Heatmap: Cluster_15 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
AES-1R,ASMDM+
AG1,ciproflaxin
D+7bld
DK2
E01
LB
LB,log
LB,untreated
PA1201
PA14
PA14,0.25xMIC G3KL
PA14,0.25xMIC T7
PA14,0.25xMIC polymyxin-B
PA14,LB
PA14,LB,log
PA14,WT
PA14,ciproflaxin
PA14,cmrA+
PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,late stat,untreated
PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,untreated
PA212
PA2596
PA558
PA580
PAK,LB
PAK,WT
PAK,WT,LB
PAK,pilR
PAK,pmrB6,LB
PAO1
PAO1,0.56mg/mL farnesol
PAO1,ABTGC
PAO1,DDS
PAO1,GUN,LB,glucose
PAO1,HapZ,early stat
PAO1,LB
PAO1,LB,glucose
PAO1,LB,untreated
PAO1,M9-CA,early stat
PAO1,M9-CA,log
PAO1,RsmN+
PAO1,SagS,early stat
PAO1,WT
PAO1,WT,BHI
PAO1,WT,LB
PAO1,WT,MOPS acetate
PAO1,WT,MOPS glycerol
PAO1,early stat
PAO1,ersA,BHI
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log
PAO1,liquid culture
PAO1,mexZ,LB
PAO1,oxylipin-
PAO1,pBAD-yhjH
PAO1,pUCP18::msr(E)
PAO1,qslA,M9-CA,early stat
PAO1,qslA,M9-CA,log
PAO1,qteE,M9-CA,early stat
PAO1,qteE,M9-CA,log
PAO1,untreated
PAO1,wspFpelApslBCD,LB
PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated
Y31,LB
Y71,LB
Y82,LB
Y89,LB
ciproflaxin
liquid culture
m pheno
mexT
nirS
pHerdB20T-gp68
untreated
CRN70164 (gmr_2)
0.89 -0.12 -0.02 0.59 1.4 0.56 -1.17 -0.24 0.06 -0.16 0.51 0.47 0.3 0.57 -1.05 0.5 -0.6 -1.61 0.77 0.1 0.79 0.13 -0.09 -0.21 0.18 0.12 -1.33 0.16 -1.52 0.1 -1.15 0.09 0.23 0.46 -2.1 0.28 0.41 -0.47 -0.69 -0.94 -0.16 -2.39 0.79 0.44 0.65 0.3 -1.27 -0.43 0.18 0.46 -0.0 -0.65 -2.16 -0.59 -1.18 0.3 -0.52 0.5 0.08 -2.28 0.01 -2.26 -0.08 -0.75 -0.22 0.93 0.98 0.43 0.31 -0.71 -0.47 0.22 -1.6 -0.77 0.75 -1.49
CRN84097 (brnQ_1)
0.16 0.71 0.17 0.23 1.85 0.13 0.6 -0.79 -1.79 0.26 -0.98 -0.91 -0.79 -0.24 -0.41 2.18 -0.99 -1.07 0.74 1.17 0.42 -0.85 -1.53 - -0.1 0.36 -0.18 -0.81 -1.59 -1.03 0.08 -0.3 -1.6 -1.04 -0.96 0.7 -1.09 -1.07 -0.1 -0.03 -2.43 0.76 -0.93 -1.54 -0.72 -1.09 0.44 -0.26 0.15 -1.21 -0.95 -2.21 0.84 -0.24 0.33 -1.69 -0.08 -1.79 -2.86 0.83 -2.69 0.96 -1.72 -2.68 -2.22 1.46 1.8 1.27 0.97 0.71 -0.64 -0.42 -1.1 -1.81 1.04 -0.38
CRN86258 (pnuC)
0.91 -0.19 0.59 -0.28 2.07 0.32 -0.6 -1.38 -1.29 0.25 0.06 0.08 -0.06 -0.55 -0.81 0.39 0.83 -0.3 0.45 1.95 1.0 -0.18 -0.05 - 1.06 1.5 -0.11 -0.96 -1.23 -0.52 0.16 -0.08 0.75 -0.09 -0.21 -0.98 -2.03 -0.63 -1.04 -1.52 0.27 -0.31 -0.68 -2.36 -1.03 -0.49 -0.65 0.01 0.28 -2.07 0.32 0.31 -0.08 -0.02 0.15 -2.06 0.36 -1.58 -0.25 -0.28 -0.23 -0.27 -1.4 -1.63 -1.82 0.87 0.69 0.16 0.29 0.14 -1.54 -0.53 -0.24 -0.76 0.78 -1.43
CRN89717 (rssA_1)
1.41 -1.09 -1.27 -0.31 2.01 0.74 0.6 -1.46 -2.11 0.12 0.17 0.41 0.32 -0.23 0.59 0.44 0.26 0.15 0.15 0.53 0.24 -0.01 -1.25 -0.69 0.82 1.0 0.21 -0.82 -0.81 -1.22 0.27 -0.3 -0.19 -0.24 -0.98 0.05 -3.8 -0.56 -0.43 -0.24 -1.44 -0.63 -1.93 -3.8 -0.89 0.31 -0.29 -0.54 -0.28 -3.78 0.97 -1.14 -0.64 0.14 -0.24 -2.58 0.92 -2.98 -1.7 -0.91 -1.77 -0.54 -2.15 -3.9 -3.48 1.44 1.62 1.75 1.14 0.11 -0.82 -0.89 0.08 -0.82 1.37 -1.11
1.05 -0.32 -0.46 0.08 1.44 0.67 0.07 -0.94 -1.62 0.35 0.33 0.4 0.32 -0.35 0.35 0.89 -0.32 0.96 -0.23 0.68 -0.04 0.06 -1.45 -0.86 0.77 1.09 0.37 -0.62 -0.19 -1.4 0.67 -0.34 0.3 0.07 -1.06 -0.62 -1.88 -0.64 0.05 -0.36 -0.61 -0.11 -0.6 -2.22 -0.92 -0.16 -1.05 -0.6 -0.03 -1.83 -0.01 -0.4 -0.2 0.29 -0.73 -3.17 0.93 -1.97 -0.77 -0.39 -0.9 -0.21 -1.69 -2.46 -2.13 1.19 1.11 0.92 0.79 -0.18 -0.06 -0.43 0.89 -0.72 1.23 -0.96
1.69 -0.61 -1.63 1.96 1.94 0.62 0.99 -1.11 -1.65 -0.52 -0.25 -0.07 -0.27 -0.99 0.67 -1.09 -3.45 0.35 0.59 -0.8 -0.21 -0.41 -1.36 -0.9 0.51 0.83 -0.06 -0.5 -0.56 -1.17 0.15 0.2 -1.13 0.09 -0.24 0.56 -1.58 -0.94 0.78 0.75 0.71 0.78 -0.33 -1.89 -1.66 -0.68 -0.57 -1.96 -0.76 -1.59 -0.12 0.8 0.82 -0.31 -0.58 -2.61 -0.96 -1.64 -1.04 0.49 -0.55 0.13 -1.55 -1.89 -1.72 -0.41 0.83 0.57 0.06 -0.59 -0.7 0.4 0.53 -2.19 1.49 -0.42
CRN95938 (dnaE2)
0.03 0.08 0.99 -0.2 2.11 0.07 -0.5 0.38 -0.65 0.25 0.23 0.28 0.28 0.32 -0.86 -0.07 1.04 -1.14 -0.14 0.75 0.28 0.04 -0.9 -0.56 0.44 0.25 -0.32 0.79 -0.72 0.02 -0.16 -0.05 -0.31 -0.56 -2.06 - -0.56 -1.1 - - -1.0 -1.77 -0.92 -0.75 0.36 - -0.78 -1.21 -0.57 -0.63 - -1.08 -1.58 -1.03 -0.69 -2.39 -0.01 -0.76 -0.95 -1.7 -1.28 -1.73 -0.98 0.87 -1.33 0.67 3.07 1.03 1.21 0.07 -1.16 -0.4 -1.13 0.31 1.73 -1.29
0.45 -0.81 -0.77 1.04 2.92 0.66 -1.45 -2.41 -0.89 -0.5 -0.73 -0.68 -0.45 -0.49 -2.03 -0.19 -1.61 -1.78 -0.41 0.42 0.18 -0.93 -0.65 -2.06 0.29 0.3 -0.75 -1.51 -3.68 -0.39 -0.58 0.51 1.15 -0.55 -1.19 0.96 2.07 -1.42 -0.23 -0.86 -1.12 -2.68 0.22 1.99 0.09 0.26 -0.52 -0.22 0.86 2.1 0.47 -1.98 -3.33 -1.0 -0.67 - -0.14 -0.97 -1.23 -3.62 -1.44 -3.32 -0.44 -1.28 -0.15 -0.84 0.53 -0.25 -0.04 -0.92 -2.21 -0.78 -2.21 0.61 1.88 -1.97
CRN98979 (oprD_2)
0.17 -0.03 -1.25 2.24 3.04 -0.38 -1.16 -2.15 0.41 -0.73 -1.47 -1.46 -1.45 0.1 -2.09 -1.08 -2.26 -3.44 -0.34 -1.17 1.71 -1.43 0.88 -0.74 0.51 -0.3 -1.99 -0.44 -2.68 0.36 -1.84 0.04 0.44 -0.61 -2.63 -0.11 1.85 -1.54 -1.38 -1.78 0.35 -3.67 1.88 1.72 -0.35 -0.72 -1.38 -0.99 0.35 1.67 -1.01 -0.45 -3.35 -2.46 -1.43 -2.33 -1.33 -0.49 0.92 -3.04 0.82 -2.94 -0.17 -1.16 0.25 -1.59 0.28 -1.13 -1.5 -1.83 -1.29 -0.23 -3.12 -0.81 1.84 -2.78
0.8 -0.5 0.27 -0.6 2.27 0.62 0.37 0.45 -0.98 0.29 -0.06 -0.08 0.08 0.7 0.28 0.28 -0.33 -1.24 -0.76 -0.23 -0.6 -0.31 -1.08 -0.74 0.85 0.12 -0.31 -0.0 -0.87 -0.12 0.09 -0.16 0.35 -0.56 -1.01 0.96 -0.88 -0.63 0.57 0.48 -0.69 -1.01 -0.22 -1.02 -0.65 0.52 -0.58 -1.47 -0.17 -0.79 0.37 -0.87 -0.72 -0.24 -1.07 -1.69 -0.45 -1.31 -0.62 -1.2 -0.7 -0.82 -1.44 -1.79 -2.02 0.36 1.4 0.64 1.51 -0.59 0.21 0.4 -1.21 0.45 1.36 -0.17
CRO00830 (mdtP_1)
-0.18 -0.78 -0.64 -0.61 2.71 2.12 0.66 -1.06 -1.35 0.51 -1.15 -1.09 -1.1 -0.0 1.09 -0.45 0.35 -0.01 -1.08 1.21 -0.66 -1.13 -1.54 -2.36 1.25 1.24 -1.36 -0.54 -0.55 -1.44 -0.98 -0.31 -1.21 -0.88 -1.23 0.96 -1.72 -1.77 1.01 1.12 -2.0 -0.75 -1.19 -2.18 -1.67 -0.35 -1.22 -1.63 -1.11 -1.84 -0.52 -2.26 -0.54 0.21 -0.67 -3.73 -0.46 -2.79 -2.34 -1.01 -2.7 -0.96 -1.79 -3.22 -3.09 -0.14 2.12 0.55 0.73 1.33 -0.38 1.38 0.03 -1.57 1.93 -0.98
CRO00867 (aaeB_2)
-0.56 -1.22 -0.39 -0.83 2.54 1.45 0.22 -1.62 -0.43 0.53 -0.72 -0.59 -0.6 0.13 0.5 -0.58 0.43 -0.32 -1.1 0.27 -0.81 -0.85 -1.22 -2.1 1.66 1.3 -1.15 -0.71 -0.85 -1.31 -0.85 -0.01 -1.35 -1.19 -1.18 1.01 -1.73 -1.5 0.98 0.84 -1.84 0.39 -1.14 -2.03 -1.02 0.29 -0.66 -2.06 -1.3 -1.86 0.01 -1.72 0.18 0.23 -0.55 -3.94 -0.2 -2.57 -1.89 -0.32 -2.01 -0.27 -1.43 -2.57 -2.83 0.21 1.75 0.56 0.85 1.41 -0.47 1.35 -0.27 -0.64 2.13 -1.43
CRO00926 (aaeA_1)
-0.4 -1.22 0.48 -1.35 2.2 2.21 0.37 -1.74 -0.58 0.72 -0.06 0.29 0.33 0.0 0.79 0.28 0.42 0.08 -1.64 -0.73 -1.03 0.17 -1.06 -0.68 1.15 0.68 -0.79 -1.51 -0.24 -1.54 -0.52 -0.3 -1.81 -0.83 -1.17 0.35 -0.74 -1.09 1.03 1.38 -3.13 -0.79 -1.04 -1.1 -0.79 0.09 0.3 -2.39 -1.72 -0.82 0.23 -3.78 -0.71 -0.16 0.52 -1.51 -0.28 -1.63 -2.68 -1.1 -3.01 -1.12 -1.1 -2.81 -2.04 1.16 1.18 0.81 1.21 0.59 -0.21 0.94 0.17 -0.86 1.22 -0.79
1.05 -1.3 -1.02 -1.58 1.23 0.22 0.01 -1.6 -1.41 0.36 0.12 0.15 -0.17 0.35 0.08 -0.34 -1.23 0.63 -0.16 0.77 0.23 -0.31 -1.34 -1.57 1.17 0.84 0.18 -0.81 -1.24 -0.84 0.39 -0.16 -0.44 -1.07 -0.78 0.19 -2.84 -0.17 -0.47 -0.63 0.46 1.13 -1.22 -2.93 -0.75 -0.3 -0.15 -1.18 -0.7 -3.21 -0.1 0.51 1.32 -0.1 -0.16 -4.44 0.39 -2.37 0.73 1.09 0.98 1.27 -1.77 -3.63 -2.65 0.67 1.47 0.72 0.71 0.33 -1.0 -0.84 0.41 -1.97 0.91 -1.05
CRO09070 (rnfC)
0.79 -0.28 -0.42 -0.14 1.24 0.84 -0.22 -0.35 -0.89 0.47 0.18 0.34 0.28 -0.1 0.37 0.91 0.64 0.89 0.39 0.46 0.64 0.09 -1.17 -2.07 0.98 1.0 0.16 -1.04 0.34 -0.86 0.38 -0.36 0.71 -0.08 -1.16 -0.7 -2.48 -0.98 -0.2 -0.71 -1.04 -0.28 -0.18 -2.55 -1.14 -1.1 -0.9 -0.2 -0.27 -2.4 -0.84 -0.91 -0.49 0.32 -1.04 -1.41 0.98 -2.35 -1.16 -0.47 -1.41 -0.27 -1.6 -3.41 -2.68 0.88 1.13 0.74 0.79 0.61 0.1 0.11 0.76 -1.41 1.71 -1.09
CRO09104 (rnfD)
1.03 -0.91 -0.35 -0.53 1.41 -0.43 -0.6 -0.97 -1.03 0.35 0.22 0.34 0.24 -0.89 -0.56 0.49 0.43 0.63 0.53 0.18 0.87 -0.2 -1.92 -1.2 -0.05 0.07 -0.06 -1.22 -0.19 -1.57 0.02 -0.65 -0.17 -0.83 -1.95 -1.42 -3.16 -0.46 -1.22 -1.38 0.39 1.73 -0.45 -3.23 -1.0 -1.16 -1.35 -0.74 -0.95 -3.3 -1.04 0.71 1.84 0.05 -0.9 -1.99 -0.01 -2.14 0.17 1.7 0.25 1.79 -1.3 -3.36 -2.1 0.48 1.21 0.32 0.54 0.61 -0.46 -0.19 0.51 -1.37 1.18 -1.48
CRO09119 (rnfG)
0.81 -0.09 0.75 0.07 1.9 -0.0 -0.39 -0.75 -0.68 0.43 0.69 0.76 0.8 -0.33 0.52 0.7 0.32 0.86 0.62 0.01 0.87 0.34 -0.55 -1.31 1.15 0.98 0.21 -0.9 0.01 -1.01 0.24 -0.29 1.38 -0.21 -0.41 -1.13 -3.09 -1.47 -0.39 -0.43 -2.83 -1.89 -0.51 -3.24 -0.99 -0.35 -1.18 -0.58 -0.74 -3.6 0.15 -2.79 -1.97 0.53 -0.32 -3.95 0.47 -2.42 -3.08 -2.09 -3.38 -1.84 -1.74 -3.6 -2.15 0.82 0.98 0.53 0.65 0.57 -0.24 0.01 0.84 -0.22 1.84 -1.23
CRO09157 (rnfE)
1.02 -0.31 0.16 -0.33 1.35 -0.3 -0.39 -1.41 -1.02 0.39 0.32 0.44 0.5 -0.34 -0.1 0.1 0.24 0.7 0.26 0.37 0.48 0.05 -0.77 -1.41 0.63 0.64 0.39 -0.68 -0.27 -0.75 0.47 -0.35 0.33 -0.39 -0.91 -1.1 -2.23 -0.48 -1.56 -1.71 0.08 0.8 -0.33 -2.38 -0.58 -0.33 0.05 -0.55 -0.34 -2.02 0.28 -0.14 0.58 0.26 0.34 -3.78 0.14 -1.85 -0.33 0.7 -0.18 0.62 -1.43 -2.42 -1.67 0.62 1.16 0.78 0.75 0.98 -0.32 -0.59 0.62 -0.69 0.8 -1.14
CRO11618 (nicP_4)
1.25 -0.64 0.21 -0.47 2.73 1.17 -0.87 0.03 0.04 0.38 0.1 0.2 0.09 0.84 -1.1 0.44 -1.0 -1.39 -0.0 1.83 0.19 -0.27 -0.75 -0.72 1.22 -0.42 -0.24 -0.36 -0.93 0.08 0.3 -0.24 -0.3 -0.75 -1.63 0.36 -0.51 -1.46 -0.78 -0.71 -2.1 -2.4 -1.07 -0.81 0.38 0.08 -1.74 -1.07 -0.15 -0.69 -0.42 -2.33 -2.21 -0.58 -1.14 -4.12 -0.16 -1.42 -1.8 -2.7 -1.81 -2.45 -1.45 -2.34 -2.18 0.63 1.77 0.74 1.02 -0.12 -1.17 -0.33 -1.46 0.93 2.03 -0.86
CRO12250 (potA_2)
-2.34 -2.2 -1.99 -0.23 2.04 0.07 -0.95 -2.28 -2.8 -0.16 -1.23 -1.3 -1.49 -0.61 -0.31 -1.87 -2.05 1.25 -2.25 -1.48 -1.76 -1.58 -2.21 -2.9 -0.23 0.08 -1.35 -2.62 -1.09 -3.06 -1.54 0.12 0.12 -0.88 -1.01 -0.38 1.33 -0.29 -0.86 -0.73 -0.45 2.32 -0.5 1.38 -0.58 0.54 -0.45 -1.68 -0.95 1.17 0.44 -0.35 2.03 -0.75 0.18 -3.29 -0.05 0.32 -0.53 1.87 -0.83 2.12 -0.11 -0.99 -0.38 -1.13 0.86 -0.3 -0.81 1.17 -1.5 -1.61 1.18 -1.13 1.15 -1.42
-0.51 -0.93 -0.77 -0.22 1.94 -0.21 -0.98 -1.59 -1.2 0.18 -0.16 -0.08 -0.1 -0.18 -0.15 -0.29 -0.48 1.97 -0.69 -0.54 -0.23 -0.41 -1.32 -1.72 -0.34 -0.43 -0.47 -1.06 1.41 -0.63 -0.36 -0.07 -0.7 -0.3 -2.14 0.26 -0.76 -0.73 0.6 0.32 -1.2 1.18 -0.34 -0.99 -0.91 -0.72 0.28 -0.46 -0.15 -0.92 -0.84 -1.17 1.1 1.08 0.19 -1.47 0.26 -1.44 -1.43 1.26 -1.36 1.24 -0.68 -2.11 -1.81 0.3 0.95 0.35 0.11 0.05 -0.35 -0.9 1.84 -0.34 0.9 -1.31
CRO17450 (glcB_1)
0.2 -0.62 0.56 0.89 1.71 0.0 0.42 -0.43 -0.39 -0.01 -0.18 -0.11 -0.19 0.06 -0.26 0.15 -0.42 -0.18 -0.05 -1.79 0.17 -0.55 -1.37 -1.58 0.58 0.59 -0.36 0.1 0.06 0.13 -0.35 0.17 -0.72 0.09 -1.45 0.2 -0.15 -0.18 -0.32 -0.76 -0.8 -1.02 -0.49 -0.0 -0.87 0.86 -1.15 -0.09 -0.59 -0.12 0.03 -0.93 -0.95 -0.2 -1.17 -2.26 0.31 0.12 -0.62 -1.28 -0.6 -0.88 -0.26 -0.71 -1.31 0.32 1.99 1.53 0.76 -0.84 -0.6 1.06 -0.2 -0.57 1.72 -1.58
CRO21732 (sfsA)
0.93 -0.34 0.17 -0.53 1.18 0.96 -0.5 -1.2 -1.6 0.34 0.33 0.58 0.56 -0.14 0.11 0.91 1.42 0.27 -0.1 0.31 0.19 0.27 -1.33 -0.5 0.73 0.8 0.07 -0.64 0.19 -1.2 0.22 -0.22 0.18 0.01 -0.68 -0.69 -3.04 -0.64 -0.28 -0.31 -0.5 -0.54 -1.23 -3.46 -0.89 0.75 -0.47 0.23 0.06 -2.83 0.86 -0.73 -0.66 0.64 -0.51 -3.53 0.79 -1.83 -1.1 -0.61 -1.15 -0.36 -1.16 -1.82 -1.81 0.75 0.73 0.55 0.77 0.06 -0.17 0.26 0.32 0.17 0.88 -0.65
CRO24321 (htrE)
0.02 -0.36 -1.0 1.08 2.07 -0.43 -2.06 -1.38 0.71 -0.05 -0.48 -0.41 -0.3 0.84 -2.63 0.3 -1.48 -3.25 0.65 0.36 0.35 -0.51 -0.77 0.07 0.18 -0.84 -1.69 0.8 -1.47 0.96 -1.29 0.3 -0.98 0.12 -3.46 0.09 2.44 -1.15 -1.05 -1.14 -2.4 -4.88 1.44 2.29 0.4 -0.81 -1.75 -1.58 -0.09 2.36 -1.47 -2.91 -4.31 -1.55 -1.52 -2.82 -1.5 0.88 -1.71 -4.38 -2.11 -3.95 0.73 -0.79 -0.17 -0.92 0.23 -0.97 -0.66 -1.61 -0.82 -0.72 -2.9 0.65 1.93 -2.66
CRO25360 (sotB)
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CRO27882 (virS_4)
-0.07 -0.63 -0.59 -0.31 1.45 0.0 0.06 -1.67 -1.5 0.45 0.28 0.28 0.25 -0.38 0.16 0.5 -0.37 -0.24 -0.2 -0.22 0.1 -0.03 -1.35 -1.36 0.51 0.26 -0.04 0.13 -0.48 0.22 0.35 -0.01 -0.45 -0.04 -1.5 0.38 -0.74 -0.28 -0.16 0.0 0.23 0.15 -1.04 -0.8 -0.0 0.3 -0.41 0.06 0.48 -0.45 0.33 0.04 0.08 -0.19 -0.4 -3.33 0.61 -0.18 0.4 0.24 0.09 0.14 -0.57 -0.95 -1.29 0.59 1.48 0.74 0.58 0.35 -0.56 0.06 -0.24 -0.51 0.69 -0.74
CRO28331 (ycaD_1)
1.18 -0.27 -0.78 0.88 2.54 0.15 -0.63 -1.32 -0.58 0.42 0.05 0.27 0.32 -0.29 -0.89 1.36 -0.38 -1.34 -0.59 0.28 -0.13 -0.23 -0.98 -0.0 1.14 0.35 -0.19 -0.56 -1.33 -0.71 0.35 -0.32 0.59 -0.04 -1.16 -0.53 -2.6 -0.69 -1.52 -1.63 -0.95 -1.52 -0.43 -2.8 -0.76 0.01 -1.51 -1.29 -0.85 -2.5 -0.73 -1.26 -1.27 -0.82 -1.03 -4.06 0.16 -1.7 -1.61 -1.62 -1.76 -1.38 -1.68 -1.94 -2.18 1.16 2.5 1.62 1.92 -0.18 -1.09 -0.28 -1.5 0.41 1.87 -1.38
CRO28875 (gcvA_3)
-0.2 -1.3 0.18 -0.28 2.23 1.18 0.05 -0.67 -1.51 0.04 0.59 0.65 0.41 0.72 0.95 -0.22 -0.3 -0.64 -0.87 -0.61 -0.63 0.41 -0.91 -1.39 0.37 0.51 -0.87 -0.47 -1.11 -0.02 -0.48 0.07 -0.74 -0.41 -1.51 0.81 -0.71 -1.28 0.75 0.4 -1.86 -2.01 -0.52 -0.94 -0.52 0.19 -1.0 -0.16 0.22 -0.84 0.36 -1.87 -2.13 0.14 -1.06 -2.77 0.5 -0.81 -1.66 -1.64 -1.85 -2.04 -0.94 -1.96 -2.07 1.25 1.9 0.86 0.94 0.49 0.11 -0.26 -0.65 0.5 1.69 -0.16
CRO31023 (rssA_2)
0.27 -0.95 -0.65 0.11 1.54 0.1 -0.48 -0.94 -0.92 0.26 -0.01 -0.03 -0.17 -0.2 -0.36 0.35 -1.0 -0.16 0.49 0.16 0.38 -0.21 -1.29 0.08 0.21 0.39 -0.26 -0.89 -0.95 -0.86 -0.08 -0.09 -0.44 0.25 -1.61 0.06 -0.07 -0.31 -0.17 -0.27 0.24 0.23 0.4 -0.09 -0.52 0.0 -0.34 -0.55 0.55 -0.16 0.0 0.29 0.09 -0.74 -0.28 -1.59 0.02 -0.51 0.39 -0.13 0.27 0.02 -0.45 -1.04 -0.45 0.79 1.85 1.03 0.84 0.14 -0.62 -0.61 -0.34 -1.06 0.91 -0.64
CRO36835 (rlmN_2)
0.85 -0.99 -1.54 0.1 1.62 0.78 0.19 -1.05 -1.43 0.42 -0.08 -0.12 -0.34 0.45 1.2 0.42 -1.25 0.51 0.9 1.71 0.56 -0.03 -0.61 -1.29 1.08 1.69 -0.11 -0.54 -1.23 -0.6 -0.12 -0.02 -0.27 -0.37 -0.83 0.51 0.1 -1.12 0.64 0.96 -2.47 -1.96 0.27 0.17 -0.75 -1.24 -1.22 0.12 0.75 0.12 -1.1 -2.51 -1.72 -0.46 -0.84 -2.94 0.4 -1.63 -2.85 -1.83 -2.94 -1.87 -1.26 -2.91 -2.05 0.59 1.17 0.31 0.2 -0.44 -0.37 -0.66 0.41 -1.15 1.48 -0.17
CRO38827 (rhtA)
0.28 -0.54 -0.29 -0.49 0.75 1.66 0.55 -0.68 -2.65 0.55 0.05 0.3 0.33 0.67 1.12 0.65 -0.53 0.23 -0.39 -0.14 -0.54 -0.23 -1.92 -1.55 0.86 1.2 0.0 -1.18 -0.66 -1.61 0.34 -0.41 -0.82 -0.65 -0.63 -0.1 -3.58 -1.22 0.52 0.33 -1.54 0.58 -1.77 -3.51 -1.36 -0.59 -0.53 -1.62 -0.3 -3.36 -0.4 -1.31 0.51 0.06 -0.42 -4.25 0.5 -2.5 -2.02 0.28 -1.85 0.42 -2.46 -3.25 -3.62 1.44 1.87 1.54 1.62 0.61 0.11 -0.64 0.27 -1.93 1.27 -0.32
CRO40520 (ptrB)
1.18 -0.82 -0.56 0.41 1.57 0.43 0.0 -0.77 -0.31 0.37 0.43 0.45 0.38 -0.36 -0.26 1.42 1.05 0.5 0.15 0.64 0.39 0.21 -1.58 -0.24 -0.03 0.22 -0.31 -0.33 -0.47 -1.1 -0.1 -0.28 -0.67 0.14 -1.21 -0.21 -2.81 -0.86 -0.26 -0.46 -0.17 -0.23 -0.51 -3.21 -0.55 0.11 -0.28 0.08 0.32 -2.85 0.32 -0.11 -0.36 0.32 -0.32 -0.39 0.07 -1.69 -0.57 -0.46 -0.52 -0.19 -0.85 -2.67 -2.16 0.7 0.99 0.38 0.84 -0.37 0.16 0.11 0.36 -0.53 0.89 -0.06
CRO48936 (mntP)
1.91 -0.29 -0.49 -0.43 2.64 0.57 -0.3 -0.4 -0.83 0.39 0.23 0.38 0.25 -0.02 -0.77 -0.06 -1.74 -0.85 -0.92 1.31 -0.49 0.17 -1.36 -1.99 0.24 0.69 0.82 -0.86 -1.0 -2.08 0.81 0.03 -0.07 -0.93 -1.63 -0.1 -0.98 -1.4 -0.05 -1.35 -1.97 -1.58 -1.18 -1.25 0.33 0.66 -0.43 -1.26 -0.05 -0.79 -0.18 -1.87 -2.04 -1.19 -0.59 -6.24 -0.04 -1.81 -1.63 -1.52 -2.62 -1.65 -1.75 -2.66 -2.15 1.1 2.32 1.43 1.37 -0.2 -1.66 -0.64 -0.64 -0.61 1.88 -0.32
0.29 -0.98 0.12 0.09 1.42 -0.03 -0.65 -1.33 -1.16 0.5 0.01 0.2 0.25 -0.11 0.11 0.51 0.34 -0.19 -0.78 -0.35 -0.43 -0.31 -0.89 -1.42 0.07 0.58 -0.21 -0.83 -1.2 -1.94 0.09 -0.34 -0.13 -0.28 -0.39 -0.17 -2.85 -0.81 -0.77 -1.29 1.08 1.19 -1.04 -2.39 -0.92 0.01 -0.21 0.11 0.45 -2.97 -0.18 0.83 1.29 0.25 -0.54 -5.84 0.94 -2.35 0.13 0.98 0.06 1.11 -1.86 -2.52 -2.87 0.9 1.5 0.44 0.92 1.0 -1.01 -0.68 -0.3 -0.82 1.19 -1.1
-0.22 -0.66 -0.06 -0.97 2.26 0.52 -0.48 -1.86 -1.96 0.53 0.54 0.57 0.54 0.52 0.75 0.02 -1.1 -0.77 0.63 0.33 1.36 0.02 -0.4 -0.84 0.65 0.54 -1.87 0.41 -0.61 0.71 -1.76 -0.15 0.67 -1.0 -1.69 0.67 -1.56 -0.94 0.21 0.41 -0.54 -1.06 -0.65 -1.82 -1.79 1.54 -1.84 -0.44 -1.07 -1.05 1.42 -0.72 -0.79 -0.87 -1.2 -2.39 -0.95 -1.17 -0.32 -0.96 -0.47 -1.03 -1.44 -2.61 -2.42 -0.52 1.89 -0.6 -0.04 -1.33 -0.4 0.66 -0.81 0.5 1.93 -1.66
CRO55618 (potD_1)
-1.32 -0.23 -1.17 -2.57 3.38 0.43 0.08 -1.99 -2.21 0.34 -0.1 -0.01 -0.14 0.76 1.03 -1.24 -0.37 -0.41 -0.94 -0.85 -1.14 -0.69 -1.45 -2.29 0.36 0.48 -1.59 -0.79 -0.3 -0.55 -1.09 -0.15 0.55 -1.49 -1.29 0.63 -1.25 -2.23 -0.42 -0.27 -1.53 -3.08 -0.46 -2.09 -2.21 1.25 -1.0 -0.54 -0.79 -1.76 0.86 -2.17 -2.63 -1.01 -0.83 -7.68 0.13 -1.83 -1.04 -3.13 -1.82 -2.9 -2.17 -1.39 -4.57 0.18 2.87 0.22 0.97 0.45 -0.83 -0.45 -0.26 1.1 2.62 -2.48
CRO55636 (stcD_1)
-0.16 -0.3 -0.57 -0.78 2.25 1.18 -0.27 -2.11 -1.52 0.45 0.24 0.27 0.14 0.76 0.42 0.43 0.28 -0.6 -0.08 1.19 0.04 -0.21 -1.28 -0.87 0.69 0.75 -1.2 0.69 -0.42 -0.49 -0.64 -0.16 0.94 -0.64 -1.35 0.56 -1.22 -1.74 -0.24 0.21 -1.97 -2.95 -0.71 -1.43 -0.9 0.72 -0.82 -0.66 -0.34 -1.27 0.42 -2.3 -3.19 -0.14 -0.53 -3.92 0.09 -1.66 -1.41 -3.08 -1.7 -2.8 -1.75 -2.01 -2.37 0.67 2.3 0.75 1.26 0.08 -0.3 -0.42 -0.48 0.18 2.13 -2.57
CRO57624 (priA)
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CRO59693 (cdhR_3)
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CRO72266 (cynR_2)
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CRO77859 (budC_2)
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CRO80200 (cynR_3)
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CRO80550 (bmr3)
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CRO82955 (degS)
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CRO83835 (cph2_5)
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CRO84197 (exsA_3)
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CRO85184 (cynR_4)
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CRO87941 (codB)
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CRO88537 (rhtC_4)
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CRO88578 (rhaS_2)
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CRO90667 (virS_5)
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CRO94457 (fecA_1)
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CRO94954 (phnV)
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CRP00767 (cdhR_6)
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CRP05530 (gmr_7)
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CRP06248 (mntH_2)
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CRP07410 (mexA_3)
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CRP07564 (cusS_3)
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CRP12421 (cysJ_1)
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CRP14867 (sauU)
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CRP24723 (hemN_1)
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CRP27746 (glsA2)
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CRP32224 (yhdN_3)
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CRP38958 (barA_6)
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CRP45459 (cysW_3)
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CRP45508 (benM_8)
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CRP46282 (efeU)
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CRP46790 (trg_2)
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CRP51989 (kinB_1)
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CRP55341 (iutA_2)
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CRP55692 (cysW_4)
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CRP58733 (cmpR_7)
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CRP59411 (leuO_5)
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CRP62462 (gcvA_8)
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CRP63042 (acsAB)
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CRP63180 (rstB_2)
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CRP67973 (cirA_5)
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-0.3 -0.94 -0.47 -0.69 2.01 1.21 0.1 -0.26 -1.04 0.12 0.08 0.12 -0.13 0.3 0.66 -0.31 0.91 0.14 0.01 0.98 0.18 -0.25 -0.78 -1.41 0.89 1.03 -0.34 0.57 -0.61 -0.22 -0.25 -0.18 -0.67 -0.32 -1.35 0.11 -1.91 -0.78 -0.13 -0.37 -0.49 -0.69 -1.3 -1.86 -0.28 -0.7 -0.15 -0.46 -0.35 -1.79 -0.41 -0.49 -0.43 0.22 -0.44 -1.57 0.21 -1.66 -0.9 -0.67 -0.78 -0.74 -1.21 -2.8 -2.11 0.76 1.83 0.62 0.83 0.67 0.36 -0.44 0.1 -0.62 1.52 0.15
CRP77653 (hprA)
0.01 -1.22 0.01 0.14 2.03 1.44 0.25 0.07 -1.44 0.08 0.38 0.3 0.04 -0.06 -0.05 0.88 1.23 -0.07 -0.11 0.71 -0.07 0.06 -1.37 -1.77 0.72 0.83 -1.13 -0.11 -1.63 0.14 -0.78 -0.12 -0.47 0.0 -1.25 0.21 -3.75 -1.24 0.23 0.13 -0.15 -0.41 -0.93 -4.13 -0.35 -0.75 -0.93 0.56 0.59 -3.62 -0.45 -0.4 -0.34 0.34 -1.19 -1.0 0.37 -1.78 -0.87 -0.57 -0.98 -0.28 -1.72 -3.1 -2.93 0.43 1.34 0.33 0.68 0.55 -0.23 0.33 -0.17 -1.44 1.78 -0.06
CRP78390 (phnR_3)
0.72 -1.07 -1.01 1.12 1.39 0.24 0.16 -1.79 -0.96 -0.04 0.77 0.78 0.63 -0.47 -0.02 0.46 0.21 -0.03 0.01 1.59 -0.0 0.41 -1.1 -1.2 1.35 1.81 -0.38 -0.11 -0.56 0.25 -0.23 0.01 0.07 -0.38 -0.89 -0.96 -2.27 -1.07 -1.14 -1.64 0.16 -0.17 -1.05 -2.48 -1.19 -0.01 -1.02 -0.11 0.2 -2.07 0.46 0.01 -0.17 0.15 -0.85 -2.32 1.16 -1.9 -0.3 -0.36 -0.37 -0.27 -1.1 -2.13 -1.82 0.43 0.67 0.24 -0.16 0.1 -0.67 0.0 -0.13 -1.11 1.58 -1.17
CRP81532 (quiP_3)
0.51 -0.28 -0.32 0.82 0.54 0.41 0.52 -0.66 -0.58 0.49 0.56 0.57 0.41 0.25 0.51 0.84 -0.54 0.58 0.24 0.52 0.35 0.32 -1.08 -0.2 0.23 0.7 -0.72 -0.41 -0.37 -0.61 -0.39 0.07 -0.27 0.16 -1.35 0.03 -0.45 -0.64 -0.01 0.05 -0.68 -0.62 0.24 -0.44 -0.27 -0.14 -0.62 -0.12 0.38 -0.41 -0.03 -0.65 -0.79 -0.37 -0.49 -1.26 0.1 -0.54 -0.73 -0.94 -0.82 -0.69 -0.23 -1.64 -1.02 0.55 1.15 0.63 0.3 0.12 -0.23 0.19 0.45 -0.19 0.43 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.