Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
AES-1R,ASMDM+
AG1,ciproflaxin
D+7bld
DK2
E01
LB
LB,log
LB,untreated
PA1201
PA14
PA14,0.25xMIC G3KL
PA14,0.25xMIC T7
PA14,0.25xMIC polymyxin-B
PA14,LB
PA14,LB,log
PA14,WT
PA14,ciproflaxin
PA14,cmrA+
PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,late stat,untreated
PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose
PA14,untreated
PA212
PA2596
PA558
PA580
PAK,LB
PAK,WT
PAK,WT,LB
PAK,pilR
PAK,pmrB6,LB
PAO1
PAO1,0.56mg/mL farnesol
PAO1,ABTGC
PAO1,DDS
PAO1,GUN,LB,glucose
PAO1,HapZ,early stat
PAO1,LB
PAO1,LB,glucose
PAO1,LB,untreated
PAO1,M9-CA,early stat
PAO1,M9-CA,log
PAO1,RsmN+
PAO1,SagS,early stat
PAO1,WT
PAO1,WT,BHI
PAO1,WT,LB
PAO1,WT,MOPS acetate
PAO1,WT,MOPS glycerol
PAO1,early stat
PAO1,ersA,BHI
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat
PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log
PAO1,liquid culture
PAO1,mexZ,LB
PAO1,oxylipin-
PAO1,pBAD-yhjH
PAO1,pUCP18::msr(E)
PAO1,qslA,M9-CA,early stat
PAO1,qslA,M9-CA,log
PAO1,qteE,M9-CA,early stat
PAO1,qteE,M9-CA,log
PAO1,untreated
PAO1,wspFpelApslBCD,LB
PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated
Y31,LB
Y71,LB
Y82,LB
Y89,LB
ciproflaxin
liquid culture
m pheno
mexT
nirS
pHerdB20T-gp68
untreated
CRN64861 (dctP_1)
-1.97 -0.44 -0.37 -1.78 0.25 -0.36 0.12 -0.2 -2.82 0.52 0.14 0.27 0.49 0.95 0.88 -0.33 1.74 0.15 -1.81 -0.83 -1.55 0.38 -2.08 -2.31 -0.96 -0.93 2.36 -0.6 1.41 -2.25 2.21 -0.55 -0.97 -0.01 -2.15 -0.05 -2.69 0.01 0.03 -0.1 -1.73 -0.26 -2.47 -2.71 -1.67 -1.42 0.82 -2.57 -1.87 -2.67 -1.27 -1.67 -0.51 0.55 0.74 -0.48 1.36 -2.71 -2.65 -0.14 -2.62 -0.24 -1.19 -3.46 -3.33 0.68 1.3 1.9 1.12 0.26 0.99 -1.57 0.3 -0.77 -1.33 -0.03
CRN65962 (ribF)
1.24 -0.81 -0.3 -0.46 0.34 1.08 0.09 -1.45 -1.0 0.0 0.13 0.26 0.05 -0.34 0.09 0.01 -0.88 0.45 -0.54 0.21 -0.31 0.18 -1.38 -1.0 0.7 1.0 1.04 -0.64 -0.38 -1.24 1.17 -0.2 -0.01 0.31 -0.6 -0.67 -3.11 -0.14 -0.47 -0.04 -0.2 0.06 -1.34 -3.42 0.19 0.19 1.13 -0.34 0.04 -2.84 0.88 -0.25 -0.17 0.24 1.11 -4.12 0.72 -2.02 -0.61 -0.11 -0.67 -0.05 -1.28 -2.01 -2.18 0.9 1.06 0.48 1.05 0.66 -0.27 -0.92 0.51 -0.99 -0.17 -0.58
CRN86127 (yheS_1)
1.06 0.17 0.23 -1.02 0.21 -0.47 -1.25 0.76 -1.99 0.38 0.48 0.55 0.55 -0.06 -0.55 0.84 0.83 -0.07 -0.54 0.85 -0.45 0.45 -1.4 - -1.03 -0.5 1.23 -1.06 -0.34 -2.58 1.33 -0.58 -0.09 0.43 -1.12 -1.23 -3.27 -0.39 -0.61 -0.77 -0.8 1.11 -1.88 -3.43 0.51 -1.11 0.43 -1.91 -1.03 -3.18 -0.42 -0.9 0.99 0.21 0.49 -0.04 0.35 -3.15 -1.72 1.05 -1.71 1.14 -2.19 -3.49 -3.48 1.72 1.38 1.23 1.23 0.06 -0.47 -1.16 -0.17 -0.81 0.23 -0.74
CRN96959 (mnmA)
0.85 -0.45 -0.24 -0.51 -0.03 0.46 0.02 -0.52 -1.54 0.28 0.09 0.18 0.1 -0.11 0.26 0.51 0.07 0.77 -0.18 0.45 -0.14 0.06 -2.21 -0.68 0.04 0.3 0.95 -0.35 -0.24 -1.72 1.05 -0.46 -0.48 0.43 -0.94 -0.76 -3.29 -0.4 -0.43 -0.37 0.46 0.66 -0.72 -3.61 -0.25 -0.81 0.44 -0.18 -0.11 -3.4 -0.33 0.32 0.55 0.44 0.51 -1.76 0.64 -2.2 -0.2 0.55 -0.35 0.52 -1.37 -2.08 -2.57 0.99 1.01 0.8 1.0 0.74 -0.01 -0.37 0.64 -1.04 -0.08 0.06
CRN97263 (ndhC_1)
-0.31 0.15 0.89 -2.22 -1.61 -0.01 -0.01 0.8 -1.34 -0.4 0.16 0.31 0.24 0.68 0.63 -0.14 -1.5 0.21 -0.49 0.23 -0.43 0.09 -0.69 -1.54 -1.11 -0.92 0.16 -0.75 -1.09 -1.36 0.37 -1.01 1.01 -0.9 -0.44 0.09 -1.97 0.4 0.02 -0.0 -0.58 -0.19 -0.88 -2.16 0.5 0.43 2.28 -0.55 -0.33 -1.94 1.54 -0.62 -0.07 -0.88 2.31 -0.59 -0.3 -2.92 -0.8 -0.08 -0.79 -0.15 -1.78 -3.29 -3.8 0.57 0.48 0.44 0.7 0.58 -0.35 -0.62 0.11 -2.36 -0.7 1.23
CRO03027 (suhB)
1.15 -0.87 -0.36 -1.37 -0.4 -0.59 0.19 -0.8 -2.59 0.54 -0.09 -0.17 -0.26 0.19 1.19 0.46 0.27 0.88 -0.51 0.48 -0.13 0.13 -1.16 -2.2 0.12 0.54 1.3 -0.92 -0.86 -2.04 1.14 -0.74 -0.58 -0.25 -0.21 -1.14 -3.47 -0.59 -0.36 -0.58 0.24 1.41 -1.4 -3.54 -0.18 -1.9 0.1 -1.31 -0.55 -3.41 -1.88 0.41 1.75 -0.52 0.12 -2.16 -0.08 -3.29 -0.3 1.58 -0.81 1.75 -2.68 -3.45 -3.26 -0.13 1.33 0.43 0.59 1.29 -0.71 -0.77 0.7 -1.14 0.12 -0.03
0.56 -0.51 -1.06 -0.56 -0.95 0.2 0.48 -0.57 -1.24 0.29 0.18 0.23 0.02 0.43 0.84 0.14 -0.86 0.8 0.28 1.03 0.56 0.07 -1.5 -1.21 -0.87 -0.64 0.78 -0.89 -0.08 -1.56 0.8 -0.66 0.04 -0.15 -1.32 -0.34 -2.66 -0.03 0.05 0.02 0.36 1.08 -1.05 -2.9 0.45 -0.89 0.54 -0.46 -0.5 -2.65 -0.62 0.59 0.96 -0.17 0.51 -0.35 -0.13 -2.28 0.11 0.95 0.13 0.99 -1.18 -2.63 -2.27 0.79 0.58 0.82 0.46 0.6 0.09 -0.47 0.69 -1.44 -0.57 -0.09
CRO03467 (rodZ)
1.07 -0.47 -0.2 0.56 -0.29 0.53 -0.31 -1.04 -0.91 0.42 0.41 0.45 0.3 -0.37 0.01 1.25 0.12 0.91 0.84 1.25 1.07 0.22 -1.39 -1.24 0.48 -0.11 0.76 -0.41 0.6 -1.06 0.74 -0.35 0.14 0.16 -1.08 -0.83 -2.44 -0.68 -0.4 -0.54 -1.95 -1.23 -0.31 -2.63 0.16 -0.77 -0.16 0.23 0.32 -2.51 -0.57 -1.51 -1.2 0.58 -0.19 -2.19 0.48 -1.8 -1.97 -1.37 -2.11 -1.1 -1.0 -2.22 -1.65 1.28 0.99 1.08 0.85 0.68 0.04 0.24 0.84 -1.24 0.51 -0.56
CRO03538 (hisS)
0.9 -1.06 -0.19 -0.93 -1.28 0.15 -0.18 -0.6 -2.16 0.46 0.59 0.75 0.56 -0.27 0.34 0.24 1.67 0.94 -0.4 0.89 -0.05 0.29 -2.02 -0.89 -0.69 -0.48 1.01 -1.21 0.56 -1.9 0.88 -0.42 0.11 -0.18 -1.54 -0.91 -3.76 -0.07 -0.4 -0.48 -0.34 0.83 -1.26 -3.69 -0.2 0.35 0.35 -0.0 -0.28 -3.71 0.72 -0.08 0.63 0.44 0.28 0.04 0.23 -1.57 -0.52 0.7 -0.35 0.64 -0.56 -1.93 -1.33 0.52 0.23 0.42 0.29 0.35 0.01 -0.38 0.81 -0.9 -0.97 -0.23
CRO03594 (bamB)
0.61 -1.21 0.23 -0.5 -1.25 0.18 -0.31 -1.15 -1.12 0.56 0.91 1.03 0.98 -0.16 0.61 0.59 -0.71 0.83 0.4 1.13 0.48 0.58 -2.17 -0.58 0.38 0.47 0.77 -1.1 0.57 -1.42 0.59 -0.35 -0.52 0.26 -1.28 -0.87 -3.98 -0.39 -0.59 -0.71 -0.76 0.02 -0.91 -3.89 -0.3 0.11 0.35 0.36 0.02 -3.93 0.42 -0.78 -0.2 0.64 0.29 -3.72 0.48 -1.41 -1.23 -0.2 -1.07 -0.03 -0.74 -2.51 -1.83 1.01 0.95 1.0 0.9 -0.29 0.01 0.03 0.76 0.21 -0.29 -0.53
CRO03630 (der)
0.6 -0.78 -0.46 -0.83 -0.97 0.49 0.32 -0.74 -0.97 0.69 0.42 0.49 0.48 0.25 0.7 0.54 -0.08 0.79 0.33 0.25 0.4 0.48 -0.89 -1.07 -0.22 -0.12 0.78 -1.15 0.12 -1.54 0.51 -0.41 -0.3 0.5 -1.17 -0.43 -2.25 -0.33 -0.2 -0.24 -0.17 0.44 -0.44 -2.41 -0.07 0.42 0.93 -0.9 -0.73 -2.33 0.78 -0.2 0.3 0.16 0.9 -1.22 0.31 -1.04 -0.33 0.34 -0.26 0.4 -0.96 -1.38 -1.05 0.71 0.7 0.71 0.51 -0.36 0.05 -0.8 0.76 -0.58 -0.49 -0.44
CRO10680 (fruA)
-2.03 -2.07 0.7 -0.09 1.02 -0.71 -0.46 -4.25 0.33 -0.57 -1.6 -1.03 -0.63 -1.26 -0.66 0.14 0.31 -0.1 -1.78 -2.45 -1.9 -2.02 -3.39 -3.3 -0.06 -0.31 0.98 -2.04 0.84 -2.01 1.14 -1.11 -2.52 -1.65 -0.92 -1.22 -1.53 0.21 -1.08 -3.58 -3.6 -3.93 -2.05 -1.98 -2.37 2.09 -1.33 -2.15 -0.79 -1.63 1.73 -3.63 -4.03 0.93 -1.26 -4.88 0.64 -2.02 -3.74 -4.34 -3.69 -3.9 -1.25 -3.6 -3.09 2.78 2.79 2.65 2.86 0.46 -0.57 -0.29 -0.24 -0.64 0.59 -2.88
CRO10708 (lacC)
-1.59 -2.29 0.05 -1.38 0.23 -1.0 -2.19 -4.72 -0.07 -0.82 -1.83 -1.46 -0.81 -2.14 -1.7 -0.04 0.39 -0.1 -2.42 -3.55 -2.66 -2.28 -3.84 -3.48 -0.62 -0.89 1.11 -1.95 1.16 -2.19 -0.13 -1.4 -2.93 -2.0 -1.11 -1.05 -1.66 0.08 -1.53 -4.49 -4.25 -4.36 -2.78 -2.12 -2.63 2.69 -1.05 -2.4 -1.06 -1.67 2.5 -4.48 -4.48 0.69 -0.86 -8.55 0.6 -2.27 -3.76 -4.48 -4.08 -4.25 -1.32 -4.04 -3.19 2.89 2.97 2.79 3.03 0.01 -0.75 -0.55 -0.33 -0.79 0.35 -3.32
CRO10741 (ptsI_1)
-1.75 -2.07 0.31 -1.69 0.44 -0.63 -1.5 -5.17 -0.36 -0.5 -1.74 -1.39 -0.87 -0.78 -0.59 0.11 0.13 -0.06 -2.62 -3.26 -2.72 -2.37 -3.22 -4.18 -0.13 -0.7 0.88 -2.31 1.0 -2.22 -0.35 -1.38 -2.87 -2.1 -0.61 -0.98 -1.91 -0.06 -1.17 -4.21 -2.74 -3.26 -2.72 -2.33 -2.62 2.18 -1.1 -2.63 -0.86 -1.89 2.2 -3.08 -3.43 0.86 -1.06 -4.55 0.84 -2.58 -2.93 -3.62 -2.92 -3.43 -1.56 -4.22 -3.78 2.72 3.06 2.77 3.24 0.66 -0.64 -0.75 -0.24 -1.5 0.53 -3.59
CRO13174 (ftsB)
0.94 0.02 0.03 -1.09 -0.23 0.04 -0.32 -1.24 -0.64 0.4 1.2 1.15 0.91 0.21 0.91 0.22 1.32 0.94 0.35 -0.31 -0.01 1.13 -0.97 0.29 0.23 0.16 0.6 -0.45 -0.33 -0.64 0.52 -0.32 0.31 -0.3 -0.45 -1.7 -0.91 -0.37 -1.07 -1.07 -1.32 0.05 -1.78 -1.14 0.8 -0.71 0.37 -0.21 0.27 -0.85 -0.53 -1.13 -0.14 -0.24 0.29 -1.18 0.09 -1.29 -1.35 -0.42 -1.49 -0.12 -0.94 -1.64 -1.54 0.19 0.31 0.17 0.24 0.9 -0.76 -0.97 0.84 0.49 0.53 -0.88
CRO13219 (eno)
0.4 -0.78 -0.16 -0.63 -2.38 0.13 -0.18 -0.76 -0.75 0.29 0.46 0.48 0.35 -0.33 0.33 1.0 -0.55 1.01 -0.21 -0.57 -0.24 0.26 -2.01 -1.06 -0.19 -0.18 0.86 -1.0 0.39 -1.34 0.64 -0.43 -0.44 0.21 -1.87 -0.29 -4.25 -0.21 0.61 0.59 0.08 1.02 -0.0 -4.54 -0.3 -0.34 0.56 0.76 0.24 -4.22 -0.11 0.72 0.89 0.2 0.55 -0.84 0.3 -1.71 -0.18 0.99 -0.06 1.0 -0.88 -2.37 -1.86 0.07 0.01 0.07 -0.06 -0.26 0.38 0.33 0.94 -0.36 -0.62 -0.07
CRO13253 (kdsA)
0.66 -0.41 -0.71 -1.02 -0.6 -0.16 -0.32 -0.17 -0.86 0.36 0.37 0.33 0.27 -0.15 0.12 0.67 0.34 1.14 -0.02 0.03 -0.08 0.53 -2.19 -1.09 -0.91 -0.83 1.24 -1.09 0.39 -1.82 1.23 -0.46 -0.75 -0.13 -2.42 -0.25 -2.15 -0.18 0.51 0.61 0.15 1.03 -0.25 -2.37 0.27 -1.55 0.44 0.28 0.18 -2.18 -1.34 0.39 0.82 0.1 0.35 -0.12 0.38 -1.93 -0.17 0.94 -0.12 1.01 -0.93 -2.8 -2.41 0.37 0.42 0.31 0.25 0.07 0.18 -0.32 1.0 -1.23 -0.53 -0.51
CRO13564 (fabZ)
0.96 -0.92 -0.49 -1.73 -1.29 0.61 0.51 -1.11 -1.35 0.48 -0.03 0.01 -0.03 0.57 0.44 -0.12 -0.27 0.97 -0.32 -0.26 -0.03 0.12 -0.74 -1.42 -0.13 -0.04 0.32 -0.9 -0.02 -1.68 0.57 -0.54 -0.98 0.39 -1.69 -0.65 -2.68 -0.06 -0.19 0.38 -0.09 1.84 -1.83 -2.84 -0.17 -1.1 0.6 -0.24 -0.52 -2.75 -0.81 -0.11 1.47 0.6 0.42 0.46 0.53 -2.35 -0.65 1.54 -0.31 1.6 -1.31 -2.4 -2.1 0.44 0.33 0.24 0.24 0.38 -0.01 -0.38 0.86 -1.81 -1.31 0.16
CRO13633 (skp)
0.22 0.12 0.14 -1.07 -1.58 0.1 -0.58 -1.38 -0.21 0.56 0.6 0.67 0.68 -0.16 0.25 1.17 -0.15 0.98 0.99 0.42 1.08 0.67 -1.53 0.23 -0.14 -0.27 0.07 -0.36 0.53 -0.87 0.27 -0.3 -0.73 -0.46 -1.63 -1.31 -3.9 -0.45 -0.71 -0.72 0.02 0.54 -0.57 -3.91 -0.16 0.09 0.31 0.66 0.1 -4.03 0.61 0.34 0.63 -0.22 0.29 -0.16 -0.12 -1.48 -0.26 0.49 -0.28 0.71 -0.8 -1.09 -0.69 -0.35 -0.44 0.71 -0.4 -0.11 -0.24 0.45 1.04 -0.52 -0.95 -0.2
CRO13878 (pyrH)
-0.23 -0.32 -0.23 -1.77 -0.99 0.39 -0.19 -1.83 -1.06 0.57 0.53 0.58 0.45 -0.23 0.78 -0.38 0.21 1.45 -0.39 0.75 -0.63 0.53 -1.95 -2.15 -0.3 -0.15 0.97 -1.03 0.49 -1.51 1.06 -0.64 0.35 -0.25 -1.49 -1.0 -2.84 -0.47 -0.36 0.04 -1.55 0.45 -1.03 -3.29 -0.18 0.42 2.01 -0.06 -0.52 -2.74 1.29 -0.69 0.18 0.11 1.87 -2.94 -0.2 -2.46 -1.78 0.26 -1.84 0.29 -1.01 -3.17 -2.54 0.44 0.62 0.55 0.6 0.09 -0.18 -0.76 1.36 -0.17 -0.92 -0.29
CRO16799 (trmD)
0.08 -1.29 -0.82 -2.06 -2.92 0.86 1.24 -1.0 -2.62 0.22 -0.47 -0.31 -0.52 -0.7 1.55 -1.54 -2.11 1.43 -1.92 -0.61 -2.03 -0.13 -2.33 -3.03 -0.29 0.32 2.06 -2.01 -0.03 -2.66 1.9 -0.31 -1.03 0.25 -0.64 -0.06 -4.56 0.01 0.91 1.28 -2.3 -0.38 -1.93 -4.69 -0.3 -0.27 1.5 -0.18 -0.03 -4.23 0.48 -1.87 -0.68 -0.19 1.48 -5.31 0.68 -2.4 -2.61 -0.63 -2.92 -0.34 -1.86 -4.24 -2.61 1.2 1.45 1.22 1.31 0.2 0.13 -1.93 1.39 -1.98 -0.7 0.91
CRO16836 (rimM)
0.1 -1.5 -1.13 -1.68 -2.94 0.4 0.77 -1.5 -2.0 0.43 -0.17 -0.14 -0.28 -1.07 0.73 -0.95 -1.28 1.51 -1.41 -0.23 -1.42 -0.07 -2.67 -2.8 0.31 0.65 1.91 -1.65 -0.28 -2.25 1.76 -0.62 -1.35 0.21 -1.23 -0.21 -4.81 -0.06 0.71 0.7 -0.5 1.18 -1.66 -4.92 0.13 -0.89 1.24 -0.15 0.22 -4.62 -0.34 -0.02 0.93 -0.24 1.23 -5.03 0.39 -3.18 -1.0 0.79 -1.0 1.07 -1.97 -4.47 -3.34 0.8 1.16 0.94 0.94 0.3 -0.37 -1.65 1.43 -1.37 -0.19 0.24
CRO20676 (carB)
0.66 0.17 -0.77 -0.5 -0.31 -0.39 -0.82 0.39 -1.22 0.53 0.59 0.57 0.65 -0.27 -0.21 1.03 0.88 0.75 0.65 1.11 0.57 0.57 -2.52 0.53 -1.09 -0.89 0.47 -0.35 0.46 -0.54 0.55 -0.62 -0.81 0.42 -2.08 -0.59 -1.87 -0.27 -0.04 -0.04 -0.59 0.57 -1.11 -2.21 0.32 -0.47 0.26 0.27 -0.15 -1.72 -0.32 -0.28 0.4 0.45 -0.02 -0.79 -0.23 -1.5 -0.96 0.44 -1.04 0.42 -0.65 -1.78 -1.71 0.71 0.51 0.57 0.4 -0.09 0.03 -0.27 0.62 0.13 -0.21 -0.39
CRO20709 (greA)
0.65 -0.22 -0.22 -0.57 -1.47 0.67 -0.57 -0.85 -0.9 0.32 0.51 0.58 0.7 -0.06 0.3 1.08 0.29 0.64 0.5 1.21 0.42 0.41 -2.68 0.41 0.04 0.14 0.32 -0.66 0.75 -0.53 0.35 -0.41 -0.06 0.55 -1.83 -0.32 -2.35 -0.42 -0.19 -0.25 -1.16 0.28 -0.39 -2.39 -0.31 0.03 -0.26 0.42 0.3 -2.3 0.06 -1.07 0.09 0.48 -0.54 0.82 0.2 -1.55 -1.75 0.07 -1.45 0.05 -0.69 -1.17 -0.91 0.48 0.33 0.14 0.33 0.24 -0.28 -0.31 0.61 0.91 -0.56 -0.43
CRO20912 (tpiA)
0.3 -1.81 -0.37 -2.51 -2.89 0.72 0.84 -0.95 -3.17 0.06 0.07 0.13 -0.12 0.04 1.17 -1.33 -2.43 0.94 -1.84 0.61 -1.87 -0.35 -1.67 -3.03 1.95 2.47 1.61 -1.4 -0.9 -1.68 1.59 -0.51 -0.43 -0.26 -0.71 -0.43 -4.39 -0.25 -0.06 0.43 -1.9 -0.73 -2.77 -4.5 -0.46 -1.21 1.19 0.07 -0.13 -4.15 -0.54 -1.84 -0.83 -0.04 1.06 -4.34 0.04 -3.0 -2.53 -1.01 -2.49 -0.7 -2.18 -3.69 -3.48 1.14 1.89 1.25 1.27 1.12 -0.15 -1.52 0.91 -2.03 -0.77 0.69
CRO20963 (rimP)
1.42 -1.21 -0.88 -3.33 -1.83 -1.2 -0.62 -0.73 -2.94 0.64 0.34 0.29 0.22 0.19 0.16 -0.51 -1.68 0.5 -1.14 0.4 -1.07 0.72 -1.54 -2.31 -0.41 0.05 2.08 -1.53 -1.07 -2.46 2.07 -0.56 -0.13 0.11 -0.89 -0.91 -4.78 -0.01 -0.47 0.14 -0.44 0.85 -1.32 -5.28 1.06 -1.5 1.67 -0.67 -0.69 -4.79 -0.62 -0.32 0.74 -0.54 1.52 -1.56 0.14 -2.76 -1.18 0.64 -1.07 0.58 -2.35 -3.85 -3.6 1.15 1.74 1.28 1.27 0.22 -1.1 -0.96 0.51 -2.47 -0.96 -0.17
CRO20993 (nusA)
0.83 -0.75 -1.43 -2.21 -1.82 -0.02 0.32 -0.1 -1.54 0.61 0.28 0.29 0.22 -0.05 0.83 0.59 -0.57 0.58 -0.29 0.9 -0.43 0.25 -2.16 -1.72 -0.79 -0.37 1.51 -1.28 0.33 -2.12 1.45 -0.52 -1.01 0.4 -1.53 -0.24 -4.45 -0.26 0.79 0.81 -0.83 0.45 -1.0 -4.62 0.68 -0.61 0.7 -0.24 -0.25 -4.35 -0.41 -0.35 0.2 0.02 0.59 -1.71 0.49 -2.56 -1.03 0.2 -1.02 0.34 -1.5 -3.65 -3.1 1.3 1.51 1.21 1.17 0.1 0.06 -0.75 0.62 -0.63 -0.5 0.09
CRO21030 (infB)
0.06 -0.73 -1.12 -1.88 -2.03 0.36 0.47 -0.23 -1.38 0.79 0.25 0.3 0.3 -0.12 0.93 0.74 0.28 0.58 0.0 0.74 -0.12 0.21 -2.41 -1.42 -0.45 -0.1 1.32 -1.61 0.93 -2.05 0.98 -0.46 -1.39 0.46 -1.71 -0.23 -4.53 -0.46 1.15 1.12 -1.57 0.32 -0.73 -4.76 0.24 -0.19 0.19 -0.07 -0.15 -4.43 0.04 -1.23 0.0 0.72 0.2 -2.71 0.35 -2.51 -1.52 0.07 -1.57 0.16 -1.24 -3.64 -2.38 1.35 1.21 1.14 0.89 -0.04 0.21 -0.71 0.62 0.3 -0.11 0.14
CRO21092 (rbfA)
0.07 -0.88 -0.67 -2.25 -1.35 0.35 0.52 -0.22 -1.68 0.94 0.03 0.16 0.17 0.33 1.38 -0.36 0.87 0.72 0.35 0.87 0.24 0.5 -2.05 -1.78 -1.05 -0.79 1.34 -1.34 0.3 -2.87 0.9 -0.39 -0.79 0.22 -1.09 -0.54 -4.38 -0.73 0.48 0.25 -2.09 -0.05 -1.7 -4.8 0.98 0.54 1.2 -0.99 -0.84 -4.16 0.99 -2.44 -0.17 0.74 1.15 -0.76 0.36 -2.82 -2.82 -0.07 -2.51 -0.01 -1.75 -3.46 -2.4 1.12 1.36 1.48 0.83 -0.4 -0.02 -1.49 0.62 -0.88 -0.36 0.23
CRO21120 (truB)
0.34 -1.41 -0.39 -1.2 -0.31 0.12 0.43 -0.3 -2.19 0.92 0.56 0.67 0.57 0.86 1.2 -0.14 -0.1 0.82 0.64 2.07 0.71 0.44 -2.35 -1.04 0.46 0.57 1.29 -0.9 -0.35 -1.58 1.04 -0.61 -1.29 0.4 -1.3 -0.44 -4.29 -0.47 -0.21 -0.02 -0.68 -0.29 -1.34 -4.34 0.32 -1.43 0.1 -1.0 -0.44 -4.04 -0.73 -0.47 -0.36 0.23 -0.05 -4.39 0.31 -2.69 -0.99 -0.29 -1.08 -0.21 -1.82 -3.62 -3.14 1.45 1.15 1.1 0.93 0.51 -0.32 -1.31 0.93 -1.69 -0.53 -0.25
CRO21175 (pnp)
-0.14 -0.56 -0.82 -1.96 -2.29 -0.34 -0.57 -0.34 -1.87 0.73 0.57 0.54 0.6 -0.23 0.22 1.25 2.03 0.76 -0.54 0.73 -0.63 0.41 -2.51 -0.78 -1.8 -1.21 0.93 -0.79 0.61 -1.75 0.6 -0.61 -2.25 1.26 -2.23 -0.32 -5.44 -0.29 0.55 0.43 -1.12 0.28 -1.84 -5.66 0.59 -2.04 0.43 0.08 0.03 -5.38 -1.71 -0.77 0.2 0.94 0.34 -0.59 -0.52 -2.05 -1.22 0.22 -1.12 0.26 -1.05 -3.48 -2.91 1.53 0.97 1.25 1.03 0.31 0.1 -0.63 0.69 0.6 -0.53 0.03
CRO21514 (pcnB)
0.71 -0.38 -0.5 -0.25 -0.88 0.16 -0.16 -0.37 -1.19 0.29 0.28 0.33 0.34 0.52 0.49 0.75 0.68 0.68 -0.36 0.95 0.04 0.15 -1.63 -1.15 -0.37 -0.22 0.49 -0.37 -0.15 -1.86 0.7 -0.4 0.08 0.08 -1.0 -0.96 -4.05 -0.4 -0.56 -0.52 0.15 0.61 -1.39 -3.82 0.35 -1.09 -0.37 -0.35 0.16 -3.79 -0.89 0.04 0.5 0.71 -0.38 -0.58 0.68 -2.45 -0.56 0.52 -0.53 0.58 -1.35 -2.04 -2.4 1.58 1.26 1.19 1.21 0.62 -0.4 -0.64 0.54 -1.16 -0.04 -0.12
CRO41503 (serC)
0.01 0.74 -0.25 0.27 0.11 -0.24 0.13 0.71 -0.85 0.69 0.68 0.76 0.73 0.01 0.16 1.19 0.89 0.6 0.21 0.2 0.16 0.52 -1.53 -0.1 -1.12 -1.01 0.32 -0.97 0.05 -2.14 0.49 -0.31 -0.22 -0.9 -1.31 -0.53 -3.51 -0.29 -0.05 -0.16 -0.51 0.53 -1.62 -3.71 -0.26 -0.95 -0.87 -0.55 -0.64 -3.53 -1.0 0.07 0.37 -0.54 -0.85 -1.36 0.22 -1.6 -0.74 0.49 -0.75 0.36 -0.88 -1.07 -0.99 -0.39 1.52 1.51 1.61 -0.75 0.47 -0.73 0.46 -0.27 -0.03 0.69
CRO41542 (pheA)
0.66 0.36 0.1 0.07 0.19 -0.57 -0.17 0.37 -0.58 0.62 0.8 0.92 0.81 -0.82 0.15 0.99 1.11 0.87 0.41 0.27 0.38 0.73 -1.55 0.21 -0.68 -0.74 0.45 -0.9 -0.08 -2.21 0.6 -0.14 -0.52 -0.61 -1.49 -0.23 -3.68 -0.68 0.54 0.48 -1.64 -0.44 -1.78 -3.66 0.1 0.08 -0.1 -0.14 -0.38 -3.7 -0.11 -1.39 -0.75 -0.05 -0.04 -0.64 0.59 -1.29 -1.88 -0.67 -1.73 -0.44 -0.45 -1.01 -1.01 -0.28 1.17 1.22 1.24 -0.11 0.33 -0.44 0.73 -0.34 0.01 0.59
CRO41561 (hisC2_1)
-0.12 -0.48 0.43 1.54 0.33 -1.27 -2.23 -1.19 -1.74 0.6 0.63 0.82 0.77 -1.56 -1.36 0.84 0.49 0.49 -0.76 -0.66 -0.72 0.48 -1.66 -0.89 -0.22 0.21 0.97 -1.47 0.07 -1.89 1.14 0.07 -0.38 0.07 -0.79 -0.96 -3.92 -0.3 -0.34 -0.33 -0.14 0.99 -1.87 -4.01 -0.37 -0.16 0.21 -0.41 -0.52 -3.65 0.58 -0.49 0.61 -0.11 -0.17 -4.5 1.02 -1.57 -0.92 0.43 -0.7 0.44 -0.87 -1.54 -1.22 0.28 1.75 1.6 1.66 -0.57 0.12 -0.94 0.41 -0.53 -0.13 -0.73
CRO41592 (aroA)
0.75 -0.2 -0.04 0.72 -0.05 0.04 -0.34 -0.56 -0.81 0.38 0.61 0.66 0.55 -0.61 0.1 0.94 0.7 0.61 -0.28 -0.24 -0.28 0.39 -1.68 -0.4 -0.37 -0.07 0.46 -1.08 0.13 -1.19 0.48 -0.26 -0.79 0.58 -1.39 -0.48 -3.19 -0.55 -0.09 -0.37 -0.69 0.07 -1.52 -3.34 -0.43 0.37 0.43 -0.42 -0.48 -3.05 1.23 -0.69 -0.03 0.06 0.31 -2.48 0.47 -1.43 -1.3 0.16 -0.9 -0.03 -0.72 -1.5 -0.87 0.45 1.66 1.31 1.53 -0.33 0.36 -0.55 0.5 -0.52 -0.26 -0.17
CRO41634 (cmk)
0.64 0.16 0.42 1.05 -0.73 -0.5 -1.23 -0.08 -1.14 0.47 0.55 0.68 0.59 -1.42 -0.32 0.78 0.18 0.46 -0.2 -0.46 -0.2 0.64 -0.61 -0.84 -0.19 -0.56 -0.81 -1.72 -0.94 -2.28 -0.68 -0.1 -0.42 -0.32 -1.04 -1.45 -3.34 0.55 -0.84 -1.48 0.14 0.39 -1.83 -2.98 -0.32 0.53 -0.06 -1.2 -1.21 -3.13 0.69 -0.03 0.24 -0.23 0.01 -5.68 0.52 -1.61 0.26 0.02 0.22 0.13 -1.17 -2.04 -1.44 0.27 1.94 1.58 1.87 -1.36 0.8 -0.78 0.46 1.15 0.62 0.14
CRO42519 (tyrB)
1.17 0.56 -0.44 0.39 -0.15 0.07 0.03 0.07 -0.76 0.53 0.77 0.76 0.61 -0.86 -0.32 1.01 1.13 1.06 -0.12 -0.57 0.76 0.79 -0.8 -0.27 -0.37 -0.44 0.28 -0.72 0.06 -1.11 0.63 -0.3 -0.08 -0.77 -0.5 -0.97 -2.98 -0.36 -0.75 -0.89 -0.51 0.01 -0.76 -3.04 0.14 -1.49 0.66 -0.68 -0.24 -2.91 -1.19 -0.47 -0.14 -0.74 0.54 -0.89 0.25 -1.72 -1.08 -0.3 -1.09 -0.29 -0.7 -1.96 -1.81 -0.47 1.41 0.95 1.24 0.11 0.01 0.4 0.95 -0.73 0.19 0.58
CRO43617 (purF)
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CRO47046 (plsX)
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CRO50994 (speA)
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CRO51232 (aroQ_1)
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CRO51416 (dus_3)
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CRO51451 (fis)
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CRO51482 (purH)
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CRO51514 (purD)
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CRO52581 (desA3)
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CRO53935 (rplI)
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CRO54025 (rpsF)
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CRO54162 (purA)
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CRO54195 (hisZ)
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CRO54864 (serB_1)
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CRO55966 (msbA)
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CRO62569 (ychF)
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CRO66814 (pheT)
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CRO66847 (pheS)
1.0 -0.32 -0.51 -0.97 -0.4 -0.55 0.03 -0.49 -1.26 0.31 -0.29 -0.25 -0.12 -0.67 0.15 0.62 1.38 0.29 -0.25 -0.37 -0.3 -0.34 -1.94 -0.66 -1.53 -1.42 0.9 -0.77 1.02 -1.17 0.91 -0.41 -1.16 0.03 -0.82 -0.98 -3.53 -0.24 -0.05 -0.48 0.04 0.65 -1.83 -3.74 0.18 -0.39 0.69 0.32 -0.25 -3.49 -0.32 0.16 0.53 1.08 0.58 0.99 0.25 -1.08 -0.37 0.58 -0.53 0.7 -0.49 -1.6 -1.46 0.73 0.59 0.76 0.71 0.85 0.34 -0.17 0.12 0.55 -0.51 -0.03
CRO66939 (thrS)
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CRO73415 (nusG)
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CRO73713 (rpsJ)
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CRO74663 (yajR)
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CRO88221 (rhlE_2)
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CRP09073 (rplM)
-0.49 -1.98 -1.0 -2.6 -3.62 -0.01 -0.01 -1.3 -2.53 0.1 -0.16 -0.21 -0.31 -1.14 1.05 -1.14 0.31 1.94 -1.44 -0.34 -1.4 0.64 -2.79 -3.49 0.24 1.15 1.73 -0.98 0.68 -2.42 1.59 -0.39 -2.33 -0.22 -0.08 -1.04 -5.26 -0.08 0.42 0.41 -1.96 -0.15 -1.67 -5.24 0.14 -1.81 2.01 0.02 0.16 -5.27 -0.87 -1.42 -0.06 0.2 1.99 1.28 0.67 -3.25 -2.72 -0.19 -2.48 -0.11 -0.78 -4.27 -3.59 0.5 0.71 0.38 0.63 0.99 -0.4 -1.9 1.82 -1.36 -0.59 0.34
-0.78 -1.11 -0.57 -1.8 -1.81 0.49 0.82 -1.92 -3.85 0.18 -0.51 -0.42 -0.57 -0.35 1.21 -0.84 -1.24 1.4 -2.08 -0.34 -2.07 -0.32 -1.38 -3.58 0.09 0.74 0.57 -1.65 -0.54 -2.93 0.58 -0.22 -0.17 -0.22 0.08 -0.15 -5.32 -0.13 0.64 0.83 -0.27 1.56 -2.23 -5.29 -0.02 -0.33 1.79 0.12 -0.75 -4.98 0.76 -0.02 1.34 0.15 1.72 -1.51 0.38 -3.67 -0.93 1.34 -0.87 1.36 -1.39 -4.18 -4.07 0.57 0.82 0.6 0.34 0.69 -0.48 -1.9 1.29 -2.16 -1.18 0.37
CRP09541 (murA)
0.67 -0.3 -0.34 -0.8 -0.88 0.52 -0.2 -1.04 -1.59 0.29 0.65 0.7 0.55 -0.47 0.64 1.06 -0.14 1.01 -0.51 0.04 -0.53 0.47 -1.35 -1.27 -0.08 0.26 1.05 -0.77 0.16 -1.27 1.09 -0.32 0.13 0.56 -1.03 -1.08 -3.81 -0.1 -0.78 -0.94 -0.4 0.4 -1.34 -3.97 -0.2 0.63 0.09 -0.02 0.17 -3.77 1.29 -0.21 0.25 0.24 0.11 -0.2 1.03 -1.99 -0.95 0.29 -0.75 0.29 -1.08 -2.48 -2.46 0.74 0.79 0.83 0.68 0.19 -0.63 -0.11 0.89 -1.05 -0.12 -0.69
CRP12875 (outO)
0.55 0.05 0.99 -0.81 -1.42 -0.07 -1.05 -0.35 -2.41 -0.06 -0.1 -0.02 0.09 0.12 -0.07 0.3 0.57 -0.22 -0.4 -1.03 -0.21 -0.34 -2.0 -1.71 0.17 0.21 1.27 -0.03 0.85 -1.21 1.49 -0.36 0.74 0.11 -1.41 -1.35 -3.67 0.18 -1.38 -1.39 0.78 -0.39 -1.78 -3.6 -1.09 -0.69 -0.43 -0.18 -0.16 -3.62 -0.26 0.9 -0.26 1.29 -0.51 -1.18 0.87 -1.57 0.58 -0.3 0.06 -0.3 -0.84 -2.47 -2.22 0.62 1.86 1.05 1.83 0.54 0.67 -1.37 -0.17 -0.1 -1.0 -0.61
CRP12903 (coaE)
0.69 0.45 0.76 -0.43 -0.49 0.18 -0.32 -0.22 -0.9 -0.01 0.35 0.49 0.58 -0.01 -0.21 0.33 0.86 0.05 -0.24 0.1 -0.3 0.34 -1.27 -0.53 0.46 0.45 0.61 0.3 0.4 -0.78 0.8 -0.33 0.86 -0.17 -1.14 -0.61 -1.74 0.03 -0.73 -0.43 0.45 -0.32 -1.05 -1.99 -0.75 -0.8 -0.49 -0.47 -0.4 -1.74 -0.59 0.64 -0.44 0.52 -0.62 -1.24 0.68 -1.43 0.16 -0.36 0.24 -0.38 -1.25 -1.5 -1.93 0.96 1.12 1.1 1.1 0.65 0.12 -0.74 0.01 -0.14 -0.23 -0.76
CRP22862 (deaD)
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CRP46065 (rho)
1.41 -0.6 -0.93 -1.49 -1.21 -0.43 -0.32 -0.17 -2.12 0.55 -0.21 -0.26 -0.28 -0.12 -0.33 -0.45 0.01 0.07 -1.01 -0.23 -1.02 0.11 -1.59 -1.51 -1.83 -1.42 0.85 -0.81 -0.48 -2.95 1.33 -0.9 -0.9 0.85 -1.43 -0.5 -4.96 -0.38 0.26 0.3 -0.31 1.48 -1.76 -5.36 1.38 -1.48 1.43 -1.13 -0.83 -4.53 -0.72 -0.37 1.17 -0.14 1.22 0.54 0.73 -3.24 -1.06 1.23 -0.74 1.19 -2.32 -3.23 -3.3 1.55 1.47 1.44 1.49 0.2 -0.21 -1.01 -0.04 -2.09 -0.87 -0.44
CRP48151 (typA)
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CRP48175 (thiI)
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CRP52158 (xseB)
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CRP53162 (sstT)
0.34 -0.57 -0.3 -0.98 -0.98 -0.49 -0.33 -1.68 -0.78 0.16 -0.09 -0.22 -0.41 -0.34 0.27 -1.19 0.23 0.68 -0.93 -0.38 -0.31 -0.18 -1.14 -2.78 -0.02 0.36 1.01 -0.71 -0.56 -0.96 1.08 -0.57 -1.53 -0.24 -0.99 -0.8 -5.37 -0.0 -0.22 0.66 1.34 1.25 0.08 -5.35 -0.12 -1.42 0.25 0.27 -0.34 -5.26 -0.94 1.56 1.45 0.27 0.3 -0.88 -0.65 -2.6 0.68 1.48 0.62 1.81 -1.55 -3.94 -3.38 1.26 0.44 0.67 0.17 -0.11 -0.13 -0.43 0.51 -1.53 -0.61 -0.19
CRP64092 (gyrA)
0.96 -0.13 -0.55 0.07 0.36 -0.07 -0.04 -0.03 -1.65 0.58 0.78 0.83 0.74 -0.33 0.08 1.5 0.4 0.75 -0.21 0.29 -0.28 0.55 -2.14 -0.46 -0.43 -0.23 0.66 -0.83 0.43 -1.55 0.85 -0.15 -0.48 -0.01 -0.95 -0.53 -3.11 -0.25 0.09 0.04 -0.98 -0.39 -0.81 -3.32 0.14 -0.64 -0.02 -0.0 0.1 -3.08 -0.32 -0.69 -0.57 0.08 0.01 -0.84 0.58 -1.43 -1.23 -0.57 -1.13 -0.53 -0.7 -1.68 -1.79 0.6 1.3 1.2 1.35 0.13 -0.02 -0.19 0.6 -0.26 0.2 -0.12
CRP64127 (mtnA)
0.46 0.27 -0.52 0.09 0.62 0.49 0.2 -0.29 -1.43 0.41 0.32 0.37 0.16 -0.49 0.58 0.96 0.58 0.51 -1.27 0.06 -0.97 0.18 -0.59 -1.14 0.96 1.11 0.58 -0.62 0.03 -0.96 0.56 -0.04 -0.23 -1.25 -0.3 0.18 -2.53 -0.52 0.49 0.34 -1.64 -0.83 -2.0 -2.66 -1.09 -0.54 -0.84 -1.09 -1.16 -2.45 -0.19 -1.09 -1.09 -0.32 -0.96 -1.58 0.81 -1.98 -1.8 -1.06 -1.63 -1.16 -0.89 -1.86 -1.79 -0.87 2.09 1.78 1.88 0.44 0.25 -0.2 0.38 0.13 0.78 0.55
CRP64156 (mtaD)
0.31 0.62 -0.61 0.68 1.17 -0.34 -0.42 -0.1 -0.18 0.35 0.54 0.64 0.48 0.25 0.05 1.08 0.49 -0.07 -0.01 0.24 0.34 0.33 -0.8 0.08 0.09 -0.07 -1.06 0.51 -0.54 0.0 -0.79 -0.38 -0.65 -0.96 -1.32 -0.12 -2.87 -0.88 -0.86 -0.46 -0.26 -0.51 -1.04 -3.02 -0.51 -1.12 -1.28 -1.02 -0.57 -2.87 -0.59 -0.31 -0.94 -0.5 -1.3 -0.39 0.51 -1.45 -0.27 -0.76 -0.56 -0.79 -1.47 -1.21 -1.88 0.26 2.12 1.81 2.1 0.09 0.3 -0.61 -0.15 -0.86 1.22 -0.38
-0.22 -1.73 -0.11 -2.89 -1.24 0.33 1.76 -0.65 -2.33 0.1 -0.75 -0.77 -0.91 0.84 1.12 -1.8 -2.3 -0.01 -1.69 -0.31 -1.09 -0.56 -1.31 -3.66 0.13 0.6 1.06 -1.29 -1.36 -1.66 0.92 -0.71 -0.07 -1.29 -1.45 0.41 -3.1 0.21 -0.55 0.23 1.61 1.74 -1.71 -3.36 -0.13 -1.35 1.68 -1.21 -1.54 -3.1 -0.82 1.55 1.73 -1.43 1.68 -2.33 -0.82 -3.96 1.11 1.67 0.57 1.93 -2.34 -3.6 -3.33 -0.23 -0.31 -0.33 -0.41 0.02 -0.67 -1.31 0.22 -3.37 -1.62 0.19
0.2 -1.24 0.23 -0.68 -1.33 0.16 0.16 -0.92 -0.57 -0.0 0.72 0.65 0.55 -1.08 0.73 -0.56 -0.33 0.65 -1.65 0.92 -1.6 0.69 -0.39 -1.3 0.91 1.15 1.31 -0.02 -0.95 -0.76 1.18 -0.45 -0.26 -0.4 -0.31 -1.19 -3.22 0.83 -1.8 -1.28 0.45 -0.56 -1.51 -3.6 0.54 -0.3 1.33 -0.07 -0.01 -3.52 0.7 0.53 -0.63 -0.14 1.23 -0.86 -0.28 -2.92 -0.09 -0.53 -0.31 -0.22 -1.84 -2.59 -3.02 0.73 1.1 0.39 0.84 0.95 -0.8 -1.96 0.64 -0.71 0.07 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.