Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL17052 (BN171_1130006)	0.43	0.59	0.48	0.86	0.36	0.3	0.37	0.35	0.73	0.5	0.54	0.42	0.58	0.57	0.86	0.77	0.48	0.52	0.39	0.86	1.0	0.35	0.48	0.9	0.56	0.46	0.13	0.87	0.57
CCL17053 (speA)	0.02	0.31	0.02	0.06	0.01	0.03	0.03	0.01	0.75	0.02	0.02	0.01	0.17	0.02	0.32	1.0	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01
CCL17188 (pepT)	0.34	0.53	0.8	0.87	0.65	0.55	0.9	0.36	1.0	0.58	0.44	0.61	0.98	0.36	0.74	0.83	0.44	0.5	0.32	0.42	0.34	0.46	0.31	0.5	0.44	0.26	0.21	0.5	0.39
CCL17234 (BN171_1400006)	0.59	0.38	0.47	0.24	0.43	0.29	0.36	0.48	1.0	0.49	0.44	0.62	0.57	0.46	0.21	0.55	0.34	0.49	0.23	0.61	0.22	0.27	0.29	0.21	0.35	0.42	0.11	0.24	0.46
CCL17378 (BN171_1450039)	0.21	0.1	0.28	0.22	0.3	0.16	0.48	0.1	1.0	0.57	0.51	0.54	0.53	0.29	0.17	0.63	0.29	0.19	0.2	0.47	0.23	0.1	0.34	0.62	0.36	0.25	0.33	0.43	0.51
CCL17523 (BN171_1540002)	0.43	0.47	0.42	0.64	0.22	0.2	0.41	0.24	0.72	0.27	0.25	0.28	0.48	0.38	0.42	0.36	0.25	0.3	0.26	0.4	0.56	0.07	0.15	1.0	0.71	0.17	0.28	0.68	0.2
CCL17527 (BN171_1540006)	1.0	0.52	0.71	0.5	0.57	0.36	0.55	0.87	0.98	0.38	0.62	0.44	0.3	0.79	0.38	0.28	0.37	0.58	0.26	0.72	0.26	0.08	0.55	0.16	0.22	0.37	0.05	0.68	0.48
CCL17598 (BN171_1600002)	0.09	0.2	0.15	0.52	0.22	0.11	0.14	0.1	0.16	0.3	0.16	0.12	0.23	0.12	0.35	0.18	0.11	0.12	0.19	0.19	1.0	0.19	0.35	0.55	0.23	0.13	0.03	0.45	0.11
CCL17750 (hisZ)	0.03	0.61	0.04	0.43	0.05	0.26	0.34	0.01	1.0	0.46	0.25	0.16	0.33	0.02	0.09	0.33	0.06	0.01	0.19	0.07	0.05	0.05	0.14	0.23	0.24	0.05	0.06	0.08	0.17
CCL17758 (BN171_1770002)	0.46	0.39	0.44	0.26	0.21	0.24	0.28	0.13	1.0	0.39	0.32	0.32	0.45	0.45	0.21	0.36	0.13	0.27	0.2	0.74	0.26	0.21	0.12	0.23	0.22	0.22	0.05	0.14	0.26
CCL17759 (BN171_1770003)	0.63	0.57	0.67	0.45	0.61	0.44	0.74	0.52	0.5	0.7	0.73	0.82	0.66	0.81	0.34	0.61	0.34	0.59	0.35	1.0	0.33	0.34	0.4	0.37	0.39	0.49	0.07	0.23	0.7
CCL17848 (BN171_1840008)	0.78	0.47	0.58	0.43	0.73	0.32	0.64	0.9	0.59	0.67	0.55	0.55	0.58	0.65	0.47	0.5	0.47	0.74	0.32	1.0	0.43	0.35	0.53	0.53	0.41	0.76	0.07	0.64	0.56
CCL17933 (BN171_1970002)	0.27	0.04	0.37	0.12	0.25	0.19	0.64	0.13	1.0	0.59	0.47	0.54	0.58	0.39	0.04	0.9	0.28	0.27	0.22	0.25	0.07	0.19	0.28	0.27	0.31	0.09	0.04	0.22	0.48
CCL17935 (BN171_1970004)	0.67	0.25	0.69	0.45	0.62	0.38	0.45	0.47	1.0	0.56	0.39	0.41	0.62	0.76	0.23	0.88	0.48	0.78	0.16	0.5	0.2	0.66	0.13	0.45	0.64	0.37	0.07	0.3	0.34
CCL17981 (pyrB)	0.22	0.13	0.39	0.47	0.45	0.21	0.36	0.22	1.0	0.32	0.27	0.24	0.35	0.26	0.36	0.38	0.12	0.36	0.3	0.41	0.19	0.11	0.13	0.34	0.2	0.27	0.03	0.12	0.22
CCL17982 (pyrK)	0.19	0.16	0.35	0.59	0.55	0.43	1.0	0.21	0.63	0.86	0.77	0.74	0.58	0.2	0.49	0.79	0.21	0.39	0.58	0.31	0.16	0.35	0.23	0.8	0.37	0.23	0.07	0.23	0.73
CCL17983 (pyrD)	0.19	0.21	0.46	0.72	0.81	0.5	0.62	0.3	0.25	0.69	0.45	0.6	0.68	0.2	0.59	0.98	0.26	0.45	0.68	0.32	0.17	0.54	0.26	1.0	0.46	0.28	0.1	0.29	0.43
CCL17984 (pyrE)	0.32	0.3	0.54	0.63	0.88	0.68	0.55	0.65	0.11	0.59	0.48	0.6	0.35	0.31	0.85	0.62	0.37	0.6	0.59	0.61	0.23	0.55	0.19	1.0	0.52	0.59	0.11	0.18	0.47
CCL18040 (BN171_2040005)	1.0	0.37	0.7	0.37	0.33	0.28	0.29	0.29	0.68	0.25	0.19	0.18	0.31	0.56	0.28	0.2	0.18	0.31	0.31	0.99	0.3	0.15	0.42	0.31	0.29	0.35	0.13	0.44	0.17
CCL18138 (BN171_2100022)	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.07	0.25	0.0	1.0	0.57	0.38	0.48	0.28	0.01	0.02	0.05	0.27	0.03	0.12	0.0	0.02	0.0	0.33	0.01	0.01	0.0	0.04	0.0	0.25
CCL18208 (BN171_2160004)	0.22	0.15	0.24	0.13	0.2	0.26	0.39	0.16	1.0	0.34	0.41	0.28	0.47	0.29	0.12	0.67	0.26	0.17	0.23	0.4	0.22	0.12	0.33	0.32	0.27	0.11	0.1	0.33	0.32
CCL18220 (BN171_2170007)	0.05	0.01	0.1	0.17	0.06	0.15	0.21	0.01	1.0	0.23	0.37	0.3	0.42	0.13	0.02	0.22	0.09	0.04	0.21	0.17	0.07	0.1	0.42	0.22	0.27	0.03	0.1	0.29	0.42
CCL18462 (BN171_2360004)	0.2	0.02	0.44	0.11	0.44	0.16	0.04	0.13	1.0	0.03	0.05	0.03	0.23	0.09	0.02	0.43	0.21	0.07	0.04	0.11	0.03	0.01	0.09	0.04	0.08	0.06	0.01	0.03	0.02
CCL18468 (BN171_2370005)	0.07	0.24	0.1	0.16	0.19	0.15	0.15	0.24	1.0	0.29	0.31	0.26	0.3	0.06	0.08	0.7	0.18	0.15	0.1	0.09	0.1	0.22	0.07	0.22	0.24	0.15	0.02	0.15	0.24
CCL18605 (SinR)	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	1.0	0.32	0.57	0.13	0.16	0.07	0.01	0.02	0.52	0.03	0.03	0.1	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.0	0.13	0.02
CCL18606 (BN171_2460002)	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.06	0.08	0.01	1.0	0.47	0.63	0.31	0.7	0.04	0.0	0.1	0.89	0.01	0.08	0.05	0.02	0.01	0.16	0.02	0.03	0.01	0.01	0.53	0.04
CCL18682 (BN171_2480057)	0.09	0.09	0.11	0.17	0.08	0.0	0.34	0.11	1.0	0.56	0.61	0.38	0.33	0.09	0.08	0.32	0.35	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.41
CCL18683 (BN171_2490001)	0.3	0.29	0.57	0.96	0.53	0.02	0.2	0.32	1.0	0.34	0.22	0.2	0.36	0.42	0.31	0.32	0.29	0.31	0.05	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.23
CCL18684 (BN171_2490002)	0.19	0.11	0.24	0.42	0.28	0.31	0.36	0.14	1.0	0.25	0.32	0.33	0.42	0.2	0.17	0.55	0.32	0.25	0.32	0.37	0.38	0.3	0.35	0.33	0.57	0.26	0.36	0.28	0.27
CCL18743 (BN171_2600002)	0.11	0.09	0.25	0.23	0.14	0.19	0.3	0.06	1.0	0.36	0.25	0.28	0.44	0.24	0.12	0.58	0.21	0.08	0.24	0.35	0.38	0.06	0.44	0.35	0.22	0.14	0.2	0.32	0.29
CCL19057 (pyrR)	0.18	0.27	0.69	1.0	0.87	0.3	0.35	0.54	0.67	0.45	0.5	0.48	0.45	0.36	0.73	0.73	0.29	0.61	0.11	0.33	0.27	0.1	0.1	0.72	0.52	0.57	0.04	0.48	0.47
CCL19073 (BN171_2870003)	0.28	0.32	0.29	0.34	0.5	0.33	0.11	0.41	1.0	0.22	0.28	0.28	0.53	0.11	0.47	0.95	0.35	0.24	0.15	0.24	0.34	0.08	0.05	0.15	0.97	0.32	0.04	0.26	0.14
CCL19075 (BN171_2870005)	0.53	0.56	0.55	1.0	0.49	0.05	0.24	0.61	0.6	0.3	0.31	0.29	0.42	0.22	0.28	0.38	0.13	0.24	0.16	0.3	0.44	0.63	0.3	0.16	0.14	0.22	0.02	0.31	0.3
CCL19233 (BN171_2970012)	0.59	0.09	0.48	0.21	0.71	0.27	0.28	0.7	0.92	0.27	0.44	0.29	0.58	0.78	0.06	1.0	0.33	0.57	0.21	0.59	0.09	0.22	0.39	0.26	0.28	0.51	0.04	0.2	0.39
CCL19326 (BN171_3040002)	0.15	0.03	0.29	0.17	0.21	0.04	0.0	0.07	0.72	0.0	0.0	0.02	0.44	0.16	0.12	1.0	0.32	0.19	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
CCL19338 (BN171_3070004)	0.34	0.08	0.42	0.42	0.45	0.17	0.63	0.08	1.0	0.43	0.4	0.57	0.69	0.4	0.16	0.61	0.25	0.41	0.3	0.64	0.26	0.06	0.29	0.25	0.51	0.35	0.03	0.63	0.44
CCL19469 (BN171_3170003)	0.15	0.02	0.32	0.08	0.18	0.07	0.16	0.06	1.0	0.4	0.46	0.58	0.33	0.21	0.05	0.4	0.3	0.13	0.25	0.12	0.02	0.1	0.11	0.07	0.1	0.05	0.01	0.5	0.6
CCL19620 (smpB)	0.47	0.36	0.58	0.46	0.41	0.35	0.6	0.28	1.0	0.72	0.71	0.74	0.42	0.43	0.37	0.38	0.39	0.4	0.54	0.41	0.26	0.11	0.6	0.36	0.34	0.28	0.07	0.24	0.74
CCL20059 (carA)	0.06	0.15	0.17	0.48	0.32	0.42	0.18	0.09	0.54	0.2	0.18	0.18	0.47	0.08	1.0	0.48	0.09	0.16	0.27	0.11	0.12	0.16	0.22	0.94	0.17	0.1	0.07	0.17	0.13
CCL20060 (pyrF)	0.06	0.18	0.19	0.51	0.36	0.3	0.11	0.14	0.97	0.11	0.09	0.09	0.27	0.07	1.0	0.28	0.09	0.19	0.18	0.15	0.12	0.24	0.11	0.55	0.09	0.17	0.03	0.08	0.09
CCL20296 (BN171_4060003)	0.35	0.21	0.48	1.0	0.48	0.0	0.08	0.15	0.79	0.1	0.07	0.09	0.19	0.27	0.38	0.21	0.23	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06
CCL20297 (BN171_4060004)	0.15	0.06	0.27	0.35	0.23	0.0	0.24	0.07	1.0	0.16	0.2	0.23	0.3	0.14	0.11	0.41	0.22	0.17	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24
CCL20668 (BN171_880004)	0.18	0.21	0.23	0.31	0.22	0.0	0.73	0.12	1.0	0.72	0.43	0.46	0.43	0.11	0.14	0.74	0.27	0.11	0.02	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.35
CCL20669 (BN171_880005)	0.09	0.17	0.15	0.36	0.15	0.06	0.21	0.08	1.0	0.35	0.27	0.18	0.18	0.07	0.17	0.25	0.15	0.11	0.16	0.05	0.1	0.1	0.05	0.09	0.08	0.03	0.06	0.0	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)