Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL17203 (mreB)	0.43	0.19	0.51	0.22	0.54	0.97	0.61	0.4	0.15	0.78	0.56	0.65	0.54	0.43	0.31	0.73	0.29	0.5	0.95	0.54	0.24	1.0	0.55	0.27	0.47	0.43	0.22	0.24	0.51
CCL17204 (fabZ)	0.42	0.19	0.37	0.19	0.32	0.52	0.35	0.33	0.09	0.36	0.32	0.34	0.51	0.28	0.26	0.71	0.29	0.42	0.64	0.41	0.18	1.0	0.35	0.25	0.5	0.32	0.41	0.24	0.31
CCL17701 (BN171_170002)	0.06	0.03	0.06	0.05	0.09	0.26	0.23	0.05	0.09	0.24	0.33	0.3	0.52	0.06	0.05	1.0	0.31	0.12	0.56	0.07	0.06	0.09	0.89	0.46	0.66	0.06	0.08	0.47	0.27
CCL17702 (BN171_170003)	0.13	0.08	0.16	0.11	0.28	0.34	0.38	0.17	0.16	0.57	0.6	0.62	0.61	0.19	0.12	1.0	0.36	0.26	0.57	0.27	0.1	0.14	0.84	0.34	0.46	0.19	0.06	0.36	0.46
CCL19486 (anmK)	0.33	0.27	0.64	1.0	0.88	0.17	0.39	0.38	0.1	0.52	0.49	0.43	0.46	0.43	0.41	0.39	0.15	0.55	0.66	0.32	0.17	0.1	0.84	0.23	0.26	0.25	0.02	0.2	0.4
CCL19487 (BN171_3180011)	0.2	0.08	0.5	0.28	0.47	0.23	0.24	0.19	0.06	0.31	0.33	0.44	0.37	0.18	0.1	0.46	0.16	0.21	0.55	0.26	0.09	0.08	1.0	0.14	0.14	0.17	0.02	0.23	0.37
CCL19488 (BN171_3180012)	0.25	0.24	0.54	0.33	0.42	0.44	0.34	0.38	0.18	0.34	0.35	0.48	0.39	0.44	0.21	0.4	0.17	0.21	0.56	0.24	0.07	0.03	1.0	0.13	0.11	0.13	0.02	0.26	0.35
CCL19489 (BN171_3180013)	0.3	0.11	0.22	0.12	0.23	0.22	0.26	0.23	0.1	0.24	0.21	0.27	0.29	0.22	0.09	0.4	0.17	0.25	0.53	0.18	0.07	0.07	1.0	0.18	0.21	0.1	0.1	0.23	0.2
CCL19490 (BN171_3180014)	0.19	0.09	0.17	0.13	0.22	0.16	0.14	0.19	0.09	0.29	0.2	0.24	0.22	0.2	0.11	0.22	0.21	0.22	0.6	0.2	0.09	0.09	1.0	0.41	0.18	0.15	0.21	0.14	0.19
CCL19656 (BN171_3350005)	0.64	0.47	0.99	0.91	0.71	0.74	0.91	0.41	0.25	0.7	0.47	0.6	0.53	0.45	0.42	0.55	0.19	0.53	0.93	0.52	0.4	0.17	1.0	0.38	0.66	0.41	0.11	0.4	0.3
CCL19672 (hslO)	0.38	0.23	0.49	0.98	0.71	0.59	0.69	0.38	0.12	0.45	0.57	0.56	0.84	0.34	0.29	0.69	0.56	0.48	0.85	0.32	0.24	1.0	0.7	0.29	0.44	0.38	0.45	0.43	0.52
CCL19750 (pstS)	0.23	0.08	0.39	0.49	0.3	0.33	0.29	0.15	0.12	0.32	0.34	0.24	0.75	0.34	0.09	0.76	0.32	0.18	0.69	0.3	0.15	0.42	1.0	0.33	0.34	0.09	0.23	0.37	0.24
CCL19751 (BN171_3450005)	0.34	0.13	0.49	0.74	0.44	0.24	0.39	0.27	0.16	0.38	0.38	0.32	0.82	0.3	0.15	0.83	0.29	0.3	0.73	0.29	0.25	0.38	1.0	0.34	0.35	0.18	0.23	0.32	0.32
CCL19752 (BN171_3450006)	0.12	0.03	0.2	0.32	0.15	0.33	0.08	0.05	0.13	0.12	0.11	0.09	0.47	0.09	0.04	0.34	0.18	0.06	0.7	0.12	0.11	0.2	1.0	0.17	0.26	0.07	0.09	0.21	0.08
CCL19785 (BN171_3470023)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.06	0.17	0.16	0.1	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
CCL19838 (pyk)	0.27	0.02	0.2	0.03	0.38	0.52	0.12	0.26	0.11	0.13	0.12	0.16	0.57	0.22	0.04	0.86	0.23	0.45	0.75	0.4	0.03	0.62	1.0	0.66	0.45	0.45	0.1	0.14	0.11
CCL19839 (pfkA)	0.2	0.02	0.15	0.02	0.31	1.0	0.08	0.24	0.1	0.08	0.07	0.11	0.4	0.16	0.03	0.55	0.19	0.33	0.63	0.3	0.01	0.55	0.71	0.41	0.27	0.32	0.06	0.09	0.07
CCL19861 (BN171_3570010)	0.18	0.11	0.26	0.5	0.32	0.17	0.18	0.14	0.37	0.24	0.31	0.3	0.49	0.16	0.13	0.45	0.3	0.19	0.68	0.32	0.17	0.17	1.0	0.38	0.31	0.19	0.09	0.36	0.31
CCL19879 (BN171_3580014)	0.04	0.03	0.12	0.04	0.17	0.45	0.48	0.04	0.07	1.0	0.87	0.78	0.57	0.1	0.03	0.67	0.13	0.05	0.61	0.15	0.07	0.21	0.55	0.25	0.31	0.07	0.02	0.26	0.79
CCL19882 (cobB)	0.08	0.05	0.17	0.06	0.18	0.37	0.63	0.1	0.14	1.0	0.91	0.86	0.72	0.07	0.05	0.84	0.2	0.11	0.7	0.17	0.08	0.53	0.55	0.42	0.45	0.11	0.16	0.25	0.73
CCL19883 (cobQ)	0.19	0.13	0.39	0.13	0.48	0.52	0.75	0.21	0.14	0.98	1.0	0.98	0.68	0.14	0.11	0.83	0.23	0.23	0.68	0.34	0.12	0.58	0.51	0.29	0.31	0.27	0.1	0.21	0.8
CCL19892 (BN171_3590013)	0.28	0.29	0.33	0.53	0.56	0.53	0.39	0.35	0.25	0.31	0.19	0.36	0.67	0.15	0.25	0.92	0.36	0.37	0.95	0.3	0.5	0.68	1.0	0.35	0.51	0.35	0.24	0.47	0.12
CCL19919 (BN171_360013)	0.25	0.32	0.3	0.52	0.23	0.07	0.61	0.25	0.07	0.24	0.34	0.32	0.38	0.16	0.39	0.54	0.24	0.28	0.71	0.08	0.17	0.15	1.0	0.18	0.14	0.1	0.16	0.25	0.07
CCL19935 (atpC)	0.66	0.09	0.58	0.16	0.54	0.45	0.17	0.42	0.01	0.24	0.25	0.24	0.33	0.63	0.11	0.41	0.1	0.48	0.35	1.0	0.06	0.51	0.54	0.19	0.31	0.52	0.14	0.09	0.19
CCL19936 (atpD)	0.22	0.04	0.18	0.06	0.18	0.22	0.12	0.13	0.14	0.17	0.16	0.18	0.28	0.15	0.05	0.35	0.24	0.18	0.37	0.29	0.03	1.0	0.52	0.21	0.27	0.17	0.1	0.07	0.15
CCL19937 (atpG)	0.4	0.05	0.39	0.11	0.34	0.61	0.34	0.22	0.02	0.49	0.48	0.51	0.56	0.36	0.07	0.63	0.38	0.32	0.65	0.53	0.04	1.0	0.9	0.28	0.48	0.29	0.16	0.13	0.52
CCL19938 (atpA)	0.29	0.04	0.23	0.08	0.22	0.33	0.23	0.16	0.02	0.32	0.34	0.37	0.51	0.19	0.05	0.55	0.3	0.23	0.49	0.34	0.03	1.0	0.67	0.27	0.44	0.18	0.13	0.11	0.39
CCL19939 (atpH)	0.19	0.02	0.25	0.06	0.19	0.27	0.46	0.08	0.03	0.82	0.78	0.9	0.63	0.2	0.04	0.64	0.35	0.14	0.69	0.31	0.03	0.75	1.0	0.26	0.37	0.13	0.1	0.15	1.0
CCL19940 (atpF)	0.73	0.13	0.74	0.23	0.66	0.83	0.38	0.5	0.04	0.57	0.59	0.68	0.62	0.67	0.17	0.59	0.43	0.57	0.77	1.0	0.07	0.74	0.9	0.38	0.48	0.51	0.12	0.13	0.68
CCL19942 (atpB)	0.25	0.06	0.19	0.06	0.16	0.17	0.23	0.12	0.05	0.3	0.34	0.39	0.57	0.17	0.07	0.62	0.24	0.2	0.62	0.3	0.03	0.45	1.0	0.5	0.45	0.12	0.14	0.15	0.36
CCL19943 (atpI)	0.74	0.28	0.58	0.19	0.46	0.29	0.3	0.48	0.06	0.38	0.34	0.46	0.39	0.66	0.25	0.37	0.34	0.59	0.67	0.81	0.12	0.7	1.0	0.51	0.36	0.34	0.07	0.19	0.36
CCL19944 (atpZ)	0.02	0.0	0.04	0.01	0.02	0.11	0.2	0.0	0.06	0.27	0.35	0.35	0.29	0.04	0.01	0.18	0.21	0.01	0.57	0.05	0.01	0.05	1.0	0.23	0.17	0.01	0.01	0.29	0.43
CCL19945 (BN171_3600023)	0.95	0.86	0.63	0.36	0.48	0.2	0.48	0.81	0.1	0.41	0.44	0.54	0.27	0.3	0.52	0.23	0.25	0.75	0.66	0.51	0.1	0.07	1.0	0.61	0.24	0.28	0.01	0.29	0.48
CCL20011 (BN171_3660008)	0.32	0.22	0.37	0.21	0.58	0.89	0.49	0.5	0.24	0.63	0.68	0.7	0.71	0.37	0.26	1.0	0.48	0.49	0.91	0.42	0.19	0.61	0.8	0.53	0.47	0.36	0.07	0.51	0.51
CCL20016 (BN171_3660013)	0.2	0.1	0.21	0.11	0.21	0.47	0.33	0.16	0.25	0.61	0.54	0.45	0.73	0.16	0.14	1.0	0.25	0.24	0.59	0.31	0.11	0.2	0.6	0.3	0.42	0.18	0.04	0.27	0.44
CCL20021 (dusB)	0.42	0.21	0.35	0.41	0.46	0.59	0.31	0.39	0.26	0.36	0.43	0.47	0.65	0.39	0.24	0.78	0.53	0.49	0.71	0.37	0.2	1.0	0.75	0.45	0.48	0.32	0.07	0.28	0.46
CCL20024 (BN171_3670007)	0.39	0.21	0.39	0.44	0.54	0.53	0.37	0.33	0.06	0.44	0.39	0.42	0.49	0.28	0.23	0.82	0.23	0.44	0.66	0.31	0.12	1.0	0.54	0.23	0.28	0.33	0.19	0.34	0.37
CCL20073 (BN171_3690017)	0.13	0.05	0.36	0.54	0.29	0.08	0.25	0.05	0.15	0.33	0.45	0.49	0.42	0.17	0.09	0.18	0.21	0.09	0.59	0.11	0.11	0.02	1.0	0.29	0.12	0.06	0.04	0.39	0.5
CCL20091 (BN171_3690035)	0.81	0.56	0.57	0.44	0.85	0.3	0.72	0.93	0.34	0.69	0.66	0.64	0.68	1.0	0.49	0.91	0.3	0.84	0.81	0.78	0.43	0.11	0.86	0.37	0.38	0.58	0.12	0.26	0.43
CCL20134 (BN171_370008)	0.36	0.22	0.42	0.37	0.39	0.23	0.2	0.34	0.15	0.1	0.17	0.22	0.63	0.35	0.25	0.93	0.48	0.27	0.83	0.13	0.16	0.28	1.0	0.24	0.43	0.2	0.08	0.37	0.24
CCL20152 (BN171_3710006)	0.2	0.15	0.13	0.12	0.15	0.57	0.57	0.14	0.07	0.89	0.91	1.0	0.43	0.21	0.18	0.19	0.24	0.24	0.47	0.23	0.19	0.06	0.49	0.59	0.56	0.12	0.17	0.33	0.93
CCL20153 (BN171_3710007)	0.06	0.04	0.12	0.06	0.09	0.39	0.61	0.05	0.14	0.76	0.98	1.0	0.61	0.12	0.06	0.54	0.19	0.07	0.57	0.21	0.19	0.06	0.51	0.36	0.36	0.06	0.08	0.3	0.97
CCL20157 (spo0J)	0.31	0.53	0.28	0.4	0.25	0.47	1.0	0.25	0.32	0.94	0.71	0.86	0.86	0.25	0.34	0.65	0.35	0.24	0.88	0.36	0.43	0.74	0.62	0.37	0.35	0.19	0.39	0.29	0.62
CCL20158 (soj)	0.19	0.19	0.18	0.26	0.14	0.36	0.83	0.07	0.07	1.0	0.7	0.85	0.72	0.15	0.18	0.68	0.19	0.15	0.62	0.18	0.28	0.64	0.56	0.27	0.3	0.09	0.21	0.21	0.44
CCL20209 (BN171_380004)	0.18	0.03	0.22	0.12	0.16	0.23	0.43	0.06	0.12	0.44	0.59	0.52	0.42	0.16	0.08	0.38	0.24	0.14	0.65	0.24	0.11	0.15	0.81	0.38	1.0	0.13	0.04	0.0	0.57
CCL20210 (BN171_380005)	0.25	0.07	0.34	0.23	0.21	0.34	0.37	0.11	0.08	0.56	0.6	0.51	0.53	0.45	0.13	0.59	0.43	0.21	0.76	0.31	0.19	0.53	0.94	0.43	1.0	0.15	0.08	0.01	0.57
CCL20214 (spaF)	0.37	0.43	0.43	0.81	0.91	0.45	0.74	0.66	0.08	1.0	0.6	0.55	0.8	0.2	0.53	0.84	0.35	0.72	0.69	0.24	0.23	0.57	0.82	0.69	0.49	0.28	0.14	0.43	0.93
CCL20215 (spaE)	0.13	0.12	0.15	0.39	0.24	0.31	0.25	0.13	0.07	0.3	0.32	0.41	0.51	0.08	0.18	0.5	0.35	0.23	0.66	0.1	0.11	0.42	1.0	0.55	0.46	0.14	0.14	0.33	0.34
CCL20217 (spaG)	0.09	0.11	0.11	0.29	0.19	0.41	0.11	0.16	0.05	0.38	0.21	0.31	0.6	0.05	0.15	0.69	0.4	0.19	0.67	0.09	0.11	0.65	1.0	0.49	0.4	0.09	0.15	0.29	0.24
CCL20220 (spaK)	0.12	0.08	0.14	0.16	0.3	0.45	0.39	0.25	0.07	0.53	0.58	0.57	0.63	0.14	0.16	0.98	0.39	0.39	0.83	0.18	0.1	0.6	1.0	0.71	0.69	0.23	0.22	0.56	0.48
CCL20275 (serS)	0.17	0.1	0.22	0.17	0.41	0.5	0.38	0.3	0.14	0.58	0.54	0.54	0.6	0.15	0.13	0.96	0.31	0.34	0.63	0.29	0.17	1.0	0.38	0.33	0.42	0.28	0.27	0.24	0.47
CCL20278 (BN171_40006)	0.31	0.2	0.48	0.74	0.63	1.0	0.62	0.28	0.07	0.79	0.52	0.72	0.63	0.37	0.29	0.7	0.43	0.4	0.87	0.29	0.24	0.71	0.7	0.24	0.3	0.32	0.25	0.51	0.51
CCL20334 (BN171_420004)	0.12	0.08	0.13	0.12	0.15	0.17	0.15	0.1	0.12	1.0	1.0	0.23	0.29	0.12	0.08	0.35	0.11	0.14	0.35	0.14	0.12	0.05	0.48	0.17	0.21	0.11	0.03	0.17	0.19
CCL20335 (BN171_420005)	0.12	0.07	0.16	0.16	0.16	0.25	0.18	0.1	0.1	0.94	1.0	0.24	0.32	0.1	0.08	0.37	0.17	0.17	0.46	0.11	0.12	0.1	0.62	0.3	0.28	0.1	0.06	0.23	0.21
CCL20479 (gapN)	0.08	0.03	0.13	0.03	0.13	0.01	0.06	0.09	0.02	0.05	0.05	0.09	0.11	0.01	0.03	0.03	0.12	0.09	0.4	0.02	0.0	0.03	1.0	0.12	0.02	0.01	0.02	0.21	0.07
CCL20537 (BN171_600002)	0.49	0.29	0.41	0.23	0.3	0.47	0.41	0.35	0.79	0.77	0.76	0.9	0.67	0.37	0.33	0.82	0.58	0.4	0.99	0.37	0.35	0.35	1.0	0.61	0.65	0.24	0.2	0.49	0.72
CCL20538 (BN171_600003)	0.42	0.19	0.33	0.28	0.37	0.24	0.33	0.2	0.66	0.7	0.56	0.58	0.59	0.33	0.33	0.64	0.35	0.41	0.93	0.42	0.28	0.52	1.0	0.6	0.62	0.23	0.13	0.28	0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)