1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
25RC,0.25% glucose
3RC,0.25% glucose
58RC,0.25% glucose
ATCC 29212,0% glucose
ATCC 29212,0.15% glucose
ATCC 29212,0.25% glucose
ATCC 29212,15min
ATCC 29212,ampicillin,15min
ATCC 29212,bacitracin,15min
ATCC 29212,chloramphenicol,15min
ATCC 29212,erythromycin,15min
ATCC 29212,kanamycin,15min
ATCC 29212,lincomycin,15min
ATCC 29212,ofloxacin,15min
ATCC 33186,TSB
ATCC 33186,pH10
EF16C185,37C,4h,20mlMH
EF16C185-O2,37C,4h,20mlMH
F4,37C,4h,20mlMH
F4-11,37C,4h,20mlMH
OG1RF
OG1RF,(p)ppGpp0
OG1RF,(p)ppGpp0 codY-KO
OG1RF,Untreated,0min
OG1RF,Untreated,10min
OG1RF,Untreated,20min
OG1RF,Untreated,40min
OG1RF,WT
OG1RF,cellobiose
OG1RF,clpP-KO
OG1RF,gentiobiose
OG1RF,glucose
OG1RF,pCF10
OG1RF,pCIE
OG1RF,pDAK1010A,highFstpAD1
OG1RF,pDAK1010E,highFstEF0409
OG1RF,pDAK1010E,lowFstEF0409
OG1RF,phageVPE25,0min
OG1RF,phageVPE25,10min
OG1RF,phageVPE25,20min
V649,LVX
V649,Untreated
V649,pGR-IS256
V649,pGR-tetM
AEA92694 (rpsF)
 0.16 0.12 0.12 0.04 0.16 0.23 0.6 0.58 0.38 0.5 1.0 0.56 0.45 0.55 0.33 0.76 0.51 0.2 0.03 0.22 0.4 0.52 0.58 0.52 0.38 0.67 0.56 0.4 0.55 0.21 0.58 0.5 0.46 0.97 0.86 0.83 1.0 0.4 0.28 0.28 0.36 0.81 0.46 0.33
AEA92778 (OG1RF_10091)
 0.18 0.14 0.14 0.1 0.85 0.73 0.82 0.84 0.63 0.55 0.63 0.89 0.43 1.0 0.37 0.27 0.16 0.04 0.13 0.34 0.06 0.38 0.29 0.31 0.1 0.12 0.28 0.12 0.13 0.37 0.1 0.12 0.2 0.48 0.83 0.5 0.6 0.24 0.14 0.1 0.38 0.26 0.2 0.18
AEA92831 (rpsL)
 0.39 0.29 0.26 0.06 0.72 0.63 0.68 0.67 0.47 0.73 0.66 0.6 0.82 0.6 0.33 0.84 0.6 0.28 0.04 0.35 0.79 0.75 0.75 0.66 0.61 0.48 0.83 0.53 0.58 0.3 0.55 0.41 0.44 0.99 0.78 0.63 0.88 0.34 0.34 0.3 0.43 1.0 0.7 0.28
AEA92832 (rpsG)
 0.35 0.29 0.27 0.05 0.63 0.56 0.8 0.77 0.57 0.93 0.77 0.68 1.0 0.69 0.31 0.69 0.48 0.24 0.04 0.3 0.7 0.45 0.48 0.81 0.77 0.67 0.99 0.47 0.52 0.33 0.59 0.39 0.35 0.68 0.52 0.44 0.61 0.56 0.49 0.42 0.31 0.68 0.51 0.22
AEA92833 (fusA)
 0.17 0.15 0.13 0.03 0.62 0.42 0.84 0.85 0.63 0.93 0.76 0.74 1.0 0.74 0.35 0.56 0.46 0.2 0.05 0.34 0.64 0.41 0.42 0.47 0.47 0.43 0.55 0.3 0.44 0.14 0.62 0.35 0.39 0.7 0.5 0.44 0.59 0.46 0.35 0.29 0.28 0.56 0.46 0.21
AEA92839 (rplD)
 0.1 0.04 0.04 0.01 0.06 0.11 0.97 0.95 0.76 0.95 1.0 0.83 0.79 0.87 0.34 0.65 0.34 0.18 0.03 0.16 0.21 0.12 0.11 0.22 0.18 0.18 0.26 0.23 0.17 0.22 0.34 0.13 0.27 0.43 0.28 0.28 0.36 0.16 0.13 0.13 0.32 0.61 0.32 0.3
AEA92853 (rplF)
 0.15 0.08 0.08 0.01 0.08 0.15 0.78 0.79 0.56 0.95 0.88 0.68 1.0 0.71 0.33 0.59 0.35 0.12 0.02 0.16 0.15 0.19 0.2 0.46 0.33 0.27 0.31 0.27 0.23 0.31 0.4 0.17 0.23 0.41 0.26 0.26 0.32 0.39 0.28 0.24 0.26 0.56 0.33 0.27
AEA92855 (rpsE)
 0.13 0.05 0.04 0.0 0.09 0.13 0.74 0.74 0.57 0.98 0.92 0.66 1.0 0.7 0.27 0.53 0.3 0.14 0.02 0.21 0.06 0.18 0.2 0.56 0.4 0.23 0.38 0.26 0.34 0.31 0.4 0.28 0.23 0.41 0.24 0.24 0.31 0.32 0.26 0.24 0.24 0.55 0.31 0.23
AEA92865 (rplQ)
 0.09 0.09 0.08 0.04 0.11 0.12 0.76 0.7 0.49 1.0 0.53 0.71 0.78 0.73 0.19 0.44 0.21 0.07 0.03 0.22 0.2 0.42 0.47 0.23 0.18 0.2 0.21 0.24 0.22 0.14 0.26 0.17 0.27 0.49 0.46 0.41 0.47 0.29 0.19 0.16 0.22 0.41 0.26 0.18
AEA92879 (OG1RF_10192)
 0.03 0.06 0.05 0.06 0.1 0.09 0.21 0.19 0.11 0.17 0.11 0.24 0.11 0.24 0.26 0.47 1.0 0.11 0.05 0.16 0.04 0.19 0.17 0.02 0.02 0.03 0.06 0.33 0.16 0.33 0.13 0.32 0.24 0.33 0.3 0.33 0.33 0.04 0.03 0.04 0.12 0.11 0.06 0.04
AEA92914 (fabZ)
 0.1 0.38 0.4 0.08 0.14 0.19 0.66 0.68 0.88 0.51 0.59 0.71 0.46 0.73 0.6 0.42 0.46 0.72 0.37 0.81 0.03 0.16 0.18 0.16 0.33 0.37 0.27 0.33 0.59 0.41 0.36 1.0 0.48 0.35 0.27 0.6 0.38 0.25 0.23 0.26 0.28 0.24 0.16 0.12
AEA93049 (morA)
 0.66 0.6 0.51 0.56 0.29 0.39 0.19 0.15 0.25 0.16 0.18 0.18 0.22 0.21 0.53 0.13 0.78 0.85 0.1 0.2 0.17 0.59 0.59 0.54 0.54 0.35 0.63 0.45 0.34 0.51 0.35 0.48 1.0 0.82 0.55 0.59 0.73 0.42 0.57 0.51 0.31 0.17 0.13 0.11
AEA93054 (OG1RF_10367)
 0.19 0.59 0.59 0.01 0.49 0.54 0.08 0.06 0.06 0.06 0.11 0.06 0.05 0.09 0.38 0.0 1.0 0.07 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.21 0.17 0.51 0.18 0.08 0.02 0.4 0.01 0.02 0.08 0.29 0.17 0.44 0.34 0.56 0.32 0.26 0.71 0.12 0.12 0.05
AEA93055 (OG1RF_10368)
 0.21 0.98 1.0 0.01 0.86 0.89 0.08 0.05 0.05 0.07 0.12 0.07 0.05 0.1 0.24 0.0 0.88 0.04 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.21 0.16 0.41 0.21 0.08 0.02 0.46 0.02 0.02 0.07 0.23 0.17 0.42 0.34 0.73 0.47 0.4 0.84 0.1 0.12 0.06
AEA93139 (tig)
 0.25 0.34 0.33 1.0 0.38 0.28 0.41 0.44 0.43 0.4 0.39 0.39 0.24 0.4 0.21 0.3 0.43 0.41 0.15 0.25 0.42 0.38 0.32 0.53 0.69 0.62 0.49 0.25 0.33 0.22 0.3 0.35 0.5 0.66 0.37 0.45 0.57 0.39 0.44 0.41 0.23 0.41 0.22 0.23
AEA93274 (OG1RF_10587)
 0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.09 0.37 0.36 0.34 0.31 0.29 0.5 0.33 0.5 0.36 0.03 0.42 0.25 0.13 0.2 0.13 0.77 0.53 0.12 0.12 0.26 0.21 0.28 0.22 0.14 0.1 0.25 0.94 1.0 0.58 0.77 0.75 0.08 0.05 0.08 0.23 0.28 0.26 0.2
AEA93312 (OG1RF_10625)
 0.16 0.26 0.28 0.42 0.29 0.18 0.51 0.52 0.49 0.36 0.38 0.5 0.34 0.48 0.32 0.2 0.33 0.64 0.29 0.46 0.13 0.2 0.19 0.24 0.42 0.43 0.4 0.36 0.37 0.36 0.25 0.46 0.65 1.0 0.7 0.82 0.78 0.2 0.22 0.21 0.27 0.3 0.22 0.21
AEA93363 (pta)
 0.12 0.17 0.15 0.05 0.2 0.34 0.58 0.63 0.49 0.5 0.48 0.64 0.43 0.61 0.27 0.24 0.4 1.0 0.15 0.62 0.14 0.4 0.19 0.39 0.41 0.5 0.6 0.24 0.58 0.16 0.37 0.46 0.49 0.44 0.17 0.24 0.31 0.38 0.39 0.4 0.12 0.21 0.15 0.06
AEA93390 (rplU)
 0.08 0.14 0.13 0.01 0.22 0.23 0.46 0.47 0.36 0.53 1.0 0.45 0.55 0.46 0.28 0.92 0.36 0.12 0.02 0.18 0.15 0.29 0.26 0.38 0.31 0.36 0.42 0.37 0.34 0.22 0.25 0.35 0.19 0.53 0.48 0.41 0.52 0.22 0.19 0.21 0.26 0.49 0.6 0.32
AEA93391 (OG1RF_10704)
 0.11 0.22 0.21 0.01 0.25 0.3 0.44 0.39 0.25 0.48 1.0 0.38 0.47 0.4 0.24 0.5 0.27 0.09 0.02 0.16 0.19 0.32 0.3 0.46 0.39 0.45 0.59 0.37 0.42 0.21 0.27 0.45 0.18 0.32 0.28 0.24 0.31 0.33 0.28 0.32 0.19 0.37 0.44 0.23
AEA93531 (OG1RF_10844)
 0.47 0.35 0.38 0.58 0.34 0.61 0.47 0.46 0.77 0.56 0.42 0.5 0.45 0.52 0.46 0.5 0.68 0.39 0.19 0.28 0.41 0.47 0.45 0.28 0.69 0.77 0.43 0.38 0.92 0.62 0.37 0.53 0.97 0.65 0.68 0.93 1.0 0.22 0.39 0.57 0.51 0.29 0.46 0.34
AEA93556 (OG1RF_10869)
 0.29 0.31 0.29 0.01 0.04 0.07 0.55 0.59 0.61 0.45 0.54 0.45 0.36 0.51 0.07 0.12 0.19 0.3 0.01 0.24 0.04 0.3 0.19 0.23 0.26 0.41 0.6 0.14 0.06 0.15 0.23 0.09 1.0 0.14 0.05 0.07 0.07 0.22 0.23 0.24 0.09 0.1 0.2 0.08
AEA93557 (OG1RF_10870)
 0.29 0.31 0.3 0.01 0.04 0.06 0.51 0.54 0.58 0.42 0.52 0.41 0.33 0.46 0.08 0.13 0.19 0.47 0.01 0.29 0.03 0.22 0.14 0.22 0.19 0.27 0.52 0.12 0.06 0.13 0.41 0.07 1.0 0.13 0.05 0.08 0.08 0.23 0.22 0.2 0.08 0.08 0.17 0.07
AEA93558 (OG1RF_10871)
 0.28 0.59 0.6 0.01 0.06 0.06 0.39 0.42 0.44 0.34 0.41 0.33 0.26 0.37 0.08 0.12 0.26 0.84 0.03 0.46 0.02 0.21 0.13 0.22 0.15 0.19 0.44 0.15 0.12 0.17 0.65 0.19 1.0 0.13 0.05 0.09 0.09 0.29 0.26 0.22 0.07 0.08 0.15 0.05
AEA93705 (OG1RF_11018)
 0.19 0.21 0.19 0.27 0.08 0.21 0.61 0.63 0.35 0.61 0.5 0.79 0.69 0.82 0.44 1.0 0.16 0.05 0.09 0.12 0.16 0.03 0.04 0.16 0.74 0.5 0.28 0.15 0.94 0.25 0.16 0.6 0.51 0.74 0.41 0.48 0.7 0.09 0.35 0.43 0.4 0.56 0.6 0.28
AEA93732 (OG1RF_11045)
 0.28 0.27 0.25 0.24 0.39 0.46 0.74 0.69 0.52 0.51 0.64 1.0 0.56 0.75 0.45 0.68 0.1 0.04 0.04 0.1 0.38 0.08 0.07 0.12 0.23 0.37 0.26 0.16 0.32 0.26 0.11 0.29 0.51 0.21 0.27 0.29 0.21 0.35 0.49 0.41 0.24 0.21 0.27 0.38
AEA93828 (pdhA)
 0.18 0.11 0.1 1.0 0.34 0.1 0.56 0.61 0.46 0.76 0.42 0.55 0.35 0.53 0.36 0.18 0.18 0.76 0.21 0.26 0.48 0.43 0.1 0.74 0.77 0.31 0.19 0.2 0.73 0.34 0.31 0.17 0.34 0.38 0.18 0.22 0.28 0.33 0.52 0.43 0.25 0.26 0.27 0.09
AEA93829 (pdhB)
 0.23 0.16 0.14 0.61 0.35 0.11 0.56 0.62 0.48 0.78 0.45 0.54 0.34 0.53 0.43 0.14 0.16 1.0 0.58 0.72 0.38 0.17 0.03 0.66 0.9 0.39 0.21 0.14 0.52 0.3 0.32 0.14 0.32 0.29 0.12 0.17 0.17 0.37 0.62 0.5 0.28 0.21 0.33 0.11
AEA93830 (aceF)
 0.22 0.17 0.15 0.32 0.26 0.12 0.74 0.76 0.58 1.0 0.65 0.68 0.43 0.66 0.58 0.19 0.14 0.62 0.42 0.8 0.38 0.25 0.04 0.47 0.78 0.35 0.2 0.13 0.31 0.24 0.29 0.11 0.3 0.31 0.12 0.15 0.15 0.26 0.47 0.4 0.31 0.22 0.45 0.13
AEA93831 (lpd)
 0.22 0.26 0.26 0.09 0.18 0.11 0.48 0.5 0.39 0.6 0.44 0.45 0.26 0.45 0.5 0.1 0.16 0.97 0.69 1.0 0.22 0.17 0.03 0.36 0.83 0.41 0.24 0.12 0.2 0.23 0.25 0.09 0.18 0.23 0.08 0.09 0.11 0.25 0.53 0.46 0.22 0.14 0.33 0.1
AEA93842 (cspA)
 0.1 0.18 0.17 0.01 0.11 0.16 0.75 0.73 0.54 0.75 0.57 0.84 0.9 0.85 0.05 0.21 1.0 0.36 0.03 0.21 0.56 0.21 0.31 0.16 0.22 0.2 0.11 0.38 0.45 0.32 0.03 0.3 0.24 0.27 0.22 0.2 0.3 0.13 0.1 0.08 0.08 0.49 0.21 0.08
AEA93913 (yitW)
 0.55 0.3 0.27 0.38 0.31 0.28 0.87 0.91 0.99 0.55 0.4 0.93 0.45 1.0 0.29 0.61 0.47 0.13 0.04 0.07 0.67 0.12 0.1 0.29 0.22 0.32 0.22 0.22 0.52 0.31 0.23 0.28 0.62 0.48 0.45 0.39 0.44 0.17 0.16 0.15 0.25 0.3 0.21 0.21
AEA93992 (ndh)
 0.22 0.26 0.24 0.03 0.03 0.13 0.11 0.12 0.13 0.08 0.08 0.11 0.08 0.11 0.06 0.2 0.28 1.0 0.61 0.47 0.48 0.02 0.02 0.23 0.81 0.84 0.19 0.09 0.26 0.28 0.1 0.09 0.04 0.15 0.1 0.11 0.11 0.14 0.22 0.28 0.1 0.13 0.22 0.26
AEA94093 (OG1RF_11406)
 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.04 0.76 0.76 0.43 0.89 0.47 0.86 0.58 0.83 0.12 0.21 0.43 0.27 0.05 0.65 0.64 0.06 0.06 0.22 0.22 0.3 0.27 0.09 1.0 0.11 0.33 0.88 0.29 0.45 0.18 0.24 0.33 0.22 0.15 0.11 0.05 0.21 0.1 0.05
AEA94094 (rpsP)
 0.1 0.04 0.04 0.02 0.03 0.12 0.62 0.62 0.4 0.78 0.53 0.62 0.54 0.64 0.23 0.33 0.63 0.37 0.05 1.0 0.97 0.25 0.33 0.64 0.61 0.68 0.77 0.37 0.88 0.34 0.38 0.79 0.42 0.81 0.44 0.55 0.75 0.53 0.39 0.27 0.09 0.42 0.18 0.09
AEA94331 (ackA)
 0.26 0.32 0.33 0.4 0.31 0.31 0.78 0.83 0.76 0.69 0.66 0.77 0.44 0.75 0.31 0.33 0.63 1.0 0.29 0.72 0.31 0.41 0.21 0.39 0.56 0.63 0.87 0.27 0.69 0.25 0.63 0.93 0.47 0.42 0.19 0.29 0.32 0.62 0.64 0.57 0.3 0.32 0.27 0.21
AEA94372 (OG1RF_11685)
 0.06 0.02 0.03 0.0 0.06 0.04 0.63 0.53 0.46 0.67 0.42 1.0 0.47 0.85 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.07 0.22 0.11
AEA94534 (OG1RF_11847)
 0.2 0.52 0.54 0.11 0.47 0.45 0.75 0.78 0.73 0.66 0.51 0.76 0.61 0.74 0.41 0.28 0.38 0.3 0.14 0.37 0.25 0.36 0.29 0.28 0.36 0.56 0.36 0.37 0.87 0.38 0.3 1.0 0.78 0.87 0.6 0.65 0.62 0.42 0.37 0.33 0.54 0.52 0.72 0.45
AEA94543 (pgcA)
 0.23 0.16 0.14 0.28 0.24 0.34 0.38 0.37 0.65 0.32 0.29 0.36 0.21 0.35 0.54 0.56 0.65 1.0 0.23 0.67 0.29 0.55 0.38 0.57 0.67 0.76 0.62 0.4 0.6 0.56 0.57 0.68 0.6 0.37 0.34 0.44 0.4 0.68 0.65 0.59 0.44 0.44 0.43 0.46
AEA94557 (uppP)
 0.16 0.33 0.3 0.01 0.38 0.31 0.4 0.36 0.53 0.3 0.45 0.39 0.33 0.43 0.21 1.0 0.32 0.09 0.05 0.08 0.13 0.27 0.29 0.19 0.39 0.89 0.48 0.17 0.37 0.12 0.2 0.43 0.32 0.41 0.31 0.43 0.45 0.22 0.27 0.33 0.5 0.53 0.55 0.48
AEA94561 (rpsT)
 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.05 0.46 0.51 0.47 0.42 0.29 0.52 0.38 0.51 0.12 0.19 0.18 0.1 0.05 0.21 0.2 0.06 0.05 0.11 0.16 0.33 0.2 0.06 0.49 0.06 0.11 0.52 0.57 1.0 0.57 0.69 0.86 0.06 0.06 0.06 0.11 0.19 0.14 0.1
AEA94617 (OG1RF_11930)
 0.39 0.39 0.37 0.38 0.29 0.65 0.15 0.11 0.14 0.17 0.14 0.19 0.22 0.21 0.4 0.1 0.08 0.04 0.05 0.04 0.47 0.39 0.53 0.09 0.15 0.12 0.06 0.33 0.99 0.26 0.26 0.65 1.0 0.56 0.65 0.79 0.72 0.07 0.09 0.1 0.58 0.22 0.19 0.22
AEA94683 (secG)
 0.1 0.2 0.2 0.24 0.28 0.39 0.63 0.5 0.5 0.61 0.5 0.75 0.81 0.67 0.25 0.43 0.41 0.19 0.19 0.17 0.5 0.3 0.28 0.32 0.28 0.45 0.26 0.28 0.17 0.28 0.23 0.13 1.0 0.94 0.66 0.72 0.91 0.36 0.27 0.23 0.57 0.71 0.38 0.35
AEA94877 (OG1RF_12190)
 0.25 0.6 0.62 0.19 0.26 0.3 0.69 0.61 1.0 0.76 0.55 0.77 0.73 0.78 0.29 0.22 0.98 0.62 0.19 0.36 0.2 0.33 0.31 0.14 0.23 0.29 0.25 0.19 0.23 0.16 0.19 0.2 0.44 0.58 0.42 0.56 0.63 0.18 0.23 0.22 0.28 0.3 0.23 0.2
AEA94890 (OG1RF_12203)
 0.29 0.26 0.26 0.7 0.47 0.24 0.34 0.37 0.29 0.23 0.36 0.34 0.18 0.3 0.13 0.15 0.57 1.0 0.34 0.54 0.37 0.26 0.16 0.34 0.52 0.73 0.64 0.29 0.31 0.27 0.7 0.31 0.31 0.21 0.13 0.15 0.18 0.42 0.51 0.55 0.36 0.3 0.28 0.26
AEA95022 (rpsO)
 0.06 0.15 0.16 0.02 0.19 0.17 0.76 0.76 0.62 0.8 0.54 0.81 0.68 0.8 0.18 0.52 1.0 0.38 0.04 0.39 0.29 0.2 0.12 0.22 0.19 0.24 0.23 0.15 0.62 0.15 0.16 0.61 0.39 0.75 0.77 0.72 0.83 0.15 0.14 0.13 0.41 0.71 0.47 0.36
AEA95067 (rpmB2)
 0.08 0.11 0.13 0.13 0.26 0.2 0.47 0.41 0.35 0.38 0.54 0.5 0.36 0.49 0.27 0.48 0.2 0.22 0.43 0.3 0.68 0.22 0.34 0.1 0.12 0.25 0.2 0.09 0.08 0.02 0.06 0.07 0.72 1.0 0.56 0.74 0.96 0.08 0.06 0.07 0.58 0.44 0.38 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)