Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA49525 (VCV51_030324)
0.46 0.18 0.22 0.43 0.23 0.21 0.2 0.17 0.52 0.29 0.16 0.44 0.25 0.17 0.26 0.88 1.0 0.55 0.62 0.45 0.51 0.51 0.58
KNA50224 (VCV51_030259)
0.53 0.49 0.37 0.53 0.25 0.28 0.28 0.24 0.83 0.68 0.73 0.86 0.49 0.51 0.53 0.93 1.0 0.7 0.77 0.58 0.73 0.79 0.54
KNA50408 (VCV51_031431)
0.24 0.28 0.36 0.22 0.36 0.36 0.4 0.4 1.0 0.44 0.12 0.68 0.82 0.27 0.41 0.49 0.38 0.24 0.26 0.89 0.8 0.82 0.53
KNA51521 (VCV51_033560)
0.54 0.52 0.43 0.44 0.68 0.76 0.71 0.5 0.76 0.85 0.45 0.73 1.0 0.52 0.19 0.69 0.96 0.47 0.49 0.75 0.7 0.61 0.98
KNA51551 (VCV51_033594)
0.41 0.14 0.18 0.36 0.15 0.18 0.18 0.14 0.87 0.38 0.22 0.4 0.28 0.14 0.47 0.24 0.37 0.97 1.0 0.76 0.61 0.72 0.45
KNA51556 (VCV51_033599)
0.34 0.28 1.0 0.24 0.42 0.59 0.55 0.33 0.49 0.33 0.22 0.73 0.41 0.28 0.09 0.6 0.91 0.64 0.62 0.41 0.49 0.47 0.69
KNA52217 (VCV51_033475)
0.3 0.43 0.11 0.22 0.78 0.72 0.69 0.66 1.0 0.39 0.47 0.37 0.53 0.47 0.35 0.37 0.44 0.54 0.56 0.8 0.71 0.9 0.84
KNA52266 (VCV51_033431)
0.47 0.21 0.15 0.37 0.2 0.22 0.2 0.16 0.44 0.28 0.2 0.3 0.27 0.3 0.28 0.3 0.41 0.52 0.6 0.48 0.59 0.44 1.0
KNA52748 (VCV51_033381)
0.26 0.2 0.16 0.25 0.15 0.19 0.19 0.15 1.0 0.27 0.17 0.31 0.29 0.2 0.73 0.34 0.34 0.5 0.43 0.91 0.54 0.97 0.5
KNA53562 (VCV51_030043)
0.46 0.4 0.3 0.29 0.33 0.26 0.27 0.27 0.78 0.22 0.27 0.23 0.27 0.48 0.3 0.19 0.27 0.83 1.0 0.82 0.92 0.81 0.49
KNA53583 (VCV51_030061)
0.33 0.5 0.24 0.26 0.36 0.36 0.38 0.35 0.82 0.38 0.45 0.57 0.4 0.52 0.65 0.74 0.8 0.93 1.0 0.71 0.67 0.91 0.71
KNA53593 (VCV51_030071)
0.27 0.1 0.26 0.18 0.12 0.13 0.13 0.13 0.3 0.48 0.49 0.58 0.55 0.11 0.52 0.46 0.5 0.97 1.0 0.24 0.26 0.32 0.64
KNA53677 (VCV51_030032)
0.51 0.2 0.21 0.34 0.13 0.14 0.15 0.12 0.71 0.33 0.34 0.46 0.3 0.2 0.89 0.3 0.4 0.92 1.0 0.8 0.81 0.97 0.49
KNA53758 (VCV51_033275)
0.14 0.01 0.42 0.1 0.02 0.03 0.03 0.02 1.0 0.04 0.04 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.83 0.59 0.73 0.0
KNA53790 (VCV51_033264)
0.4 0.01 0.17 0.17 0.01 0.02 0.02 0.01 0.39 0.36 0.06 0.35 1.0 0.01 0.01 0.12 0.18 0.06 0.04 0.33 0.27 0.46 0.05
KNA53791 (FadA)
0.56 0.01 0.29 0.38 0.03 0.05 0.05 0.03 0.38 0.51 0.06 0.78 1.0 0.01 0.05 0.23 0.36 0.15 0.11 0.34 0.34 0.47 0.11
KNA53792 (VCV51_031853)
0.63 0.39 0.65 0.4 0.52 0.46 0.51 0.4 0.52 0.78 0.66 1.0 0.63 0.36 0.44 0.5 0.63 0.38 0.46 0.52 0.48 0.65 0.7
KNA53853 (VCV51_033234)
0.26 0.08 1.0 0.24 0.11 0.1 0.1 0.09 0.41 0.16 0.05 0.1 0.23 0.07 0.03 0.39 0.4 0.55 0.43 0.45 0.56 0.37 0.46
KNA54653 (VCV51_030743)
0.39 0.24 0.54 0.3 0.25 0.17 0.2 0.19 0.38 0.33 0.31 0.26 0.6 0.21 0.18 0.34 0.33 0.99 1.0 0.4 0.49 0.32 0.76
KNA54882 (VCV51_031808)
0.64 0.23 0.11 0.42 0.26 0.22 0.25 0.25 0.73 0.26 0.36 0.28 0.9 0.21 0.29 0.44 0.71 1.0 0.88 0.67 0.69 0.64 0.68
KNA54883 (VCV51_033125)
0.47 0.34 0.33 0.24 0.21 0.23 0.24 0.22 0.69 0.45 0.39 0.46 0.49 0.34 0.23 0.39 0.63 0.7 0.74 0.71 0.73 1.0 0.75
KNA54904 (VCV51_031792)
0.24 0.32 0.18 0.18 0.41 0.41 0.41 0.39 0.37 0.33 0.36 0.57 0.26 0.35 0.5 0.21 0.26 0.55 0.62 0.31 1.0 0.36 0.6
KNA54911 (VCV51_031788)
0.28 0.52 0.16 0.24 0.6 0.57 0.63 0.53 0.51 0.52 0.54 0.66 0.42 0.57 0.76 0.36 0.43 1.0 0.96 0.46 0.46 0.56 0.52
KNA54964 (KefG)
0.6 0.16 0.36 0.37 0.31 0.32 0.35 0.29 0.51 0.45 0.44 1.0 0.54 0.12 0.49 0.69 0.94 0.71 0.77 0.45 0.51 0.61 0.77
KNA54965 (VCV51_031741)
0.74 0.26 0.49 0.46 0.24 0.22 0.23 0.22 0.85 0.25 0.36 0.75 0.3 0.21 0.36 0.43 0.53 0.8 0.8 0.84 0.86 1.0 0.66
KNA55087 (VCV51_031846)
0.63 0.53 0.4 0.43 0.28 0.28 0.31 0.26 0.59 0.64 0.52 0.87 0.8 0.61 0.51 0.56 0.79 0.46 0.49 0.52 0.53 0.77 1.0
KNA55116 (VCV51_033120)
0.35 0.06 0.61 0.37 0.17 0.17 0.15 0.18 0.84 0.16 0.04 0.55 0.29 0.07 0.09 0.2 0.28 0.21 0.2 1.0 0.76 0.93 0.57
KNA55123 (RecG)
0.35 0.25 0.18 0.18 0.22 0.23 0.22 0.2 0.37 0.34 0.31 0.57 0.33 0.24 0.32 0.3 0.36 0.87 1.0 0.36 0.38 0.55 0.61
KNA55272 (VCV51_033085)
0.59 0.05 0.44 0.32 0.07 0.08 0.08 0.05 0.72 0.18 0.05 0.29 0.29 0.04 0.06 0.27 0.26 0.06 0.05 0.84 0.63 1.0 0.19
KNA55367 (VCV51_033044)
0.39 0.45 0.19 0.22 0.49 0.46 0.53 0.39 0.84 0.58 0.46 0.57 0.45 0.46 0.52 0.58 0.44 0.46 0.57 0.66 0.8 1.0 0.37
KNA55690 (VCV51_033026)
0.66 0.04 0.19 0.99 0.03 0.03 0.03 0.02 1.0 0.09 0.04 0.03 0.1 0.04 0.02 0.05 0.04 0.16 0.13 0.87 0.81 0.84 0.03
KNA56415 (VCV51_030686)
0.51 0.2 0.16 0.31 0.18 0.22 0.2 0.17 0.6 0.76 0.31 0.7 0.6 0.21 0.17 0.38 0.32 0.93 1.0 0.56 0.93 0.9 0.58
KNA57460 (VCV51_030450)
0.44 0.57 0.24 0.33 0.36 0.35 0.36 0.27 0.91 0.32 0.39 0.32 0.32 0.65 0.13 0.79 1.0 0.75 0.81 0.79 0.89 0.97 0.62
KNA58530 (VCV51_031168)
0.25 0.02 0.08 0.1 0.03 0.05 0.05 0.03 0.57 0.13 0.06 0.19 1.0 0.01 0.01 0.13 0.11 0.04 0.05 0.55 0.31 0.54 0.06
KNA59361 (VCV51_031325)
0.52 0.35 0.23 0.36 0.17 0.16 0.18 0.15 0.81 0.22 0.39 0.55 0.22 0.33 0.04 0.73 0.62 0.91 1.0 0.72 0.88 0.9 0.8
KNA59384 (VCV51_031306)
0.49 0.21 0.37 0.31 0.36 0.35 0.33 0.27 0.88 0.19 0.24 0.35 0.25 0.2 0.12 0.58 0.42 0.53 0.58 0.8 0.79 1.0 0.58
KNA59640 (VCV51_032537)
0.2 0.32 0.17 0.16 0.16 0.16 0.17 0.13 1.0 0.29 0.1 0.51 0.56 0.34 0.11 0.48 0.36 0.22 0.22 0.89 0.71 0.81 0.44
KNA59643 (VCV51_032540)
0.22 0.61 0.14 0.19 0.53 0.52 0.57 0.52 0.35 0.34 0.69 0.76 0.34 0.65 1.0 0.57 0.48 0.54 0.63 0.31 0.28 0.34 0.64
KNA59746 (VCV51_032441)
0.42 0.53 0.13 0.27 0.6 0.7 0.79 0.56 0.92 0.69 0.27 0.55 0.52 0.6 0.71 0.18 0.24 0.92 1.0 0.74 0.88 0.93 0.59
KNA59756 (VCV51_032451)
0.57 0.05 0.22 0.65 0.1 0.15 0.15 0.09 0.81 1.0 0.1 0.71 0.88 0.05 0.04 0.25 0.53 0.35 0.36 0.68 0.63 0.72 0.44
KNA59758 (VCV51_032453)
0.69 0.06 0.88 0.49 0.13 0.1 0.13 0.1 1.0 0.27 0.19 0.27 0.74 0.07 0.03 0.18 0.34 0.23 0.22 0.86 0.85 0.74 0.13
KNA59791 (VCV51_032486)
0.47 0.3 0.15 0.36 0.37 0.41 0.4 0.38 0.95 0.46 0.28 0.35 0.37 0.28 0.17 0.25 0.34 0.5 0.45 0.89 1.0 1.0 0.68
KNA59875 (VCV51_032286)
0.55 0.32 0.18 0.37 0.27 0.35 0.3 0.24 0.68 0.43 0.32 0.45 0.37 0.3 0.28 0.51 0.62 0.83 1.0 0.65 0.59 0.74 0.25
KNA59892 (VCV51_032303)
0.28 0.21 0.12 0.17 0.19 0.21 0.22 0.19 0.33 0.5 0.15 0.57 0.38 0.23 0.26 0.18 0.28 0.82 1.0 0.29 0.29 0.35 0.25
KNA59900 (VCV51_032311)
0.65 0.15 0.25 0.48 0.39 0.35 0.33 0.35 1.0 0.32 0.1 0.23 0.23 0.19 0.34 0.31 0.5 0.83 0.8 0.94 0.91 0.9 0.78
KNA59950 (VCV51_032362)
0.37 0.35 0.16 0.36 0.37 0.38 0.36 0.33 1.0 0.32 0.18 0.23 0.49 0.34 0.15 0.54 0.79 0.25 0.25 0.89 0.81 0.88 0.25
KNA59957 (VCV51_032369)
0.71 0.08 0.46 0.58 1.0 0.83 0.82 0.89 0.53 0.61 0.21 0.57 0.8 0.07 0.33 0.37 0.6 0.56 0.6 0.47 0.55 0.47 0.68
KNA60011 (VCV51_032423)
0.26 0.07 1.0 0.29 0.07 0.07 0.07 0.06 0.39 0.21 0.02 0.09 0.49 0.06 0.02 0.28 0.62 0.79 0.69 0.49 0.76 0.33 0.09
KNA60545 (VCV51_032216)
0.48 0.1 0.21 0.26 0.24 0.28 0.27 0.22 0.18 0.4 0.06 0.38 0.39 0.1 0.34 0.42 0.53 0.93 1.0 0.3 0.23 0.28 0.64
KNA60685 (VCV51_032124)
0.32 0.16 0.2 0.14 0.18 0.15 0.14 0.13 0.25 0.92 0.35 0.7 0.25 0.17 0.05 0.26 0.33 0.4 0.41 1.0 0.7 0.55 0.37
KNA60699 (VCV51_032138)
0.58 0.16 0.21 0.42 0.17 0.17 0.19 0.15 0.67 0.49 0.23 1.0 0.5 0.15 0.08 0.44 0.68 0.5 0.48 0.61 0.57 0.72 0.65
KNA60703 (VCV51_032142)
0.91 0.3 0.22 0.59 0.53 0.51 0.52 0.43 1.0 0.45 0.27 0.46 0.43 0.31 0.24 0.55 0.71 0.49 0.58 0.91 0.98 0.95 0.77
KNA60704 (SoxR)
0.55 0.42 0.13 0.2 0.38 0.35 0.4 0.34 0.37 0.35 0.35 0.32 0.48 0.4 0.31 0.19 0.34 0.89 1.0 0.44 0.4 0.45 0.7
KNA60734 (VCV51_032174)
0.21 0.06 0.36 0.15 0.67 0.59 0.57 0.63 0.08 0.59 0.15 0.4 0.51 0.06 0.19 0.11 0.18 0.92 1.0 0.09 0.12 0.1 0.54
KNA60811 (VCV51_032074)
1.0 0.01 0.17 0.94 0.04 0.04 0.04 0.04 0.99 0.66 0.04 0.2 0.39 0.01 0.05 0.41 0.63 0.17 0.17 0.72 0.54 0.84 0.07
KNA60931 (VCV51_031905)
0.42 0.32 0.11 0.26 0.25 0.28 0.26 0.21 0.52 0.41 0.28 0.39 0.31 0.26 0.08 0.25 0.36 0.91 1.0 0.52 0.45 0.58 0.34
KNA60932 (VCV51_031906)
0.73 0.04 0.24 0.62 0.42 0.43 0.41 0.24 0.79 0.85 0.13 0.2 0.63 0.12 0.21 0.71 1.0 0.71 0.77 0.83 0.85 0.89 0.57
KNA60933 (VCV51_031907)
0.45 0.06 0.28 0.35 0.08 0.08 0.08 0.07 0.4 0.15 0.07 0.26 0.13 0.06 0.09 0.23 0.38 1.0 0.98 0.49 0.59 0.47 0.4
KNA60934 (VCV51_031908)
0.35 0.12 0.06 0.27 0.19 0.15 0.2 0.13 0.59 0.39 0.12 0.25 0.21 0.12 0.2 0.15 0.28 0.98 1.0 0.56 0.53 0.65 0.36
KNA60935 (VCV51_031909)
0.75 0.23 0.34 0.38 0.62 0.54 0.55 0.55 0.61 0.99 0.25 0.83 0.66 0.21 0.44 0.36 0.79 0.84 1.0 0.67 0.79 0.74 0.66
KNA61034 (VCV51_032009)
0.3 0.09 0.09 0.39 0.09 0.12 0.12 0.09 0.42 0.19 0.08 0.52 0.18 0.09 0.08 0.11 0.22 1.0 0.71 0.34 0.26 0.36 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)