1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
BHI
Basal Medium
CD196,BHI
CD196,Basal Medium
CD196,Log,BHI
ClnR mutant
LB-CD16
Log,BHI
LuxS KO
ND-CD12
ND-CD13
ND-CD17
R20291
R20291,BHI
R20291,Basal Medium
R20291,Heme+
R20291,Log
R20291,Log,BHI
Strain 630
Strain 630,BHI
Strain 630,Basal Medium
Strain 630,Faecal water+
Strain 630,HPUra+
Strain 630,Lag
Strain 630,Log
Strain 630,Log,BHI
Strain 630,Sporulating
TW11
UK1
CCL17061 (BN171_1170003)
 0.09 0.02 0.06 0.03 0.06 0.17 0.01 0.07 0.08 0.0 0.01 0.01 0.12 0.05 0.03 0.01 0.05 0.07 0.07 0.16 0.02 0.0 0.12 0.56 0.3 0.05 1.0 0.02 0.0
CCL17067 (BN171_1190001)
 0.05 0.04 0.17 0.25 0.09 0.01 0.72 0.01 0.01 1.0 0.6 0.35 0.89 0.04 0.05 0.06 0.01 0.02 0.02 0.02 0.05 0.09 0.02 0.0 0.01 0.02 0.55 0.05 0.1
CCL17238 (BN171_1400010)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.03 0.06 0.04 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.06
CCL17240 (BN171_1410002)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01
CCL17241 (BN171_1410003)
 0.02 0.02 0.04 0.03 0.03 0.02 1.0 0.02 0.03 0.14 0.11 0.11 0.55 0.02 0.02 0.06 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.22 0.05 0.01 0.01 0.01 0.69 0.12 0.04
CCL17242 (BN171_1410004)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.2 0.12 0.09 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04
CCL17283 (BN171_1430010)
 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.14 0.43 0.01 0.01 0.33 0.28 0.26 0.68 0.05 0.01 0.25 0.04 0.01 0.08 0.03 0.02 0.09 0.14 0.23 0.16 0.01 1.0 0.12 0.12
CCL17382 (sigK)
 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.13 0.01 0.04 0.08 0.1 0.07 0.15 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.05 0.04 0.05 0.04 0.01 1.0 0.01 0.06
CCL17394 (sigE)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 0.0 0.0 0.26 0.19 0.14 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11
CCL17618 (BN171_1640008)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.15 0.13 0.09 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.05
CCL17665 (BN171_1660006)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
CCL17718 (feoB)
 0.03 0.03 0.03 0.06 0.03 0.01 0.12 0.01 0.11 0.26 0.17 0.15 0.37 0.02 0.03 0.04 0.05 0.03 0.12 0.03 0.04 0.14 0.27 0.16 0.06 0.01 1.0 0.12 0.08
CCL17719 (feoA)
 0.02 0.04 0.02 0.07 0.03 0.02 0.03 0.01 0.23 0.06 0.03 0.03 0.43 0.02 0.07 0.04 0.03 0.03 0.07 0.08 0.06 0.23 0.12 0.14 0.06 0.03 1.0 0.07 0.05
CCL17783 (BN171_1800006)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.25 0.01 0.0 0.09 0.06 0.09 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02
CCL17818 (BN171_1810025)
 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.46 0.0 0.01 0.3 0.17 0.21 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.84 0.0 0.07
CCL17956 (BN171_1970025)
 0.04 0.06 0.04 0.1 0.04 0.01 0.33 0.01 0.05 0.21 0.12 0.12 0.11 0.03 0.05 0.11 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.21 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.06 0.11
CCL17957 (grdF)
 0.07 0.14 0.09 0.24 0.11 0.02 0.64 0.04 0.09 0.46 0.27 0.27 0.17 0.08 0.14 0.17 0.07 0.06 0.04 0.02 0.03 0.37 0.02 0.02 0.01 0.01 1.0 0.09 0.15
CCL17958 (BN171_1970027)
 0.1 0.27 0.14 0.41 0.11 0.01 0.0 0.06 0.19 0.19 0.05 0.05 0.1 0.14 0.18 0.14 0.09 0.1 0.04 0.04 0.07 0.47 0.02 0.03 0.02 0.02 1.0 0.12 0.03
CCL17993 (BN171_200014)
 0.2 0.08 0.27 0.39 0.24 0.14 1.0 0.08 0.13 0.69 0.56 0.54 0.9 0.15 0.07 0.46 0.11 0.14 0.5 0.22 0.12 0.46 0.34 0.21 0.35 0.12 0.73 0.17 0.31
CCL17994 (BN171_200015)
 0.02 0.01 0.03 0.04 0.02 0.1 0.93 0.0 0.05 0.77 0.57 0.61 1.0 0.02 0.0 0.39 0.09 0.01 0.48 0.03 0.02 0.2 0.36 0.13 0.17 0.01 0.41 0.37 0.31
CCL18140 (ytlA)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.04 0.14 0.1 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.01 0.01 0.11 0.14 0.09 0.02 0.01 1.0 0.01 0.03
CCL18146 (BN171_2130003)
 0.03 0.04 0.07 0.11 0.06 0.15 0.67 0.02 0.66 0.67 0.67 0.69 0.76 0.02 0.04 0.12 0.44 0.02 0.62 0.1 0.27 0.04 1.0 0.5 0.15 0.03 0.5 0.13 0.71
CCL18147 (BN171_2130004)
 0.17 0.54 0.19 0.42 0.18 0.15 1.0 0.17 0.69 0.98 1.0 0.96 0.78 0.04 0.24 0.14 0.41 0.12 0.66 0.21 0.57 0.19 0.95 0.6 0.14 0.11 0.62 0.11 0.74
CCL18153 (BN171_2130010)
 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.55 0.0 0.02 0.92 0.65 0.62 0.75 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.0 1.0 0.06 0.24
CCL18179 (tauB)
 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.63 0.0 0.0 1.0 0.58 0.53 0.5 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.75 0.03 0.27
CCL18286 (BN171_220038)
 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.62 0.03 0.02 0.03 0.13 0.01 0.06 0.01 0.21 0.01 0.18 0.01 0.04 0.02 0.02 0.1 0.01 0.01 1.0 0.14 0.02
CCL18301 (BN171_2210001)
 0.0 0.0 0.0 1.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
CCL18394 (BN171_2280010)
 0.02 0.01 0.05 0.08 0.02 0.02 0.59 0.01 0.01 1.0 0.69 0.44 0.85 0.02 0.01 0.1 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.04 0.01 0.03 0.01 0.37 0.1 0.21
CCL18527 (BN171_2410009)
 0.06 0.04 0.1 0.34 0.18 0.02 0.39 0.04 0.02 0.2 0.12 0.11 0.5 0.09 0.06 0.06 0.03 0.07 0.05 0.06 0.08 0.14 0.07 0.03 0.05 0.05 1.0 0.12 0.08
CCL18528 (BN171_2410010)
 0.1 0.05 0.23 0.65 0.32 0.06 0.51 0.03 0.02 0.29 0.18 0.2 1.0 0.17 0.08 0.17 0.07 0.13 0.06 0.1 0.19 0.2 0.06 0.04 0.13 0.1 0.39 0.2 0.09
CCL18529 (BN171_2410011)
 0.0 0.0 0.03 0.08 0.03 0.02 0.24 0.0 0.0 0.19 0.12 0.11 1.0 0.02 0.0 0.09 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.04 0.02 0.07 0.0 0.15 0.14 0.09
CCL18530 (BN171_2410012)
 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.16 0.0 0.0 0.24 0.19 0.16 1.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.22 0.05 0.12
CCL18573 (BN171_2440014)
 0.06 0.03 0.1 0.14 0.08 0.02 0.56 0.04 0.04 0.52 0.39 0.43 1.0 0.05 0.03 0.05 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.71 0.03 0.15
CCL18752 (BN171_2600011)
 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.05 0.7 0.01 0.64 0.9 0.75 0.59 1.0 0.02 0.01 0.16 0.19 0.01 0.23 0.02 0.02 0.05 0.38 0.21 0.29 0.01 0.28 0.23 0.32
CCL18809 (BN171_2650006)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.02
CCL18810 (cotJB)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.08 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.06
CCL18811 (cotJC)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.04 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03
CCL18819 (BN171_2670001)
 0.01 0.03 0.03 0.09 0.03 0.02 0.28 0.0 0.01 0.1 0.23 0.11 0.76 0.01 0.04 0.02 0.01 0.0 0.05 0.01 0.23 0.1 0.02 0.01 0.01 0.0 1.0 0.07 0.13
CCL18956 (BN171_2770007)
 0.02 0.06 0.02 0.14 0.02 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.01 0.12 0.0 0.09 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
CCL19308 (BN171_3020020)
 0.04 0.02 0.07 0.07 0.02 0.22 0.65 0.0 1.0 0.45 0.38 0.45 0.81 0.05 0.04 0.21 0.08 0.03 0.13 0.08 0.2 0.04 0.23 0.46 0.26 0.03 0.72 0.32 0.25
CCL19313 (BN171_3020025)
 0.02 0.03 0.02 0.06 0.02 0.01 0.37 0.01 0.26 0.26 0.04 0.1 0.06 0.01 0.02 0.04 0.08 0.02 0.06 0.01 0.03 0.26 0.03 0.07 0.02 0.01 1.0 0.0 0.01
CCL19314 (BN171_3020026)
 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.77 0.01 0.26 0.62 0.1 0.14 0.06 0.01 0.01 0.05 0.06 0.02 0.06 0.01 0.02 0.2 0.03 0.08 0.02 0.01 1.0 0.0 0.01
CCL19401 (spoVFB)
 0.04 0.02 0.08 0.2 0.09 0.01 0.09 0.03 0.06 0.13 0.12 0.08 0.14 0.04 0.02 0.05 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.06 0.08 0.05 0.06 0.02 1.0 0.05 0.08
CCL19402 (dpaA)
 0.0 0.01 0.02 0.09 0.04 0.01 0.06 0.0 0.0 0.11 0.09 0.07 0.13 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.05
CCL19440 (BN171_3150003)
 0.13 0.12 0.1 0.16 0.11 0.07 0.46 0.12 0.2 0.34 0.21 0.26 0.4 0.07 0.09 0.26 0.09 0.12 0.17 0.09 0.11 0.19 0.25 0.2 0.11 0.06 1.0 0.26 0.21
CCL19467 (BN171_3170001)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.33 0.0 0.0 0.31 0.19 0.21 0.51 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 0.01 0.0 1.0 0.0 0.08
CCL19483 (BN171_3180007)
 0.09 0.27 0.13 0.76 0.21 0.03 1.0 0.06 0.13 0.84 0.32 0.65 0.54 0.06 0.32 0.23 0.11 0.11 0.35 0.03 0.08 0.13 0.13 0.07 0.1 0.01 0.27 0.14 0.12
CCL19484 (BN171_3180008)
 0.1 0.3 0.2 0.84 0.3 0.06 0.9 0.08 0.24 0.95 0.43 1.0 0.39 0.12 0.39 0.07 0.18 0.13 0.3 0.06 0.07 0.0 0.14 0.05 0.06 0.04 0.22 0.33 0.12
CCL19814 (BN171_3510002)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.51 0.0 0.0 0.31 0.25 0.14 0.21 0.01 0.01 0.05 0.0 0.01 0.26 0.01 0.02 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.14
CCL19991 (BN171_3610034)
 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 1.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.05 0.29 0.01 0.0 0.07 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.44 0.02 0.0 0.0 0.0 0.58 0.09 0.01
CCL20036 (BN171_3670019)
 0.31 0.4 0.27 0.25 0.27 0.2 0.67 0.27 0.19 0.71 0.6 0.61 0.8 0.28 0.26 0.59 0.16 0.29 0.37 0.37 0.25 1.0 0.24 0.24 0.24 0.24 0.48 0.17 0.47
CCL20048 (BN171_3670031)
 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.32 0.0 0.01 0.34 0.16 0.11 0.32 0.01 0.0 0.04 0.02 0.01 0.11 0.01 0.02 0.03 0.09 0.02 0.03 0.01 1.0 0.06 0.08
CCL20088 (BN171_3690032)
 0.1 0.06 0.09 0.08 0.1 0.03 1.0 0.11 0.02 0.4 0.3 0.3 0.54 0.06 0.04 0.06 0.03 0.08 0.09 0.13 0.06 0.03 0.06 0.03 0.06 0.13 0.28 0.04 0.15
CCL20438 (sleC)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.04 0.03 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01
CCL20500 (BN171_580009)
 0.01 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.51 0.0 0.0 0.19 0.18 0.24 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.08
CCL20501 (cotJB)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.44 0.33 0.47 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.01 0.13
CCL20502 (cotJC)
 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.28 0.18 0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.08
CCL20503 (BN171_590001)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0
CCL20751 (BN171_990001)
 0.12 0.09 0.25 0.31 0.36 0.28 0.77 0.21 0.1 0.61 0.5 0.5 1.0 0.18 0.12 0.38 0.12 0.24 0.26 0.25 0.17 0.12 0.48 0.24 0.28 0.3 0.08 0.23 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)