Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
ATCC_14028
SL1344
ATCC_14028,E-stationary,WT
14028s
ATCC_14028,Log,rpsL*_mut
14028s,mLPM
opgGH_mut
LT2
Florfenicol
NCTC_12023,37_C
Chlortetracycline
SL1344,NarS_defic
ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut
LT2,ridA
fliA_del
High-patho
LT2,Cell_susp_cult
14028s,hilC_del,pBAD24
14028s,sprB_del,pBAD24
14028s,pBAD24
gastro
hfq_mut
Low-patho,42C
plank_cells
ATCC_14028,gastro
Typh_14028s,Expo_phase
biofilm,cpxR_mut
14028s,typhoid
14028s,rtcR
Typh_14028s
infection
ATCC_14028,Log,WT
14028s,rtcB
High-patho,42C
LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C
plank_cells,cpxR_mut
biofilm
ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut
ATCC_14028,Log,rpsD*_mut
AAL19174 (cdaR)
-1.38 0.51 -0.9 -0.6 2.18 -1.79 -2.77 -0.49 0.91 -0.5 0.75 -1.53 -0.31 -1.4 1.29 -0.89 1.75 -0.82 -1.17 -0.54 -1.15 -1.21 0.99 0.45 -1.38 -1.64 -1.01 0.83 -1.16 -3.79 -1.67 -0.97 -1.49 -0.43 1.44 -0.29 1.02 -0.82 -0.57
AAL19569 (citT)
-1.02 0.43 -1.4 -2.39 -2.02 -1.8 -0.87 0.39 -0.03 -1.89 1.03 -1.61 -0.67 1.32 -1.25 -0.71 -1.58 -1.91 -1.31 -1.12 -1.21 0.91 -0.71 1.25 -1.0 -1.02 2.97 0.5 -1.82 -1.92 -1.5 -1.55 -1.61 -1.02 -0.07 -0.11 2.26 -2.29 -1.11
AAL19570 (citG)
-0.95 0.96 -0.31 -1.62 -3.07 -2.83 -1.54 -0.91 -0.51 -0.63 0.56 -1.69 -0.61 -1.56 -1.34 -1.96 -0.8 -0.49 -0.75 -0.41 -1.87 -0.5 -2.74 0.44 -1.05 -1.41 3.51 0.93 -1.76 -4.18 -1.72 -1.8 -1.87 -1.46 0.08 0.94 2.33 -2.31 -1.28
AAL19571 (citX)
-0.16 0.63 -3.01 -2.34 -4.01 -4.59 -1.33 -0.07 -0.52 -2.66 0.59 -1.24 -2.38 -3.27 -2.37 -3.35 -3.27 -3.5 -3.04 -2.95 -2.82 -1.61 -2.55 0.09 -2.28 -3.45 3.97 0.61 -3.77 -4.69 1.19 -4.54 -3.03 -1.94 -3.48 1.17 2.67 -4.33 -2.83
AAL19572 (citF)
-1.04 -0.34 -3.59 -2.67 -3.24 -5.2 -1.93 -1.06 -0.56 -3.06 0.36 -2.08 -3.4 -3.05 -1.92 -3.79 -3.97 -3.24 -3.52 -3.21 -3.08 -3.0 -1.75 1.22 -2.83 -4.42 4.08 0.67 -3.57 -6.15 -2.99 -3.59 -3.35 -2.2 -3.6 1.59 2.96 -4.59 -1.87
AAL19573 (citE)
0.05 -0.06 -2.22 -1.93 -2.73 -3.59 -1.33 -0.69 -0.03 -1.7 0.67 -1.53 -2.41 -0.66 -1.38 -3.24 -2.18 -2.8 -3.07 -2.54 -2.65 -1.09 -2.3 0.8 -2.05 -2.29 3.86 0.54 -2.73 -4.48 -2.37 -2.45 -2.56 -2.32 -2.67 1.85 2.54 -3.2 -1.18
AAL19574 (citD)
0.12 -0.42 -3.51 -2.28 -2.38 -5.53 -1.18 -0.73 -0.22 -2.82 0.92 -2.54 -2.79 -1.71 -1.19 -2.61 -3.39 -3.94 -4.3 -3.76 -3.18 -2.1 -1.35 0.99 -1.91 -4.07 3.86 0.32 -3.02 -7.19 -2.98 -2.79 -3.2 -1.48 -3.94 2.14 2.75 -4.18 -1.95
AAL19575 (citC)
1.0 0.33 -3.03 -1.81 -2.34 -5.29 -0.91 0.39 -0.46 -2.87 0.77 -2.97 -3.32 -2.85 -1.24 -0.94 -1.47 -2.33 -3.15 -2.78 -2.34 -1.8 -0.74 2.48 -1.29 -4.11 2.23 -0.0 -3.14 -5.95 -3.87 -3.25 -3.18 0.12 -2.99 1.74 3.39 -3.83 -2.1
AAL19577 (dpiA)
-0.65 0.05 -0.45 -0.38 -0.6 -2.87 -0.27 0.36 -0.22 0.39 -0.02 0.79 -0.45 -0.49 -0.32 -1.04 -0.35 0.25 -0.09 0.22 -1.56 -0.65 -1.61 0.94 -1.24 -0.84 0.53 -0.21 0.65 -3.31 -1.54 -0.59 0.91 -0.96 -0.59 -0.41 2.57 -0.73 0.75
AAL19684 (cydA)
-1.15 0.42 0.53 0.27 0.04 -0.9 -1.26 -0.23 0.54 1.06 -0.58 -0.31 0.52 -1.95 0.92 0.27 -2.24 0.65 0.62 0.91 -2.18 -0.65 0.26 -0.17 -2.41 -1.33 0.11 0.46 0.73 -3.93 0.15 0.16 0.35 0.44 -2.63 -0.1 0.08 -0.3 0.27
AAL19685 (cydB)
-1.1 0.44 1.31 0.33 -0.01 -0.37 -1.27 -0.09 0.52 1.05 -1.01 0.27 1.15 -1.26 0.91 0.26 -3.2 -0.1 -0.2 0.3 -1.74 -1.18 -0.08 0.06 -2.26 -1.21 0.26 0.11 0.6 -4.03 0.47 0.29 0.13 -0.05 -3.5 0.14 0.23 -0.07 0.06
AAL19687 (ybgE)
-0.57 0.82 0.53 -0.01 0.03 -0.78 -0.96 -0.31 -1.01 0.58 -2.1 -0.03 0.95 -1.19 -0.48 0.62 -3.0 -0.29 0.11 0.1 -0.98 1.06 0.41 0.35 -1.08 -1.59 0.58 0.42 1.14 -2.09 -1.01 0.25 0.81 0.25 -2.73 0.21 0.39 -1.15 0.4
AAL19899 (dmsA)
-2.64 0.17 -0.92 0.19 -1.18 -3.7 -3.15 -0.32 0.01 1.44 -0.11 1.12 -0.09 -4.8 2.22 0.34 -5.26 1.06 0.88 1.41 -5.21 -4.4 1.1 -0.3 -4.29 -5.15 -1.37 1.81 -2.96 -7.2 1.07 -0.63 -3.53 1.09 -5.22 -1.17 -0.58 -1.47 -0.66
AAL19900 (dmsB)
-2.56 0.26 -1.3 0.56 -2.23 -4.04 -2.76 -0.21 -0.47 1.34 -0.93 1.53 -0.42 -4.53 2.15 -0.63 -5.67 1.85 1.68 2.13 -4.97 -5.7 0.23 -0.24 -4.25 -5.0 -1.59 1.6 -2.94 -8.64 0.85 -1.69 -3.64 0.1 -4.95 -2.32 -0.05 -3.07 -0.99
AAL19901 (dmsC)
-2.05 0.52 -1.68 -0.6 -3.1 -4.39 -2.59 -0.51 -0.55 0.66 -1.14 2.02 -0.69 -2.87 1.23 0.51 -4.49 1.28 0.95 1.55 -0.1 -1.29 1.21 0.51 -1.4 -4.26 -0.81 1.74 -1.94 -7.86 0.88 -2.35 -2.45 0.78 -3.75 -1.53 1.11 -3.1 -1.44
AAL20353 (sodB)
-0.96 0.04 0.62 -0.08 0.02 -4.72 -0.21 -0.42 -0.42 1.38 -1.16 -1.14 0.56 -3.34 0.7 0.7 -0.87 0.53 0.66 0.95 -3.79 -1.06 1.51 -1.12 -1.48 -1.89 -1.21 0.79 -0.7 -1.78 1.21 0.09 -0.55 1.3 -1.35 -1.0 -1.87 0.4 0.21
AAL20411 (STM1492)
-1.02 0.03 1.14 -0.91 -0.96 -2.45 1.26 -0.72 -1.84 -1.16 -0.87 -3.37 0.83 -0.77 -2.45 0.51 -2.54 0.01 -0.46 -0.29 -1.74 0.0 -2.38 3.16 -1.15 -0.44 -2.33 -0.11 -1.84 -3.13 -0.15 -1.14 -1.8 -0.14 -1.12 -1.84 2.3 0.2 -1.03
AAL20473 (STM1555)
-0.6 0.9 0.37 -0.84 0.11 -2.02 -1.34 0.49 -1.05 0.36 -0.32 -0.54 0.42 1.26 -0.21 0.97 -0.97 -0.13 -0.22 0.17 -1.08 0.28 1.3 -1.12 -0.02 0.37 -0.59 0.22 -0.43 -2.55 -0.03 0.25 -0.29 0.59 -0.98 -0.69 -0.76 0.16 0.41
AAL20650 (ompW)
-0.87 0.09 1.32 -1.27 -2.45 -4.09 -3.05 -0.81 -0.81 -1.37 -1.08 0.16 1.63 -5.57 0.92 0.8 -3.15 1.2 1.05 1.76 -5.07 -4.52 2.05 -1.85 -4.04 -3.59 -0.5 1.44 -1.32 -8.05 1.22 -1.66 -0.93 1.63 -4.72 -0.28 -2.12 -1.34 -2.29
AAL20934 (cbiT)
-1.87 0.34 -0.19 0.36 -0.93 -2.48 -3.49 0.01 -0.96 1.01 -1.38 1.35 0.79 -2.38 3.04 -0.63 -2.76 -1.04 -1.6 -0.89 -2.88 -2.71 0.93 -0.52 -2.49 -2.53 -0.14 1.37 0.54 -6.56 0.1 -0.81 1.08 -0.03 -2.49 -2.91 0.13 -1.29 -0.04
AAL20935 (cbiE)
-2.1 0.56 -0.05 0.48 -0.53 -1.8 -3.42 0.36 -0.66 1.1 -1.18 1.41 0.75 -2.28 2.46 -0.92 -2.79 -1.13 -1.68 -0.89 -2.47 -2.83 0.17 -0.58 -2.33 -2.2 0.34 1.64 0.89 -5.27 0.03 -0.37 1.4 -0.51 -3.23 -2.24 0.0 -1.26 0.73
AAL20936 (cbiD)
-1.94 0.16 0.26 0.45 -0.35 -2.13 -3.12 0.28 -0.73 0.8 -1.04 1.06 0.81 -1.74 2.07 -0.23 -2.62 -1.06 -1.44 -0.72 -2.85 -2.1 1.39 -0.51 -2.74 -2.2 -0.19 1.41 0.5 -5.36 -0.07 0.01 0.94 0.54 -2.79 -2.23 0.26 -1.04 1.43
AAL20937 (cbiC)
-1.88 0.46 0.38 0.35 -0.12 -2.16 -3.31 -0.27 -0.71 1.1 -1.17 1.12 0.59 -2.31 1.65 -0.33 -2.6 -1.35 -1.65 -1.08 -2.73 -2.28 1.16 -0.77 -1.83 -1.97 0.06 1.2 0.75 -5.7 -0.22 0.47 1.21 0.34 -3.02 -1.91 -0.23 -0.89 1.99
AAL20938 (cibB)
-1.05 0.65 0.2 0.06 0.41 -2.95 -3.45 -0.13 -0.54 0.55 -0.71 0.75 0.51 -1.51 1.63 -1.19 -1.9 -1.66 -1.85 -1.34 -2.18 -1.3 -0.61 0.35 -1.46 -1.88 -0.1 1.19 0.35 -5.08 0.06 0.93 0.79 -1.06 -1.96 -2.0 0.54 -0.59 2.53
AAL20939 (cbiA)
-2.08 -0.03 -0.34 0.0 0.89 -3.73 -3.42 -0.05 -0.57 0.53 -0.92 0.14 0.56 -2.62 2.2 -0.4 -2.13 -1.38 -1.72 -1.05 -2.55 -2.84 0.46 -0.33 -1.69 -2.8 -0.62 0.79 0.34 -6.8 -0.11 1.38 1.03 0.21 -2.47 -2.07 0.12 -0.62 2.43
AAL21104 (lysP)
0.06 -0.01 -1.24 -0.4 -1.33 -1.24 -0.28 1.1 -1.25 -1.79 -1.96 -0.14 -0.36 2.26 -0.53 -1.08 -1.05 1.41 1.53 1.62 -1.65 -1.62 -1.56 0.34 -1.4 -0.76 0.38 -0.27 0.62 -2.44 -1.09 -1.11 0.78 -1.2 -0.78 -0.73 0.75 -1.5 -0.15
AAL21185 (glpA)
-0.38 1.75 -0.4 0.61 -7.43 -1.17 -2.68 -2.04 0.97 -5.74 0.47 2.27 0.86 -5.86 2.48 -2.31 -2.6 -4.24 -4.86 -4.82 -3.13 -0.29 -2.7 0.9 -1.64 -1.64 -1.94 -0.73 -2.98 -5.22 2.23 0.04 -2.92 -7.44 -2.03 0.86 0.5 -0.19 -0.28
AAL21793 (STM2913)
-1.88 0.21 0.13 0.14 -1.69 -0.45 -2.13 -0.54 -0.09 -0.21 -0.88 -2.85 -0.28 -0.61 -1.44 -1.27 0.08 1.64 0.97 2.15 -1.0 -1.32 -1.22 0.56 -1.69 -1.58 -1.8 2.09 -1.69 -1.29 -1.32 -1.67 -1.72 -2.03 2.03 -1.52 1.45 -1.07 -1.1
AAL21794 (STM2914)
-3.27 0.01 0.05 0.26 -3.01 -0.19 -4.15 -1.4 -0.07 0.12 -1.45 -4.86 -1.11 -2.55 -2.9 -1.6 0.57 1.66 1.36 2.23 -1.63 -1.93 -0.67 0.47 -2.14 -1.26 -2.05 1.62 -2.6 -1.5 -3.99 -2.66 -2.41 -2.18 2.9 -1.53 1.5 -1.8 -2.75
AAL21795 (ygbM)
-2.6 0.17 0.36 0.75 -2.24 0.14 -3.72 -0.71 0.72 -0.42 -0.53 -3.13 -0.81 -1.77 -1.05 -1.48 0.45 1.96 1.53 2.21 -1.35 -1.34 -0.89 0.03 -1.88 -0.41 -1.78 1.29 -2.05 -1.54 -2.75 -2.37 -1.78 -2.27 2.36 -1.75 0.45 -0.88 -2.3
AAL21796 (ygbL)
-3.63 -1.01 -0.79 0.33 -3.72 -0.8 -4.38 -1.47 -0.07 -1.47 -1.33 -3.9 -2.56 -2.33 -1.87 -2.66 1.43 2.33 2.04 2.47 -2.59 -2.76 -2.46 -0.09 -2.95 -1.59 -3.01 0.34 -2.84 -2.15 -3.64 -3.5 -2.91 -3.51 3.23 -2.84 0.81 -2.17 -3.97
AAL21797 (ygbK)
-2.97 -0.36 0.05 0.78 -2.88 0.29 -5.1 -0.78 1.17 -0.57 -0.69 -3.35 0.12 -2.72 -1.6 -2.44 1.08 1.98 1.92 2.08 -1.43 -1.86 -1.95 -1.31 -2.1 -0.13 -2.4 1.15 -1.49 -0.63 -3.84 -2.98 -1.47 -3.42 2.55 -2.1 -0.66 -1.38 -1.78
AAL21798 (ygbJ)
-3.07 -0.73 0.06 0.49 -3.2 -0.62 -5.31 -1.24 0.77 -1.29 -1.5 -4.84 0.61 -2.58 -1.89 -3.3 1.13 2.39 2.09 2.53 -1.25 -2.34 -2.76 -1.13 -1.82 -0.46 -2.67 1.01 -0.57 -1.61 -3.92 -2.58 -0.48 -4.36 2.21 -2.46 -0.5 -2.3 -1.05
AAL21839 (STM2959)
-0.58 0.84 0.61 -0.02 0.93 -1.29 -0.49 0.24 0.07 -0.21 -0.48 -0.73 1.03 0.09 -0.27 -0.83 -0.71 0.06 -0.38 0.18 0.63 -0.54 -0.58 -0.79 0.59 -1.09 0.32 1.52 -0.41 -3.61 0.1 0.23 -0.54 -1.08 -1.31 0.13 -0.5 -0.26 0.73
AAL21840 (gudD)
-2.14 0.05 -0.39 0.55 3.06 -0.53 -1.24 -0.82 0.94 0.58 -0.28 -1.76 -0.66 -0.81 0.61 -1.53 0.58 -0.49 -0.78 -0.39 -1.58 -1.87 0.59 -2.09 -1.41 -1.45 0.11 2.32 -1.36 -3.62 -1.47 -0.76 -1.66 -2.38 -0.77 -0.72 -1.28 -0.72 0.03
AAL21841 (ygcY)
-2.29 0.3 -1.22 0.13 3.7 -1.11 -1.15 -1.09 0.52 -0.47 0.06 -3.49 -0.95 -1.2 1.31 -2.93 0.86 -0.66 -1.25 -0.71 -2.02 -1.74 0.29 -2.47 -1.86 -2.24 -0.29 2.02 -2.18 -3.63 -2.44 -0.94 -2.4 -3.65 -0.7 -1.29 -1.77 -1.39 0.01
AAL21842 (gudT)
-2.79 0.53 -1.74 -1.17 4.03 -1.75 -1.83 -1.67 0.58 -1.02 0.2 -4.46 -1.03 -2.39 -0.52 -2.61 0.72 -1.36 -1.65 -1.1 -2.9 -1.6 2.02 -3.98 -2.38 -3.0 -0.92 1.71 -3.74 -4.85 -2.66 -0.82 -3.83 -2.47 -0.7 -2.07 -2.52 -1.35 -0.52
AAL21889 (lysA)
0.59 -0.05 -2.04 -0.63 -3.7 -1.12 -0.72 1.26 -3.21 -2.65 -2.54 -2.39 -2.09 2.04 -0.78 -2.54 -2.11 2.13 2.4 2.23 -2.14 -2.02 -4.85 -0.31 0.4 -1.59 -2.16 0.83 0.87 -5.47 -2.29 -1.74 0.81 -4.67 -1.57 -2.89 0.7 -2.2 -1.45
AAL22017 (hybG)
-0.88 -0.64 -1.91 -0.62 -1.75 -3.23 -0.68 0.05 -0.75 0.15 -1.21 0.92 -0.72 -1.29 1.86 0.15 -1.44 1.53 1.03 1.81 -2.99 -1.74 2.13 -0.73 -3.17 -2.85 -0.8 0.85 -0.58 -3.39 0.05 -1.1 -0.44 1.5 -0.73 -2.47 -0.09 -2.61 -0.97
AAL22018 (hybF)
-0.76 0.27 -1.36 -0.32 -1.0 -2.67 -1.12 0.2 -0.12 0.44 -0.06 2.03 0.26 -0.51 1.22 -0.84 -2.6 1.07 0.88 1.46 -2.39 -1.31 0.52 -0.72 -2.76 -2.23 -0.03 1.17 0.25 -4.88 0.84 -0.37 0.51 -0.28 -1.52 -1.64 -0.41 -1.61 -0.37
AAL22019 (hybE)
-0.95 -0.19 -1.37 -0.24 -1.48 -2.69 -2.21 0.07 0.1 0.78 -0.27 1.85 -0.34 -0.94 1.0 -0.1 -3.04 0.36 0.5 1.08 -3.57 -2.09 1.66 -0.39 -3.27 -2.15 -0.24 1.17 0.69 -4.53 0.73 -0.68 0.78 0.98 -2.39 -1.72 0.6 -1.85 -0.73
AAL22020 (hybD)
-0.85 0.05 -0.77 -0.3 -0.95 -2.81 -1.94 -0.02 -0.11 0.99 -0.39 1.31 0.07 -1.61 0.82 0.12 -1.91 0.58 0.99 1.27 -3.69 -1.03 2.1 -1.28 -3.75 -2.25 -0.91 1.05 0.15 -4.42 0.54 -0.38 0.33 1.2 -1.41 -2.26 -0.94 -1.04 -0.21
AAL22021 (hybC)
-1.25 -0.08 -1.0 -0.02 -0.84 -2.93 -1.71 -0.02 0.11 1.05 -0.28 1.4 -0.28 -1.35 1.26 -0.37 -2.05 0.97 1.06 1.43 -3.65 -1.63 1.6 -0.89 -3.5 -2.33 -0.57 0.86 0.46 -5.13 0.66 -0.47 0.46 0.62 -1.39 -1.65 -0.5 -1.04 -0.1
AAL22022 (hybB)
-1.52 -0.26 -1.73 -0.46 -0.56 -4.25 -2.81 -0.94 -0.44 0.46 -1.44 1.28 -0.48 -3.4 1.16 0.62 -3.65 0.59 0.46 0.89 -5.04 -3.32 2.63 0.52 -4.22 -3.56 -0.79 0.6 0.29 -6.25 0.33 -0.46 0.34 1.75 -2.44 -2.25 0.31 -1.07 0.16
AAL22023 (hybA)
-1.57 -0.83 -2.26 -0.18 -1.1 -4.28 -2.87 -0.8 -0.9 0.51 -2.05 0.46 -0.21 -4.7 1.63 0.68 -4.19 1.58 1.4 1.76 -5.6 -3.72 2.5 -1.64 -5.05 -4.47 -1.52 0.39 -0.23 -7.0 0.04 -0.85 -0.09 2.09 -3.45 -2.75 -0.95 -1.29 -0.09
AAL22024 (hypO)
-1.18 -0.82 -0.82 -0.34 -0.66 -3.56 -2.7 -0.62 -0.65 0.81 -0.74 0.33 0.11 -3.87 1.16 0.76 -3.51 1.51 1.61 1.85 -5.46 -3.24 2.23 -1.03 -4.64 -4.26 -1.62 0.27 -0.34 -6.47 0.4 -0.42 -0.13 1.71 -3.29 -2.18 -0.82 -0.87 -0.4
AAL22117 (tdcB)
-1.8 -1.11 -4.41 0.86 -0.67 -4.33 -4.99 0.83 0.58 -0.79 0.93 -1.94 -3.93 -7.6 3.89 -2.84 -2.12 -3.18 -3.27 -2.72 -7.1 -8.18 1.43 -1.2 -4.85 -6.67 -3.11 1.3 -7.07 -7.51 -1.7 0.68 -6.63 -1.49 -1.93 -5.5 -0.62 -3.48 2.32
AAL22118 (tdcA)
-1.3 -0.28 -2.59 -0.16 1.54 -3.44 -4.19 1.29 1.72 0.89 1.79 -1.73 -1.88 -4.58 1.95 -0.68 -1.96 -2.71 -3.18 -2.11 -4.8 -2.77 2.13 -0.14 -2.03 -3.98 -2.99 1.2 -5.0 -3.49 -0.84 0.96 -5.04 0.13 -2.05 -3.23 0.63 -0.56 1.16
AAL22119 (garK)
-2.61 0.38 -0.93 0.82 2.79 -1.46 -2.64 -1.26 0.46 -0.28 -0.44 -2.49 -1.34 -1.72 1.55 -2.55 1.12 -0.53 -0.93 -0.32 -1.59 -2.65 -0.7 0.42 -1.31 -2.53 -0.69 2.26 -3.3 -4.52 -1.89 -0.58 -3.17 -3.04 -1.98 -1.3 1.89 -1.41 0.85
AAL22120 (garR)
-3.41 -0.1 -0.37 1.21 2.85 -0.45 -3.46 -1.88 1.49 0.79 0.52 -2.81 -1.23 -2.83 1.54 -3.43 2.03 -1.24 -1.75 -1.0 -2.22 -3.19 -1.22 -1.48 -1.62 -2.23 -0.56 2.17 -3.11 -3.23 -2.63 -0.38 -3.53 -4.21 -3.1 -1.33 0.31 -1.28 0.38
AAL22121 (garL)
-3.14 0.57 -0.88 0.39 3.54 -0.96 -3.74 -2.03 1.53 0.18 0.75 -3.09 -0.91 -3.29 0.52 -3.79 1.01 -1.71 -2.08 -1.44 -1.71 -2.89 -0.37 -1.13 -0.82 -2.39 -0.3 1.71 -3.66 -3.5 -2.43 0.43 -3.63 -4.54 -2.58 -1.77 0.28 -1.07 0.8
AAL22122 (garD)
-2.41 0.55 -0.83 0.01 3.81 -1.17 -3.96 -1.63 0.56 -0.48 0.33 -2.74 -0.88 -1.85 0.13 -2.98 0.0 -1.3 -1.51 -1.15 -2.32 -2.6 -0.68 -0.53 -0.69 -2.39 0.36 1.46 -2.6 -4.91 -1.56 0.58 -2.62 -3.08 -2.53 -1.76 0.64 -0.82 0.68
AAL22375 (malQ)
-2.09 -0.27 -0.0 0.6 -0.4 -2.15 -2.09 0.69 -0.54 -1.3 -1.1 0.72 0.11 -1.17 1.65 -1.73 1.72 -1.16 -1.2 -0.98 -0.69 -1.88 -0.62 1.78 -1.2 -1.39 -0.99 -0.84 -0.61 -4.02 -1.68 -1.22 -0.91 -2.0 2.78 -1.32 0.96 -0.84 -0.2
AAL22376 (malP)
-3.27 -0.98 -1.89 0.68 -1.03 -3.61 -2.98 1.31 -0.65 -1.98 -1.25 0.31 -1.78 -1.69 2.08 -2.67 2.44 -1.67 -1.82 -1.59 -3.11 -3.04 -0.25 1.62 -3.14 -2.98 -2.36 -1.84 -1.06 -5.53 -2.29 -1.59 -1.53 -2.18 3.32 -2.8 0.88 -2.35 -0.34
AAL22377 (malT)
-1.49 -0.43 0.42 -0.15 1.77 -2.76 -2.06 0.63 -0.01 -0.02 -0.48 -0.18 0.74 -0.24 1.07 -0.95 0.85 -1.59 -1.76 -0.96 -1.56 -2.21 -0.9 -0.52 -1.51 -1.36 -2.49 0.66 -1.05 -3.76 -1.07 1.39 -0.37 -0.58 1.65 -1.49 -1.16 0.7 1.89
AAL22452 (yhiP)
-1.2 -0.3 -0.69 0.27 1.37 -2.12 -3.21 -1.87 1.05 0.26 0.6 -1.65 -0.27 -3.87 1.44 0.15 -0.17 -0.27 -0.23 0.12 -6.07 -1.89 1.07 -0.61 -4.57 -2.82 -2.15 1.07 -4.37 -3.24 -0.46 1.54 -4.45 1.38 0.66 -1.85 0.01 0.14 1.73
AAL22653 (ilvN)
-0.26 -0.52 0.26 -0.54 1.13 0.24 -2.38 0.09 -0.33 0.04 0.02 -2.16 0.0 0.69 -1.6 -0.37 -1.06 0.37 0.56 0.97 -2.23 -1.2 -1.33 0.21 -2.2 0.66 -1.84 0.14 0.57 -2.97 -1.64 -0.72 -0.34 -1.08 -0.59 -1.56 1.27 2.52 -0.69
AAL22654 (ilvB)
-0.54 -0.51 0.21 -0.5 1.08 0.22 -3.36 0.12 -0.35 -0.38 -0.09 -3.03 0.18 0.66 -0.81 -1.49 -1.68 1.22 1.3 1.73 -2.75 -1.27 -2.74 -0.03 -2.3 1.08 -1.93 0.12 0.3 -4.87 -1.99 -0.8 -0.35 -2.25 -1.08 -1.86 0.68 2.35 -0.49
AAL23051 (malG)
-0.54 0.17 -0.63 -0.09 0.21 -1.17 -0.79 1.21 0.4 -1.67 0.32 -0.8 -0.64 0.76 1.17 -1.81 1.83 -1.65 -1.25 -1.28 -0.36 0.76 0.7 1.12 -0.1 -1.18 -1.76 -1.14 -0.87 -4.08 -2.14 -1.04 -0.99 -1.98 2.25 -1.69 0.65 -1.97 -0.45
AAL23052 (malF)
-2.28 -0.47 -2.25 0.64 -0.36 -3.31 -2.8 1.3 0.38 -1.97 0.08 -0.73 -1.71 -1.72 2.46 -2.43 2.08 -2.62 -2.75 -2.33 -3.14 -2.28 2.12 1.65 -2.49 -3.41 -2.09 -2.15 -2.54 -4.93 -3.28 -1.76 -2.91 -0.27 2.42 -2.44 1.06 -2.92 -0.45
AAL23053 (malE)
-4.55 -1.88 -3.21 0.75 -0.7 -2.9 -6.01 1.81 0.43 -2.07 0.01 -1.71 -2.29 -4.34 2.64 -4.66 2.79 -5.58 -5.64 -4.89 -7.01 -4.01 1.0 1.09 -5.99 -5.37 -3.28 -3.73 -4.32 -5.21 -4.89 -1.96 -5.02 -1.92 3.24 -4.1 0.1 -4.53 -0.83
AAL23054 (malK)
-4.92 -1.33 -4.98 0.35 0.4 -3.48 -7.73 1.24 1.1 -3.41 0.42 -0.23 -2.81 -3.17 2.82 -5.19 1.84 -6.77 -8.1 -7.14 -7.31 -5.54 1.18 2.66 -5.51 -5.35 -2.7 -3.97 -3.24 -6.22 -6.16 -1.43 -3.75 -1.49 2.12 -2.9 1.19 -5.28 0.64
AAL23055 (lamB)
-5.43 -1.84 -3.83 1.17 0.88 -2.1 -5.6 1.39 1.02 -2.78 -0.63 -1.93 -1.82 -4.34 2.61 -5.11 2.31 -5.15 -5.55 -4.92 -6.25 -3.88 1.92 0.95 -6.37 -6.22 -3.51 -3.82 -4.53 -5.57 -5.45 -1.29 -4.96 -2.13 3.0 -4.0 -0.33 -3.89 0.52
AAL23056 (malM)
-3.38 -1.42 -2.49 1.55 -0.25 -2.11 -3.7 1.54 0.44 -2.02 -0.32 -0.92 -1.52 -2.72 3.11 -4.54 2.26 -3.23 -3.57 -3.07 -4.03 -3.17 1.35 1.3 -4.3 -3.94 -2.48 -3.04 -3.15 -4.05 -4.1 -1.63 -3.52 -3.11 2.47 -2.94 0.56 -3.14 -0.83
AAL23124 (fumB)
-1.88 0.59 -2.55 1.02 0.86 -3.0 -1.01 0.52 0.22 0.92 0.5 1.88 -1.55 -2.09 2.52 -0.92 -2.48 -1.5 -1.47 -1.16 -4.19 -2.9 -0.18 -0.2 -3.54 -2.07 -0.26 0.74 -0.15 -4.9 -1.19 0.51 0.28 0.42 -1.77 -1.58 0.45 -2.66 1.35
AAL23125 (dcuB)
-2.16 0.57 -3.13 0.48 1.7 -2.57 -2.63 -0.55 0.63 0.7 0.71 1.87 -2.76 -3.66 1.84 -0.29 -4.65 -3.29 -3.44 -2.96 -4.33 -3.26 -0.09 0.02 -4.01 -2.38 -0.69 0.93 0.08 -4.33 -1.74 1.33 0.5 1.0 -3.99 -2.02 1.04 -3.8 1.78
AAL23126 (STM4302)
-2.94 0.55 -2.0 -0.3 2.56 -2.99 -1.0 0.18 0.73 1.48 0.96 -0.84 -2.61 -8.89 1.06 -0.27 -3.89 -4.26 -4.25 -4.49 - -6.17 1.37 -0.17 -3.86 -3.66 -2.52 -0.0 -1.52 -1.64 -2.88 2.31 -1.31 0.75 -4.85 -3.75 1.66 -4.76 1.32
AAL23148 (dcuA)
-1.47 -0.27 -1.08 0.58 -0.12 -1.82 -3.16 -1.29 0.03 1.3 -0.45 1.16 -0.07 -4.02 2.29 0.33 -4.43 0.18 0.12 0.84 -4.3 -2.34 1.93 -0.84 -3.77 -2.43 -0.72 0.93 -1.49 -5.37 0.14 0.59 -1.48 1.14 -4.31 -1.68 -0.41 -1.1 0.96
AAL23149 (aspA)
-1.81 -0.46 -0.68 0.05 1.03 -2.53 -3.29 -0.9 0.4 0.88 0.16 0.57 -0.36 -4.66 1.79 0.26 -0.54 -0.18 -0.2 0.24 -4.06 -2.33 1.98 -1.59 -3.17 -2.6 -1.25 1.26 -2.31 -3.09 0.35 0.99 -2.76 1.31 0.24 -1.49 -1.81 0.08 0.91
AAL23163 (frdD)
-1.57 0.36 -0.23 0.59 0.2 -2.6 -3.66 -0.92 0.51 0.56 0.43 1.92 0.3 -3.81 0.73 -1.16 -4.06 -1.28 -1.19 -0.79 -5.16 -2.49 0.3 -0.01 -4.22 -1.79 -0.06 1.42 1.54 -4.77 -0.08 0.39 1.74 -0.32 -3.21 0.1 -0.52 -0.71 0.94
AAL23164 (frdC)
-2.01 0.62 -0.84 0.84 -0.47 -2.65 -2.58 -0.47 0.22 0.65 0.37 1.95 -0.55 -3.96 1.53 -0.44 -2.51 -0.17 -0.35 0.04 -5.63 -3.14 1.01 -0.38 -4.57 -1.8 -0.43 1.05 1.36 -5.63 -0.19 -0.2 1.43 0.63 -2.16 -0.3 -0.99 -1.08 0.39
AAL23165 (frdB)
-1.98 0.35 -0.42 0.53 0.05 -2.74 -3.34 -0.84 0.55 0.61 0.57 1.92 -0.13 -4.18 1.46 -0.65 -4.21 -0.92 -0.71 -0.44 -5.86 -2.79 0.86 -0.42 -4.81 -1.89 -0.44 1.34 1.15 -4.7 0.07 0.43 1.37 0.42 -3.81 -0.34 -1.07 -0.61 1.02
AAL23282 (STM4463)
-1.27 -1.52 -3.12 -2.07 -3.76 -4.67 -4.22 -2.22 -1.89 -0.48 -1.6 -4.45 -2.96 -3.99 -1.13 -1.92 -2.05 3.21 2.57 3.69 -3.84 -2.15 -1.56 -0.83 -3.65 -3.73 -3.83 1.53 -5.33 -3.84 -0.68 -2.85 -4.92 -1.7 -1.81 -3.56 -0.29 -3.85 -3.03
AAL23283 (STM4464)
-0.65 -1.49 -2.84 -2.1 -3.35 -5.2 -2.64 -2.14 -1.49 -0.98 -1.37 -3.81 -2.41 -2.34 -1.46 -4.31 -2.32 3.15 2.48 3.51 -3.84 -3.04 -2.57 -0.73 -3.36 -3.66 -3.39 1.99 -3.75 -6.09 0.83 -2.56 -3.61 -3.93 -1.9 -3.6 -0.21 -3.62 -1.92
AAL23284 (STM4465)
-1.28 -3.19 -6.52 -2.49 -5.88 -6.44 -7.77 -4.57 -1.96 -1.2 -1.99 -7.86 -4.55 -7.22 -2.31 -5.94 -7.12 3.22 2.82 3.75 -6.93 -6.53 -3.03 -1.79 -6.51 -7.45 -4.96 2.13 -7.67 -8.85 0.53 -4.06 -7.7 -4.72 -6.01 -6.11 -0.9 -6.83 -2.99
AAL23285 (STM4466)
-0.55 -2.32 -4.32 -1.74 -3.2 -5.33 -6.4 -3.94 -1.2 -0.5 -0.97 -5.07 -2.95 -4.84 -1.0 -5.36 -5.22 3.21 2.06 3.64 -5.91 -4.88 -3.08 -2.06 -5.34 -5.6 -3.55 2.5 -5.14 -7.91 0.75 -1.65 -5.04 -4.48 -5.69 -4.13 -1.67 -4.59 -1.0
AAL23286 (STM4467)
-1.05 -2.29 -4.72 -1.71 -1.42 -4.91 -8.4 -3.59 -1.42 -0.29 -1.26 -8.23 -2.72 -7.95 -0.79 -3.88 -7.8 3.04 1.98 3.62 -5.91 -6.05 -1.07 -1.07 -4.99 -8.66 -4.23 2.41 -8.22 -9.04 0.93 -0.92 -7.25 -2.68 -8.02 -5.71 -0.08 -3.0 -0.89

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.