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Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
25RC,0.25% glucose
3RC,0.25% glucose
58RC,0.25% glucose
ATCC 29212,0% glucose
ATCC 29212,0.15% glucose
ATCC 29212,0.25% glucose
ATCC 29212,15min
ATCC 29212,ampicillin,15min
ATCC 29212,bacitracin,15min
ATCC 29212,chloramphenicol,15min
ATCC 29212,erythromycin,15min
ATCC 29212,kanamycin,15min
ATCC 29212,lincomycin,15min
ATCC 29212,ofloxacin,15min
ATCC 33186,TSB
ATCC 33186,pH10
EF16C185,37C,4h,20mlMH
EF16C185-O2,37C,4h,20mlMH
F4,37C,4h,20mlMH
F4-11,37C,4h,20mlMH
OG1RF
OG1RF,(p)ppGpp0
OG1RF,(p)ppGpp0 codY-KO
OG1RF,Untreated,0min
OG1RF,Untreated,10min
OG1RF,Untreated,20min
OG1RF,Untreated,40min
OG1RF,WT
OG1RF,cellobiose
OG1RF,clpP-KO
OG1RF,gentiobiose
OG1RF,glucose
OG1RF,pCF10
OG1RF,pCIE
OG1RF,pDAK1010A,highFstpAD1
OG1RF,pDAK1010E,highFstEF0409
OG1RF,pDAK1010E,lowFstEF0409
OG1RF,phageVPE25,0min
OG1RF,phageVPE25,10min
OG1RF,phageVPE25,20min
V649,LVX
V649,Untreated
V649,pGR-IS256
V649,pGR-tetM
AEA92696 (rpsR)
 -3.2 -3.08 -3.38 -4.37 -1.84 -2.04 1.61 1.53 0.92 1.42 2.03 1.64 1.07 1.51 -1.05 0.12 0.29 -0.86 -2.84 -0.62 -0.92 -2.27 -2.63 -0.92 -1.54 -0.62 -0.84 -1.55 0.8 -1.47 0.41 0.78 -0.47 0.12 -0.17 -0.12 0.01 -1.44 -2.01 -1.93 -1.61 0.06 -0.88 -1.22
AEA92741 (purR)
 -0.42 0.09 0.1 -2.39 0.74 1.08 0.7 0.91 0.11 0.35 0.27 0.86 0.12 0.81 -1.19 0.01 -0.14 -1.42 -2.51 -1.84 -1.94 -0.08 0.12 -0.82 0.34 0.51 0.51 0.38 0.26 0.4 -0.85 1.22 0.69 0.45 -0.92 -0.16 -0.07 -0.7 -0.48 -0.44 -1.08 -1.89 -2.19 -2.55
AEA92830 (rpiA)
 0.61 -0.03 0.26 -2.52 -0.62 0.9 0.55 0.55 0.1 -0.0 0.9 0.39 -0.13 0.57 0.44 0.89 -0.02 -1.53 -2.73 -2.55 -2.94 0.03 -0.33 -0.32 -0.15 -0.12 0.66 -0.14 -0.89 -0.42 -0.87 -0.29 0.12 0.06 -0.49 -0.13 0.05 -0.17 0.03 0.1 0.93 0.41 -0.2 -0.77
AEA92834 (tuf)
 -1.26 -0.73 -0.8 -4.01 -0.03 -0.46 0.23 0.2 -0.04 0.31 0.05 0.06 0.25 0.11 0.07 0.79 0.09 -0.48 -2.74 -0.0 -0.8 0.48 0.39 0.07 0.2 -0.07 0.27 0.11 0.4 -0.58 0.79 0.49 -0.17 0.1 -0.07 -0.08 0.11 0.71 0.57 0.32 -1.13 0.23 -0.25 -1.19
AEA92912 (fabI)
 -0.74 0.44 0.45 -1.36 -1.72 -0.28 0.17 0.08 0.45 0.38 0.81 0.18 0.38 0.29 -0.03 -0.69 0.14 -0.34 -3.44 -1.66 -4.15 -0.67 -0.69 -1.03 0.83 0.1 -0.72 0.15 1.36 0.82 -0.88 1.12 0.57 0.79 0.53 0.64 0.45 -1.18 -0.35 0.19 -0.78 -0.96 -1.4 -2.79
AEA92917 (efp)
 -1.36 -1.15 -0.95 0.67 -0.72 -0.54 0.57 0.66 0.56 0.99 0.58 0.78 0.14 0.71 -0.15 -0.71 0.41 -0.65 -3.08 -2.64 -0.91 0.74 0.58 -0.46 0.12 0.64 0.41 -0.31 0.87 -0.28 -0.67 0.87 0.41 0.1 -0.61 -0.12 -0.01 -0.23 -0.25 -0.21 -0.75 -0.95 -1.54 -1.99
AEA93024 (OG1RF_10337)
 -0.95 -0.8 -0.85 -3.25 -0.2 -0.27 -0.79 -0.59 -1.05 -1.5 -1.76 -0.75 -2.21 -0.64 0.51 1.68 1.02 -0.22 -1.59 0.29 -4.32 -0.13 -0.75 0.09 0.09 1.37 1.59 0.4 0.19 0.36 0.17 1.3 -0.6 -0.31 -0.74 -0.17 0.04 1.03 0.55 0.4 -0.29 -0.48 -1.62 -1.42
AEA93144 (OG1RF_10457)
 0.23 0.12 0.04 -3.55 0.63 1.36 -0.49 -0.38 -1.02 -0.46 -0.12 -0.29 -0.4 -0.19 1.07 -0.78 -0.53 -3.78 -2.81 -2.57 -2.41 -0.25 -0.43 -0.32 0.14 0.18 -0.46 0.54 0.37 0.16 -1.21 0.98 0.46 0.55 0.38 0.43 0.25 0.5 0.55 0.41 0.35 -0.35 0.12 -0.24
AEA93197 (OG1RF_10510)
 1.65 0.95 0.75 -1.07 -1.3 1.98 -1.56 -1.43 -1.22 -0.24 -0.5 -0.52 0.39 -0.49 0.26 -2.44 -2.17 -6.54 -4.02 -3.69 -1.12 -0.71 0.66 -3.49 -2.62 -4.04 -0.61 0.72 -1.61 1.84 -0.42 -1.06 0.58 -0.9 2.08 -0.32 -0.49 -2.21 -1.55 -1.48 1.38 -0.31 0.36 0.55
AEA93198 (OG1RF_10511)
 0.91 0.25 -0.05 -0.61 0.46 1.44 -1.29 -1.66 -1.01 -1.08 0.0 -1.53 -0.24 -1.35 0.64 -0.68 -0.75 -2.41 -3.51 -3.21 -1.15 0.12 0.71 -0.25 0.3 -0.26 -0.07 -0.09 -0.15 0.46 0.06 0.52 0.48 -0.82 1.28 -0.29 -0.76 0.29 0.73 0.65 0.99 -0.49 0.07 0.08
AEA93199 (OG1RF_10512)
 1.16 1.27 0.98 0.09 0.77 1.72 -3.47 -2.88 -2.81 -2.44 -0.85 -2.89 -1.38 -2.48 0.88 -1.33 -0.57 -1.93 -2.65 -2.36 -0.91 -0.09 0.27 -0.26 0.22 0.22 -0.15 -0.07 -0.4 0.55 0.1 0.51 0.41 -0.83 1.13 -0.36 -1.03 0.43 0.49 0.5 0.74 -0.53 -0.14 -0.3
AEA93204 (metK)
 -0.68 -0.22 -0.29 -3.05 -0.92 -0.2 -0.17 0.04 -0.32 -0.29 -0.66 -0.09 -0.83 0.05 1.45 1.7 0.57 -0.25 -2.37 -1.23 -0.81 -0.09 -0.57 -0.42 -0.06 0.73 0.46 0.55 0.71 0.93 0.27 1.03 0.78 -0.3 -1.5 -0.67 -0.36 -0.59 -0.4 -0.38 -0.31 -0.25 -0.48 -1.0
AEA93208 (OG1RF_10521)
 0.05 -0.2 -0.62 -2.51 0.33 1.05 0.94 0.87 0.42 1.08 1.7 0.93 2.19 1.09 0.4 0.1 -0.97 -2.07 -1.68 -1.31 -1.18 0.14 -0.37 -0.54 -0.53 -1.65 -1.04 -0.8 0.1 -0.99 -1.22 -0.34 -1.77 -0.18 -1.24 -0.91 -0.4 -0.46 -0.18 -0.46 -0.8 -0.59 -1.06 -2.01
AEA93209 (OG1RF_10522)
 -0.41 0.15 -0.13 -2.66 0.39 0.79 0.74 0.82 0.31 1.28 1.61 0.75 1.79 0.97 0.15 0.25 -0.6 -1.18 -1.08 -0.56 -0.8 0.27 -0.29 -0.48 -0.27 -1.57 -1.16 -0.62 -0.07 -0.57 -0.8 -0.21 -1.97 -0.59 -1.36 -1.12 -0.81 -0.04 0.19 -0.05 -0.84 -0.67 -0.73 -1.41
AEA93212 (OG1RF_10525)
 -0.23 1.01 1.21 -1.31 0.61 1.05 -1.66 -1.79 -1.71 -1.45 -1.08 -1.65 -1.38 -1.5 0.32 0.84 -0.22 -1.38 -2.1 -1.81 -1.71 0.35 0.71 -0.04 0.45 0.48 0.55 0.44 -0.4 1.36 -1.31 -0.05 0.19 -0.3 -0.28 -0.51 -0.47 0.28 0.64 0.37 0.71 -0.36 0.14 -0.06
AEA93243 (udk)
 -0.54 0.6 0.43 -3.4 0.46 0.82 0.48 0.5 0.22 0.54 1.21 0.7 0.03 0.43 -0.79 -0.42 0.38 -2.16 -3.6 -3.47 -2.2 0.23 0.09 -1.06 0.2 0.84 0.47 -0.4 -1.0 -1.15 -1.64 -0.61 -0.23 0.89 -0.56 0.57 0.72 -0.46 -0.19 -0.25 0.21 -0.2 -0.15 -0.66
AEA93330 (rplT)
 -0.77 -0.1 -0.16 -3.94 1.12 0.83 1.09 0.98 0.45 1.12 0.91 1.18 1.66 1.12 -1.35 -0.64 0.52 -0.42 -2.61 -0.71 0.17 -0.77 -0.32 -1.0 -1.54 -0.93 -0.97 -0.64 -0.12 -1.14 -1.79 0.04 -0.73 -0.19 -0.06 -0.74 -0.4 -0.07 -0.29 -0.29 -0.9 -0.21 -0.66 -1.61
AEA93344 (metG)
 -0.54 -0.25 -0.29 -0.21 -0.42 -0.16 0.15 0.25 0.02 -0.11 -0.22 0.11 -0.61 0.14 -0.34 -0.21 0.24 -0.09 -1.51 0.18 0.0 0.55 0.36 0.3 0.52 1.1 0.72 -0.04 0.09 -0.65 0.22 0.75 0.61 0.1 -0.9 -0.35 -0.08 0.14 -0.02 -0.06 -0.64 -0.74 -0.76 -1.05
AEA93361 (ppx2)
 0.67 0.0 -0.02 0.64 0.44 1.21 -0.5 -0.49 -0.41 -0.67 -0.16 -0.7 -0.54 -0.47 0.34 0.61 -0.03 -0.87 -2.52 -1.4 -0.15 0.22 -0.06 0.45 -0.03 0.29 0.55 0.33 0.54 0.93 0.26 0.4 0.23 -1.2 -0.87 -1.07 -1.14 0.28 0.23 0.2 -0.01 -0.6 -0.75 -0.92
AEA93392 (rpmA)
 -1.99 -0.51 -0.47 -4.55 -0.8 -0.75 0.84 0.81 0.41 1.05 1.56 0.96 0.87 0.98 -0.83 0.71 0.7 -0.61 -2.29 0.0 -0.64 -0.6 -0.65 -0.51 -0.88 -0.54 -0.59 -0.32 0.68 -0.88 -0.33 0.85 -0.01 0.27 0.05 -0.26 0.06 -0.52 -0.6 -0.68 -1.31 -0.28 -0.12 -1.01
AEA93631 (OG1RF_10944)
 0.08 0.18 0.38 -0.67 0.47 1.07 0.17 0.05 -0.32 0.2 0.91 0.16 -0.02 0.19 -0.14 0.24 -0.53 -1.54 -2.73 -1.83 -0.88 -0.16 -0.28 -0.59 -0.08 0.19 0.36 -0.29 -0.12 -0.12 -0.47 0.17 0.76 0.18 -0.57 0.21 0.26 -0.47 -0.39 -0.31 0.84 -0.35 -0.03 0.1
AEA93635 (rpmE)
 -1.58 -0.66 -0.54 -4.87 -1.4 -0.53 0.84 0.82 0.58 0.39 0.26 0.94 1.03 0.88 -1.7 -0.0 0.17 -1.6 -3.12 -2.51 -0.83 -1.46 -1.09 0.23 -0.01 0.47 -0.05 0.94 0.63 1.02 -1.56 0.42 -0.5 0.94 0.57 0.61 1.0 0.22 -0.12 -0.35 -2.18 -0.76 -2.02 -2.56
AEA93641 (luxS)
 0.06 -0.03 -0.05 0.54 -0.3 0.53 -0.5 -0.34 0.16 -0.45 -1.11 -0.62 -1.06 -0.47 1.77 1.61 0.74 -0.67 -1.98 -2.46 -0.58 -1.6 -1.48 -1.12 -0.39 0.95 0.1 0.16 0.81 0.24 0.03 0.94 0.5 -0.43 0.54 0.38 0.23 -1.16 -1.0 -0.31 -0.69 -1.32 -0.94 -1.12
AEA93648 (OG1RF_10961)
 -0.1 0.58 0.62 -1.41 0.31 1.07 -0.17 -0.15 -0.18 -0.07 0.09 0.09 -0.4 0.12 -0.39 -0.26 0.27 -1.43 -2.59 -1.03 -0.43 -0.61 -0.69 -0.26 0.12 0.01 0.24 -0.49 -0.06 0.02 -0.08 0.42 1.13 0.22 0.15 0.36 -0.1 0.12 0.3 0.15 -0.1 0.12 -0.03 -0.55
AEA93733 (OG1RF_11046)
 0.09 0.19 0.32 -0.25 1.2 1.33 -1.33 -0.97 -0.77 -1.14 -0.92 -1.25 -1.43 -1.11 -0.71 0.07 -0.27 -0.91 -1.19 0.24 -0.83 0.02 0.53 -0.89 0.03 0.75 -0.03 -0.04 -0.53 0.89 -0.63 0.1 -0.22 -0.62 0.1 -0.37 -0.53 0.4 1.04 0.84 1.47 -1.33 0.22 -1.0
AEA93734 (OG1RF_11047)
 0.65 -0.07 -0.16 -0.87 0.84 1.0 -1.18 -1.11 -0.79 -1.15 -1.47 -1.01 -1.33 -0.66 -0.85 -0.32 -0.51 -1.39 -2.01 -0.61 -0.93 -0.28 -0.08 -0.35 0.74 1.28 0.54 -0.14 -0.68 1.12 -1.22 -0.5 -0.53 -1.19 -0.07 -0.98 -0.73 0.83 1.36 1.29 1.64 -1.25 0.53 -0.66
AEA93888 (msrA)
 1.29 -0.98 -1.15 -3.34 1.01 1.81 -2.58 -3.06 -2.85 -1.92 4.37 -2.55 -1.22 -3.0 -4.64 -0.52 -3.09 -3.17 -2.7 -3.85 -1.76 -0.85 0.76 -0.59 -1.45 -1.52 -1.58 -3.38 -2.71 -3.05 -0.88 -2.66 -1.87 -2.4 -2.79 -2.3 -2.07 0.92 0.61 0.47 -2.99 -4.27 -2.34 -3.91
AEA93918 (ptsG)
 -0.11 -0.88 -1.03 -3.67 1.09 1.52 1.19 1.34 0.32 1.14 1.97 1.15 1.52 1.12 -2.62 -1.13 -2.67 -3.57 -3.0 -2.11 0.88 0.13 0.15 -1.07 -1.1 -1.15 0.28 -2.31 0.0 -2.04 0.03 0.5 -2.1 -0.5 -1.39 -0.9 -0.58 -0.19 -0.21 -0.37 -3.38 -2.29 -1.81 -2.7
AEA93988 (OG1RF_11301)
 2.09 -1.19 -1.2 -2.66 0.35 1.78 1.88 1.75 1.57 1.68 1.93 1.74 1.89 1.87 -2.2 -1.92 -4.27 -5.56 -1.62 -1.3 -4.09 -1.36 -1.12 -3.13 -2.73 -2.36 -1.65 -2.99 -2.43 -3.87 -2.66 -1.06 -2.31 -2.79 -3.38 -3.79 -2.94 -2.33 -2.25 -2.26 -2.2 -3.57 -1.8 -1.24
AEA94014 (ppaC)
 -0.24 -0.92 -0.87 -2.2 -1.0 -0.18 0.08 0.1 0.21 -0.34 -0.57 -0.03 -0.9 0.17 -0.07 1.22 0.57 0.34 -2.33 -0.02 -1.27 0.36 -0.1 -0.08 0.06 1.05 1.11 0.23 0.64 0.28 0.84 0.9 0.48 -0.04 -0.78 -0.07 -0.01 0.34 -0.1 -0.12 -1.6 -0.84 -1.66 -2.23
AEA94129 (mdlB)
 0.21 0.07 0.06 -2.5 -0.07 0.52 -1.09 -1.09 -0.79 1.07 2.06 -0.86 1.94 -1.08 -0.79 -1.26 -2.31 -2.56 -2.76 -0.86 -1.83 1.55 0.26 0.33 -0.07 -1.7 -0.45 -0.44 -0.36 0.24 -0.41 -0.27 -1.86 -0.63 0.49 0.13 -0.44 0.61 0.64 0.23 -0.43 -1.84 0.68 -1.02
AEA94130 (mdlA)
 0.33 -0.1 -0.31 -1.13 -0.14 0.79 -1.15 -1.16 -0.68 0.72 2.22 -1.1 1.95 -1.08 -0.61 -1.05 -2.81 -3.73 -3.41 -2.04 -1.56 1.46 0.09 0.58 0.14 -1.46 -0.08 -0.43 -0.67 0.19 -0.67 -0.45 -1.28 -0.66 0.39 -0.32 -0.44 0.55 0.48 0.22 0.25 -1.47 0.72 -0.86
AEA94131 (yneF)
 -0.88 -0.33 -0.45 -5.62 -1.52 -0.64 1.58 1.74 1.55 0.91 0.99 1.92 1.26 1.69 -1.11 -2.91 -0.16 -1.86 -3.57 -1.66 -2.48 0.05 0.03 -1.21 -0.67 -1.2 -0.54 -0.94 -0.54 -1.22 -0.59 -0.05 0.39 -0.02 -0.04 -0.43 -0.18 -1.1 -0.62 -0.76 -0.47 -1.32 -0.92 -1.85
AEA94136 (tyrS2)
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AEA94144 (cap4C)
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AEA94171 (metG2)
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AEA94251 (rplS)
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AEA94342 (OG1RF_11655)
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AEA94373 (OG1RF_11686)
 0.97 0.17 0.08 -1.75 0.45 1.34 -0.51 -0.64 -0.27 -0.16 0.19 -0.21 -0.02 -0.25 0.22 0.58 0.3 -0.98 -2.23 -1.22 -0.54 -0.22 0.14 -0.83 -0.03 0.27 0.36 0.21 -0.24 0.87 0.28 0.28 -0.5 -0.75 -0.65 -0.5 -0.36 0.04 0.1 0.02 0.64 -0.51 0.08 -0.12
AEA94415 (OG1RF_11728)
 -0.06 0.03 -0.12 -3.4 1.22 1.3 1.02 0.86 0.96 1.01 1.14 1.46 0.99 1.27 -0.83 -0.0 0.98 -2.12 -1.81 -0.74 -2.46 -0.7 0.06 -1.17 -0.59 -0.16 -0.73 -1.01 -1.65 -1.11 -1.81 -1.82 -1.17 -0.21 -0.37 0.01 -0.15 -0.59 -0.7 -0.53 -0.64 -0.77 -0.91 -1.3
AEA94455 (trpS)
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AEA94484 (pbuX)
 0.32 -0.15 -0.16 -5.49 1.04 1.61 -0.84 -0.93 -1.76 -0.6 -0.63 -0.68 -0.8 -0.93 -2.05 0.46 -0.07 -4.29 -2.57 -2.84 -0.78 -1.98 -1.63 -0.31 0.56 -0.15 -0.36 -0.34 1.09 0.4 -0.68 1.58 0.93 1.12 -0.17 0.3 0.59 0.72 0.88 0.79 -0.47 -1.19 -0.46 -0.5
AEA94485 (xpt)
 0.91 -0.15 -0.11 -4.29 1.05 1.71 -1.17 -0.78 -1.81 -0.5 -0.58 -1.31 -0.67 -0.77 -2.1 -0.05 0.14 -4.67 -2.88 -2.82 -0.5 -0.7 -0.3 -0.35 0.58 -0.28 -0.52 -0.71 1.07 -0.16 -1.01 0.95 1.04 1.04 0.08 0.28 0.68 0.42 0.6 0.48 0.06 -0.84 -0.02 0.24
AEA94492 (asnS)
 -0.45 0.64 0.57 -2.28 0.08 0.15 -0.33 -0.25 0.17 -0.14 -0.03 -0.37 -0.54 -0.34 -0.22 0.03 0.53 -0.4 -2.46 -0.47 -1.05 0.04 0.02 0.02 0.66 0.75 0.41 0.08 0.34 0.16 -0.17 0.91 0.52 -0.29 -0.49 -0.23 -0.28 0.38 0.39 0.27 -0.17 -0.48 -0.13 -0.63
AEA94505 (proS)
 -0.8 0.31 0.24 -2.46 0.02 -0.14 0.04 0.05 0.19 0.02 -0.19 -0.05 -0.76 0.0 -0.14 0.04 0.08 -0.08 -1.94 0.15 -0.61 0.1 -0.01 0.39 0.44 0.29 0.1 -0.01 0.5 0.03 -0.03 0.9 0.42 -0.03 0.14 0.38 0.07 -0.06 0.07 -0.08 -0.09 -0.74 -0.18 -0.23
AEA94517 (frr)
 -0.92 -0.4 -0.56 -1.22 -0.15 -0.24 -0.13 -0.17 -0.34 0.1 0.55 -0.29 -0.75 -0.27 -0.64 0.68 -0.32 -0.22 -1.81 0.07 0.25 1.15 1.27 -0.54 -0.61 0.25 -0.03 0.01 0.69 -0.46 0.58 0.78 0.68 0.84 -0.64 0.13 0.4 -0.36 -0.81 -0.77 -0.38 -0.08 -0.55 -0.76
AEA94519 (tsf)
 -0.9 -0.02 -0.16 -1.08 0.23 0.38 0.38 0.4 0.22 0.67 1.12 0.28 -0.17 0.32 -0.35 -0.47 0.15 -0.51 -2.35 -0.48 0.45 0.31 0.37 -0.55 -0.58 -0.16 -0.3 -0.36 0.1 -0.82 -0.12 0.25 -0.07 0.6 -0.06 0.23 0.34 0.33 0.08 0.04 -0.51 -0.25 -0.53 -0.78
AEA94520 (rpsB)
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AEA94526 (glyS)
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AEA94527 (glyQ)
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AEA94542 (OG1RF_11855)
 -0.7 -1.11 -0.92 -3.16 -0.92 -0.28 0.06 0.07 0.78 0.18 0.21 0.07 -0.11 -0.06 -0.17 1.5 -0.21 -0.32 -1.23 -0.25 -1.77 0.14 -0.89 0.05 0.26 -0.28 -0.24 -0.05 0.4 0.4 0.79 0.82 0.02 -0.32 -0.06 0.45 0.02 0.42 0.45 0.24 -0.39 -0.4 -0.12 -0.28
AEA94603 (metQ)
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AEA94625 (OG1RF_11938)
 -1.81 -1.58 -1.6 -4.1 -0.24 -0.58 -0.09 0.04 -0.59 -0.42 -0.19 -0.1 -0.5 -0.09 -1.62 0.62 1.43 0.33 -1.83 0.47 -3.61 -3.36 -3.15 0.68 0.91 1.44 0.98 0.09 0.47 0.36 -0.38 0.44 0.03 0.99 -0.01 0.57 0.61 0.51 -0.02 -0.38 -0.78 0.66 -1.85 -2.19
AEA94653 (rihB)
 -1.24 -1.58 -1.51 -3.54 -0.99 -0.57 -0.28 -0.24 -0.45 -0.43 -0.24 -0.38 -0.43 -0.37 0.35 1.84 0.58 -0.92 -3.02 -0.68 -2.49 0.33 0.32 0.33 0.09 0.7 0.37 0.31 1.05 0.24 0.52 1.34 -0.3 0.14 -0.23 -0.07 0.09 0.64 0.01 -0.35 -1.37 0.32 0.22 -1.34
AEA94654 (OG1RF_11967)
 -1.82 -1.17 -1.13 -3.37 -0.79 -0.55 0.08 0.19 0.08 0.13 0.17 0.15 0.05 0.13 0.58 1.82 0.94 -0.44 -2.16 0.03 -2.45 -0.87 -0.98 -0.02 -0.41 0.37 -0.02 -0.43 1.06 -0.35 0.7 1.4 -0.23 0.14 -0.22 -0.03 0.12 0.48 -0.09 -0.34 -1.62 0.12 -0.07 -1.64
AEA94665 (OG1RF_11978)
 -2.48 -2.64 -2.82 - - -0.91 2.09 2.16 2.28 1.1 1.72 2.37 1.7 2.16 -4.22 - -6.71 -6.99 - - -2.66 -4.17 -5.15 -0.59 -1.32 -1.39 0.22 -3.51 -0.7 -2.35 0.87 -0.09 -2.99 -5.3 -5.85 - -4.96 0.47 0.77 0.21 - -6.1 -6.03 -7.15
AEA94718 (OG1RF_12031)
 -1.36 -1.01 -1.48 -4.78 0.56 0.38 -0.77 -0.74 -1.4 -0.79 -0.37 -0.64 -0.13 -0.55 -1.88 -0.87 1.03 -1.09 -2.7 -1.57 -3.55 0.88 1.1 -0.8 0.41 0.5 0.76 0.18 1.55 0.07 -0.0 1.5 0.08 1.05 0.87 0.85 1.04 -0.17 -0.22 -0.04 -1.74 -0.7 -1.69 -2.34
AEA94724 (cutC)
 0.02 0.4 0.54 -1.25 -0.13 0.8 -0.28 -0.2 -0.28 -0.48 -0.32 -0.25 -0.45 -0.15 0.02 0.57 1.04 0.15 -1.69 -0.97 -1.35 -0.13 -0.09 -0.57 -0.01 0.62 0.7 0.27 0.55 0.54 -0.32 0.61 -0.05 0.0 -0.15 -0.1 -0.05 -0.07 0.04 0.08 0.1 -0.74 -0.79 -0.88
AEA94767 (rplL2)
 -2.94 -2.26 -2.56 -3.99 -0.47 -1.41 1.44 1.45 1.06 1.57 0.85 1.52 1.28 1.37 -0.38 -0.3 1.1 -0.03 -3.01 0.49 -1.36 -1.28 -1.59 -1.22 -2.02 -0.91 -1.49 -1.18 0.51 -1.49 -0.32 0.73 -0.11 0.53 0.16 0.07 0.48 -1.57 -2.33 -2.33 -1.88 0.1 -1.32 -2.73
AEA94768 (rplJ)
 -1.69 -1.97 -2.15 -3.67 -0.8 -1.12 0.25 0.35 -0.09 0.41 -0.11 0.18 0.29 0.17 -0.77 0.44 0.7 -0.79 -3.64 0.03 -1.59 -0.4 -0.32 1.19 0.36 0.98 0.83 0.18 0.68 -0.14 0.15 0.83 -0.47 0.71 0.45 0.27 0.68 0.37 -0.1 0.01 -1.32 0.32 -1.25 -2.67
AEA94769 (rplA)
 -1.83 -1.05 -1.08 -2.78 -0.41 -0.69 0.87 0.83 0.6 1.77 0.69 0.79 0.8 0.76 -0.6 0.78 0.0 -1.65 -4.2 -1.57 -0.23 -1.04 -0.7 -0.2 -0.6 0.28 -0.18 -1.08 0.74 -1.26 -0.03 0.76 -0.01 0.85 0.19 0.27 0.61 -0.02 -0.5 -0.62 -1.69 -0.18 -0.83 -1.85
AEA94786 (xthA)
 -0.02 -0.35 -0.39 -1.24 0.84 0.93 -0.5 -0.56 -0.37 -0.74 0.12 -0.41 -0.63 -0.57 0.48 -0.16 -0.26 -0.49 -1.81 -1.49 -0.76 -0.12 -0.22 -0.28 0.04 0.84 0.39 0.42 0.14 1.28 0.03 0.45 0.97 -0.33 0.17 0.17 -0.04 0.65 0.19 0.16 -0.03 -0.8 -0.71 -1.26
AEA94787 (OG1RF_12100)
 0.03 -0.05 -0.24 0.06 0.76 1.01 -0.72 -0.45 0.11 -0.3 0.42 -0.35 -0.1 -0.27 0.09 -0.17 -0.1 -0.23 -0.76 0.06 -0.46 -1.07 -0.75 -0.66 -0.35 0.25 -0.05 -0.21 0.22 0.62 0.03 0.73 0.85 -0.26 0.45 0.47 0.01 0.18 0.01 0.12 0.11 -0.93 -0.56 -1.24
AEA94971 (OG1RF_12284)
 -0.02 0.14 0.24 -3.74 0.5 0.41 -0.45 -0.59 -1.19 -0.74 -0.15 -0.5 -0.48 -0.39 0.63 -0.15 -0.44 -3.65 -2.91 -2.76 -3.73 0.84 0.31 0.15 0.04 -0.54 -0.78 0.52 -0.19 -0.37 -1.27 0.98 0.56 0.29 -0.29 0.06 0.24 0.51 0.74 0.73 1.05 0.96 0.36 0.1
AEA95027 (rpsD)
 -1.63 -0.39 -0.38 -5.66 -0.12 -0.05 0.54 0.56 0.3 0.71 1.39 0.59 0.92 0.59 -1.15 0.59 -0.4 -2.37 -4.67 -2.14 -0.65 0.36 0.71 -0.05 -0.5 0.19 -0.17 -0.03 0.93 -0.75 -1.29 0.82 -0.55 0.32 -0.51 -0.21 0.21 0.47 0.16 0.09 -1.06 0.25 -0.79 -1.42
AEA95077 (rpoZ)
 -1.12 -0.19 -0.09 -4.62 -0.06 -0.31 1.02 0.85 1.0 0.94 0.58 1.2 0.34 1.28 -2.41 -0.61 0.44 -0.49 -2.13 -1.98 -1.33 -0.94 -1.44 0.25 0.62 0.83 0.32 -0.3 0.08 -0.02 -0.62 0.74 0.8 0.1 -0.46 -0.52 -0.38 0.18 -0.06 -0.32 -1.8 -1.65 -1.6 -1.97
AEA95097 (pgsA)
 -0.43 0.17 0.26 0.19 -0.04 -0.08 0.37 0.36 0.44 0.34 1.44 0.29 0.57 0.39 -0.43 1.09 -2.03 -3.67 -3.75 -3.28 -2.28 -0.16 -0.4 0.02 0.09 -0.78 -0.48 -0.82 0.97 -0.89 -1.12 0.32 0.39 0.2 -0.35 -0.01 -0.0 -0.58 0.12 0.03 0.81 0.22 -0.06 -0.48
AEA95107 (mscL)
 -1.62 -0.62 -0.64 -0.93 -1.47 -1.62 0.44 0.41 -0.43 0.43 0.21 0.44 0.76 0.42 -1.56 -0.1 -1.34 -3.35 -2.91 -3.14 -2.79 -0.94 -1.16 -0.39 1.53 -0.22 -0.38 0.56 1.61 1.3 -0.38 1.41 0.45 0.48 0.01 0.52 0.19 -0.75 0.51 0.41 -0.32 -0.48 -0.9 -1.98
AEA95110 (treR)
 1.01 0.15 0.43 -2.25 0.68 1.01 0.6 0.42 0.78 0.41 0.38 0.3 0.16 0.64 -0.63 -0.1 -0.91 -2.1 -1.68 -1.74 -2.16 0.78 0.56 -0.41 -0.02 -1.12 0.45 0.1 -0.56 0.86 -0.29 0.23 0.33 -0.28 -1.01 -0.66 -0.67 -1.25 -0.27 -0.37 0.42 -0.47 -0.6 -0.92
AEA95124 (OG1RF_12437)
 -0.03 0.4 0.42 -0.58 0.08 0.27 0.27 0.37 0.25 -0.0 0.26 0.16 -0.11 0.26 -0.1 0.27 -0.33 -1.47 -3.32 -2.26 -1.05 0.28 -0.04 0.27 0.13 0.11 0.43 -0.3 0.61 -0.52 -0.73 0.04 0.46 0.32 -0.08 -0.06 0.11 -0.31 -0.15 -0.13 1.02 0.04 -0.52 -0.66
AEA95173 (rpsI3)
 -1.25 0.38 0.47 -2.89 0.36 -0.14 0.54 0.51 0.12 0.6 0.95 0.45 1.07 0.51 -0.26 1.17 0.01 -1.22 -2.93 -1.23 -0.46 0.04 -0.14 -0.24 0.08 0.36 0.3 -0.4 0.67 -0.77 -0.31 0.78 -0.41 0.39 -0.15 -0.3 0.17 -0.49 -0.62 -0.71 -0.95 -0.68 -1.55 -1.88
AEA95179 (rpoC)
 -0.69 0.07 -0.01 -3.35 0.47 -0.16 0.29 0.29 -0.07 0.63 0.1 0.21 0.23 0.25 -0.36 0.65 -0.95 -2.03 -2.69 -0.49 -1.48 0.48 0.59 -0.2 -0.57 -0.04 -0.13 -0.08 0.65 -0.96 0.54 0.78 -0.16 0.09 -0.91 -0.34 -0.06 1.26 0.78 0.72 -0.77 -0.56 -0.4 -0.89
AEA95180 (rpoB)
 -0.41 -0.06 -0.1 -1.52 0.13 -0.13 0.31 0.31 -0.12 0.51 -0.08 0.25 0.34 0.3 -0.67 0.01 -0.9 -1.99 -2.78 -0.69 0.09 0.66 0.88 -0.0 -0.13 0.16 0.3 0.16 0.33 -1.02 0.24 0.63 -0.05 -0.09 -1.12 -0.59 -0.21 1.18 0.74 0.63 -0.54 -0.59 -0.46 -0.83
AEA95196 (OG1RF_12509)
 -1.62 -0.06 -0.08 -6.64 -1.34 -0.92 -0.96 -0.66 -1.23 -1.36 -1.95 -0.98 -1.45 -0.84 -0.06 0.95 1.34 0.54 -1.83 0.29 -3.16 0.23 0.17 0.63 0.86 1.5 1.93 0.41 -0.33 0.83 -0.22 0.28 -0.56 -0.37 -0.52 0.01 0.02 0.77 0.12 -0.18 -0.93 -0.55 -0.79 -0.33
AEA95197 (ndh3)
 -1.63 -0.49 -0.53 -2.92 0.03 0.01 -0.11 0.02 -0.82 -0.34 0.41 -0.05 -0.89 0.0 -0.02 0.74 0.79 -0.88 -2.59 -0.55 -2.16 -0.19 0.16 -0.81 -0.38 0.84 0.88 0.43 0.85 0.03 0.06 1.58 0.44 0.79 -0.08 0.37 0.59 0.4 -0.15 -0.25 -0.54 -0.56 -1.63 -2.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.