Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16985 (BN171_1040002)	0.05	0.02	0.09	0.18	0.07	0.01	0.12	0.02	1.0	0.14	0.06	0.08	0.25	0.06	0.03	0.07	0.08	0.03	0.1	0.03	0.09	0.14	0.05	0.07	0.08	0.01	0.02	0.14	0.09
CCL16994 (rbr)	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.4	0.03	0.01	1.0	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.39	0.01	0.01	0.03	0.2	0.31	0.49	0.01	0.34	0.05	0.03
CCL16995 (BN171_1060009)	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.44	0.01	0.01	0.01	0.33	0.67	0.78	0.0	0.59	0.07	0.03
CCL16996 (rbo)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.01	0.0	1.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.35	0.0	0.01	0.02	0.23	0.43	0.47	0.0	0.46	0.04	0.02
CCL16997 (BN171_1060011)	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.5	0.03	0.01	0.78	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.86	0.01	0.02	0.06	0.8	0.63	0.82	0.01	1.0	0.11	0.04
CCL16998 (BN171_1060012)	0.06	0.06	0.16	0.38	0.2	0.49	0.08	0.02	1.0	0.11	0.09	0.08	0.26	0.06	0.09	0.14	0.07	0.06	0.64	0.2	0.17	0.13	0.59	0.4	0.72	0.08	0.33	0.68	0.05
CCL17037 (modA)	0.23	0.07	0.23	0.29	0.14	0.02	0.02	0.04	0.92	0.03	0.03	0.04	0.27	0.37	0.07	1.0	0.17	0.05	0.12	0.26	0.1	0.06	0.01	0.35	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03
CCL17602 (BN171_1600006)	0.18	0.42	0.21	0.25	0.11	0.27	0.25	0.13	1.0	0.14	0.1	0.12	0.15	0.13	0.26	0.06	0.15	0.07	0.18	0.26	0.21	0.17	0.12	0.23	0.04	0.11	0.13	0.1	0.09
CCL17662 (feoA)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.0	0.07	0.01	0.0
CCL17663 (feoA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
CCL17664 (feoB)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0
CCL17680 (BN171_1670012)	0.23	0.11	0.45	0.33	0.37	0.72	0.3	0.14	1.0	0.28	0.26	0.22	0.43	0.15	0.07	0.54	0.69	0.14	0.57	0.27	0.21	0.25	0.71	0.84	0.75	0.18	0.58	0.23	0.27
CCL17681 (proC)	0.46	0.28	0.52	0.46	0.5	0.35	0.27	0.25	1.0	0.29	0.24	0.17	0.5	0.33	0.17	0.59	0.55	0.28	0.55	0.5	0.46	0.31	0.67	0.92	0.77	0.3	0.65	0.28	0.24
CCL17788 (BN171_1800011)	0.06	0.11	0.08	0.11	0.05	0.11	0.12	0.06	1.0	0.23	0.15	0.18	0.29	0.05	0.07	0.16	0.1	0.04	0.09	0.11	0.14	0.04	0.05	0.07	0.07	0.05	0.05	0.06	0.14
CCL17860 (BN171_1870001)	0.0	0.0	0.04	0.02	0.03	0.26	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.01	0.1	0.02	0.03	0.23	0.04	0.01	0.3	0.12	0.18	0.0	0.46	0.67	1.0	0.03	0.06	0.0	0.0
CCL17943 (BN171_1970012)	0.17	0.03	0.27	0.07	0.23	0.03	0.29	0.23	1.0	0.21	0.18	0.1	0.41	0.97	0.06	0.34	0.12	0.3	0.35	0.94	0.1	0.05	0.05	0.05	0.1	0.14	0.13	0.46	0.14
CCL17985 (BN171_200006)	0.05	0.09	0.04	0.07	0.03	0.06	0.15	0.03	1.0	0.14	0.13	0.12	0.37	0.05	0.07	0.14	0.16	0.04	0.29	0.06	0.13	0.14	0.23	0.37	0.12	0.03	0.32	0.09	0.11
CCL18144 (BN171_2130001)	0.35	0.19	0.4	0.22	0.13	1.0	0.5	0.15	0.26	0.38	0.34	0.4	0.31	0.27	0.14	0.37	0.32	0.15	0.54	0.77	0.45	0.33	0.59	0.9	0.94	0.38	0.57	0.43	0.24
CCL18219 (BN171_2170006)	0.21	0.05	0.27	0.53	0.24	0.06	0.12	0.07	1.0	0.18	0.22	0.17	0.33	0.32	0.08	0.22	0.11	0.16	0.24	0.55	0.16	0.51	0.39	0.31	0.37	0.13	0.22	0.34	0.18
CCL18353 (clpB)	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.0	1.0	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.03	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01
CCL18354 (BN171_2230004)	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.03	0.0	1.0	0.1	0.06	0.04	0.35	0.01	0.0	0.07	0.07	0.0	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.0	0.01	0.03	0.02
CCL18355 (BN171_2230005)	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	1.0	0.04	0.03	0.02	0.18	0.01	0.0	0.03	0.09	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.0	0.01	0.03	0.02
CCL18374 (BN171_2240014)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	1.0	0.31	0.05	0.58	0.33	0.74	0.43	0.09	0.0	0.0
CCL18404 (BN171_2290009)	0.01	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.09	0.0	1.0	0.05	0.06	0.05	0.22	0.01	0.0	0.05	0.15	0.0	0.04	0.0	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.0	0.04	0.11	0.05
CCL18702 (BN171_2570001)	0.2	0.07	0.18	0.22	0.17	0.4	0.02	0.17	0.31	0.05	0.09	0.06	0.18	0.36	0.13	0.26	0.46	0.26	0.41	0.22	0.24	0.08	0.48	1.0	0.83	0.29	0.13	0.0	0.09
CCL18705 (BN171_2570004)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0
CCL18742 (BN171_2600001)	0.24	0.44	0.23	0.38	0.23	0.26	0.49	0.18	1.0	0.39	0.34	0.37	0.39	0.19	0.31	0.57	0.4	0.17	0.35	0.37	0.4	0.28	0.51	0.94	0.4	0.21	0.68	0.32	0.35
CCL18753 (BN171_2600012)	0.05	0.18	0.18	0.53	0.11	0.03	0.04	0.05	1.0	0.04	0.04	0.04	0.09	0.09	0.25	0.03	0.02	0.07	0.08	0.08	0.15	0.11	0.04	0.11	0.04	0.04	0.03	0.17	0.02
CCL18883 (dnaJ)	0.04	0.02	0.09	0.25	0.13	0.14	0.09	0.05	1.0	0.15	0.14	0.1	0.27	0.02	0.02	0.23	0.11	0.06	0.1	0.04	0.03	0.66	0.04	0.11	0.12	0.05	0.09	0.07	0.09
CCL18884 (dnaK)	0.04	0.02	0.06	0.12	0.09	0.06	0.07	0.06	1.0	0.11	0.1	0.06	0.19	0.02	0.01	0.1	0.08	0.07	0.06	0.06	0.02	0.28	0.04	0.07	0.06	0.04	0.06	0.05	0.06
CCL18885 (grpE)	0.05	0.02	0.06	0.11	0.08	0.16	0.17	0.07	1.0	0.23	0.2	0.14	0.24	0.02	0.02	0.11	0.08	0.07	0.08	0.06	0.02	0.25	0.06	0.07	0.08	0.05	0.03	0.07	0.11
CCL18886 (hrcA)	0.02	0.01	0.07	0.11	0.05	0.05	0.09	0.01	1.0	0.13	0.11	0.06	0.34	0.02	0.01	0.09	0.07	0.02	0.05	0.04	0.03	0.07	0.06	0.05	0.09	0.01	0.04	0.09	0.06
CCL18919 (comE)	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.03	0.35	0.02	1.0	0.08	0.03	0.1	0.18	0.02	0.04	0.1	0.04	0.02	0.11	0.02	0.02	0.32	0.09	0.09	0.02	0.02	0.24	0.22	0.1
CCL19165 (BN171_2900020)	0.33	0.14	0.24	0.18	0.2	0.11	0.16	0.17	1.0	0.27	0.28	0.23	0.48	0.28	0.1	0.57	0.35	0.21	0.16	0.2	0.08	0.22	0.27	0.26	0.23	0.14	0.05	0.04	0.24
CCL19258 (cwp)	0.24	0.07	0.18	0.06	0.05	0.08	0.13	0.06	1.0	0.17	0.15	0.13	0.3	0.21	0.06	0.1	0.39	0.06	0.12	0.19	0.04	0.38	0.12	0.14	0.09	0.03	0.24	0.12	0.15
CCL19307 (BN171_3020019)	0.11	0.16	0.11	0.16	0.07	0.07	0.25	0.05	1.0	0.11	0.1	0.1	0.18	0.09	0.14	0.09	0.1	0.09	0.09	0.11	0.21	0.1	0.17	0.34	0.18	0.05	0.08	0.22	0.09
CCL19323 (BN171_3030001)	0.12	0.13	0.16	0.26	0.12	0.32	0.2	0.12	0.75	0.15	0.19	0.16	0.46	0.08	0.05	0.42	0.86	0.08	0.71	0.24	0.4	0.28	1.0	0.73	0.67	0.19	0.44	0.2	0.15
CCL19342 (BN171_3070008)	0.09	0.06	0.69	1.0	0.76	0.21	0.21	0.06	0.88	0.33	0.23	0.24	0.32	0.1	0.07	0.19	0.1	0.07	0.21	0.19	0.14	0.14	0.17	0.06	0.07	0.08	0.02	0.21	0.24
CCL19429 (BN171_3140001)	0.13	0.1	0.13	0.11	0.06	0.1	0.23	0.06	1.0	0.21	0.17	0.15	0.43	0.13	0.08	0.19	0.19	0.08	0.21	0.12	0.1	0.1	0.22	0.42	0.15	0.03	0.24	0.31	0.16
CCL19470 (BN171_3170004)	0.13	0.08	0.15	0.12	0.14	0.04	0.13	0.1	1.0	0.16	0.21	0.22	0.23	0.11	0.11	0.36	0.2	0.14	0.14	0.08	0.05	0.12	0.05	0.18	0.14	0.05	0.07	0.13	0.26
CCL19630 (BN171_3320004)	0.2	0.37	0.16	0.24	0.09	0.09	0.43	0.12	1.0	0.23	0.28	0.26	0.33	0.1	0.27	0.31	0.24	0.16	0.32	0.16	0.23	0.17	0.19	0.51	0.3	0.06	0.46	0.29	0.28
CCL19682 (BN171_3390001)	0.23	0.45	0.19	0.19	0.2	0.08	0.16	0.21	1.0	0.15	0.12	0.12	0.26	0.14	0.28	0.09	0.13	0.21	0.28	0.24	0.18	0.12	0.18	0.32	0.1	0.17	0.2	0.11	0.1
CCL19683 (dapB)	0.04	0.1	0.05	0.09	0.04	0.12	0.18	0.05	1.0	0.22	0.22	0.19	0.22	0.05	0.12	0.26	0.09	0.07	0.31	0.12	0.34	0.23	0.2	0.64	0.21	0.06	0.14	0.19	0.15
CCL19755 (feoA)	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.02	0.07	0.02	1.0	0.05	0.05	0.05	0.13	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.12	0.03	0.11	0.08	0.09	0.21	0.05	0.02	0.18	0.24	0.06
CCL19764 (pflD)	0.01	0.03	0.25	1.0	0.36	0.02	0.04	0.02	0.73	0.04	0.03	0.04	0.06	0.03	0.24	0.02	0.01	0.08	0.06	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.03
CCL19765 (pflE)	0.01	0.03	0.42	1.0	0.58	0.02	0.05	0.02	0.89	0.06	0.06	0.06	0.07	0.04	0.24	0.03	0.02	0.1	0.11	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.04
CCL19831 (BN171_3520017)	0.19	0.24	0.18	0.21	0.15	0.37	0.48	0.13	1.0	0.42	0.36	0.32	0.51	0.17	0.27	0.49	0.2	0.2	0.6	0.44	0.7	0.14	0.5	0.73	0.49	0.31	0.24	0.41	0.24
CCL20456 (BN171_50004)	0.05	0.03	0.06	0.06	0.06	0.03	0.08	0.03	1.0	0.09	0.09	0.11	0.06	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.18	0.04	0.02	0.03	0.25	0.07	0.02	0.02	0.03	0.05	0.1
CCL20457 (mcsA)	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	1.0	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.11	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03
CCL20458 (mcsB)	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	1.0	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01	0.04	0.11	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04
CCL20459 (clpC)	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	1.0	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.12	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03
CCL20509 (BN171_590007)	0.05	0.04	0.04	0.04	0.02	0.11	0.06	0.02	1.0	0.09	0.07	0.08	0.36	0.04	0.04	0.26	0.18	0.03	0.3	0.02	0.04	0.01	0.37	0.27	0.23	0.01	0.21	0.24	0.08
CCL20684 (BN171_900004)	0.15	0.23	0.41	0.4	0.43	0.18	0.18	0.17	1.0	0.41	0.31	0.24	0.19	0.31	0.34	0.16	0.15	0.23	0.29	0.91	0.2	0.6	0.11	0.03	0.08	0.14	0.1	0.27	0.26
CCL20736 (BN171_960028)	0.14	0.24	0.17	0.52	0.2	0.26	0.02	0.05	1.0	0.01	0.01	0.03	0.23	0.13	0.38	0.06	0.13	0.16	0.27	0.58	0.71	0.18	0.33	0.25	0.06	0.22	0.21	0.11	0.01
CCL20737 (BN171_960029)	0.09	0.37	0.09	0.31	0.1	0.19	0.14	0.1	1.0	0.14	0.09	0.11	0.4	0.07	0.34	0.22	0.11	0.09	0.28	0.25	0.38	0.51	0.26	0.42	0.1	0.12	0.26	0.12	0.07
CCL20738 (BN171_960030)	0.11	0.54	0.1	0.48	0.1	0.06	0.2	0.11	1.0	0.1	0.1	0.1	0.35	0.06	0.46	0.17	0.17	0.12	0.29	0.28	0.68	0.91	0.23	0.55	0.13	0.16	0.29	0.11	0.09
CCL20749 (BN171_980004)	0.21	0.3	0.3	0.39	0.29	0.52	0.61	0.25	0.94	0.71	0.54	0.55	0.79	0.19	0.26	0.66	0.34	0.25	0.77	0.46	0.61	0.35	1.0	0.62	0.64	0.27	0.56	0.53	0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)