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Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
37C
40C
6A10,THB
6A10,THB with GAL
6A10,THB with GLU
D39
D39,HPUra+
D39,Kanamycin+
D39,L-Log
GA02254
GA17457
GA41565
IU1781
IU1781,37C
IU1781,40C
L-Log,THB with Lysed horse blood,37C
PMEN3 (Spain9V-3)
PMEN3 (Spain9V-3),mitomycin+
PMEN3,37C
PMEN6,37C
R801
Rx1
Rx1,HPUra+
Rx1,Kanamycin+
Rx1,L-Log
Rx1,Log
Rx1,Log,Seconeolitsine+
Rx1,PhrA+
SP17
SP27
SRL1
ST556
TH11425
TH9063
TIGR4
TIGR4,Carolacton+
TIGR4,M-Log
TIGR4,M-Log,THB
TIGR4,M-Log,vancomycin+
TIGR4,THB
WT
XL28
XL28,IPTG+
XL29,IPTG+
XZ7022
XZ8009
XZ8015
Xen35
AAK98944 (mutR)
 0.89 0.59 -1.23 -2.31 -1.42 0.78 -0.5 -1.63 -0.08 -1.76 -1.11 -1.88 -0.23 -0.81 -0.47 1.25 -0.07 -0.31 -0.07 0.68 -1.62 -0.16 -0.5 -1.63 -0.52 -0.08 0.12 -0.52 -1.57 -0.25 1.8 -0.22 -0.19 -0.13 0.41 0.13 -0.38 0.63 1.4 0.64 0.49 0.43 0.56 0.36 -1.16 -1.34 -1.37 0.5
AAK98974 (corA)
 -0.17 -0.27 -0.11 0.16 -0.04 0.35 -0.39 -0.86 -0.72 0.14 0.17 -0.06 0.02 0.02 -0.2 1.34 0.17 0.07 0.17 -0.19 -1.19 0.03 -0.39 -0.86 -0.36 0.29 -0.79 0.12 -1.43 -0.35 -0.26 -0.11 -0.12 0.03 0.35 0.54 0.1 0.28 -0.41 0.13 0.49 0.34 0.36 0.33 0.23 -0.0 0.07 -0.52
AAK99044 (uppS)
 -0.3 -0.48 -0.42 -0.61 -0.37 0.4 -0.34 -0.65 -0.24 -0.35 -0.43 -0.4 0.28 0.31 0.19 -0.25 0.31 -0.07 0.31 -0.26 -1.12 0.07 -0.34 -0.65 -0.44 0.28 0.08 0.39 -1.12 -0.72 0.13 0.37 0.41 0.39 0.17 0.42 0.03 0.37 0.41 0.18 0.51 0.29 0.32 0.31 -0.37 -0.15 -0.19 0.54
AAK99045 (cdsA)
 -0.12 -0.21 -0.19 -0.28 -0.16 0.06 -0.32 -1.04 0.14 -0.44 -0.51 -0.2 0.57 0.68 -0.24 -0.48 0.57 0.08 0.57 -0.07 -0.3 0.09 -0.32 -1.04 -1.34 0.36 0.44 0.73 -0.12 0.08 -0.22 0.38 0.41 0.36 -0.19 -0.43 -1.5 0.21 -0.41 0.0 0.47 0.2 0.4 0.33 -0.22 -0.31 -0.19 0.16
AAK99046 (eep)
 -0.51 -0.52 -0.28 -0.35 -0.17 0.17 -1.53 -2.34 -0.07 0.01 -0.22 -0.11 0.51 0.57 -0.21 -0.48 0.2 -0.02 0.2 -0.31 -1.49 -0.02 -1.53 -2.34 -0.24 0.75 0.55 0.64 -0.2 0.74 -0.0 0.47 0.44 0.44 0.18 0.44 -1.3 0.08 -0.44 -0.07 1.0 -0.18 0.06 -0.04 -0.06 0.07 0.4 0.23
AAK99047 (proS)
 -0.52 -0.56 0.21 0.05 0.13 -0.03 -2.09 -2.82 0.0 0.06 -0.2 -0.15 0.2 0.35 -0.26 -0.26 0.4 0.06 0.4 -0.35 -1.77 -0.25 -2.09 -2.82 0.06 0.44 0.48 0.38 0.16 0.42 -0.45 0.6 0.58 0.58 0.3 0.5 -0.28 0.13 -0.08 0.03 0.56 -0.07 0.11 0.1 -0.04 -0.06 0.25 0.15
AAK99056 (spr0252)
 -0.41 -0.31 -1.39 -1.41 -1.1 0.83 -0.83 -0.67 -1.01 -0.44 -0.95 -2.06 0.88 0.95 0.01 -1.21 -0.16 -0.34 -0.16 0.14 -0.18 0.36 -0.83 -0.67 -1.17 1.28 0.69 1.39 -0.4 -0.23 0.4 0.55 0.56 0.51 -0.02 1.27 -1.18 -0.79 -0.3 -0.85 1.64 -1.68 -1.52 -1.43 -0.33 -0.2 -0.04 0.08
AAK99109 (mraY)
 -0.14 -0.03 -1.08 -1.23 -0.73 0.07 -2.41 -2.34 -0.33 0.09 -0.34 -0.15 0.77 1.03 -0.02 -0.11 0.2 -0.25 0.2 -0.65 -1.62 -0.02 -2.41 -2.34 -0.88 0.97 0.08 1.24 1.31 -0.56 0.68 0.54 0.52 0.49 0.04 0.87 -0.71 -0.08 -1.25 -0.12 0.83 -0.2 -0.08 -0.08 -0.3 0.06 -0.89 -0.24
AAK99169 (rnhB)
 0.01 0.02 -0.25 0.18 -0.04 0.11 -0.53 -1.06 -0.45 -0.05 -0.09 -0.22 0.47 0.23 -0.14 -0.03 0.43 0.08 0.43 -0.43 -2.27 0.06 -0.53 -1.06 -0.05 0.52 -0.55 0.45 -0.92 0.66 -0.26 0.43 0.34 0.35 0.04 0.38 -1.25 0.17 -0.8 -0.0 0.1 0.51 0.66 0.54 -0.16 0.36 -0.12 -0.82
AAK99224 (xylR)
 - - -0.99 -1.0 -0.86 0.73 -1.73 -1.11 -0.01 - -10.42 - -0.62 -0.63 -1.7 1.09 0.71 0.66 0.71 1.09 -1.32 -0.47 -1.73 -1.11 0.69 0.19 0.14 -0.91 -10.48 -1.16 - -0.96 -1.04 -0.78 0.61 0.35 0.06 0.25 1.98 0.08 0.51 2.25 0.08 2.3 -11.15 -10.69 -0.4 0.1
AAK99281 (spr0477)
 -0.27 -0.23 -0.32 -0.25 -0.01 0.46 -1.05 -0.69 -0.34 -0.26 -0.09 -0.18 0.01 -0.12 -0.18 -0.51 -0.82 -0.37 -0.82 -0.39 -1.91 -0.18 -1.05 -0.69 -1.03 0.59 0.51 -0.04 -0.05 -0.76 0.2 0.02 0.03 0.03 0.08 0.37 1.52 0.23 1.08 0.09 0.89 0.05 0.16 0.14 0.37 0.12 0.07 0.05
AAK99470 (ftsE)
 -0.9 -0.78 -0.78 -0.6 -0.82 0.07 -2.34 -0.93 -0.66 0.0 -0.51 0.25 0.69 1.02 -0.43 -0.22 -0.84 -1.03 -0.84 -0.96 -0.15 0.03 -2.34 -0.93 -0.7 0.88 0.79 0.94 0.35 1.17 0.17 0.69 0.66 0.61 -0.02 0.0 -0.37 0.15 -0.25 0.06 1.02 0.01 -0.05 -0.03 -0.56 -0.49 -0.09 0.25
AAK99548 (pdp)
 0.08 0.08 -0.09 -0.4 0.06 0.02 -3.16 -2.58 -0.16 0.64 0.28 0.14 0.2 0.35 -0.58 -0.2 -0.36 -0.45 -0.36 -0.11 -0.1 -0.45 -3.16 -2.58 -1.36 0.69 0.43 0.42 0.48 0.42 0.59 0.58 0.49 0.51 -0.52 -0.51 0.51 -0.01 0.26 -0.21 0.93 -0.85 -0.57 -0.62 -0.31 0.75 0.14 0.56
AAK99549 (deoC)
 -0.41 -0.39 -0.29 -0.2 0.02 0.17 -2.85 -2.53 -0.22 0.72 -0.29 -0.36 0.58 0.79 -0.71 -0.41 -0.02 -0.23 -0.02 -0.45 0.39 -0.05 -2.85 -2.53 -0.9 0.45 0.35 0.9 0.11 -0.06 0.33 0.41 0.34 0.32 0.27 0.45 0.0 -0.08 -0.32 -0.19 1.09 -0.3 -0.19 -0.29 -0.83 0.37 0.47 0.32
AAK99550 (cdd)
 -0.08 0.06 -0.81 -0.74 -0.72 0.12 -3.58 -3.42 -0.34 1.03 0.2 0.32 0.43 0.49 -2.01 -1.22 -0.23 -0.99 -0.23 -0.74 -1.5 -0.11 -3.58 -3.42 -1.65 0.81 0.19 0.79 0.34 0.06 -0.36 0.74 0.6 0.6 -0.03 0.66 1.15 -0.68 0.18 -0.77 1.27 -0.91 -0.62 -0.8 -0.07 1.16 0.5 0.5
AAK99610 (spr0806)
 - - -0.11 -0.04 -0.25 0.86 -1.78 -0.43 -0.16 - -9.13 - 1.46 1.62 -0.39 1.3 - - - - 2.44 0.78 -1.78 -0.43 0.66 1.28 0.31 1.54 0.32 - - - - - 0.66 1.33 -0.58 -0.92 0.68 -1.19 2.11 -0.72 -0.46 -0.6 - - - 0.27
AAK99611 (spr0807)
 - - -0.1 0.05 -0.3 0.49 -2.46 -1.02 0.69 - -9.41 - 1.04 1.09 -0.07 1.74 - - - - 1.82 0.47 -2.46 -1.02 0.78 0.85 -0.46 0.83 1.09 -7.23 - - - - 1.26 1.65 0.18 0.18 1.1 0.06 1.77 -0.36 0.08 0.01 - - - 1.03
AAK99727 (bltD)
 -0.38 -0.69 - - - 0.37 0.14 0.58 -0.06 -0.17 -10.37 - 0.87 0.69 -0.23 0.97 - - - -0.62 1.61 0.48 0.14 0.58 -1.13 0.92 0.24 0.93 -0.88 -9.27 - - - - 0.54 1.09 1.32 0.61 0.57 0.51 1.37 0.53 0.68 0.65 - - - 1.69
AAK99785 (cpoA)
 0.08 0.1 -0.67 -0.15 -0.16 0.4 -2.13 -1.45 -0.75 0.1 -0.21 -0.12 0.49 0.45 -0.51 -0.69 -0.19 -0.38 -0.19 -0.15 -0.84 0.06 -2.13 -1.45 -1.4 0.85 0.87 0.74 0.29 0.2 0.99 0.29 0.31 0.25 0.08 0.65 -0.46 0.26 -0.51 0.11 0.73 -0.27 -0.08 -0.2 -0.59 0.39 -0.16 0.22
AAK99786 (spr0982)
 0.39 0.47 -0.3 0.19 0.09 -0.05 -2.92 -2.59 -0.13 0.1 0.1 0.09 0.17 -0.03 -0.65 -0.35 -0.06 -0.23 -0.06 0.06 -0.12 -0.2 -2.92 -2.59 -1.4 0.03 0.55 0.17 0.71 0.41 0.44 0.43 0.43 0.39 -0.15 -0.04 -0.11 0.39 -0.54 0.23 0.39 -0.08 0.16 0.02 -0.29 0.46 0.13 0.59
AAK99842 (spr1038)
 -4.77 -4.63 -2.46 -2.18 -2.6 0.56 -1.01 0.12 0.05 -1.21 -1.72 -3.92 1.92 1.96 0.3 -1.42 - - - -8.33 1.15 0.84 -1.01 0.12 0.36 1.22 -0.12 2.22 -7.47 -5.84 -1.34 -5.17 -4.81 -5.12 0.37 2.03 0.61 -3.22 0.61 -2.92 2.2 0.33 0.15 0.16 -3.76 -3.32 -5.53 -0.13
AAK99886 (pphA)
 0.24 0.6 -0.36 -0.27 -0.13 -0.1 -2.74 -1.89 0.07 0.44 0.35 0.7 0.31 0.61 0.05 -0.29 -0.25 -0.84 -0.25 -0.68 0.57 0.12 -2.74 -1.89 -0.18 0.4 0.31 0.61 0.43 0.52 -0.37 0.36 0.25 0.27 -0.36 -0.36 -0.9 -0.24 -2.19 -0.3 1.21 -0.5 -0.14 -0.16 0.38 0.34 0.01 0.09
AAK99887 (recN)
 0.2 0.51 -0.39 -0.4 -0.24 -0.09 -3.22 -2.33 0.03 0.24 0.31 0.56 0.36 0.45 -0.06 -0.28 -0.34 -0.76 -0.34 -0.45 1.0 0.02 -3.22 -2.33 -0.54 0.71 0.69 0.56 0.29 0.48 -0.09 0.28 0.25 0.24 -0.39 -0.18 -0.34 -0.41 -1.73 -0.5 1.32 -0.6 -0.26 -0.27 0.28 0.33 -0.12 0.35
AAK99888 (ahrC)
 0.36 0.52 -0.56 -0.72 -0.43 0.16 -2.99 -1.8 0.01 0.39 0.63 0.63 0.29 0.32 -0.49 -0.16 -0.5 -0.65 -0.5 -0.36 0.33 -0.15 -2.99 -1.8 -1.47 0.72 0.72 0.27 0.41 0.65 -0.21 0.56 0.48 0.4 -0.3 -0.37 -0.99 -0.26 -1.83 -0.34 0.85 -0.74 -0.3 -0.3 0.49 0.79 0.38 0.63
AAK99889 (spr1086)
 0.02 0.27 -0.41 -0.32 -0.05 -0.06 -2.61 -1.61 -0.36 0.02 0.26 0.45 0.0 0.04 -0.1 -0.24 -0.62 -0.88 -0.62 -0.4 1.46 -0.23 -2.61 -1.61 -1.02 0.6 0.86 0.3 1.3 1.07 -0.08 0.09 0.04 0.02 -0.62 -0.55 -0.18 -0.22 -1.4 -0.3 1.24 -0.72 -0.4 -0.41 0.03 0.36 -0.22 0.45
AAK99890 (ispA)
 0.35 0.64 -0.27 -0.45 0.06 -0.07 -3.8 -2.83 0.23 0.29 0.17 0.48 0.18 0.12 -0.02 -0.13 -0.19 -0.54 -0.19 -0.11 0.53 -0.18 -3.8 -2.83 -1.01 0.43 0.67 0.36 0.5 0.51 0.17 0.36 0.32 0.33 -0.46 -0.41 -0.48 -0.08 -1.54 -0.15 0.98 -0.44 -0.11 -0.09 0.08 0.45 0.13 0.58
AAK99892 (xseA)
 0.25 0.36 -0.38 -0.56 -0.14 0.27 -4.76 -3.44 -0.18 0.42 0.24 0.55 0.45 0.6 0.08 -0.21 -0.48 -0.72 -0.48 -0.11 0.38 -0.14 -4.76 -3.44 -1.0 0.58 0.39 0.86 0.33 0.26 0.49 0.19 0.08 0.09 -0.14 0.14 -0.13 -0.21 -0.93 -0.23 1.32 -0.74 -0.4 -0.46 0.21 0.54 0.24 0.13
AAK99901 (srtA)
 -0.91 -0.74 -1.48 -1.87 -1.83 -0.36 -2.97 -1.72 -0.47 -0.04 -0.1 0.33 0.79 1.0 0.09 -0.55 -0.35 -0.58 -0.35 -0.71 -0.65 -0.1 -2.97 -1.72 -1.8 0.74 0.04 0.93 1.18 0.91 -0.17 1.2 1.11 1.13 -0.18 0.37 -0.51 -0.33 -0.2 -0.39 1.28 -0.35 -0.24 -0.27 -0.12 -0.0 0.27 -0.6
AAK99904 (spr1101)
 - - -0.21 0.14 0.32 0.4 -1.86 -0.97 1.04 -12.37 0.81 -11.67 0.74 0.68 -0.19 0.43 - - - - 1.12 0.14 -1.86 -0.97 0.7 0.94 1.04 0.52 - - - - - - 0.91 1.46 0.35 0.67 1.28 0.6 1.74 0.12 0.22 0.17 0.72 0.3 -12.36 0.33
AAK99905 (spr1102)
 - - -0.78 -0.66 -0.62 0.51 -1.09 -0.4 0.87 - 0.84 -12.1 0.82 0.77 -0.25 0.75 - - - - 0.24 0.29 -1.09 -0.4 -0.58 1.11 0.91 0.58 - - - - - - 0.94 1.81 0.94 0.65 1.33 0.54 1.77 0.24 0.41 0.31 0.57 0.13 -12.27 0.52
AAL00068 (nagD)
 0.19 0.43 -0.01 -0.03 0.24 -0.05 -3.06 -3.1 0.52 0.44 0.08 0.18 0.44 0.48 -0.09 -0.66 -0.31 -0.69 -0.31 -0.28 0.15 -0.08 -3.06 -3.1 0.66 0.46 0.03 0.66 -0.03 0.84 -0.93 0.45 0.42 0.43 -0.28 0.16 -1.27 0.0 -0.28 -0.2 0.84 -0.38 -0.22 -0.3 -0.2 0.54 0.41 -0.6
AAL00069 (spr1265)
 0.19 0.44 -0.26 -0.31 -0.15 -0.04 -2.69 -2.31 0.41 0.49 0.1 0.12 0.74 1.0 -0.57 -0.93 -0.28 -0.66 -0.28 -0.3 0.09 0.27 -2.69 -2.31 0.02 -0.0 -0.32 1.12 -0.34 0.84 -0.27 0.56 0.58 0.55 -0.49 -0.39 -0.69 -0.2 0.1 -0.42 0.84 -0.42 -0.08 -0.26 -0.08 0.49 0.14 -0.35
AAL00228 (spr1424)
 -0.17 0.07 -0.34 0.08 -0.05 0.24 -2.84 -2.89 -0.09 0.85 0.2 0.54 0.54 0.85 -0.74 -0.8 -0.17 -0.37 -0.17 -0.2 -0.25 -0.09 -2.84 -2.89 0.12 0.73 0.71 0.87 0.96 0.9 -0.61 0.06 -0.05 -0.09 -0.46 -0.06 -1.13 -0.49 -0.22 -0.54 0.99 -0.9 -0.53 -0.6 -0.27 0.74 0.35 -0.21
AAL00391 (spr1588)
 0.2 0.38 -0.76 -0.37 0.07 0.22 -1.81 -2.67 -0.16 -0.12 -0.29 -0.15 0.15 0.3 -0.97 0.18 -0.1 -0.47 -0.1 0.11 -1.11 -0.35 -1.81 -2.67 -1.09 0.71 0.99 0.48 0.93 0.75 1.0 0.01 -0.02 -0.08 0.13 0.75 -0.03 0.3 -0.18 0.11 0.65 -0.86 -0.43 -0.63 -0.75 0.2 0.18 0.38
AAL00394 (spr1591)
 -0.03 0.19 -0.52 -0.12 0.02 0.12 -2.52 -2.47 -0.29 0.24 -0.61 0.17 0.62 0.68 -1.01 -0.32 0.03 -0.43 0.03 -0.48 0.28 0.04 -2.52 -2.47 0.09 0.85 0.63 0.93 0.81 0.97 -0.46 0.23 0.26 0.23 -0.34 -0.06 -0.34 -0.06 -0.36 -0.24 1.26 -0.54 -0.26 -0.35 -1.35 -0.07 -0.08 0.11
AAL00415 (spr1612)
 0.88 0.98 -0.65 -0.51 -0.86 0.08 -2.71 -3.34 -0.11 -0.83 0.04 -1.19 1.31 1.14 -0.29 -1.0 0.14 0.34 0.14 0.36 -0.03 0.55 -2.71 -3.34 0.18 1.3 -0.57 1.75 0.45 0.28 0.36 -0.47 -0.53 -0.63 -0.55 0.34 -1.99 -1.22 -1.2 -1.51 1.35 -0.34 -0.22 -0.28 -0.1 -0.69 -0.47 -1.64
AAL00493 (spr1690)
 -0.13 0.21 -0.59 -0.28 0.19 -0.1 -1.76 -2.37 -0.26 0.78 0.23 0.27 0.59 0.8 -0.48 -0.81 -0.25 -1.02 -0.25 -0.31 0.45 0.3 -1.76 -2.37 0.09 1.02 0.28 0.84 -0.06 0.27 -0.44 -0.27 -0.31 -0.28 -0.29 0.21 -0.08 0.14 0.03 -0.0 1.44 -0.86 -0.44 -0.69 -0.24 0.59 0.19 -0.42
AAL00494 (spr1691)
 -0.21 0.11 -0.43 -0.13 0.34 -0.15 -2.75 -3.38 -0.26 0.62 0.23 0.03 1.23 1.56 -0.53 -0.57 -0.44 -0.81 -0.44 -0.32 0.46 0.57 -2.75 -3.38 0.03 0.83 0.14 1.53 -0.07 0.15 -1.32 -0.57 -0.57 -0.59 -0.22 0.22 -0.76 -0.06 -0.46 -0.21 1.37 -1.07 -0.7 -0.91 -0.36 0.53 0.18 -0.35
AAL00562 (lytR)
 -0.96 -0.97 -0.83 -1.37 -0.96 0.25 -1.65 -1.24 -0.32 0.41 0.27 0.61 0.41 0.58 0.04 -0.05 -0.65 -0.62 -0.65 -0.65 -1.59 0.32 -1.65 -1.24 -2.1 0.67 0.67 1.09 -0.74 -0.82 0.46 0.51 0.49 0.51 0.1 0.86 -0.1 -0.08 0.37 -0.04 1.22 -0.21 -0.22 -0.27 0.08 0.41 0.35 0.15
AAL00609 (spr1806)
 -0.58 -1.01 -0.58 -0.82 -1.07 0.98 -0.42 -0.3 -2.04 -1.62 -1.77 -2.32 0.31 0.3 -0.94 0.79 -2.4 -1.5 -2.4 -0.7 -2.21 0.28 -0.42 -0.3 -0.75 1.23 1.4 0.33 -1.14 -2.16 1.7 -1.74 -1.58 -1.73 0.64 1.78 1.35 0.23 -0.05 -0.03 0.45 0.8 0.86 0.78 -1.11 -1.64 -1.13 0.27
AAL00711 (pbp1b)
 -0.62 -0.65 -0.76 -1.15 -0.78 -0.11 -0.78 -1.28 -0.37 -0.08 -0.18 0.11 0.39 0.48 0.27 -0.09 -0.08 -0.5 -0.08 -0.27 -1.07 -0.2 -0.78 -1.28 -0.52 0.7 -0.07 0.75 0.18 0.6 0.45 0.48 0.44 0.47 -0.07 0.49 -0.54 0.18 0.01 0.13 1.21 0.16 0.2 0.13 -0.18 0.17 -0.03 -0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.