View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19061 (polB) | 0.98 | 0.57 | 0.5 | 0.32 | 0.24 | 0.06 | 0.13 | 0.39 | 0.25 | 0.17 | 0.43 | 0.27 | 0.47 | 0.43 | 0.19 | 0.13 | 0.12 | 0.33 | 0.34 | 0.35 | 0.13 | 0.19 | 0.09 | 0.46 | 0.2 | 0.23 | 0.31 | 0.4 | 0.93 | 0.05 | 0.24 | 0.39 | 1.0 | 0.14 | 0.12 | 0.24 | 0.68 | 0.31 | 0.37 |
AAL19098 (lpxC) | 0.5 | 0.44 | 0.43 | 0.51 | 0.27 | 0.7 | 0.23 | 0.49 | 0.6 | 0.51 | 0.94 | 0.39 | 0.43 | 0.78 | 0.19 | 0.52 | 0.12 | 0.32 | 0.33 | 0.39 | 0.16 | 0.37 | 0.51 | 0.23 | 0.23 | 0.34 | 0.35 | 0.61 | 0.89 | 0.11 | 0.38 | 0.36 | 1.0 | 0.58 | 0.11 | 0.29 | 0.28 | 0.26 | 0.4 |
AAL19270 (dinP) | 0.72 | 0.5 | 0.33 | 0.2 | 0.29 | 0.04 | 0.12 | 0.24 | 0.34 | 0.15 | 0.67 | 0.12 | 0.34 | 0.19 | 0.19 | 0.15 | 0.25 | 0.2 | 0.2 | 0.24 | 0.07 | 0.33 | 0.18 | 0.54 | 0.15 | 0.13 | 0.16 | 0.4 | 0.59 | 0.04 | 0.11 | 0.33 | 0.57 | 0.21 | 0.22 | 0.13 | 1.0 | 0.36 | 0.26 |
AAL19363 (STM0409) | 0.12 | 0.16 | 0.12 | 0.19 | 0.06 | 0.08 | 0.26 | 0.14 | 0.07 | 0.11 | 0.08 | 0.07 | 0.11 | 0.15 | 0.2 | 0.12 | 0.1 | 0.2 | 0.23 | 0.27 | 0.17 | 0.09 | 0.1 | 0.21 | 0.15 | 0.08 | 0.08 | 0.14 | 1.0 | 0.02 | 0.05 | 0.1 | 0.1 | 0.11 | 0.12 | 0.08 | 0.26 | 0.06 | 0.13 |
AAL19735 (uvrB) | 0.5 | 0.59 | 0.38 | 0.41 | 0.28 | 0.14 | 0.87 | 0.65 | 0.6 | 0.28 | 0.57 | 0.4 | 0.6 | 0.72 | 0.57 | 0.34 | 0.41 | 0.86 | 0.84 | 0.82 | 0.24 | 0.32 | 0.27 | 0.44 | 0.25 | 0.33 | 0.3 | 0.57 | 0.87 | 0.04 | 0.44 | 0.29 | 0.82 | 0.32 | 1.0 | 0.25 | 0.8 | 0.39 | 0.43 |
AAL19758 (dinG) | 1.0 | 0.41 | 0.23 | 0.4 | 0.48 | 0.05 | 0.23 | 0.48 | 0.26 | 0.18 | 0.29 | 0.27 | 0.33 | 0.53 | 0.61 | 0.18 | 0.26 | 0.4 | 0.51 | 0.49 | 0.08 | 0.19 | 0.22 | 0.47 | 0.09 | 0.19 | 0.19 | 0.38 | 0.85 | 0.04 | 0.19 | 0.49 | 0.82 | 0.15 | 0.39 | 0.2 | 0.61 | 0.32 | 0.55 |
AAL19759 (ybiB) | 0.52 | 0.59 | 0.53 | 0.39 | 0.39 | 0.2 | 0.22 | 0.46 | 0.27 | 0.36 | 0.3 | 0.28 | 0.65 | 0.57 | 0.24 | 0.21 | 0.09 | 0.19 | 0.2 | 0.22 | 0.33 | 0.22 | 0.15 | 0.35 | 0.52 | 0.45 | 0.43 | 0.41 | 1.0 | 0.04 | 0.38 | 0.52 | 0.96 | 0.19 | 0.15 | 0.31 | 0.46 | 0.3 | 0.87 |
AAL19842 (STM0906) | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.5 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.01 |
AAL19843 (STM0907) | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.17 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.51 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.04 | 0.01 |
AAL19844 (STM0908) | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.51 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.01 |
AAL19943 (STM1009) | 0.02 | 0.07 | 0.05 | 0.24 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.96 | 0.0 | 0.02 | 0.04 | 1.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.03 |
AAL19947 (STM1013) | 0.18 | 0.14 | 0.5 | 0.25 | 0.03 | 0.11 | 0.03 | 0.08 | 0.12 | 0.05 | 0.22 | 0.01 | 0.21 | 0.05 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 0.09 | 0.05 | 0.0 | 0.24 | 0.17 | 0.02 | 0.01 | 0.12 | 1.0 | 0.01 | 0.1 | 0.07 | 0.97 | 0.0 | 0.05 | 0.01 | 0.47 | 0.14 | 0.06 |
AAL20004 (sulA) | 0.71 | 0.16 | 0.15 | 0.27 | 0.13 | 0.03 | 0.06 | 0.13 | 0.06 | 0.04 | 0.09 | 0.03 | 0.12 | 0.15 | 0.08 | 0.14 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.07 | 0.05 | 0.13 | 0.14 | 0.06 | 0.12 | 0.04 | 0.07 | 0.27 | 1.0 | 0.01 | 0.05 | 0.12 | 0.94 | 0.16 | 0.1 | 0.05 | 0.14 | 0.16 | 0.1 |
AAL20092 (dinI) | 0.27 | 0.23 | 0.12 | 0.22 | 0.15 | 0.11 | 0.13 | 0.19 | 0.16 | 0.11 | 0.3 | 0.09 | 0.18 | 0.32 | 0.23 | 0.14 | 0.13 | 0.06 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.28 | 0.08 | 0.07 | 0.15 | 0.21 | 0.19 | 0.19 | 0.92 | 0.17 | 0.04 | 0.1 | 1.0 | 0.12 | 0.28 | 0.11 | 0.17 | 0.37 | 0.15 |
AAL20234 (STM1309) | 0.34 | 0.33 | 0.33 | 0.27 | 0.19 | 0.05 | 0.13 | 0.29 | 0.21 | 0.15 | 0.38 | 0.11 | 0.34 | 0.35 | 0.11 | 0.13 | 0.08 | 0.26 | 0.21 | 0.29 | 0.15 | 0.28 | 0.07 | 0.31 | 0.26 | 0.17 | 0.14 | 0.43 | 0.97 | 0.06 | 0.31 | 0.22 | 1.0 | 0.12 | 0.12 | 0.09 | 0.51 | 0.29 | 0.18 |
AAL20785 (STM1869A) | 0.02 | 0.18 | 0.33 | 0.25 | 0.08 | 0.04 | 0.02 | 0.06 | 0.03 | 0.05 | 0.04 | 0.0 | 0.22 | 0.06 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.07 | 0.01 | 0.06 | 0.03 | 0.01 | 0.11 | 1.0 | 0.01 | 0.2 | 0.18 | 0.76 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.26 | 0.16 |
AAL20786 (STM1870) | 0.03 | 0.2 | 0.14 | 0.22 | 0.03 | 0.05 | 0.04 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.0 | 0.08 | 0.01 | 0.04 | 0.01 | 0.0 | 0.14 | 0.15 | 0.17 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.07 | 0.01 | 0.01 | 0.07 | 1.0 | 0.0 | 0.01 | 0.11 | 0.63 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.14 | 0.08 |
AAL20796 (yebE) | 0.17 | 0.11 | 0.14 | 0.26 | 0.06 | 0.01 | 0.05 | 0.12 | 0.03 | 0.06 | 0.07 | 0.02 | 0.22 | 0.07 | 0.03 | 0.12 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.25 | 0.09 | 0.06 | 0.1 | 0.03 | 0.25 | 0.74 | 0.01 | 0.04 | 0.07 | 1.0 | 0.28 | 0.04 | 0.02 | 0.15 | 0.16 | 0.1 |
AAL20797 (yebF) | 0.12 | 0.09 | 0.3 | 0.21 | 0.1 | 0.04 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.02 | 0.34 | 0.02 | 0.01 | 0.18 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.2 | 0.1 | 0.01 | 0.03 | 0.24 | 0.12 | 0.05 | 0.1 | 0.61 | 0.01 | 0.04 | 0.06 | 1.0 | 0.11 | 0.01 | 0.03 | 0.04 | 0.25 | 0.09 |
AAL20798 (yebG) | 0.11 | 0.06 | 0.08 | 0.24 | 0.05 | 0.01 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.05 | 0.04 | 0.11 | 0.03 | 0.15 | 0.08 | 0.01 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.09 | 0.03 | 0.05 | 0.08 | 0.71 | 0.01 | 0.06 | 0.05 | 1.0 | 0.22 | 0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.18 | 0.06 |
AAL20810 (ruvB) | 0.11 | 0.18 | 0.12 | 0.23 | 0.06 | 0.03 | 0.13 | 0.18 | 0.1 | 0.1 | 0.11 | 0.12 | 0.1 | 0.34 | 0.13 | 0.03 | 0.14 | 0.19 | 0.21 | 0.21 | 0.08 | 0.19 | 0.03 | 0.24 | 0.09 | 0.14 | 0.11 | 0.12 | 0.67 | 0.02 | 0.06 | 0.06 | 1.0 | 0.03 | 0.14 | 0.11 | 0.31 | 0.1 | 0.1 |
AAL20811 (ruvA) | 0.09 | 0.09 | 0.06 | 0.23 | 0.04 | 0.02 | 0.17 | 0.1 | 0.08 | 0.07 | 0.11 | 0.07 | 0.08 | 0.14 | 0.16 | 0.02 | 0.1 | 0.15 | 0.15 | 0.17 | 0.03 | 0.07 | 0.03 | 0.11 | 0.05 | 0.09 | 0.07 | 0.11 | 0.63 | 0.01 | 0.06 | 0.06 | 1.0 | 0.03 | 0.13 | 0.07 | 0.15 | 0.08 | 0.08 |
AAL20851 (yecH) | 0.14 | 0.29 | 0.08 | 0.22 | 0.18 | 0.01 | 0.09 | 0.15 | 0.18 | 0.27 | 0.29 | 0.29 | 0.24 | 0.01 | 0.43 | 0.12 | 0.04 | 0.16 | 0.18 | 0.22 | 0.02 | 0.18 | 0.23 | 0.36 | 0.04 | 0.02 | 0.36 | 0.28 | 0.62 | 0.01 | 0.16 | 0.19 | 1.0 | 0.1 | 0.05 | 0.6 | 0.46 | 0.09 | 0.26 |
AAL20852 (tyrP) | 0.46 | 0.53 | 0.14 | 0.3 | 0.21 | 0.05 | 0.19 | 0.37 | 0.37 | 0.18 | 0.73 | 0.69 | 0.24 | 0.99 | 0.5 | 0.09 | 0.17 | 0.27 | 0.31 | 0.34 | 0.07 | 0.51 | 0.09 | 0.66 | 0.11 | 0.15 | 0.58 | 0.35 | 0.67 | 0.06 | 0.15 | 0.19 | 1.0 | 0.09 | 0.27 | 0.53 | 0.71 | 0.12 | 0.51 |
AAL20877 (yedE) | 0.12 | 0.36 | 0.08 | 0.34 | 0.12 | 0.2 | 0.09 | 0.21 | 0.16 | 0.4 | 0.18 | 0.38 | 0.15 | 0.09 | 0.23 | 0.03 | 0.06 | 0.11 | 0.13 | 0.14 | 0.01 | 0.12 | 0.04 | 0.31 | 0.03 | 0.17 | 0.4 | 0.07 | 0.63 | 0.08 | 0.12 | 0.06 | 1.0 | 0.02 | 0.18 | 0.3 | 0.49 | 0.44 | 0.08 |
AAL20907 (umuC) | 0.22 | 0.13 | 0.11 | 0.24 | 0.09 | 0.02 | 0.03 | 0.07 | 0.03 | 0.03 | 0.1 | 0.03 | 0.15 | 0.07 | 0.04 | 0.0 | 0.04 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.11 | 0.05 | 0.0 | 0.15 | 0.08 | 0.04 | 0.02 | 0.08 | 0.86 | 0.0 | 0.03 | 0.07 | 1.0 | 0.0 | 0.41 | 0.02 | 0.31 | 0.14 | 0.11 |
AAL20908 (umuD) | 0.22 | 0.07 | 0.05 | 0.21 | 0.08 | 0.01 | 0.05 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.09 | 0.02 | 0.11 | 0.04 | 0.05 | 0.0 | 0.09 | 0.05 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.03 | 0.0 | 0.09 | 0.04 | 0.03 | 0.02 | 0.07 | 0.73 | 0.0 | 0.02 | 0.07 | 0.89 | 0.0 | 1.0 | 0.01 | 0.2 | 0.15 | 0.1 |
AAL20964 (yeeA) | 0.22 | 0.44 | 0.49 | 0.29 | 0.52 | 0.1 | 0.17 | 0.26 | 0.18 | 0.28 | 0.29 | 0.1 | 1.0 | 0.31 | 0.17 | 0.24 | 0.09 | 0.3 | 0.3 | 0.38 | 0.23 | 0.24 | 0.2 | 0.37 | 0.3 | 0.17 | 0.18 | 0.34 | 0.78 | 0.03 | 0.17 | 0.56 | 0.77 | 0.34 | 0.24 | 0.13 | 0.47 | 0.78 | 0.71 |
AAL20965 (sbmC) | 0.05 | 0.31 | 0.65 | 0.34 | 0.48 | 0.15 | 0.06 | 0.15 | 0.14 | 0.37 | 0.12 | 0.04 | 0.55 | 0.06 | 0.17 | 0.19 | 0.25 | 0.18 | 0.16 | 0.2 | 0.12 | 0.18 | 0.17 | 0.07 | 0.22 | 0.1 | 0.05 | 0.21 | 1.0 | 0.05 | 0.1 | 0.26 | 0.73 | 0.36 | 0.35 | 0.05 | 0.06 | 0.91 | 0.21 |
AAL21137 (STM2235) | 0.01 | 0.09 | 0.02 | 0.2 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.12 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.4 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.01 |
AAL21142 (STM2240) | 0.03 | 0.1 | 0.03 | 0.22 | 0.03 | 0.06 | 0.02 | 0.09 | 0.03 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.06 | 0.19 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.72 | 0.0 | 0.03 | 0.03 | 1.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.04 | 0.05 |
AAL21513 (STM2619) | 0.16 | 0.14 | 0.16 | 0.27 | 0.12 | 0.02 | 0.01 | 0.12 | 0.09 | 0.04 | 0.32 | 0.02 | 0.2 | 0.15 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.07 | 0.06 | 0.07 | 0.07 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.1 | 0.04 | 0.0 | 0.15 | 1.0 | 0.0 | 0.03 | 0.18 | 0.99 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.17 | 0.24 |
AAL21514 (STM2620) | 0.34 | 0.29 | 0.1 | 0.27 | 0.05 | 0.02 | 0.06 | 0.08 | 0.12 | 0.1 | 0.44 | 0.01 | 0.14 | 0.07 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.04 | 0.06 | 0.04 | 0.29 | 0.0 | 0.13 | 0.1 | 0.04 | 0.0 | 0.16 | 0.95 | 0.08 | 0.06 | 0.1 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.21 | 0.08 | 0.12 |
AAL21521 (STM2627) | 0.18 | 0.14 | 0.5 | 0.25 | 0.03 | 0.11 | 0.03 | 0.08 | 0.12 | 0.05 | 0.22 | 0.01 | 0.21 | 0.05 | 0.03 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 0.09 | 0.05 | 0.0 | 0.24 | 0.17 | 0.02 | 0.01 | 0.12 | 1.0 | 0.01 | 0.1 | 0.07 | 0.97 | 0.0 | 0.05 | 0.01 | 0.47 | 0.14 | 0.06 |
AAL21523 (STM2629) | 0.04 | 0.03 | 0.31 | 0.22 | 0.02 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.21 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.11 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.13 | 0.01 | 0.0 | 0.09 | 0.95 | 0.0 | 0.06 | 0.09 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.19 | 0.07 |
AAL21525 (STM2631) | 0.01 | 0.0 | 0.07 | 0.22 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.88 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.06 | 0.02 |
AAL21526 (STM2632) | 0.02 | 0.07 | 0.05 | 0.24 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.96 | 0.0 | 0.02 | 0.04 | 1.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.03 |
AAL21527 (STM2633) | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.23 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.91 | 0.0 | 0.01 | 0.04 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.02 |
AAL21528 (STM2634) | 0.03 | 0.08 | 0.04 | 0.21 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.01 | 0.07 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.0 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.93 | 0.0 | 0.03 | 0.06 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.07 | 0.06 | 0.06 |
AAL21529 (STM2635) | 0.05 | 0.12 | 0.12 | 0.21 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.06 | 0.06 | 0.04 | 0.11 | 0.03 | 0.08 | 0.06 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.07 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.04 | 0.0 | 0.04 | 0.8 | 0.01 | 0.07 | 0.1 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.09 | 0.06 |
AAL21573 (recN) | 0.45 | 0.26 | 0.13 | 0.25 | 0.15 | 0.06 | 0.07 | 0.13 | 0.25 | 0.1 | 0.42 | 0.15 | 0.15 | 0.17 | 0.14 | 0.07 | 0.1 | 0.06 | 0.06 | 0.07 | 0.06 | 0.2 | 0.05 | 0.16 | 0.11 | 0.16 | 0.24 | 0.5 | 1.0 | 0.03 | 0.05 | 0.12 | 0.93 | 0.13 | 0.21 | 0.12 | 0.29 | 0.27 | 0.14 |
AAL21592 (STM2705) | 0.02 | 0.07 | 0.03 | 0.2 | 0.01 | 0.02 | 0.05 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.03 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.06 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.45 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 1.0 | 0.01 | 0.18 | 0.0 | 0.06 | 0.1 | 0.02 |
AAL21593 (STM2706) | 0.01 | 0.07 | 0.03 | 0.2 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.39 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 1.0 | 0.01 | 0.13 | 0.0 | 0.24 | 0.09 | 0.02 |
AAL21708 (oraA) | 0.93 | 0.52 | 0.31 | 0.34 | 0.23 | 0.05 | 0.23 | 0.28 | 0.33 | 0.12 | 0.58 | 0.21 | 0.52 | 0.33 | 0.17 | 0.17 | 0.07 | 0.14 | 0.18 | 0.17 | 0.17 | 0.19 | 0.18 | 0.49 | 0.28 | 0.2 | 0.45 | 0.43 | 0.81 | 0.05 | 0.11 | 0.4 | 1.0 | 0.25 | 0.14 | 0.22 | 0.99 | 0.26 | 0.51 |
AAL21709 (recA) | 0.41 | 0.17 | 0.12 | 0.27 | 0.12 | 0.1 | 0.08 | 0.1 | 0.13 | 0.09 | 0.1 | 0.12 | 0.14 | 0.12 | 0.21 | 0.09 | 0.07 | 0.08 | 0.09 | 0.09 | 0.05 | 0.08 | 0.08 | 0.1 | 0.11 | 0.08 | 0.22 | 0.25 | 0.76 | 0.02 | 0.05 | 0.14 | 1.0 | 0.14 | 0.12 | 0.18 | 0.12 | 0.18 | 0.17 |
AAL22379 (STM3517) | 0.13 | 0.29 | 0.22 | 0.32 | 0.13 | 0.03 | 0.2 | 0.19 | 0.18 | 0.13 | 0.34 | 0.09 | 0.19 | 0.08 | 0.26 | 0.29 | 0.12 | 0.11 | 0.09 | 0.13 | 0.06 | 0.21 | 0.2 | 0.03 | 0.1 | 0.08 | 0.01 | 0.19 | 0.08 | 0.13 | 0.07 | 0.13 | 1.0 | 0.63 | 0.24 | 0.01 | 0.02 | 0.24 | 0.2 |
AAL22380 (rtcA) | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.16 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.01 |
AAL22381 (rtcB) | 0.03 | 0.07 | 0.13 | 1.0 | 0.07 | 0.1 | 0.04 | 0.05 | 0.12 | 0.08 | 0.12 | 0.03 | 0.16 | 0.04 | 0.07 | 0.01 | 0.03 | 0.07 | 0.09 | 0.08 | 0.05 | 0.04 | 0.02 | 0.02 | 0.08 | 0.1 | 0.03 | 0.21 | 0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.08 | 0.26 | 0.01 | 0.09 | 0.04 | 0.02 | 0.44 | 0.12 |
AAL22382 (STM3521) | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.01 |
AAL22795 (uvrD) | 0.56 | 0.58 | 0.36 | 0.59 | 0.35 | 0.21 | 0.51 | 0.64 | 0.59 | 0.32 | 0.63 | 0.53 | 0.39 | 0.84 | 0.86 | 0.14 | 0.58 | 0.58 | 0.72 | 0.69 | 0.15 | 0.4 | 0.13 | 0.45 | 0.19 | 0.4 | 0.35 | 0.59 | 1.0 | 0.07 | 0.32 | 0.42 | 0.86 | 0.11 | 0.96 | 0.35 | 0.61 | 0.43 | 0.63 |
AAL22871 (STM4032) | 0.19 | 0.48 | 0.26 | 0.32 | 0.25 | 0.21 | 0.11 | 0.3 | 0.32 | 0.23 | 0.51 | 0.15 | 0.23 | 0.39 | 0.35 | 0.07 | 0.31 | 0.15 | 0.13 | 0.18 | 0.05 | 0.31 | 0.05 | 0.4 | 0.15 | 0.27 | 0.07 | 0.31 | 0.88 | 0.05 | 0.08 | 0.24 | 0.72 | 0.05 | 0.64 | 0.08 | 1.0 | 0.39 | 0.28 |
AAL23061 (lexA) | 0.26 | 0.31 | 0.19 | 0.28 | 0.18 | 0.02 | 0.06 | 0.16 | 0.2 | 0.14 | 0.17 | 0.14 | 0.2 | 0.21 | 0.14 | 0.09 | 0.09 | 0.12 | 0.13 | 0.14 | 0.06 | 0.22 | 0.12 | 0.11 | 0.1 | 0.09 | 0.21 | 0.26 | 0.84 | 0.03 | 0.09 | 0.25 | 1.0 | 0.1 | 0.11 | 0.24 | 0.17 | 0.31 | 0.23 |
AAL23062 (dinF) | 0.6 | 0.31 | 0.12 | 0.26 | 0.19 | 0.01 | 0.14 | 0.2 | 0.37 | 0.07 | 0.48 | 0.2 | 0.24 | 0.28 | 0.28 | 0.08 | 0.21 | 0.21 | 0.21 | 0.24 | 0.04 | 0.13 | 0.08 | 0.44 | 0.09 | 0.13 | 0.16 | 0.26 | 0.7 | 0.02 | 0.07 | 0.28 | 1.0 | 0.07 | 0.57 | 0.12 | 0.86 | 0.17 | 0.31 |
AAL23078 (uvrA) | 0.43 | 0.43 | 0.2 | 0.36 | 0.23 | 0.16 | 0.21 | 0.36 | 0.41 | 0.21 | 0.37 | 0.4 | 0.27 | 0.42 | 0.22 | 0.09 | 0.08 | 0.2 | 0.29 | 0.24 | 0.1 | 0.24 | 0.11 | 0.25 | 0.11 | 0.4 | 0.37 | 0.36 | 0.94 | 0.05 | 0.21 | 0.27 | 1.0 | 0.09 | 0.13 | 0.28 | 0.4 | 0.31 | 0.36 |
AAL23202 (yjfR) | 0.07 | 0.2 | 0.07 | 0.05 | 0.04 | 0.05 | 0.07 | 0.08 | 0.14 | 0.07 | 0.24 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.1 | 0.05 | 0.05 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.03 | 0.1 | 0.09 | 0.39 | 0.05 | 0.06 | 0.12 | 0.13 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.05 | 0.06 | 0.11 | 0.1 | 1.0 | 0.04 | 0.06 |
AAL23271 (nrdG) | 0.17 | 0.34 | 0.13 | 0.28 | 0.13 | 0.04 | 0.17 | 0.32 | 0.29 | 0.17 | 0.41 | 0.54 | 0.18 | 0.23 | 1.0 | 0.11 | 0.16 | 0.34 | 0.49 | 0.45 | 0.08 | 0.16 | 0.21 | 0.26 | 0.07 | 0.1 | 0.15 | 0.33 | 0.47 | 0.02 | 0.09 | 0.15 | 0.5 | 0.12 | 0.33 | 0.12 | 0.47 | 0.11 | 0.19 |
AAL23360 (yjjA) | 0.46 | 0.4 | 0.61 | 0.38 | 0.37 | 0.26 | 0.22 | 0.48 | 0.4 | 0.28 | 0.49 | 0.35 | 0.56 | 0.52 | 0.3 | 0.2 | 0.15 | 0.22 | 0.25 | 0.26 | 0.4 | 0.14 | 0.16 | 0.47 | 0.27 | 0.29 | 0.47 | 0.45 | 0.87 | 0.04 | 0.23 | 0.5 | 1.0 | 0.15 | 0.18 | 0.37 | 0.67 | 0.47 | 0.6 |
AAL23361 (dnaC) | 0.43 | 0.4 | 0.33 | 0.51 | 0.26 | 0.13 | 0.35 | 0.43 | 0.35 | 0.28 | 0.44 | 0.32 | 0.43 | 0.46 | 0.98 | 0.25 | 0.24 | 0.45 | 0.55 | 0.57 | 0.21 | 0.2 | 0.23 | 0.35 | 0.22 | 0.3 | 0.3 | 0.41 | 0.96 | 0.03 | 0.26 | 0.35 | 1.0 | 0.23 | 0.35 | 0.25 | 0.48 | 0.33 | 0.5 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)