Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
37C
40C
6A10,THB
6A10,THB with GAL
6A10,THB with GLU
D39
D39,HPUra+
D39,Kanamycin+
D39,L-Log
GA02254
GA17457
GA41565
IU1781
IU1781,37C
IU1781,40C
L-Log,THB with Lysed horse blood,37C
PMEN3 (Spain9V-3)
PMEN3 (Spain9V-3),mitomycin+
PMEN3,37C
PMEN6,37C
R801
Rx1
Rx1,HPUra+
Rx1,Kanamycin+
Rx1,L-Log
Rx1,Log
Rx1,Log,Seconeolitsine+
Rx1,PhrA+
SP17
SP27
SRL1
ST556
TH11425
TH9063
TIGR4
TIGR4,Carolacton+
TIGR4,M-Log
TIGR4,M-Log,THB
TIGR4,M-Log,vancomycin+
TIGR4,THB
WT
XL28
XL28,IPTG+
XL29,IPTG+
XZ7022
XZ8009
XZ8015
Xen35
AAK98833 (spr0029)
0.16 0.14 0.0 0.0 0.0 0.2 0.55 0.03 0.12 0.0 0.14 0.0 0.1 0.07 0.64 0.04 0.1 0.09 0.1 0.29 0.2 0.27 0.55 0.03 1.0 0.12 0.1 0.07 0.06 0.04 0.21 0.03 0.03 0.04 0.07 0.11 0.06 0.32 0.19 0.31 0.08 0.0 0.0 0.0 0.15 0.22 0.12 0.04
AAK98960 (spr0156)
0.12 0.1 0.11 0.08 0.1 0.22 0.06 0.13 0.14 0.16 0.15 0.12 0.23 0.26 0.27 0.14 0.13 0.14 0.13 0.19 0.09 0.16 0.06 0.13 0.05 0.41 0.41 0.33 0.05 0.07 0.24 0.11 0.1 0.1 0.34 1.0 0.13 0.17 0.15 0.18 0.29 0.25 0.22 0.23 0.16 0.2 0.21 0.11
AAK98977 (arsC)
0.26 0.26 0.4 0.28 0.32 0.48 0.27 0.39 0.25 0.3 0.18 0.2 0.48 0.5 0.31 0.16 0.38 0.44 0.38 0.74 0.11 0.38 0.27 0.39 0.44 0.57 0.49 0.52 0.22 0.67 0.39 0.78 0.78 0.76 0.59 1.0 0.17 0.41 1.0 0.43 0.45 0.54 0.52 0.44 0.18 0.21 0.17 0.14
AAK98978 (spr0174)
0.36 0.43 0.33 0.28 0.35 0.47 0.19 0.13 0.43 0.35 0.36 0.31 0.56 0.53 0.25 0.25 0.37 0.31 0.37 1.0 0.88 0.36 0.19 0.13 0.2 0.56 0.72 0.52 0.34 0.64 0.46 0.94 0.97 0.94 0.5 0.71 0.2 0.2 0.8 0.17 0.83 0.33 0.37 0.33 0.34 0.29 0.23 0.23
AAK98980 (spr0176)
0.32 0.37 0.24 0.3 0.3 0.22 0.1 0.07 0.18 0.33 0.25 0.26 0.43 0.43 0.14 0.18 0.26 0.26 0.26 0.36 0.42 0.27 0.1 0.07 0.23 0.36 0.38 0.48 0.41 1.0 0.54 0.54 0.53 0.52 0.41 0.48 0.31 0.3 0.86 0.27 0.53 0.21 0.23 0.21 0.23 0.32 0.24 0.24
AAK98981 (spr0177)
0.4 0.45 0.34 0.39 0.4 0.27 0.21 0.28 0.23 0.29 0.32 0.31 0.51 0.48 0.11 0.25 0.34 0.33 0.34 0.44 0.76 0.31 0.21 0.28 0.26 0.98 0.64 0.59 0.24 0.64 0.75 0.44 0.43 0.42 0.45 0.7 0.58 0.26 0.89 0.24 1.0 0.26 0.26 0.25 0.3 0.25 0.2 0.19
AAK99057 (spr0253)
0.46 0.52 0.14 0.16 0.16 0.29 0.06 0.08 0.24 0.19 0.21 0.06 0.29 0.31 0.14 0.16 0.56 0.57 0.56 0.68 1.0 0.22 0.06 0.08 0.37 0.25 0.4 0.39 0.18 0.25 0.21 0.43 0.44 0.45 0.24 0.42 0.27 0.23 0.47 0.2 0.49 0.1 0.09 0.09 0.23 0.2 0.24 0.15
AAK99058 (pepS)
0.58 0.62 0.61 0.66 0.63 0.49 0.09 0.1 0.58 0.64 0.46 0.16 0.45 0.45 0.34 0.3 0.97 0.96 0.97 1.0 0.92 0.36 0.09 0.1 0.64 0.36 0.34 0.56 0.58 0.94 0.35 0.92 0.87 0.89 0.43 0.49 0.35 0.51 0.78 0.46 0.8 0.39 0.41 0.43 0.56 0.65 0.74 0.44
AAK99059 (spr0255)
0.3 0.32 0.23 0.25 0.27 0.19 0.04 0.05 0.28 0.2 0.13 0.06 0.22 0.21 0.12 0.17 0.63 0.5 0.63 0.1 1.0 0.17 0.04 0.05 0.25 0.14 0.14 0.3 0.18 0.4 0.25 0.32 0.31 0.31 0.11 0.2 0.16 0.0 0.21 0.0 0.26 0.11 0.11 0.13 0.18 0.21 0.35 0.05
AAK99105 (yorfE)
0.94 0.99 0.36 0.71 0.38 0.25 0.32 0.23 0.12 0.54 0.44 0.1 0.24 0.23 0.98 0.71 0.26 0.4 0.26 0.65 1.0 0.36 0.32 0.23 0.7 0.11 0.07 0.35 0.33 0.18 0.64 0.2 0.17 0.19 0.2 0.11 0.59 0.06 0.5 0.05 0.08 0.13 0.11 0.07 0.1 0.23 0.21 0.02
AAK99203 (asp23)
0.25 0.22 0.44 0.38 0.46 0.67 0.07 0.09 0.28 0.56 0.51 0.42 0.74 0.82 0.52 0.26 0.33 0.33 0.33 0.25 0.26 0.44 0.07 0.09 0.07 0.81 0.51 0.85 0.35 0.37 0.59 0.63 0.64 0.63 0.63 1.0 0.75 0.33 0.84 0.34 0.61 0.29 0.31 0.28 0.32 0.59 0.42 0.81
AAK99236 (cspR)
0.56 0.48 0.26 0.28 0.27 0.1 0.03 0.02 0.05 0.38 0.22 0.27 0.14 0.17 0.13 0.62 0.28 0.27 0.28 0.29 0.04 0.33 0.03 0.02 0.06 0.25 0.06 0.18 0.18 0.11 1.0 0.23 0.22 0.24 0.12 0.32 0.11 0.15 0.07 0.19 0.15 0.19 0.2 0.18 0.29 0.31 0.31 0.15
AAK99279 (spr0475)
0.46 0.52 0.21 0.45 0.53 0.38 0.4 0.27 0.28 0.17 0.25 0.24 0.46 0.53 0.45 0.32 0.23 0.27 0.23 0.47 0.22 0.38 0.4 0.27 0.16 0.52 0.27 0.6 0.11 0.08 0.56 0.31 0.3 0.31 0.54 1.0 0.62 0.36 0.37 0.39 0.41 0.44 0.43 0.44 0.33 0.22 0.42 0.44
AAK99461 (spr0657)
0.18 0.15 0.2 0.18 0.13 0.48 0.32 0.83 0.11 0.32 0.33 0.3 0.55 0.5 0.29 0.55 0.26 0.19 0.26 0.21 0.05 0.37 0.32 0.83 0.31 1.0 0.48 0.55 0.17 0.09 0.66 0.42 0.42 0.44 0.5 0.84 0.52 0.29 0.45 0.29 0.84 0.2 0.19 0.17 0.29 0.44 0.32 0.88
AAK99462 (spr0658)
0.23 0.24 0.22 0.19 0.16 0.24 0.05 0.1 0.35 0.15 0.38 0.17 0.39 0.45 0.33 0.42 0.39 0.44 0.39 0.23 1.0 0.27 0.05 0.1 0.09 0.44 0.34 0.36 0.16 0.13 0.24 0.38 0.34 0.36 0.52 0.79 0.12 0.37 0.28 0.33 0.28 0.34 0.32 0.3 0.19 0.19 0.21 0.91
AAK99489 (spr0685)
0.15 0.18 0.07 0.08 0.08 0.21 0.11 0.12 0.15 0.31 0.3 0.16 0.28 0.31 0.05 0.23 0.15 0.19 0.15 0.15 1.0 0.19 0.11 0.12 0.06 0.32 0.32 0.26 0.09 0.13 0.44 0.18 0.18 0.19 0.23 0.38 0.39 0.09 0.54 0.09 0.33 0.09 0.09 0.09 0.08 0.22 0.12 0.25
AAK99614 (spr0810)
0.18 0.19 0.74 0.34 0.35 0.24 0.02 0.05 0.13 0.11 0.08 0.07 0.32 0.41 0.82 0.07 0.15 0.21 0.15 1.0 0.22 0.47 0.02 0.05 0.47 0.33 0.43 0.43 0.11 0.21 0.18 0.7 0.79 0.72 0.15 0.04 0.08 0.07 0.67 0.06 0.19 0.13 0.11 0.08 0.09 0.05 0.08 0.03
AAK99722 (asd)
0.19 0.17 0.18 0.11 0.11 0.32 0.04 0.04 0.25 0.1 0.14 0.14 0.41 0.41 0.33 0.22 0.19 0.23 0.19 0.29 0.02 0.22 0.04 0.04 0.06 0.29 0.2 0.46 0.06 0.03 0.31 0.13 0.13 0.13 0.47 1.0 0.23 0.28 0.55 0.33 0.47 0.34 0.35 0.31 0.19 0.1 0.21 0.26
AAK99738 (spr0934)
0.17 0.18 0.04 0.04 0.03 0.27 0.03 0.06 0.16 0.23 0.35 0.35 0.31 0.45 0.19 0.66 0.11 0.19 0.11 0.24 0.24 0.17 0.03 0.06 0.11 0.45 0.17 0.3 0.2 0.08 0.32 0.19 0.18 0.18 0.48 1.0 0.23 0.26 0.2 0.31 0.46 0.26 0.21 0.28 0.25 0.2 0.0 0.38
AAK99739 (spr0935)
0.42 0.45 0.06 0.07 0.04 0.4 0.12 0.14 0.34 0.26 0.57 0.42 0.48 0.56 0.51 0.86 0.25 0.36 0.25 0.63 0.17 0.3 0.12 0.14 0.12 0.59 0.25 0.37 0.28 0.08 0.58 0.37 0.34 0.37 0.65 1.0 0.29 0.55 0.4 0.62 0.6 0.35 0.37 0.37 0.55 0.3 0.0 0.75
AAK99740 (spr0936)
0.38 0.44 0.05 0.07 0.03 0.33 0.05 0.07 0.21 0.27 0.74 0.46 0.44 0.5 0.34 0.64 0.19 0.33 0.19 0.54 0.09 0.32 0.05 0.07 0.07 0.62 0.37 0.34 0.31 0.12 0.75 0.34 0.31 0.33 0.63 1.0 0.29 0.34 0.16 0.36 0.55 0.21 0.26 0.24 0.65 0.25 0.0 0.79
AAK99742 (spr0938)
0.25 0.3 0.05 0.06 0.03 0.19 0.02 0.02 0.11 0.21 0.34 0.29 0.24 0.25 0.15 0.34 0.15 0.19 0.15 0.42 0.02 0.19 0.02 0.02 0.04 0.43 0.27 0.22 0.2 0.08 0.57 0.18 0.18 0.17 0.52 1.0 0.34 0.22 0.11 0.24 0.43 0.12 0.15 0.13 0.41 0.16 0.0 0.31
AAK99746 (ccrB)
0.44 0.51 0.08 0.08 0.07 0.25 0.04 0.05 0.14 0.29 0.32 0.21 0.27 0.24 0.22 0.29 0.18 0.27 0.18 0.39 0.61 0.21 0.04 0.05 0.11 0.77 0.54 0.26 0.39 0.29 1.0 0.15 0.15 0.14 0.3 0.47 0.68 0.14 0.5 0.14 0.75 0.13 0.18 0.13 0.13 0.3 0.01 0.23
AAK99747 (spr0943)
0.59 0.67 0.11 0.13 0.1 0.25 0.05 0.07 0.21 0.43 0.48 0.28 0.28 0.28 0.09 0.42 0.29 0.33 0.29 0.48 0.63 0.24 0.05 0.07 0.19 0.4 0.29 0.26 0.46 0.37 1.0 0.22 0.17 0.2 0.28 0.32 0.48 0.2 0.27 0.2 0.46 0.16 0.21 0.17 0.24 0.5 0.0 0.29
AAK99748 (spr0944)
0.3 0.25 0.02 0.03 0.01 0.15 0.03 0.04 0.05 0.1 0.12 0.09 0.11 0.12 0.0 0.21 0.06 0.05 0.06 0.24 0.35 0.11 0.03 0.04 0.13 0.23 0.2 0.15 0.16 0.13 1.0 0.06 0.06 0.06 0.14 0.24 0.37 0.02 0.49 0.02 0.25 0.01 0.01 0.01 0.1 0.12 0.0 0.02
AAK99788 (obg)
0.52 0.48 0.3 0.26 0.3 0.53 0.16 0.25 0.51 0.31 0.3 0.37 0.65 0.77 0.48 0.44 0.56 0.59 0.56 0.6 0.21 0.5 0.16 0.25 0.25 0.57 0.69 0.89 0.47 0.26 0.56 0.42 0.41 0.41 0.6 1.0 0.44 0.64 0.28 0.65 0.65 0.62 0.63 0.64 0.38 0.29 0.56 0.56
AAK99815 (spr1011)
0.7 0.73 0.16 0.13 0.13 0.42 0.16 0.26 0.27 0.27 0.33 0.4 0.51 0.57 0.37 0.48 0.29 0.36 0.29 0.52 0.25 0.4 0.16 0.26 0.36 0.53 0.28 0.54 0.11 0.21 0.62 0.16 0.16 0.16 0.55 1.0 0.16 0.37 0.25 0.4 0.46 0.34 0.36 0.36 0.26 0.41 0.53 0.45
AAK99825 (spr1021)
0.16 0.16 0.14 0.13 0.12 0.41 0.11 0.11 0.29 0.17 0.19 0.18 0.37 0.37 0.27 0.34 0.13 0.13 0.13 0.16 0.1 0.25 0.11 0.11 0.19 0.4 0.5 0.38 0.13 0.11 0.29 0.13 0.12 0.13 0.54 1.0 0.33 0.36 0.23 0.39 0.47 0.26 0.28 0.29 0.22 0.2 0.24 0.44
AAK99826 (rggD)
0.18 0.22 0.09 0.09 0.08 0.3 0.09 0.11 0.3 0.17 0.18 0.17 0.29 0.29 0.26 0.26 0.16 0.14 0.16 0.18 0.08 0.22 0.09 0.11 0.2 0.34 0.36 0.28 0.22 0.16 0.29 0.15 0.14 0.15 0.5 1.0 0.22 0.29 0.13 0.3 0.35 0.24 0.26 0.27 0.25 0.17 0.16 0.35
AAK99961 (spr1158)
0.19 0.19 0.39 0.31 0.31 0.37 0.04 0.09 0.2 0.45 0.32 0.4 0.42 0.45 0.34 0.36 0.2 0.23 0.2 0.21 0.17 0.31 0.04 0.09 0.09 0.71 0.28 0.45 0.16 0.14 0.74 0.29 0.29 0.28 0.33 0.43 0.83 0.4 1.0 0.41 0.79 0.32 0.36 0.32 0.2 0.32 0.46 0.39
AAK99970 (spr1167)
0.15 0.12 0.16 0.18 0.15 0.35 0.28 0.42 0.15 0.22 0.29 0.23 0.41 0.54 0.43 0.25 0.15 0.21 0.15 0.22 0.42 0.3 0.28 0.42 0.1 0.73 0.49 0.55 0.09 0.1 0.47 0.45 0.41 0.42 0.39 0.8 1.0 0.25 0.87 0.25 0.56 0.23 0.21 0.22 0.22 0.25 0.21 0.25
AAL00065 (spr1261)
0.3 0.35 0.14 0.17 0.16 0.39 0.11 0.12 0.28 0.3 0.26 0.32 0.37 0.35 0.15 0.33 0.26 0.18 0.26 0.27 0.39 0.28 0.11 0.12 0.31 0.71 0.49 0.47 0.29 0.15 0.72 0.21 0.19 0.18 0.31 0.48 0.64 0.24 0.29 0.22 1.0 0.18 0.18 0.17 0.25 0.3 0.23 0.15
AAL00086 (spr1282)
0.43 0.31 0.1 0.07 0.08 0.47 0.08 0.05 0.53 0.3 0.23 0.09 0.29 0.22 0.17 0.49 0.37 0.54 0.37 0.24 0.0 0.47 0.08 0.05 0.13 0.27 0.5 0.2 0.06 0.03 0.25 0.1 0.08 0.1 0.54 1.0 0.33 0.52 0.49 0.59 0.42 0.21 0.22 0.19 0.4 0.13 0.09 0.82
AAL00088 (spr1284)
0.27 0.2 0.08 0.06 0.07 0.46 0.07 0.07 0.53 0.14 0.16 0.25 0.22 0.19 0.43 0.18 0.31 0.39 0.31 0.41 0.09 0.14 0.07 0.07 0.29 0.24 0.37 0.17 0.06 0.08 0.26 0.13 0.11 0.13 0.36 1.0 0.28 0.15 0.26 0.18 0.39 0.18 0.17 0.17 0.28 0.17 0.19 0.29
AAL00092 (spr1288)
0.88 1.0 0.04 0.03 0.03 0.3 0.02 0.04 0.23 0.16 0.24 0.21 0.33 0.4 0.11 0.34 0.32 0.39 0.32 0.09 0.61 0.23 0.02 0.04 0.05 0.43 0.25 0.29 0.1 0.07 0.63 0.23 0.22 0.22 0.48 0.83 0.22 0.21 0.34 0.18 0.59 0.38 0.35 0.33 0.25 0.12 0.23 0.26
AAL00178 (spr1374)
0.26 0.31 0.12 0.12 0.15 0.23 0.14 0.14 0.19 0.23 0.27 0.26 0.28 0.29 0.14 0.22 0.27 0.2 0.27 0.27 1.0 0.23 0.14 0.14 0.43 0.37 0.22 0.29 0.14 0.18 0.22 0.2 0.2 0.2 0.24 0.36 0.43 0.21 0.42 0.19 0.4 0.14 0.16 0.15 0.25 0.22 0.2 0.24
AAL00196 (spr1392)
0.66 0.75 0.52 0.44 0.42 0.42 0.53 0.66 0.47 0.62 0.53 0.49 0.56 0.54 0.23 0.44 0.6 0.67 0.6 0.62 0.39 0.72 0.53 0.66 0.34 0.52 0.96 0.67 0.47 0.57 0.48 0.69 0.7 0.67 0.6 0.61 0.87 0.78 1.0 0.7 0.66 0.6 0.71 0.65 0.59 0.51 0.68 0.75
AAL00204 (spr1400)
0.18 0.2 0.1 0.1 0.12 0.41 0.09 0.09 0.17 0.13 0.15 0.15 0.44 0.5 0.18 0.25 0.16 0.17 0.16 0.2 0.19 0.26 0.09 0.09 0.06 0.76 0.31 0.49 0.12 0.05 0.36 0.14 0.14 0.14 0.42 1.0 0.23 0.2 0.17 0.19 0.39 0.17 0.21 0.18 0.12 0.24 0.21 0.41
AAL00233 (dfr)
0.37 0.38 0.51 0.58 0.58 0.65 0.08 0.14 0.31 0.73 0.52 0.38 0.64 0.68 0.36 0.29 0.33 0.36 0.33 0.34 0.16 0.4 0.08 0.14 0.11 0.68 1.0 0.82 0.31 0.09 0.52 0.61 0.64 0.62 0.42 0.72 0.45 0.31 0.81 0.31 0.74 0.29 0.29 0.3 0.33 0.95 0.74 0.34
AAL00310 (spr1506)
0.17 0.19 0.12 0.16 0.19 0.17 0.07 0.08 0.26 0.24 0.25 0.24 0.21 0.22 0.16 0.23 0.22 0.21 0.22 0.18 1.0 0.17 0.07 0.08 0.09 0.24 0.23 0.19 0.13 0.11 0.18 0.18 0.19 0.18 0.2 0.21 0.35 0.29 0.4 0.26 0.27 0.2 0.22 0.21 0.18 0.21 0.21 0.34
AAL00531 (spr1728)
0.24 0.24 0.26 0.22 0.25 0.54 0.43 0.34 0.29 0.35 0.45 0.41 0.47 0.47 0.57 0.29 0.23 0.17 0.23 0.25 0.4 0.4 0.43 0.34 0.11 1.0 0.61 0.69 0.15 0.26 0.67 0.33 0.31 0.36 0.4 0.78 0.67 0.15 0.82 0.17 0.99 0.29 0.3 0.32 0.34 0.49 0.32 0.22
AAL00593 (spr1790)
0.38 0.41 0.56 0.35 0.4 0.44 0.1 0.09 0.37 0.32 0.23 0.24 0.32 0.3 0.69 0.41 0.32 0.4 0.32 1.0 0.04 0.25 0.1 0.09 0.46 0.29 0.18 0.34 0.1 0.25 0.24 0.48 0.48 0.49 0.32 0.3 0.18 0.24 0.61 0.27 0.21 0.53 0.49 0.51 0.26 0.2 0.28 0.15
AAL00643 (spr1840)
0.14 0.11 0.2 0.19 0.24 0.34 0.23 0.43 0.18 0.13 0.2 0.23 0.17 0.26 0.44 0.33 0.18 0.2 0.18 0.22 0.5 0.21 0.23 0.43 0.11 0.36 0.31 0.21 0.05 0.04 0.32 0.15 0.15 0.16 0.42 1.0 0.5 0.15 0.73 0.17 0.28 0.24 0.2 0.21 0.14 0.17 0.16 0.16
AAL00727 (spr1925)
0.07 0.07 0.27 0.22 0.25 0.19 0.15 0.09 0.12 0.15 0.1 0.12 0.05 0.02 1.0 0.23 0.09 0.09 0.09 0.09 0.19 0.27 0.15 0.09 0.26 0.05 0.04 0.03 0.07 0.09 0.06 0.09 0.1 0.09 0.19 0.06 0.22 0.21 0.87 0.22 0.03 0.13 0.12 0.11 0.13 0.11 0.16 0.03
AAL00780 (adcR)
0.13 0.11 0.06 0.06 0.09 0.24 0.18 0.18 0.21 0.13 0.13 0.13 0.2 0.26 0.18 0.25 0.18 0.2 0.18 0.21 0.18 0.15 0.18 0.18 0.32 0.31 0.26 0.25 0.05 0.06 0.23 0.11 0.11 0.11 0.2 0.39 1.0 0.23 0.59 0.21 0.29 0.21 0.22 0.19 0.13 0.12 0.16 0.29
AAL00809 (spr2007)
0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.15 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.05 0.17 0.15 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.64 0.83 0.25 0.06 0.06 0.27 0.04 0.04 0.04 0.2 0.68 0.38 0.03 0.77 0.02 1.0 0.02 0.03 0.03 0.03 0.06 0.03 0.01
AAL00811 (rplI)
0.13 0.12 0.09 0.1 0.13 0.24 0.07 0.05 0.11 0.11 0.13 0.12 0.22 0.15 0.04 0.12 0.16 0.13 0.16 0.15 0.21 0.15 0.07 0.05 0.01 0.48 0.72 0.22 0.14 0.15 0.39 0.18 0.18 0.17 0.2 0.47 1.0 0.15 0.59 0.13 0.87 0.1 0.11 0.1 0.12 0.15 0.12 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)