Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA48024 (VCV51_033859)	0.36	0.43	0.14	0.26	0.64	0.89	0.77	0.51	0.48	0.59	0.72	0.41	0.21	1.0	0.33	0.58	0.57	0.33	0.36	0.36	0.4	0.44	0.48
KNA48530 (VCV51_030200)	0.32	0.29	0.11	0.19	0.29	0.41	0.39	0.24	0.2	1.0	0.39	0.53	0.95	0.34	0.28	0.71	0.8	0.32	0.37	0.22	0.26	0.31	0.32
KNA49504 (VCV51_033792)	0.3	0.35	0.16	0.29	0.12	0.17	0.13	0.14	0.36	0.32	0.31	0.59	0.35	0.42	0.19	0.72	0.79	1.0	0.91	0.34	0.24	0.33	0.28
KNA49505 (VCV51_033793)	0.47	0.38	0.12	0.51	0.26	0.35	0.33	0.26	0.67	0.51	0.49	0.34	0.52	0.47	0.35	0.47	0.56	1.0	0.93	0.51	0.43	0.56	0.31
KNA49506 (VCV51_030308)	0.51	0.19	0.19	0.6	0.2	0.3	0.26	0.22	0.47	0.64	0.4	0.43	0.54	0.23	0.18	0.47	0.54	1.0	0.92	0.37	0.32	0.44	0.4
KNA49507 (VCV51_030309)	0.28	0.63	0.09	0.19	0.39	0.58	0.49	0.41	0.51	1.0	0.81	0.72	0.87	0.69	0.46	0.67	0.71	0.8	0.79	0.4	0.44	0.52	0.34
KNA51817 (VCV51_030368)	0.13	0.29	0.08	0.12	0.17	0.25	0.23	0.18	0.17	0.53	0.39	0.48	0.42	0.38	0.3	0.54	0.56	1.0	0.85	0.15	0.15	0.15	0.19
KNA51844 (VCV51_033528)	0.15	0.19	0.03	0.1	0.54	1.0	0.83	0.6	0.19	0.83	0.45	0.4	0.81	0.3	0.23	0.41	0.43	0.41	0.37	0.16	0.16	0.18	0.13
KNA51845 (VCV51_033529)	0.25	0.34	0.08	0.13	0.6	1.0	0.81	0.6	0.25	0.84	0.45	0.43	0.79	0.57	0.19	0.26	0.29	0.5	0.47	0.21	0.21	0.28	0.21
KNA52464 (VCV51_030128)	0.15	0.12	0.07	0.11	0.36	0.58	0.49	0.38	0.12	1.0	0.37	0.4	0.82	0.17	0.19	0.44	0.44	0.61	0.55	0.1	0.1	0.15	0.14
KNA53293 (VCV51_031610)	0.41	0.55	0.28	0.25	0.37	0.5	0.45	0.37	0.38	0.5	0.76	0.48	0.54	0.62	0.47	0.58	0.34	1.0	0.93	0.36	0.5	0.46	0.43
KNA53795 (VCV51_031857)	0.43	0.18	0.44	0.38	0.38	0.39	0.42	0.38	0.29	1.0	0.33	0.83	0.62	0.14	0.45	0.36	0.43	0.4	0.39	0.34	0.43	0.34	0.29
KNA53796 (VCV51_031858)	0.36	0.52	0.2	0.26	0.29	0.35	0.39	0.3	0.35	1.0	0.54	0.93	0.76	0.47	0.57	0.49	0.54	0.63	0.63	0.34	0.35	0.38	0.2
KNA53797 (VCV51_031859)	0.31	0.99	0.18	0.21	0.44	0.49	0.54	0.46	0.37	1.0	0.68	0.96	0.85	0.98	0.75	0.59	0.66	0.54	0.52	0.37	0.35	0.4	0.16
KNA53798 (VCV51_031860)	0.22	0.37	0.16	0.16	0.35	0.41	0.46	0.37	0.19	1.0	0.48	0.73	0.75	0.33	0.59	0.49	0.54	0.46	0.48	0.18	0.17	0.2	0.15
KNA53799 (VCV51_031861)	0.25	0.63	0.23	0.18	0.56	0.57	0.63	0.56	0.34	1.0	0.63	0.64	0.83	0.61	0.61	0.49	0.57	0.5	0.54	0.32	0.31	0.35	0.28
KNA53800 (VCV51_031862)	0.37	0.89	0.29	0.25	0.69	0.72	0.79	0.7	0.53	1.0	0.78	0.72	0.93	0.93	0.5	0.51	0.48	0.59	0.62	0.53	0.51	0.56	0.29
KNA53801 (VCV51_031863)	0.18	0.16	0.15	0.14	0.57	0.6	0.64	0.56	0.11	1.0	0.3	0.36	0.82	0.15	0.19	0.38	0.3	0.24	0.28	0.11	0.11	0.12	0.1
KNA53802 (VCV51_031864)	0.48	0.32	0.27	0.34	0.53	0.57	0.66	0.5	0.35	1.0	0.61	0.66	0.98	0.31	0.31	0.56	0.46	0.46	0.49	0.33	0.34	0.38	0.43
KNA53803 (VCV51_031865)	0.27	0.18	0.44	0.19	0.43	0.47	0.52	0.39	0.22	1.0	0.3	0.7	0.77	0.17	0.23	0.75	0.65	0.31	0.34	0.25	0.25	0.27	0.42
KNA53806 (VCV51_031868)	0.27	0.77	0.49	0.21	0.53	0.49	0.56	0.47	0.27	0.53	0.52	0.86	0.46	0.75	1.0	0.38	0.3	0.34	0.46	0.3	0.31	0.26	0.28
KNA53807 (GidA)	0.16	0.9	0.3	0.12	0.48	0.53	0.58	0.47	0.25	0.62	0.67	1.0	0.52	0.82	0.92	0.4	0.33	0.41	0.51	0.2	0.19	0.22	0.39
KNA53845 (VCV51_030786)	0.25	0.07	0.17	0.18	0.33	0.45	0.4	0.32	0.25	0.93	0.07	0.4	0.46	0.07	0.11	1.0	0.79	0.3	0.29	0.25	0.24	0.27	0.25
KNA54902 (VCV51_033130)	0.11	0.18	0.04	0.09	0.39	0.61	0.51	0.4	0.2	1.0	0.34	0.29	0.69	0.24	0.14	0.19	0.21	0.42	0.37	0.19	0.18	0.2	0.09
KNA54903 (VCV51_031793)	0.19	0.36	0.07	0.16	0.25	0.41	0.34	0.28	0.21	0.81	0.49	0.55	0.73	0.54	0.39	0.36	0.41	1.0	0.91	0.18	0.16	0.21	0.12
KNA54912 (VCV51_033135)	0.04	0.08	0.01	0.03	0.47	0.78	0.66	0.43	0.07	1.0	0.14	0.15	0.84	0.12	0.24	0.11	0.13	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.01
KNA54913 (GroL)	0.03	0.07	0.02	0.03	0.31	0.57	0.5	0.26	0.04	1.0	0.11	0.3	0.79	0.09	0.3	0.21	0.22	0.12	0.1	0.03	0.03	0.03	0.03
KNA54922 (VCV51_033138)	0.73	0.8	0.2	0.39	0.76	0.96	0.91	0.78	0.65	0.89	0.98	0.78	0.86	0.75	0.41	0.81	1.0	0.38	0.4	0.67	0.57	0.88	0.66
KNA54923 (SecB)	0.49	0.31	0.18	0.23	0.75	0.96	0.81	0.79	0.3	0.94	1.0	0.71	0.85	0.32	0.7	0.47	0.52	0.28	0.29	0.31	0.33	0.56	0.68
KNA54959 (VCV51_031749)	0.27	0.06	0.18	0.19	0.19	0.26	0.26	0.2	0.15	1.0	0.31	0.45	0.46	0.07	0.71	0.13	0.16	0.14	0.16	0.13	0.14	0.15	0.75
KNA55097 (VCV51_031839)	0.26	0.35	0.09	0.19	0.24	0.34	0.33	0.25	0.16	0.86	0.56	0.65	0.59	0.38	1.0	0.22	0.21	0.31	0.3	0.14	0.17	0.19	0.29
KNA55098 (VCV51_031838)	0.37	1.0	0.11	0.22	0.55	0.64	0.61	0.55	0.44	0.7	0.64	0.6	0.55	0.98	0.6	0.44	0.51	0.32	0.29	0.38	0.47	0.53	0.13
KNA55680 (VCV51_033023)	0.38	0.04	0.33	0.27	0.45	0.55	0.44	0.47	0.26	0.79	0.19	0.35	0.48	0.04	0.09	1.0	0.87	0.39	0.38	0.28	0.29	0.3	0.3
KNA55695 (VCV51_031006)	0.27	0.62	0.18	0.21	0.22	0.28	0.25	0.22	0.32	0.53	0.35	0.62	0.47	0.57	0.08	0.66	0.55	1.0	0.82	0.31	0.27	0.34	0.36
KNA55696 (VCV51_031007)	0.15	0.71	0.09	0.13	0.35	0.49	0.42	0.39	0.14	0.69	0.54	1.0	0.47	0.74	0.08	0.36	0.25	0.4	0.45	0.12	0.1	0.14	0.17
KNA55697 (VCV51_031008)	0.12	0.66	0.07	0.08	0.74	1.0	0.86	0.84	0.13	0.68	0.6	0.79	0.55	0.72	0.56	0.36	0.26	0.23	0.22	0.11	0.1	0.12	0.3
KNA55700 (VCV51_033027)	0.27	0.16	0.24	0.22	0.45	0.81	0.66	0.5	0.55	1.0	0.25	0.45	0.6	0.16	0.38	0.37	0.32	0.83	0.82	0.46	0.41	0.46	0.34
KNA55705 (VCV51_031013)	0.29	0.27	0.43	0.26	0.47	0.59	0.52	0.44	0.19	0.59	0.4	0.6	0.55	0.28	0.59	0.46	0.39	1.0	0.89	0.24	0.24	0.21	0.31
KNA56145 (VCV51_032985)	0.45	0.13	0.12	0.35	0.24	0.39	0.32	0.23	0.38	1.0	0.28	0.49	0.72	0.17	0.37	0.81	0.72	0.51	0.48	0.35	0.26	0.44	0.6
KNA56277 (VCV51_032900)	0.23	0.35	0.13	0.18	0.58	0.67	0.57	0.59	0.31	0.59	0.36	0.52	0.39	0.63	0.29	1.0	0.89	0.51	0.5	0.32	0.3	0.39	0.43
KNA56278 (VCV51_030596)	0.1	0.11	0.03	0.07	0.47	0.82	0.7	0.49	0.16	1.0	0.24	0.36	0.68	0.18	0.14	0.89	0.47	0.23	0.23	0.14	0.13	0.2	0.22
KNA56413 (VCV51_030684)	0.29	0.26	0.03	0.26	0.58	0.7	0.62	0.47	0.42	1.0	0.63	0.21	0.89	0.37	0.1	0.52	0.42	0.47	0.4	0.39	0.32	0.31	0.18
KNA56420 (VCV51_030689)	0.04	0.14	0.02	0.03	0.63	1.0	0.84	0.56	0.04	0.63	0.12	0.23	0.59	0.22	0.28	0.29	0.21	0.21	0.2	0.04	0.04	0.03	0.03
KNA56847 (VCV51_032859)	0.13	0.29	0.21	0.11	0.56	0.59	0.6	0.56	0.16	0.52	0.34	0.37	0.49	0.27	0.24	0.61	0.68	0.93	1.0	0.16	0.16	0.13	0.43
KNA56854 (VCV51_030491)	0.54	0.64	0.22	0.31	0.88	1.0	0.86	0.84	0.22	0.96	0.74	0.53	0.83	0.63	0.29	0.75	0.76	0.22	0.23	0.26	0.39	0.37	0.56
KNA56912 (VCV51_032867)	0.36	0.08	0.23	0.32	0.08	0.1	0.11	0.07	0.47	1.0	0.18	0.43	0.85	0.11	0.15	0.71	0.82	0.15	0.13	0.48	0.53	0.55	0.92
KNA56954 (VCV51_030577)	0.23	0.3	0.16	0.18	1.0	0.77	0.9	0.79	0.34	0.57	0.24	0.56	0.47	0.29	0.81	0.15	0.13	0.29	0.33	0.27	0.29	0.32	0.37
KNA56955 (VCV51_030578)	0.4	0.18	0.2	0.36	1.0	0.85	0.93	0.77	0.27	0.99	0.3	0.43	0.77	0.16	0.77	0.32	0.26	0.4	0.41	0.28	0.27	0.26	0.48
KNA56959 (GrpE)	0.07	0.15	0.03	0.06	0.77	1.0	0.86	0.74	0.1	0.7	0.22	0.23	0.52	0.19	0.17	0.27	0.21	0.25	0.23	0.11	0.09	0.1	0.15
KNA56960 (DnaK)	0.17	0.23	0.03	0.14	0.38	0.7	0.56	0.41	0.23	0.94	0.36	0.35	0.84	0.36	0.31	0.47	0.38	1.0	0.76	0.22	0.2	0.23	0.07
KNA56961 (DnaJ)	0.18	0.21	0.07	0.14	0.31	0.43	0.39	0.27	0.08	0.72	0.34	0.48	0.72	0.34	0.32	0.38	0.28	1.0	0.87	0.09	0.09	0.12	0.1
KNA57481 (ClpB)	0.1	0.08	0.03	0.11	0.19	0.36	0.29	0.19	0.08	0.72	0.11	0.23	0.69	0.11	0.1	0.38	0.41	1.0	0.77	0.08	0.07	0.08	0.05
KNA59402 (VCV51_032581)	0.18	0.35	0.08	0.14	0.58	0.82	0.71	0.55	0.18	1.0	0.52	0.62	0.79	0.51	0.45	0.62	0.48	0.53	0.52	0.16	0.14	0.2	0.22
KNA59420 (VCV51_031285)	0.21	0.28	0.05	0.17	0.33	0.42	0.36	0.35	0.25	1.0	0.54	0.46	0.85	0.4	0.19	0.74	0.63	0.35	0.3	0.23	0.2	0.22	0.2
KNA59763 (VCV51_032458)	0.03	0.0	0.09	0.03	0.41	0.8	0.73	0.28	0.02	1.0	0.01	0.06	0.96	0.01	0.34	0.46	0.41	0.13	0.1	0.02	0.02	0.02	0.04
KNA59764 (GroL)	0.01	0.03	0.01	0.01	0.17	0.42	0.4	0.12	0.01	1.0	0.01	0.1	0.9	0.04	0.55	0.25	0.28	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01
KNA59765 (VCV51_032460)	0.01	0.05	0.01	0.01	0.25	0.54	0.51	0.18	0.02	1.0	0.01	0.07	0.94	0.1	0.77	0.14	0.17	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01
KNA59817 (VCV51_032499)	0.06	0.08	0.02	0.05	0.6	1.0	0.69	0.69	0.11	0.46	0.13	0.18	0.36	0.1	0.18	0.13	0.14	0.23	0.16	0.11	0.1	0.1	0.08
KNA59902 (VCV51_032313)	0.2	0.27	0.2	0.12	0.92	0.97	0.93	1.0	0.3	0.59	0.22	0.7	0.63	0.24	0.92	0.17	0.26	0.41	0.41	0.26	0.25	0.28	0.34
KNA60001 (VCV51_032413)	0.09	0.09	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	1.0	0.26	0.24	0.67	0.07	0.65	0.09	0.09	0.03	0.03	0.14	0.16	0.18	0.39
KNA60002 (VCV51_032414)	0.12	0.04	0.04	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.22	0.21	0.65	0.03	0.48	0.08	0.08	0.04	0.04	0.14	0.15	0.17	0.59
KNA60782 (VCV51_032044)	0.19	0.28	0.05	0.16	0.21	0.19	0.19	0.2	0.21	0.24	0.75	0.41	0.25	0.23	0.24	0.17	0.25	1.0	0.71	0.19	0.19	0.22	0.36
KNA60937 (VCV51_031911)	0.08	0.14	0.19	0.08	0.26	0.24	0.2	0.25	0.09	1.0	0.23	0.26	0.5	0.16	0.22	0.18	0.21	0.09	0.09	0.09	0.07	0.08	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)