1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA47629 (VCV51_033875)
 0.0 0.63 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
KNA47894 (VCV51_033874)
 0.01 1.0 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.19 0.0 0.26 0.12 0.0 0.81 0.11 0.78 0.93 0.19 0.18 0.18 0.17 0.18 0.1
KNA49490 (VCV51_030298)
 0.14 0.49 0.09 0.08 0.61 0.64 0.64 0.63 0.2 0.27 0.66 0.71 0.27 0.42 0.72 0.26 0.26 1.0 0.66 0.18 0.2 0.21 0.18
KNA49652 (VCV51_030208)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04
KNA49653 (VCV51_030209)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA51532 (VCV51_033572)
 0.17 1.0 0.04 0.18 0.04 0.09 0.06 0.05 0.13 0.12 0.13 0.11 0.07 0.63 0.32 0.04 0.06 0.13 0.13 0.12 0.1 0.11 0.13
KNA52279 (VCV51_033445)
 0.26 0.34 0.15 0.24 0.23 0.27 0.27 0.28 0.45 0.21 0.3 0.44 0.2 0.35 1.0 0.23 0.27 0.43 0.42 0.38 0.33 0.48 0.33
KNA53608 (VCV51_033300)
 0.32 0.93 0.37 0.28 0.26 0.26 0.27 0.25 0.38 0.24 0.65 0.57 0.21 1.0 0.63 0.43 0.5 0.45 0.4 0.27 0.23 0.4 0.33
KNA53859 (VCV51_030796)
 0.17 1.0 0.06 0.14 0.5 0.29 0.42 0.53 0.38 0.15 0.2 0.22 0.1 0.93 0.18 0.15 0.13 0.21 0.21 0.29 0.24 0.34 0.13
KNA55084 (VCV51_031849)
 0.07 1.0 0.02 0.06 0.06 0.06 0.07 0.07 0.11 0.11 0.28 0.32 0.16 0.88 0.17 0.1 0.13 0.1 0.11 0.1 0.12 0.1 0.14
KNA55289 (VCV51_033102)
 0.12 0.83 0.13 0.07 0.19 0.18 0.19 0.19 0.15 0.06 0.29 0.23 0.08 1.0 0.15 0.42 0.33 0.28 0.31 0.15 0.17 0.17 0.15
KNA55993 (VCV51_030911)
 0.12 0.24 0.09 0.08 0.73 0.67 0.74 0.72 0.14 0.08 0.72 0.79 0.06 0.19 1.0 0.2 0.14 0.47 0.33 0.12 0.12 0.14 0.14
KNA56275 (VCV51_032898)
 0.08 0.81 0.03 0.04 0.25 0.18 0.23 0.23 0.23 0.17 0.44 0.26 0.17 1.0 0.14 0.16 0.11 0.17 0.2 0.19 0.2 0.27 0.12
KNA56859 (IscR)
 0.28 0.79 0.9 0.18 0.75 0.63 0.75 0.59 1.0 0.18 0.26 0.7 0.13 0.69 0.41 0.27 0.31 0.53 0.56 0.67 0.58 0.94 0.41
KNA56860 (IscS)
 0.16 0.45 0.47 0.11 0.82 0.88 1.0 0.8 0.44 0.32 0.33 0.75 0.22 0.38 0.8 0.23 0.24 0.68 0.61 0.33 0.3 0.41 0.32
KNA56861 (VCV51_030498)
 0.19 0.27 0.66 0.15 0.91 0.92 1.0 0.9 0.29 0.32 0.32 0.53 0.23 0.22 0.74 0.25 0.28 0.99 0.65 0.28 0.28 0.29 0.25
KNA56862 (IscA)
 0.37 0.61 0.78 0.31 0.83 0.84 0.86 0.83 0.55 0.38 0.26 0.38 0.26 0.64 0.41 0.36 0.39 1.0 0.61 0.54 0.53 0.55 0.17
KNA56863 (HscB)
 0.12 0.64 0.35 0.09 0.37 0.4 0.43 0.35 0.09 0.46 0.41 0.79 0.35 0.67 0.72 0.71 0.72 1.0 0.72 0.1 0.09 0.1 0.3
KNA56864 (HscA)
 0.11 0.61 0.33 0.08 0.42 0.46 0.53 0.45 0.15 0.43 0.45 0.68 0.31 0.58 0.84 0.55 0.56 1.0 0.62 0.15 0.14 0.15 0.21
KNA56865 (VCV51_032862)
 0.27 0.78 0.48 0.15 0.68 0.62 0.64 0.68 0.29 0.32 0.46 0.42 0.23 0.8 0.66 0.33 0.34 1.0 0.59 0.28 0.28 0.35 0.17
KNA56933 (VCV51_030557)
 0.02 0.63 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.19 0.0 1.0 0.05 0.03 0.04 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02
KNA56937 (TcpB)
 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56938 (VCV51_032881)
 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.25 0.0 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56939 (VCV51_030562)
 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.22 0.0 1.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56940 (VCV51_030563)
 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56945 (VCV51_030569)
 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.23 0.0 1.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA56946 (VCV51_030570)
 0.0 0.81 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.27 0.0 1.0 0.1 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
KNA56947 (AcfB)
 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 1.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
KNA58257 (NspC)
 0.03 0.67 0.03 0.03 0.21 0.21 0.12 0.19 0.01 0.18 0.01 0.01 0.14 1.0 0.9 0.02 0.02 0.17 0.15 0.05 0.05 0.05 0.09
KNA59392 (VCV51_031300)
 0.29 0.21 0.49 0.21 0.98 0.97 1.0 0.96 0.66 0.39 0.45 0.58 0.19 0.18 0.37 0.24 0.22 0.51 0.46 0.46 0.44 0.59 0.22
KNA59777 (VCV51_032472)
 0.26 0.89 0.15 0.18 0.48 0.44 0.45 0.49 0.43 0.17 1.0 0.81 0.28 0.85 0.77 0.26 0.34 0.4 0.49 0.33 0.32 0.41 0.43
KNA59778 (VCV51_032473)
 0.1 0.59 0.19 0.11 0.14 0.13 0.13 0.15 0.46 0.04 0.55 0.41 0.02 0.6 1.0 0.06 0.09 0.1 0.1 0.21 0.15 0.25 0.1
KNA59781 (VCV51_032476)
 0.07 1.0 0.12 0.07 0.17 0.12 0.14 0.18 0.2 0.05 0.57 0.43 0.04 0.93 0.96 0.08 0.12 0.23 0.26 0.12 0.09 0.1 0.21
KNA59794 (VCV51_032490)
 0.15 0.25 0.11 0.11 0.45 0.41 0.45 0.44 0.17 0.2 0.59 1.0 0.15 0.22 0.71 0.11 0.14 0.82 0.62 0.14 0.14 0.19 0.29
KNA59815 (VCV51_032498)
 0.18 0.22 0.07 0.13 0.1 0.13 0.12 0.11 0.56 0.13 0.2 0.53 0.12 0.21 1.0 0.22 0.35 0.32 0.27 0.49 0.34 0.56 0.33
KNA59869 (VCV51_032280)
 0.25 0.66 0.19 0.21 0.27 0.29 0.29 0.21 0.66 0.17 0.15 0.9 0.19 1.0 0.16 0.29 0.36 0.38 0.42 0.54 0.44 0.6 0.28
KNA59880 (VCV51_032291)
 0.14 0.43 0.08 0.25 0.06 0.06 0.06 0.05 0.96 0.16 0.35 1.0 0.1 0.36 0.36 0.21 0.39 0.19 0.2 0.64 0.52 0.35 0.39
KNA59907 (VCV51_032318)
 0.28 0.94 0.24 0.28 0.18 0.26 0.27 0.28 0.57 0.49 0.39 1.0 0.26 0.62 0.76 0.28 0.55 0.23 0.23 0.6 0.44 0.54 0.67
KNA59915 (VCV51_032326)
 0.38 0.91 0.24 0.37 0.3 0.3 0.31 0.28 0.67 0.46 0.48 1.0 0.35 0.82 0.95 0.39 0.51 0.62 0.67 0.57 0.46 0.63 0.57
KNA59991 (VCV51_032403)
 0.06 0.35 0.05 0.04 0.24 0.17 0.21 0.22 0.12 0.08 0.19 0.32 0.08 0.39 0.36 0.06 0.06 1.0 0.74 0.09 0.1 0.11 0.04
KNA59992 (VCV51_032404)
 0.08 0.28 0.05 0.06 0.25 0.22 0.25 0.26 0.12 0.1 0.26 0.41 0.11 0.28 0.69 0.07 0.09 1.0 0.86 0.09 0.11 0.12 0.1
KNA59998 (VCV51_032410)
 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.34 1.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.33
KNA60015 (VCV51_032427)
 0.33 0.33 0.1 0.17 0.41 0.42 0.46 0.44 0.36 1.0 0.69 0.94 0.45 0.39 0.31 0.17 0.24 0.42 0.44 0.41 0.31 0.38 0.24
KNA60016 (VCV51_032428)
 0.21 0.24 0.12 0.16 0.28 0.29 0.31 0.29 0.33 0.8 0.63 1.0 0.45 0.3 0.26 0.11 0.13 0.2 0.21 0.28 0.17 0.27 0.21
KNA60686 (VCV51_032125)
 0.29 0.95 0.2 0.25 0.29 0.29 0.33 0.27 0.68 0.27 0.46 0.84 0.26 0.91 1.0 0.55 0.76 0.39 0.47 0.7 0.48 0.61 0.79
KNA60724 (VCV51_032163)
 0.26 0.84 0.27 0.27 0.38 0.4 0.44 0.37 0.44 0.41 0.63 0.72 0.27 0.89 1.0 0.35 0.48 0.48 0.54 0.32 0.24 0.32 0.5
KNA60794 (VCV51_032056)
 0.11 0.79 0.04 0.1 0.07 0.07 0.06 0.05 0.11 0.08 1.0 0.62 0.04 0.78 0.61 0.1 0.13 0.14 0.15 0.11 0.11 0.11 0.07
KNA60928 (VCV51_031902)
 0.43 1.0 0.16 0.33 0.12 0.13 0.12 0.12 0.49 0.22 0.74 0.68 0.15 0.84 0.62 0.3 0.43 0.48 0.51 0.45 0.39 0.49 0.55

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)