1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,60min+PMN
FA1090,L-log,from bact
GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept
from N. gon mtr mut mosiac transformant
WT,from L-log cell cultures
from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept
FA1090/H041,0min+PMN
from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept
FA1090cpxR::erm,L-log,from bact
FA1090 GCM77,strain+mut,untreated
GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept
from urethra,test for azithromycin resist
FA1090/H041,60min
WT parent,FA19 WT,from p-log cells
WT,FA19,from p-L-log cells
overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells
FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2
FA1090cpxA::kan,L-log,from bact
from p-cells
AKP14174 (nrdB)
 0.56 0.31 0.1 0.67 0.29 0.44 0.73 0.28 0.65 0.15 1.0 0.66 0.23 0.4 0.43 0.44 0.44 0.92 0.06 0.67
AKP14182 (rsuA)
 0.52 0.33 0.26 0.68 0.46 0.17 0.71 0.39 0.71 0.13 1.0 0.56 0.5 0.28 0.16 0.15 0.21 0.91 0.12 0.21
AKP14184 (cmk)
 0.51 0.42 0.23 0.71 0.35 0.53 0.62 0.44 0.71 0.1 1.0 0.63 0.94 0.35 0.45 0.55 0.48 0.85 0.15 0.18
AKP14211 (WX61_00122)
 0.39 0.12 0.06 0.5 0.22 0.42 0.5 0.1 0.5 0.14 1.0 0.38 0.76 0.15 0.35 0.42 0.41 0.81 0.04 0.13
AKP14212 (hcpC)
 0.51 0.22 0.05 0.82 0.45 0.55 0.64 0.19 0.66 0.04 1.0 0.59 0.83 0.27 0.59 0.5 0.62 0.92 0.03 0.13
AKP14216 (uvrB)
 0.55 0.33 0.04 0.5 0.27 0.33 0.57 0.35 0.58 0.06 1.0 0.44 0.38 0.21 0.23 0.3 0.38 0.83 0.02 0.19
AKP14233 (WX61_00144)
 0.18 0.09 0.09 0.7 0.13 0.08 0.65 0.06 0.65 0.07 0.59 0.64 1.0 0.12 0.04 0.07 0.11 0.7 0.04 0.2
AKP14243 (ttcA)
 0.58 0.5 0.15 0.54 0.29 0.35 0.53 0.51 0.46 0.18 1.0 0.42 0.6 0.35 0.36 0.37 0.33 0.97 0.11 0.27
AKP14245 (WX61_00156)
 0.19 0.29 0.27 0.68 0.23 0.06 0.37 0.29 0.34 0.06 1.0 0.39 0.53 0.21 0.36 0.05 0.06 0.8 0.12 0.09
AKP14257 (sotB_2)
 0.4 0.32 0.26 0.72 0.34 0.3 0.48 0.35 0.45 0.09 0.57 0.53 1.0 0.35 0.68 0.26 0.36 0.78 0.17 0.15
AKP14261 (lcfB)
 0.54 0.43 0.12 1.0 0.63 0.56 0.79 0.42 0.77 0.11 0.78 0.87 0.73 0.34 0.33 0.53 0.61 0.71 0.1 0.26
AKP14280 (WX61_00191)
 0.57 0.47 0.18 0.66 0.54 0.68 0.43 0.34 0.35 0.07 0.81 0.35 0.94 0.64 0.52 0.57 0.85 1.0 0.13 0.27
AKP14339 (WX61_00251)
 0.93 0.4 0.16 0.66 0.45 0.58 0.54 0.37 0.47 0.09 0.94 0.51 0.96 0.55 0.65 0.47 0.73 1.0 0.11 0.34
AKP14348 (eptA)
 1.0 0.56 0.19 0.84 0.73 0.69 0.84 0.66 0.75 0.18 0.59 0.84 0.39 0.47 0.52 0.7 0.67 0.57 0.12 0.26
AKP14366 (WX61_00278)
 0.75 0.04 0.01 0.17 0.03 0.06 0.71 0.09 1.0 0.01 0.03 0.19 0.65 0.04 0.0 0.08 0.03 0.04 0.01 0.28
AKP14375 (yhbU)
 0.82 0.62 0.37 0.77 0.43 0.41 0.73 0.69 0.68 0.23 1.0 0.68 0.57 0.4 0.21 0.39 0.46 0.74 0.23 0.31
AKP14407 (WX61_00324)
 0.83 0.35 0.18 0.68 0.47 0.17 0.66 0.39 0.71 0.11 0.23 0.83 1.0 0.23 0.29 0.16 0.17 0.22 0.13 0.2
AKP14447 (relA)
 0.53 0.24 0.07 0.69 0.34 0.19 0.61 0.22 0.51 0.04 0.7 0.51 1.0 0.36 0.27 0.16 0.24 0.95 0.05 0.48
AKP14483 (WX61_00401)
 0.75 0.44 0.15 0.98 0.61 0.25 0.98 0.55 1.0 0.17 0.6 0.93 0.91 0.24 0.18 0.22 0.3 0.55 0.09 0.24
AKP14510 (WX61_00428)
 0.45 0.33 0.11 0.82 0.37 0.14 0.88 0.37 0.73 0.03 0.35 0.73 1.0 0.22 0.14 0.14 0.14 0.36 0.08 0.12
AKP14512 (dsbC)
 0.9 0.66 0.52 0.91 0.54 0.41 0.97 0.64 1.0 0.26 0.82 0.84 0.73 0.61 0.55 0.44 0.36 0.96 0.29 0.48
AKP14513 (macB)
 0.81 0.29 0.04 0.5 0.43 0.33 0.96 0.38 1.0 0.03 0.45 0.62 0.19 0.17 0.18 0.34 0.33 0.48 0.02 0.04
AKP14514 (macA)
 0.81 0.35 0.17 0.64 0.43 0.64 0.88 0.36 1.0 0.07 0.35 0.65 0.25 0.27 0.3 0.67 0.6 0.56 0.09 0.08
AKP14528 (WX61_00446)
 0.35 0.14 0.03 0.73 0.11 0.46 0.72 0.09 0.64 0.02 0.94 0.49 0.67 0.21 0.36 0.34 0.64 1.0 0.02 0.22
AKP14624 (putA)
 0.21 0.27 0.06 0.66 0.15 0.25 0.51 0.17 0.55 0.04 0.53 0.63 1.0 0.2 0.19 0.18 0.35 0.66 0.07 0.5
AKP14627 (yiaD)
 0.43 0.34 0.22 0.9 0.33 0.5 0.95 0.41 1.0 0.01 0.42 0.62 0.57 0.34 0.26 0.42 0.62 0.91 0.04 0.05
AKP14678 (tal)
 0.23 0.19 0.06 0.81 0.13 0.28 0.76 0.14 0.59 0.09 0.87 0.66 0.47 0.2 0.2 0.25 0.32 1.0 0.04 0.51
AKP14732 (trkA)
 0.66 0.32 0.12 1.0 0.51 0.38 0.77 0.31 0.73 0.07 0.58 0.87 0.97 0.22 0.35 0.4 0.34 0.53 0.08 0.18
AKP14765 (gloB)
 0.24 0.21 0.16 0.69 0.18 0.12 0.67 0.15 0.75 0.09 0.83 0.57 1.0 0.12 0.08 0.1 0.14 0.73 0.09 0.16
AKP14772 (argJ)
 0.43 0.19 0.04 0.94 0.27 0.38 0.75 0.14 0.65 0.03 0.99 0.82 0.87 0.28 0.29 0.29 0.51 1.0 0.03 0.41
AKP14773 (clcA_2)
 0.48 0.3 0.04 0.8 0.32 0.33 0.69 0.28 0.7 0.05 0.54 1.0 0.81 0.26 0.44 0.31 0.35 0.54 0.03 0.17
AKP14778 (WX61_00705)
 0.66 0.42 0.1 0.74 0.4 0.31 0.78 0.47 0.85 0.09 1.0 0.79 0.74 0.28 0.44 0.31 0.3 0.83 0.07 0.23
AKP14818 (ubiI)
 0.48 0.17 0.07 0.56 0.26 0.34 0.62 0.18 0.53 0.07 1.0 0.43 0.56 0.28 0.48 0.33 0.36 0.97 0.05 0.38
AKP14845 (dmlR_2)
 0.28 0.21 0.11 0.66 0.16 0.28 0.64 0.18 0.6 0.08 0.89 0.48 0.57 0.33 0.26 0.21 0.38 1.0 0.07 0.33
AKP14847 (dinG)
 0.54 0.5 0.1 0.88 0.44 0.5 0.79 0.4 0.7 0.11 0.92 0.7 0.73 0.51 0.7 0.46 0.55 1.0 0.07 0.26
AKP14852 (rnb)
 0.78 0.69 0.2 0.77 0.52 0.59 0.73 0.76 0.71 0.28 1.0 0.82 0.88 0.46 0.42 0.62 0.55 0.88 0.19 0.34
AKP14859 (WX61_00792)
 0.61 0.58 0.13 0.65 0.38 0.43 0.66 0.65 0.54 0.07 0.97 0.68 0.62 0.45 0.36 0.45 0.4 1.0 0.1 0.17
AKP14861 (recQ)
 0.65 0.47 0.08 0.89 0.42 0.43 0.85 0.47 0.66 0.1 0.63 0.77 1.0 0.27 0.48 0.41 0.46 0.6 0.06 0.25
AKP14946 (ppc)
 0.25 0.3 0.09 0.72 0.21 0.39 0.56 0.26 0.48 0.1 0.49 0.54 1.0 0.29 0.3 0.32 0.49 0.51 0.11 0.39
AKP14977 (gmhA)
 0.42 0.2 0.04 0.76 0.32 0.25 0.64 0.18 0.54 0.03 0.78 0.46 1.0 0.22 0.29 0.22 0.31 0.98 0.03 0.12
AKP15031 (tsaA)
 0.59 0.21 0.1 0.89 0.45 0.27 0.8 0.29 0.81 0.06 0.24 0.66 1.0 0.16 0.15 0.24 0.32 0.3 0.1 0.18
AKP15040 (ftsE)
 0.49 0.23 0.06 0.69 0.37 0.23 0.52 0.21 0.44 0.06 0.79 0.47 0.83 0.29 0.16 0.19 0.29 1.0 0.05 0.18
AKP15064 (rffG)
 0.49 0.45 0.07 1.0 0.38 0.43 0.85 0.45 0.66 0.06 0.5 0.74 0.93 0.36 0.41 0.39 0.51 0.58 0.07 0.52
AKP15067 (haeIIIM_1)
 0.53 0.14 0.3 0.9 0.24 0.22 1.0 0.15 0.88 0.37 0.83 0.89 0.12 0.24 0.19 0.23 0.2 0.73 0.25 0.65
AKP15096 (WX61_01038)
 0.29 0.37 0.16 0.56 0.17 0.37 0.44 0.33 0.46 0.13 1.0 0.33 0.87 0.37 0.24 0.35 0.4 0.92 0.13 0.42
AKP15097 (topA)
 0.31 0.43 0.06 0.63 0.18 0.36 0.55 0.39 0.48 0.09 0.8 0.43 1.0 0.35 0.19 0.32 0.4 0.72 0.05 0.43
AKP15121 (tufA_2)
 0.25 0.3 0.02 0.46 0.24 0.0 0.34 0.24 0.32 0.12 1.0 0.42 0.41 0.17 0.0 0.0 0.0 0.7 0.04 0.81
AKP15155 (WX61_01101)
 0.52 0.32 0.12 0.22 0.32 0.22 1.0 0.34 0.97 0.09 0.07 0.18 0.69 0.21 0.1 0.21 0.23 0.06 0.1 0.22
AKP15163 (skp)
 0.48 0.51 0.06 0.56 0.46 0.39 0.62 0.5 0.48 0.18 0.81 0.49 0.23 0.41 0.25 0.34 0.47 1.0 0.04 0.14
AKP15164 (bamA)
 0.67 0.42 0.07 0.96 0.49 0.52 0.97 0.36 0.8 0.16 0.96 0.82 0.75 0.44 0.42 0.44 0.65 1.0 0.06 0.46
AKP15165 (rseP)
 0.74 0.6 0.09 0.9 0.62 0.49 0.97 0.62 0.82 0.1 0.98 0.9 1.0 0.37 0.38 0.49 0.49 0.93 0.08 0.25
AKP15229 (yccA)
 0.94 0.33 0.06 0.8 0.32 0.35 0.97 0.41 1.0 0.04 0.61 0.82 0.32 0.47 0.4 0.31 0.41 0.91 0.04 0.15
AKP15230 (coaD)
 0.72 0.35 0.08 0.93 0.5 0.26 1.0 0.46 0.62 0.14 0.78 0.79 0.46 0.33 0.1 0.27 0.23 0.7 0.09 0.41
AKP15232 (WX61_01183)
 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.02 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AKP15244 (lysA)
 0.48 0.44 0.28 0.96 0.47 0.28 0.83 0.33 0.81 0.2 1.0 1.0 0.97 0.37 0.21 0.3 0.26 0.74 0.21 0.23
AKP15258 (aldA)
 0.3 0.26 0.08 0.68 0.24 0.22 0.65 0.21 0.68 0.05 0.45 0.57 0.83 0.26 0.33 0.2 0.25 1.0 0.08 0.14
AKP15310 (WX61_01261)
 1.0 0.53 0.07 0.67 0.62 0.63 0.7 0.62 0.61 0.04 0.67 0.69 0.46 0.33 0.38 0.57 0.72 0.76 0.05 0.41
AKP15314 (plsX)
 0.43 0.32 0.16 0.6 0.37 0.2 0.64 0.29 0.54 0.07 0.96 0.5 1.0 0.21 0.18 0.17 0.25 0.73 0.13 0.1
AKP15315 (WX61_01266)
 0.35 0.38 0.12 0.5 0.24 0.15 0.46 0.28 0.42 0.15 1.0 0.4 0.41 0.39 0.14 0.14 0.16 0.82 0.14 0.11
AKP15399 (pglF)
 0.64 0.38 0.05 0.8 0.47 0.39 0.81 0.36 0.61 0.16 1.0 0.69 0.78 0.39 0.44 0.37 0.43 0.99 0.04 0.26
AKP15402 (WX61_01355)
 0.39 0.41 0.02 0.84 0.4 0.26 0.74 0.34 0.76 0.06 1.0 0.8 0.23 0.27 0.23 0.24 0.29 0.84 0.02 0.0
AKP15430 (rng)
 0.34 0.3 0.05 0.58 0.22 0.25 0.49 0.31 0.45 0.04 1.0 0.42 0.86 0.38 0.17 0.21 0.32 0.9 0.04 0.17
AKP15451 (nagZ)
 0.65 0.65 0.04 0.68 0.33 0.44 0.81 0.8 0.64 0.13 1.0 0.63 0.52 0.42 0.42 0.46 0.4 0.73 0.03 0.37
AKP15454 (nth)
 0.65 0.42 0.33 0.79 0.28 0.51 0.69 0.55 0.77 0.24 0.94 0.74 1.0 0.47 0.53 0.46 0.59 0.95 0.25 0.14
AKP15462 (WX61_01416)
 0.72 0.34 0.05 0.91 0.53 0.25 0.74 0.42 0.69 0.03 0.93 0.78 1.0 0.24 0.42 0.27 0.23 0.95 0.04 0.26
AKP15489 (ompR)
 0.48 0.35 0.11 0.6 0.32 0.22 0.58 0.34 0.63 0.04 0.98 0.45 0.56 0.3 0.08 0.19 0.25 1.0 0.06 0.17
AKP15490 (WX61_01444)
 0.65 0.34 0.08 0.86 0.51 0.24 1.0 0.27 0.88 0.16 0.83 0.83 0.85 0.27 0.19 0.23 0.26 0.79 0.47 0.2
AKP15491 (WX61_01445)
 0.43 0.12 0.09 0.93 0.29 0.23 0.83 0.11 0.91 0.1 0.49 1.0 0.53 0.12 0.15 0.22 0.25 0.34 0.45 0.15
AKP15506 (WX61_01460)
 1.0 0.05 0.0 0.19 0.31 0.0 0.9 0.18 0.83 0.0 0.0 0.32 0.57 0.06 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04
AKP15509 (WX61_01463)
 0.78 0.4 0.18 0.78 0.56 0.35 0.86 0.52 0.93 0.1 0.19 1.0 1.0 0.31 0.37 0.35 0.37 0.2 0.16 0.21
AKP15520 (hisB)
 0.34 0.32 0.1 0.75 0.15 0.16 0.77 0.27 0.72 0.11 0.99 0.53 0.99 0.28 0.12 0.14 0.18 1.0 0.07 0.22
AKP15521 (hisC2)
 0.5 0.3 0.04 0.92 0.21 0.13 0.87 0.28 0.76 0.02 0.56 0.7 1.0 0.21 0.14 0.11 0.17 0.65 0.02 0.37
AKP15537 (purN)
 0.69 0.37 0.14 0.58 0.41 0.68 0.82 0.51 0.88 0.05 0.21 0.5 1.0 0.26 0.38 0.72 0.62 0.23 0.1 0.06
AKP15553 (WX61_01513)
 0.55 0.28 0.07 0.62 0.0 0.0 0.64 0.3 0.75 0.26 1.0 0.78 0.23 0.25 0.0 0.0 0.0 0.59 0.05 0.37
AKP15586 (pta)
 0.17 0.19 0.02 0.58 0.1 0.23 0.52 0.12 0.47 0.02 0.76 0.41 0.39 0.2 0.18 0.18 0.29 1.0 0.02 0.36
AKP15606 (ridA)
 0.57 0.41 0.08 0.66 0.43 0.43 0.73 0.35 0.64 0.11 0.78 0.63 1.0 0.36 0.18 0.43 0.44 0.79 0.06 0.1
AKP15646 (WX61_01608)
 0.46 0.32 0.08 0.45 0.32 0.27 0.44 0.55 0.45 0.07 1.0 0.44 0.22 0.2 0.36 0.32 0.2 0.82 0.07 0.55
AKP15653 (rluD)
 0.97 0.4 0.12 0.72 0.5 0.48 0.94 0.54 1.0 0.07 0.25 0.86 0.75 0.24 0.32 0.48 0.47 0.22 0.08 0.11
AKP15708 (rmlD)
 0.48 0.3 0.17 0.72 0.32 0.16 0.58 0.23 0.49 0.14 0.91 0.4 1.0 0.48 0.22 0.15 0.18 0.96 0.13 0.23
AKP15711 (WX61_01676)
 0.8 0.53 0.34 1.0 0.48 0.39 0.86 0.53 0.89 0.16 0.71 0.98 0.95 0.37 0.33 0.42 0.33 0.65 0.29 0.17
AKP15746 (yfeX)
 0.58 0.35 0.08 0.75 0.31 0.25 0.64 0.35 0.64 0.05 0.87 0.6 0.94 0.31 0.34 0.24 0.27 1.0 0.05 0.09
AKP15765 (rluF)
 1.0 0.7 0.03 0.74 0.55 0.4 0.78 0.62 0.7 0.22 0.69 0.62 0.58 0.71 0.41 0.41 0.38 0.71 0.01 0.46
AKP15774 (htpX)
 0.51 0.12 0.04 0.32 0.44 0.13 1.0 0.15 1.0 0.01 0.22 0.27 0.38 0.11 0.12 0.13 0.13 0.43 0.01 0.02
AKP15816 (rplY)
 0.58 0.59 0.25 0.62 0.59 0.47 0.6 0.47 0.52 0.49 1.0 0.5 0.53 0.46 0.17 0.52 0.4 0.73 0.29 0.63
AKP15923 (WX61_01893)
 0.48 0.2 0.15 0.75 0.57 0.05 0.96 0.09 0.96 0.2 0.72 0.49 1.0 0.14 0.05 0.04 0.07 0.48 0.1 0.25
AKP16003 (WX61_01976)
 0.64 0.45 0.17 0.57 0.4 0.2 0.63 0.42 0.48 0.15 1.0 0.56 0.41 0.42 0.17 0.2 0.2 0.99 0.18 0.12
AKP16014 (piiC_13)
 0.74 0.0 0.01 0.49 0.0 0.0 0.45 0.0 0.48 0.01 0.99 0.28 0.42 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03
AKP16058 (lutA)
 0.2 0.19 0.03 0.58 0.14 0.31 0.4 0.17 0.35 0.06 1.0 0.48 0.4 0.22 0.15 0.27 0.36 0.75 0.03 0.44
AKP16060 (clsA)
 0.54 0.35 0.12 0.77 0.32 0.24 0.81 0.33 0.8 0.1 0.8 0.64 1.0 0.24 0.21 0.23 0.26 0.73 0.07 0.11
AKP16082 (WX61_02056)
 0.64 0.41 0.11 0.56 0.37 0.26 0.52 0.43 0.67 0.12 1.0 0.51 0.55 0.26 0.11 0.25 0.27 0.97 0.06 0.11
AKP16092 (glyA2)
 0.3 0.21 0.15 0.7 0.27 0.2 0.64 0.19 1.0 0.07 0.43 0.58 0.71 0.34 0.15 0.17 0.24 0.84 0.08 0.3
AKP16104 (crcB)
 0.85 0.31 0.12 0.52 0.22 0.47 0.56 0.34 0.54 0.07 0.9 0.48 0.61 0.51 0.45 0.39 0.6 1.0 0.09 0.13
AKP16121 (yciK)
 0.36 0.33 0.19 0.67 0.24 0.29 0.49 0.26 0.47 0.22 0.94 0.43 1.0 0.44 0.23 0.27 0.32 0.86 0.14 0.18
AKP16137 (mpl)
 0.29 0.35 0.08 0.69 0.32 0.38 0.6 0.29 0.65 0.04 0.5 0.6 1.0 0.35 0.34 0.31 0.47 0.64 0.07 0.28
AKP16150 (guaB)
 0.76 0.4 0.49 0.6 0.55 0.25 0.6 0.34 0.46 0.19 0.93 0.51 0.75 0.4 0.3 0.22 0.3 1.0 0.28 0.27
AKP16159 (hflK)
 0.32 0.19 0.14 0.49 0.23 0.24 0.47 0.16 0.44 0.18 0.62 0.44 0.55 0.43 0.21 0.19 0.31 1.0 0.14 0.42
AKP16171 (WX61_02147)
 0.58 0.18 0.0 0.08 0.29 0.43 1.0 0.31 0.93 0.0 0.1 0.4 0.16 0.12 0.54 0.46 0.39 0.09 0.0 0.11
AKP16185 (WX61_02161)
 0.48 0.34 0.05 1.0 0.44 0.18 0.93 0.47 0.98 0.01 0.65 0.87 0.28 0.21 0.21 0.17 0.2 0.76 0.01 0.09
AKP16248 (hsdR_2)
 0.96 0.55 0.18 0.92 0.47 0.35 0.88 0.67 0.88 0.32 1.0 0.75 0.71 0.51 0.45 0.35 0.34 1.0 0.09 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)