Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16977 (BN171_1030027)	0.01	0.0	0.02	0.01	0.04	0.11	0.08	0.01	0.57	0.12	0.13	0.12	0.28	0.03	0.02	0.37	0.37	0.03	0.4	0.06	0.06	0.06	0.44	1.0	0.38	0.05	0.17	0.58	0.16
CCL16983 (BN171_1030033)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.17	0.31	0.0	0.5	0.25	0.24	0.22	0.27	0.0	0.0	0.27	0.36	0.0	0.18	0.01	0.02	0.01	0.27	0.35	0.24	0.0	0.44	1.0	0.27
CCL17010 (BN171_1080002)	0.12	0.13	0.13	0.22	0.1	0.18	0.57	0.11	0.3	0.49	0.3	0.39	0.53	0.12	0.13	0.59	0.33	0.19	0.36	0.11	0.29	0.92	0.33	0.67	0.47	0.08	1.0	0.24	0.26
CCL17013 (cwp)	0.34	0.18	0.31	0.13	0.19	0.13	1.0	0.25	0.22	0.63	0.54	0.7	0.29	0.26	0.12	0.22	0.3	0.22	0.16	0.32	0.28	0.1	0.17	0.2	0.15	0.12	0.8	0.47	0.62
CCL17024 (oppA)	0.02	1.0	0.02	0.46	0.03	0.09	0.08	0.04	0.35	0.06	0.05	0.05	0.23	0.0	0.29	0.11	0.07	0.02	0.34	0.15	0.63	0.22	0.49	0.26	0.12	0.1	0.51	0.08	0.03
CCL17025 (oppD)	0.02	0.38	0.02	0.26	0.02	0.11	0.09	0.03	0.55	0.07	0.06	0.07	0.27	0.0	0.17	0.12	0.09	0.02	0.35	0.12	0.4	0.31	0.54	0.44	0.13	0.07	1.0	0.07	0.03
CCL17026 (oppF)	0.02	0.28	0.02	0.23	0.02	0.08	0.08	0.02	0.85	0.07	0.05	0.06	0.26	0.0	0.13	0.13	0.09	0.01	0.33	0.1	0.41	0.17	0.53	0.56	0.15	0.05	1.0	0.09	0.03
CCL17239 (ccpA)	0.74	0.69	0.67	0.61	0.46	0.28	0.47	0.46	0.59	0.41	0.48	0.48	0.56	0.3	0.34	0.73	0.71	0.42	0.62	0.55	0.32	0.21	1.0	0.93	0.64	0.35	0.42	0.86	0.58
CCL17254 (BN171_1410016)	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.2	0.04	1.0	0.27	0.35	0.35	0.23	0.03	0.05	0.14	0.11	0.04	0.16	0.03	0.09	0.03	0.28	0.17	0.12	0.02	0.06	0.62	0.33
CCL17255 (BN171_1410017)	0.54	0.32	0.4	0.26	0.22	0.67	0.34	0.28	1.0	0.48	0.42	0.44	0.43	0.43	0.27	0.64	0.86	0.27	0.59	0.62	0.32	0.16	0.82	0.59	0.68	0.27	0.31	0.78	0.43
CCL17270 (BN171_1420013)	0.27	0.17	0.3	0.18	0.15	0.28	0.41	0.25	0.46	0.26	0.36	0.37	0.59	0.22	0.12	0.54	0.35	0.18	0.5	0.28	0.24	0.25	0.75	1.0	0.69	0.14	0.56	0.47	0.29
CCL17274 (BN171_1430001)	0.13	0.27	0.18	0.24	0.13	0.05	0.52	0.12	1.0	0.37	0.38	0.49	0.21	0.03	0.24	0.06	0.62	0.15	0.34	0.12	0.1	0.08	0.45	0.58	0.1	0.03	0.23	0.74	0.48
CCL17307 (norV)	0.13	0.27	0.13	0.21	0.1	0.03	0.4	0.13	1.0	0.42	0.48	0.61	0.35	0.06	0.21	0.16	0.61	0.14	0.46	0.08	0.13	0.21	0.57	0.96	0.18	0.04	0.54	0.49	0.7
CCL17363 (BN171_1450024)	0.32	0.22	0.41	0.63	0.21	0.25	0.68	0.04	0.83	0.66	0.49	0.5	0.49	0.34	0.34	0.42	0.43	0.14	0.4	0.55	0.58	0.26	0.61	1.0	0.48	0.13	0.2	0.46	0.41
CCL17364 (bltD)	0.07	0.04	0.07	0.1	0.05	0.25	1.0	0.01	0.4	0.64	0.6	0.57	0.35	0.06	0.07	0.3	0.4	0.05	0.29	0.11	0.11	0.05	0.37	0.81	0.41	0.01	0.14	0.27	0.51
CCL17444 (iscR)	0.67	0.0	0.8	0.03	0.26	0.41	0.11	0.06	0.51	0.08	0.1	0.1	0.17	0.44	0.02	0.11	0.43	0.24	0.18	1.0	0.02	0.07	0.53	0.17	0.04	0.36	0.22	0.31	0.15
CCL17445 (iscS)	0.89	0.26	0.74	0.24	0.29	0.35	0.52	0.28	1.0	0.39	0.42	0.52	0.31	0.4	0.24	0.18	0.74	0.47	0.45	0.78	0.04	0.14	1.0	0.85	0.1	0.39	0.95	0.61	0.54
CCL17446 (BN171_1500022)	0.36	0.06	0.24	0.06	0.08	0.35	0.29	0.12	0.68	0.19	0.26	0.33	0.24	0.14	0.06	0.17	0.51	0.17	0.4	0.27	0.01	0.13	1.0	0.63	0.1	0.17	0.83	0.78	0.43
CCL17453 (fur)	0.23	0.37	0.23	0.29	0.17	0.08	0.34	0.25	1.0	0.23	0.27	0.33	0.18	0.07	0.2	0.1	0.38	0.19	0.26	0.11	0.1	0.02	0.5	0.73	0.13	0.07	0.15	0.33	0.34
CCL17468 (BN171_1510010)	0.29	0.14	0.32	0.32	0.21	0.38	0.43	0.1	1.0	0.46	0.37	0.33	0.63	0.24	0.18	0.54	0.25	0.11	0.34	0.39	0.31	0.11	0.48	0.19	0.28	0.2	0.27	0.39	0.38
CCL17500 (BN171_1520018)	0.11	0.13	0.18	0.14	0.09	0.14	0.62	0.06	1.0	0.47	0.27	0.34	0.33	0.09	0.09	0.29	0.17	0.05	0.19	0.24	0.22	0.08	0.23	0.32	0.2	0.08	0.19	0.43	0.22
CCL17547 (BN171_1540026)	0.02	0.01	0.07	0.02	0.04	0.35	0.44	0.01	0.06	0.65	0.56	0.56	0.81	0.05	0.02	0.98	0.56	0.03	0.49	0.08	0.05	0.02	1.0	1.0	0.8	0.03	0.14	0.53	0.54
CCL17575 (BN171_1580002)	0.06	0.06	0.03	0.03	0.05	0.33	0.4	0.1	0.32	0.39	0.7	0.56	0.84	0.05	0.12	0.7	0.48	0.12	0.85	0.06	0.32	0.45	0.83	1.0	0.89	0.09	0.66	0.38	0.8
CCL17576 (BN171_1580003)	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.15	0.32	0.02	0.2	0.29	0.59	0.47	0.6	0.04	0.03	0.57	0.56	0.03	0.65	0.04	0.19	0.23	0.69	1.0	0.66	0.03	0.6	0.5	0.76
CCL17609 (BN171_1620002)	0.15	0.04	0.11	0.14	0.11	0.48	1.0	0.03	0.69	0.8	0.57	0.37	0.53	0.18	0.07	0.57	0.39	0.11	0.32	0.07	0.19	0.08	0.55	0.49	0.38	0.05	0.18	0.0	0.39
CCL17610 (BN171_1630001)	0.23	0.19	0.16	0.17	0.18	0.18	0.33	0.16	1.0	0.3	0.21	0.25	0.48	0.16	0.28	0.48	0.38	0.3	0.46	0.2	0.2	0.48	0.5	0.68	0.47	0.13	0.73	0.18	0.21
CCL17646 (BN171_1640036)	0.13	0.14	0.14	0.26	0.11	0.04	0.27	0.06	1.0	0.29	0.21	0.24	0.21	0.13	0.18	0.11	0.28	0.13	0.32	0.15	0.29	0.07	0.47	0.51	0.18	0.06	0.23	0.5	0.22
CCL17649 (BN171_1640039)	0.06	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.22	0.06	0.01	0.05	0.08	0.06	0.37	0.07	0.04	0.01	0.01	0.06	0.36	0.04	0.02	0.01	0.23	0.22	0.02	0.02	1.0	0.02	0.05
CCL17724 (BN171_1730003)	0.78	0.36	0.64	0.26	0.27	0.23	0.35	0.27	0.76	0.37	0.4	0.36	0.64	0.71	0.35	0.38	1.0	0.37	0.38	0.66	0.33	0.19	0.17	0.52	0.46	0.17	0.26	0.88	0.47
CCL17747 (BN171_1750008)	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.0	0.44	0.21	0.12	0.15	0.24	0.01	0.0	0.08	0.45	0.0	0.1	0.01	0.02	0.02	0.23	0.14	0.07	0.0	0.01	1.0	0.1
CCL17748 (BN171_1750009)	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.0	0.04	0.0	1.0	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.29	0.0	0.08	0.01	0.05	0.04	0.11	0.24	0.12	0.0	0.09	0.33	0.01
CCL17775 (BN171_1790004)	0.18	0.19	0.17	0.18	0.13	0.21	0.88	0.07	0.21	0.86	0.56	0.54	0.32	0.04	0.09	0.29	0.25	0.09	0.34	0.08	0.09	0.07	1.0	0.5	0.19	0.03	0.43	0.59	0.49
CCL17776 (pgm)	0.19	0.37	0.19	0.29	0.17	0.17	0.9	0.15	0.23	0.64	0.57	0.6	0.32	0.04	0.19	0.24	0.31	0.14	0.43	0.19	0.17	0.28	1.0	0.7	0.2	0.08	0.73	0.64	0.59
CCL17827 (BN171_1830001)	0.07	0.25	0.08	0.13	0.05	0.03	1.0	0.07	0.1	0.66	0.35	0.55	0.25	0.03	0.17	0.04	0.18	0.07	0.26	0.05	0.21	0.13	0.28	0.18	0.03	0.01	0.6	0.18	0.41
CCL17828 (BN171_1830002)	0.06	0.23	0.08	0.21	0.14	0.04	0.56	0.18	0.99	0.39	0.44	0.62	0.51	0.01	0.24	0.06	1.0	0.18	0.84	0.04	0.1	0.31	0.85	0.97	0.08	0.04	0.96	0.56	0.69
CCL18019 (BN171_2030005)	0.01	0.0	0.08	0.03	0.04	0.04	0.48	0.0	0.1	0.5	0.4	0.57	0.15	0.01	0.01	0.07	0.76	0.01	0.47	0.04	0.02	0.01	0.99	0.66	0.09	0.01	0.12	0.5	1.0
CCL18143 (BN171_2120003)	0.12	0.09	0.13	0.1	0.07	0.24	0.36	0.04	0.63	0.24	0.14	0.21	0.36	0.19	0.12	0.15	0.23	0.07	0.31	0.21	0.3	0.0	0.26	0.23	0.22	0.06	0.27	1.0	0.22
CCL18185 (lexA)	0.75	0.71	0.27	0.35	0.28	0.17	0.39	0.3	1.0	0.34	0.49	0.39	0.37	0.4	0.46	0.36	0.37	0.4	0.36	0.44	0.37	0.49	0.45	0.55	0.41	0.26	0.24	0.68	0.36
CCL18199 (BN171_2150013)	0.11	0.13	0.11	0.09	0.09	0.11	0.5	0.13	0.2	0.37	0.51	0.53	0.18	0.04	0.1	0.2	0.59	0.12	0.29	0.09	0.04	0.12	0.38	1.0	0.24	0.07	0.18	0.41	0.59
CCL18359 (BN171_2230009)	0.09	0.06	0.2	0.22	0.09	0.42	1.0	0.03	0.69	0.94	0.89	0.88	0.65	0.08	0.06	0.83	0.29	0.04	0.43	0.24	0.23	0.2	0.78	0.49	0.63	0.1	0.77	0.87	0.57
CCL18386 (BN171_2280002)	0.17	0.05	0.14	0.11	0.17	0.18	1.0	0.07	0.72	0.78	0.53	0.57	0.38	0.15	0.03	0.45	0.3	0.15	0.23	0.19	0.06	0.27	0.29	0.38	0.3	0.17	0.9	0.26	0.36
CCL18493 (BN171_2390012)	0.79	0.34	0.57	0.47	0.38	0.33	0.75	0.25	0.38	0.51	0.55	0.61	0.53	0.6	0.37	0.56	0.34	0.43	0.58	0.47	0.22	0.78	0.86	1.0	0.36	0.23	0.44	0.69	0.52
CCL18654 (BN171_2480029)	0.18	0.15	0.23	0.25	0.16	0.2	0.46	0.08	1.0	0.48	0.43	0.36	0.57	0.27	0.2	0.42	0.18	0.13	0.28	0.37	0.41	0.12	0.45	0.46	0.3	0.2	0.28	0.64	0.31
CCL18924 (BN171_2720024)	0.01	0.08	0.01	0.1	0.02	0.04	0.71	0.01	0.85	1.0	0.39	0.15	0.08	0.0	0.01	0.1	0.32	0.0	0.2	0.03	0.15	0.02	0.22	0.44	0.15	0.01	0.71	0.1	0.1
CCL19142 (BN171_2880009)	0.15	0.22	0.15	0.58	0.21	0.05	0.89	0.13	0.73	0.48	0.49	0.55	0.67	0.16	0.23	0.53	0.38	0.19	0.45	0.08	0.3	0.06	1.0	0.77	0.41	0.05	0.61	0.62	0.1
CCL19185 (BN171_2920006)	0.01	0.0	0.05	0.03	0.03	0.07	0.29	0.0	1.0	0.32	0.39	0.51	0.66	0.07	0.01	0.48	0.25	0.01	0.23	0.06	0.05	0.02	0.44	0.1	0.1	0.02	0.12	0.68	0.31
CCL19193 (glyA)	0.88	0.04	0.84	0.1	0.14	0.86	0.9	0.16	0.07	0.83	0.63	0.64	0.18	0.39	0.01	0.25	0.4	0.27	0.41	0.92	0.07	0.26	1.0	0.63	0.32	0.33	0.39	0.52	0.38
CCL19255 (BN171_3000018)	0.85	0.62	0.73	0.78	0.6	0.48	0.24	0.44	0.92	0.23	0.28	0.26	0.53	1.0	0.61	0.67	0.68	0.54	0.47	0.86	0.41	0.45	0.61	0.36	0.43	0.4	0.79	0.92	0.28
CCL19312 (BN171_3020024)	0.02	0.06	0.02	0.04	0.01	0.04	0.44	0.01	1.0	0.3	0.14	0.22	0.21	0.01	0.02	0.19	0.17	0.01	0.21	0.02	0.03	0.21	0.26	0.73	0.18	0.01	0.93	0.07	0.06
CCL19315 (BN171_3020027)	0.02	0.06	0.03	0.1	0.03	0.06	1.0	0.02	0.62	0.72	0.13	0.2	0.08	0.01	0.03	0.11	0.22	0.03	0.16	0.02	0.05	0.3	0.06	0.11	0.02	0.02	0.83	0.0	0.0
CCL19321 (BN171_3020033)	0.0	0.02	0.02	0.08	0.01	0.02	1.0	0.0	0.93	0.47	0.2	0.22	0.13	0.01	0.01	0.06	0.17	0.0	0.16	0.03	0.34	0.05	0.16	0.28	0.07	0.0	0.89	0.05	0.06
CCL19441 (BN171_3150004)	0.12	0.11	0.12	0.17	0.13	0.39	0.41	0.09	1.0	0.48	0.38	0.37	0.49	0.08	0.09	0.43	0.21	0.14	0.42	0.09	0.11	0.2	0.56	0.45	0.23	0.04	0.56	0.68	0.22
CCL19657 (BN171_3350006)	0.12	0.05	0.12	0.08	0.06	0.33	0.39	0.05	0.36	0.48	0.46	0.4	0.69	0.08	0.04	0.92	0.2	0.07	0.7	0.13	0.11	0.04	0.89	0.57	0.74	0.06	0.96	1.0	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)