1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA44005 (VCV51_033986)
 1.0 0.0 0.92 0.97 0.49 0.62 0.38 0.32 0.03 0.36 0.25 0.0 0.23 0.0 0.7 0.0 0.0 0.21 0.16 0.02 0.02 0.01 0.03
KNA44020 (VCV51_033983)
 0.02 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.04 0.05 0.36 0.51 0.04 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0
KNA44023 (VCV51_033982)
 1.0 0.31 0.12 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.36 0.0 0.0 0.0 0.14 0.17 0.05 0.02 0.08 0.0
KNA44054 (VCV51_033976)
 1.0 0.0 0.33 0.67 0.24 0.23 0.21 0.07 0.19 0.33 0.11 0.0 0.18 0.01 0.14 0.0 0.0 0.11 0.02 0.16 0.07 0.19 0.08
KNA44177 (VCV51_033964)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA44569 (VCV51_033948)
 0.18 0.0 1.0 0.21 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.11 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA44570 (VCV51_033949)
 1.0 0.01 0.35 0.9 0.19 0.36 0.25 0.14 0.08 0.51 0.09 0.07 0.44 0.01 0.0 0.03 0.04 0.1 0.12 0.07 0.05 0.07 0.11
KNA45506 (VCV51_033926)
 0.81 0.05 1.0 0.6 0.48 0.42 0.43 0.36 0.18 0.43 0.2 0.05 0.25 0.05 0.44 0.0 0.02 0.34 0.36 0.06 0.08 0.11 0.88
KNA46307 (VCV51_033911)
 1.0 0.0 0.33 0.67 0.24 0.23 0.21 0.07 0.19 0.33 0.11 0.0 0.18 0.01 0.14 0.0 0.0 0.11 0.02 0.16 0.07 0.19 0.08
KNA48531 (VCV51_030201)
 0.34 0.18 0.92 0.14 0.67 0.53 0.58 0.48 0.09 0.71 0.34 0.33 0.94 0.15 0.18 0.26 0.26 0.07 0.08 0.11 0.27 0.21 1.0
KNA48718 (VCV51_030193)
 0.3 0.15 1.0 0.22 0.22 0.21 0.21 0.19 0.23 0.25 0.2 0.36 0.24 0.16 0.38 0.38 0.39 0.37 0.43 0.24 0.18 0.31 0.38
KNA49912 (VCV51_033758)
 1.0 0.0 0.3 0.92 0.69 0.77 0.66 0.5 0.0 0.91 0.25 0.0 0.77 0.0 0.16 0.0 0.0 0.27 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA49919 (VCV51_033745)
 0.81 0.05 1.0 0.6 0.48 0.42 0.43 0.36 0.18 0.43 0.2 0.05 0.25 0.05 0.44 0.0 0.02 0.34 0.36 0.06 0.08 0.11 0.88
KNA49929 (VCV51_033757)
 1.0 0.0 0.3 0.92 0.69 0.77 0.66 0.5 0.0 0.91 0.25 0.0 0.77 0.0 0.16 0.0 0.0 0.27 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA50124 (VCV51_033742)
 0.1 0.0 0.83 0.1 0.04 0.04 0.04 0.02 0.09 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.81 0.01 0.04 0.02 0.01 0.09 0.04 0.1 1.0
KNA50145 (VCV51_033732)
 1.0 0.04 0.46 0.87 0.37 0.42 0.31 0.24 0.29 0.87 0.19 0.0 0.81 0.04 0.13 0.0 0.0 0.25 0.22 0.25 0.16 0.28 0.05
KNA50149 (VCV51_033736)
 1.0 0.0 0.92 0.97 0.49 0.62 0.38 0.32 0.03 0.36 0.25 0.0 0.23 0.0 0.7 0.0 0.0 0.21 0.16 0.02 0.02 0.01 0.03
KNA50159 (VCV51_033721)
 1.0 0.0 0.92 0.97 0.49 0.62 0.38 0.32 0.03 0.36 0.25 0.0 0.23 0.0 0.7 0.0 0.0 0.21 0.16 0.02 0.02 0.01 0.03
KNA50182 (VCV51_033718)
 1.0 0.0 0.92 0.97 0.49 0.62 0.38 0.32 0.03 0.36 0.25 0.0 0.23 0.0 0.7 0.0 0.0 0.21 0.16 0.02 0.02 0.01 0.03
KNA50190 (VCV51_033709)
 1.0 0.0 0.33 0.67 0.24 0.23 0.21 0.07 0.19 0.33 0.11 0.0 0.18 0.01 0.14 0.0 0.0 0.11 0.02 0.16 0.07 0.19 0.08
KNA51123 (VCV51_031664)
 0.39 0.04 1.0 0.45 0.03 0.04 0.03 0.02 0.22 0.51 0.06 0.14 0.35 0.03 0.03 0.57 0.47 0.06 0.05 0.26 0.32 0.21 0.17
KNA51520 (VCV51_033559)
 0.04 0.0 1.0 0.06 0.05 0.04 0.04 0.06 0.04 0.03 0.01 0.0 0.04 0.01 0.16 0.0 0.0 0.04 0.04 0.01 0.02 0.03 0.0
KNA51541 (VCV51_033582)
 0.24 0.52 1.0 0.17 0.04 0.04 0.05 0.03 0.25 0.07 0.14 0.18 0.06 0.49 0.95 0.1 0.15 0.37 0.53 0.24 0.16 0.19 0.86
KNA51670 (VCV51_033551)
 0.5 0.0 0.14 1.0 0.02 0.03 0.02 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA51964 (VCV51_033496)
 0.97 0.02 0.24 1.0 0.13 0.29 0.21 0.09 0.19 0.4 0.11 0.0 0.32 0.06 0.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.2 0.12 0.2 0.0
KNA52110 (VCV51_033479)
 1.0 0.03 0.32 0.75 0.16 0.34 0.24 0.12 0.35 0.46 0.18 0.0 0.35 0.05 0.22 0.0 0.0 0.13 0.13 0.33 0.2 0.34 0.02
KNA52112 (VCV51_033481)
 0.82 0.01 1.0 0.86 0.24 0.23 0.17 0.11 0.15 0.29 0.07 0.05 0.32 0.03 0.24 0.16 0.18 0.08 0.11 0.11 0.1 0.17 0.07
KNA53017 (VCV51_031559)
 0.17 0.04 1.0 0.17 0.07 0.06 0.06 0.05 0.12 0.14 0.11 0.11 0.08 0.05 0.09 0.09 0.09 0.28 0.25 0.11 0.11 0.13 0.52
KNA53344 (VCV51_033338)
 0.03 0.01 1.0 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
KNA53756 (VCV51_033273)
 0.59 0.04 1.0 0.52 0.07 0.07 0.07 0.07 0.2 0.21 0.18 0.15 0.29 0.04 0.3 0.18 0.16 0.12 0.23 0.21 0.19 0.19 0.94
KNA53844 (VCV51_033232)
 0.74 0.0 0.18 1.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.09 0.85 0.0 0.03 0.55 0.0 0.0 0.1 0.12 0.0 0.0 0.09 0.11 0.1 0.0
KNA53869 (CspD)
 0.38 0.0 0.57 0.39 0.61 0.8 0.67 0.38 0.21 1.0 0.02 0.17 0.68 0.01 0.0 0.14 0.11 0.03 0.04 0.2 0.2 0.23 0.67
KNA53880 (VCV51_030816)
 0.48 0.0 1.0 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.02 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.01 0.1 0.06 0.7 0.16
KNA54613 (VCV51_030715)
 0.15 0.08 1.0 0.15 0.06 0.08 0.07 0.05 0.13 0.17 0.09 0.16 0.1 0.09 0.06 0.13 0.14 0.12 0.12 0.14 0.15 0.15 0.18
KNA54624 (VCV51_030724)
 0.66 0.97 0.88 0.71 0.12 0.1 0.1 0.15 0.8 0.14 0.41 0.76 0.14 0.89 0.86 0.43 0.38 0.38 0.43 0.76 0.66 0.72 1.0
KNA54640 (VCV51_033214)
 0.07 0.0 0.77 0.0 0.14 0.06 0.15 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA55338 (VCV51_031034)
 0.32 0.06 1.0 0.31 0.04 0.04 0.03 0.03 0.31 0.1 0.04 0.29 0.13 0.1 0.09 0.31 0.36 0.15 0.15 0.41 0.3 0.35 0.99
KNA55709 (VCV51_031017)
 0.18 0.42 1.0 0.11 0.1 0.09 0.09 0.09 0.09 0.19 0.43 0.7 0.24 0.34 0.29 0.43 0.33 0.21 0.23 0.11 0.12 0.12 0.35
KNA55854 (VCV51_033012)
 0.57 0.05 0.44 0.38 0.75 0.73 0.64 0.69 0.12 0.76 0.33 0.05 1.0 0.05 0.05 0.23 0.2 0.41 0.46 0.12 0.11 0.12 0.21
KNA56153 (VCV51_030893)
 0.15 0.5 1.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.09 0.2 0.2 0.05 0.42 0.36 0.09 0.07 0.67 0.77 0.07 0.11 0.14 0.1
KNA56866 (IscX)
 0.3 0.01 0.74 0.21 0.43 0.4 0.4 0.44 0.0 0.24 0.19 0.03 0.15 0.01 1.0 0.03 0.03 0.27 0.16 0.0 0.0 0.0 0.24
KNA56963 (VCV51_032889)
 0.05 0.02 1.0 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.08 0.02 0.01 0.09 0.02 0.01 0.01 0.07 0.07 0.02 0.03 0.06 0.03 0.04 0.1
KNA57832 (VCV51_032801)
 1.0 0.04 0.28 0.5 0.28 0.3 0.34 0.21 0.25 0.23 0.37 0.0 0.5 0.04 0.47 0.0 0.0 0.51 0.55 0.3 0.37 0.37 0.0
KNA58533 (VCV51_032722)
 0.57 0.02 0.27 1.0 0.46 0.29 0.33 0.34 0.05 0.06 0.17 0.0 0.03 0.02 0.31 0.0 0.0 0.07 0.09 0.12 0.01 0.02 0.0
KNA58570 (VCV51_032730)
 0.16 0.03 1.0 0.21 0.1 0.09 0.09 0.09 0.1 0.2 0.05 0.1 0.38 0.03 0.03 0.34 0.34 0.13 0.12 0.12 0.15 0.1 0.26
KNA58920 (VCV51_032610)
 1.0 0.02 0.15 0.68 0.19 0.22 0.21 0.17 0.24 0.11 0.15 0.08 0.12 0.02 0.09 0.43 0.36 0.43 0.37 0.36 0.39 0.33 0.19
KNA59342 (VCV51_032561)
 1.0 0.02 1.0 0.89 0.01 0.01 0.01 0.01 0.14 0.34 0.05 0.14 0.36 0.02 0.04 0.42 0.41 0.34 0.42 0.17 0.23 0.22 0.82
KNA59747 (VCV51_032442)
 0.62 0.07 1.0 0.48 0.48 0.37 0.39 0.37 0.4 0.37 0.22 0.28 0.41 0.06 0.25 0.27 0.45 0.32 0.37 0.43 0.45 0.48 0.38
KNA59754 (VCV51_032449)
 0.51 0.03 0.08 1.0 0.03 0.03 0.05 0.05 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.11 0.05 0.09 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
KNA59819 (VCV51_030879)
 0.03 0.06 1.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.08 0.5 0.06 0.06 0.04 0.03 0.17 0.21 0.07 0.08 0.04 0.03 0.03 0.13
KNA59821 (VCV51_030881)
 0.02 0.16 1.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04 0.08 0.67 0.08 0.04 0.09 0.12 0.09 0.12 0.03 0.06 0.06 0.04 0.04 0.19
KNA59964 (VCV51_032376)
 0.58 0.13 0.93 0.43 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.82 0.09 0.01 0.16 0.12 0.01 0.01 0.01 0.01 0.54 0.48 0.83 0.02
KNA60003 (VCV51_032415)
 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA60007 (VCV51_032419)
 0.25 0.11 1.0 0.2 0.08 0.06 0.04 0.03 0.29 0.01 0.83 0.83 0.0 0.18 0.06 0.29 0.4 0.01 0.01 0.18 0.12 0.21 0.12
KNA60008 (VCV51_032420)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA60533 (VCV51_032204)
 0.34 0.52 1.0 0.33 0.55 0.45 0.42 0.52 0.2 0.09 0.58 0.56 0.12 0.44 0.44 0.23 0.36 0.12 0.13 0.17 0.17 0.17 0.66
KNA60709 (VCV51_032148)
 0.85 0.01 0.43 1.0 0.41 0.59 0.53 0.31 0.48 0.55 0.04 0.21 0.51 0.01 0.01 0.12 0.16 0.42 0.39 0.5 0.37 0.47 0.24
KNA60777 (VCV51_032039)
 0.87 0.11 0.14 1.0 0.56 0.56 0.6 0.47 0.09 0.29 0.32 0.19 0.29 0.12 0.16 0.11 0.16 0.26 0.29 0.09 0.09 0.1 0.11
KNA60790 (VCV51_032052)
 0.04 0.03 1.0 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.05 0.03 0.28 0.05 0.03 0.04 0.02 0.05 0.07 0.18 0.1 0.05 0.04 0.05 0.23
KNA60805 (VCV51_032067)
 0.18 0.04 1.0 0.21 0.03 0.02 0.02 0.04 0.07 0.01 0.13 0.07 0.01 0.05 0.07 0.1 0.19 0.02 0.03 0.05 0.05 0.06 0.25
KNA60938 (VCV51_031913)
 1.0 0.03 0.07 0.59 0.03 0.04 0.03 0.02 0.18 0.47 0.13 0.26 0.8 0.02 0.02 0.12 0.26 0.36 0.34 0.21 0.19 0.23 0.0
KNA61028 (VCV51_032003)
 0.67 0.29 1.0 0.4 0.91 0.87 0.79 0.85 0.39 0.8 0.3 0.62 0.81 0.23 0.8 0.11 0.18 0.24 0.24 0.61 0.45 0.52 0.7

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)