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Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
BW25113,25m,0.13uM colistin
BW25113,25m,0.25uM polymyxineB
BW25113,25m,0.75uM ceftriaxone
BW25113,25m,0.75uM doxycycline
BW25113,25m,0.75uM levofloxacin
BW25113,25m,0.78uM meropenem
BW25113,25m,100uM nitroxolin
BW25113,25m,1uM ceftriaxone
BW25113,25m,1uM norfloxacin
BW25113,25m,25uM chloramphenicol
BW25113,25m,25uM globomycin
BW25113,25m,50uM clarithromycin
BW25113,25m,50uM nitrofurantoin
BW25113,25m,50uM trimethoprim
BW25113,25m,5uM mecillinam
BW25113,25m,DMSO
MG1655,WT,0m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,WT,0m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,WT,10m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,WT,15m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,WT,2m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,WT,2m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,WT,4m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,WT,4m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,WT,6m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,WT,6m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,WT,8m,Post-rfp kasugamycin(+)
MG1655,[A] mut,0m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,[A] mut,10m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,[A] mut,2m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,[A] mut,4m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,[A] mut,6m,Post-rfp kasugamycin(-)
MG1655,[A] mut,8m,Post-rfp kasugamycin(-)
WO153,M-log,actinomycin-d
WO153,M-log,bacitracin
WO153,M-log,cefotaxime
WO153,M-log,ceftriaxone
WO153,M-log,cerulenin
WO153,M-log,chloramphenicol
WO153,M-log,ciprofloxacin
WO153,M-log,colistin
WO153,M-log,d-cycloserine
WO153,M-log,dmso
WO153,M-log,doxorubicin
WO153,M-log,doxycycline
WO153,M-log,erythromycin
WO153,M-log,ethanol
WO153,M-log,fidaxomicin
WO153,M-log,flavomycin
WO153,M-log,gentamicin
WO153,M-log,isoniazid
WO153,M-log,levofloxacin
WO153,M-log,linezolid
WO153,M-log,meropenem
WO153,M-log,metronidazole
WO153,M-log,monactin
WO153,M-log,nalidixic-acid
WO153,M-log,naoh
WO153,M-log,norfloxacin
WO153,M-log,novobiocin
WO153,M-log,penicillin
WO153,M-log,phosphomycin
WO153,M-log,polymyxin
WO153,M-log,rachelmycin
WO153,M-log,ramoplanin
WO153,M-log,retapamulin
WO153,M-log,rifampicin
WO153,M-log,rifapentine
WO153,M-log,streptomycin
WO153,M-log,sulfacetamide
WO153,M-log,sulfamethoxazole
WO153,M-log,teicoplanin
WO153,M-log,teixobactin
WO153,M-log,tetracycline
WO153,M-log,thiostrepton
WO153,M-log,triclosan
WO153,M-log,trimethoprim
WO153,M-log,valinomycin
WO153,M-log,vancomycin
WO153,M-log,water
WO153,M-log,zeocin
AAC73166 (djlA)
 -0.12 -0.14 -0.18 -0.25 -0.19 -0.02 -0.13 -0.05 0.04 -0.43 0.14 1.06 -0.05 -0.28 -0.05 -0.11 -1.01 -1.51 -5.39 -4.87 -2.28 -3.17 -3.18 -5.27 -4.08 -7.53 -4.47 0.02 -1.97 -0.55 -1.02 -1.27 -1.69 0.83 -0.01 0.43 0.19 0.5 -0.15 0.43 0.5 0.47 0.39 -0.8 0.36 0.83 0.05 0.6 0.05 0.16 0.39 0.9 0.16 0.41 0.45 0.51 0.3 0.34 0.67 -0.31 0.32 0.47 0.55 -0.03 0.12 0.15 0.01 0.32 0.34 0.46 -0.46 0.37 0.2 0.32 -0.32 0.52 0.69 0.43 0.28 0.18 0.7
AAC73253 (folK)
 0.94 0.67 1.17 0.72 0.59 1.2 -1.29 0.92 0.6 -1.63 0.74 -0.09 -0.55 1.03 1.1 1.09 0.29 -0.32 -4.8 -5.46 -2.56 -4.69 -4.19 -6.38 -4.53 -7.41 -5.03 0.37 -5.13 -3.13 -4.11 -4.72 -5.2 -1.73 -0.06 0.53 -0.15 -0.66 0.41 -0.15 0.33 0.91 -0.23 -0.17 0.83 0.18 -0.06 -0.88 0.13 -1.22 -0.72 0.04 0.86 -0.48 0.46 -2.69 -0.46 0.29 -0.56 -0.76 -0.39 0.27 0.77 0.17 0.02 0.54 0.68 0.19 1.21 -0.1 0.05 1.42 -0.06 0.38 -0.09 -0.58 -0.1 0.29 -0.98 0.26 0.19
AAC73255 (gluQ)
 0.46 0.3 0.47 0.84 -0.22 0.34 -0.29 0.07 -0.18 0.45 0.45 1.05 0.2 0.72 0.31 0.37 0.6 -0.28 -2.22 -2.15 -0.79 -3.94 -1.78 -5.12 -2.01 -3.94 -2.12 0.79 -1.89 -0.6 -1.58 -1.57 -1.65 -0.32 0.15 -0.15 -0.09 0.11 0.71 -0.43 0.0 0.13 -0.19 0.33 0.29 0.58 -0.31 0.1 0.14 0.64 -0.58 1.17 0.15 -0.3 -0.18 0.81 -0.5 -0.52 -0.23 -0.63 -0.79 -0.14 0.27 0.17 -0.4 0.91 -0.03 0.64 0.27 0.04 0.16 0.61 -0.23 0.24 0.57 -0.06 -0.01 -0.07 -0.2 -0.1 0.12
AAC73316 (mltD)
 0.47 0.08 0.38 -0.25 0.21 0.48 -2.2 0.43 0.21 -0.04 1.06 -0.11 -1.08 0.45 0.04 0.42 -0.66 -1.29 -4.22 -4.3 -1.94 -3.4 -3.03 -5.29 -3.63 -5.8 -4.06 -0.11 -3.04 -1.26 -2.41 -2.77 -3.03 -1.1 0.63 0.85 0.17 -0.7 0.23 0.75 0.88 0.91 0.33 -0.06 0.02 0.19 -0.13 0.37 0.48 -1.14 -0.18 0.3 0.51 0.21 -0.07 -1.28 0.91 0.83 0.59 -2.34 0.06 0.89 0.87 0.1 0.27 0.12 0.11 0.66 0.2 -0.71 0.29 1.11 0.55 -0.22 0.22 -0.33 1.34 -0.32 0.02 0.57 0.32
AAC73342 (gpt)
 2.25 1.63 2.63 1.94 2.31 2.58 -1.1 2.36 2.48 1.82 2.14 2.14 0.96 1.94 2.63 2.5 0.19 1.49 -3.57 -4.16 -1.34 0.15 -2.2 -2.26 -2.85 -2.66 -3.39 1.42 -2.29 -0.13 -1.46 -1.98 -2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -8.13 - - -
AAC73480 (sbmA)
 -0.45 0.04 -1.14 -1.9 -2.15 -1.02 0.16 -1.68 -2.04 -1.83 -0.19 -1.58 -1.58 -1.71 -1.2 -1.24 -2.45 -2.5 -6.33 -6.29 -4.27 -4.8 -5.18 -5.92 -5.75 -6.76 -5.9 -1.11 -2.88 -1.82 -2.31 -2.42 -2.65 -0.07 0.41 0.39 0.47 0.53 -0.39 -0.03 0.54 0.46 0.55 -0.09 0.51 -0.79 -0.14 0.21 0.42 1.77 0.14 0.54 -0.32 0.41 0.15 0.5 0.1 0.89 0.21 -0.34 0.08 0.61 1.12 0.47 0.52 -0.15 -0.5 0.49 1.67 2.2 0.85 2.59 0.22 -0.45 0.05 0.28 0.06 -0.12 0.02 0.45 1.13
AAC73481 (yaiW)
 0.98 1.25 -0.44 -1.46 -1.03 -0.45 0.83 -0.84 -1.1 -1.39 1.3 -1.0 -0.85 -0.79 -0.41 -0.52 -1.81 -1.86 -4.41 -3.75 -2.87 -4.33 -3.54 -5.43 -4.08 -6.16 -4.07 -0.6 -2.08 -1.29 -2.09 -2.32 -2.29 -0.72 0.93 0.27 0.17 0.28 -0.55 0.11 0.46 0.41 0.33 -0.27 0.43 -1.02 0.16 0.1 0.32 -0.27 0.58 0.43 -0.31 0.19 0.44 -0.06 0.04 0.45 0.2 -0.17 0.54 0.58 0.67 0.58 0.91 -0.42 -0.14 0.46 0.85 1.58 0.64 2.02 0.48 -0.4 -0.26 0.28 0.12 0.46 0.33 0.37 0.78
AAC73508 (queA)
 0.47 0.4 0.62 1.18 0.37 0.65 -2.24 0.55 0.51 1.03 0.5 1.23 0.3 1.02 0.66 0.64 -0.52 -0.83 -4.44 -4.91 -2.1 -3.75 -3.33 -5.31 -3.79 -5.39 -3.97 0.04 -3.74 -1.6 -2.69 -3.39 -3.77 0.18 -0.44 0.26 0.05 -0.2 1.04 -0.63 0.07 0.44 -0.21 0.06 0.44 0.83 -0.45 -0.14 0.29 -0.04 -0.54 0.5 0.68 -0.01 -0.1 -0.55 -0.51 -0.11 -0.2 0.08 -0.91 -0.28 0.48 0.11 -0.53 1.4 -0.6 0.73 0.15 -0.18 -0.12 1.06 -0.19 0.5 1.08 -0.21 -0.23 -0.65 -0.94 -0.3 0.32
AAC73526 (thiI)
 0.59 0.13 0.94 0.58 0.85 0.79 -2.0 0.97 1.01 0.62 0.65 0.55 0.19 0.79 0.98 0.74 -0.43 0.48 -3.59 -3.88 -1.56 -0.25 -2.42 -1.83 -2.97 -3.43 -3.26 0.64 -1.19 0.07 -0.43 -0.8 -1.15 -0.29 -0.14 0.14 -0.13 -0.27 0.24 -0.39 0.24 0.51 -0.31 -0.7 0.23 0.21 -0.28 -0.05 0.06 -0.77 0.0 0.2 0.17 -0.03 -0.34 -1.24 -0.29 -0.07 -0.12 -2.57 -0.52 -0.18 0.5 -0.04 -0.35 0.53 -0.3 0.76 -0.25 -0.11 0.08 0.76 -0.01 -0.36 0.99 -0.32 -0.01 -0.34 -0.45 -0.13 0.32
AAC73567 (mscK)
 0.88 0.74 0.27 -0.53 0.0 0.26 -1.29 0.04 0.08 -0.58 1.25 -0.23 -0.6 -0.49 0.27 0.21 -1.09 -0.63 -3.14 -2.98 -2.17 -2.29 -2.74 -4.0 -3.08 -4.73 -3.06 0.48 -0.8 -0.05 -0.72 -0.84 -0.93 -0.48 0.74 0.06 -0.04 0.15 -0.01 -0.18 0.04 0.55 0.24 -0.92 0.31 -0.15 -0.27 0.15 0.22 -0.01 -0.17 0.66 0.03 0.22 0.49 -0.15 -0.02 0.3 0.07 -0.71 0.06 0.33 0.59 0.32 0.36 -0.31 -0.05 0.41 0.29 1.94 0.18 1.26 0.47 -0.32 -0.32 -0.09 0.3 -0.03 -0.02 0.11 0.55
AAC73579 (gsk)
 0.77 0.37 0.79 0.35 0.06 0.79 -2.21 0.66 0.06 -0.02 0.61 0.39 -0.32 0.3 0.86 0.69 -1.26 -0.6 -4.6 -4.78 -3.1 -2.44 -3.91 -4.64 -4.49 -5.33 -4.63 0.15 -1.94 -1.04 -1.83 -2.19 -1.96 0.34 -0.05 0.15 -0.06 0.27 0.11 -0.24 0.12 0.69 0.34 -0.62 0.35 0.24 -0.01 -0.02 0.04 -0.43 0.06 0.4 0.28 0.04 0.61 -0.78 -0.17 0.3 0.0 -2.21 -0.19 0.41 0.61 0.31 -0.28 0.23 0.32 0.85 0.67 1.15 0.21 0.93 0.38 -0.02 0.14 0.11 0.39 0.21 -0.37 0.17 0.84
AAC73735 (mrdB)
 0.8 0.71 0.69 0.78 0.34 0.38 -1.5 0.59 0.21 -0.54 1.03 -0.12 0.18 0.07 0.87 0.45 0.27 0.77 -2.43 -2.44 -0.39 -0.5 -1.16 -1.65 -1.86 -3.25 -2.04 1.37 0.14 1.36 0.83 0.56 0.43 -1.98 0.22 -0.37 -0.37 0.41 -0.39 -0.44 -0.08 -0.13 -0.34 -0.54 0.16 -1.01 -0.53 -0.54 -0.07 -1.72 -0.15 0.1 -0.61 -0.19 -0.04 -1.54 -0.52 -0.3 -0.23 -0.52 -0.64 -0.39 0.23 -0.16 0.01 -0.64 -0.09 0.13 -0.36 0.91 0.09 1.37 -0.14 -0.63 -0.31 -0.07 -0.38 0.25 -1.05 -0.27 0.48
AAC73736 (mrdA)
 0.94 0.82 0.95 0.9 0.7 0.98 -2.37 0.86 0.63 -0.37 1.12 1.0 -0.07 0.15 0.97 0.87 -0.32 0.4 -4.18 -4.17 -2.09 -2.3 -2.89 -3.57 -3.64 -5.19 -3.96 1.38 -0.84 0.72 -0.02 -0.53 -0.62 -1.37 -0.1 -0.12 -0.44 0.47 -0.21 -0.63 -0.31 0.13 -0.33 -0.81 -0.14 -0.31 -0.85 -0.71 0.05 -0.87 -0.38 0.05 -0.3 -0.3 -0.04 -1.19 -0.41 -0.16 -0.55 -0.31 -0.73 -0.28 0.19 0.05 -0.38 -0.27 -0.23 1.09 0.36 1.13 0.5 1.62 -0.3 -0.39 -0.05 -0.02 -0.4 -0.41 -1.0 -0.36 0.38
AAC73737 (rlmH)
 0.32 0.07 0.51 -0.05 0.28 0.33 -1.92 0.14 0.41 -0.56 0.51 1.01 -0.36 -0.14 0.52 0.47 -0.72 -0.33 -3.51 -3.84 -2.41 -1.38 -2.83 -2.92 -3.25 -4.04 -3.43 1.1 0.15 0.83 0.49 0.37 0.14 0.47 -0.0 0.32 0.04 0.56 -0.29 -0.39 -0.14 0.47 -0.07 0.38 -0.35 0.28 -0.11 -0.08 0.3 -0.3 0.29 0.24 -0.58 0.05 0.18 -0.42 -0.48 -0.37 -0.46 -0.4 -0.43 -0.21 0.02 0.22 -0.23 -0.4 -0.26 1.19 0.4 0.46 0.74 1.31 0.12 -0.81 -0.14 0.45 -0.08 -0.56 -0.5 -0.17 0.46
AAC73738 (rsfS)
 0.75 0.61 0.73 0.07 0.85 0.82 -0.93 0.79 0.85 -0.19 0.88 1.3 -0.09 0.46 0.85 0.83 -0.84 -0.49 -3.75 -3.77 -2.29 -1.18 -2.89 -2.5 -3.65 -3.62 -3.73 0.43 -0.75 0.02 -0.3 -0.4 -0.67 1.38 -0.02 0.38 0.16 0.34 -0.59 -0.19 -0.35 0.03 -0.11 0.06 -0.26 0.12 -0.24 0.14 0.27 0.31 0.13 -0.6 -0.48 -0.01 0.37 -0.19 -0.16 -0.03 -0.21 -0.26 -0.53 -0.14 -0.02 0.15 -0.26 -0.54 -0.13 0.59 0.17 0.44 0.36 0.93 0.11 -0.93 -0.55 -0.19 -0.09 -0.56 -0.43 -0.19 -0.32
AAC73779 (ybfE)
 -0.21 -0.48 0.06 0.82 0.28 0.1 -2.32 0.09 0.26 0.69 -0.23 1.29 -0.19 1.02 0.1 0.01 -0.06 -1.97 -2.68 -2.7 -1.31 -3.42 -1.82 -4.02 -1.9 -4.77 -2.58 -0.14 -4.13 -1.95 -3.29 -3.12 -3.89 2.05 -0.66 0.35 0.27 -0.41 0.27 -0.12 0.06 -0.1 -0.08 -1.36 0.21 0.41 -0.91 0.15 0.19 1.03 -0.76 0.48 0.6 0.22 0.69 1.91 -0.01 0.16 0.17 0.82 -0.77 0.02 0.37 0.16 -1.05 1.53 0.44 -1.29 0.24 -0.59 -0.39 -0.15 -0.34 0.0 0.5 -0.95 0.19 -1.18 0.9 -0.26 0.25
AAC73884 (rhlE)
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AAC73907 (ybiT)
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AAC73922 (rimO)
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AAC73991 (ycaO)
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AAC73996 (cmk)
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AAC74000 (msbA)
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AAC74001 (lpxK)
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AAC74034 (rlmL)
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AAC74035 (uup)
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AAC74053 (rlmI)
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AAC74139 (trhO)
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AAC74170 (rluC)
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AAC74174 (plsX)
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AAC74210 (potA)
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AAC74294 (hemA)
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AAC74295 (prfA)
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AAC74296 (prmC)
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AAC74297 (ychQ)
 0.86 0.84 1.14 0.78 1.29 1.39 0.97 0.89 1.12 0.42 0.96 1.69 1.87 1.41 0.97 0.91 0.17 -0.21 -4.73 -4.64 -0.44 -0.79 -1.84 -2.36 -3.02 -4.73 -3.73 0.12 -3.5 0.2 -1.36 -2.82 -3.25 -7.42 -0.66 -0.4 -0.2 -0.82 -0.31 -0.46 0.37 0.79 -0.43 0.1 0.5 0.19 -0.29 0.09 0.3 -2.46 0.19 -1.04 -0.21 -0.42 -0.74 -1.96 -0.61 -0.63 -0.18 0.82 -0.91 -0.34 -0.54 -0.4 -0.28 -0.16 -0.86 -2.59 -0.56 0.16 0.15 -0.46 -0.07 -0.42 0.01 -0.2 -0.66 -0.86 -1.59 -0.11 -0.42
AAC74320 (tdk)
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AAC74351 (rluB)
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AAC74425 (dbpA)
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AAC74426 (ttcA)
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AAC74698 (ydgK)
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AAC74699 (rsxA)
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AAC74700 (rsxB)
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AAC74701 (rsxC)
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AAC74702 (rsxD)
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AAC74703 (rsxG)
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AAC74704 (rsxE)
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AAC74705 (nth)
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AAC74724 (rnt)
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AAC74792 (ydiY)
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AAC74874 (rnd)
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AAC74877 (tsaB)
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AAC74892 (rlmA)
 0.2 0.36 0.29 -0.12 -0.02 0.21 -1.44 -0.21 -0.13 0.33 0.2 0.63 0.03 0.65 0.19 0.23 -0.12 -0.57 -1.85 -1.76 -0.85 -1.02 -1.26 -1.93 -1.36 -2.31 -1.71 0.42 -1.07 -0.11 -0.43 -0.5 -0.78 0.16 -0.56 -0.06 -0.3 -0.39 0.63 -0.18 0.28 0.36 0.06 -1.19 0.49 0.57 -0.7 0.38 -0.39 1.46 -0.72 0.07 0.95 -0.36 0.74 -0.74 -0.0 0.52 0.03 -2.0 -0.32 0.65 0.59 -0.53 -0.78 0.69 0.11 0.32 0.96 0.73 -0.88 0.12 0.12 0.97 -0.74 -0.23 0.57 -0.07 -0.79 0.05 0.55
AAC74925 (lpxM)
 0.84 1.2 1.0 0.61 0.11 0.94 1.28 0.08 -0.17 0.35 1.13 0.87 0.79 0.61 0.66 0.96 0.07 -0.02 -4.06 -4.59 -1.14 -2.62 -2.52 -5.75 -3.32 -6.14 -3.63 0.83 -2.31 -0.13 -1.38 -2.28 -2.18 -1.34 -0.43 -0.31 -0.11 0.14 -0.02 -0.64 0.21 -0.04 -0.43 -0.64 0.27 0.01 -0.34 -0.34 -0.22 0.76 0.24 0.15 0.48 -0.51 0.01 -0.38 -0.4 0.12 -0.34 -2.53 -0.44 0.15 0.52 -1.07 -0.19 0.29 -0.64 0.53 0.34 1.13 -0.61 1.14 -0.34 0.02 -0.58 0.23 -0.17 -0.66 -0.27 -0.16 0.61
AAC75026 (vsr)
 0.5 0.88 0.67 -0.41 0.6 0.52 -0.49 0.14 0.31 -0.67 0.49 0.37 0.05 0.47 0.47 0.56 -1.56 -0.82 -4.36 -4.96 -3.06 -4.13 -3.63 -5.79 -4.0 -5.7 -4.53 0.46 -2.17 -0.55 -1.51 -1.95 -1.66 -1.97 -0.32 0.75 0.09 0.64 -0.3 0.33 0.51 1.34 0.34 0.51 0.54 0.26 0.58 0.3 0.21 -1.31 0.94 0.8 -0.72 0.16 0.33 -1.09 -0.19 0.25 0.08 -2.02 -0.59 0.37 0.28 0.69 0.23 0.06 0.17 1.5 -0.59 -0.67 0.59 0.03 0.4 -0.34 -0.3 0.7 0.31 -0.08 -1.0 0.14 0.66
AAC75027 (dcm)
 1.07 1.4 1.13 -0.31 1.18 1.08 0.33 0.73 0.91 -0.53 1.17 0.55 0.33 0.77 0.92 1.11 -1.15 -0.77 -5.25 -5.21 -3.1 -3.57 -4.31 -5.0 -5.01 -6.34 -5.05 0.13 -2.36 -1.01 -2.06 -2.25 -2.2 -1.16 -0.28 0.04 -0.13 0.09 -0.27 -0.22 -0.0 0.37 -0.01 -0.44 0.49 -0.11 -0.17 -0.12 0.08 -1.04 0.25 0.58 -0.02 0.04 0.72 -1.02 -0.16 0.36 -0.3 -1.8 -0.39 0.29 0.19 0.09 -0.17 0.13 0.28 0.61 -0.0 0.48 -0.27 0.27 0.1 -0.31 -0.74 0.74 0.12 0.29 -0.89 0.02 0.7
AAC75075 (plaP)
 0.77 0.57 1.5 0.99 1.19 1.47 -3.37 0.6 0.97 0.33 0.82 1.09 -0.24 0.4 1.22 1.47 0.54 2.07 -3.33 -3.23 -1.02 1.35 -2.03 0.03 -2.76 -1.24 -2.97 2.43 1.0 2.18 1.95 1.69 1.24 -0.03 -0.75 -1.9 -1.86 -3.01 -0.07 -2.79 -1.96 -1.03 -2.21 -1.21 -1.52 -0.01 -2.39 -2.18 -1.4 -2.93 -1.94 -2.09 -0.55 -1.86 -2.09 -3.23 -3.07 -1.93 -2.52 -2.76 -1.74 -1.78 -1.47 -1.74 -1.06 -0.55 -1.23 1.3 -0.71 -2.61 -2.23 -0.83 -1.38 -0.49 -0.65 -2.41 -2.42 -2.09 -1.52 -1.79 -1.36
AAC75142 (trhP)
 0.09 -0.1 0.71 0.94 0.54 1.02 -0.85 0.12 0.26 1.77 0.16 1.73 1.47 1.62 0.37 0.97 0.18 0.45 -3.76 -4.03 -1.22 -0.25 -2.25 -1.1 -2.93 -1.64 -3.35 1.15 -0.57 0.31 -0.14 -0.38 -0.52 0.44 -0.79 -0.84 -1.01 -0.65 1.55 -1.31 -0.47 -0.4 -0.88 -0.72 -0.28 0.75 -1.07 -0.41 -0.9 -0.36 -1.08 -0.47 0.51 -1.14 -0.26 -1.39 -0.97 -0.34 -1.17 -0.92 -1.33 -0.45 0.01 -0.92 -0.85 1.04 -0.39 1.33 0.18 -0.5 -1.18 0.63 -0.84 0.41 0.15 -0.39 -1.03 -1.02 -1.24 -0.8 0.31
AAC75235 (lpxT)
 0.21 0.38 0.34 0.3 0.06 0.32 -0.13 -0.31 -0.23 -0.32 0.39 1.29 1.68 0.1 -0.02 0.42 -0.13 0.85 -2.55 -3.18 -0.66 0.08 -1.19 -1.54 -1.65 -2.74 -2.06 1.61 0.54 1.42 1.29 1.11 0.53 -0.52 -0.84 -0.19 -0.21 0.69 0.55 -0.89 -0.39 0.11 -0.68 -1.4 -0.2 0.82 -0.26 -0.64 0.25 -2.68 0.39 -1.18 0.72 -0.27 0.72 -2.79 -1.09 -0.72 -0.77 -2.02 -0.74 -0.73 -0.78 -0.28 -0.67 0.57 -0.45 0.55 -0.81 0.2 0.05 -0.93 -0.55 0.5 0.3 -0.54 -0.78 -0.32 -1.24 -0.4 -0.01
AAC75271 (yojI)
 -0.54 0.63 -0.11 -0.8 -0.64 -0.04 1.7 -2.06 -1.7 -0.21 -0.5 0.29 1.35 -0.94 -0.96 -0.15 0.87 1.31 -3.08 -3.11 -0.96 -0.65 -1.86 -2.46 -2.47 -4.1 -2.67 2.7 -0.06 1.7 1.16 0.64 0.18 -1.02 0.74 -1.17 -0.65 -0.16 -0.19 -0.96 0.1 -0.81 -0.92 -2.2 -0.92 -0.73 -1.02 -0.89 -0.72 0.14 -0.19 0.93 -1.22 -1.27 -0.3 -0.75 -0.78 -0.69 -0.94 -2.03 -1.38 -0.59 0.49 -0.37 -0.29 -0.56 -0.77 1.42 0.31 1.41 -1.39 1.08 -0.2 -1.39 -1.21 -0.17 -1.05 0.83 -0.45 -0.29 1.51
AAC75371 (ubiX)
 0.38 0.62 0.24 -0.26 -0.42 0.16 -1.27 -0.65 -0.48 0.02 0.38 0.85 -0.15 0.13 0.14 0.26 -0.7 -1.07 -3.72 -5.13 -2.07 -2.85 -2.51 -3.86 -3.08 -5.48 -3.93 0.67 -2.2 -0.32 -1.16 -1.57 -1.8 -0.05 0.01 0.24 0.2 0.3 0.85 -0.28 0.31 0.46 0.38 -0.69 0.73 0.72 0.02 0.21 0.5 0.5 0.15 0.59 0.66 0.2 0.74 -0.16 -0.42 0.22 -0.19 -0.58 -0.76 0.03 0.32 0.84 -0.05 0.96 -0.29 0.94 0.13 -1.09 -0.22 0.43 0.29 0.34 0.59 1.18 0.46 0.45 -0.68 0.02 0.41
AAC75375 (folC)
 0.55 0.77 0.62 -0.51 0.38 0.58 -0.86 0.13 0.03 -0.35 0.84 0.17 -0.17 0.3 0.49 0.54 -0.57 0.22 -2.93 -3.07 -1.18 -0.44 -1.75 -1.92 -2.2 -3.1 -2.56 0.42 -0.95 0.14 -0.14 -0.48 -0.66 -2.55 0.36 0.31 -0.04 0.31 -0.28 -0.34 -0.32 0.39 0.12 0.49 0.31 -0.51 0.15 0.13 0.42 0.09 0.49 0.67 -0.63 0.0 -0.1 -0.83 -0.45 -0.19 -0.31 -1.34 -0.57 -0.05 0.22 0.64 0.21 0.03 -0.53 0.9 -0.39 0.9 0.6 1.14 0.39 -0.85 0.17 0.82 0.04 0.07 -0.68 0.02 0.46
AAC75464 (ligA)
 0.43 0.64 0.68 0.62 0.16 0.68 0.64 -0.24 -0.18 1.0 0.69 1.32 1.66 0.46 0.41 0.71 -0.61 0.33 -2.74 -3.08 -0.93 -0.28 -1.52 -2.0 -2.12 -3.19 -2.41 0.68 0.33 0.63 0.37 0.22 0.26 -2.39 -0.4 -0.1 -0.27 -0.46 0.29 -0.39 -0.11 0.06 -0.27 -0.69 0.02 0.24 -0.55 -0.01 -0.11 -0.89 -0.46 0.28 0.38 -0.15 0.45 -0.64 -0.51 -0.01 -0.29 -0.71 -0.21 -0.19 -0.14 -0.19 -0.34 -0.02 -0.55 0.56 -0.13 -0.5 -0.33 0.15 -0.17 0.14 -0.39 -0.4 -0.32 0.01 -0.71 -0.2 0.48
AAC75488 (amiA)
 0.06 0.61 0.28 -0.52 -0.28 0.23 2.19 -0.98 -0.65 -0.2 0.66 0.09 0.57 -0.52 -0.18 0.11 -1.07 -1.2 -4.87 -5.02 -2.49 -3.48 -3.57 -6.49 -3.85 -6.75 -4.25 -0.08 -2.79 -1.28 -2.19 -2.53 -2.67 0.3 0.12 0.3 0.15 -0.01 -0.02 0.17 0.43 0.87 0.09 1.07 0.18 0.01 0.59 0.3 0.13 -0.33 0.42 -0.28 0.48 -0.13 0.3 0.85 0.13 0.46 0.22 -0.01 0.27 0.48 0.28 -0.02 0.56 -0.33 -0.45 0.73 0.16 0.76 0.08 0.68 0.26 -0.29 -0.33 0.17 0.29 -0.23 0.31 0.32 0.28
AAC75489 (hemF)
 0.02 0.39 0.08 -0.26 -0.34 0.15 1.62 -1.05 -0.53 -0.23 0.62 0.52 0.68 -0.51 -0.1 0.1 -0.93 -0.95 -4.09 -4.61 -2.24 -3.33 -2.85 -4.47 -3.37 -4.71 -3.45 0.29 -1.76 -0.5 -1.24 -1.52 -1.53 -0.95 -0.13 0.64 0.29 0.25 -0.05 -0.03 0.43 0.91 -0.05 0.77 0.25 0.0 0.59 0.21 0.37 -0.14 0.69 0.33 0.19 -0.15 -0.04 -0.09 -0.09 0.42 -0.01 -0.14 -0.05 0.22 0.36 0.19 0.16 -0.19 -0.7 1.07 0.1 0.75 0.28 1.11 0.15 -0.26 -0.17 0.54 -0.04 -0.13 -0.54 0.32 1.31
AAC75549 (hda)
 0.06 0.09 0.28 -0.3 0.37 0.06 -1.23 -0.29 0.26 -0.8 0.3 0.32 -0.72 0.41 -0.12 0.06 -0.66 -1.86 -4.67 -4.39 -2.33 -3.02 -3.13 -4.41 -3.78 -5.65 -4.04 -0.48 -2.77 -1.36 -1.79 -2.13 -2.35 -0.42 -0.26 0.74 0.38 0.62 -0.15 0.5 0.52 1.04 0.52 0.36 0.49 0.37 0.8 0.62 0.13 -0.79 0.8 0.63 -0.14 0.23 1.11 -0.07 0.36 0.44 0.32 -1.56 0.43 0.62 0.47 0.3 -0.09 0.1 0.19 -0.43 0.35 0.28 0.14 0.11 0.69 0.05 -0.48 1.04 0.75 0.03 -0.1 0.45 1.05
AAC75570 (rlmN)
 0.25 0.2 0.89 0.61 0.83 0.76 0.75 0.12 0.8 0.91 0.62 1.1 0.14 1.07 0.61 0.73 0.25 0.62 -2.7 -2.76 -0.76 0.25 -1.5 -0.62 -1.98 -1.5 -2.32 1.62 1.07 1.47 1.21 1.11 1.19 -0.15 -0.26 -0.79 -0.91 -1.49 0.39 -1.26 -0.51 -0.25 -0.78 -0.92 -0.29 0.11 -1.09 -0.77 -0.71 -0.86 -0.84 -0.81 0.44 -0.91 -0.05 -0.33 -1.13 -0.95 -1.0 -0.91 -0.89 -0.97 -0.64 -0.35 -0.58 0.49 -0.75 0.42 -0.34 -1.32 -0.8 -0.06 -0.39 0.04 -0.05 -1.04 -0.7 -0.77 -0.38 -0.83 -0.82
AAC75586 (suhB)
 0.12 -0.45 1.24 0.77 0.6 1.03 -2.47 0.66 0.72 0.9 0.47 2.1 -1.16 0.95 0.97 0.93 -0.41 0.91 -4.12 -3.78 -2.7 0.51 -3.47 -0.68 -3.92 -2.01 -3.93 0.73 -1.58 -0.01 -0.46 -0.76 -1.51 1.8 -0.66 0.32 0.26 -2.46 0.48 -0.23 0.44 0.42 -0.76 -0.58 -0.44 0.8 -0.76 0.03 0.35 -1.12 -0.66 -0.09 0.45 -0.32 -0.95 -1.16 0.07 -0.17 -0.3 -0.91 -0.99 0.04 0.79 -0.44 -0.87 0.8 -1.7 -0.4 -0.61 -1.42 -1.45 0.68 -0.17 -0.39 0.27 -1.95 0.39 -1.3 -1.0 -0.14 -0.15
AAC75618 (recO)
 0.35 0.16 1.0 0.62 0.48 0.86 -1.99 0.17 0.12 0.02 0.82 0.74 -0.37 0.82 0.77 0.81 -0.09 0.4 -3.98 -4.77 -1.06 -0.91 -2.05 -2.66 -3.07 -3.34 -3.37 0.54 -1.81 -0.23 -0.81 -1.15 -1.3 -2.22 -0.36 0.48 0.22 -0.33 0.23 -0.2 0.2 0.61 -0.06 -0.7 0.42 0.28 0.01 0.29 0.43 -1.06 -0.3 0.85 0.34 0.1 -0.05 -0.73 -0.38 -0.06 -0.01 -1.33 -0.47 0.08 0.38 0.35 -0.23 0.47 -0.41 1.05 0.22 0.25 0.35 0.59 0.1 0.07 0.21 -0.52 0.12 -0.13 -0.72 0.06 0.83
AAC75642 (pgeF)
 0.29 0.53 0.56 0.14 0.2 0.47 -0.55 -0.17 0.16 0.44 0.62 1.29 0.2 0.22 0.38 0.48 -0.23 0.32 -2.76 -3.45 -0.57 -0.09 -1.11 -1.35 -1.69 -2.64 -2.05 0.06 -2.14 -0.34 -0.89 -1.52 -1.77 -2.77 -0.16 0.13 0.01 0.3 0.27 -0.04 0.32 0.56 0.23 -0.41 -0.1 0.38 0.53 0.39 0.16 -1.82 0.75 0.77 0.16 0.09 0.58 -0.52 -0.24 -0.02 -0.15 -0.07 -0.03 0.07 -0.01 -0.01 0.0 -0.33 -0.18 -0.12 -0.05 0.19 0.01 0.04 0.26 0.04 -0.22 0.68 0.3 -0.23 -0.43 0.2 0.98
AAC75667 (yfjF)
 0.76 0.85 0.81 0.07 0.58 1.03 -0.05 -0.0 0.14 0.2 0.72 1.1 0.35 0.11 0.6 0.86 -0.45 -0.2 -5.23 -6.05 -2.92 -1.82 -4.19 -3.33 -5.28 -5.01 -5.17 -0.42 -5.4 -2.1 -4.05 -4.51 -5.47 0.42 0.01 -0.26 -0.54 0.22 -0.42 0.2 0.05 0.2 0.1 -0.18 0.07 -0.54 0.07 0.25 -1.19 1.2 0.65 -0.4 0.27 -0.27 1.2 0.34 0.32 0.51 0.55 0.94 0.2 0.36 -0.18 -0.55 -0.12 -0.75 -0.01 -0.44 -0.23 1.5 -1.56 -0.09 0.06 -0.11 -2.2 0.88 0.49 0.23 0.7 -0.06 -0.19
AAC75668 (ratA)
 0.17 0.51 0.37 -0.24 0.14 0.4 0.57 -0.52 -0.21 0.1 0.23 0.48 0.17 -0.11 0.07 0.38 -0.91 -0.99 -4.33 -4.65 -2.61 -2.41 -3.34 -3.6 -4.01 -4.77 -4.07 -0.37 -4.41 -2.02 -2.83 -3.33 -3.58 0.34 -0.14 -0.19 0.12 0.82 -0.33 -0.34 -0.12 0.09 0.36 0.34 0.27 -0.37 0.38 0.01 0.27 1.61 1.35 0.21 0.02 -0.2 0.74 1.37 0.01 0.28 -0.55 0.64 -0.22 0.27 0.21 0.2 -0.12 -0.4 -0.34 0.12 0.84 1.54 0.35 0.18 0.15 -0.34 -0.44 0.82 -0.15 -0.19 0.29 0.15 0.26
AAC75807 (queD)
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AAC76054 (plsC)
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AAC76102 (dnaG)
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AAC76196 (deaD)
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AAC76197 (nlpI)
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AAC76209 (folP)
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AAC76280 (yhdE)
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AAC76281 (mreD)
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AAC76282 (mreC)
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AAC76450 (glpE)
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AAC76723 (recF)
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AAC76725 (dnaA)
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AAC77325 (holD)
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AAC77327 (yjjG)
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AAT48161 (ygiQ)
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AAT48182 (glpG)
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AAT48216 (yifK)
 0.02 0.79 0.03 1.46 -0.55 0.13 0.88 -0.61 -1.11 1.23 0.1 1.99 0.74 0.62 -0.35 0.06 0.12 -0.04 -1.68 -2.28 -0.43 -0.46 -0.63 -1.01 -0.98 -1.2 -1.05 0.7 1.2 0.43 0.6 0.79 1.22 -0.68 -0.39 -0.74 -0.82 -0.37 0.35 -0.48 -0.3 -0.71 -1.07 -0.64 -0.41 0.29 -1.4 -0.85 -0.58 0.83 0.51 1.12 -0.69 -0.87 -0.22 -0.2 -0.29 -0.61 -0.54 -2.08 -1.52 -1.14 -0.41 -0.98 -0.53 0.56 -0.43 1.27 -0.83 -0.59 -0.92 0.09 -1.11 0.16 0.33 -0.18 -0.94 0.21 -1.33 -0.86 0.3
AAT48232 (bipA)
 0.2 0.13 0.85 0.25 0.35 0.64 -1.96 0.21 0.39 0.55 0.58 0.7 0.28 0.51 0.49 0.64 -0.69 0.77 -3.45 -4.11 -1.26 0.77 -1.94 -0.08 -2.54 -0.84 -2.93 0.95 0.25 0.94 0.84 0.74 0.45 -1.05 0.09 0.58 0.29 -1.15 0.29 -0.03 -0.23 0.06 -0.52 -0.58 -0.05 -0.01 -0.63 -0.43 0.34 -0.97 -0.21 -0.22 0.31 -0.14 -0.11 -0.83 0.12 -0.24 -0.36 -1.65 -0.59 -0.23 -0.1 -0.1 -0.22 -0.25 -0.23 1.06 0.23 -0.45 0.32 0.33 -0.03 -0.24 0.26 -0.83 -0.13 -0.96 -0.71 -0.08 -0.29
ABD18707 (yidD)
 0.21 -0.24 0.83 1.04 1.2 0.66 -4.47 0.8 0.87 0.79 0.69 1.27 -0.4 0.11 0.46 0.61 0.11 0.06 -2.87 -4.05 -0.54 -1.48 -1.1 -3.86 -1.67 -5.39 -2.18 1.1 -1.88 0.65 0.1 -0.53 -1.18 -1.2 -1.08 -0.58 -0.64 -2.05 0.57 0.12 0.15 0.03 -1.02 -1.02 0.29 0.35 -1.81 -0.8 -0.76 1.44 -1.55 0.83 0.61 -1.09 -0.4 -2.21 0.57 -0.04 -0.19 2.03 -1.04 -0.25 0.64 -0.63 -1.28 0.41 -0.67 0.51 0.39 -0.02 -1.29 1.57 -0.71 0.18 -0.61 -1.64 0.13 -1.19 -1.1 -0.79 -0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.