1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL16947 (BN171_1020014)
 0.02 0.18 0.04 0.33 0.05 0.02 1.0 0.03 0.1 0.49 0.45 0.66 0.09 0.03 0.51 0.05 0.7 0.06 0.24 0.03 0.28 0.08 0.06 0.14 0.39 0.04 0.42 0.03 0.22
CCL16948 (BN171_1020015)
 0.0 0.04 0.01 0.06 0.01 0.04 1.0 0.0 0.08 0.72 0.61 0.78 0.15 0.01 0.11 0.08 0.99 0.01 0.26 0.0 0.09 0.06 0.09 0.18 0.51 0.0 0.74 0.05 0.22
CCL16950 (BN171_1020017)
 0.01 0.19 0.02 0.34 0.03 0.02 1.0 0.02 0.05 0.41 0.48 0.58 0.07 0.02 0.47 0.03 0.46 0.04 0.16 0.02 0.26 0.07 0.04 0.11 0.26 0.02 0.73 0.02 0.25
CCL16951 (BN171_1020018)
 0.02 0.3 0.03 0.46 0.04 0.02 0.96 0.03 0.06 0.5 0.46 0.64 0.09 0.02 0.68 0.05 0.62 0.06 0.19 0.02 0.3 0.06 0.05 0.14 0.32 0.02 1.0 0.04 0.21
CCL17339 (BN171_1440023)
 0.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
CCL17340 (BN171_1450001)
 0.11 0.11 0.09 0.18 0.12 0.08 0.1 0.09 0.06 0.09 0.08 0.09 0.21 0.07 0.11 0.36 1.0 0.08 0.12 0.08 0.1 0.07 0.12 0.09 0.15 0.08 0.06 0.22 0.03
CCL17392 (BN171_1480004)
 0.03 0.01 0.06 0.08 0.03 0.06 0.26 0.01 0.01 0.09 0.02 0.11 0.01 0.05 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.02 0.07 0.0 0.05 0.01 0.06 0.02 0.03 0.04 0.0
CCL17393 (BN171_1480005)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL17528 (BN171_1540007)
 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.39 0.0 0.0 0.2 0.23 0.08 0.31 0.03 0.14 0.0 0.31 0.08 0.34 0.0 0.02 0.0 0.57 0.0 0.04 0.0 0.03 1.0 0.0
CCL17529 (BN171_1540008)
 0.06 0.07 0.08 0.07 0.07 0.04 0.38 0.02 0.01 0.14 0.58 0.2 0.65 0.27 0.41 0.19 0.24 0.23 0.56 0.04 0.02 0.05 1.0 0.03 0.04 0.01 0.09 0.72 0.21
CCL17590 (BN171_160006)
 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.39
CCL17619 (BN171_1640009)
 0.15 0.1 0.17 0.2 0.13 0.18 0.16 0.06 0.94 0.16 0.16 0.13 0.31 0.16 0.14 0.21 1.0 0.12 0.27 0.19 0.21 0.06 0.36 0.35 0.29 0.09 0.08 0.22 0.14
CCL17705 (fdxA)
 0.28 0.35 0.18 0.17 0.12 0.55 0.0 0.26 0.08 0.0 0.0 0.0 0.5 0.12 0.22 0.0 0.07 0.2 0.22 0.2 0.32 0.02 0.13 0.12 0.24 0.19 0.07 1.0 0.0
CCL17726 (BN171_1740001)
 0.31 1.0 0.32 0.54 0.33 0.04 0.09 0.57 0.17 0.05 0.08 0.09 0.11 0.07 0.68 0.04 0.55 0.36 0.16 0.22 0.2 0.02 0.26 0.61 0.13 0.16 0.24 0.11 0.12
CCL17945 (BN171_1970014)
 0.39 0.15 0.48 0.36 0.3 0.05 0.15 0.05 0.07 0.09 0.11 0.13 0.12 0.06 0.14 0.03 1.0 0.22 0.26 0.11 0.15 0.0 0.42 0.26 0.02 0.05 0.17 0.49 0.11
CCL17971 (BN171_1980009)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.3 0.08 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.16 0.14 0.02
CCL18067 (BN171_210003)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
CCL18142 (BN171_2120002)
 0.06 0.54 0.04 0.39 0.04 0.03 0.53 0.04 0.13 0.54 0.52 0.41 0.29 0.1 1.0 0.09 0.78 0.17 0.18 0.08 0.96 0.07 0.03 0.2 0.12 0.03 0.63 0.63 0.51
CCL18184 (BN171_2140026)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.78 0.0 0.83 0.0 0.0
CCL18348 (BN171_2220035)
 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.09 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02
CCL18350 (BN171_2220037)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.27 0.0 0.06 0.01 0.0
CCL18378 (BN171_2270001)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
CCL18384 (BN171_2270007)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.18 0.0 0.0
CCL18385 (BN171_2270008)
 0.01 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.74 0.01 0.67 0.35 0.44 0.44 0.15 0.01 0.01 0.03 1.0 0.01 0.2 0.03 0.02 0.0 0.34 0.43 0.06 0.0 0.09 0.35 0.57
CCL18496 (BN171_240001)
 0.06 0.05 0.06 0.05 0.03 0.05 0.3 0.02 0.16 0.14 0.08 0.13 0.12 0.05 0.05 0.1 1.0 0.06 0.43 0.06 0.04 0.07 0.28 0.07 0.07 0.02 0.15 0.18 0.09
CCL18497 (BN171_240002)
 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.11 0.2 0.0 0.27 0.21 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.4 0.96 0.07 1.0 0.0 0.15 0.0 0.6 0.19 0.23 0.0 0.18 0.51 0.0
CCL18498 (BN171_240003)
 0.1 0.06 0.07 0.08 0.09 0.11 0.11 0.07 0.26 0.06 0.07 0.08 0.13 0.07 0.09 0.15 1.0 0.1 0.69 0.06 0.08 0.24 0.37 0.15 0.16 0.06 0.13 0.2 0.04
CCL18499 (BN171_240004)
 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.05 0.08 0.0 0.05 0.05 0.02 0.01 0.08 0.01 0.01 0.05 1.0 0.01 0.85 0.04 0.06 0.05 0.52 0.15 0.18 0.03 0.15 0.26 0.03
CCL18650 (BN171_2480025)
 0.01 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.05 0.0 0.8 0.04 0.06 0.04 0.2 0.04 0.01 0.1 0.72 0.01 0.06 0.05 0.09 0.0 0.07 0.12 0.13 0.0 1.0 0.49 0.04
CCL18744 (4hbD)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.22 0.96 0.01 0.03 1.0 0.84 0.6 0.1 0.0 0.01 0.01 0.4 0.0 0.24 0.01 0.01 0.02 0.3 0.01 0.26 0.05 0.05 0.02 0.39
CCL18745 (cat)
 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.25 1.0 0.01 0.03 0.96 0.84 0.57 0.11 0.0 0.01 0.0 0.37 0.0 0.27 0.01 0.01 0.03 0.31 0.01 0.24 0.05 0.04 0.01 0.36
CCL18746 (BN171_2600005)
 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.73 1.0 0.03 0.04 0.79 0.72 0.49 0.14 0.0 0.01 0.01 0.78 0.01 0.42 0.03 0.02 0.03 0.3 0.01 0.3 0.13 0.06 0.01 0.37
CCL18747 (abfD)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.21 1.0 0.01 0.04 0.84 0.75 0.55 0.13 0.0 0.01 0.0 0.35 0.0 0.24 0.01 0.01 0.02 0.2 0.01 0.21 0.04 0.04 0.01 0.39
CCL18748 (sucD)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 1.0 0.01 0.06 0.91 0.84 0.59 0.08 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.3 0.01 0.0 0.01 0.25 0.01 0.19 0.06 0.05 0.01 0.45
CCL18749 (cat)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.27 0.9 0.02 0.06 1.0 0.9 0.6 0.08 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.36 0.01 0.01 0.01 0.37 0.01 0.22 0.07 0.05 0.02 0.45
CCL18750 (BN171_2600009)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.26 0.91 0.01 0.06 1.0 0.87 0.57 0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.35 0.01 0.01 0.0 0.46 0.01 0.19 0.07 0.03 0.02 0.45
CCL18823 (BN171_2670005)
 0.02 0.11 0.02 0.1 0.02 0.04 0.11 0.02 0.11 0.07 0.09 0.08 0.12 0.01 0.14 0.09 1.0 0.01 0.12 0.02 0.25 0.1 0.11 0.06 0.03 0.02 0.17 0.14 0.1
CCL18824 (BN171_2670006)
 0.11 0.42 0.15 0.56 0.09 0.04 0.16 0.15 0.16 0.1 0.04 0.18 0.2 0.07 0.5 0.27 1.0 0.15 0.28 0.09 0.76 0.0 0.35 0.19 0.05 0.07 0.15 0.41 0.34
CCL18825 (BN171_2670007)
 0.09 0.07 0.05 0.33 0.04 0.02 0.12 0.06 0.16 0.07 0.11 0.11 0.19 0.02 0.26 0.32 1.0 0.05 0.18 0.09 0.34 0.0 0.21 0.15 0.02 0.03 0.11 0.52 0.12
CCL18826 (BN171_2670008)
 0.01 0.01 0.04 0.07 0.03 0.04 0.19 0.0 0.14 0.13 0.26 0.19 0.3 0.03 0.06 0.21 1.0 0.02 0.26 0.01 0.3 0.0 0.29 0.1 0.04 0.01 0.11 0.35 0.29
CCL18827 (BN171_2670009)
 0.01 0.23 0.01 0.22 0.01 0.01 0.16 0.01 0.11 0.04 0.06 0.07 0.1 0.01 0.35 0.14 1.0 0.02 0.14 0.01 0.47 0.05 0.02 0.03 0.01 0.01 0.2 0.17 0.1
CCL18828 (BN171_2670010)
 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.0 0.14 0.11 0.09 0.02 0.06 0.0 0.1 0.08 1.0 0.01 0.08 0.0 0.12 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.13 0.12 0.12
CCL18927 (BN171_2720027)
 0.01 0.0 0.04 0.03 0.04 0.04 0.19 0.0 0.22 0.56 0.74 0.46 0.38 0.04 0.0 0.23 0.22 0.01 0.54 0.03 0.03 0.08 0.97 0.19 0.22 0.01 0.01 1.0 0.92
CCL18928 (LinCd)
 0.08 0.02 0.08 0.11 0.1 0.03 0.17 0.04 0.23 0.53 0.67 0.4 0.46 0.07 0.04 0.32 0.36 0.11 0.63 0.07 0.06 0.5 1.0 0.4 0.47 0.06 0.05 0.45 0.68
CCL19205 (BN171_2950007)
 0.03 0.3 0.06 0.44 0.07 0.07 0.88 0.03 0.01 0.42 0.58 0.87 0.17 0.1 0.75 0.03 1.0 0.16 0.12 0.06 0.35 0.04 0.05 0.11 0.21 0.07 0.67 0.03 0.17
CCL19206 (BN171_2950008)
 0.02 0.11 0.04 0.2 0.07 0.07 0.72 0.01 0.0 0.54 0.54 0.79 0.2 0.06 0.37 0.03 1.0 0.11 0.15 0.03 0.18 0.06 0.05 0.11 0.24 0.05 0.6 0.04 0.16
CCL19407 (BN171_3100013)
 0.01 0.0 0.04 0.04 0.07 0.37 0.22 0.0 0.07 0.41 0.3 0.29 0.25 0.04 0.01 0.37 0.18 0.04 0.73 0.09 0.21 0.05 1.0 0.48 0.53 0.04 0.04 0.87 0.28
CCL19460 (BN171_3150023)
 0.29 0.08 0.24 0.11 0.13 0.29 0.51 0.11 0.09 0.59 0.56 0.52 0.33 0.25 0.09 0.45 0.12 0.21 1.0 0.26 0.08 0.19 0.59 0.12 0.45 0.16 0.04 1.0 0.7
CCL19461 (BN171_3150024)
 0.4 0.13 0.37 0.16 0.26 0.44 0.22 0.27 0.11 0.41 0.29 0.28 0.29 0.46 0.11 0.48 0.13 0.33 0.72 0.35 0.07 0.1 0.4 0.08 0.34 0.21 0.02 1.0 0.21
CCL19533 (BN171_3220002)
 0.01 0.02 0.13 0.33 0.18 0.03 0.6 0.01 0.02 0.05 0.05 0.17 0.21 0.01 0.03 0.18 0.03 0.03 0.26 0.07 0.08 0.22 0.09 0.94 0.05 0.05 0.02 1.0 0.07
CCL19534 (BN171_3220003)
 0.03 0.04 0.04 0.05 0.19 0.06 1.0 0.08 0.0 0.07 0.08 0.27 0.11 0.05 0.06 0.03 0.0 0.15 0.4 0.61 0.07 0.0 0.03 0.94 0.05 0.38 0.01 0.87 0.09
CCL19584 (BN171_3270022)
 0.03 0.01 0.04 0.02 0.03 0.11 0.06 0.04 0.05 0.21 0.12 0.1 0.23 0.07 0.02 0.25 0.22 0.05 0.43 0.01 0.02 0.02 0.43 0.22 0.15 0.0 0.11 1.0 0.03
CCL19621 (BN171_3310001)
 0.32 0.16 0.18 0.1 0.13 0.36 0.16 0.17 0.25 0.18 0.24 0.2 0.5 0.32 0.13 0.41 0.72 0.26 0.91 0.18 0.19 0.03 0.68 0.42 0.49 0.07 0.31 1.0 0.4
CCL19622 (BN171_3310002)
 0.35 0.06 0.27 0.26 0.14 0.11 0.1 0.07 0.11 0.32 0.14 0.25 0.29 0.4 0.08 0.13 0.65 0.17 1.0 0.13 0.24 0.19 0.77 0.37 0.37 0.08 0.41 0.88 0.42
CCL19737 (rgaR)
 0.07 0.06 0.12 0.11 0.14 0.18 0.27 0.07 0.64 0.41 0.42 0.42 0.39 0.11 0.07 0.66 0.48 0.09 0.72 0.23 0.23 0.11 0.88 0.65 0.49 0.11 0.27 1.0 0.37
CCL19746 (pstC)
 0.21 0.04 0.27 0.1 0.07 0.02 0.19 0.04 0.12 0.16 0.04 0.08 0.46 0.9 0.06 0.13 0.06 0.05 0.53 1.0 0.09 0.11 0.61 0.13 0.03 0.03 0.24 0.99 0.1
CCL19803 (BN171_3490006)
 0.63 0.25 0.4 0.36 0.44 0.33 0.28 0.19 0.4 0.45 0.5 0.42 0.7 0.46 0.27 0.92 0.54 0.37 0.74 0.61 0.4 0.02 1.0 0.66 0.96 0.3 0.48 0.69 0.44
CCL20035 (BN171_3670018)
 0.12 0.03 0.09 0.06 0.05 0.08 0.12 0.03 0.67 0.1 0.17 0.18 0.22 0.1 0.02 0.11 1.0 0.05 0.52 0.11 0.06 0.03 0.49 0.22 0.14 0.04 0.12 0.61 0.24
CCL20038 (BN171_3670021)
 0.06 0.02 0.06 0.03 0.04 0.19 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.46 0.09 0.01 0.0 0.17 0.09 0.29 0.07 0.02 0.0 0.36 0.26 0.65 0.03 0.01 1.0 0.0
CCL20212 (BN171_380007)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.31 0.18 0.12 0.08 0.41 0.01 0.0 0.47 0.31 0.0 0.37 0.0 0.0 0.02 0.27 0.17 0.12 0.0 0.16 1.0 0.18
CCL20280 (BN171_40008)
 0.17 0.08 0.25 0.22 0.42 0.09 0.2 0.27 0.11 0.25 0.25 0.23 0.35 0.6 0.11 0.86 0.17 0.32 0.57 0.82 0.62 0.0 0.54 0.03 0.08 0.18 0.01 1.0 0.23
CCL20414 (BN171_440002)
 0.87 0.62 0.87 0.5 0.65 0.36 0.54 0.77 0.26 0.4 0.47 0.62 0.46 0.37 0.36 0.69 0.31 0.59 0.67 0.46 0.23 0.13 0.75 0.43 0.46 0.33 0.07 1.0 0.5
CCL20432 (BN171_450008)
 0.51 0.22 0.36 0.2 0.26 0.13 0.7 0.17 0.68 0.67 0.8 0.53 0.54 0.27 0.16 0.46 1.0 0.24 1.0 0.55 0.4 0.16 0.73 0.62 0.37 0.21 0.84 0.51 0.74
CCL20437 (BN171_460001)
 0.02 0.16 0.05 0.54 0.05 0.03 0.63 0.03 0.04 0.34 0.18 0.18 0.45 0.02 0.05 0.8 1.0 0.03 0.32 0.03 0.16 0.06 0.53 0.05 0.03 0.01 0.42 0.25 0.05
CCL20474 (BN171_530001)
 0.26 0.17 0.21 0.22 0.26 0.2 0.05 0.26 0.3 0.07 0.13 0.26 0.46 0.47 0.16 0.05 1.0 0.22 0.84 0.05 0.12 0.0 0.78 0.25 0.2 0.05 0.28 0.69 0.2
CCL20490 (BN171_570003)
 0.03 1.0 0.02 0.26 0.02 0.0 0.05 0.02 0.12 0.05 0.01 0.01 0.02 0.01 0.14 0.02 0.42 0.01 0.05 0.01 0.08 0.0 0.02 0.08 0.01 0.01 0.25 0.0 0.0
CCL20491 (BN171_570004)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.5 0.0 0.17 0.39 0.09 0.13 0.18 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.01 0.0 0.23 0.02 0.03
CCL20492 (BN171_580001)
 0.08 0.31 0.09 0.29 0.11 0.05 0.54 0.07 0.22 1.0 0.38 0.47 0.32 0.04 0.1 0.46 0.93 0.04 0.18 0.01 0.05 0.38 0.06 0.02 0.03 0.01 0.24 0.05 0.2
CCL20493 (BN171_580002)
 0.06 0.3 0.07 0.22 0.09 0.05 0.5 0.07 0.13 1.0 0.39 0.49 0.3 0.02 0.09 0.38 0.53 0.04 0.2 0.02 0.05 0.36 0.1 0.04 0.05 0.02 0.25 0.06 0.21
CCL20612 (BN171_730002)
 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.1 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.4 0.01 0.01 0.0 0.35 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.21 0.27 0.18 0.0 0.12 1.0 0.0
CCL20613 (BN171_740001)
 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02 0.2 0.1 0.03 0.15 0.14 0.08 0.16 0.14 0.03 0.02 0.06 0.41 0.02 0.47 0.18 0.22 0.01 0.48 0.31 0.2 0.14 0.24 1.0 0.06
CCL20646 (BN171_810002)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.45 0.0
CCL20648 (tcdC)
 0.04 0.04 0.03 0.08 0.04 0.15 1.0 0.04 0.05 0.6 0.18 0.34 0.14 0.04 0.05 0.07 0.06 0.08 0.39 0.26 0.26 0.18 0.39 0.39 0.27 0.2 0.25 0.57 0.13
CCL20718 (BN171_960010)
 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0 0.75 0.02 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)