Heatmap: Cluster_33 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL17165 (BN171_1330026)	0.36	0.31	0.61	0.44	0.44	0.32	1.0	0.42	0.15	0.4	0.51	0.57	0.53	0.32	0.3	0.74	0.29	0.3	0.39	0.28	0.11	0.94	0.7	0.24	0.19	0.2	0.29	0.42	0.49
CCL17178 (BN171_1330039)	0.51	0.31	0.48	0.43	0.41	0.26	0.86	0.36	0.19	0.58	0.48	0.7	0.62	0.39	0.26	0.44	0.17	0.37	0.26	0.36	0.42	1.0	0.53	0.29	0.17	0.17	0.14	0.33	0.33
CCL17195 (BN171_1380006)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
CCL17202 (spoIIID)	0.01	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.42	0.02	0.0	0.04	0.01	0.0	0.1	0.03	0.03	0.01	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.02	0.0
CCL17304 (BN171_1430031)	0.1	0.04	0.46	0.68	0.34	0.64	0.15	0.03	0.39	0.39	0.3	0.37	0.41	0.2	0.06	0.2	0.23	0.07	0.29	0.16	0.21	0.23	0.2	0.06	0.21	0.14	0.03	1.0	0.1
CCL17305 (BN171_1430032)	0.31	0.16	0.77	1.0	0.76	0.3	0.24	0.15	0.29	0.21	0.23	0.25	0.4	0.26	0.14	0.35	0.19	0.23	0.25	0.42	0.41	0.12	0.31	0.15	0.24	0.45	0.12	0.51	0.23
CCL17437 (BN171_1500013)	0.08	0.0	0.12	0.22	0.08	0.24	0.87	0.04	0.0	0.74	1.0	0.36	0.39	0.15	0.06	0.0	0.13	0.09	0.13	0.0	0.07	0.0	0.19	0.15	0.09	0.02	0.26	0.9	0.61
CCL17693 (BN171_1680008)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.08	0.0	0.07	1.0	0.0
CCL17902 (BN171_1930014)	0.68	0.25	0.39	0.29	0.22	0.23	0.19	0.16	0.17	0.2	0.38	0.28	0.55	0.43	0.26	0.8	0.28	0.24	0.24	0.33	0.33	1.0	0.23	0.26	0.58	0.15	0.23	0.58	0.31
CCL18149 (BN171_2130006)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.1	1.0	0.0
CCL18155 (BN171_2130012)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.24	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.0
CCL18221 (BN171_2170008)	0.14	0.32	0.48	0.84	0.35	0.1	0.92	0.22	0.2	0.73	1.0	0.85	0.3	0.11	0.38	0.23	0.2	0.22	0.3	0.21	0.24	0.8	0.28	0.34	0.21	0.11	0.19	0.68	0.78
CCL18363 (argF)	0.2	0.38	0.25	0.61	0.39	0.1	1.0	0.22	0.17	0.89	0.43	0.67	0.47	0.14	0.33	0.32	0.26	0.18	0.2	0.13	0.17	0.15	0.11	0.11	0.08	0.07	0.25	0.24	0.27
CCL18364 (argM)	0.24	0.47	0.4	0.72	0.36	0.16	0.44	0.19	0.3	0.89	0.79	0.77	1.0	0.09	0.44	0.67	0.38	0.2	0.43	0.13	0.12	0.15	0.33	0.23	0.1	0.04	0.36	0.47	0.56
CCL18446 (BN171_2340006)	0.11	0.28	0.17	0.46	0.19	0.07	0.69	0.08	0.12	0.44	0.6	0.44	0.32	0.07	0.38	0.33	0.12	0.16	0.32	0.13	0.35	0.5	0.17	0.18	0.11	0.05	0.17	1.0	0.61
CCL18503 (bioB)	0.4	0.34	0.72	1.0	0.65	0.15	0.48	0.38	0.14	0.41	0.31	0.34	0.39	0.31	0.5	0.42	0.12	0.47	0.35	0.59	0.89	0.31	0.24	0.16	0.17	0.58	0.05	0.5	0.25
CCL18535 (BN171_2420002)	0.1	0.14	0.54	1.0	0.5	0.15	0.35	0.11	0.04	0.09	0.12	0.1	0.46	0.19	0.35	0.2	0.1	0.2	0.16	0.25	0.37	0.33	0.64	0.03	0.12	0.12	0.09	0.63	0.09
CCL18594 (BN171_2440035)	0.4	0.21	0.6	1.0	0.65	0.2	0.35	0.2	0.25	0.53	0.37	0.35	0.55	0.46	0.25	0.61	0.28	0.33	0.36	0.54	0.33	0.66	0.34	0.28	0.26	0.25	0.14	0.74	0.24
CCL18602 (BN171_2440043)	0.43	0.1	0.52	0.67	0.61	0.27	0.21	0.27	0.14	0.16	0.19	0.2	0.45	0.42	0.16	1.0	0.15	0.4	0.21	0.33	0.22	0.77	0.25	0.1	0.31	0.3	0.01	0.55	0.19
CCL18610 (BN171_2470004)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
CCL18627 (BN171_2480002)	0.43	0.09	0.35	0.25	0.16	0.13	0.69	0.17	0.13	0.88	0.66	0.64	0.67	0.39	0.09	0.55	0.22	0.18	0.22	0.22	0.1	1.0	0.64	0.16	0.24	0.15	0.34	0.52	0.78
CCL18651 (BN171_2480026)	0.2	0.55	0.36	1.0	0.33	0.15	0.54	0.13	0.13	0.32	0.19	0.52	0.26	0.18	0.28	0.38	0.07	0.22	0.13	0.17	0.35	0.31	0.08	0.04	0.09	0.14	0.18	0.55	0.14
CCL18677 (BN171_2480052)	0.18	0.41	0.15	0.46	0.14	0.04	0.96	0.17	0.18	1.0	0.59	0.77	0.33	0.08	0.27	0.27	0.23	0.2	0.37	0.09	0.3	0.32	0.78	0.5	0.19	0.06	0.44	0.53	0.81
CCL18678 (BN171_2480053)	0.35	0.6	0.25	0.68	0.37	0.1	1.0	0.35	0.09	0.59	0.49	0.43	0.25	0.13	0.34	0.1	0.25	0.29	0.23	0.37	0.69	0.4	0.14	0.11	0.21	0.29	0.18	0.88	0.69
CCL18689 (BN171_250002)	0.06	0.07	0.41	1.0	0.56	0.13	0.36	0.04	0.89	0.34	0.29	0.36	0.19	0.05	0.08	0.34	0.29	0.09	0.1	0.03	0.05	0.02	0.1	0.05	0.03	0.03	0.05	0.92	0.24
CCL18834 (BN171_2680003)	0.14	0.25	0.18	0.49	0.21	0.07	1.0	0.07	0.18	0.12	0.13	0.12	0.2	0.06	0.17	0.12	0.09	0.11	0.26	0.12	0.4	0.27	0.68	0.35	0.13	0.08	0.26	0.45	0.09
CCL18835 (BN171_2680004)	0.18	0.35	0.18	0.63	0.22	0.07	1.0	0.08	0.25	0.25	0.12	0.17	0.26	0.07	0.16	0.14	0.06	0.08	0.11	0.15	0.47	0.42	0.06	0.08	0.05	0.11	0.16	0.33	0.05
CCL18836 (ptb)	0.21	0.43	0.3	1.0	0.39	0.03	0.69	0.14	0.18	0.19	0.07	0.11	0.34	0.12	0.25	0.2	0.06	0.1	0.06	0.15	0.56	0.44	0.03	0.06	0.03	0.15	0.09	0.19	0.04
CCL18837 (buk)	0.19	0.42	0.35	1.0	0.48	0.03	0.51	0.13	0.2	0.13	0.04	0.06	0.2	0.1	0.27	0.14	0.19	0.13	0.06	0.15	0.42	0.55	0.02	0.03	0.01	0.16	0.06	0.13	0.03
CCL18838 (BN171_2680007)	0.1	0.18	0.19	0.35	0.15	0.03	1.0	0.08	0.43	0.24	0.15	0.14	0.32	0.06	0.12	0.11	0.05	0.05	0.1	0.15	0.41	0.7	0.14	0.11	0.03	0.12	0.3	0.15	0.1
CCL18839 (BN171_2680008)	0.08	0.15	0.1	0.21	0.09	0.03	0.48	0.05	0.2	0.1	0.09	0.04	0.16	0.02	0.11	0.04	0.03	0.07	0.08	0.06	0.18	1.0	0.08	0.06	0.01	0.05	0.18	0.08	0.02
CCL18840 (BN171_2680009)	0.05	0.09	0.05	0.12	0.06	0.02	0.41	0.04	0.16	0.07	0.05	0.05	0.15	0.02	0.07	0.06	0.04	0.03	0.06	0.04	0.1	1.0	0.05	0.04	0.01	0.04	0.2	0.07	0.05
CCL19032 (BN171_2820002)	0.33	0.45	0.49	0.7	0.65	0.8	1.0	0.49	0.44	0.74	0.85	0.84	0.56	0.23	0.49	0.62	0.36	0.49	0.46	0.67	0.64	0.51	0.62	0.36	0.39	0.79	0.26	0.46	0.59
CCL19172 (BN171_2910007)	0.33	0.67	0.39	1.0	0.4	0.08	0.33	0.22	0.38	0.6	0.57	0.73	0.36	0.19	0.44	0.34	0.19	0.24	0.3	0.24	0.37	0.2	0.82	0.28	0.15	0.13	0.24	0.36	0.34
CCL19173 (aroE)	0.26	0.56	0.29	0.86	0.2	0.04	0.49	0.14	0.34	1.0	0.59	0.49	0.3	0.21	0.35	0.38	0.11	0.15	0.24	0.18	0.34	0.53	0.66	0.13	0.09	0.1	0.11	0.27	0.24
CCL19200 (BN171_2950002)	0.13	0.25	0.11	0.25	0.11	0.15	0.76	0.1	0.1	1.0	0.9	0.92	0.34	0.13	0.26	0.38	0.21	0.12	0.36	0.21	0.41	0.22	0.38	0.33	0.26	0.11	0.24	0.85	0.53
CCL19201 (BN171_2950003)	0.25	0.25	0.13	0.43	0.16	0.02	1.0	0.1	0.11	0.89	0.6	0.67	0.31	0.15	0.31	0.23	0.19	0.15	0.29	0.14	0.38	0.19	0.32	0.33	0.2	0.07	0.17	0.78	0.37
CCL19331 (BN171_3050005)	0.05	0.04	0.08	0.1	0.09	0.03	1.0	0.02	0.05	0.11	0.17	0.35	0.18	0.0	0.07	0.28	0.1	0.05	0.26	0.02	0.05	0.05	0.58	0.34	0.04	0.01	0.25	0.21	0.32
CCL19333 (BN171_3050007)	0.24	0.21	0.4	0.72	0.25	0.19	1.0	0.07	0.46	0.27	0.19	0.21	0.44	0.25	0.2	0.54	0.13	0.12	0.21	0.37	0.58	0.03	0.21	0.15	0.19	0.16	0.16	0.18	0.15
CCL19452 (BN171_3150015)	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.1	1.0	0.03	0.09	0.63	0.87	0.39	0.11	0.07	0.02	0.11	0.29	0.1	0.28	0.07	0.15	0.06	0.21	0.04	0.16	0.08	0.02	0.94	0.76
CCL19481 (murQ)	0.24	0.29	0.44	1.0	0.6	0.28	0.45	0.23	0.13	0.37	0.32	0.42	0.39	0.17	0.26	0.35	0.16	0.24	0.31	0.26	0.16	0.39	0.28	0.11	0.1	0.19	0.06	0.38	0.22
CCL19482 (BN171_3180006)	0.15	0.22	0.38	1.0	0.35	0.11	0.91	0.12	0.12	0.67	0.35	0.45	0.54	0.16	0.19	0.24	0.09	0.13	0.25	0.11	0.06	0.07	0.16	0.04	0.07	0.08	0.05	0.34	0.05
CCL19492 (BN171_3180016)	0.24	0.6	0.23	0.39	0.31	0.15	0.77	0.18	0.1	0.73	0.51	0.57	0.37	0.29	0.54	0.54	0.24	0.45	0.34	0.37	0.75	0.04	0.34	0.18	0.23	0.26	0.07	0.42	1.0
CCL19494 (BN171_3180018)	0.15	0.48	0.11	0.34	0.16	0.08	1.0	0.19	0.17	0.9	0.8	0.6	0.33	0.14	0.49	0.44	0.19	0.22	0.28	0.1	0.53	0.26	0.26	0.18	0.16	0.12	0.06	0.54	0.86
CCL19495 (BN171_3180019)	0.07	0.26	0.06	0.29	0.06	0.01	0.71	0.07	0.06	1.0	0.7	0.34	0.31	0.05	0.33	0.51	0.09	0.12	0.18	0.04	0.49	0.16	0.06	0.33	0.13	0.04	0.04	0.65	0.53
CCL19557 (BN171_3260008)	0.05	0.08	0.08	0.19	0.09	0.08	1.0	0.06	0.05	0.3	0.14	0.21	0.25	0.03	0.12	0.24	0.1	0.08	0.21	0.07	0.28	0.86	0.22	0.09	0.08	0.07	0.34	0.03	0.16
CCL19558 (BN171_3260009)	0.05	0.13	0.09	0.28	0.13	0.03	0.77	0.06	0.05	0.25	0.13	0.16	0.21	0.04	0.13	0.25	0.08	0.1	0.15	0.08	0.34	1.0	0.13	0.06	0.05	0.1	0.21	0.32	0.17
CCL19894 (BN171_3590015)	0.24	0.21	0.36	0.62	0.54	1.0	0.15	0.21	0.44	0.04	0.1	0.44	0.68	0.16	0.28	0.8	0.45	0.4	0.57	0.4	0.91	0.63	0.61	0.55	0.84	0.38	0.17	0.68	0.07
CCL19895 (BN171_3590016)	0.23	0.21	0.39	0.66	0.51	0.72	0.0	0.28	0.15	0.05	0.18	0.11	0.68	0.23	0.24	1.0	0.24	0.28	0.34	0.34	0.47	0.37	0.36	0.26	0.51	0.35	0.06	0.86	0.08
CCL19896 (BN171_3590017)	0.25	0.27	0.4	0.53	0.57	0.8	0.37	0.31	0.3	0.19	0.4	0.31	0.61	0.17	0.27	1.0	0.23	0.33	0.4	0.33	0.45	0.33	0.24	0.16	0.36	0.34	0.05	0.51	0.12
CCL20248 (BN171_390002)	0.15	0.16	0.15	0.34	0.25	0.1	0.18	0.15	0.08	0.62	0.17	0.45	0.74	0.18	0.23	1.0	0.28	0.11	0.46	0.24	0.36	0.42	0.36	0.29	0.3	0.14	0.06	0.52	0.56
CCL20604 (BN171_710002)	0.31	0.15	0.25	0.63	0.39	0.08	0.18	0.18	0.05	0.62	0.41	0.52	0.58	0.24	0.18	1.0	0.27	0.31	0.26	0.11	0.07	0.26	0.17	0.07	0.4	0.15	0.06	0.36	0.22
CCL20605 (BN171_710003)	0.26	0.12	0.6	0.47	0.77	0.52	0.94	0.29	0.18	0.7	0.71	0.72	0.53	0.38	0.16	0.49	0.31	0.54	0.3	0.37	0.15	0.29	0.21	0.36	0.32	0.51	0.14	1.0	0.94
CCL20657 (BN171_840001)	0.03	0.02	1.0	0.8	0.33	0.08	0.34	0.01	0.06	0.32	0.28	0.27	0.37	0.1	0.05	0.41	0.13	0.04	0.1	0.07	0.18	0.5	0.1	0.04	0.12	0.03	0.22	0.66	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)