Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	10P129H1,ModA15 OFF	10P129H1,ModA15 ON	10P129H1,ModA15ON	477,ModA5 OFF	477,ModA5 OFF	477,ModA5 ON	84P36H1,ModA18 OFF	84P36H1,ModA18 OFF	84P36H1,ModA18 ON	84P36H1,ModA18ON	86-028NP,rpsL,nasopharynx	86-028NP,rspL/fur-,nasopharynx	86-028NP,rspL/pT-fur,nasopharynx	C486,ModA4 OFF	C486,ModA4 ON	C486,ModA4ON	GE47,WT,sBHI,37C	GE47,WT,sBHI,42C	R2866,ModA10 OFF	R2866,ModA10 OFF	R2866,ModA10 OFF	R2866,ModA10 ON	R2866,ModA10ON	RdKW20,BHI	RdKW20,HI0628-,mid-log,50ÂµM beclomethasone	RdKW20,HI0628-,mid-log,DMSO	RdKW20,HI0659-,MIV	RdKW20,HI0659-,MM	RdKW20,HI0659-/HI0660-,MIV	RdKW20,HI0660-,MIV	RdKW20,MIV	RdKW20,WT	RdKW20,WT,mid-log,50ÂµM beclomethasone	RdKW20,WT,mid-log,DMSO	RdKW20,beclomethasone	RdKW20,comN-,MIV	RdKW20,crp-,BHI	RdKW20,crp-,MIV	RdKW20,hfq-,MIV	RdKW20,murE749,BHI	RdKW20,prednisolone	RdKW20,rpoD753,BHI	RdKW20,sxy-,BHI	RdKW20,sxy-,MIV	RdKW20,sxy-1,BHI	bronchoalveolar lavage	nasopharynx
EDJ90017 (CGSHi22421_09606)	0.51	0.22	0.22	0.18	0.19	0.17	0.33	0.32	0.45	0.43	0.08	0.06	0.06	0.18	0.26	0.27	0.11	0.3	0.94	0.94	1.0	0.97	0.94	0.09	0.08	0.09	0.14	0.11	0.1	0.12	0.19	0.1	0.29	0.23	0.07	0.1	0.08	0.08	0.11	0.11	0.15	0.13	0.08	0.17	0.09	0.15	0.16
EDJ90018 (CGSHi22421_09611)	0.5	0.21	0.21	0.26	0.27	0.23	0.38	0.39	0.53	0.51	0.11	0.09	0.1	0.22	0.41	0.4	0.08	0.22	1.0	0.89	0.84	0.96	0.96	0.17	0.1	0.09	0.23	0.19	0.18	0.19	0.35	0.16	0.41	0.29	0.06	0.18	0.14	0.11	0.17	0.21	0.21	0.21	0.13	0.26	0.17	0.2	0.23
EDJ90019 (CGSHi22421_09616)	0.41	0.2	0.2	0.42	0.42	0.34	0.57	0.53	0.64	0.67	0.11	0.09	0.11	0.24	0.3	0.31	0.1	0.26	0.92	0.77	0.65	1.0	0.98	0.18	0.17	0.12	0.25	0.22	0.2	0.2	0.39	0.25	0.54	0.3	0.06	0.2	0.14	0.09	0.18	0.21	0.26	0.22	0.13	0.26	0.17	0.27	0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)