1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA44739 (VCV51_033941)
 0.81 0.19 0.38 0.43 0.12 0.12 0.12 0.06 0.73 0.34 0.24 0.0 0.26 0.2 0.01 0.0 0.0 0.32 0.32 0.59 0.92 1.0 0.06
KNA49227 (VCV51_030347)
 0.14 0.05 0.17 0.07 0.27 0.28 0.3 0.25 0.07 0.3 0.09 0.22 0.28 0.04 0.19 0.15 0.16 0.09 0.1 1.0 0.04 0.16 0.32
KNA49509 (VCV51_033794)
 0.22 0.41 0.1 0.19 0.3 0.34 0.3 0.3 0.2 0.22 0.36 0.32 0.26 0.43 0.08 0.48 0.45 0.35 0.37 1.0 0.21 0.19 0.44
KNA50226 (VCV51_033686)
 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.07 0.01
KNA51840 (VCV51_030376)
 0.72 0.41 0.37 0.28 0.47 0.46 0.46 0.46 0.64 0.36 0.46 0.57 0.41 0.39 0.48 0.78 0.9 0.58 0.64 0.57 0.52 1.0 0.78
KNA51911 (VCV51_033501)
 0.81 0.19 0.38 0.43 0.12 0.12 0.12 0.06 0.73 0.34 0.24 0.0 0.26 0.2 0.01 0.0 0.0 0.32 0.32 0.59 0.92 1.0 0.06
KNA53342 (VCV51_031633)
 0.91 0.02 0.07 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 0.05 0.04 0.02 0.02 0.09 0.06 0.04 0.05 0.02 0.03 1.0 0.03
KNA53343 (PilB)
 0.69 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.05 0.05 0.03 0.03 1.0 0.04
KNA53630 (VCV51_033305)
 0.64 0.11 0.21 0.14 0.1 0.12 0.12 0.1 0.25 0.17 0.19 0.22 0.18 0.12 0.16 0.34 0.36 0.14 0.17 0.24 0.24 1.0 0.2
KNA53675 (VCV51_030030)
 0.52 0.03 0.17 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.05 0.03 0.05 0.05 0.03 0.03 0.05 0.06 0.04 0.04 0.13 0.1 1.0 0.05
KNA53765 (VCV51_030016)
 0.33 0.01 0.1 0.07 0.02 0.03 0.03 0.02 0.06 0.04 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.06 0.07 0.13 0.13 1.0 0.05 0.61 0.08
KNA53908 (VCV51_030835)
 0.65 0.03 0.09 0.06 0.03 0.02 0.03 0.03 0.11 0.02 0.02 0.06 0.06 0.03 0.05 0.1 0.09 0.08 0.09 0.11 0.03 1.0 0.13
KNA54938 (PilM)
 0.75 0.04 0.08 0.06 0.07 0.08 0.08 0.06 0.04 0.09 0.03 0.07 0.11 0.04 0.01 0.14 0.15 0.07 0.07 0.06 0.16 1.0 0.06
KNA54939 (VCV51_033142)
 0.76 0.01 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.0 0.03 0.04 0.01 0.02 0.01 0.11 1.0 0.03
KNA54940 (VCV51_033143)
 0.62 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.14 1.0 0.02
KNA54941 (VCV51_033144)
 0.74 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.14 1.0 0.03
KNA54942 (PilQ)
 1.0 0.01 0.07 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.04 0.04 0.01 0.01 0.05 0.06 0.04 0.04 0.03 0.16 0.97 0.06
KNA55088 (VCV51_033112)
 0.45 0.05 0.09 0.05 0.06 0.06 0.07 0.06 0.1 0.1 0.07 0.12 0.14 0.07 0.05 0.08 0.1 0.05 0.06 0.11 0.1 1.0 0.15
KNA55239 (VCV51_031084)
 0.71 0.01 0.28 0.09 0.04 0.04 0.04 0.04 0.09 0.1 0.04 0.1 0.06 0.01 0.14 0.14 0.1 0.06 0.05 0.4 0.07 1.0 0.05
KNA55240 (VCV51_031085)
 0.84 0.06 0.28 0.16 0.16 0.17 0.17 0.16 0.2 0.18 0.06 0.15 0.14 0.06 0.12 0.24 0.2 0.14 0.15 0.56 0.18 1.0 0.25
KNA55297 (VCV51_033110)
 0.16 0.01 0.05 0.09 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.08 0.07 0.03 0.03 1.0 0.07 0.17 0.05
KNA55339 (PilW)
 0.4 0.01 0.13 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.1 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.08 0.08 0.02 0.02 0.1 0.08 1.0 0.11
KNA56408 (VCV51_030680)
 1.0 0.01 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.08 0.04 0.01 0.04 0.06 0.05 0.01 0.02 0.02 0.02 0.67 0.29
KNA56409 (VCV51_030681)
 0.94 0.21 0.37 0.12 0.21 0.21 0.2 0.19 0.23 0.19 0.4 0.25 0.28 0.19 0.09 0.77 0.56 0.14 0.14 0.2 0.23 1.0 0.91
KNA56881 (VCV51_030516)
 0.82 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.04 0.06 0.01 0.01 0.11 0.14 0.04 0.04 0.03 0.56 1.0 0.08
KNA56962 (VCV51_032888)
 0.83 0.01 0.21 0.08 0.03 0.06 0.06 0.02 0.13 0.09 0.02 0.07 0.1 0.01 0.01 0.16 0.15 0.02 0.02 0.14 0.41 1.0 0.17
KNA56964 (PilW)
 1.0 0.04 0.3 0.06 0.12 0.19 0.19 0.11 0.29 0.13 0.03 0.02 0.12 0.01 0.05 0.02 0.04 0.08 0.16 0.18 0.22 0.31 0.17
KNA56966 (PilV)
 1.0 0.01 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.01 0.02 0.05 0.01 0.08 0.05 0.0 0.02 0.14 0.12 0.01 0.02 0.02 0.09 0.66 0.05
KNA57811 (VCV51_032780)
 0.19 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.04 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.01 1.0 0.56 0.45 0.06
KNA57812 (VCV51_032781)
 0.26 0.09 0.08 0.08 0.05 0.05 0.06 0.04 0.09 0.33 0.1 0.42 0.14 0.07 0.08 0.17 0.16 0.29 0.33 1.0 0.47 0.67 0.18
KNA57820 (VCV51_032789)
 0.22 0.46 0.1 0.14 0.63 0.64 0.67 0.58 0.31 0.5 0.33 0.61 0.41 0.44 0.05 0.29 0.23 0.18 0.22 1.0 0.22 0.29 0.59
KNA57840 (VCV51_032809)
 0.81 0.19 0.29 0.34 0.43 0.46 0.47 0.43 0.44 0.44 0.2 0.67 0.41 0.21 0.22 1.0 0.84 0.37 0.36 0.43 0.45 0.76 0.69
KNA57855 (VCV51_032779)
 0.19 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.04 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.01 1.0 0.56 0.45 0.06
KNA59382 (VCV51_031307)
 0.56 0.19 0.11 0.09 0.37 0.36 0.38 0.37 0.24 0.19 0.19 0.38 0.41 0.19 0.22 0.61 0.53 0.15 0.15 0.24 0.21 1.0 0.43
KNA59405 (VCV51_032584)
 0.45 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.18 0.02 1.0 0.0
KNA59608 (VCV51_031392)
 0.91 0.17 0.32 0.29 0.24 0.24 0.24 0.23 0.47 0.24 0.11 0.34 0.28 0.16 0.26 0.79 0.68 0.26 0.29 0.59 0.46 1.0 0.51
KNA59785 (VCV51_032480)
 0.64 0.05 0.12 0.16 0.04 0.05 0.04 0.04 0.18 0.11 0.03 0.05 0.1 0.05 0.03 0.05 0.1 0.05 0.05 0.21 0.25 1.0 0.08
KNA60608 (VCV51_032197)
 0.31 0.07 0.11 0.1 0.05 0.08 0.06 0.06 0.13 0.45 0.11 0.44 0.18 0.07 0.1 0.14 0.18 0.26 0.28 1.0 0.55 0.68 0.22
KNA60609 (VCV51_032198)
 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 1.0 0.58 0.5 0.0
KNA60652 (VCV51_032091)
 0.74 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.3 1.0 0.01
KNA60666 (VCV51_032105)
 0.54 0.18 0.53 0.37 0.48 0.56 0.48 0.36 0.32 0.62 0.19 0.53 0.46 0.22 0.06 0.41 0.63 0.66 0.58 1.0 0.92 0.62 0.48
KNA60667 (VCV51_032106)
 0.32 0.17 0.2 0.18 0.17 0.17 0.16 0.1 0.24 0.27 0.16 0.37 0.21 0.19 0.06 0.25 0.36 0.46 0.46 1.0 0.75 0.64 0.28
KNA60668 (VCV51_032107)
 0.21 0.16 0.12 0.07 0.04 0.06 0.05 0.02 0.17 0.07 0.14 0.34 0.04 0.11 0.04 0.09 0.14 0.18 0.15 1.0 0.71 0.5 0.15
KNA60669 (VCV51_032108)
 0.25 0.06 0.18 0.12 0.05 0.05 0.05 0.03 0.13 0.17 0.1 0.27 0.08 0.07 0.03 0.07 0.1 0.21 0.22 1.0 0.69 0.61 0.15
KNA60670 (IcmF)
 0.22 0.06 0.16 0.09 0.06 0.09 0.07 0.05 0.11 0.43 0.15 0.59 0.09 0.06 0.04 0.13 0.17 0.18 0.19 1.0 0.7 0.58 0.16
KNA60671 (VCV51_032110)
 0.17 0.06 0.11 0.06 0.02 0.04 0.03 0.02 0.09 0.25 0.08 0.53 0.05 0.05 0.03 0.11 0.13 0.13 0.13 1.0 0.65 0.6 0.09
KNA60672 (VCV51_032111)
 0.25 0.04 0.14 0.09 0.02 0.04 0.03 0.02 0.05 0.54 0.09 1.0 0.08 0.03 0.05 0.16 0.22 0.18 0.17 0.67 0.49 0.41 0.19
KNA60673 (VCV51_032112)
 0.23 0.05 0.09 0.08 0.03 0.03 0.03 0.02 0.09 0.38 0.09 0.74 0.06 0.04 0.06 0.11 0.12 0.17 0.17 1.0 0.66 0.62 0.11
KNA60674 (VCV51_032113)
 0.21 0.08 0.09 0.07 0.03 0.04 0.03 0.02 0.08 0.49 0.16 0.94 0.08 0.07 0.05 0.11 0.13 0.2 0.21 1.0 0.68 0.66 0.09
KNA60675 (VCV51_032114)
 0.21 0.06 0.07 0.05 0.04 0.06 0.04 0.03 0.06 0.67 0.18 1.0 0.08 0.06 0.04 0.08 0.08 0.11 0.11 0.98 0.71 0.64 0.1
KNA60676 (VCV51_032115)
 0.21 0.05 0.08 0.06 0.03 0.05 0.04 0.02 0.09 0.59 0.2 0.88 0.06 0.05 0.08 0.1 0.1 0.12 0.12 1.0 0.72 0.65 0.09
KNA60677 (VCV51_032116)
 0.11 0.07 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.06 0.12 0.09 0.2 0.01 0.07 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 1.0 0.76 0.61 0.03
KNA60678 (VCV51_032117)
 0.16 0.06 0.09 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01 0.06 0.46 0.17 0.58 0.04 0.07 0.03 0.07 0.07 0.11 0.09 1.0 0.71 0.67 0.06
KNA60679 (VCV51_032118)
 0.33 0.06 0.22 0.1 0.03 0.04 0.03 0.02 0.09 0.51 0.13 1.0 0.04 0.08 0.08 0.13 0.13 0.08 0.09 0.95 0.74 0.56 0.17
KNA60680 (VCV51_032119)
 0.17 0.04 0.09 0.04 0.04 0.06 0.04 0.03 0.07 0.37 0.11 0.59 0.04 0.04 0.07 0.1 0.11 0.08 0.08 1.0 0.73 0.51 0.11
KNA60681 (VCV51_032120)
 0.16 0.03 0.1 0.03 0.01 0.04 0.02 0.01 0.06 0.27 0.11 0.38 0.02 0.04 0.06 0.08 0.09 0.04 0.04 1.0 0.82 0.47 0.06
KNA60682 (VCV51_032121)
 0.2 0.07 0.13 0.04 0.04 0.1 0.06 0.02 0.07 0.89 0.27 1.0 0.05 0.07 0.19 0.15 0.15 0.07 0.07 0.99 0.84 0.53 0.1
KNA60683 (VCV51_032122)
 0.27 0.06 0.27 0.06 0.03 0.11 0.06 0.02 0.07 1.0 0.39 0.83 0.06 0.07 0.69 0.13 0.12 0.09 0.08 0.85 0.65 0.44 0.16
KNA60684 (VCV51_032123)
 0.45 0.13 0.16 0.19 0.16 0.17 0.16 0.11 0.22 0.72 0.45 0.76 0.25 0.14 0.08 0.38 0.52 0.37 0.35 1.0 0.61 0.49 0.87
KNA60749 (VCV51_032189)
 0.64 0.01 0.12 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.05 0.03 0.01 0.01 0.04 0.05 0.03 0.03 0.02 0.1 1.0 0.04
KNA60806 (VCV51_032068)
 0.89 0.03 0.16 0.05 0.01 0.03 0.03 0.01 0.08 0.13 0.01 0.13 0.08 0.02 0.01 0.08 0.12 0.02 0.03 0.09 0.07 1.0 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)