Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16921 (rsbV)	0.04	0.03	0.12	0.04	0.08	0.19	0.67	0.02	0.22	1.0	0.59	0.92	0.55	0.17	0.04	0.6	0.24	0.03	0.43	0.18	0.15	0.1	0.34	0.29	0.28	0.05	0.14	0.37	0.76
CCL16940 (spoIIAA)	0.03	0.15	0.06	0.12	0.04	0.03	1.0	0.03	0.03	0.49	0.07	0.2	0.09	0.04	0.11	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.11	0.34	0.03	0.03	0.02	0.04	0.11	0.02	0.03
CCL16941 (spoIIAB)	0.02	0.12	0.03	0.07	0.02	0.04	0.87	0.03	0.02	0.38	0.07	0.2	0.09	0.01	0.08	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	1.0	0.03	0.03	0.02	0.02	0.17	0.02	0.02
CCL16942 (sigF)	0.01	0.08	0.02	0.05	0.01	0.03	1.0	0.02	0.02	0.4	0.09	0.23	0.1	0.01	0.05	0.06	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.92	0.03	0.04	0.03	0.01	0.22	0.02	0.04
CCL17155 (BN171_1330016)	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.0	1.0	0.01	0.1	0.39	0.08	0.14	0.06	0.02	0.03	0.03	0.14	0.01	0.04	0.01	0.02	0.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.26	0.06	0.03
CCL17397 (BN171_1480009)	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.07	1.0	0.03	0.04	0.17	0.12	0.13	0.23	0.07	0.02	0.41	0.05	0.06	0.07	0.05	0.02	0.23	0.14	0.1	0.14	0.03	0.11	0.25	0.06
CCL17560 (BN171_1550013)	0.03	0.04	0.03	0.07	0.03	0.01	1.0	0.01	0.01	0.17	0.02	0.06	0.05	0.02	0.03	0.13	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.0
CCL17561 (BN171_1550014)	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	1.0	0.01	0.0	0.19	0.02	0.09	0.06	0.01	0.01	0.16	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.02	0.0
CCL17562 (BN171_1550015)	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	1.0	0.01	0.02	0.22	0.03	0.08	0.08	0.02	0.01	0.17	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.03	0.02
CCL17574 (BN171_1580001)	0.26	0.27	0.2	0.33	0.18	0.24	1.0	0.12	0.1	0.53	0.28	0.27	0.29	0.1	0.09	0.3	0.09	0.08	0.27	0.28	0.21	0.41	0.47	0.13	0.21	0.16	0.58	0.2	0.19
CCL17774 (BN171_1790003)	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	1.0	0.01	0.01	0.2	0.04	0.05	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01
CCL17836 (asnB)	0.24	0.14	0.19	0.21	0.15	0.2	1.0	0.11	0.45	0.55	0.49	0.37	0.56	0.27	0.14	0.35	0.18	0.16	0.45	0.29	0.29	0.32	0.49	0.39	0.29	0.16	0.73	0.16	0.32
CCL17869 (BN171_1900001)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.25	0.03	0.11	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
CCL18183 (BN171_2140025)	0.06	0.02	0.17	0.13	0.19	0.23	1.0	0.05	0.2	0.17	0.18	0.14	0.31	0.25	0.08	0.22	0.17	0.14	0.15	0.16	0.08	0.19	0.15	0.18	0.23	0.12	0.22	0.15	0.13
CCL18351 (BN171_2230001)	0.13	0.02	0.22	0.17	0.23	0.18	1.0	0.04	0.3	0.43	0.3	0.33	0.45	0.2	0.05	0.56	0.15	0.14	0.14	0.2	0.16	0.02	0.13	0.09	0.14	0.1	0.02	0.36	0.27
CCL18841 (BN171_2680010)	0.06	0.08	0.07	0.2	0.14	0.03	1.0	0.02	0.09	0.0	0.0	0.07	0.06	0.06	0.09	0.0	0.14	0.04	0.04	0.09	0.18	0.2	0.02	0.03	0.01	0.06	0.09	0.05	0.0
CCL18854 (BN171_2690011)	0.28	0.15	0.2	0.14	0.23	0.2	1.0	0.2	0.11	0.57	0.47	0.43	0.59	0.3	0.15	0.57	0.22	0.25	0.17	0.32	0.11	0.59	0.33	0.16	0.28	0.2	0.21	0.24	0.39
CCL19231 (uppS)	0.11	0.04	0.08	0.11	0.13	0.05	1.0	0.1	0.19	0.32	0.16	0.24	0.22	0.09	0.03	0.17	0.09	0.1	0.13	0.08	0.07	0.7	0.32	0.14	0.11	0.09	0.4	0.17	0.1
CCL19329 (abgT)	0.04	0.07	0.04	0.08	0.04	0.01	1.0	0.04	0.01	0.13	0.03	0.33	0.09	0.02	0.05	0.15	0.04	0.04	0.06	0.03	0.03	0.05	0.11	0.03	0.02	0.02	0.09	0.11	0.07
CCL19332 (BN171_3050006)	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	1.0	0.0	0.03	0.16	0.23	0.46	0.23	0.02	0.01	0.28	0.03	0.01	0.08	0.04	0.06	0.03	0.07	0.05	0.06	0.01	0.35	0.32	0.04
CCL19457 (BN171_3150020)	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	1.0	0.03	0.01	0.13	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.04
CCL19458 (BN171_3150021)	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	1.0	0.01	0.01	0.09	0.03	0.05	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.0	0.02
CCL19459 (BN171_3150022)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
CCL19497 (BN171_3180021)	0.39	0.16	0.48	0.43	0.43	0.79	1.0	0.22	0.4	0.59	0.53	0.34	0.84	0.48	0.19	0.97	0.25	0.29	0.78	0.74	0.37	0.15	0.91	0.18	0.42	0.32	0.51	0.67	0.27
CCL19632 (BN171_3330003)	0.27	0.3	0.3	0.32	0.29	0.48	0.82	0.27	0.55	1.0	0.8	0.81	0.71	0.26	0.36	0.92	0.3	0.34	0.83	0.51	0.41	0.46	0.84	0.26	0.3	0.39	0.1	0.47	0.72
CCL19770 (BN171_3470008)	0.02	0.0	0.08	0.04	0.07	0.09	0.54	0.0	0.1	0.33	0.34	0.36	0.69	0.06	0.01	1.0	0.21	0.04	0.41	0.07	0.05	0.08	0.44	0.27	0.44	0.01	0.06	0.34	0.46
CCL19771 (BN171_3470009)	0.17	0.03	0.23	0.14	0.19	0.23	1.0	0.05	0.22	0.77	0.78	0.76	0.67	0.27	0.07	0.83	0.39	0.18	0.68	0.18	0.17	0.16	0.68	0.5	0.71	0.11	0.11	0.53	0.82
CCL19772 (BN171_3470010)	0.13	0.03	0.19	0.07	0.17	0.13	1.0	0.11	0.07	0.66	0.5	0.59	0.41	0.24	0.04	0.56	0.15	0.15	0.25	0.18	0.06	0.28	0.29	0.13	0.26	0.14	0.03	0.26	0.53
CCL19884 (cobC)	0.12	0.06	0.17	0.1	0.17	0.27	0.6	0.06	0.2	1.0	0.93	0.79	0.57	0.15	0.1	0.73	0.16	0.11	0.51	0.33	0.32	0.1	0.42	0.23	0.29	0.15	0.08	0.22	0.66
CCL19885 (cobS)	0.05	0.05	0.1	0.06	0.1	0.28	0.55	0.03	0.08	1.0	0.8	0.7	0.53	0.06	0.08	0.68	0.11	0.08	0.39	0.09	0.19	0.28	0.27	0.21	0.27	0.05	0.02	0.12	0.5
CCL19886 (cobU)	0.07	0.09	0.1	0.08	0.1	0.38	0.57	0.06	0.14	1.0	0.86	0.88	0.53	0.07	0.11	0.64	0.1	0.09	0.54	0.16	0.37	0.21	0.3	0.26	0.32	0.08	0.03	0.12	0.64
CCL19962 (BN171_3610005)	0.05	0.01	0.17	0.06	0.1	0.17	1.0	0.04	0.03	0.52	0.38	0.48	0.39	0.08	0.03	0.71	0.11	0.07	0.32	0.16	0.08	0.06	0.35	0.18	0.31	0.06	0.22	0.34	0.38
CCL20018 (BN171_3670001)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	1.0	0.0	0.01	0.3	0.02	0.01	0.1	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.03	0.0	0.01	0.05	0.03	0.02	0.02	0.0	0.1	0.03	0.01
CCL20345 (BN171_4230002)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.09	0.17	0.02
CCL20444 (BN171_460008)	0.07	0.03	0.09	0.05	0.08	0.12	1.0	0.05	0.02	0.46	0.26	0.36	0.23	0.07	0.05	0.2	0.09	0.08	0.13	0.11	0.04	0.4	0.16	0.11	0.13	0.06	0.2	0.12	0.25
CCL20599 (cwlD)	0.2	0.07	0.37	0.49	0.5	0.06	1.0	0.21	0.02	0.15	0.17	0.17	0.46	0.24	0.11	0.29	0.13	0.3	0.15	0.15	0.07	0.35	0.11	0.05	0.18	0.16	0.22	0.17	0.2
CCL20603 (BN171_710001)	0.21	0.18	0.19	0.21	0.22	0.21	1.0	0.22	0.21	0.54	0.55	0.49	0.58	0.14	0.17	0.64	0.33	0.25	0.45	0.22	0.17	0.57	0.71	0.4	0.58	0.14	0.96	0.44	0.45
CCL20615 (BN171_740003)	0.2	0.07	0.4	0.19	0.42	0.27	0.77	0.13	0.24	1.0	0.84	0.59	0.82	0.33	0.16	0.7	0.23	0.31	0.71	0.33	0.29	0.03	0.55	0.51	0.51	0.15	0.2	0.57	0.66
CCL20631 (BN171_770008)	0.04	0.02	0.08	0.07	0.04	0.2	0.69	0.01	0.57	1.0	0.81	0.47	0.97	0.06	0.04	0.93	0.44	0.04	0.89	0.09	0.08	0.1	0.81	0.58	0.7	0.03	0.25	0.83	0.74
CCL20667 (BN171_880003)	0.15	0.13	0.11	0.17	0.14	0.0	1.0	0.1	0.05	0.22	0.13	0.15	0.29	0.08	0.13	0.24	0.15	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
CCL20717 (cooS)	0.02	0.23	0.03	0.22	0.02	0.04	1.0	0.03	0.22	0.51	0.26	0.26	0.25	0.01	0.18	0.03	0.09	0.02	0.2	0.03	0.23	0.14	0.08	0.1	0.04	0.02	0.19	0.05	0.16
CCL20721 (fchA)	0.01	0.12	0.02	0.1	0.02	0.04	1.0	0.03	0.03	0.67	0.34	0.36	0.17	0.01	0.1	0.03	0.08	0.02	0.07	0.01	0.09	0.09	0.02	0.03	0.02	0.01	0.07	0.05	0.22
CCL20722 (folD)	0.02	0.2	0.04	0.2	0.06	0.05	1.0	0.05	0.02	0.61	0.36	0.4	0.18	0.01	0.17	0.04	0.1	0.04	0.09	0.02	0.15	0.17	0.02	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05	0.26
CCL20723 (BN171_960015)	0.01	0.13	0.02	0.12	0.03	0.05	1.0	0.03	0.02	0.78	0.38	0.41	0.14	0.01	0.1	0.03	0.13	0.02	0.1	0.01	0.1	0.23	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.05	0.24
CCL20724 (metF)	0.03	0.28	0.04	0.25	0.07	0.04	1.0	0.07	0.02	0.78	0.37	0.39	0.14	0.02	0.23	0.03	0.12	0.04	0.09	0.02	0.17	0.2	0.02	0.03	0.03	0.03	0.07	0.07	0.24
CCL20725 (BN171_960017)	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.02	1.0	0.02	0.02	0.68	0.32	0.36	0.16	0.0	0.07	0.03	0.08	0.01	0.06	0.0	0.06	0.09	0.02	0.03	0.02	0.01	0.07	0.05	0.25
CCL20726 (BN171_960018)	0.01	0.2	0.02	0.19	0.02	0.03	1.0	0.04	0.02	0.61	0.33	0.4	0.16	0.01	0.15	0.03	0.11	0.02	0.08	0.01	0.14	0.08	0.02	0.03	0.02	0.01	0.06	0.05	0.23
CCL20731 (gcvH)	0.1	0.43	0.11	0.46	0.06	0.04	1.0	0.07	0.12	0.42	0.3	0.3	0.2	0.03	0.24	0.08	0.22	0.04	0.1	0.15	0.46	0.08	0.07	0.12	0.07	0.05	0.15	0.13	0.26
CCL20732 (BN171_960024)	0.04	0.12	0.05	0.17	0.04	0.09	1.0	0.03	0.28	0.73	0.38	0.42	0.23	0.01	0.08	0.11	0.16	0.02	0.29	0.06	0.26	0.21	0.21	0.12	0.07	0.03	0.24	0.12	0.28
CCL20733 (BN171_960025)	0.04	0.11	0.06	0.17	0.05	0.06	1.0	0.03	0.23	0.66	0.4	0.39	0.24	0.02	0.08	0.09	0.13	0.02	0.25	0.06	0.23	0.25	0.18	0.13	0.07	0.03	0.26	0.07	0.29
CCL20734 (BN171_960026)	0.02	0.07	0.04	0.13	0.04	0.08	1.0	0.02	0.16	0.95	0.5	0.5	0.25	0.02	0.06	0.11	0.13	0.02	0.26	0.05	0.23	0.1	0.22	0.11	0.07	0.02	0.18	0.13	0.32
CCL20735 (BN171_960027)	0.1	0.24	0.11	0.31	0.09	0.11	1.0	0.06	0.15	0.75	0.41	0.45	0.21	0.06	0.15	0.09	0.12	0.06	0.26	0.1	0.33	0.26	0.19	0.09	0.05	0.06	0.15	0.11	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)