View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | ATCC_14028 | SL1344 | ATCC_14028,E-stationary,WT | 14028s | ATCC_14028,Log,rpsL*_mut | 14028s,mLPM | opgGH_mut | LT2 | Florfenicol | NCTC_12023,37_C | Chlortetracycline | SL1344,NarS_defic | ATCC_14028,E-stationary,rpsD*_mut | LT2,ridA | fliA_del | High-patho | LT2,Cell_susp_cult | 14028s,hilC_del,pBAD24 | 14028s,sprB_del,pBAD24 | 14028s,pBAD24 | gastro | hfq_mut | Low-patho,42C | plank_cells | ATCC_14028,gastro | Typh_14028s,Expo_phase | biofilm,cpxR_mut | 14028s,typhoid | 14028s,rtcR | Typh_14028s | infection | ATCC_14028,Log,WT | 14028s,rtcB | High-patho,42C | LT2,Cell_susp_cult,Rho_Y80C | plank_cells,cpxR_mut | biofilm | ATCC_14028,E-stationary,rpsL*_mut | ATCC_14028,Log,rpsD*_mut |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AAL19204 (yaeJ) | 0.51 | 0.63 | 0.78 | 0.4 | 0.4 | 0.18 | 1.0 | 0.89 | 0.51 | 0.36 | 0.78 | 0.5 | 0.7 | 0.72 | 0.42 | 0.27 | 0.41 | 0.55 | 0.51 | 0.56 | 0.47 | 0.7 | 0.23 | 0.59 | 0.34 | 0.38 | 0.49 | 0.84 | 0.47 | 0.14 | 0.49 | 0.66 | 0.5 | 0.19 | 0.51 | 0.57 | 0.49 | 0.45 | 0.57 |
AAL19231 (STM0274A) | 0.55 | 0.0 | 1.0 | 0.12 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.52 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
AAL19313 (STM0359) | 0.08 | 0.0 | 0.56 | 0.0 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.93 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.35 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.49 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.06 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.04 |
AAL19322 (prpB) | 0.05 | 0.41 | 0.29 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.04 | 0.63 | 0.07 | 1.0 | 0.1 | 0.03 | 0.35 | 0.07 | 0.03 | 0.01 | 0.2 | 0.06 | 0.06 | 0.07 | 0.06 | 0.14 | 0.0 | 0.45 | 0.08 | 0.06 | 0.08 | 0.19 | 0.04 | 0.02 | 0.09 | 0.08 | 0.04 | 0.01 | 0.1 | 0.06 | 0.67 | 0.05 | 0.25 |
AAL19323 (prpC) | 0.03 | 0.27 | 0.27 | 0.03 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.37 | 0.05 | 1.0 | 0.08 | 0.01 | 0.35 | 0.04 | 0.02 | 0.05 | 0.03 | 0.04 | 0.05 | 0.05 | 0.03 | 0.15 | 0.02 | 0.36 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.12 | 0.02 | 0.01 | 0.13 | 0.04 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.44 | 0.07 | 0.1 |
AAL19324 (prpD) | 0.03 | 0.22 | 0.23 | 0.02 | 0.06 | 0.03 | 0.02 | 0.24 | 0.04 | 1.0 | 0.05 | 0.01 | 0.28 | 0.05 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.04 | 0.04 | 0.05 | 0.03 | 0.1 | 0.02 | 0.2 | 0.04 | 0.03 | 0.04 | 0.13 | 0.02 | 0.01 | 0.08 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.3 | 0.07 | 0.09 |
AAL19325 (prpE) | 0.09 | 0.28 | 0.23 | 0.04 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.44 | 0.07 | 1.0 | 0.09 | 0.02 | 0.28 | 0.09 | 0.03 | 0.03 | 0.07 | 0.06 | 0.06 | 0.08 | 0.06 | 0.13 | 0.01 | 0.4 | 0.05 | 0.04 | 0.05 | 0.09 | 0.04 | 0.01 | 0.09 | 0.06 | 0.03 | 0.02 | 0.07 | 0.04 | 0.53 | 0.09 | 0.11 |
AAL19332 (yaiY) | 0.13 | 0.25 | 0.23 | 0.11 | 0.15 | 0.15 | 0.3 | 0.3 | 0.11 | 0.1 | 0.15 | 0.03 | 0.16 | 0.1 | 0.1 | 0.23 | 0.06 | 0.12 | 0.14 | 0.17 | 0.3 | 0.29 | 0.33 | 0.45 | 0.23 | 0.09 | 0.15 | 0.3 | 0.24 | 0.01 | 0.18 | 0.12 | 0.29 | 0.17 | 0.09 | 0.07 | 1.0 | 0.17 | 0.11 |
AAL19413 (STM0458) | 0.09 | 0.16 | 0.44 | 0.13 | 0.18 | 0.04 | 0.09 | 0.16 | 0.43 | 0.08 | 0.34 | 0.04 | 0.74 | 0.12 | 0.05 | 0.14 | 1.0 | 0.11 | 0.13 | 0.14 | 0.04 | 0.09 | 0.03 | 0.28 | 0.05 | 0.06 | 0.26 | 0.1 | 0.05 | 0.05 | 0.08 | 0.16 | 0.05 | 0.07 | 0.12 | 0.05 | 0.67 | 0.19 | 0.18 |
AAL19490 (ppiB) | 0.36 | 0.49 | 0.39 | 0.51 | 0.28 | 0.49 | 0.86 | 0.41 | 0.4 | 0.61 | 0.43 | 0.54 | 0.31 | 0.45 | 0.72 | 0.3 | 0.73 | 0.18 | 0.19 | 0.23 | 0.13 | 0.29 | 0.26 | 0.41 | 0.26 | 0.74 | 0.61 | 0.4 | 0.43 | 1.0 | 0.16 | 0.38 | 0.42 | 0.27 | 0.72 | 0.75 | 0.39 | 0.31 | 0.45 |
AAL19497 (fimA) | 0.04 | 0.1 | 0.54 | 0.12 | 0.0 | 0.07 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 1.0 | 0.09 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.55 | 0.04 | 0.07 | 0.32 | 0.41 | 0.49 | 0.0 | 0.02 | 0.29 | 0.03 | 0.02 | 0.2 | 0.04 | 0.32 | 0.08 | 0.06 | 0.55 | 0.47 | 0.1 | 0.09 | 0.0 | 0.04 | 0.05 | 0.01 | 0.01 |
AAL19624 (asnB) | 0.06 | 0.16 | 0.11 | 0.25 | 0.04 | 0.07 | 0.06 | 0.17 | 0.07 | 0.12 | 0.07 | 0.04 | 0.05 | 0.21 | 0.07 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.09 | 0.06 | 0.13 | 0.11 | 0.03 | 0.06 | 0.05 | 0.12 | 0.04 | 0.08 | 1.0 | 0.01 | 0.1 | 0.05 | 0.6 | 0.03 | 0.11 | 0.02 | 0.15 | 0.06 | 0.05 |
AAL19651 (STM0707) | 0.26 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
AAL19659 (STM0715) | 0.23 | 0.04 | 0.27 | 0.03 | 0.15 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.07 | 0.0 | 0.52 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.95 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.14 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.12 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.19 | 0.25 |
AAL19686 (ybgT) | 0.22 | 0.03 | 0.75 | 0.01 | 0.27 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.86 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.18 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.51 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.23 | 0.61 |
AAL20059 (STM1128) | 0.16 | 0.07 | 0.26 | 0.18 | 0.17 | 0.01 | 0.02 | 0.06 | 0.08 | 0.16 | 0.15 | 0.0 | 0.14 | 0.03 | 0.04 | 0.29 | 0.51 | 0.8 | 0.67 | 1.0 | 0.03 | 0.03 | 0.16 | 0.31 | 0.03 | 0.06 | 0.01 | 0.18 | 0.11 | 0.07 | 0.02 | 0.12 | 0.13 | 0.36 | 0.11 | 0.01 | 0.6 | 0.11 | 0.1 |
AAL20060 (STM1129) | 0.49 | 0.22 | 0.13 | 0.34 | 0.85 | 0.01 | 0.01 | 0.08 | 0.22 | 0.13 | 0.29 | 0.01 | 0.06 | 0.02 | 0.14 | 0.08 | 1.0 | 0.08 | 0.04 | 0.08 | 0.02 | 0.05 | 0.08 | 0.18 | 0.05 | 0.03 | 0.01 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.08 | 0.02 | 0.11 | 0.19 | 0.01 | 0.61 | 0.06 | 0.09 |
AAL20061 (STM1130) | 0.17 | 0.11 | 0.07 | 0.18 | 0.19 | 0.0 | 0.0 | 0.06 | 0.04 | 0.04 | 0.07 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.06 | 0.02 | 1.0 | 0.04 | 0.03 | 0.05 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.24 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.22 | 0.0 | 0.73 | 0.01 | 0.03 |
AAL20062 (STM1131) | 0.1 | 0.03 | 0.13 | 0.11 | 0.1 | 0.0 | 0.0 | 0.06 | 0.03 | 0.03 | 0.05 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 1.0 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.16 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.02 | 0.17 | 0.0 | 0.56 | 0.01 | 0.01 |
AAL20064 (STM1133) | 0.16 | 0.11 | 0.35 | 0.09 | 0.13 | 0.03 | 0.11 | 0.13 | 0.08 | 0.13 | 0.08 | 0.02 | 0.16 | 0.07 | 0.13 | 0.08 | 1.0 | 0.19 | 0.14 | 0.2 | 0.07 | 0.04 | 0.04 | 0.19 | 0.04 | 0.05 | 0.04 | 0.11 | 0.04 | 0.03 | 0.08 | 0.1 | 0.04 | 0.08 | 0.11 | 0.03 | 0.45 | 0.1 | 0.08 |
AAL20141 (ycfJ) | 0.19 | 0.28 | 0.18 | 0.15 | 0.24 | 0.09 | 1.0 | 0.24 | 0.09 | 0.15 | 0.14 | 0.07 | 0.26 | 0.08 | 0.14 | 0.32 | 0.08 | 0.24 | 0.28 | 0.26 | 0.15 | 0.11 | 0.44 | 0.4 | 0.1 | 0.15 | 0.33 | 0.3 | 0.16 | 0.03 | 0.12 | 0.15 | 0.22 | 0.35 | 0.09 | 0.14 | 0.66 | 0.3 | 0.13 |
AAL20200 (yaoF) | 0.17 | 0.2 | 0.95 | 0.08 | 0.27 | 0.05 | 0.07 | 0.19 | 0.12 | 0.12 | 0.17 | 0.07 | 0.42 | 0.13 | 0.11 | 0.14 | 0.04 | 0.1 | 0.1 | 0.1 | 1.0 | 0.28 | 0.02 | 0.1 | 0.72 | 0.14 | 0.1 | 0.24 | 0.12 | 0.01 | 0.38 | 0.32 | 0.09 | 0.03 | 0.04 | 0.11 | 0.12 | 0.28 | 0.29 |
AAL20349 (cfa) | 0.07 | 0.2 | 0.19 | 0.11 | 0.05 | 0.24 | 1.0 | 0.22 | 0.05 | 0.11 | 0.06 | 0.16 | 0.25 | 0.13 | 0.12 | 0.37 | 0.05 | 0.21 | 0.2 | 0.23 | 0.22 | 0.08 | 0.1 | 0.16 | 0.2 | 0.1 | 0.08 | 0.23 | 0.13 | 0.03 | 0.28 | 0.05 | 0.11 | 0.36 | 0.08 | 0.11 | 0.16 | 0.07 | 0.1 |
AAL20369 (ydhA) | 0.13 | 0.2 | 0.21 | 0.18 | 0.17 | 0.06 | 0.61 | 0.34 | 0.08 | 0.16 | 0.1 | 0.07 | 0.15 | 0.16 | 0.25 | 0.36 | 0.29 | 0.22 | 0.23 | 0.24 | 0.09 | 0.17 | 1.0 | 0.3 | 0.11 | 0.15 | 0.22 | 0.28 | 0.13 | 0.18 | 0.12 | 0.15 | 0.15 | 0.45 | 0.26 | 0.15 | 0.55 | 0.15 | 0.25 |
AAL20428 (ydfZ) | 0.16 | 0.18 | 0.22 | 0.07 | 0.01 | 0.02 | 0.3 | 0.09 | 0.12 | 0.55 | 0.22 | 1.0 | 0.07 | 0.02 | 0.01 | 0.64 | 0.0 | 0.05 | 0.1 | 0.1 | 0.06 | 0.05 | 0.74 | 0.14 | 0.07 | 0.02 | 0.17 | 0.05 | 0.09 | 0.04 | 0.4 | 0.03 | 0.04 | 0.91 | 0.01 | 0.6 | 0.11 | 0.03 | 0.04 |
AAL20480 (STM1562) | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.05 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.09 | 0.01 | 0.01 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.37 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 |
AAL20483 (rpsV) | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.19 | 0.01 | 0.0 | 0.18 | 0.0 | 0.01 | 0.06 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.16 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.02 |
AAL20566 (hslJ) | 0.24 | 0.47 | 0.42 | 0.27 | 0.25 | 0.08 | 1.0 | 0.42 | 0.21 | 0.27 | 0.24 | 0.35 | 0.52 | 0.34 | 0.38 | 0.41 | 0.16 | 0.37 | 0.44 | 0.41 | 0.28 | 0.48 | 0.49 | 0.37 | 0.26 | 0.25 | 0.31 | 0.65 | 0.39 | 0.04 | 0.22 | 0.25 | 0.46 | 0.42 | 0.37 | 0.21 | 0.63 | 0.21 | 0.4 |
AAL20601 (ycjF) | 0.19 | 0.55 | 0.59 | 0.27 | 0.44 | 0.18 | 0.15 | 0.36 | 0.33 | 0.41 | 0.35 | 0.27 | 0.42 | 0.49 | 0.46 | 0.2 | 0.26 | 0.52 | 0.66 | 0.6 | 0.6 | 0.53 | 0.19 | 0.39 | 0.39 | 0.54 | 0.26 | 0.75 | 0.36 | 0.06 | 0.22 | 0.42 | 0.35 | 0.16 | 0.48 | 0.18 | 0.71 | 0.55 | 1.0 |
AAL20602 (ycjX) | 0.11 | 0.34 | 0.25 | 0.2 | 0.34 | 0.09 | 0.11 | 0.23 | 0.27 | 0.35 | 0.34 | 0.19 | 0.31 | 0.29 | 0.31 | 0.13 | 0.12 | 0.33 | 0.4 | 0.38 | 0.12 | 0.21 | 0.27 | 0.27 | 0.17 | 0.42 | 0.17 | 0.67 | 0.25 | 0.07 | 0.26 | 0.38 | 0.28 | 0.17 | 0.19 | 0.1 | 0.42 | 0.28 | 1.0 |
AAL20623 (osmB) | 0.22 | 0.18 | 0.52 | 0.1 | 0.18 | 0.05 | 0.21 | 0.07 | 0.05 | 0.07 | 0.09 | 0.03 | 0.63 | 0.01 | 0.02 | 0.15 | 0.04 | 0.08 | 0.07 | 0.07 | 1.0 | 0.04 | 0.05 | 0.28 | 0.89 | 0.21 | 0.57 | 0.51 | 0.21 | 0.05 | 0.05 | 0.12 | 0.22 | 0.1 | 0.03 | 0.17 | 0.96 | 0.2 | 0.12 |
AAL20670 (galU) | 0.42 | 0.48 | 0.51 | 0.52 | 0.57 | 0.35 | 0.44 | 0.4 | 0.42 | 0.45 | 0.34 | 0.47 | 0.46 | 0.4 | 0.51 | 0.32 | 0.36 | 0.21 | 0.34 | 0.21 | 0.2 | 0.23 | 0.35 | 0.77 | 0.22 | 0.61 | 1.0 | 0.57 | 0.8 | 0.13 | 0.28 | 0.46 | 0.86 | 0.28 | 0.32 | 0.97 | 0.91 | 0.48 | 0.6 |
AAL20725 (STM1810) | 0.03 | 0.02 | 0.13 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.28 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.05 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.06 |
AAL20755 (yobG) | 0.08 | 0.0 | 0.22 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.12 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.26 | 0.0 | 0.01 | 0.08 | 0.0 | 0.02 | 0.02 | 0.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.02 | 0.05 | 0.11 |
AAL20780 (STM1865) | 0.01 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.57 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 |
AAL21065 (STM2161) | 0.85 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.64 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
AAL21106 (yeiH) | 0.28 | 0.09 | 0.07 | 0.11 | 0.04 | 0.02 | 0.05 | 0.08 | 0.08 | 0.51 | 0.08 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.36 | 0.04 | 0.09 | 0.08 | 0.09 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.05 | 0.03 | 0.04 | 0.05 | 0.15 | 0.08 | 0.01 | 1.0 | 0.06 | 0.09 | 0.04 | 0.03 | 0.03 | 0.08 | 0.03 | 0.07 |
AAL21164 (eco) | 0.58 | 0.42 | 0.87 | 0.56 | 0.81 | 0.12 | 0.51 | 0.44 | 0.54 | 0.64 | 0.79 | 0.28 | 0.74 | 0.18 | 0.86 | 0.18 | 0.17 | 0.85 | 0.84 | 0.95 | 0.05 | 0.23 | 0.44 | 0.66 | 0.1 | 0.32 | 0.62 | 1.0 | 0.35 | 0.08 | 0.63 | 0.68 | 0.3 | 0.23 | 0.23 | 0.74 | 0.7 | 0.85 | 0.78 |
AAL21290 (yfcY) | 0.13 | 0.44 | 0.7 | 0.2 | 0.34 | 0.04 | 0.04 | 0.23 | 0.17 | 0.28 | 0.16 | 0.04 | 0.53 | 0.19 | 0.19 | 0.14 | 0.66 | 0.47 | 0.37 | 0.54 | 0.06 | 0.11 | 0.05 | 0.55 | 0.14 | 0.26 | 0.11 | 0.27 | 0.12 | 0.01 | 0.17 | 0.27 | 0.14 | 0.15 | 1.0 | 0.07 | 0.9 | 0.7 | 0.18 |
AAL21307 (ypeC) | 0.26 | 0.8 | 0.76 | 0.18 | 0.25 | 0.14 | 0.8 | 0.49 | 0.22 | 0.38 | 0.3 | 0.08 | 0.73 | 0.38 | 0.16 | 0.33 | 1.0 | 0.41 | 0.56 | 0.45 | 0.49 | 1.0 | 0.37 | 0.5 | 0.62 | 0.47 | 0.57 | 0.61 | 0.19 | 0.04 | 0.34 | 0.4 | 0.23 | 0.42 | 0.6 | 0.26 | 0.99 | 0.38 | 0.74 |
AAL21442 (asrA) | 0.16 | 0.07 | 0.02 | 0.1 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.12 | 0.02 | 1.0 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.22 | 0.1 | 0.01 | 0.44 | 0.34 | 0.5 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.13 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.18 | 0.02 | 0.0 | 0.89 | 0.02 | 0.02 | 0.05 | 0.01 | 0.01 | 0.22 | 0.01 | 0.09 |
AAL21443 (asrB) | 0.12 | 0.06 | 0.02 | 0.05 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.07 | 0.02 | 1.0 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.06 | 0.01 | 0.15 | 0.12 | 0.14 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.07 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.14 | 0.02 | 0.0 | 0.79 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.16 | 0.01 | 0.07 |
AAL21444 (asrC) | 0.12 | 0.06 | 0.05 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.09 | 0.04 | 1.0 | 0.04 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | 0.08 | 0.05 | 0.03 | 0.13 | 0.11 | 0.14 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.08 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.12 | 0.02 | 0.0 | 0.6 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.05 | 0.02 | 0.18 | 0.02 | 0.06 |
AAL21686 (ygaC) | 0.15 | 0.23 | 0.24 | 0.09 | 0.16 | 0.01 | 1.0 | 0.22 | 0.17 | 0.15 | 0.33 | 0.1 | 0.51 | 0.08 | 0.15 | 0.25 | 0.17 | 0.25 | 0.23 | 0.3 | 0.04 | 0.18 | 0.6 | 0.44 | 0.06 | 0.19 | 0.18 | 0.28 | 0.18 | 0.03 | 0.09 | 0.3 | 0.19 | 0.49 | 0.27 | 0.16 | 0.6 | 0.11 | 0.22 |
AAL21883 (ygdR) | 0.18 | 0.15 | 0.69 | 0.14 | 0.39 | 0.03 | 0.29 | 0.18 | 0.29 | 0.16 | 0.27 | 0.04 | 0.72 | 0.1 | 0.13 | 0.7 | 0.15 | 0.13 | 0.15 | 0.15 | 0.13 | 0.02 | 0.93 | 0.23 | 0.2 | 0.14 | 0.12 | 0.44 | 0.11 | 0.12 | 0.22 | 0.36 | 0.11 | 1.0 | 0.22 | 0.1 | 0.4 | 0.32 | 0.58 |
AAL21940 (yggE) | 0.27 | 0.41 | 0.35 | 0.3 | 0.21 | 0.27 | 0.5 | 0.44 | 0.24 | 0.18 | 0.3 | 0.23 | 0.4 | 0.42 | 0.28 | 0.16 | 0.28 | 0.26 | 0.25 | 0.24 | 0.4 | 0.28 | 0.15 | 0.64 | 0.48 | 0.59 | 0.7 | 0.65 | 0.47 | 0.07 | 0.29 | 0.18 | 0.62 | 0.09 | 0.36 | 0.41 | 1.0 | 0.21 | 0.28 |
AAL21952 (yggG) | 0.46 | 0.65 | 0.67 | 0.44 | 0.5 | 0.17 | 0.91 | 0.76 | 0.58 | 0.46 | 0.77 | 0.28 | 0.81 | 0.44 | 0.59 | 0.32 | 0.71 | 0.4 | 0.41 | 0.47 | 0.8 | 0.64 | 0.34 | 0.79 | 0.69 | 0.58 | 0.74 | 0.72 | 0.61 | 0.13 | 0.34 | 0.58 | 0.68 | 0.3 | 0.71 | 0.43 | 1.0 | 0.51 | 0.74 |
AAL21988 (nupG) | 0.04 | 0.3 | 0.12 | 0.12 | 0.1 | 0.01 | 0.06 | 0.17 | 0.64 | 0.09 | 0.53 | 0.25 | 0.07 | 0.1 | 1.0 | 0.08 | 0.96 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.11 | 0.17 | 0.25 | 0.01 | 0.04 | 0.07 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.1 | 0.35 | 0.03 | 0.1 | 0.65 | 0.09 | 0.39 | 0.11 | 0.17 |
AAL22008 (STM3134) | 0.06 | 0.16 | 0.13 | 0.22 | 0.19 | 0.04 | 0.01 | 0.11 | 0.3 | 0.16 | 0.28 | 0.03 | 0.08 | 0.01 | 1.0 | 0.07 | 0.57 | 0.09 | 0.07 | 0.1 | 0.01 | 0.05 | 0.06 | 0.24 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.16 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.34 | 0.01 | 0.06 | 0.5 | 0.03 | 0.42 | 0.09 | 0.37 |
AAL22009 (STM3135) | 0.04 | 0.1 | 0.07 | 0.17 | 0.09 | 0.03 | 0.02 | 0.1 | 0.21 | 0.12 | 0.19 | 0.07 | 0.04 | 0.02 | 1.0 | 0.05 | 0.33 | 0.05 | 0.04 | 0.06 | 0.01 | 0.04 | 0.03 | 0.06 | 0.01 | 0.05 | 0.01 | 0.11 | 0.03 | 0.01 | 0.03 | 0.14 | 0.01 | 0.02 | 0.62 | 0.02 | 0.11 | 0.04 | 0.19 |
AAL22010 (STM3136) | 0.07 | 0.19 | 0.15 | 0.26 | 0.14 | 0.06 | 0.02 | 0.14 | 0.33 | 0.23 | 0.28 | 0.14 | 0.12 | 0.06 | 1.0 | 0.05 | 0.15 | 0.07 | 0.07 | 0.07 | 0.02 | 0.06 | 0.03 | 0.19 | 0.03 | 0.09 | 0.03 | 0.23 | 0.07 | 0.01 | 0.08 | 0.25 | 0.04 | 0.02 | 0.32 | 0.04 | 0.33 | 0.08 | 0.45 |
AAL22011 (STM3137) | 0.1 | 0.18 | 0.35 | 0.26 | 0.12 | 0.11 | 0.05 | 0.16 | 0.32 | 0.27 | 0.35 | 0.13 | 0.23 | 0.12 | 1.0 | 0.1 | 0.12 | 0.07 | 0.07 | 0.09 | 0.05 | 0.08 | 0.07 | 0.13 | 0.04 | 0.11 | 0.04 | 0.25 | 0.09 | 0.04 | 0.12 | 0.21 | 0.05 | 0.08 | 0.29 | 0.05 | 0.28 | 0.12 | 0.38 |
AAL22069 (ribB) | 0.24 | 0.19 | 0.07 | 0.1 | 0.09 | 0.04 | 0.21 | 0.22 | 0.13 | 0.13 | 0.09 | 0.08 | 0.17 | 0.31 | 0.12 | 0.14 | 0.22 | 0.14 | 0.24 | 0.22 | 0.04 | 0.14 | 0.12 | 0.23 | 0.05 | 0.14 | 0.17 | 0.13 | 0.13 | 0.01 | 0.09 | 0.16 | 0.15 | 0.18 | 1.0 | 0.1 | 0.48 | 0.11 | 0.32 |
AAL22088 (yqjI) | 0.21 | 0.32 | 0.24 | 0.25 | 0.15 | 0.06 | 0.3 | 0.43 | 0.21 | 0.21 | 0.59 | 0.31 | 0.12 | 0.34 | 1.0 | 0.08 | 0.31 | 0.35 | 0.3 | 0.36 | 0.09 | 0.17 | 0.05 | 0.2 | 0.07 | 0.11 | 0.18 | 0.22 | 0.18 | 0.03 | 0.11 | 0.21 | 0.22 | 0.06 | 0.38 | 0.38 | 0.23 | 0.21 | 0.2 |
AAL22092 (fadH) | 0.38 | 0.49 | 1.0 | 0.18 | 0.38 | 0.06 | 0.04 | 0.25 | 0.29 | 0.31 | 0.38 | 0.05 | 0.79 | 0.24 | 0.17 | 0.14 | 0.36 | 0.26 | 0.23 | 0.28 | 0.32 | 0.17 | 0.05 | 0.43 | 0.27 | 0.27 | 0.19 | 0.42 | 0.12 | 0.03 | 0.22 | 0.48 | 0.11 | 0.12 | 0.48 | 0.16 | 0.71 | 0.47 | 0.44 |
AAL22110 (yhaL) | 1.0 | 0.05 | 0.26 | 0.1 | 0.28 | 0.17 | 0.0 | 0.01 | 0.39 | 0.17 | 0.33 | 0.04 | 0.25 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.75 | 0.01 | 0.0 | 0.09 | 0.3 | 0.01 | 0.08 | 0.35 | 0.02 | 0.12 | 0.32 | 0.28 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.16 | 0.16 | 0.22 | 0.26 |
AAL22111 (yhaN) | 0.31 | 0.5 | 0.27 | 0.52 | 0.55 | 0.14 | 0.17 | 0.42 | 1.0 | 0.33 | 0.84 | 0.21 | 0.49 | 0.34 | 0.28 | 0.4 | 0.2 | 0.59 | 0.64 | 0.72 | 0.35 | 0.4 | 0.22 | 0.57 | 0.21 | 0.21 | 0.21 | 0.55 | 0.19 | 0.04 | 0.31 | 0.37 | 0.17 | 0.55 | 0.11 | 0.18 | 0.87 | 0.18 | 0.6 |
AAL22112 (yhaO) | 0.06 | 0.1 | 0.31 | 0.07 | 0.44 | 0.01 | 0.04 | 0.11 | 0.26 | 0.06 | 0.23 | 0.01 | 1.0 | 0.03 | 0.06 | 0.35 | 0.06 | 0.14 | 0.14 | 0.19 | 0.02 | 0.04 | 0.23 | 0.43 | 0.03 | 0.02 | 0.03 | 0.16 | 0.02 | 0.01 | 0.06 | 0.24 | 0.02 | 0.79 | 0.03 | 0.02 | 0.75 | 0.38 | 0.29 |
AAL22175 (nlp) | 0.35 | 0.18 | 0.11 | 0.09 | 0.1 | 0.06 | 0.48 | 0.18 | 0.19 | 0.06 | 0.31 | 0.11 | 0.1 | 0.3 | 0.19 | 0.07 | 0.34 | 0.06 | 0.09 | 0.09 | 0.02 | 0.18 | 0.08 | 0.44 | 0.06 | 0.13 | 0.36 | 0.11 | 0.09 | 0.07 | 0.02 | 0.09 | 0.11 | 0.09 | 1.0 | 0.21 | 0.79 | 0.1 | 0.11 |
AAL22179 (yrbC) | 0.38 | 0.52 | 0.8 | 0.52 | 0.49 | 0.62 | 0.63 | 0.68 | 0.53 | 0.6 | 0.55 | 0.52 | 0.77 | 0.85 | 0.55 | 0.25 | 0.4 | 0.32 | 0.38 | 0.35 | 0.35 | 0.39 | 0.19 | 0.47 | 0.48 | 1.0 | 0.61 | 0.66 | 0.64 | 0.17 | 0.37 | 0.52 | 0.69 | 0.16 | 0.39 | 0.44 | 0.78 | 0.64 | 0.56 |
AAL22246 (STM3377) | 0.38 | 0.54 | 0.51 | 0.23 | 0.19 | 0.21 | 0.42 | 0.38 | 0.19 | 0.23 | 0.28 | 0.17 | 0.33 | 0.56 | 0.4 | 0.22 | 0.38 | 0.29 | 0.29 | 0.33 | 0.26 | 0.63 | 0.28 | 0.66 | 0.27 | 0.5 | 0.29 | 1.0 | 0.24 | 0.05 | 0.13 | 0.27 | 0.21 | 0.26 | 0.39 | 0.36 | 0.94 | 0.22 | 0.46 |
AAL22247 (STM3378) | 0.26 | 0.35 | 0.64 | 0.19 | 0.26 | 0.16 | 0.55 | 0.4 | 0.25 | 0.24 | 0.36 | 0.12 | 0.52 | 0.57 | 0.36 | 0.41 | 0.21 | 0.32 | 0.27 | 0.35 | 0.2 | 0.29 | 0.5 | 0.68 | 0.18 | 0.32 | 0.18 | 0.92 | 0.2 | 0.11 | 0.18 | 0.37 | 0.16 | 0.5 | 0.26 | 0.2 | 1.0 | 0.31 | 0.5 |
AAL22261 (yhdV) | 0.17 | 0.16 | 0.09 | 0.08 | 0.07 | 0.02 | 1.0 | 0.14 | 0.11 | 0.1 | 0.16 | 0.22 | 0.09 | 0.09 | 0.3 | 0.34 | 0.34 | 0.11 | 0.14 | 0.14 | 0.09 | 0.05 | 0.49 | 0.46 | 0.24 | 0.07 | 0.12 | 0.36 | 0.07 | 0.27 | 0.06 | 0.07 | 0.07 | 0.32 | 0.35 | 0.1 | 0.79 | 0.06 | 0.09 |
AAL22440 (STM3580) | 0.44 | 0.68 | 0.81 | 0.52 | 0.71 | 0.83 | 0.52 | 0.65 | 0.47 | 0.52 | 0.55 | 0.71 | 0.64 | 0.52 | 0.6 | 0.33 | 0.33 | 0.28 | 0.37 | 0.34 | 0.56 | 0.96 | 0.28 | 0.54 | 0.55 | 0.66 | 0.82 | 0.74 | 0.67 | 0.15 | 0.37 | 0.95 | 0.73 | 0.17 | 0.22 | 0.67 | 0.71 | 0.53 | 1.0 |
AAL22618 (STM3760) | 0.08 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.31 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.43 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.17 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
AAL23046 (yjbE) | 0.21 | 0.05 | 0.14 | 0.09 | 0.07 | 0.15 | 0.09 | 0.1 | 0.04 | 0.1 | 0.05 | 0.03 | 0.08 | 0.08 | 0.02 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 1.0 | 0.06 | 0.01 | 0.08 | 0.9 | 0.22 | 0.88 | 0.07 | 0.24 | 0.25 | 0.06 | 0.07 | 0.15 | 0.01 | 0.01 | 0.11 | 0.43 | 0.07 | 0.06 |
AAL23068 (yjbO) | 0.18 | 0.25 | 0.22 | 0.05 | 0.08 | 0.02 | 0.09 | 0.13 | 0.23 | 0.09 | 0.44 | 0.09 | 0.34 | 0.08 | 0.01 | 0.06 | 0.02 | 0.05 | 0.05 | 0.08 | 0.08 | 0.21 | 0.04 | 0.47 | 0.16 | 0.13 | 0.2 | 0.23 | 0.08 | 0.06 | 0.17 | 0.15 | 0.07 | 0.1 | 0.04 | 0.13 | 1.0 | 0.1 | 0.25 |
AAL23120 (adi) | 0.05 | 0.08 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 1.0 | 0.05 | 0.03 | 0.03 | 0.06 | 0.02 | 0.05 | 0.04 | 0.11 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.12 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.21 | 0.03 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | 0.32 | 0.02 | 0.06 |
AAL23225 (ytfJ) | 0.15 | 0.45 | 1.0 | 0.25 | 0.47 | 0.09 | 0.16 | 0.26 | 0.17 | 0.44 | 0.23 | 0.04 | 0.75 | 0.14 | 0.2 | 0.33 | 0.33 | 0.24 | 0.28 | 0.34 | 0.18 | 0.64 | 0.36 | 0.38 | 0.37 | 0.26 | 0.06 | 0.31 | 0.09 | 0.05 | 0.25 | 0.53 | 0.09 | 0.35 | 0.56 | 0.06 | 0.79 | 0.65 | 0.44 |
AAL23325 (uxuR) | 0.69 | 0.59 | 0.5 | 0.38 | 0.34 | 0.09 | 0.35 | 0.55 | 0.54 | 0.5 | 0.58 | 0.3 | 0.43 | 0.29 | 1.0 | 0.22 | 0.76 | 0.59 | 0.52 | 0.72 | 0.22 | 0.55 | 0.15 | 0.47 | 0.46 | 0.42 | 0.32 | 0.46 | 0.33 | 0.05 | 0.32 | 0.37 | 0.26 | 0.17 | 0.8 | 0.45 | 0.77 | 0.39 | 0.4 |
AAL23377 (STM4562) | 0.03 | 0.13 | 0.14 | 0.01 | 0.02 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.0 | 0.09 | 0.0 | 0.0 | 0.15 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.46 | 0.07 | 0.0 | 0.01 | 1.0 | 0.02 | 0.03 | 0.33 | 0.02 | 0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.09 | 0.0 | 0.02 | 0.03 | 0.03 | 0.02 |
AAL23522 (pefA) | 0.08 | 0.17 | 0.59 | 0.17 | 0.29 | 0.11 | 0.03 | 0.22 | 0.1 | 1.0 | 0.15 | 0.49 | 0.12 | 0.41 | 0.08 | 0.01 | 0.1 | 0.31 | 0.2 | 0.28 | 0.03 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.11 | 0.16 | 0.0 | 0.13 | 0.18 | 0.02 | 0.19 | 0.28 | 0.1 | 0.01 | 0.03 | 0.0 | 0.0 | 0.27 | 0.16 |
AAM89474 (ysdA) | 0.1 | 0.04 | 0.03 | 0.0 | 0.04 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 1.0 | 0.0 | 0.0 | 0.71 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.01 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)