Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
ATCC_14028
SL1344
ATCC_14028,E-stationary,WT
14028s
ATCC_14028,Log,rpsL*_mut
14028s,mLPM
opgGH_mut
LT2
Florfenicol
NCTC_12023,37_C
Chlortetracycline
SL1344,NarS_defic
ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut
LT2,ridA
fliA_del
High-patho
LT2,Cell_susp_cult
14028s,hilC_del,pBAD24
14028s,sprB_del,pBAD24
14028s,pBAD24
gastro
hfq_mut
Low-patho,42C
plank_cells
ATCC_14028,gastro
Typh_14028s,Expo_phase
biofilm,cpxR_mut
14028s,typhoid
14028s,rtcR
Typh_14028s
infection
ATCC_14028,Log,WT
14028s,rtcB
High-patho,42C
LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C
plank_cells,cpxR_mut
biofilm
ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut
ATCC_14028,Log,rpsD*_mut
AAL18973 (yaaH)
0.2 0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.03 0.1 0.01 0.16 0.15 0.03 0.03 0.03 0.01 0.15 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.14 0.01 0.06 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 0.08 0.2 0.2 0.02 0.04
AAL19059 (rluA)
1.0 0.5 0.41 0.37 0.37 0.2 0.4 0.65 0.75 0.25 0.58 0.41 0.57 0.63 0.34 0.13 0.41 0.34 0.39 0.35 0.27 0.42 0.09 0.61 0.18 0.48 0.51 0.36 0.47 0.13 0.17 0.38 0.48 0.06 0.3 0.35 0.54 0.75 0.44
AAL19060 (hepA)
1.0 0.39 0.33 0.42 0.25 0.25 0.39 0.47 0.84 0.26 0.67 0.6 0.43 0.57 0.3 0.13 0.24 0.29 0.37 0.33 0.18 0.13 0.08 0.84 0.15 0.73 0.78 0.34 0.61 0.06 0.13 0.22 0.61 0.1 0.17 0.39 0.66 0.6 0.32
AAL19185 (uppS)
0.69 0.42 0.18 0.44 0.46 0.09 0.58 0.67 0.69 0.24 0.63 0.74 0.51 0.82 0.68 0.32 0.55 0.78 1.0 1.0 0.16 0.21 0.51 0.72 0.2 0.34 0.82 0.58 0.49 0.11 0.2 0.44 0.62 0.43 0.9 0.54 0.98 0.35 0.91
AAL19186 (cdsA)
0.5 0.49 0.32 0.38 0.35 0.12 0.6 0.74 0.83 0.29 0.96 0.76 0.43 1.0 0.71 0.32 0.49 0.8 0.72 0.79 0.24 0.31 0.47 0.76 0.29 0.52 0.75 0.51 0.46 0.08 0.24 0.4 0.57 0.32 0.53 0.51 0.86 0.36 0.64
AAL19273 (gpt)
0.18 0.37 0.05 0.25 0.21 0.1 0.61 0.26 0.3 0.26 0.44 1.0 0.46 0.3 0.39 0.07 0.33 0.28 0.28 0.38 0.06 0.15 0.11 0.63 0.13 0.62 0.98 0.27 0.31 0.35 0.16 0.2 0.49 0.07 0.43 0.84 0.55 0.1 0.45
AAL19442 (adk)
0.26 0.27 0.08 0.41 0.24 0.15 0.36 0.33 0.35 0.37 0.35 0.66 0.2 0.38 1.0 0.09 0.3 0.47 0.5 0.53 0.04 0.22 0.14 0.32 0.05 0.57 0.55 0.45 0.29 0.08 0.16 0.2 0.32 0.1 0.37 0.52 0.28 0.16 0.3
AAL19757 (rhlE)
1.0 0.3 0.04 0.29 0.19 0.03 0.11 0.41 0.28 0.03 0.31 0.55 0.17 0.68 0.14 0.07 0.06 0.19 0.3 0.2 0.08 0.04 0.05 0.41 0.11 0.37 0.94 0.22 0.63 0.03 0.09 0.14 0.86 0.02 0.07 0.54 0.54 0.08 0.3
AAL19770 (ybiP)
1.0 0.32 0.11 0.12 0.16 0.03 0.18 0.3 0.31 0.11 0.62 0.3 0.28 0.43 0.24 0.22 0.23 0.41 0.45 0.54 0.06 0.13 0.47 0.59 0.12 0.27 0.5 0.25 0.15 0.08 0.13 0.15 0.17 0.35 0.83 0.14 0.9 0.12 0.24
AAL19773 (ybiS)
0.46 0.43 0.19 0.28 0.3 0.15 0.68 0.6 0.51 0.24 0.47 0.9 0.59 0.95 0.4 0.18 0.53 0.42 0.56 0.55 0.11 0.2 0.16 0.5 0.24 1.0 0.81 0.44 0.44 0.13 0.2 0.29 0.54 0.17 0.81 0.35 0.62 0.16 0.63
AAL19774 (ybiT)
0.57 0.37 0.18 0.47 0.22 0.2 0.47 0.57 0.35 0.24 0.4 0.64 0.31 0.85 0.3 0.24 0.24 0.74 1.0 0.89 0.16 0.18 0.2 0.56 0.22 0.72 0.56 0.46 0.73 0.15 0.29 0.18 0.8 0.25 0.32 0.45 0.6 0.24 0.3
AAL19788 (yliG)
0.43 0.44 0.16 0.37 0.27 0.14 0.67 0.62 0.56 0.34 0.48 0.72 0.38 0.91 0.25 0.14 0.34 0.9 1.0 0.96 0.07 0.32 0.19 0.66 0.12 0.94 1.0 0.35 0.4 0.09 0.24 0.22 0.43 0.15 0.55 0.61 0.77 0.36 0.34
AAL19909 (ycaO)
0.49 0.38 0.12 0.38 0.27 0.09 0.25 0.58 0.35 0.15 0.34 0.61 0.26 0.9 0.34 0.18 0.19 0.35 0.5 0.41 0.12 0.12 0.27 0.68 0.09 0.8 1.0 0.3 0.64 0.09 0.13 0.19 0.71 0.13 0.19 0.55 0.89 0.16 0.35
AAL19918 (msbA)
0.37 0.41 0.18 0.37 0.25 0.13 0.55 0.55 0.4 0.25 0.51 0.68 0.39 1.0 0.87 0.25 0.38 0.65 0.69 0.75 0.1 0.31 0.25 0.58 0.11 0.57 0.48 0.39 0.39 0.15 0.17 0.25 0.4 0.27 0.67 0.38 0.62 0.24 0.45
AAL19927 (mukE)
0.46 0.71 0.67 0.64 0.56 0.25 0.77 0.81 0.77 0.72 0.65 0.79 0.58 1.0 0.99 0.26 0.63 0.65 0.69 0.63 0.23 0.47 0.34 0.76 0.18 0.77 0.5 0.58 0.63 0.1 0.25 0.4 0.51 0.23 0.71 0.48 0.76 0.89 0.49
AAL19928 (mukB)
0.48 0.62 0.62 0.59 0.75 0.48 0.43 0.78 0.66 0.62 0.41 0.76 0.52 1.0 0.92 0.19 0.6 0.41 0.51 0.45 0.28 0.65 0.15 0.58 0.17 0.66 0.44 0.43 0.55 0.14 0.21 0.47 0.47 0.1 0.6 0.43 0.57 0.84 0.41
AAL19991 (pyrD)
0.22 0.45 0.07 0.29 0.18 0.17 0.77 0.49 0.19 0.35 0.26 0.98 0.23 0.5 0.83 0.17 0.19 0.74 0.74 0.87 0.05 0.17 0.33 0.53 0.07 0.42 1.0 0.3 0.18 0.08 0.16 0.32 0.24 0.2 0.34 0.38 0.89 0.14 0.43
AAL19994 (ycbY)
0.33 0.54 0.23 0.36 0.28 0.12 0.73 0.54 0.67 0.36 0.73 1.0 0.31 0.82 0.77 0.14 0.34 0.95 1.0 0.98 0.12 0.3 0.17 0.66 0.14 0.7 0.67 0.35 0.32 0.09 0.18 0.22 0.33 0.13 0.53 0.5 0.81 0.41 0.35
AAL19995 (uup)
0.39 0.45 0.26 0.35 0.51 0.22 0.77 0.65 0.5 0.36 0.49 0.72 0.27 1.0 0.42 0.19 0.3 0.5 0.57 0.55 0.14 0.36 0.25 0.54 0.1 0.69 0.5 0.29 0.33 0.11 0.15 0.3 0.28 0.14 0.51 0.34 0.62 0.73 0.27
AAL20000 (fabA)
0.39 0.25 0.07 0.39 0.29 0.14 0.32 0.3 0.29 0.26 0.37 0.67 0.18 0.38 0.21 0.1 0.22 0.24 0.34 0.34 0.05 0.18 0.15 0.7 0.07 0.43 1.0 0.26 0.28 0.15 0.09 0.19 0.29 0.09 0.27 1.0 0.49 0.17 0.28
AAL20116 (rluC)
0.56 0.37 0.19 0.4 0.33 0.13 0.34 0.39 0.33 0.36 0.46 0.79 0.67 0.84 0.48 0.05 0.44 0.54 0.58 0.7 0.14 0.28 0.05 0.51 0.15 0.89 0.73 0.5 0.57 0.25 0.09 0.43 0.67 0.03 0.68 0.53 0.56 0.22 1.0
AAL20121 (plsX)
0.47 0.39 0.11 0.25 0.29 0.06 0.34 0.51 0.49 0.23 0.63 0.68 0.19 1.0 0.2 0.17 0.1 0.46 0.51 0.49 0.08 0.39 0.21 0.33 0.09 0.35 0.47 0.34 0.36 0.16 0.13 0.26 0.35 0.14 0.15 0.4 0.36 0.17 0.33
AAL20122 (fabH)
0.62 0.39 0.17 0.41 0.38 0.18 0.47 0.51 0.65 0.34 0.65 1.0 0.21 0.71 0.35 0.18 0.19 0.41 0.4 0.42 0.15 0.22 0.18 0.48 0.18 0.65 0.85 0.34 0.6 0.17 0.16 0.29 0.71 0.11 0.25 0.69 0.35 0.25 0.4
AAL20123 (fabD)
0.67 0.49 0.23 0.56 0.47 0.43 0.39 0.69 0.68 0.45 0.67 1.0 0.22 0.88 0.53 0.21 0.31 0.37 0.47 0.42 0.61 0.72 0.17 0.57 0.44 0.72 0.89 0.28 0.53 0.15 0.23 0.34 0.61 0.09 0.32 0.79 0.43 0.39 0.38
AAL20155 (potA)
0.49 0.29 0.07 0.25 0.16 0.06 0.43 0.31 0.36 0.15 0.47 0.59 0.23 0.38 0.44 0.14 0.24 0.57 0.6 0.69 0.04 0.13 0.2 0.6 0.05 0.38 0.33 0.32 0.24 0.14 0.11 0.13 0.25 0.21 0.39 0.33 1.0 0.14 0.25
AAL20163 (trmU)
0.38 0.37 0.12 0.27 0.22 0.07 0.68 0.41 0.3 0.22 0.41 0.57 0.33 0.72 0.76 0.14 0.19 0.85 0.85 1.0 0.07 0.27 0.18 0.33 0.08 0.4 0.35 0.29 0.3 0.08 0.16 0.2 0.31 0.15 0.35 0.31 0.45 0.16 0.33
AAL20172 (STM1243)
1.0 0.13 0.1 0.03 0.13 0.01 0.04 0.15 0.17 0.01 0.35 0.03 0.07 0.15 0.07 0.25 0.02 0.1 0.15 0.21 0.18 0.18 0.15 0.31 0.36 0.02 0.11 0.13 0.04 0.0 0.02 0.11 0.06 0.14 0.03 0.04 0.62 0.07 0.09
AAL20252 (ydiY)
0.21 0.18 0.06 0.08 0.19 0.03 0.4 0.18 0.14 0.06 0.2 0.27 0.12 0.28 0.1 0.1 0.36 0.21 0.21 0.27 0.05 0.07 0.11 0.22 0.05 0.2 1.0 0.12 0.09 0.05 0.07 0.09 0.11 0.11 0.67 0.14 0.54 0.08 0.15
AAL20572 (ydaO)
0.25 0.29 0.14 0.25 0.4 0.06 0.31 0.36 0.23 0.32 0.32 0.34 0.23 0.46 0.58 0.09 0.42 0.62 0.64 0.7 0.09 0.17 0.11 0.32 0.1 0.41 0.39 0.38 0.27 0.05 0.24 0.25 0.33 0.08 1.0 0.36 0.4 0.27 0.41
AAL20624 (yciH)
0.17 0.36 0.11 0.2 0.21 0.08 0.59 0.23 0.32 0.2 0.38 0.25 0.19 0.28 0.25 0.14 0.23 1.0 0.7 0.88 0.12 0.12 0.13 0.53 0.07 0.2 0.45 0.21 0.13 0.03 0.08 0.14 0.14 0.17 0.49 0.33 0.58 0.55 0.2
AAL20625 (pyrF)
0.2 0.33 0.09 0.33 0.16 0.12 0.56 0.38 0.31 0.29 0.34 0.55 0.18 0.57 0.4 0.06 0.22 0.9 0.71 1.0 0.1 0.2 0.07 0.4 0.1 0.49 0.76 0.2 0.3 0.13 0.13 0.1 0.35 0.06 0.46 0.52 0.48 0.21 0.18
AAL20632 (topA)
0.55 0.37 0.57 0.36 0.23 0.17 0.31 0.44 0.53 0.38 0.53 0.53 0.38 0.58 0.43 0.21 0.3 0.36 0.44 0.4 0.18 0.36 0.13 0.6 0.16 0.85 1.0 0.43 0.44 0.18 0.18 0.19 0.48 0.17 0.4 0.85 0.59 0.47 0.22
AAL20637 (yciL)
0.76 0.32 0.22 0.47 0.4 0.09 0.25 0.57 0.43 0.26 0.45 0.83 0.33 0.73 0.21 0.12 0.42 0.43 0.64 0.55 0.09 0.16 0.11 0.61 0.18 0.65 0.76 0.42 0.75 0.16 0.27 0.27 1.0 0.12 0.46 0.6 0.53 0.38 0.39
AAL20654 (yciA)
0.4 0.56 0.21 0.28 0.18 0.07 0.65 0.47 0.28 0.24 0.4 1.0 0.3 0.72 0.56 0.09 0.27 0.58 0.54 0.69 0.16 0.71 0.05 0.37 0.14 0.58 0.39 0.22 0.26 0.26 0.16 0.17 0.4 0.05 0.41 0.39 0.5 0.16 0.24
AAL20698 (pth)
0.39 0.54 0.88 0.36 0.31 0.09 0.52 0.49 0.33 0.4 0.51 0.94 1.0 0.51 0.71 0.35 0.28 0.61 0.56 0.8 0.19 0.23 0.19 0.61 0.26 0.49 0.78 0.47 0.43 0.11 0.31 0.44 0.65 0.39 0.57 0.84 0.76 0.35 0.59
AAL20699 (ychF)
0.39 0.36 0.41 0.45 0.18 0.1 0.43 0.45 0.32 0.35 0.38 1.0 0.44 0.67 0.51 0.15 0.28 0.56 0.55 0.59 0.08 0.22 0.18 0.42 0.19 0.54 0.67 0.4 0.62 0.15 0.21 0.27 0.85 0.18 0.38 0.47 0.43 0.21 0.35
AAL20726 (ycgN)
0.35 0.6 0.67 0.35 0.39 0.08 0.66 0.45 0.36 0.38 0.66 0.37 0.76 0.65 0.46 0.44 0.24 0.71 0.9 1.0 0.18 0.48 0.36 0.43 0.17 0.56 0.83 0.53 0.6 0.24 0.32 0.57 0.66 0.44 0.43 0.57 0.73 0.43 0.59
AAL20735 (yeaZ)
0.37 0.27 0.1 0.36 0.18 0.04 0.28 0.4 0.24 0.16 0.27 0.47 0.27 0.7 0.53 0.04 0.42 0.66 0.65 0.71 0.04 0.13 0.03 0.3 0.13 0.33 0.36 0.28 0.65 0.03 0.12 0.23 1.0 0.03 0.6 0.36 0.25 0.16 0.34
AAL20761 (proQ)
0.5 0.3 0.14 0.42 0.43 0.14 0.48 0.54 0.33 0.31 0.4 0.74 0.22 0.86 0.35 0.1 0.44 0.28 0.31 0.31 0.14 0.18 0.16 0.35 0.29 0.65 0.56 0.29 0.73 0.12 0.12 0.25 1.0 0.09 0.49 0.46 0.28 0.29 0.32
AAL20816 (ntpA)
0.43 0.52 0.36 0.56 0.48 0.38 0.42 0.63 0.42 0.33 0.31 0.76 0.24 1.0 0.31 0.2 0.13 0.37 0.45 0.44 0.25 0.8 0.21 0.51 0.23 0.6 0.65 0.36 0.8 0.13 0.21 0.23 1.0 0.13 0.12 0.51 0.45 0.48 0.26
AAL20817 (aspS)
0.27 0.3 0.29 0.45 0.38 0.28 0.22 0.48 0.42 0.34 0.36 0.62 0.22 0.82 0.18 0.13 0.09 0.24 0.3 0.28 0.14 0.32 0.11 0.36 0.12 0.69 0.5 0.35 0.76 0.05 0.22 0.2 1.0 0.06 0.08 0.33 0.36 0.45 0.26
AAL20825 (argS)
0.31 0.31 0.13 0.37 0.23 0.13 0.33 0.43 0.38 0.3 0.36 0.66 0.32 0.73 0.41 0.15 0.16 0.88 0.95 1.0 0.08 0.28 0.16 0.48 0.1 0.52 0.5 0.38 0.56 0.12 0.37 0.17 0.78 0.15 0.2 0.4 0.4 0.26 0.34
AAL21000 (rfbD)
0.31 0.39 0.42 0.48 0.37 0.14 0.8 0.47 0.52 0.36 0.53 0.66 0.45 0.57 0.53 0.22 0.45 0.56 0.58 0.59 0.08 0.17 0.41 0.34 0.17 0.62 0.41 0.38 0.76 0.14 0.15 0.3 1.0 0.26 0.61 0.26 0.39 0.59 0.38
AAL21026 (udk)
0.6 0.62 0.24 0.41 0.58 0.12 0.73 0.57 0.33 0.38 0.48 0.9 0.91 0.93 0.69 0.36 0.28 0.52 0.57 0.68 0.22 0.36 0.56 0.69 0.2 0.6 0.7 0.74 0.62 0.26 0.43 0.53 0.86 0.56 0.67 0.46 0.68 0.35 1.0
AAL21039 (yegQ)
0.24 0.34 0.08 0.32 0.13 0.11 0.7 0.35 0.44 0.2 0.26 0.68 0.25 0.34 0.22 0.15 0.13 0.92 1.0 0.98 0.07 0.07 0.18 0.6 0.09 0.4 0.64 0.24 0.28 0.07 0.2 0.1 0.44 0.19 0.18 0.4 0.97 0.14 0.19
AAL21129 (yejK)
0.73 0.62 0.3 0.61 0.54 0.29 0.81 0.74 0.65 0.55 0.7 0.7 0.47 0.91 0.8 0.3 0.46 0.92 0.92 1.0 0.2 0.55 0.45 0.71 0.17 0.66 0.82 0.53 0.5 0.22 0.32 0.52 0.58 0.34 0.63 0.68 0.85 0.6 0.74
AAL21269 (truA)
0.59 0.58 0.3 0.41 0.29 0.42 0.45 0.64 0.45 0.4 0.6 0.63 0.27 0.98 0.28 0.31 0.25 0.47 0.6 0.54 0.33 1.0 0.2 0.32 0.29 0.65 0.5 0.34 0.47 0.1 0.17 0.23 0.54 0.13 0.32 0.3 0.49 0.49 0.33
AAL21270 (usg)
0.44 0.5 0.27 0.42 0.27 0.36 0.41 0.55 0.53 0.33 0.55 0.69 0.23 0.9 0.31 0.17 0.26 0.45 0.57 0.51 0.26 1.0 0.11 0.35 0.29 0.66 0.49 0.37 0.51 0.09 0.16 0.23 0.55 0.06 0.29 0.26 0.46 0.37 0.35
AAL21286 (yfcB)
0.49 0.6 0.32 0.44 0.46 0.24 0.68 0.68 0.69 0.57 0.82 0.99 0.45 1.0 0.77 0.16 0.25 0.66 0.59 0.67 0.19 0.44 0.22 0.71 0.19 0.81 0.99 0.41 0.5 0.24 0.2 0.45 0.5 0.12 0.38 0.95 0.94 0.43 0.79
AAL21377 (dapE)
0.5 0.57 0.52 0.45 0.47 0.28 0.41 0.66 0.73 0.56 0.85 0.7 0.66 0.94 0.95 0.17 0.37 0.55 0.6 0.6 0.16 0.43 0.13 0.58 0.25 1.0 0.83 0.62 0.29 0.08 0.34 0.5 0.28 0.17 0.38 0.98 0.61 0.48 0.71
AAL21391 (uraA)
0.1 0.3 0.06 0.23 0.04 0.36 0.21 0.35 0.32 0.2 0.27 0.85 0.08 0.57 0.15 0.02 0.08 0.09 0.1 0.11 0.03 0.12 0.04 0.38 0.04 0.33 1.0 0.1 0.07 0.07 0.04 0.27 0.11 0.02 0.07 0.29 0.46 0.08 0.25
AAL21413 (engA)
0.5 0.47 0.26 0.51 0.24 0.63 0.53 0.64 0.35 0.24 0.38 0.78 0.33 1.0 0.52 0.41 0.47 0.57 0.75 0.68 0.51 0.57 0.35 0.55 0.34 0.9 0.71 0.28 0.61 0.07 0.22 0.2 0.65 0.17 0.66 0.27 0.84 0.28 0.29
AAL21419 (yfgB)
0.74 0.41 0.16 0.41 0.45 0.35 0.58 0.6 0.49 0.31 0.58 0.74 0.61 1.0 0.35 0.21 0.28 0.46 0.6 0.58 0.27 0.27 0.3 0.56 0.25 0.69 0.93 0.42 0.4 0.15 0.17 0.33 0.44 0.23 0.56 0.49 0.7 0.37 0.63
AAL21440 (suhB)
0.57 0.32 0.1 0.33 0.21 0.07 0.82 0.57 0.22 0.13 0.38 0.76 0.27 0.72 0.34 0.1 0.65 0.62 0.61 0.62 0.05 0.31 0.21 0.63 0.07 0.39 0.67 0.2 0.5 0.38 0.15 0.22 0.77 0.12 0.51 0.35 1.0 0.07 0.3
AAL21462 (yfhC)
0.59 0.7 0.44 0.3 0.25 0.12 0.44 0.44 0.54 0.24 0.85 0.46 0.7 0.68 0.3 0.26 0.32 0.61 0.73 0.75 0.59 1.0 0.07 0.52 0.49 0.41 0.75 0.39 0.44 0.42 0.25 0.37 0.39 0.15 0.31 0.45 0.67 0.23 0.55
AAL21537 (srmB)
0.9 0.49 0.23 0.46 0.35 0.22 0.48 0.59 0.64 0.45 0.58 1.0 0.39 0.78 0.82 0.15 0.3 0.57 0.55 0.6 0.11 0.28 0.21 0.66 0.12 0.74 0.95 0.48 0.42 0.2 0.24 0.41 0.41 0.13 0.41 0.59 0.75 0.33 0.66
AAL21542 (yfiF)
0.31 0.17 0.11 0.19 0.14 0.12 0.05 0.13 0.26 0.09 0.31 0.41 0.19 0.18 0.15 0.03 0.04 0.09 0.11 0.11 0.08 0.05 0.03 0.44 0.07 0.29 1.0 0.12 0.23 0.02 0.04 0.13 0.27 0.02 0.05 0.8 0.48 0.11 0.24
AAL21560 (yfiR)
0.7 0.3 0.19 0.21 0.23 0.03 0.16 0.19 0.58 0.12 0.99 0.54 0.4 0.1 0.43 0.46 0.12 0.33 0.28 0.39 0.1 0.08 0.55 0.53 0.18 0.15 0.26 0.35 0.31 0.1 0.08 0.33 0.32 0.41 0.08 0.23 1.0 0.21 0.51
AAL21858 (ygdE)
0.43 0.46 0.41 0.36 0.23 0.15 0.73 0.65 0.44 0.35 0.58 0.49 0.29 0.69 0.54 0.38 0.62 0.79 1.0 0.9 0.46 0.28 0.23 0.48 0.41 0.59 0.46 0.36 0.45 0.13 0.43 0.21 0.48 0.26 0.67 0.28 0.73 0.39 0.21
AAL21859 (ygdD)
0.55 0.88 0.25 0.54 0.12 0.18 0.91 0.56 0.36 0.26 0.52 0.84 0.17 0.62 0.82 0.39 0.56 0.95 0.59 0.82 0.51 0.55 0.17 0.71 0.85 0.65 0.68 0.42 0.74 0.14 0.33 0.12 0.95 0.18 0.74 0.4 1.0 0.13 0.15
AAL21860 (gcvA)
0.5 0.51 0.44 0.23 0.18 0.15 0.71 0.79 0.44 0.37 0.81 0.3 0.46 0.84 0.35 0.54 0.43 0.83 0.95 1.0 0.42 0.74 0.36 0.48 0.52 0.49 0.32 0.55 0.34 0.13 0.5 0.2 0.34 0.53 0.47 0.17 0.93 0.24 0.25
AAL21936 (ygfA)
1.0 0.22 0.49 0.12 0.39 0.04 0.16 0.48 0.28 0.23 1.0 0.16 0.62 0.42 0.1 0.15 0.11 0.22 0.21 0.27 0.13 0.08 0.12 0.17 0.23 0.13 0.13 0.31 0.27 0.01 0.21 0.41 0.23 0.1 0.34 0.13 0.24 0.4 0.41
AAL22097 (ygjT)
1.0 0.2 0.15 0.14 0.05 0.03 0.19 0.3 0.14 0.07 0.4 0.07 0.11 0.62 0.12 0.06 0.19 0.22 0.22 0.27 0.07 0.18 0.05 0.46 0.07 0.23 0.08 0.25 0.22 0.04 0.05 0.1 0.21 0.13 0.18 0.07 0.92 0.06 0.11
AAL22177 (yrbA)
0.78 0.44 0.25 0.35 0.4 0.2 0.88 0.62 0.51 0.31 0.67 0.7 0.53 1.0 0.57 0.28 0.55 0.32 0.34 0.39 0.13 0.22 0.32 0.74 0.26 0.53 0.85 0.59 0.31 0.13 0.17 0.47 0.41 0.35 1.0 0.7 0.86 0.36 0.63
AAL22243 (mreB)
0.43 0.46 0.22 0.41 0.2 0.14 0.5 0.48 0.44 0.35 0.39 1.0 0.27 0.85 0.56 0.1 0.58 0.39 0.44 0.45 0.17 0.71 0.21 0.52 0.13 0.78 0.82 0.39 0.49 0.15 0.15 0.23 0.65 0.09 0.74 0.59 0.63 0.2 0.34
AAL22253 (yhdG)
0.98 0.27 0.06 0.37 0.2 0.07 0.62 0.54 0.46 0.12 0.84 0.86 0.18 0.7 0.39 0.11 0.45 0.66 0.54 0.65 0.05 0.11 0.15 0.7 0.05 0.42 1.0 0.29 0.5 0.19 0.08 0.15 0.62 0.11 0.26 0.63 0.63 0.12 0.21
AAL22349 (aroK)
0.7 0.53 0.3 0.54 0.38 0.19 1.0 0.67 0.56 0.42 0.78 0.93 0.5 1.0 0.76 0.3 0.65 0.76 0.69 0.8 0.22 0.22 0.36 0.63 0.29 0.68 1.0 0.66 0.64 0.19 0.31 0.44 0.81 0.27 0.91 0.59 0.59 0.41 0.61
AAL22385 (glpG)
0.6 0.55 0.16 0.34 0.14 0.15 0.59 0.33 0.27 0.18 0.28 0.57 0.56 0.55 0.75 0.11 0.33 0.38 0.36 0.42 0.13 0.36 0.11 0.76 0.37 0.47 0.44 0.35 0.28 0.07 0.15 0.26 0.39 0.08 0.49 0.38 1.0 0.13 0.43
AAL22564 (yibP)
0.47 0.43 0.14 0.32 0.16 0.09 0.44 0.46 0.27 0.25 0.35 1.0 0.24 0.6 0.91 0.05 0.64 0.37 0.49 0.48 0.09 0.34 0.04 0.43 0.14 0.37 0.5 0.3 0.37 0.11 0.14 0.24 0.39 0.03 0.63 0.47 0.48 0.14 0.43
AAL22592 (pyrE)
0.09 0.14 0.03 0.13 0.03 0.07 0.33 0.12 0.08 0.11 0.09 0.24 0.05 0.18 1.0 0.02 0.14 0.11 0.08 0.1 0.05 0.09 0.03 0.23 0.03 0.05 0.26 0.05 0.02 0.02 0.04 0.15 0.03 0.01 0.23 0.26 0.33 0.03 0.17
AAL22593 (rph)
0.34 0.26 0.05 0.21 0.12 0.05 0.26 0.18 0.2 0.18 0.1 0.77 0.23 0.24 0.26 0.07 0.1 0.21 0.22 0.25 0.06 0.09 0.11 0.53 0.09 0.2 1.0 0.22 0.26 0.06 0.06 0.13 0.41 0.07 0.2 0.76 0.82 0.08 0.32
AAL22600 (rpoZ)
0.59 0.48 0.22 0.51 0.28 0.27 1.0 0.58 0.52 0.29 0.74 0.86 0.31 0.85 0.31 0.18 0.55 0.31 0.48 0.41 0.22 0.26 0.19 0.59 0.17 0.49 0.8 0.35 0.53 0.11 0.24 0.29 0.54 0.16 0.68 0.75 0.54 0.28 0.4
AAL22657 (STM3796A)
0.64 0.18 0.06 0.15 0.09 0.02 0.08 0.26 0.13 0.09 0.25 0.03 0.15 0.43 0.14 0.04 0.32 0.22 0.18 0.25 0.01 0.05 0.02 0.53 0.05 0.08 0.11 0.17 0.17 0.03 0.02 0.19 0.21 0.04 0.54 0.17 1.0 0.11 0.18
AAL22696 (dnaN)
0.64 0.46 0.37 0.51 0.29 0.21 0.35 0.58 0.39 0.44 0.27 0.75 0.34 0.76 0.64 0.17 0.41 0.5 0.5 0.51 0.28 0.51 0.18 0.46 0.2 0.71 0.42 0.45 0.99 0.13 0.19 0.26 1.0 0.15 0.58 0.27 0.56 0.52 0.31
AAL22697 (dnaA)
1.0 0.53 0.25 0.43 0.28 0.17 0.61 0.56 0.41 0.39 0.4 0.64 0.6 0.76 0.72 0.28 0.34 0.68 0.72 0.81 0.28 0.45 0.33 0.5 0.28 0.61 0.51 0.64 0.6 0.27 0.23 0.37 0.67 0.35 0.48 0.29 0.73 0.31 0.68
AAL22699 (rnpA)
1.0 0.32 0.03 0.23 0.18 0.07 0.13 0.28 0.13 0.12 0.27 0.86 0.19 0.5 0.11 0.11 0.04 0.14 0.16 0.17 0.02 0.26 0.12 0.3 0.03 0.46 0.43 0.27 0.41 0.08 0.07 0.16 0.43 0.09 0.18 0.29 0.23 0.06 0.21
AAL22700 (STM3841)
0.97 0.22 0.06 0.24 0.4 0.09 0.16 0.45 0.18 0.13 0.46 1.0 0.37 0.77 0.16 0.12 0.1 0.18 0.23 0.21 0.04 0.07 0.14 0.35 0.05 0.61 0.53 0.4 0.3 0.08 0.1 0.32 0.35 0.13 0.51 0.31 0.24 0.15 0.49
AAL22767 (rfe)
0.56 0.49 0.5 0.22 0.23 0.05 0.42 0.45 0.45 0.2 0.67 0.28 0.47 0.49 0.41 0.56 0.5 0.42 0.49 0.54 0.15 0.22 0.59 0.62 0.36 0.28 0.31 0.44 0.28 0.19 0.26 0.33 0.34 0.65 0.71 0.23 1.0 0.34 0.39
AAL22933 (ftsN)
0.35 0.36 0.17 0.19 0.17 0.05 0.2 0.42 0.34 0.26 0.44 0.45 0.32 0.62 1.0 0.06 0.4 0.19 0.32 0.29 0.07 0.38 0.07 0.37 0.14 0.39 0.24 0.29 0.21 0.13 0.12 0.27 0.22 0.04 0.52 0.25 0.34 0.18 0.5
AAL23107 (gltP)
1.0 0.3 0.18 0.21 0.2 0.07 0.18 0.38 0.23 0.18 0.33 0.15 0.29 0.72 0.28 0.04 0.46 0.19 0.18 0.23 0.09 0.29 0.05 0.27 0.09 0.32 0.14 0.21 0.33 0.2 0.2 0.13 0.34 0.03 0.7 0.07 0.29 0.25 0.26
AAL23144 (STM4320)
1.0 0.56 0.28 0.21 0.24 0.04 0.86 0.55 0.42 0.18 0.9 0.24 0.48 0.43 0.33 0.0 0.41 0.4 0.43 0.55 0.09 0.58 0.0 0.0 0.21 0.26 0.0 0.33 0.26 0.53 0.26 0.29 0.32 0.0 0.82 0.0 0.0 0.21 0.48
AAL23167 (yjeA)
0.58 0.42 0.14 0.4 0.27 0.1 0.58 0.42 0.48 0.19 0.7 0.99 0.37 0.38 0.72 0.19 0.22 0.48 0.48 0.57 0.08 0.13 0.18 0.71 0.09 0.39 0.85 0.37 0.43 0.12 0.22 0.25 0.51 0.24 0.37 0.67 1.0 0.27 0.53
AAL23175 (yjeS)
0.58 0.24 0.16 0.15 0.12 0.05 0.26 0.2 0.14 0.1 0.61 0.19 0.44 0.16 0.35 0.19 0.17 0.4 0.32 0.47 0.08 0.13 0.19 0.3 0.11 0.12 0.11 0.22 0.16 0.03 0.13 0.24 0.16 0.22 1.0 0.13 0.71 0.14 0.37
AAL23217 (fklB)
0.2 0.18 0.04 0.25 0.17 0.15 0.17 0.24 0.1 0.21 0.06 0.58 0.11 0.31 0.4 0.03 0.2 0.12 0.12 0.13 0.05 0.07 0.03 0.5 0.08 0.29 0.83 0.16 0.23 0.07 0.05 0.15 0.3 0.02 0.29 1.0 0.36 0.09 0.25
AAL23278 (pyrI)
0.01 0.04 0.01 0.07 0.01 0.06 0.13 0.05 0.04 0.03 0.03 0.01 0.03 0.03 0.11 0.01 0.02 0.08 0.06 0.09 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.02 0.17 0.03 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.01 0.02 0.05 0.1 0.03 0.81
AAL23279 (pyrB)
0.03 0.06 0.01 0.11 0.01 0.09 0.14 0.08 0.06 0.05 0.05 0.04 0.03 0.1 0.12 0.01 0.02 0.1 0.09 0.11 0.0 0.03 0.02 0.06 0.01 0.04 0.43 0.03 0.02 0.0 0.03 1.0 0.02 0.0 0.01 0.13 0.16 0.03 0.84
AAL23372 (holD)
0.7 0.53 0.14 0.31 0.23 0.07 0.57 0.48 0.51 0.28 0.67 1.0 0.46 0.68 0.7 0.05 0.36 0.44 0.35 0.49 0.07 0.42 0.05 0.56 0.11 0.42 0.7 0.38 0.37 0.26 0.12 0.3 0.44 0.03 0.53 0.68 0.58 0.18 0.51
AAL23373 (rimI)
0.78 0.34 0.21 0.26 0.37 0.11 0.57 0.5 0.61 0.27 0.9 0.77 0.53 0.71 0.4 0.17 0.27 0.44 0.33 0.46 0.06 0.1 0.24 0.69 0.07 0.34 0.65 0.51 0.3 0.05 0.19 0.39 0.32 0.23 0.53 0.6 1.0 0.37 0.75
AAL23374 (yjjG)
0.78 0.56 0.24 0.39 0.3 0.15 1.0 0.43 0.46 0.37 0.6 0.91 0.29 0.6 0.69 0.23 0.44 0.68 0.68 0.67 0.16 0.4 0.26 0.66 0.14 0.46 0.62 0.46 0.46 0.12 0.23 0.32 0.54 0.22 0.66 0.6 0.91 0.35 0.44
AAL23375 (prfC)
0.54 0.4 0.13 0.44 0.25 0.17 0.93 0.45 0.63 0.24 0.72 0.95 0.17 0.65 0.99 0.13 0.49 0.71 0.74 0.72 0.09 0.18 0.18 0.55 0.1 0.58 0.53 0.28 0.37 0.11 0.14 0.22 0.37 0.1 1.0 0.37 0.77 0.24 0.33
AAL23412 (STM4597)
0.72 0.24 0.2 0.16 0.29 0.04 0.6 0.47 0.27 0.1 0.64 0.1 0.35 0.49 0.32 0.29 0.35 0.22 0.26 0.29 0.21 0.1 0.33 0.47 0.23 0.14 0.51 0.52 0.18 0.04 0.09 0.31 0.19 0.32 0.7 0.19 1.0 0.17 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)