Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA49525 (VCV51_030324)	0.46	0.18	0.22	0.43	0.23	0.21	0.2	0.17	0.52	0.29	0.16	0.44	0.25	0.17	0.26	0.88	1.0	0.55	0.62	0.45	0.51	0.51	0.58
KNA50224 (VCV51_030259)	0.53	0.49	0.37	0.53	0.25	0.28	0.28	0.24	0.83	0.68	0.73	0.86	0.49	0.51	0.53	0.93	1.0	0.7	0.77	0.58	0.73	0.79	0.54
KNA50408 (VCV51_031431)	0.24	0.28	0.36	0.22	0.36	0.36	0.4	0.4	1.0	0.44	0.12	0.68	0.82	0.27	0.41	0.49	0.38	0.24	0.26	0.89	0.8	0.82	0.53
KNA51521 (VCV51_033560)	0.54	0.52	0.43	0.44	0.68	0.76	0.71	0.5	0.76	0.85	0.45	0.73	1.0	0.52	0.19	0.69	0.96	0.47	0.49	0.75	0.7	0.61	0.98
KNA51551 (VCV51_033594)	0.41	0.14	0.18	0.36	0.15	0.18	0.18	0.14	0.87	0.38	0.22	0.4	0.28	0.14	0.47	0.24	0.37	0.97	1.0	0.76	0.61	0.72	0.45
KNA51556 (VCV51_033599)	0.34	0.28	1.0	0.24	0.42	0.59	0.55	0.33	0.49	0.33	0.22	0.73	0.41	0.28	0.09	0.6	0.91	0.64	0.62	0.41	0.49	0.47	0.69
KNA52217 (VCV51_033475)	0.3	0.43	0.11	0.22	0.78	0.72	0.69	0.66	1.0	0.39	0.47	0.37	0.53	0.47	0.35	0.37	0.44	0.54	0.56	0.8	0.71	0.9	0.84
KNA52266 (VCV51_033431)	0.47	0.21	0.15	0.37	0.2	0.22	0.2	0.16	0.44	0.28	0.2	0.3	0.27	0.3	0.28	0.3	0.41	0.52	0.6	0.48	0.59	0.44	1.0
KNA52748 (VCV51_033381)	0.26	0.2	0.16	0.25	0.15	0.19	0.19	0.15	1.0	0.27	0.17	0.31	0.29	0.2	0.73	0.34	0.34	0.5	0.43	0.91	0.54	0.97	0.5
KNA53562 (VCV51_030043)	0.46	0.4	0.3	0.29	0.33	0.26	0.27	0.27	0.78	0.22	0.27	0.23	0.27	0.48	0.3	0.19	0.27	0.83	1.0	0.82	0.92	0.81	0.49
KNA53583 (VCV51_030061)	0.33	0.5	0.24	0.26	0.36	0.36	0.38	0.35	0.82	0.38	0.45	0.57	0.4	0.52	0.65	0.74	0.8	0.93	1.0	0.71	0.67	0.91	0.71
KNA53593 (VCV51_030071)	0.27	0.1	0.26	0.18	0.12	0.13	0.13	0.13	0.3	0.48	0.49	0.58	0.55	0.11	0.52	0.46	0.5	0.97	1.0	0.24	0.26	0.32	0.64
KNA53677 (VCV51_030032)	0.51	0.2	0.21	0.34	0.13	0.14	0.15	0.12	0.71	0.33	0.34	0.46	0.3	0.2	0.89	0.3	0.4	0.92	1.0	0.8	0.81	0.97	0.49
KNA53758 (VCV51_033275)	0.14	0.01	0.42	0.1	0.02	0.03	0.03	0.02	1.0	0.04	0.04	0.0	0.15	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.83	0.59	0.73	0.0
KNA53790 (VCV51_033264)	0.4	0.01	0.17	0.17	0.01	0.02	0.02	0.01	0.39	0.36	0.06	0.35	1.0	0.01	0.01	0.12	0.18	0.06	0.04	0.33	0.27	0.46	0.05
KNA53791 (FadA)	0.56	0.01	0.29	0.38	0.03	0.05	0.05	0.03	0.38	0.51	0.06	0.78	1.0	0.01	0.05	0.23	0.36	0.15	0.11	0.34	0.34	0.47	0.11
KNA53792 (VCV51_031853)	0.63	0.39	0.65	0.4	0.52	0.46	0.51	0.4	0.52	0.78	0.66	1.0	0.63	0.36	0.44	0.5	0.63	0.38	0.46	0.52	0.48	0.65	0.7
KNA53853 (VCV51_033234)	0.26	0.08	1.0	0.24	0.11	0.1	0.1	0.09	0.41	0.16	0.05	0.1	0.23	0.07	0.03	0.39	0.4	0.55	0.43	0.45	0.56	0.37	0.46
KNA54653 (VCV51_030743)	0.39	0.24	0.54	0.3	0.25	0.17	0.2	0.19	0.38	0.33	0.31	0.26	0.6	0.21	0.18	0.34	0.33	0.99	1.0	0.4	0.49	0.32	0.76
KNA54882 (VCV51_031808)	0.64	0.23	0.11	0.42	0.26	0.22	0.25	0.25	0.73	0.26	0.36	0.28	0.9	0.21	0.29	0.44	0.71	1.0	0.88	0.67	0.69	0.64	0.68
KNA54883 (VCV51_033125)	0.47	0.34	0.33	0.24	0.21	0.23	0.24	0.22	0.69	0.45	0.39	0.46	0.49	0.34	0.23	0.39	0.63	0.7	0.74	0.71	0.73	1.0	0.75
KNA54904 (VCV51_031792)	0.24	0.32	0.18	0.18	0.41	0.41	0.41	0.39	0.37	0.33	0.36	0.57	0.26	0.35	0.5	0.21	0.26	0.55	0.62	0.31	1.0	0.36	0.6
KNA54911 (VCV51_031788)	0.28	0.52	0.16	0.24	0.6	0.57	0.63	0.53	0.51	0.52	0.54	0.66	0.42	0.57	0.76	0.36	0.43	1.0	0.96	0.46	0.46	0.56	0.52
KNA54964 (KefG)	0.6	0.16	0.36	0.37	0.31	0.32	0.35	0.29	0.51	0.45	0.44	1.0	0.54	0.12	0.49	0.69	0.94	0.71	0.77	0.45	0.51	0.61	0.77
KNA54965 (VCV51_031741)	0.74	0.26	0.49	0.46	0.24	0.22	0.23	0.22	0.85	0.25	0.36	0.75	0.3	0.21	0.36	0.43	0.53	0.8	0.8	0.84	0.86	1.0	0.66
KNA55087 (VCV51_031846)	0.63	0.53	0.4	0.43	0.28	0.28	0.31	0.26	0.59	0.64	0.52	0.87	0.8	0.61	0.51	0.56	0.79	0.46	0.49	0.52	0.53	0.77	1.0
KNA55116 (VCV51_033120)	0.35	0.06	0.61	0.37	0.17	0.17	0.15	0.18	0.84	0.16	0.04	0.55	0.29	0.07	0.09	0.2	0.28	0.21	0.2	1.0	0.76	0.93	0.57
KNA55123 (RecG)	0.35	0.25	0.18	0.18	0.22	0.23	0.22	0.2	0.37	0.34	0.31	0.57	0.33	0.24	0.32	0.3	0.36	0.87	1.0	0.36	0.38	0.55	0.61
KNA55272 (VCV51_033085)	0.59	0.05	0.44	0.32	0.07	0.08	0.08	0.05	0.72	0.18	0.05	0.29	0.29	0.04	0.06	0.27	0.26	0.06	0.05	0.84	0.63	1.0	0.19
KNA55367 (VCV51_033044)	0.39	0.45	0.19	0.22	0.49	0.46	0.53	0.39	0.84	0.58	0.46	0.57	0.45	0.46	0.52	0.58	0.44	0.46	0.57	0.66	0.8	1.0	0.37
KNA55690 (VCV51_033026)	0.66	0.04	0.19	0.99	0.03	0.03	0.03	0.02	1.0	0.09	0.04	0.03	0.1	0.04	0.02	0.05	0.04	0.16	0.13	0.87	0.81	0.84	0.03
KNA56415 (VCV51_030686)	0.51	0.2	0.16	0.31	0.18	0.22	0.2	0.17	0.6	0.76	0.31	0.7	0.6	0.21	0.17	0.38	0.32	0.93	1.0	0.56	0.93	0.9	0.58
KNA57460 (VCV51_030450)	0.44	0.57	0.24	0.33	0.36	0.35	0.36	0.27	0.91	0.32	0.39	0.32	0.32	0.65	0.13	0.79	1.0	0.75	0.81	0.79	0.89	0.97	0.62
KNA58530 (VCV51_031168)	0.25	0.02	0.08	0.1	0.03	0.05	0.05	0.03	0.57	0.13	0.06	0.19	1.0	0.01	0.01	0.13	0.11	0.04	0.05	0.55	0.31	0.54	0.06
KNA59361 (VCV51_031325)	0.52	0.35	0.23	0.36	0.17	0.16	0.18	0.15	0.81	0.22	0.39	0.55	0.22	0.33	0.04	0.73	0.62	0.91	1.0	0.72	0.88	0.9	0.8
KNA59384 (VCV51_031306)	0.49	0.21	0.37	0.31	0.36	0.35	0.33	0.27	0.88	0.19	0.24	0.35	0.25	0.2	0.12	0.58	0.42	0.53	0.58	0.8	0.79	1.0	0.58
KNA59640 (VCV51_032537)	0.2	0.32	0.17	0.16	0.16	0.16	0.17	0.13	1.0	0.29	0.1	0.51	0.56	0.34	0.11	0.48	0.36	0.22	0.22	0.89	0.71	0.81	0.44
KNA59643 (VCV51_032540)	0.22	0.61	0.14	0.19	0.53	0.52	0.57	0.52	0.35	0.34	0.69	0.76	0.34	0.65	1.0	0.57	0.48	0.54	0.63	0.31	0.28	0.34	0.64
KNA59746 (VCV51_032441)	0.42	0.53	0.13	0.27	0.6	0.7	0.79	0.56	0.92	0.69	0.27	0.55	0.52	0.6	0.71	0.18	0.24	0.92	1.0	0.74	0.88	0.93	0.59
KNA59756 (VCV51_032451)	0.57	0.05	0.22	0.65	0.1	0.15	0.15	0.09	0.81	1.0	0.1	0.71	0.88	0.05	0.04	0.25	0.53	0.35	0.36	0.68	0.63	0.72	0.44
KNA59758 (VCV51_032453)	0.69	0.06	0.88	0.49	0.13	0.1	0.13	0.1	1.0	0.27	0.19	0.27	0.74	0.07	0.03	0.18	0.34	0.23	0.22	0.86	0.85	0.74	0.13
KNA59791 (VCV51_032486)	0.47	0.3	0.15	0.36	0.37	0.41	0.4	0.38	0.95	0.46	0.28	0.35	0.37	0.28	0.17	0.25	0.34	0.5	0.45	0.89	1.0	1.0	0.68
KNA59875 (VCV51_032286)	0.55	0.32	0.18	0.37	0.27	0.35	0.3	0.24	0.68	0.43	0.32	0.45	0.37	0.3	0.28	0.51	0.62	0.83	1.0	0.65	0.59	0.74	0.25
KNA59892 (VCV51_032303)	0.28	0.21	0.12	0.17	0.19	0.21	0.22	0.19	0.33	0.5	0.15	0.57	0.38	0.23	0.26	0.18	0.28	0.82	1.0	0.29	0.29	0.35	0.25
KNA59900 (VCV51_032311)	0.65	0.15	0.25	0.48	0.39	0.35	0.33	0.35	1.0	0.32	0.1	0.23	0.23	0.19	0.34	0.31	0.5	0.83	0.8	0.94	0.91	0.9	0.78
KNA59950 (VCV51_032362)	0.37	0.35	0.16	0.36	0.37	0.38	0.36	0.33	1.0	0.32	0.18	0.23	0.49	0.34	0.15	0.54	0.79	0.25	0.25	0.89	0.81	0.88	0.25
KNA59957 (VCV51_032369)	0.71	0.08	0.46	0.58	1.0	0.83	0.82	0.89	0.53	0.61	0.21	0.57	0.8	0.07	0.33	0.37	0.6	0.56	0.6	0.47	0.55	0.47	0.68
KNA60011 (VCV51_032423)	0.26	0.07	1.0	0.29	0.07	0.07	0.07	0.06	0.39	0.21	0.02	0.09	0.49	0.06	0.02	0.28	0.62	0.79	0.69	0.49	0.76	0.33	0.09
KNA60545 (VCV51_032216)	0.48	0.1	0.21	0.26	0.24	0.28	0.27	0.22	0.18	0.4	0.06	0.38	0.39	0.1	0.34	0.42	0.53	0.93	1.0	0.3	0.23	0.28	0.64
KNA60685 (VCV51_032124)	0.32	0.16	0.2	0.14	0.18	0.15	0.14	0.13	0.25	0.92	0.35	0.7	0.25	0.17	0.05	0.26	0.33	0.4	0.41	1.0	0.7	0.55	0.37
KNA60699 (VCV51_032138)	0.58	0.16	0.21	0.42	0.17	0.17	0.19	0.15	0.67	0.49	0.23	1.0	0.5	0.15	0.08	0.44	0.68	0.5	0.48	0.61	0.57	0.72	0.65
KNA60703 (VCV51_032142)	0.91	0.3	0.22	0.59	0.53	0.51	0.52	0.43	1.0	0.45	0.27	0.46	0.43	0.31	0.24	0.55	0.71	0.49	0.58	0.91	0.98	0.95	0.77
KNA60704 (SoxR)	0.55	0.42	0.13	0.2	0.38	0.35	0.4	0.34	0.37	0.35	0.35	0.32	0.48	0.4	0.31	0.19	0.34	0.89	1.0	0.44	0.4	0.45	0.7
KNA60734 (VCV51_032174)	0.21	0.06	0.36	0.15	0.67	0.59	0.57	0.63	0.08	0.59	0.15	0.4	0.51	0.06	0.19	0.11	0.18	0.92	1.0	0.09	0.12	0.1	0.54
KNA60811 (VCV51_032074)	1.0	0.01	0.17	0.94	0.04	0.04	0.04	0.04	0.99	0.66	0.04	0.2	0.39	0.01	0.05	0.41	0.63	0.17	0.17	0.72	0.54	0.84	0.07
KNA60931 (VCV51_031905)	0.42	0.32	0.11	0.26	0.25	0.28	0.26	0.21	0.52	0.41	0.28	0.39	0.31	0.26	0.08	0.25	0.36	0.91	1.0	0.52	0.45	0.58	0.34
KNA60932 (VCV51_031906)	0.73	0.04	0.24	0.62	0.42	0.43	0.41	0.24	0.79	0.85	0.13	0.2	0.63	0.12	0.21	0.71	1.0	0.71	0.77	0.83	0.85	0.89	0.57
KNA60933 (VCV51_031907)	0.45	0.06	0.28	0.35	0.08	0.08	0.08	0.07	0.4	0.15	0.07	0.26	0.13	0.06	0.09	0.23	0.38	1.0	0.98	0.49	0.59	0.47	0.4
KNA60934 (VCV51_031908)	0.35	0.12	0.06	0.27	0.19	0.15	0.2	0.13	0.59	0.39	0.12	0.25	0.21	0.12	0.2	0.15	0.28	0.98	1.0	0.56	0.53	0.65	0.36
KNA60935 (VCV51_031909)	0.75	0.23	0.34	0.38	0.62	0.54	0.55	0.55	0.61	0.99	0.25	0.83	0.66	0.21	0.44	0.36	0.79	0.84	1.0	0.67	0.79	0.74	0.66
KNA61034 (VCV51_032009)	0.3	0.09	0.09	0.39	0.09	0.12	0.12	0.09	0.42	0.19	0.08	0.52	0.18	0.09	0.08	0.11	0.22	1.0	0.71	0.34	0.26	0.36	0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)