View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19014 (STM0050) | 0.24 | 0.26 | 0.15 | 0.2 | 0.14 | 0.09 | 0.43 | 0.34 | 0.26 | 0.19 | 0.35 | 0.13 | 0.24 | 0.19 | 0.84 | 0.19 | 0.35 | 0.57 | 0.41 | 0.6 | 0.04 | 0.13 | 0.23 | 0.48 | 0.06 | 0.14 | 0.14 | 0.22 | 0.12 | 0.05 | 0.13 | 0.21 | 0.13 | 0.27 | 0.53 | 0.15 | 1.0 | 0.17 | 0.23 |
AAL19198 (ldcC) | 0.25 | 0.43 | 0.41 | 0.4 | 0.29 | 0.12 | 0.61 | 0.43 | 0.26 | 0.28 | 0.27 | 0.23 | 0.58 | 0.37 | 1.0 | 0.29 | 0.29 | 0.63 | 0.6 | 0.65 | 0.16 | 0.16 | 0.27 | 0.61 | 0.18 | 0.34 | 0.43 | 0.41 | 0.35 | 0.04 | 0.19 | 0.37 | 0.31 | 0.3 | 0.41 | 0.37 | 0.87 | 0.33 | 0.56 |
AAL19199 (yaeR) | 0.19 | 0.5 | 0.38 | 0.38 | 0.28 | 0.07 | 1.0 | 0.43 | 0.23 | 0.36 | 0.27 | 0.25 | 0.44 | 0.25 | 0.92 | 0.31 | 0.36 | 0.64 | 0.77 | 0.7 | 0.17 | 0.2 | 0.29 | 0.72 | 0.24 | 0.33 | 0.4 | 0.46 | 0.32 | 0.02 | 0.18 | 0.3 | 0.27 | 0.29 | 0.45 | 0.4 | 0.94 | 0.31 | 0.43 |
AAL19221 (dnaQ) | 0.31 | 0.52 | 0.48 | 0.4 | 0.21 | 0.1 | 0.64 | 0.59 | 0.33 | 0.47 | 0.43 | 0.35 | 0.62 | 0.57 | 0.89 | 0.45 | 0.41 | 0.53 | 0.46 | 0.66 | 0.19 | 0.51 | 0.43 | 0.47 | 0.2 | 0.45 | 0.22 | 0.43 | 0.46 | 0.09 | 0.24 | 0.32 | 0.45 | 0.47 | 0.6 | 0.24 | 1.0 | 0.28 | 0.44 |
AAL19314 (STM0360) | 0.09 | 0.35 | 0.68 | 0.14 | 0.08 | 0.26 | 0.76 | 0.16 | 0.09 | 0.05 | 0.13 | 0.03 | 1.0 | 0.05 | 0.04 | 0.37 | 0.03 | 0.58 | 0.52 | 0.49 | 0.45 | 0.08 | 0.01 | 0.45 | 0.63 | 0.98 | 0.07 | 0.54 | 0.21 | 0.01 | 0.34 | 0.04 | 0.14 | 0.24 | 0.04 | 0.03 | 0.65 | 0.38 | 0.06 |
AAL19315 (STM0361) | 0.16 | 0.53 | 0.91 | 0.15 | 0.14 | 0.35 | 0.39 | 0.2 | 0.16 | 0.15 | 0.2 | 0.06 | 0.95 | 0.2 | 0.06 | 0.32 | 0.06 | 0.29 | 0.27 | 0.3 | 0.65 | 0.29 | 0.05 | 0.49 | 0.6 | 1.0 | 0.12 | 0.49 | 0.28 | 0.03 | 0.31 | 0.11 | 0.18 | 0.21 | 0.07 | 0.1 | 0.55 | 0.48 | 0.13 |
AAL19316 (STM0362) | 0.14 | 1.0 | 0.5 | 0.1 | 0.07 | 0.05 | 0.53 | 0.28 | 0.06 | 0.11 | 0.09 | 0.03 | 0.57 | 0.1 | 0.32 | 0.15 | 0.23 | 0.37 | 0.23 | 0.32 | 0.2 | 0.55 | 0.06 | 0.79 | 0.29 | 0.11 | 0.1 | 0.15 | 0.13 | 0.0 | 0.02 | 0.09 | 0.08 | 0.09 | 0.27 | 0.17 | 0.93 | 0.16 | 0.14 |
AAL19335 (STM0381) | 0.12 | 0.27 | 0.95 | 0.09 | 0.1 | 0.05 | 0.19 | 0.16 | 0.07 | 0.09 | 0.13 | 0.03 | 1.0 | 0.07 | 0.08 | 0.26 | 0.05 | 0.29 | 0.23 | 0.33 | 0.64 | 0.09 | 0.03 | 0.29 | 0.64 | 0.11 | 0.06 | 0.21 | 0.08 | 0.01 | 0.21 | 0.16 | 0.05 | 0.27 | 0.07 | 0.07 | 0.44 | 0.31 | 0.25 |
AAL19339 (yaiC) | 0.17 | 0.47 | 0.38 | 0.11 | 0.12 | 0.07 | 0.34 | 0.25 | 0.15 | 0.1 | 0.42 | 0.05 | 1.0 | 0.29 | 0.18 | 0.28 | 0.17 | 0.54 | 0.52 | 0.57 | 0.57 | 0.39 | 0.04 | 0.46 | 0.67 | 0.23 | 0.13 | 0.31 | 0.16 | 0.03 | 0.22 | 0.16 | 0.14 | 0.2 | 0.26 | 0.09 | 0.65 | 0.17 | 0.38 |
AAL19368 (yajI) | 0.13 | 0.35 | 0.25 | 0.14 | 0.16 | 0.05 | 0.45 | 0.25 | 0.14 | 0.24 | 0.11 | 0.12 | 0.29 | 0.16 | 0.32 | 0.09 | 0.24 | 0.23 | 0.33 | 0.26 | 0.11 | 0.12 | 0.09 | 0.67 | 0.14 | 0.17 | 0.23 | 0.34 | 0.16 | 0.02 | 0.13 | 0.25 | 0.18 | 0.1 | 0.35 | 0.16 | 1.0 | 0.18 | 0.27 |
AAL19433 (STM0479) | 0.37 | 0.51 | 0.6 | 0.27 | 0.28 | 0.16 | 0.71 | 0.73 | 0.44 | 0.35 | 0.48 | 0.19 | 0.72 | 0.58 | 0.64 | 0.25 | 0.68 | 0.61 | 0.65 | 0.76 | 0.3 | 0.36 | 0.22 | 0.54 | 0.24 | 0.27 | 0.22 | 0.45 | 0.25 | 0.06 | 0.31 | 0.44 | 0.23 | 0.28 | 1.0 | 0.22 | 0.74 | 0.36 | 0.63 |
AAL19555 (ybdM) | 0.25 | 0.44 | 1.0 | 0.3 | 0.27 | 0.18 | 0.73 | 0.63 | 0.19 | 0.46 | 0.24 | 0.14 | 0.49 | 0.69 | 0.62 | 0.5 | 0.57 | 0.64 | 0.52 | 0.7 | 0.45 | 0.53 | 0.19 | 0.3 | 0.34 | 0.24 | 0.19 | 0.26 | 0.28 | 0.04 | 0.37 | 0.38 | 0.31 | 0.29 | 0.51 | 0.15 | 0.48 | 0.29 | 0.35 |
AAL19566 (ybdR) | 0.15 | 0.57 | 0.49 | 0.14 | 0.16 | 0.25 | 0.87 | 0.34 | 0.1 | 0.1 | 0.17 | 0.04 | 0.95 | 0.15 | 0.08 | 0.3 | 0.08 | 0.54 | 0.44 | 0.54 | 0.97 | 0.27 | 0.04 | 0.59 | 0.97 | 0.36 | 0.13 | 0.36 | 0.19 | 0.03 | 0.22 | 0.12 | 0.13 | 0.26 | 0.1 | 0.07 | 1.0 | 0.31 | 0.2 |
AAL19585 (ybeF) | 0.15 | 0.23 | 0.35 | 0.12 | 0.07 | 0.06 | 0.2 | 0.16 | 0.13 | 0.07 | 0.22 | 0.09 | 0.72 | 0.12 | 0.18 | 0.27 | 0.25 | 0.54 | 0.51 | 0.59 | 0.1 | 0.12 | 0.06 | 0.38 | 0.43 | 0.58 | 0.08 | 0.25 | 0.19 | 0.03 | 0.12 | 0.12 | 0.19 | 0.23 | 1.0 | 0.05 | 0.99 | 0.11 | 0.19 |
AAL19653 (phrB) | 0.25 | 0.59 | 0.52 | 0.2 | 0.19 | 0.21 | 0.28 | 0.39 | 0.14 | 0.13 | 0.24 | 0.14 | 1.0 | 0.5 | 0.19 | 0.22 | 0.09 | 0.42 | 0.41 | 0.37 | 0.79 | 0.29 | 0.1 | 0.43 | 0.7 | 0.66 | 0.4 | 0.26 | 0.37 | 0.08 | 0.18 | 0.26 | 0.35 | 0.22 | 0.1 | 0.16 | 0.81 | 0.32 | 0.53 |
AAL19722 (ybhA) | 0.2 | 0.63 | 0.43 | 0.33 | 0.37 | 0.13 | 0.53 | 0.53 | 0.48 | 0.59 | 0.45 | 0.35 | 0.52 | 0.5 | 0.83 | 0.22 | 0.39 | 0.64 | 0.74 | 0.79 | 0.16 | 0.5 | 0.18 | 0.73 | 0.29 | 0.52 | 0.37 | 0.41 | 0.31 | 0.11 | 0.36 | 0.37 | 0.31 | 0.22 | 0.59 | 0.42 | 1.0 | 0.38 | 0.55 |
AAL19747 (STM0810) | 0.09 | 0.37 | 0.28 | 0.04 | 0.06 | 0.04 | 1.0 | 0.16 | 0.11 | 0.03 | 0.22 | 0.02 | 0.36 | 0.06 | 0.09 | 0.49 | 0.06 | 0.31 | 0.27 | 0.34 | 0.12 | 0.16 | 0.09 | 0.36 | 0.14 | 0.1 | 0.06 | 0.1 | 0.05 | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.04 | 0.34 | 0.17 | 0.04 | 0.36 | 0.11 | 0.06 |
AAL19749 (ybhO) | 0.12 | 0.5 | 0.93 | 0.12 | 0.07 | 0.28 | 0.63 | 0.17 | 0.06 | 0.11 | 0.07 | 0.04 | 0.67 | 0.06 | 0.08 | 0.22 | 0.05 | 0.38 | 0.34 | 0.34 | 0.65 | 0.27 | 0.02 | 0.72 | 0.5 | 0.41 | 0.13 | 0.23 | 0.15 | 0.02 | 0.17 | 0.06 | 0.12 | 0.18 | 0.12 | 0.08 | 1.0 | 0.32 | 0.11 |
AAL19750 (ybhP) | 0.08 | 0.38 | 0.32 | 0.08 | 0.03 | 0.16 | 0.39 | 0.13 | 0.02 | 0.06 | 0.04 | 0.02 | 0.65 | 0.03 | 0.03 | 0.12 | 0.03 | 0.14 | 0.16 | 0.18 | 0.33 | 0.19 | 0.01 | 0.67 | 0.48 | 0.34 | 0.1 | 0.18 | 0.12 | 0.02 | 0.12 | 0.08 | 0.1 | 0.1 | 0.09 | 0.06 | 1.0 | 0.11 | 0.16 |
AAL19809 (ybjC) | 0.43 | 0.52 | 0.25 | 0.24 | 0.3 | 0.2 | 1.0 | 0.47 | 0.27 | 0.33 | 0.5 | 0.32 | 0.73 | 0.41 | 0.51 | 0.13 | 0.5 | 0.72 | 0.43 | 0.69 | 0.17 | 0.44 | 0.11 | 0.56 | 0.36 | 0.41 | 0.26 | 0.35 | 0.23 | 0.03 | 0.2 | 0.3 | 0.23 | 0.09 | 0.6 | 0.22 | 0.96 | 0.27 | 0.52 |
AAL19810 (mdaA) | 0.37 | 0.54 | 0.34 | 0.31 | 0.4 | 0.55 | 0.57 | 0.44 | 0.28 | 0.57 | 0.3 | 0.71 | 0.52 | 0.56 | 0.33 | 0.19 | 0.21 | 0.42 | 0.38 | 0.46 | 0.56 | 0.44 | 0.17 | 0.86 | 0.56 | 0.56 | 0.68 | 0.56 | 0.35 | 0.04 | 0.24 | 0.38 | 0.34 | 0.13 | 0.25 | 0.64 | 1.0 | 0.37 | 0.64 |
AAL19871 (poxB) | 0.12 | 0.4 | 0.81 | 0.19 | 0.11 | 0.18 | 0.51 | 0.17 | 0.11 | 0.37 | 0.15 | 0.05 | 1.0 | 0.08 | 0.14 | 0.23 | 0.06 | 0.38 | 0.47 | 0.41 | 0.38 | 0.17 | 0.01 | 0.38 | 0.49 | 0.43 | 0.09 | 0.52 | 0.22 | 0.03 | 0.39 | 0.11 | 0.16 | 0.16 | 0.21 | 0.09 | 0.46 | 0.23 | 0.25 |
AAL20005 (yccR) | 0.07 | 0.21 | 0.17 | 0.13 | 0.11 | 0.02 | 0.23 | 0.24 | 0.11 | 0.26 | 0.13 | 0.03 | 0.16 | 0.11 | 0.52 | 0.13 | 0.42 | 0.28 | 0.21 | 0.31 | 0.06 | 0.12 | 0.13 | 0.59 | 0.08 | 0.09 | 0.04 | 0.12 | 0.05 | 0.03 | 0.08 | 0.15 | 0.04 | 0.18 | 0.41 | 0.04 | 1.0 | 0.12 | 0.17 |
AAL20008 (helD) | 0.25 | 0.66 | 0.66 | 0.4 | 0.27 | 0.17 | 0.67 | 0.64 | 0.37 | 0.51 | 0.28 | 0.32 | 0.6 | 0.75 | 0.68 | 0.31 | 0.31 | 0.98 | 0.88 | 1.0 | 0.26 | 0.38 | 0.18 | 0.52 | 0.34 | 0.34 | 0.22 | 0.51 | 0.43 | 0.04 | 0.35 | 0.39 | 0.34 | 0.25 | 0.31 | 0.26 | 0.79 | 0.5 | 0.39 |
AAL20028 (copR) | 0.33 | 0.52 | 0.45 | 0.24 | 0.24 | 0.09 | 0.34 | 0.51 | 0.18 | 0.19 | 0.24 | 0.14 | 0.47 | 0.48 | 0.73 | 0.33 | 0.25 | 0.63 | 0.57 | 0.71 | 0.33 | 0.47 | 0.26 | 0.53 | 0.32 | 0.27 | 0.25 | 0.59 | 0.33 | 0.02 | 0.19 | 0.38 | 0.31 | 0.26 | 0.29 | 0.23 | 1.0 | 0.26 | 0.42 |
AAL20078 (ymdC) | 0.35 | 0.58 | 0.65 | 0.26 | 0.24 | 0.06 | 0.68 | 0.55 | 0.22 | 0.35 | 0.3 | 0.14 | 0.73 | 0.58 | 0.43 | 0.38 | 0.33 | 0.72 | 1.0 | 0.81 | 0.39 | 0.38 | 0.18 | 0.58 | 0.34 | 0.2 | 0.2 | 0.39 | 0.39 | 0.04 | 0.29 | 0.49 | 0.35 | 0.34 | 0.31 | 0.21 | 0.91 | 0.25 | 0.46 |
AAL20267 (btuD) | 0.24 | 0.52 | 0.58 | 0.23 | 0.45 | 0.24 | 0.29 | 0.36 | 0.2 | 0.36 | 0.18 | 0.4 | 0.86 | 0.42 | 0.23 | 0.2 | 0.1 | 0.43 | 0.5 | 0.48 | 0.56 | 0.32 | 0.1 | 0.61 | 0.39 | 0.44 | 0.26 | 0.4 | 0.26 | 0.04 | 0.11 | 0.35 | 0.22 | 0.18 | 0.2 | 0.32 | 1.0 | 0.59 | 0.51 |
AAL20360 (ydhL) | 0.1 | 0.75 | 0.92 | 0.08 | 0.1 | 0.04 | 0.27 | 0.18 | 0.09 | 0.09 | 0.12 | 0.01 | 1.0 | 0.09 | 0.12 | 0.31 | 0.18 | 0.29 | 0.18 | 0.29 | 0.54 | 0.58 | 0.06 | 0.48 | 0.64 | 0.16 | 0.06 | 0.2 | 0.06 | 0.02 | 0.06 | 0.19 | 0.04 | 0.33 | 0.25 | 0.07 | 0.71 | 0.24 | 0.33 |
AAL20364 (ydhJ) | 0.12 | 0.23 | 0.11 | 0.12 | 0.09 | 0.05 | 0.21 | 0.22 | 0.13 | 0.08 | 0.21 | 0.13 | 0.17 | 0.2 | 0.53 | 0.18 | 0.21 | 0.38 | 0.29 | 0.43 | 0.17 | 0.28 | 0.13 | 0.34 | 0.14 | 0.21 | 0.1 | 0.51 | 0.09 | 0.05 | 0.1 | 0.1 | 0.08 | 0.21 | 1.0 | 0.06 | 0.71 | 0.07 | 0.13 |
AAL20365 (ydhI) | 0.09 | 0.2 | 0.1 | 0.04 | 0.09 | 0.01 | 0.1 | 0.1 | 0.07 | 0.06 | 0.15 | 0.03 | 0.19 | 0.06 | 0.15 | 0.18 | 0.05 | 0.13 | 0.18 | 0.19 | 0.07 | 0.07 | 0.22 | 0.89 | 0.05 | 0.07 | 0.07 | 0.65 | 0.03 | 0.03 | 0.08 | 0.11 | 0.03 | 0.23 | 0.09 | 0.04 | 1.0 | 0.08 | 0.13 |
AAL20400 (STM1481) | 0.18 | 0.22 | 0.12 | 0.11 | 0.08 | 0.03 | 0.19 | 0.25 | 0.2 | 0.13 | 0.33 | 0.07 | 0.19 | 0.2 | 0.27 | 0.1 | 0.09 | 0.44 | 0.45 | 0.59 | 0.04 | 0.1 | 0.1 | 0.67 | 0.09 | 0.12 | 0.09 | 0.23 | 0.11 | 0.05 | 0.16 | 0.1 | 0.15 | 0.14 | 0.15 | 0.07 | 1.0 | 0.12 | 0.16 |
AAL20420 (ynfC) | 0.25 | 0.54 | 0.49 | 0.25 | 0.21 | 0.06 | 0.4 | 0.44 | 0.14 | 0.27 | 0.14 | 0.14 | 0.39 | 0.3 | 0.64 | 0.36 | 0.2 | 0.8 | 0.7 | 0.9 | 0.17 | 0.41 | 0.35 | 0.87 | 0.17 | 0.15 | 0.22 | 0.34 | 0.19 | 0.02 | 0.23 | 0.31 | 0.2 | 0.4 | 0.27 | 0.22 | 1.0 | 0.31 | 0.33 |
AAL20436 (ydeD) | 0.14 | 0.44 | 0.26 | 0.13 | 0.16 | 0.06 | 0.28 | 0.32 | 0.1 | 0.14 | 0.13 | 0.07 | 0.28 | 0.6 | 0.24 | 0.14 | 0.35 | 0.53 | 0.46 | 0.54 | 0.13 | 0.08 | 0.12 | 0.69 | 0.3 | 0.2 | 0.28 | 0.27 | 0.15 | 0.01 | 0.13 | 0.18 | 0.17 | 0.17 | 0.22 | 0.25 | 1.0 | 0.22 | 0.33 |
AAL20479 (STM1561) | 0.08 | 0.25 | 0.48 | 0.12 | 0.2 | 0.15 | 0.46 | 0.23 | 0.03 | 0.06 | 0.05 | 0.01 | 1.0 | 0.06 | 0.16 | 0.2 | 0.04 | 0.45 | 0.46 | 0.41 | 0.2 | 0.12 | 0.02 | 0.37 | 0.27 | 0.41 | 0.08 | 0.18 | 0.1 | 0.01 | 0.13 | 0.12 | 0.06 | 0.17 | 0.06 | 0.04 | 0.72 | 0.43 | 0.2 |
AAL20505 (yncD) | 0.14 | 0.41 | 0.68 | 0.15 | 0.15 | 0.16 | 0.63 | 0.23 | 0.11 | 0.13 | 0.16 | 0.05 | 0.54 | 0.19 | 0.18 | 0.28 | 0.15 | 0.72 | 0.79 | 0.64 | 0.12 | 0.25 | 0.04 | 0.64 | 0.17 | 0.49 | 0.14 | 0.25 | 0.07 | 0.07 | 0.22 | 0.15 | 0.07 | 0.37 | 0.21 | 0.12 | 1.0 | 0.28 | 0.16 |
AAL20528 (ydcK) | 0.12 | 0.42 | 0.56 | 0.12 | 0.09 | 0.08 | 0.32 | 0.24 | 0.09 | 0.14 | 0.11 | 0.04 | 0.54 | 0.16 | 0.19 | 0.4 | 0.1 | 0.24 | 0.24 | 0.25 | 0.3 | 0.24 | 0.13 | 0.57 | 0.34 | 0.19 | 0.07 | 0.28 | 0.16 | 0.02 | 0.15 | 0.14 | 0.14 | 0.42 | 0.19 | 0.08 | 1.0 | 0.22 | 0.23 |
AAL20573 (dbpA) | 0.61 | 0.49 | 0.51 | 0.25 | 0.24 | 0.24 | 0.53 | 0.52 | 0.34 | 0.14 | 0.46 | 0.4 | 0.78 | 0.63 | 0.34 | 0.21 | 0.15 | 0.72 | 0.64 | 0.68 | 0.62 | 0.3 | 0.05 | 0.69 | 0.58 | 0.58 | 1.0 | 0.34 | 0.37 | 0.04 | 0.2 | 0.17 | 0.42 | 0.16 | 0.27 | 0.56 | 0.8 | 0.29 | 0.37 |
AAL20574 (STM1656) | 0.39 | 0.56 | 0.58 | 0.32 | 0.19 | 0.09 | 0.8 | 0.55 | 0.22 | 0.29 | 0.33 | 0.21 | 0.52 | 0.55 | 0.54 | 0.23 | 0.33 | 0.81 | 0.81 | 0.87 | 0.32 | 0.34 | 0.15 | 0.71 | 0.42 | 0.34 | 0.27 | 0.44 | 0.41 | 0.02 | 0.22 | 0.3 | 0.38 | 0.19 | 0.63 | 0.26 | 1.0 | 0.3 | 0.37 |
AAL20590 (STM1673) | 0.16 | 0.41 | 0.81 | 0.09 | 0.14 | 0.04 | 0.28 | 0.47 | 0.07 | 0.15 | 0.11 | 0.07 | 0.3 | 0.22 | 0.27 | 0.24 | 0.29 | 0.48 | 0.54 | 0.63 | 0.2 | 0.27 | 0.15 | 0.31 | 0.26 | 0.08 | 0.06 | 0.32 | 0.08 | 0.03 | 0.14 | 0.21 | 0.08 | 0.19 | 0.26 | 0.07 | 1.0 | 0.24 | 0.22 |
AAL20634 (sohB) | 0.29 | 0.47 | 0.44 | 0.41 | 0.34 | 0.15 | 0.38 | 0.62 | 0.26 | 0.37 | 0.28 | 0.27 | 0.42 | 0.78 | 0.56 | 0.39 | 0.38 | 0.67 | 0.59 | 0.69 | 0.43 | 0.38 | 0.33 | 0.57 | 0.47 | 0.31 | 0.49 | 0.45 | 0.59 | 0.06 | 0.3 | 0.39 | 0.6 | 0.29 | 0.4 | 0.37 | 1.0 | 0.42 | 0.54 |
AAL20657 (cls) | 0.32 | 0.76 | 0.58 | 0.37 | 0.25 | 0.14 | 0.49 | 0.48 | 0.28 | 0.58 | 0.35 | 0.36 | 0.53 | 0.61 | 0.56 | 0.24 | 0.21 | 0.74 | 0.67 | 0.84 | 0.1 | 0.37 | 0.17 | 0.84 | 0.18 | 0.53 | 0.44 | 0.6 | 0.52 | 0.1 | 0.39 | 0.36 | 0.62 | 0.31 | 0.31 | 0.45 | 1.0 | 0.34 | 0.48 |
AAL20896 (yedP) | 0.08 | 0.3 | 0.51 | 0.13 | 0.08 | 0.12 | 0.32 | 0.17 | 0.08 | 0.1 | 0.18 | 0.03 | 0.79 | 0.12 | 0.08 | 0.35 | 0.1 | 0.48 | 0.36 | 0.41 | 0.58 | 0.16 | 0.03 | 0.61 | 0.53 | 0.32 | 0.08 | 0.27 | 0.32 | 0.01 | 0.14 | 0.08 | 0.35 | 0.31 | 0.25 | 0.04 | 1.0 | 0.23 | 0.21 |
AAL20897 (STM1987) | 0.24 | 0.48 | 0.62 | 0.29 | 0.24 | 0.16 | 0.36 | 0.41 | 0.19 | 0.2 | 0.31 | 0.09 | 1.0 | 0.51 | 0.2 | 0.28 | 0.18 | 0.63 | 0.67 | 0.72 | 0.47 | 0.3 | 0.12 | 0.51 | 0.49 | 0.48 | 0.15 | 0.32 | 0.53 | 0.06 | 0.25 | 0.22 | 0.74 | 0.29 | 0.22 | 0.1 | 0.7 | 0.54 | 0.51 |
AAL20899 (yedI) | 0.17 | 0.51 | 0.24 | 0.3 | 0.21 | 0.11 | 0.39 | 0.43 | 0.22 | 0.2 | 0.24 | 0.27 | 0.35 | 0.63 | 0.43 | 0.21 | 0.33 | 0.46 | 0.43 | 0.52 | 0.18 | 0.32 | 0.15 | 0.74 | 0.4 | 0.32 | 0.33 | 0.29 | 0.56 | 0.05 | 0.22 | 0.21 | 0.78 | 0.21 | 0.36 | 0.27 | 1.0 | 0.19 | 0.34 |
AAL20900 (yedA) | 0.17 | 0.42 | 0.12 | 0.25 | 0.12 | 0.02 | 0.14 | 0.27 | 0.13 | 0.07 | 0.2 | 0.1 | 0.19 | 0.37 | 0.14 | 0.08 | 0.08 | 0.11 | 0.15 | 0.16 | 0.14 | 0.16 | 0.06 | 0.53 | 0.37 | 0.09 | 0.36 | 0.17 | 0.67 | 0.02 | 0.16 | 0.13 | 1.0 | 0.05 | 0.14 | 0.19 | 0.97 | 0.11 | 0.35 |
AAL21067 (yehX) | 0.64 | 0.7 | 0.7 | 0.26 | 0.28 | 0.23 | 0.22 | 0.28 | 0.23 | 0.21 | 0.38 | 0.11 | 1.0 | 0.37 | 0.24 | 0.32 | 0.11 | 0.49 | 0.52 | 0.45 | 0.42 | 0.35 | 0.05 | 0.35 | 0.44 | 0.65 | 0.24 | 0.68 | 0.57 | 0.04 | 0.2 | 0.22 | 0.48 | 0.32 | 0.21 | 0.19 | 0.45 | 0.42 | 0.46 |
AAL21068 (yehY) | 0.14 | 0.61 | 0.66 | 0.18 | 0.18 | 0.14 | 0.24 | 0.23 | 0.1 | 0.14 | 0.13 | 0.07 | 1.0 | 0.17 | 0.23 | 0.16 | 0.14 | 0.51 | 0.51 | 0.49 | 0.26 | 0.39 | 0.01 | 0.49 | 0.33 | 0.49 | 0.18 | 0.46 | 0.3 | 0.02 | 0.17 | 0.17 | 0.24 | 0.12 | 0.19 | 0.11 | 0.67 | 0.31 | 0.39 |
AAL21075 (yohF) | 0.16 | 0.47 | 0.99 | 0.14 | 0.25 | 0.1 | 0.33 | 0.28 | 0.15 | 0.14 | 0.18 | 0.06 | 1.0 | 0.23 | 0.09 | 0.27 | 0.11 | 0.26 | 0.26 | 0.25 | 0.87 | 0.18 | 0.03 | 0.3 | 0.77 | 0.38 | 0.14 | 0.38 | 0.32 | 0.01 | 0.18 | 0.19 | 0.23 | 0.15 | 0.13 | 0.11 | 0.47 | 0.41 | 0.36 |
AAL21213 (elaA) | 0.19 | 0.51 | 0.48 | 0.31 | 0.4 | 0.48 | 0.62 | 0.49 | 0.29 | 0.4 | 0.21 | 0.18 | 0.57 | 0.58 | 0.57 | 0.23 | 0.32 | 0.46 | 0.37 | 0.51 | 0.27 | 0.15 | 0.27 | 0.55 | 0.41 | 0.19 | 0.37 | 0.45 | 0.19 | 0.04 | 0.21 | 0.48 | 0.15 | 0.22 | 0.4 | 0.47 | 1.0 | 0.73 | 0.63 |
AAL21294 (yfdC) | 0.08 | 0.42 | 0.67 | 0.08 | 0.12 | 0.04 | 0.28 | 0.2 | 0.06 | 0.1 | 0.15 | 0.02 | 0.97 | 0.07 | 0.13 | 0.78 | 0.07 | 0.27 | 0.42 | 0.31 | 0.46 | 0.26 | 0.13 | 0.65 | 0.4 | 0.12 | 0.07 | 0.28 | 0.08 | 0.02 | 0.17 | 0.18 | 0.06 | 1.0 | 0.05 | 0.05 | 0.98 | 0.33 | 0.39 |
AAL21304 (STM2404) | 0.17 | 0.58 | 0.72 | 0.16 | 0.24 | 0.2 | 0.14 | 0.33 | 0.27 | 0.2 | 0.34 | 0.18 | 0.94 | 0.36 | 0.27 | 0.13 | 0.19 | 0.34 | 0.31 | 0.38 | 0.43 | 0.3 | 0.03 | 0.61 | 0.47 | 0.45 | 0.3 | 0.29 | 0.23 | 0.05 | 0.15 | 0.37 | 0.19 | 0.12 | 0.26 | 0.18 | 1.0 | 0.25 | 0.56 |
AAL21557 (STM2668) | 0.25 | 0.5 | 0.59 | 0.2 | 0.14 | 0.19 | 0.52 | 0.5 | 0.16 | 0.14 | 0.23 | 0.12 | 0.95 | 0.57 | 0.25 | 0.39 | 0.15 | 0.42 | 0.41 | 0.42 | 0.61 | 0.37 | 0.13 | 0.57 | 0.62 | 0.36 | 0.15 | 0.36 | 0.29 | 0.02 | 0.22 | 0.2 | 0.32 | 0.36 | 0.2 | 0.14 | 1.0 | 0.25 | 0.37 |
AAL21572 (yfjB) | 0.32 | 0.53 | 0.65 | 0.34 | 0.39 | 0.13 | 0.62 | 0.54 | 0.26 | 0.3 | 0.34 | 0.24 | 0.8 | 0.44 | 0.84 | 0.25 | 0.34 | 0.51 | 0.55 | 0.6 | 0.33 | 0.36 | 0.19 | 0.6 | 0.38 | 0.4 | 0.33 | 0.43 | 0.37 | 0.03 | 0.2 | 0.5 | 0.33 | 0.2 | 0.59 | 0.34 | 1.0 | 0.33 | 0.67 |
AAL21711 (mltB) | 0.37 | 0.72 | 0.46 | 0.29 | 0.18 | 0.3 | 0.72 | 0.54 | 0.39 | 0.32 | 0.51 | 0.5 | 0.92 | 0.74 | 0.96 | 0.2 | 0.49 | 0.42 | 0.42 | 0.48 | 0.36 | 0.63 | 0.1 | 0.64 | 0.52 | 0.79 | 0.43 | 0.46 | 0.23 | 0.11 | 0.25 | 0.29 | 0.25 | 0.14 | 0.59 | 0.29 | 1.0 | 0.29 | 0.62 |
AAL21838 (barA) | 0.23 | 0.48 | 0.25 | 0.34 | 0.34 | 0.08 | 0.37 | 0.52 | 0.24 | 0.3 | 0.33 | 0.46 | 0.38 | 0.49 | 1.0 | 0.23 | 0.31 | 0.49 | 0.46 | 0.55 | 0.16 | 0.25 | 0.37 | 0.53 | 0.15 | 0.26 | 0.24 | 0.37 | 0.38 | 0.07 | 0.27 | 0.46 | 0.33 | 0.27 | 0.53 | 0.3 | 0.9 | 0.29 | 0.73 |
AAL22037 (yqhC) | 0.19 | 0.34 | 0.24 | 0.14 | 0.07 | 0.04 | 0.44 | 0.35 | 0.25 | 0.23 | 0.42 | 0.18 | 0.24 | 0.27 | 0.67 | 0.11 | 0.72 | 0.83 | 0.53 | 0.85 | 0.08 | 0.28 | 0.1 | 0.32 | 0.11 | 0.32 | 0.16 | 0.4 | 0.08 | 0.08 | 0.16 | 0.13 | 0.09 | 0.19 | 1.0 | 0.18 | 0.59 | 0.14 | 0.16 |
AAL22094 (ygjP) | 0.36 | 0.57 | 0.38 | 0.26 | 0.24 | 0.1 | 0.45 | 0.49 | 0.35 | 0.27 | 0.46 | 0.27 | 0.54 | 0.48 | 1.0 | 0.14 | 0.41 | 0.48 | 0.4 | 0.55 | 0.19 | 0.41 | 0.11 | 0.45 | 0.25 | 0.24 | 0.25 | 0.38 | 0.29 | 0.11 | 0.2 | 0.38 | 0.3 | 0.14 | 0.56 | 0.31 | 0.63 | 0.25 | 0.52 |
AAL22108 (yhaJ) | 0.33 | 0.48 | 0.38 | 0.29 | 0.2 | 0.2 | 0.26 | 0.44 | 0.26 | 0.4 | 0.3 | 0.4 | 0.36 | 0.6 | 0.54 | 0.11 | 0.27 | 0.66 | 0.65 | 0.73 | 0.16 | 0.25 | 0.06 | 0.65 | 0.37 | 0.46 | 0.58 | 0.45 | 0.29 | 0.07 | 0.23 | 0.28 | 0.3 | 0.07 | 0.28 | 0.79 | 1.0 | 0.34 | 0.5 |
AAL22413 (ugpQ) | 0.2 | 0.51 | 0.8 | 0.19 | 0.21 | 0.12 | 0.49 | 0.47 | 0.09 | 0.24 | 0.07 | 0.26 | 0.89 | 0.47 | 0.51 | 0.41 | 0.46 | 0.62 | 0.58 | 0.74 | 0.21 | 0.33 | 0.05 | 0.57 | 0.22 | 0.19 | 0.22 | 0.26 | 0.19 | 0.01 | 0.17 | 0.19 | 0.19 | 0.21 | 1.0 | 0.21 | 0.85 | 0.31 | 0.32 |
AAL22546 (mtlR) | 0.18 | 0.45 | 0.35 | 0.11 | 0.17 | 0.06 | 0.21 | 0.22 | 0.27 | 0.18 | 0.43 | 0.17 | 1.0 | 0.32 | 0.36 | 0.18 | 0.15 | 0.27 | 0.22 | 0.36 | 0.18 | 0.51 | 0.06 | 0.3 | 0.15 | 0.21 | 0.22 | 0.27 | 0.17 | 0.08 | 0.14 | 0.2 | 0.13 | 0.17 | 0.25 | 0.16 | 0.47 | 0.2 | 0.39 |
AAL22613 (rhuM) | 0.56 | 0.67 | 0.95 | 0.39 | 0.5 | 0.11 | 0.47 | 0.57 | 0.45 | 0.42 | 0.54 | 0.38 | 1.0 | 0.38 | 0.91 | 0.26 | 0.41 | 0.69 | 0.62 | 0.86 | 0.15 | 0.36 | 0.3 | 0.47 | 0.25 | 0.43 | 0.4 | 0.54 | 0.45 | 0.07 | 0.36 | 0.92 | 0.38 | 0.26 | 0.38 | 0.45 | 0.74 | 0.6 | 0.82 |
AAL22624 (STM3766) | 0.11 | 0.19 | 0.17 | 0.08 | 0.1 | 0.03 | 0.25 | 0.25 | 0.15 | 0.11 | 0.26 | 0.02 | 0.26 | 0.15 | 0.42 | 0.13 | 0.53 | 0.19 | 0.15 | 0.21 | 0.04 | 0.09 | 0.11 | 0.54 | 0.06 | 0.1 | 0.09 | 0.13 | 0.04 | 0.03 | 0.11 | 0.13 | 0.04 | 0.19 | 0.52 | 0.09 | 1.0 | 0.2 | 0.16 |
AAL22631 (STM3773) | 0.2 | 0.54 | 0.36 | 0.28 | 0.31 | 0.12 | 0.34 | 0.5 | 0.3 | 0.42 | 0.35 | 0.25 | 0.32 | 0.66 | 0.64 | 0.18 | 0.54 | 0.35 | 0.38 | 0.43 | 0.13 | 0.37 | 0.27 | 0.56 | 0.14 | 0.27 | 0.27 | 0.27 | 0.22 | 0.06 | 0.19 | 0.4 | 0.17 | 0.18 | 0.63 | 0.25 | 1.0 | 0.31 | 0.81 |
AAL22707 (yieE) | 0.32 | 0.35 | 0.12 | 0.29 | 0.18 | 0.07 | 0.3 | 0.38 | 0.18 | 0.27 | 0.22 | 0.1 | 0.18 | 0.15 | 0.53 | 0.21 | 0.44 | 0.37 | 0.46 | 0.44 | 0.07 | 0.14 | 0.23 | 0.67 | 0.12 | 0.18 | 0.24 | 0.32 | 0.2 | 0.05 | 0.13 | 0.22 | 0.24 | 0.22 | 0.55 | 0.24 | 1.0 | 0.19 | 0.26 |
AAL22746 (yieP) | 0.2 | 0.29 | 0.22 | 0.26 | 0.11 | 0.04 | 0.28 | 0.24 | 0.15 | 0.17 | 0.16 | 0.14 | 0.21 | 0.15 | 1.0 | 0.12 | 0.37 | 0.29 | 0.19 | 0.31 | 0.05 | 0.15 | 0.14 | 0.42 | 0.11 | 0.13 | 0.14 | 0.25 | 0.23 | 0.1 | 0.12 | 0.2 | 0.23 | 0.13 | 0.45 | 0.17 | 0.89 | 0.16 | 0.22 |
AAL22831 (hemG) | 0.39 | 0.54 | 0.55 | 0.51 | 0.48 | 0.28 | 1.0 | 0.62 | 0.3 | 0.47 | 0.36 | 0.41 | 0.53 | 0.63 | 0.88 | 0.41 | 0.46 | 0.51 | 0.52 | 0.55 | 0.27 | 0.25 | 0.33 | 0.57 | 0.18 | 0.61 | 0.28 | 0.51 | 0.39 | 0.1 | 0.24 | 0.44 | 0.4 | 0.46 | 0.53 | 0.27 | 0.85 | 0.52 | 0.53 |
AAL22832 (mobB) | 0.1 | 0.18 | 0.14 | 0.14 | 0.08 | 0.02 | 0.23 | 0.22 | 0.08 | 0.07 | 0.08 | 0.06 | 0.14 | 0.12 | 0.88 | 0.1 | 0.36 | 0.26 | 0.21 | 0.27 | 0.05 | 0.08 | 0.11 | 0.54 | 0.05 | 0.05 | 0.1 | 0.14 | 0.09 | 0.01 | 0.04 | 0.14 | 0.08 | 0.11 | 0.47 | 0.17 | 1.0 | 0.1 | 0.23 |
AAL22833 (mobA) | 0.12 | 0.34 | 0.19 | 0.21 | 0.16 | 0.04 | 0.3 | 0.23 | 0.17 | 0.17 | 0.2 | 0.13 | 0.25 | 0.18 | 0.48 | 0.1 | 0.36 | 0.25 | 0.2 | 0.3 | 0.06 | 0.17 | 0.11 | 0.55 | 0.11 | 0.11 | 0.18 | 0.21 | 0.19 | 0.03 | 0.11 | 0.28 | 0.18 | 0.1 | 0.47 | 0.31 | 1.0 | 0.16 | 0.33 |
AAL22923 (yiiR) | 0.27 | 0.35 | 0.3 | 0.17 | 0.16 | 0.02 | 0.29 | 0.33 | 0.17 | 0.15 | 0.24 | 0.12 | 0.25 | 0.19 | 0.5 | 0.07 | 0.32 | 0.55 | 0.25 | 0.5 | 0.1 | 0.2 | 0.06 | 0.56 | 0.12 | 0.1 | 0.18 | 0.18 | 0.2 | 0.01 | 0.14 | 0.32 | 0.18 | 0.04 | 0.47 | 0.16 | 1.0 | 0.23 | 0.33 |
AAL22971 (birA) | 0.23 | 0.4 | 0.18 | 0.26 | 0.18 | 0.05 | 0.47 | 0.36 | 0.27 | 0.24 | 0.31 | 0.28 | 0.21 | 0.33 | 0.62 | 0.26 | 0.63 | 0.42 | 0.4 | 0.43 | 0.11 | 0.16 | 0.5 | 0.6 | 0.12 | 0.2 | 0.22 | 0.19 | 0.24 | 0.08 | 0.15 | 0.22 | 0.24 | 0.34 | 0.93 | 0.2 | 1.0 | 0.22 | 0.31 |
AAL22994 (yjaD) | 0.46 | 0.68 | 0.56 | 0.46 | 0.37 | 0.14 | 0.95 | 0.6 | 0.46 | 0.37 | 0.66 | 0.38 | 1.0 | 0.71 | 0.74 | 0.29 | 0.47 | 0.9 | 0.74 | 0.81 | 0.34 | 0.48 | 0.17 | 0.55 | 0.43 | 0.7 | 0.33 | 0.53 | 0.55 | 0.03 | 0.22 | 0.48 | 0.56 | 0.22 | 0.72 | 0.32 | 0.76 | 0.49 | 0.9 |
AAL23077 (STM4253) | 0.2 | 0.2 | 0.09 | 0.17 | 0.12 | 0.02 | 0.32 | 0.2 | 0.07 | 0.05 | 0.16 | 0.05 | 0.41 | 0.18 | 0.66 | 0.07 | 0.1 | 0.59 | 0.51 | 0.7 | 0.1 | 0.04 | 0.05 | 0.4 | 0.08 | 0.07 | 0.06 | 0.19 | 0.11 | 0.01 | 0.1 | 0.17 | 0.1 | 0.06 | 1.0 | 0.04 | 0.97 | 0.11 | 0.35 |
AAL23395 (nadR) | 0.39 | 0.58 | 0.71 | 0.39 | 0.38 | 0.23 | 0.83 | 0.73 | 0.6 | 0.56 | 0.57 | 0.51 | 0.79 | 0.8 | 0.77 | 0.55 | 0.48 | 0.88 | 0.74 | 1.0 | 0.28 | 0.33 | 0.43 | 0.51 | 0.34 | 0.58 | 0.33 | 0.54 | 0.33 | 0.08 | 0.32 | 0.56 | 0.23 | 0.69 | 0.69 | 0.31 | 0.72 | 0.62 | 0.64 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)