1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
37C
40C
6A10,THB
6A10,THB with GAL
6A10,THB with GLU
D39
D39,HPUra+
D39,Kanamycin+
D39,L-Log
GA02254
GA17457
GA41565
IU1781
IU1781,37C
IU1781,40C
L-Log,THB with Lysed horse blood,37C
PMEN3 (Spain9V-3)
PMEN3 (Spain9V-3),mitomycin+
PMEN3,37C
PMEN6,37C
R801
Rx1
Rx1,HPUra+
Rx1,Kanamycin+
Rx1,L-Log
Rx1,Log
Rx1,Log,Seconeolitsine+
Rx1,PhrA+
SP17
SP27
SRL1
ST556
TH11425
TH9063
TIGR4
TIGR4,Carolacton+
TIGR4,M-Log
TIGR4,M-Log,THB
TIGR4,M-Log,vancomycin+
TIGR4,THB
WT
XL28
XL28,IPTG+
XL29,IPTG+
XZ7022
XZ8009
XZ8015
Xen35
AAK98944 (mutR)
 0.53 0.43 0.12 0.06 0.11 0.49 0.2 0.09 0.27 0.08 0.13 0.08 0.25 0.16 0.21 0.68 0.27 0.23 0.27 0.46 0.09 0.26 0.2 0.09 0.2 0.27 0.31 0.2 0.1 0.24 1.0 0.25 0.25 0.26 0.38 0.31 0.22 0.44 0.76 0.45 0.4 0.39 0.42 0.37 0.13 0.11 0.11 0.41
AAK98974 (corA)
 0.35 0.33 0.36 0.44 0.38 0.5 0.3 0.22 0.24 0.43 0.44 0.38 0.4 0.4 0.34 1.0 0.44 0.41 0.44 0.35 0.17 0.4 0.3 0.22 0.31 0.48 0.23 0.43 0.15 0.31 0.33 0.37 0.36 0.4 0.5 0.57 0.42 0.48 0.3 0.43 0.55 0.5 0.51 0.49 0.46 0.39 0.41 0.27
AAK99044 (uppS)
 0.56 0.49 0.52 0.45 0.54 0.91 0.55 0.44 0.58 0.54 0.51 0.52 0.84 0.85 0.79 0.58 0.86 0.66 0.86 0.58 0.32 0.73 0.55 0.44 0.51 0.84 0.73 0.9 0.32 0.42 0.75 0.89 0.92 0.9 0.77 0.92 0.7 0.89 0.91 0.78 0.98 0.85 0.86 0.85 0.53 0.62 0.6 1.0
AAK99045 (cdsA)
 0.56 0.52 0.53 0.49 0.54 0.63 0.48 0.29 0.67 0.44 0.42 0.52 0.89 0.96 0.51 0.43 0.89 0.64 0.89 0.57 0.49 0.64 0.48 0.29 0.24 0.77 0.82 1.0 0.55 0.64 0.52 0.78 0.8 0.77 0.53 0.45 0.21 0.69 0.45 0.6 0.83 0.69 0.8 0.76 0.52 0.49 0.53 0.67
AAK99046 (eep)
 0.35 0.35 0.41 0.39 0.44 0.56 0.17 0.1 0.48 0.5 0.43 0.46 0.71 0.74 0.43 0.36 0.57 0.49 0.57 0.4 0.18 0.49 0.17 0.1 0.42 0.84 0.73 0.78 0.44 0.84 0.5 0.69 0.68 0.68 0.57 0.68 0.2 0.53 0.37 0.48 1.0 0.44 0.52 0.49 0.48 0.52 0.66 0.59
AAK99047 (proS)
 0.46 0.45 0.76 0.69 0.72 0.65 0.15 0.09 0.66 0.69 0.57 0.59 0.76 0.84 0.55 0.55 0.87 0.69 0.87 0.52 0.19 0.55 0.15 0.09 0.69 0.9 0.92 0.86 0.74 0.89 0.48 1.0 0.99 0.99 0.81 0.93 0.54 0.72 0.62 0.67 0.97 0.63 0.71 0.71 0.64 0.63 0.78 0.73
AAK99056 (spr0252)
 0.24 0.26 0.12 0.12 0.15 0.57 0.18 0.2 0.16 0.24 0.17 0.08 0.59 0.62 0.32 0.14 0.29 0.25 0.29 0.35 0.28 0.41 0.18 0.2 0.14 0.78 0.52 0.84 0.24 0.27 0.42 0.47 0.47 0.46 0.32 0.77 0.14 0.19 0.26 0.18 1.0 0.1 0.11 0.12 0.25 0.28 0.31 0.34
AAK99109 (mraY)
 0.37 0.4 0.19 0.17 0.24 0.42 0.08 0.08 0.32 0.43 0.32 0.36 0.69 0.83 0.4 0.38 0.46 0.34 0.46 0.26 0.13 0.4 0.08 0.08 0.22 0.79 0.43 0.95 1.0 0.27 0.65 0.59 0.58 0.57 0.42 0.74 0.25 0.38 0.17 0.37 0.72 0.35 0.38 0.38 0.33 0.42 0.22 0.34
AAK99169 (rnhB)
 0.64 0.64 0.53 0.72 0.62 0.68 0.44 0.3 0.46 0.61 0.6 0.55 0.88 0.74 0.57 0.62 0.86 0.67 0.86 0.47 0.13 0.66 0.44 0.3 0.61 0.91 0.43 0.87 0.34 1.0 0.53 0.86 0.8 0.81 0.65 0.83 0.27 0.71 0.36 0.63 0.68 0.9 1.0 0.92 0.57 0.81 0.58 0.36
AAK99224 (xylR)
 0.0 0.0 0.1 0.1 0.11 0.34 0.06 0.09 0.2 0.0 0.0 0.0 0.13 0.13 0.06 0.43 0.33 0.32 0.33 0.43 0.08 0.15 0.06 0.09 0.33 0.23 0.22 0.11 0.0 0.09 0.0 0.1 0.1 0.12 0.31 0.26 0.21 0.24 0.8 0.22 0.29 0.97 0.21 1.0 0.0 0.0 0.15 0.22
AAK99281 (spr0477)
 0.29 0.3 0.28 0.29 0.35 0.48 0.17 0.22 0.28 0.29 0.33 0.31 0.35 0.32 0.31 0.24 0.2 0.27 0.2 0.26 0.09 0.31 0.17 0.22 0.17 0.52 0.5 0.34 0.34 0.2 0.4 0.35 0.36 0.36 0.37 0.45 1.0 0.41 0.74 0.37 0.64 0.36 0.39 0.38 0.45 0.38 0.37 0.36
AAK99470 (ftsE)
 0.24 0.26 0.26 0.29 0.25 0.46 0.09 0.23 0.28 0.44 0.31 0.53 0.72 0.9 0.33 0.38 0.25 0.22 0.25 0.23 0.4 0.45 0.09 0.23 0.27 0.82 0.76 0.85 0.57 1.0 0.5 0.72 0.7 0.68 0.44 0.45 0.34 0.49 0.37 0.46 0.9 0.45 0.43 0.44 0.3 0.31 0.42 0.53
AAK99548 (pdp)
 0.56 0.55 0.49 0.4 0.55 0.53 0.06 0.09 0.47 0.82 0.64 0.58 0.61 0.67 0.35 0.46 0.41 0.38 0.41 0.49 0.49 0.39 0.06 0.09 0.21 0.85 0.71 0.7 0.73 0.71 0.79 0.79 0.74 0.75 0.37 0.37 0.75 0.52 0.63 0.45 1.0 0.29 0.35 0.34 0.42 0.89 0.58 0.77
AAK99549 (deoC)
 0.35 0.36 0.38 0.41 0.48 0.53 0.07 0.08 0.4 0.78 0.39 0.37 0.7 0.81 0.29 0.36 0.47 0.4 0.47 0.34 0.62 0.45 0.07 0.08 0.25 0.64 0.6 0.88 0.51 0.45 0.59 0.62 0.6 0.59 0.57 0.64 0.47 0.45 0.38 0.41 1.0 0.38 0.41 0.39 0.26 0.61 0.65 0.59
AAK99550 (cdd)
 0.39 0.43 0.24 0.25 0.25 0.45 0.03 0.04 0.33 0.85 0.48 0.52 0.56 0.58 0.1 0.18 0.35 0.21 0.35 0.25 0.15 0.38 0.03 0.04 0.13 0.72 0.47 0.72 0.52 0.43 0.32 0.69 0.63 0.63 0.41 0.65 0.92 0.26 0.47 0.24 1.0 0.22 0.27 0.24 0.39 0.93 0.59 0.59
AAK99610 (spr0806)
 0.0 0.0 0.17 0.18 0.16 0.34 0.05 0.14 0.17 0.0 0.0 0.0 0.51 0.57 0.14 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.32 0.05 0.14 0.29 0.45 0.23 0.54 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.46 0.12 0.1 0.29 0.08 0.8 0.11 0.13 0.12 0.0 0.0 0.0 0.22
AAK99611 (spr0807)
 0.0 0.0 0.26 0.29 0.23 0.4 0.05 0.14 0.45 0.0 0.0 0.0 0.58 0.6 0.27 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.39 0.05 0.14 0.48 0.51 0.21 0.5 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.89 0.32 0.32 0.61 0.3 0.96 0.22 0.3 0.28 0.0 0.0 0.0 0.58
AAK99727 (bltD)
 0.24 0.19 0.0 0.0 0.0 0.4 0.34 0.46 0.3 0.28 0.0 0.0 0.57 0.5 0.26 0.61 0.0 0.0 0.0 0.2 0.94 0.43 0.34 0.46 0.14 0.59 0.37 0.59 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.66 0.77 0.47 0.46 0.44 0.8 0.45 0.5 0.49 0.0 0.0 0.0 1.0
AAK99785 (cpoA)
 0.53 0.54 0.32 0.46 0.45 0.67 0.12 0.18 0.3 0.54 0.44 0.46 0.71 0.69 0.35 0.31 0.44 0.39 0.44 0.45 0.28 0.52 0.12 0.18 0.19 0.91 0.92 0.84 0.62 0.58 1.0 0.62 0.63 0.6 0.53 0.79 0.37 0.6 0.36 0.55 0.84 0.42 0.48 0.44 0.34 0.66 0.45 0.59
AAK99786 (spr0982)
 0.8 0.85 0.5 0.7 0.65 0.59 0.08 0.1 0.56 0.66 0.65 0.65 0.69 0.6 0.39 0.48 0.58 0.52 0.58 0.63 0.56 0.53 0.08 0.1 0.23 0.62 0.89 0.69 1.0 0.81 0.83 0.82 0.82 0.8 0.55 0.59 0.57 0.8 0.42 0.72 0.8 0.58 0.68 0.62 0.5 0.84 0.67 0.92
AAK99842 (spr1038)
 0.01 0.01 0.04 0.05 0.04 0.32 0.11 0.23 0.22 0.09 0.07 0.01 0.82 0.84 0.26 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.38 0.11 0.23 0.28 0.5 0.2 1.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.01 0.01 0.28 0.88 0.33 0.02 0.33 0.03 0.99 0.27 0.24 0.24 0.02 0.02 0.0 0.2
AAK99886 (pphA)
 0.51 0.66 0.34 0.36 0.39 0.4 0.06 0.12 0.45 0.58 0.55 0.7 0.54 0.66 0.45 0.35 0.36 0.24 0.36 0.27 0.64 0.47 0.06 0.12 0.38 0.57 0.54 0.66 0.58 0.62 0.33 0.55 0.52 0.52 0.34 0.34 0.23 0.37 0.09 0.35 1.0 0.31 0.39 0.39 0.56 0.55 0.44 0.46
AAK99887 (recN)
 0.46 0.57 0.3 0.3 0.34 0.38 0.04 0.08 0.41 0.47 0.5 0.59 0.51 0.55 0.38 0.33 0.32 0.24 0.32 0.29 0.8 0.41 0.04 0.08 0.27 0.65 0.65 0.59 0.49 0.56 0.38 0.48 0.48 0.47 0.3 0.35 0.32 0.3 0.12 0.28 1.0 0.26 0.33 0.33 0.49 0.5 0.37 0.51
AAK99888 (ahrC)
 0.71 0.8 0.38 0.34 0.41 0.62 0.07 0.16 0.56 0.73 0.86 0.86 0.68 0.69 0.4 0.5 0.39 0.35 0.39 0.43 0.7 0.5 0.07 0.16 0.2 0.92 0.92 0.67 0.74 0.87 0.48 0.82 0.77 0.73 0.45 0.43 0.28 0.46 0.16 0.44 1.0 0.33 0.45 0.45 0.78 0.96 0.72 0.86
AAK99889 (spr1086)
 0.37 0.44 0.27 0.29 0.35 0.35 0.06 0.12 0.28 0.37 0.44 0.5 0.36 0.37 0.34 0.31 0.24 0.2 0.24 0.28 1.0 0.31 0.06 0.12 0.18 0.55 0.66 0.45 0.89 0.76 0.34 0.39 0.37 0.37 0.24 0.25 0.32 0.31 0.14 0.3 0.86 0.22 0.27 0.27 0.37 0.47 0.31 0.5
AAK99890 (ispA)
 0.65 0.79 0.42 0.37 0.53 0.48 0.04 0.07 0.6 0.62 0.57 0.71 0.57 0.55 0.5 0.46 0.44 0.35 0.44 0.47 0.74 0.45 0.04 0.07 0.25 0.69 0.81 0.65 0.72 0.72 0.57 0.65 0.64 0.64 0.37 0.38 0.37 0.48 0.18 0.46 1.0 0.38 0.47 0.48 0.54 0.69 0.56 0.76
AAK99892 (xseA)
 0.48 0.51 0.31 0.27 0.36 0.48 0.01 0.04 0.35 0.53 0.47 0.59 0.55 0.61 0.42 0.35 0.29 0.24 0.29 0.37 0.52 0.36 0.01 0.04 0.2 0.6 0.52 0.72 0.5 0.48 0.56 0.46 0.42 0.43 0.36 0.44 0.37 0.35 0.21 0.34 1.0 0.24 0.3 0.29 0.46 0.58 0.47 0.44
AAK99901 (srtA)
 0.22 0.25 0.15 0.11 0.12 0.32 0.05 0.12 0.3 0.4 0.38 0.52 0.71 0.82 0.44 0.28 0.32 0.27 0.32 0.25 0.26 0.38 0.05 0.12 0.12 0.68 0.42 0.78 0.93 0.77 0.36 0.94 0.89 0.9 0.36 0.53 0.29 0.33 0.36 0.31 1.0 0.32 0.35 0.34 0.38 0.41 0.49 0.27
AAK99904 (spr1101)
 0.0 0.0 0.26 0.33 0.38 0.4 0.08 0.15 0.62 0.0 0.53 0.0 0.5 0.48 0.26 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.33 0.08 0.15 0.49 0.58 0.62 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.83 0.38 0.48 0.73 0.45 1.0 0.33 0.35 0.34 0.49 0.37 0.0 0.38
AAK99905 (spr1102)
 0.0 0.0 0.17 0.18 0.18 0.4 0.13 0.22 0.52 0.0 0.51 0.0 0.5 0.49 0.24 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.35 0.13 0.22 0.19 0.62 0.53 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 1.0 0.55 0.45 0.71 0.41 0.97 0.34 0.38 0.35 0.42 0.31 0.0 0.41
AAL00068 (nagD)
 0.64 0.75 0.55 0.55 0.66 0.54 0.07 0.06 0.8 0.75 0.59 0.63 0.75 0.78 0.53 0.35 0.45 0.35 0.45 0.46 0.62 0.53 0.07 0.06 0.88 0.77 0.57 0.88 0.55 1.0 0.29 0.76 0.75 0.75 0.46 0.62 0.23 0.56 0.46 0.49 1.0 0.43 0.48 0.45 0.49 0.81 0.74 0.37
AAL00069 (spr1265)
 0.52 0.62 0.38 0.37 0.42 0.45 0.07 0.09 0.61 0.65 0.49 0.5 0.77 0.92 0.31 0.24 0.38 0.29 0.38 0.37 0.49 0.55 0.07 0.09 0.47 0.46 0.37 1.0 0.36 0.82 0.38 0.68 0.69 0.67 0.33 0.35 0.28 0.4 0.49 0.34 0.82 0.34 0.44 0.38 0.43 0.64 0.51 0.36
AAL00228 (spr1424)
 0.45 0.53 0.4 0.53 0.49 0.59 0.07 0.07 0.47 0.91 0.58 0.73 0.73 0.91 0.3 0.29 0.45 0.39 0.45 0.44 0.42 0.47 0.07 0.07 0.55 0.83 0.83 0.92 0.98 0.94 0.33 0.53 0.49 0.47 0.37 0.48 0.23 0.36 0.43 0.35 1.0 0.27 0.35 0.33 0.42 0.84 0.64 0.44
AAL00391 (spr1588)
 0.57 0.65 0.29 0.39 0.52 0.58 0.14 0.08 0.45 0.46 0.41 0.45 0.55 0.61 0.25 0.56 0.47 0.36 0.47 0.54 0.23 0.39 0.14 0.08 0.24 0.82 1.0 0.7 0.95 0.84 1.0 0.5 0.49 0.47 0.55 0.84 0.49 0.61 0.44 0.54 0.78 0.28 0.37 0.32 0.3 0.58 0.57 0.65
AAL00394 (spr1591)
 0.41 0.48 0.29 0.38 0.43 0.45 0.07 0.08 0.34 0.49 0.27 0.47 0.64 0.67 0.21 0.33 0.43 0.31 0.43 0.3 0.51 0.43 0.07 0.08 0.44 0.75 0.65 0.8 0.73 0.82 0.3 0.49 0.5 0.49 0.33 0.4 0.33 0.4 0.33 0.35 1.0 0.29 0.35 0.33 0.16 0.4 0.4 0.45
AAL00415 (spr1612)
 0.55 0.59 0.19 0.21 0.16 0.31 0.05 0.03 0.27 0.17 0.31 0.13 0.74 0.66 0.24 0.15 0.33 0.38 0.33 0.38 0.29 0.44 0.05 0.03 0.34 0.73 0.2 1.0 0.4 0.36 0.38 0.21 0.21 0.19 0.2 0.38 0.07 0.13 0.13 0.1 0.76 0.23 0.25 0.24 0.28 0.18 0.21 0.1
AAL00493 (spr1690)
 0.34 0.43 0.25 0.3 0.42 0.34 0.11 0.07 0.31 0.64 0.43 0.44 0.56 0.64 0.27 0.21 0.31 0.18 0.31 0.3 0.5 0.46 0.11 0.07 0.39 0.75 0.45 0.66 0.35 0.44 0.27 0.31 0.3 0.3 0.3 0.43 0.35 0.41 0.38 0.37 1.0 0.2 0.27 0.23 0.31 0.56 0.42 0.28
AAL00494 (spr1691)
 0.29 0.36 0.25 0.31 0.43 0.31 0.05 0.03 0.28 0.52 0.4 0.35 0.79 1.0 0.23 0.23 0.25 0.19 0.25 0.27 0.47 0.5 0.05 0.03 0.35 0.6 0.37 0.98 0.32 0.38 0.14 0.23 0.23 0.23 0.29 0.39 0.2 0.33 0.25 0.29 0.88 0.16 0.21 0.18 0.26 0.49 0.38 0.27
AAL00562 (lytR)
 0.22 0.22 0.24 0.17 0.22 0.51 0.14 0.18 0.34 0.57 0.52 0.65 0.57 0.64 0.44 0.41 0.27 0.28 0.27 0.27 0.14 0.54 0.14 0.18 0.1 0.68 0.68 0.91 0.26 0.24 0.59 0.61 0.6 0.61 0.46 0.78 0.4 0.41 0.55 0.42 1.0 0.37 0.37 0.36 0.45 0.57 0.55 0.48
AAL00609 (spr1806)
 0.19 0.14 0.19 0.16 0.14 0.57 0.22 0.24 0.07 0.09 0.09 0.06 0.36 0.36 0.15 0.5 0.05 0.1 0.05 0.18 0.06 0.35 0.22 0.24 0.17 0.68 0.77 0.37 0.13 0.06 0.94 0.09 0.1 0.09 0.45 1.0 0.74 0.34 0.28 0.29 0.4 0.5 0.53 0.5 0.13 0.09 0.13 0.35
AAL00711 (pbp1b)
 0.28 0.27 0.25 0.19 0.25 0.4 0.25 0.18 0.33 0.41 0.38 0.46 0.56 0.6 0.52 0.41 0.41 0.3 0.41 0.36 0.2 0.37 0.25 0.18 0.3 0.7 0.41 0.72 0.49 0.65 0.59 0.6 0.58 0.6 0.41 0.6 0.3 0.49 0.43 0.47 1.0 0.48 0.49 0.47 0.38 0.49 0.42 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)