AAL22742 (rbsB)
 0.13 0.16 0.37 0.17 0.38 0.12 0.03 0.14 1.0 0.32 0.65 0.13 0.49 0.12 0.2 0.12 0.08 0.07 0.07 0.1 0.06 0.1 0.21 0.13 0.03 0.09 0.12 0.42 0.04 0.33 0.35 0.48 0.04 0.15 0.07 0.14 0.16 0.58 0.61
AAL22743 (rbsK)
 0.2 0.39 0.29 0.24 0.49 0.08 0.07 0.28 0.57 0.48 0.54 0.36 0.43 0.31 0.31 0.16 0.19 0.17 0.18 0.22 0.1 0.19 0.21 0.23 0.11 0.21 0.21 0.4 0.14 0.24 0.16 0.74 0.12 0.17 0.18 0.26 0.22 0.34 1.0
AAL22744 (rbsR)
 0.18 0.34 0.32 0.27 0.39 0.06 0.12 0.31 0.36 0.34 0.41 0.26 0.44 0.31 0.45 0.15 0.23 0.19 0.2 0.26 0.09 0.22 0.21 0.3 0.08 0.16 0.15 0.29 0.1 0.36 0.11 0.58 0.08 0.21 0.27 0.19 0.55 0.31 1.0
AAL22765 (trxA)
 0.62 0.52 0.42 0.49 0.41 0.37 0.8 0.34 0.3 0.58 0.28 0.86 0.39 0.41 0.55 0.44 0.24 0.26 0.3 0.32 0.27 0.31 0.47 0.61 0.43 0.57 0.6 1.0 0.66 0.77 0.16 0.57 0.57 0.5 0.03 0.81 0.48 0.25 0.53
AAL22903 (sbp)
 0.23 0.12 0.04 0.25 0.02 0.1 0.23 0.4 0.02 0.05 0.05 0.02 0.05 0.38 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.1 0.03 0.36 0.54 1.0 0.18 0.4 0.49 0.0 0.0 0.03 0.8 0.03 0.04 0.42 0.46 0.09 0.04
AAL22936 (rpmE)
 0.64 0.21 0.07 0.26 0.7 0.19 0.18 0.35 0.33 0.4 0.37 0.97 0.18 0.34 0.04 0.18 0.07 0.04 0.07 0.06 0.06 0.15 0.38 0.61 0.09 1.0 0.86 0.25 0.29 0.88 0.11 0.48 0.32 0.25 0.07 0.91 0.36 0.42 0.41
AAL22968 (btuB)
 0.28 0.62 0.4 0.47 0.84 0.13 0.28 0.51 0.58 0.71 0.65 0.73 0.37 0.75 1.0 0.19 0.8 0.22 0.21 0.28 0.07 0.28 0.67 0.52 0.07 0.77 0.41 0.37 0.17 0.08 0.15 0.6 0.18 0.32 0.87 0.25 0.88 0.76 0.76
AAL23069 (qor)
 0.14 0.29 1.0 0.21 0.16 0.16 0.11 0.22 0.18 0.22 0.17 0.17 0.99 0.2 0.33 0.16 0.11 0.1 0.11 0.13 0.45 0.13 0.07 0.29 0.5 0.31 0.25 0.42 0.32 0.02 0.13 0.28 0.25 0.14 0.13 0.27 0.39 0.29 0.36
AAL23174 (STM4351)
 0.35 0.38 0.38 0.22 0.32 0.13 0.46 0.54 0.17 0.2 0.22 0.13 0.27 0.45 0.61 0.09 0.18 0.24 0.25 0.31 0.04 0.19 0.12 0.43 0.13 0.15 0.21 0.32 0.23 0.02 0.36 0.59 0.29 0.09 0.36 0.14 1.0 0.33 0.44
AAL23277 (yjgF)
 0.13 0.29 0.25 0.33 0.41 0.25 0.18 0.21 0.39 0.64 0.32 0.28 0.33 0.0 0.47 0.13 0.15 0.14 0.13 0.18 0.04 0.2 0.34 0.14 0.05 0.22 0.24 0.38 0.18 0.04 0.14 0.99 0.16 0.17 0.1 0.24 0.12 0.35 1.0
AAL23326 (trpS2)
 0.15 0.33 0.11 0.1 0.17 0.02 0.05 0.22 0.08 0.06 0.22 0.03 0.14 0.08 0.06 0.13 0.02 0.09 0.11 0.11 0.03 0.07 0.08 0.42 0.59 0.56 0.08 0.1 0.35 0.01 0.07 0.07 0.19 0.1 0.09 0.05 1.0 0.18 0.11
AAL23327 (STM4509)
 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 1.0 0.06 0.01 0.02 0.02 0.06 0.03 0.03 0.07 0.09 0.09 0.01 0.01 0.05 0.04 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.06 0.02 0.01 0.06 0.03 0.02
AAL23348 (yjiA)
 0.16 0.48 0.18 0.34 0.12 0.19 0.13 0.34 0.56 0.25 0.81 0.2 0.19 0.33 1.0 0.11 0.38 0.11 0.13 0.15 0.13 0.25 0.06 0.32 0.15 0.39 0.36 0.51 0.19 0.11 0.19 0.21 0.19 0.06 0.18 0.93 0.41 0.14 0.28
AAL23349 (yjiX)
 0.09 0.32 0.08 0.2 0.06 0.06 0.14 0.2 0.57 0.07 0.56 0.1 0.15 0.24 1.0 0.09 0.21 0.07 0.05 0.06 0.04 0.06 0.06 0.2 0.04 0.2 0.12 0.36 0.04 0.04 0.12 0.13 0.05 0.07 0.04 0.39 0.26 0.08 0.2
AAL23350 (yjiY)
 0.04 0.29 0.01 0.27 0.0 0.08 0.02 0.09 0.84 0.0 0.68 0.16 0.01 0.01 1.0 0.05 0.3 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.18 0.02 0.24 0.19 0.28 0.03 0.03 0.07 0.01 0.05 0.0 0.01 0.69 0.12 0.0 0.01
AAL23384 (deoB)
 0.13 0.17 0.2 0.22 0.08 0.15 0.1 0.11 0.27 0.19 0.28 1.0 0.3 0.07 0.28 0.06 0.15 0.16 0.14 0.18 0.1 0.05 0.05 0.44 0.09 0.15 0.19 0.26 0.18 0.02 0.13 0.17 0.14 0.04 0.07 0.61 0.17 0.12 0.22
AAL23385 (deoD)
 0.16 0.21 0.22 0.25 0.19 0.21 0.1 0.14 0.36 0.28 0.3 1.0 0.23 0.1 0.36 0.1 0.15 0.12 0.09 0.13 0.05 0.11 0.1 0.52 0.05 0.24 0.25 0.32 0.21 0.02 0.15 0.22 0.16 0.07 0.08 0.69 0.2 0.23 0.21
AAL23398 (trpR)
 0.52 0.75 0.67 0.42 0.34 0.51 0.26 0.52 0.37 0.44 0.52 0.52 0.71 0.48 0.29 0.12 0.28 0.24 0.27 0.27 0.33 0.55 0.08 0.46 1.0 0.84 0.4 0.53 0.9 0.27 0.51 0.43 0.52 0.1 0.29 0.61 0.52 0.43 0.52
AAL23526 (PSLT026)
 0.18 0.42 0.42 0.28 0.1 0.05 1.0 0.87 0.08 0.31 0.12 0.04 0.34 0.94 0.18 0.11 0.54 0.35 0.42 0.45 0.24 0.44 0.06 0.02 0.85 0.2 0.0 0.31 0.69 0.18 0.34 0.14 0.82 0.1 0.84 0.0 0.02 0.25 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)