Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	AES-1R,ASMDM+	AG1,ciproflaxin	D+7bld	DK2	E01	LB	LB,log	LB,untreated	PA1201	PA14	PA14,0.25xMIC G3KL	PA14,0.25xMIC T7	PA14,0.25xMIC polymyxin-B	PA14,LB	PA14,LB,log	PA14,WT	PA14,ciproflaxin	PA14,cmrA+	PA14,late stat,NaPyruvate+Arabinose	PA14,late stat,untreated	PA14,sutA-KO,late stat,NaPyruvate+Arabinose	PA14,untreated	PA212	PA2596	PA558	PA580	PAK,LB	PAK,WT	PAK,WT,LB	PAK,pilR	PAK,pmrB6,LB	PAO1	PAO1,0.56mg/mL farnesol	PAO1,ABTGC	PAO1,DDS	PAO1,GUN,LB,glucose	PAO1,HapZ,early stat	PAO1,LB	PAO1,LB,glucose	PAO1,LB,untreated	PAO1,M9-CA,early stat	PAO1,M9-CA,log	PAO1,RsmN+	PAO1,SagS,early stat	PAO1,WT	PAO1,WT,BHI	PAO1,WT,LB	PAO1,WT,MOPS acetate	PAO1,WT,MOPS glycerol	PAO1,early stat	PAO1,ersA,BHI	PAO1,lasR rhlR,M9-CA,early stat	PAO1,lasR rhlR,M9-CA,log	PAO1,liquid culture	PAO1,mexZ,LB	PAO1,oxylipin-	PAO1,pBAD-yhjH	PAO1,pUCP18::msr(E)	PAO1,qslA,M9-CA,early stat	PAO1,qslA,M9-CA,log	PAO1,qteE,M9-CA,early stat	PAO1,qteE,M9-CA,log	PAO1,untreated	PAO1,wspFpelApslBCD,LB	PAO1,wspFpelApslBCD,LB,untreated	Y31,LB	Y71,LB	Y82,LB	Y89,LB	ciproflaxin	liquid culture	m pheno	mexT	nirS	pHerdB20T-gp68	untreated
CRN79419 (pqiA_1)	0.48	0.3	0.54	0.22	1.0	0.72	0.24	0.15	0.15	0.52	0.72	0.75	0.73	0.59	0.39	0.34	0.42	0.4	0.37	0.66	0.58	0.65	0.23	0.38	0.3	0.44	0.37	0.32	0.28	0.38	0.44	0.27	0.3	0.09	0.24	0.09	0.13	0.24	0.12	0.16	0.27	0.2	0.1	0.14	0.25	0.19	0.26	0.06	0.06	0.14	0.22	0.27	0.21	0.18	0.19	0.04	0.16	0.26	0.19	0.22	0.21	0.2	0.23	0.12	0.1	0.44	0.95	0.57	0.54	0.5	0.11	0.3	0.47	0.33	0.59	0.15
CRP35118	0.0	0.1	0.11	0.0	0.6	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.07	0.0	0.08	0.05	0.08	0.05	0.13	0.08	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.25	0.11	0.15	0.06	0.0	0.11	0.0	0.13	0.23	0.0
CRP35149	0.0	0.05	0.05	0.0	0.71	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.0	0.06	0.05	0.08	0.03	0.1	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16	0.07	0.09	0.03	0.0	0.16	0.0	0.1	0.24	0.0
CRP35183	0.0	0.64	0.08	0.0	0.29	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.28	0.0	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.12	0.06	0.08	0.07	0.0	1.0	0.0	0.07	0.23	0.0
CRP35214	0.0	0.53	0.41	0.0	0.71	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.43	0.0	0.27	0.39	0.65	0.48	0.39	0.54	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.88	0.62	0.71	0.79	0.0	0.68	0.0	0.5	0.82	0.0
CRP35241	0.0	0.61	0.54	0.0	0.83	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.18	0.0	0.06	0.33	0.59	0.52	0.4	0.42	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.57	1.0	0.44	0.37	0.0	0.19	0.0	0.15	0.51	0.0
CRP41187 (prpR_2)	0.11	0.29	0.34	0.0	0.6	0.5	0.0	0.0	0.0	0.41	0.83	0.97	1.0	0.39	0.27	0.97	0.5	0.27	0.3	0.46	0.29	0.89	0.1	0.36	0.0	0.19	0.25	0.42	0.35	0.54	0.35	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.65	0.52	0.73	0.3	0.04	0.41	0.28	0.38	0.47	0.0
CRP41217	0.0	0.03	0.04	0.0	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.05	0.06	0.1	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.12	0.07	0.05	0.12	0.03	0.0	0.07	0.18	0.36	0.02	0.64	0.08	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.14	0.06	0.05	0.05	0.0	0.04	0.01	0.03	0.51	0.0
CRP41245	0.0	0.01	0.01	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.04	0.04	0.11	0.02	0.03	0.04	0.01	0.07	0.08	0.12	0.04	0.06	0.02	0.0	0.05	0.11	0.26	0.02	0.29	0.03	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.08	0.04	0.04	0.02	0.0	0.02	0.01	0.03	0.5	0.0
CRP41267 (acdA_6)	0.0	0.03	0.03	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.03	0.0	0.03	0.11	0.23	0.01	0.36	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.11	0.05	0.05	0.02	0.0	0.04	0.01	0.03	0.34	0.0
CRP41300 (gno)	0.0	0.02	0.02	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.0	0.03	0.07	0.15	0.02	0.15	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.03	0.03	0.02	0.0	0.04	0.01	0.03	0.37	0.0
CRP41330	0.0	0.07	0.07	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.15	0.13	0.14	0.15	0.24	0.06	0.15	0.04	0.03	0.24	0.63	0.29	0.12	0.09	0.12	0.0	0.08	0.17	0.44	0.06	0.52	0.08	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.22	0.08	0.09	0.08	0.01	0.09	0.03	0.14	0.57	0.0
CRP41362 (yjcH_2)	0.0	0.05	0.07	0.0	0.63	0.02	0.0	0.0	0.0	0.18	0.16	0.19	0.16	0.21	0.08	0.18	0.02	0.04	0.28	1.0	0.33	0.15	0.08	0.29	0.0	0.04	0.06	0.18	0.03	0.26	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.13	0.05	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.09	0.0
CRP41395 (actP_2)	0.0	0.05	0.07	0.0	0.1	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.08	0.07	0.07	0.16	0.04	0.14	0.01	0.02	0.33	1.0	0.33	0.06	0.12	0.15	0.0	0.03	0.04	0.15	0.02	0.25	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1	0.06	0.05	0.03	0.0	0.04	0.02	0.04	0.11	0.0
CRP41453 (glxR_1)	0.0	0.07	0.08	0.0	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.12	0.14	0.12	0.15	0.1	0.03	0.27	0.06	0.07	0.22	0.17	0.35	0.12	0.11	0.13	0.0	0.08	0.05	0.11	0.04	0.08	0.06	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.2	0.08	0.08	0.09	0.01	0.2	0.06	0.09	0.39	0.0
CRP41486 (ectB)	0.0	0.09	0.15	0.0	0.99	0.39	0.0	0.0	0.0	0.31	0.34	0.31	0.37	0.39	0.12	1.0	0.41	0.15	0.49	0.2	0.68	0.37	0.08	0.51	0.0	0.07	0.07	0.13	0.08	0.16	0.1	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.25	0.12	0.13	0.08	0.01	0.55	0.15	0.14	0.5	0.0
CRP41515 (prr)	0.0	0.1	0.14	0.0	1.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.33	0.37	0.33	0.38	0.66	0.16	0.73	0.17	0.12	0.45	0.51	0.61	0.31	0.1	0.35	0.0	0.09	0.07	0.14	0.07	0.21	0.09	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.21	0.11	0.1	0.07	0.01	0.46	0.13	0.1	0.5	0.0
CRP41546 (puuP_3)	0.0	0.17	0.27	0.0	1.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.3	0.38	0.36	0.3	0.6	0.17	0.37	0.18	0.1	0.48	0.67	0.62	0.29	0.18	0.28	0.0	0.08	0.08	0.34	0.07	0.4	0.12	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.24	0.14	0.16	0.14	0.02	0.2	0.12	0.22	0.45	0.0
CRP41568 (dhaT_2)	0.0	0.09	0.2	0.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.19	0.0	0.17	0.12	0.2	0.05	0.29	0.17	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.36	0.17	0.21	0.15	0.0	0.4	0.0	0.15	0.4	0.0
CRP41600 (rutD)	0.0	0.32	0.8	0.0	0.8	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.19	0.0	0.25	0.09	0.16	0.08	0.17	0.16	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.54	0.38	0.25	0.15	0.0	1.0	0.0	0.11	0.35	0.0
CRP41629 (ethA_1)	0.0	0.4	0.66	0.0	0.94	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.35	0.0	0.18	0.16	0.27	0.15	0.35	0.21	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.47	0.32	0.34	0.27	0.0	1.0	0.0	0.24	0.41	0.0
CRP41660	0.0	0.47	0.38	0.0	0.39	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.25	0.0	0.57	0.48	0.5	0.25	0.45	0.48	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.48	0.48	0.42	0.61	0.0	0.27	0.0	0.28	0.52	0.0
CRP41687	0.0	0.12	0.19	0.0	1.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.09	0.0	0.04	0.12	0.09	0.17	0.09	0.16	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.29	0.22	0.21	0.24	0.0	0.26	0.0	0.11	0.18	0.0
CRP41754 (puuB_9)	0.0	0.26	0.27	0.0	1.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.22	0.0	0.19	0.25	0.22	0.14	0.16	0.33	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.44	0.32	0.34	0.3	0.0	0.3	0.0	0.23	0.33	0.0
CRP41783	0.0	0.33	0.3	0.0	1.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.32	0.0	0.03	0.09	0.17	0.07	0.17	0.18	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.1	0.17	0.12	0.15	0.0	0.17	0.0	0.07	0.59	0.0
CRP41810	0.0	0.07	0.07	0.0	1.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.06	0.0	0.04	0.06	0.2	0.06	0.29	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.13	0.09	0.08	0.06	0.0	0.24	0.0	0.06	0.25	0.0
CRP41841	0.0	0.15	0.14	0.0	1.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.17	0.0	0.09	0.1	0.26	0.14	0.39	0.14	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.23	0.14	0.13	0.12	0.0	0.23	0.0	0.13	0.32	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)