1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL16967 (BN171_1030017)
 0.05 0.39 0.11 0.56 0.05 0.07 0.04 0.08 0.22 0.13 0.25 0.0 0.99 0.05 0.47 1.0 0.31 0.08 0.33 0.05 0.36 0.26 0.06 0.04 0.06 0.0 0.25 0.0 0.57
CCL16968 (BN171_1030018)
 0.28 0.45 0.14 0.36 0.16 0.1 0.47 0.15 0.25 0.13 0.2 0.27 1.0 0.1 0.38 0.91 0.44 0.16 0.42 0.1 0.35 0.56 0.54 0.24 0.25 0.08 0.59 0.0 0.22
CCL16969 (BN171_1030019)
 0.32 0.45 0.28 0.61 0.53 0.28 0.28 0.34 0.27 0.37 0.44 0.44 0.91 0.24 0.53 1.0 0.58 0.48 0.5 0.35 0.4 0.94 0.99 0.31 0.32 0.27 0.71 0.0 0.4
CCL17119 (BN171_1280003)
 0.05 0.05 0.14 0.2 0.13 0.0 0.38 0.03 0.03 0.22 0.23 0.2 1.0 0.13 0.39 0.11 0.21 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
CCL17152 (BN171_1330013)
 0.18 0.41 0.39 1.0 0.37 0.07 0.03 0.15 0.19 0.03 0.02 0.03 0.74 0.13 0.28 0.44 0.08 0.15 0.06 0.11 0.32 0.19 0.11 0.03 0.07 0.08 0.04 0.31 0.01
CCL17153 (nagA)
 0.14 0.33 0.27 1.0 0.41 0.08 0.04 0.1 0.06 0.04 0.02 0.03 0.37 0.14 0.25 0.34 0.07 0.12 0.06 0.09 0.25 0.16 0.07 0.03 0.07 0.08 0.06 0.24 0.02
CCL17154 (nagB)
 0.11 0.2 0.26 0.82 0.24 0.2 0.12 0.07 0.07 0.09 0.07 0.08 0.69 0.12 0.15 1.0 0.12 0.09 0.11 0.11 0.33 0.19 0.15 0.16 0.29 0.09 0.2 0.51 0.05
CCL17163 (BN171_1330024)
 0.0 0.03 0.09 0.04 0.04 0.4 0.22 0.0 0.34 0.12 0.11 0.08 1.0 0.09 0.0 0.76 0.24 0.0 0.26 0.14 0.08 0.0 0.17 0.09 0.17 0.0 0.16 0.56 0.0
CCL17164 (BN171_1330025)
 0.24 0.14 0.08 0.25 0.04 0.19 0.15 0.05 0.2 0.08 0.13 0.22 0.92 0.24 0.07 1.0 0.18 0.13 0.3 0.27 0.25 0.33 0.54 0.27 0.28 0.02 0.43 0.73 0.23
CCL17267 (BN171_1420010)
 0.04 0.02 0.02 0.15 0.07 0.25 0.35 0.03 0.23 0.26 0.27 0.23 1.0 0.01 0.02 0.78 0.21 0.01 0.27 0.03 0.03 0.07 0.48 0.3 0.15 0.0 0.6 0.67 0.37
CCL17455 (BN171_1500031)
 0.03 0.01 0.04 0.06 0.07 0.08 0.53 0.0 0.07 1.0 0.89 0.95 0.56 0.08 0.02 0.26 0.17 0.04 0.23 0.03 0.02 0.04 0.72 0.14 0.14 0.01 0.02 0.98 0.63
CCL17589 (yycF)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL17656 (BN171_1640046)
 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.55 0.03 0.02 0.8 0.79 1.0 0.1 0.0 0.01 0.02 0.18 0.01 0.19 0.0 0.0 0.0 0.58 0.34 0.04 0.0 0.03 0.82 0.89
CCL17795 (kdpA)
 0.03 0.02 0.04 0.13 0.05 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 1.0 0.02 0.04 0.28 0.02 0.02 0.12 0.03 0.07 0.09 0.08 0.04 0.05 0.02 0.05 0.2 0.01
CCL17796 (kdpB)
 0.08 0.04 0.08 0.18 0.09 0.05 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 1.0 0.06 0.04 0.31 0.05 0.06 0.1 0.09 0.07 0.14 0.08 0.07 0.05 0.06 0.06 0.17 0.02
CCL17797 (kdpC)
 0.17 0.04 0.14 0.16 0.08 0.13 0.09 0.08 0.05 0.01 0.07 0.05 1.0 0.15 0.04 0.26 0.07 0.1 0.1 0.16 0.08 0.06 0.12 0.11 0.08 0.11 0.09 0.19 0.04
CCL17831 (vanG)
 0.15 0.05 0.16 0.23 0.17 0.17 0.18 0.02 0.19 0.27 0.21 0.21 1.0 0.09 0.07 0.31 0.13 0.09 0.21 0.13 0.09 0.21 0.21 0.16 0.45 0.07 0.07 0.0 0.14
CCL17832 (vanY)
 0.23 0.16 0.21 0.39 0.18 0.17 0.36 0.07 0.17 0.54 0.32 0.38 1.0 0.11 0.1 0.39 0.16 0.14 0.26 0.2 0.14 0.18 0.29 0.18 0.41 0.17 0.04 0.0 0.19
CCL18028 (BN171_2030014)
 0.19 0.3 0.18 0.43 0.16 0.26 0.37 0.12 0.32 0.21 0.43 0.51 0.51 0.08 0.17 0.42 0.2 0.13 0.35 0.15 0.17 0.21 0.75 0.61 0.29 0.09 0.56 1.0 0.4
CCL18029 (BN171_2030015)
 0.13 0.28 0.19 0.34 0.23 0.27 1.0 0.14 0.34 0.69 0.37 0.47 0.69 0.26 0.29 0.5 0.38 0.2 0.36 0.25 0.26 0.19 0.52 0.89 0.35 0.1 0.82 0.83 0.34
CCL18305 (BN171_2210005)
 0.25 0.03 0.52 0.47 0.24 0.17 0.49 0.04 1.0 0.77 0.56 0.57 0.99 0.22 0.08 0.72 0.32 0.14 0.18 0.11 0.1 0.09 0.37 0.59 0.65 0.04 0.18 0.0 0.51
CCL18477 (trxB)
 0.27 0.35 0.37 0.35 0.26 0.06 0.8 0.24 0.17 0.64 0.78 0.96 0.3 0.07 0.27 0.1 0.34 0.22 0.33 0.09 0.08 0.11 0.98 0.5 0.06 0.04 0.18 0.74 1.0
CCL18554 (BN171_2420021)
 0.69 0.25 0.47 1.0 0.49 0.33 0.74 0.17 0.1 0.33 0.47 0.33 0.93 0.77 0.27 0.7 0.18 0.34 0.25 0.55 0.27 0.39 0.49 0.18 0.23 0.14 0.59 0.22 0.32
CCL18635 (BN171_2480010)
 0.08 0.14 0.41 1.0 0.31 0.06 0.03 0.04 0.1 0.03 0.07 0.07 0.33 0.14 0.22 0.09 0.03 0.1 0.07 0.09 0.14 0.16 0.05 0.03 0.04 0.04 0.03 0.17 0.05
CCL18636 (BN171_2480011)
 0.06 0.06 0.19 0.58 0.16 0.02 0.07 0.01 0.02 0.03 0.07 0.07 0.18 0.14 0.11 0.03 0.03 0.07 0.06 0.05 0.14 0.08 0.02 0.02 0.03 0.01 0.07 1.0 0.06
CCL18637 (BN171_2480012)
 0.06 0.15 0.19 0.85 0.25 0.01 0.07 0.02 0.01 0.03 0.05 0.03 0.26 0.13 0.25 0.02 0.02 0.13 0.11 0.04 0.16 0.12 0.01 0.02 0.04 0.02 0.16 1.0 0.03
CCL18638 (nanA)
 0.05 0.14 0.16 0.73 0.19 0.02 0.1 0.02 0.02 0.11 0.09 0.06 0.35 0.14 0.21 0.03 0.03 0.12 0.11 0.03 0.12 0.14 0.01 0.02 0.06 0.01 0.14 1.0 0.1
CCL18639 (nanE)
 0.09 0.21 0.31 1.0 0.31 0.02 0.03 0.05 0.02 0.03 0.03 0.01 0.26 0.25 0.38 0.03 0.03 0.21 0.09 0.04 0.16 0.15 0.01 0.01 0.03 0.02 0.04 0.35 0.03
CCL18674 (BN171_2480049)
 0.57 0.32 0.63 0.62 0.5 0.27 0.62 0.49 0.15 0.35 0.66 0.34 0.58 0.46 0.31 0.94 0.41 0.46 0.45 0.5 0.21 0.42 0.87 0.48 0.34 0.24 0.61 1.0 0.18
CCL18802 (BN171_2640001)
 0.25 0.21 0.33 0.34 0.44 0.29 0.07 0.22 0.1 0.2 0.2 0.24 0.6 0.25 0.18 0.23 0.23 0.25 0.2 0.25 0.12 1.0 0.13 0.41 0.37 0.23 0.04 0.42 0.1
CCL18906 (BN171_2720006)
 0.14 0.07 0.21 0.24 0.18 0.31 0.49 0.09 0.26 0.5 0.44 0.46 0.4 0.14 0.08 0.4 0.3 0.17 0.37 0.2 0.14 0.05 0.74 0.4 0.23 0.09 0.3 1.0 0.37
CCL18907 (BN171_2720007)
 0.17 0.18 0.22 0.27 0.17 0.36 0.23 0.16 0.24 0.33 0.22 0.32 0.42 0.18 0.13 0.42 0.25 0.24 0.34 0.24 0.16 0.18 0.51 0.11 0.15 0.16 0.26 1.0 0.23
CCL18908 (BN171_2720008)
 0.04 0.03 0.03 0.07 0.04 0.22 0.21 0.09 0.09 0.06 0.09 0.09 0.19 0.05 0.05 0.1 0.16 0.19 0.29 0.06 0.05 0.19 0.36 0.09 0.11 0.06 0.51 1.0 0.14
CCL18909 (BN171_2720009)
 0.13 0.21 0.16 0.27 0.16 0.73 0.64 0.32 0.2 0.12 0.21 0.3 0.3 0.23 0.21 0.15 0.36 0.65 0.63 0.24 0.16 0.35 0.63 0.22 0.2 0.33 0.68 1.0 0.42
CCL18910 (BN171_2720010)
 0.09 0.17 0.08 0.24 0.08 0.58 0.37 0.2 0.16 0.21 0.44 0.7 0.4 0.15 0.11 0.18 0.33 0.37 0.61 0.21 0.09 0.35 0.73 0.19 0.15 0.14 0.7 1.0 0.53
CCL18911 (BN171_2720011)
 0.05 0.05 0.07 0.12 0.06 0.29 0.66 0.04 0.2 0.41 0.44 0.63 0.37 0.12 0.06 0.07 0.17 0.13 0.42 0.17 0.07 0.05 0.66 0.35 0.12 0.06 0.57 1.0 0.53
CCL18912 (BN171_2720012)
 0.08 0.11 0.17 0.2 0.1 0.25 0.55 0.14 0.06 0.63 0.54 0.59 0.41 0.12 0.08 0.2 0.2 0.21 0.36 0.16 0.08 0.08 0.93 0.34 0.11 0.09 0.29 1.0 0.59
CCL19237 (BN171_300003)
 0.04 0.04 0.08 0.35 0.24 0.1 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.18 0.03 0.21 0.0 0.08 0.16 0.17 0.0 0.0 1.0 0.19 0.17 0.11 0.11 0.43 0.0 0.0
CCL19446 (BN171_3150009)
 0.32 0.51 0.32 0.44 0.28 0.05 0.48 0.33 0.09 0.53 0.82 0.97 0.32 0.08 0.33 0.12 0.16 0.3 0.34 0.12 0.12 0.02 0.59 0.6 0.1 0.08 0.17 0.74 1.0
CCL19468 (trxA)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.02 0.29 0.62 0.7 0.09 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.26 0.0 0.0 0.01 0.74 0.06 0.01 0.0 0.03 0.46 1.0
CCL19562 (bglG)
 0.03 0.01 0.1 0.06 0.11 0.24 0.32 0.03 0.07 0.56 0.48 0.52 1.0 0.74 0.06 0.48 0.09 0.52 0.67 0.41 0.06 0.24 0.23 0.19 0.36 0.14 0.05 0.28 0.46
CCL19605 (BN171_3290018)
 0.0 0.0 0.32 0.16 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.05 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL19606 (BN171_3290019)
 0.26 0.42 0.47 1.0 0.32 0.0 0.52 0.3 0.04 0.55 0.27 0.22 0.58 0.19 0.34 0.08 0.18 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
CCL19607 (BN171_3290020)
 0.0 0.0 0.0 0.13 0.17 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0 0.17 0.6 1.0 0.17 0.0 0.18 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL19743 (phoU)
 0.22 0.05 0.31 0.09 0.09 0.07 0.21 0.08 0.07 0.05 0.1 0.14 0.53 0.96 0.05 0.15 0.11 0.07 0.68 1.0 0.06 0.16 0.83 0.12 0.05 0.09 0.13 0.41 0.08
CCL19744 (pstB)
 0.3 0.12 0.35 0.13 0.09 0.03 0.15 0.11 0.13 0.09 0.19 0.09 0.73 0.84 0.11 0.12 0.14 0.12 0.72 1.0 0.06 0.14 0.82 0.16 0.04 0.08 0.18 0.37 0.11
CCL19745 (pstA)
 0.23 0.04 0.4 0.11 0.07 0.02 0.1 0.05 0.12 0.15 0.06 0.04 0.65 0.87 0.04 0.16 0.09 0.07 0.46 1.0 0.08 0.14 0.54 0.13 0.07 0.06 0.21 0.49 0.09
CCL19834 (BN171_3530001)
 0.35 0.16 0.26 0.58 0.28 0.26 0.1 0.11 0.04 0.13 0.2 0.21 0.88 0.19 0.18 0.87 0.18 0.2 0.38 0.16 0.12 0.14 0.28 0.2 0.58 0.14 0.09 1.0 0.06
CCL19835 (BN171_3530002)
 0.46 0.27 0.37 0.9 0.5 0.16 0.14 0.11 0.08 0.14 0.12 0.07 0.76 0.14 0.27 0.74 0.15 0.25 0.41 0.12 0.13 0.21 0.23 0.27 0.71 0.13 0.02 1.0 0.23
CCL20199 (BN171_3780005)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0 0.0
CCL20221 (BN171_3800001)
 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.03 0.0 0.11 0.21 0.0
CCL20222 (BN171_3800002)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0
CCL20223 (BN171_3800003)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.05 0.25 0.0
CCL20224 (BN171_3800004)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0
CCL20233 (BN171_3840001)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL20237 (BN171_3860004)
 0.05 0.15 0.09 0.29 0.19 0.21 0.09 0.04 0.0 0.0 0.18 0.25 0.52 0.33 1.0 0.0 0.21 0.58 0.03 0.36 0.06 0.0 0.0 0.04 0.06 0.19 0.04 0.0 0.0
CCL20245 (BN171_3890001)
 0.09 0.19 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.59 1.0 0.01 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL20271 (REP)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.18 0.17 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL20318 (BN171_4140001)
 0.0 0.06 0.0 0.09 0.0 0.04 0.72 0.0 0.0 0.21 0.65 0.63 1.0 0.03 0.0 0.0 0.17 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0
CCL20364 (BN171_4240003)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL20423 (BN171_4410001)
 0.16 0.29 0.37 0.95 0.06 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.28 0.27 1.0 0.15 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL20477 (BN171_540002)
 0.25 0.12 0.24 0.46 0.36 0.05 0.35 0.11 0.08 0.33 0.32 0.37 0.57 0.3 0.15 0.62 0.33 0.42 0.4 0.07 0.09 0.09 0.51 0.05 0.16 0.12 0.04 1.0 0.26
CCL20478 (BN171_540003)
 0.07 0.02 0.21 0.26 0.16 0.03 0.26 0.02 0.1 0.35 0.2 0.26 0.53 0.14 0.03 0.38 0.27 0.09 0.27 0.03 0.03 0.0 0.55 0.03 0.1 0.01 0.01 1.0 0.34
CCL20627 (BN171_770004)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
CCL20660 (BN171_870001)
 0.53 0.13 0.37 0.23 0.55 0.51 0.11 0.53 0.08 0.19 0.2 0.14 0.53 0.54 0.17 0.76 0.32 0.6 0.49 0.59 0.17 0.07 0.56 0.68 1.0 0.5 0.05 0.59 0.24
CCL20662 (BN171_870003)
 0.12 0.02 0.18 0.15 0.22 0.38 0.9 0.05 0.09 0.92 1.0 0.81 0.78 0.17 0.06 0.71 0.29 0.16 0.42 0.15 0.06 0.14 0.48 0.16 0.52 0.08 0.29 0.83 0.53
CCL20663 (BN171_870004)
 0.28 0.28 0.32 0.42 0.16 0.18 0.46 0.09 0.23 0.32 0.2 0.34 1.0 0.28 0.41 0.38 0.28 0.13 0.58 0.23 0.57 0.08 0.64 0.25 0.29 0.12 0.5 0.42 0.21
CCL20664 (BN171_870005)
 0.22 0.24 0.21 0.29 0.2 0.39 0.42 0.12 0.14 0.36 0.21 0.19 1.0 0.3 0.33 0.38 0.2 0.12 0.41 0.17 0.54 0.0 0.37 0.16 0.21 0.08 0.14 0.27 0.17
CCL20665 (BN171_880001)
 0.41 0.31 0.45 1.0 0.58 0.0 0.43 0.24 0.26 0.57 0.09 0.47 0.7 0.3 0.66 0.66 0.34 0.31 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
CCL20666 (BN171_880002)
 0.67 0.5 0.44 0.86 0.48 0.0 0.78 0.38 0.44 0.61 0.32 0.28 0.86 0.44 0.7 1.0 0.37 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)