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Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
ATCC_14028
SL1344
ATCC_14028,E-stationary,WT
14028s
ATCC_14028,Log,rpsL*_mut
14028s,mLPM
opgGH_mut
LT2
Florfenicol
NCTC_12023,37_C
Chlortetracycline
SL1344,NarS_defic
ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut
LT2,ridA
fliA_del
High-patho
LT2,Cell_susp_cult
14028s,hilC_del,pBAD24
14028s,sprB_del,pBAD24
14028s,pBAD24
gastro
hfq_mut
Low-patho,42C
plank_cells
ATCC_14028,gastro
Typh_14028s,Expo_phase
biofilm,cpxR_mut
14028s,typhoid
14028s,rtcR
Typh_14028s
infection
ATCC_14028,Log,WT
14028s,rtcB
High-patho,42C
LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C
plank_cells,cpxR_mut
biofilm
ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut
ATCC_14028,Log,rpsD*_mut
AAL19099 (yacA)
 1.04 0.05 0.03 -0.51 0.0 -0.58 -0.76 0.59 0.5 -0.01 0.61 1.23 0.64 1.09 -0.06 -1.44 -0.74 -0.88 -0.49 -0.44 -2.0 -1.07 -1.02 0.11 -1.48 -0.05 0.39 0.59 -0.41 -2.72 -0.68 0.45 -0.1 -1.47 -0.13 0.38 -0.11 -0.32 0.97
AAL19115 (pdhR)
 2.6 -0.41 0.1 -1.0 -2.47 -2.54 -0.29 0.16 -0.04 -0.84 1.8 -4.22 0.17 0.77 0.59 -2.19 -1.6 -0.65 -0.68 -0.2 -2.39 0.01 -3.01 0.38 -1.85 -0.64 0.59 0.87 -0.64 -1.44 -0.64 0.54 -0.61 -2.57 -2.06 0.44 0.75 -1.07 0.75
AAL19151 (sfsA)
 -0.07 0.37 1.26 -0.91 -0.05 -1.79 -0.77 0.21 -0.21 -0.17 0.21 -0.73 1.66 0.69 -0.15 0.34 -1.47 -0.84 -0.89 -0.69 0.18 -0.26 -0.84 -0.71 0.79 -0.05 -0.88 0.74 -0.48 -1.92 -0.38 0.47 -0.89 0.42 -1.18 -0.54 -0.4 0.43 1.0
AAL19266 (yafH)
 -1.92 0.31 2.17 -0.92 -1.07 -1.16 -1.62 -0.0 -0.38 0.41 0.17 -3.49 1.2 -0.46 -1.32 -1.35 1.79 -0.05 -0.41 0.18 -2.08 -0.47 -3.0 0.5 -1.81 0.17 -2.1 -0.13 -1.59 -3.41 -0.87 -1.01 -1.86 -1.97 2.32 -2.41 1.34 0.59 -1.03
AAL19326 (hemB)
 0.42 0.03 -0.07 0.23 0.13 -0.57 0.12 0.59 -0.27 -0.05 -0.5 0.24 0.62 0.38 0.5 -0.78 -1.38 -0.22 0.03 0.16 -1.58 -1.03 -0.88 -0.05 -1.17 -0.2 0.3 0.5 0.89 -3.24 0.04 0.43 0.86 -0.98 -1.57 0.11 0.09 -0.22 0.97
AAL19353 (brnQ)
 0.87 0.64 -1.21 -0.39 -1.22 -0.16 -0.54 0.97 -0.16 -0.23 -0.22 0.73 -1.14 1.15 -0.4 -0.76 -1.84 0.31 0.57 0.68 -0.54 0.19 -1.89 0.44 0.53 0.14 0.65 -0.12 0.77 -1.08 -0.12 -1.07 0.82 -1.47 -1.7 -0.39 0.58 -1.34 -1.35
AAL19412 (cof)
 -0.31 0.38 -0.41 -0.45 -0.04 -2.24 -1.38 0.11 -0.38 -1.29 -0.24 -1.91 0.93 -0.35 -0.31 0.07 -0.99 -0.3 -0.1 0.07 -1.89 -1.08 0.64 1.54 -0.64 -1.35 -0.6 0.29 0.16 -3.36 -0.75 1.09 -0.09 0.46 -0.92 -1.29 2.04 -1.25 1.46
AAL19429 (acrB)
 0.7 0.02 0.77 0.22 0.27 0.28 -0.42 0.09 0.04 -0.18 -0.36 1.01 0.53 0.49 -0.07 -0.31 -0.63 -0.82 -0.51 -0.59 -0.63 -0.75 -0.9 -0.2 -0.46 0.98 0.05 0.43 0.38 -2.23 -1.06 0.04 0.21 -0.69 -0.77 -0.56 0.03 0.61 0.03
AAL19430 (acrA)
 0.86 -0.17 0.35 -0.06 -0.09 -0.64 -0.11 0.23 -0.15 -0.07 0.1 0.87 0.67 0.66 0.94 -0.47 -0.98 -0.3 -0.19 -0.21 -0.83 -0.92 -1.24 -0.57 -0.34 0.97 -0.13 0.76 0.22 -2.15 -0.57 0.14 0.11 -0.63 -0.91 -0.78 -0.48 -0.2 0.7
AAL19454 (ybbJ)
 -0.49 0.69 0.82 0.01 -0.66 -0.72 -1.2 0.08 0.36 0.61 1.21 -0.23 0.55 0.12 -0.4 -1.82 -1.3 0.45 0.47 0.68 -0.3 0.07 -3.45 -0.26 -0.14 0.29 -0.41 0.14 0.8 -3.09 -0.65 -0.13 0.85 -2.73 -1.04 -0.23 0.04 0.6 -0.24
AAL19630 (glnS)
 -0.13 -0.2 -0.9 0.27 0.1 -1.05 -0.07 0.41 0.01 -0.05 -0.11 0.82 -0.13 0.6 0.03 -0.81 -0.29 -0.37 -0.14 -0.07 -2.24 -0.62 0.05 0.16 -1.45 0.48 0.39 0.39 0.73 -2.01 -0.58 0.04 0.85 -0.62 0.22 0.15 0.25 -0.3 0.83
AAL19751 (ybhQ)
 -1.24 0.84 0.08 -0.61 -0.39 -2.56 -1.82 0.75 -1.09 0.21 -1.14 -2.02 -0.3 -2.44 1.19 -0.01 0.3 1.07 0.77 1.32 0.36 2.76 -0.63 -0.65 0.68 -1.28 -1.67 -0.77 -3.14 -2.98 -0.61 -0.67 -3.13 -0.19 0.39 -1.62 -0.65 -0.8 -1.29
AAL20053 (ycdC)
 -0.81 1.45 0.13 -1.23 -0.37 -2.17 0.43 0.18 -0.76 -0.16 -0.26 -0.59 0.65 0.31 0.2 -1.24 -0.3 0.27 0.2 0.63 -0.48 2.13 -3.11 0.44 0.33 -0.07 -0.51 -0.67 -1.19 -2.58 -1.03 -0.12 -1.43 -1.72 0.91 -0.46 0.94 -1.05 -0.29
AAL20209 (yeaH)
 -1.22 -0.08 1.85 -1.12 -0.86 0.11 0.08 -0.28 -1.45 -0.72 -0.91 -3.23 2.03 -0.61 -1.1 0.72 -2.04 0.7 0.34 0.76 1.0 0.64 -2.39 -0.78 0.89 -0.19 -1.53 0.8 -0.43 -4.52 -0.66 -0.74 -1.1 0.64 -2.71 -1.87 -0.12 -0.27 0.45
AAL20288 (ydiK)
 -0.28 0.42 0.74 -0.25 -0.34 -1.08 -0.56 0.22 -0.23 -0.22 -0.1 -0.43 0.99 0.34 0.3 -0.88 -0.35 0.52 0.14 0.49 -0.05 0.18 -2.04 0.41 0.54 0.47 0.11 0.24 -0.05 -2.09 -0.37 -0.41 -0.12 -0.73 -0.9 -0.71 0.83 -0.15 0.29
AAL20313 (orf319)
 -0.67 -0.28 2.14 -0.99 -0.29 -1.33 -0.09 0.08 -1.67 -0.54 -1.31 -2.24 2.1 0.77 -1.3 0.89 -2.27 0.09 0.2 0.25 -0.04 -1.25 -2.12 -0.87 0.88 0.51 -3.07 0.12 -0.05 -4.54 -0.49 0.04 -0.79 0.98 -2.66 -2.59 -0.9 0.75 0.55
AAL20347 (ydhE)
 -0.72 0.38 0.4 -0.49 -0.12 -1.46 -0.98 -0.44 0.14 -0.58 0.55 -0.81 1.03 0.5 -2.02 -0.4 -1.48 -0.06 -0.02 0.18 -0.96 0.19 -1.13 0.67 0.79 1.23 0.14 0.07 0.37 -1.3 -0.73 -0.85 0.68 -0.01 -2.57 -1.22 1.07 0.94 -0.25
AAL20356 (rnt)
 0.41 0.09 -1.01 -0.44 -0.26 -1.96 -0.58 0.29 0.33 -0.1 0.89 0.8 0.39 1.03 -0.81 -0.44 -1.64 -0.29 -0.37 -0.07 -0.92 -0.1 -0.58 0.24 0.17 0.74 0.36 0.92 0.47 -1.47 -0.55 -0.56 0.62 -0.63 -1.21 0.09 0.17 -0.94 0.43
AAL20397 (ydgH)
 -0.07 0.25 -0.57 -0.01 0.65 -0.65 -0.47 0.53 0.07 0.45 0.14 0.54 -0.23 0.91 0.24 -1.52 -0.62 -0.74 -0.33 -0.39 -2.08 -0.57 -0.44 0.02 -1.21 0.59 0.96 -0.07 -0.17 -2.01 -0.75 0.53 0.11 -1.36 -0.93 0.58 0.28 -0.2 1.33
AAL20569 (nifJ)
 -0.28 -0.07 0.9 -0.69 -0.67 -0.9 0.23 -0.09 -1.38 -0.93 -1.42 -0.8 1.73 -0.53 -0.58 0.15 -2.36 1.22 1.15 1.19 0.21 -0.16 -1.19 0.13 0.39 -0.07 -0.13 0.63 -0.54 -3.41 -0.42 -0.15 -0.96 0.09 -2.43 -0.47 0.57 -0.25 0.31
AAL20690 (hemK)
 0.92 0.36 -0.68 0.15 0.54 -1.56 -1.72 0.78 -1.01 -0.45 -0.6 1.56 -0.39 1.6 -1.8 -1.39 -2.25 -0.85 0.23 -0.51 -1.36 -0.58 -1.6 0.23 -1.33 1.02 0.33 -0.09 1.22 -1.98 -1.05 -0.11 1.18 -2.37 -0.89 -0.35 -0.01 -0.08 0.54
AAL20691 (prfA)
 0.18 -0.26 -0.73 0.04 0.62 -2.05 -0.52 0.17 -1.37 -0.31 -0.94 0.97 0.43 0.75 0.11 -1.43 -1.1 0.27 0.94 0.6 -1.85 -1.53 -1.12 -0.33 -1.3 0.75 0.04 0.07 1.0 -1.91 -1.06 0.36 0.88 -1.3 0.78 -0.74 -0.46 0.17 1.03
AAL20734 (slp)
 0.17 0.14 -0.06 -0.04 -0.83 -1.19 -0.7 0.12 -0.1 -0.01 0.03 0.64 -0.73 0.82 -1.81 -0.98 -2.1 -1.56 -1.11 -1.36 1.22 1.06 -1.04 0.21 1.02 -0.08 0.54 -0.47 1.14 -1.53 -0.7 -0.93 1.97 -1.72 -1.98 0.37 0.14 -0.84 -0.49
AAL20823 (cutC)
 -0.67 -0.37 -0.55 -0.65 -0.9 -0.42 -0.63 1.0 -1.51 -0.71 -1.23 -1.67 -1.49 0.59 1.48 0.25 -0.9 0.32 0.3 0.55 0.99 1.34 1.01 0.55 0.27 -1.04 -0.63 0.31 -0.88 -2.97 0.07 -1.31 -0.32 0.23 -0.43 -0.9 1.35 -0.79 -2.03
AAL20906 (cspB)
 2.04 -0.67 -0.49 0.35 -0.33 -5.42 -3.64 -0.27 -3.95 -5.73 -3.14 -6.15 -0.02 -0.51 -3.07 -1.12 -2.3 -2.61 -1.42 -1.67 -1.72 -6.7 -0.27 2.74 0.29 -4.08 -1.64 1.09 1.96 -4.21 -1.43 0.29 2.47 -1.32 -1.47 -2.73 0.3 -0.61 0.66
AAL20973 (yeeY)
 -1.0 0.23 1.06 -0.81 -1.07 -1.76 0.53 -0.06 -1.62 -1.51 -1.03 -2.11 1.3 -0.79 -0.93 0.11 -1.77 -0.11 -0.08 0.2 1.77 -0.24 -1.15 1.22 1.45 -0.98 -1.15 -0.48 0.18 -4.59 -0.96 -0.77 0.45 0.31 -1.43 -2.01 1.79 -0.36 -0.07
AAL21057 (mrp)
 -0.35 -0.01 -0.37 0.52 0.56 -0.44 0.47 0.52 -0.07 0.24 -0.21 0.33 -0.16 0.65 0.05 -1.36 -0.47 -0.36 -0.05 -0.09 -1.65 -0.49 -1.13 0.08 -0.98 0.58 0.13 -0.15 0.67 -2.26 -0.28 0.39 0.64 -1.84 -0.24 0.55 0.01 0.37 0.57
AAL21073 (yohC)
 -1.5 1.28 1.9 -1.86 -1.84 -1.31 -0.3 0.32 -3.22 -2.41 -2.65 -4.94 1.49 -1.29 -2.07 0.42 -1.44 -0.75 -0.57 -0.26 2.01 -0.41 -2.86 1.42 2.12 -1.99 -1.98 -1.18 -1.23 -4.5 -0.9 -1.27 -1.67 0.05 -0.13 -2.74 1.83 -0.5 -0.45
AAL21166 (alkB)
 -0.8 0.56 1.43 -1.27 -0.09 -0.48 -0.79 -0.11 -0.07 -0.13 0.21 -0.32 1.73 0.21 -2.12 -0.8 -1.81 -0.25 -0.58 -0.31 0.89 -0.53 -3.25 0.46 0.69 -0.51 0.05 0.19 -0.58 -2.86 0.04 0.58 -1.03 -1.41 -2.2 -0.44 0.97 0.16 1.17
AAL21167 (ada)
 -0.8 0.82 1.44 -1.15 0.07 -0.6 -1.17 0.08 0.12 0.29 -0.02 0.15 1.7 0.7 -2.2 -1.4 -2.29 -0.83 -0.79 -0.58 1.18 -0.08 -3.64 -0.36 0.9 -0.26 0.29 0.16 -0.65 -2.05 -0.03 0.44 -0.84 -1.8 -2.89 -0.45 0.12 0.45 0.9
AAL21238 (ackA)
 0.4 0.35 -1.18 0.2 -0.74 -0.95 0.3 0.44 -0.08 -0.1 0.12 1.82 0.01 0.34 1.07 -0.52 -1.39 -0.93 -0.62 -0.45 -2.82 -1.17 0.27 0.34 -2.57 -0.28 0.48 0.53 0.84 -2.27 -0.41 -0.15 0.99 -0.11 -2.55 0.21 -0.08 -1.4 0.21
AAL21239 (pta)
 0.14 0.67 -1.19 0.67 -1.08 -0.49 -0.15 0.72 0.35 -0.02 0.09 2.3 -1.01 0.96 0.68 -2.31 -2.16 -1.42 -1.2 -1.0 -2.64 -0.96 -1.7 0.47 -2.94 -0.34 0.75 0.43 1.08 -2.81 -0.29 -0.47 1.41 -2.76 -2.59 0.41 -0.07 -1.4 -0.35
AAL21251 (yfcH)
 -0.01 0.42 1.11 -0.68 -0.24 -0.74 -1.2 0.59 -0.42 -0.29 -0.55 -1.4 1.68 0.73 -1.01 -0.92 -1.53 -0.31 -0.36 -0.11 0.72 -0.59 -2.05 0.17 0.99 -0.35 -1.06 0.18 0.4 -3.61 -0.23 0.47 0.24 -1.02 -1.15 -0.91 0.94 0.23 0.74
AAL21301 (ddg)
 1.44 0.06 -1.31 -0.67 -0.62 -4.65 -2.25 0.97 -1.74 -3.43 -0.68 -2.2 0.18 0.62 -1.47 0.18 -2.17 -0.99 0.56 -0.5 0.29 -1.02 1.76 0.6 -0.1 -1.2 0.17 0.55 0.13 -5.66 0.23 -0.15 0.8 0.03 -2.22 -2.6 2.23 -2.03 0.25
AAL21305 (STM2405)
 -0.92 0.83 1.99 -0.88 -0.05 -2.58 -1.16 -0.24 -0.36 -0.19 0.06 -1.4 2.2 -0.58 -0.01 -1.38 -1.49 0.39 0.36 0.52 -1.36 -0.7 -3.27 0.15 -0.73 0.37 -0.38 0.64 -1.32 -2.83 -0.26 0.35 -1.7 -1.01 -1.16 -0.33 0.65 0.48 0.65
AAL21313 (gltX)
 -0.42 -0.01 -1.14 0.29 -0.23 -0.82 0.85 0.21 0.07 0.05 0.16 1.1 -0.52 0.56 0.32 -1.24 -0.13 0.16 0.36 0.37 -1.97 -0.8 -1.14 0.05 -1.46 0.76 0.58 -0.04 0.52 -1.82 -0.5 -0.46 0.48 -1.16 0.43 0.18 0.36 -0.42 0.08
AAL21380 (STM2486)
 -0.43 0.07 1.29 -0.72 -0.26 -1.64 -0.64 0.7 -0.39 -0.44 -0.35 -0.97 1.47 1.38 -0.36 -0.12 -1.37 -0.0 -0.08 0.2 0.69 -0.42 -1.4 -0.19 0.45 -0.05 -0.54 -0.09 -0.27 -3.71 0.1 0.23 -0.21 -0.67 -1.12 -0.73 0.35 0.41 0.61
AAL21417 (gcpE)
 0.56 0.18 0.26 0.18 0.0 -0.44 -0.11 0.45 -0.5 -0.0 -1.0 0.1 0.32 0.48 -0.0 -0.44 -1.53 0.19 0.43 0.43 0.27 -0.39 -0.92 0.01 -0.39 -0.01 0.23 0.3 0.5 -3.27 0.13 0.16 0.35 -0.97 -1.25 -0.07 0.14 0.15 0.52
AAL21418 (yfgA)
 1.06 0.12 -0.28 0.07 -0.7 -1.01 -0.27 0.72 -0.37 -0.4 -0.45 0.26 0.11 1.07 0.37 -1.47 -0.85 0.14 0.5 0.58 -0.04 -0.28 -1.74 -0.08 0.32 0.27 0.43 0.06 0.66 -2.23 -0.53 -0.03 0.73 -1.77 -0.57 -0.09 0.02 -0.85 0.03
AAL21704 (yqaA)
 0.43 0.12 -1.08 -0.27 -0.57 -2.03 -0.21 -0.01 -0.1 -0.59 1.02 0.49 -0.2 0.65 0.85 -1.41 -1.29 0.3 0.05 0.28 -1.61 -0.24 -0.81 0.67 -0.97 -0.33 0.24 0.42 -0.0 -3.37 -1.05 -0.5 0.1 -1.05 1.76 0.32 0.65 -0.74 0.19
AAL21705 (yqaB)
 0.57 0.03 -0.74 -0.01 -1.04 -2.5 -0.29 0.17 -0.12 0.14 0.62 0.33 -0.49 0.37 0.44 -1.47 -0.9 0.51 0.49 0.67 -2.55 -0.3 -1.1 -0.16 -0.81 -0.23 -0.11 0.46 0.71 -2.28 -0.75 -0.36 0.84 -1.47 1.95 0.2 -0.18 -0.93 -0.05
AAL21915 (lysS)
 -0.2 -0.21 -0.99 0.7 0.29 0.72 0.68 0.46 0.34 0.35 -0.52 0.83 -0.94 0.66 0.74 -0.73 -0.87 -0.39 -0.07 -0.2 -2.07 -1.47 -0.19 0.07 -1.61 0.34 0.58 -0.19 0.36 -2.41 -0.73 -0.04 0.43 -1.05 -0.67 0.61 -0.02 0.39 -0.05
AAL21935 (ygfE)
 1.21 -0.88 0.78 -0.9 -0.17 -1.99 -0.17 0.9 0.36 -0.37 1.11 -1.25 1.24 0.81 -0.27 -0.33 -1.35 -0.69 -0.81 -0.47 -0.4 -2.27 -0.59 -0.52 -1.47 -0.5 -0.43 0.63 -0.74 0.17 0.81 0.65 -0.85 -0.34 -0.96 -0.14 -0.32 0.26 0.87
AAL22081 (ygiH)
 0.69 0.54 0.26 -0.73 -1.59 -1.54 -0.27 0.3 0.68 0.1 0.95 0.05 0.41 0.48 -0.43 -1.28 -0.99 -0.33 -0.46 -0.32 -0.54 0.3 -1.63 0.27 0.53 0.05 0.27 0.3 -0.08 -1.69 0.41 -0.03 0.12 -1.79 -0.65 0.48 0.88 -0.47 0.21
AAL22091 (oat)
 -2.08 0.07 2.38 -2.15 -2.88 -0.55 -0.87 0.0 -2.75 -1.68 -2.23 -3.82 2.21 -2.29 -2.56 -0.51 -3.17 -0.24 -0.32 -0.16 3.08 0.09 -5.12 -0.11 2.37 -1.43 -3.06 -0.8 -1.46 -5.44 -1.3 -2.16 -2.42 -1.41 -2.04 -3.16 0.54 -1.55 -1.45
AAL22152 (deaD)
 1.81 -0.49 -3.03 0.75 -1.03 -2.07 -0.97 0.29 0.25 -2.71 0.78 0.18 -0.81 0.52 -1.74 -0.86 -2.68 0.16 1.15 0.42 -1.84 -3.78 -1.61 -0.32 -0.26 0.01 0.28 -0.12 2.01 -2.99 0.12 -1.0 2.18 -1.89 -1.99 -1.43 0.1 -2.06 -0.47
AAL22171 (yhbZ)
 0.11 -0.48 -1.57 -0.33 -0.66 -2.13 0.39 0.13 1.4 -1.23 1.62 0.42 -0.4 0.06 -0.54 -0.85 -0.74 1.01 1.14 1.11 -1.47 -1.75 -1.08 0.73 -1.16 0.23 0.28 -0.9 0.24 -3.13 -1.09 -0.86 0.47 -1.43 -0.63 -0.57 1.32 -0.83 -0.51
AAL22210 (sspB)
 0.97 0.34 -1.48 0.19 -0.67 -1.18 -0.27 0.08 0.07 0.21 0.31 1.18 -0.45 0.5 -0.83 -1.42 -0.62 -0.37 0.44 0.14 -1.72 0.4 -1.2 0.38 -1.0 0.45 0.63 0.57 0.69 -1.45 -0.58 -0.47 0.8 -1.69 -0.56 0.49 0.2 -1.31 0.39
AAL22271 (sun)
 0.59 0.15 -0.21 -0.06 -0.63 -1.66 0.48 0.24 -0.72 -0.73 -0.97 0.53 1.0 0.73 0.42 -0.7 -1.45 0.87 1.08 0.79 -1.03 -1.85 -0.89 0.47 -1.29 -0.11 0.0 0.4 -0.09 -3.37 -0.61 0.22 -0.01 -0.86 -1.11 -0.75 1.0 -0.88 0.89
AAL22387 (glpD)
 -0.63 1.83 0.24 0.2 -7.09 -0.09 0.93 -1.44 1.02 -5.42 0.55 -0.44 1.26 -3.64 1.7 -1.68 0.35 -4.92 -5.11 -5.17 -0.83 1.27 -3.51 0.43 -0.22 1.12 -3.73 -0.02 -4.35 -2.06 1.4 0.14 -4.17 -6.28 0.96 -0.27 -0.6 -0.87 0.03
AAL22436 (zntA)
 0.62 0.15 -0.12 -1.09 -0.84 -1.78 -0.73 0.67 0.12 -0.43 -0.09 1.05 -1.23 0.39 -0.82 0.87 -1.07 -1.74 -1.62 -1.67 1.15 -0.5 -4.72 -0.7 2.98 -0.26 0.38 0.5 -1.03 -2.2 -2.37 -0.22 -1.45 -4.19 -0.35 -0.63 0.48 -0.8 -0.16
AAL22509 (cspA)
 2.19 -1.07 -2.68 -0.64 -0.54 -3.39 -0.32 0.22 -1.96 -6.4 -1.31 -0.23 -2.45 0.41 -1.65 0.91 0.72 -1.89 -0.28 -1.12 -2.08 -6.1 1.98 0.87 -0.28 -0.55 0.42 0.23 0.28 -0.79 -1.78 -0.25 0.73 0.93 1.07 -0.24 0.64 -2.0 -0.52
AAL22559 (gpsA)
 0.4 0.25 -0.47 0.38 0.74 -0.66 -0.38 0.15 -0.18 0.57 -0.59 1.25 -0.01 0.51 0.53 -1.42 -0.55 -0.48 -0.48 -0.27 -0.7 -0.3 -1.43 0.02 -1.34 0.31 0.39 0.11 -0.03 -1.61 -1.44 0.42 -0.07 -1.87 -0.12 0.4 -0.18 0.26 1.21
AAL22570 (rfaF)
 0.02 0.4 -0.52 0.23 -0.11 -1.18 -0.04 0.47 -0.2 0.45 -0.35 1.3 0.17 0.78 0.38 -1.61 -0.32 -0.05 0.09 0.17 -1.52 -0.41 -1.69 -0.25 -1.83 0.38 -0.32 0.52 0.87 -2.49 -0.36 0.35 0.66 -1.86 -0.18 -0.33 -0.35 -0.32 0.93
AAL22571 (rfaC)
 0.01 0.25 -0.11 -0.01 0.2 -1.13 0.03 0.31 -0.56 0.02 -0.38 1.31 0.09 0.63 0.99 -1.27 -0.73 0.1 0.26 0.22 -1.62 -0.67 -1.06 0.13 -2.03 0.02 -0.14 0.28 0.19 -2.44 -0.75 0.54 0.03 -1.63 -0.44 -0.3 0.56 -0.01 1.26
AAL22694 (gyrB)
 0.35 -0.02 -0.67 0.2 -0.12 -0.76 0.09 0.6 -0.28 -0.26 -0.76 0.71 0.27 0.95 0.28 -1.04 -0.34 0.06 0.21 0.23 -1.64 -0.62 -0.65 0.0 -1.65 0.41 0.4 0.25 0.6 -2.15 -0.41 0.13 0.56 -1.01 0.48 -0.21 0.19 -0.14 0.43
AAL22763 (gppA)
 1.49 0.37 -0.55 0.18 0.04 -1.92 -0.21 0.51 -0.81 -0.63 -0.47 0.81 -0.48 1.09 0.45 -1.52 -0.84 -0.3 0.18 -0.07 -1.44 -0.23 -1.18 0.14 -1.23 0.38 0.21 0.2 1.04 -2.25 -0.82 0.24 0.9 -1.82 -1.28 -0.14 0.28 -0.32 0.58
AAL22764 (rhlB)
 1.13 0.22 -0.53 0.16 0.12 -1.95 -0.44 -0.06 -0.39 -0.31 -0.02 0.77 0.3 0.18 0.92 -1.33 -2.4 -0.33 0.01 -0.01 -1.71 -0.75 -0.97 0.19 -0.92 0.58 0.61 0.31 1.0 -2.23 -0.64 0.51 0.88 -1.39 -3.66 0.29 0.1 -0.65 1.02
AAL22766 (rho)
 0.74 -0.54 -0.99 -0.25 -0.34 -1.96 -0.38 0.21 -0.34 -1.08 -0.16 -0.01 0.44 0.73 0.21 0.48 -0.32 0.24 0.56 0.43 -0.64 -1.23 0.53 -0.72 -0.31 0.03 -0.52 -0.02 0.43 -2.77 -0.45 -0.4 0.43 0.35 1.96 -1.28 -0.88 -0.94 0.25
AAL22822 (yigC)
 0.92 0.22 -0.28 0.06 -0.54 -1.33 0.12 0.28 -0.34 0.23 -0.15 -0.27 -0.07 1.08 0.04 -1.1 -0.25 0.15 0.34 0.43 -1.32 -0.17 -1.2 0.14 -1.07 0.57 0.34 0.51 0.29 -1.74 -0.46 -0.18 0.44 -1.15 0.14 0.49 0.15 -0.42 0.11
AAL22835 (yihE)
 0.6 0.13 0.2 -0.27 -0.35 -1.75 -0.23 0.45 -0.91 -0.7 -0.44 -0.93 0.92 0.24 0.47 -0.0 -0.63 -0.24 0.15 0.18 -2.15 -0.84 1.28 -0.14 -1.38 -0.54 -0.56 0.96 0.32 -2.14 -0.73 0.56 0.02 0.33 -0.04 -0.78 0.76 -0.43 0.91
AAL22900 (cpxP)
 2.17 -0.13 0.46 -1.88 -2.34 -5.14 -1.38 1.26 -4.02 0.24 -0.02 -3.97 0.63 0.64 -1.18 -0.46 -1.32 -0.97 -0.86 -0.59 -4.67 0.67 2.22 0.81 -4.28 -0.86 -4.95 0.95 -1.3 -1.68 -1.28 -0.76 -2.59 1.59 -0.01 -4.87 1.23 -1.18 -0.12
AAL23013 (yjbB)
 -0.21 0.68 0.46 -0.3 -0.63 -1.01 -0.48 0.04 -0.5 -0.44 -0.37 -0.48 0.99 0.26 0.39 -1.19 -0.23 -0.11 -0.34 -0.03 -0.4 1.19 -0.94 0.59 0.0 -0.56 -0.36 0.45 0.16 -2.67 -0.45 -0.0 0.14 -1.45 -0.3 -0.23 1.27 -0.05 0.73
AAL23059 (plsB)
 0.21 0.27 -0.42 -0.04 -0.12 -1.44 -0.05 0.32 0.06 0.55 -0.15 1.2 -0.17 0.8 0.53 -1.38 -0.07 -0.12 -0.03 0.09 -2.12 0.22 -0.59 0.06 -2.27 0.41 0.16 0.15 0.14 -1.52 -0.84 0.14 0.03 -1.32 0.23 0.13 0.18 -0.12 0.71
AAL23186 (purA)
 -0.54 0.36 -1.0 0.28 -0.73 -0.13 0.29 0.52 0.19 0.04 0.52 1.03 -0.79 0.68 -0.44 -0.99 -1.56 -0.04 0.27 0.35 -2.26 0.57 -0.63 0.3 -2.16 0.8 0.79 -0.09 0.98 -2.65 -0.13 -0.68 0.97 -1.0 -1.85 0.76 -0.19 -1.12 -0.59
AAL23187 (yjeB)
 2.22 0.21 0.35 -0.66 -0.43 -2.42 -0.94 0.53 0.22 -0.7 1.15 -0.91 0.42 0.89 -0.26 0.44 -1.24 -1.21 -1.22 -0.92 -1.85 -1.12 0.32 -0.42 -1.11 -0.58 -0.47 0.11 -0.07 -1.94 -0.68 0.03 0.17 0.63 0.79 -0.42 -0.13 -0.07 0.13
AAL23189 (yjfH)
 1.45 0.2 -0.09 0.19 -0.12 -0.38 -1.48 0.06 0.19 -0.17 0.11 0.3 0.58 0.75 -1.12 -0.9 -1.52 -1.96 -1.58 -1.51 -0.98 -0.42 -1.51 0.01 -0.76 0.99 0.68 0.23 1.13 -2.58 -1.06 -0.03 1.02 -1.64 0.7 0.2 -0.11 -0.19 0.49
AAL23209 (yjfY)
 -0.27 -0.3 0.72 -1.28 -1.06 -1.48 0.14 0.7 -0.66 -0.77 0.05 -1.54 1.04 0.24 -3.3 0.7 -1.52 -1.7 -2.05 -1.51 2.36 0.42 -0.46 -0.34 1.95 -1.41 -1.39 -0.32 -1.6 -1.0 0.49 -0.2 -1.43 0.67 -1.25 -1.56 0.62 -0.07 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.