1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
0.02% arabinose,A1552
0.5mM indole,N16961
37C,C6706
arabinose-,A1552
E-exponential,5uM AI-2,C6706
E-exponential,5uM CAI-1,C6706
E-exponential,5uM DPO,C6706
E-exponential,Water,C6706
empty Tn
E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706
LB(2% NaCl),30C,N16961
LB,C7258
Log,0.2% L-arabinose,C6706
Methanol,N16961
O395
Polymyxin,C6706
Polymyxin,VC1639
riboflavin-,N16961
riboflavin+,N16961
TnqstR
TntfoY
TntoX-strep
Water,Rich,N16961
KNA48019 (VCV51_030116)
 0.59 0.44 0.17 0.27 0.41 0.36 0.43 0.37 0.58 0.45 0.94 0.81 0.47 0.44 0.66 0.83 1.0 0.37 0.43 0.52 0.71 0.72 0.59
KNA49512 (VCV51_030313)
 0.21 0.16 0.11 0.15 0.97 0.76 0.93 0.9 0.23 0.26 0.62 0.62 0.27 0.18 1.0 0.59 0.59 0.74 0.5 0.24 0.25 0.28 0.33
KNA49513 (VCV51_030314)
 0.01 0.01 0.0 0.01 0.17 0.12 0.15 0.11 0.02 0.06 0.3 0.7 0.05 0.01 1.0 0.04 0.05 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02
KNA49655 (VCV51_030211)
 0.13 0.11 0.13 0.12 0.34 0.22 0.39 0.38 0.14 0.2 1.0 0.5 0.15 0.13 0.58 0.22 0.32 0.59 0.62 0.16 0.14 0.19 0.29
KNA49656 (VCV51_030212)
 0.02 0.02 0.01 0.01 0.63 0.27 0.51 0.68 0.02 0.03 1.0 0.17 0.02 0.02 0.12 0.05 0.05 0.05 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03
KNA52473 (VCV51_030135)
 0.11 0.14 0.05 0.08 0.81 0.4 0.62 0.86 0.16 0.15 1.0 0.2 0.14 0.14 0.76 0.3 0.34 0.69 0.31 0.19 0.18 0.2 0.19
KNA52474 (VCV51_030136)
 0.01 0.04 0.01 0.01 0.86 0.29 0.4 1.0 0.03 0.01 0.76 0.07 0.01 0.04 0.83 0.03 0.03 0.26 0.07 0.05 0.03 0.05 0.01
KNA52475 (VCV51_030137)
 0.04 0.04 0.02 0.02 0.31 0.13 0.19 0.31 0.04 0.06 0.65 0.11 0.05 0.05 1.0 0.08 0.1 0.33 0.15 0.04 0.04 0.05 0.06
KNA52476 (VCV51_030138)
 0.03 0.05 0.02 0.03 0.63 0.27 0.41 0.69 0.04 0.08 0.74 0.12 0.06 0.05 1.0 0.11 0.12 0.34 0.16 0.05 0.05 0.06 0.04
KNA52477 (VCV51_030139)
 0.08 0.04 0.05 0.05 0.38 0.16 0.26 0.4 0.06 0.1 0.37 0.19 0.07 0.04 1.0 0.16 0.18 0.28 0.22 0.06 0.06 0.06 0.1
KNA52731 (VCV51_031545)
 0.09 0.03 0.41 0.09 0.11 0.06 0.06 0.1 0.08 0.06 0.01 1.0 0.06 0.02 0.97 0.05 0.06 0.12 0.11 0.07 0.07 0.06 0.22
KNA53592 (VCV51_030070)
 0.1 0.04 0.06 0.14 0.38 0.29 0.39 0.35 0.24 0.06 0.28 0.24 0.05 0.04 1.0 0.17 0.17 0.16 0.11 0.18 0.12 0.17 0.31
KNA54650 (VCV51_033221)
 0.17 0.65 0.04 0.08 0.03 0.04 0.04 0.03 0.42 0.21 0.55 0.35 0.24 0.52 0.37 0.13 0.1 0.08 0.1 0.26 1.0 0.59 0.29
KNA54892 (VCV51_033127)
 0.17 0.88 0.27 0.17 0.5 0.41 0.42 0.45 0.35 0.24 0.8 0.53 0.31 1.0 0.56 0.48 0.59 0.63 0.61 0.34 0.27 0.33 0.3
KNA54960 (VCV51_031748)
 0.35 0.44 0.21 0.28 0.41 0.31 0.31 0.36 0.13 0.32 1.0 0.21 0.47 0.38 0.98 0.15 0.21 0.51 0.47 0.22 0.13 0.16 0.72
KNA55028 (VCV51_031712)
 0.43 0.88 0.33 0.29 0.71 0.68 0.7 0.69 0.62 0.46 0.81 0.73 0.45 0.85 0.69 0.79 0.65 0.95 1.0 0.58 0.67 0.61 0.7
KNA55047 (VCV51_033196)
 0.47 0.65 0.17 0.43 0.56 0.56 0.62 0.57 0.22 0.28 1.0 0.28 0.47 0.65 0.44 0.53 0.41 0.59 0.51 0.26 0.39 0.2 0.6
KNA55641 (VCV51_030958)
 0.85 0.58 0.07 0.6 0.35 0.34 0.42 0.31 0.72 0.34 1.0 0.73 0.63 0.56 0.7 0.81 0.89 0.53 0.47 0.62 0.34 0.64 0.45
KNA55656 (VCV51_033019)
 0.04 0.09 0.02 0.02 0.07 0.07 0.06 0.07 0.08 0.16 1.0 0.9 0.38 0.11 0.17 0.05 0.04 0.0 0.01 0.04 0.02 0.03 0.07
KNA55701 (VCV51_033028)
 0.41 0.26 0.13 0.35 0.27 0.22 0.26 0.27 0.47 0.3 0.31 0.53 0.21 0.23 1.0 0.27 0.23 0.43 0.48 0.4 0.4 0.42 0.57
KNA56005 (VCV51_033003)
 0.12 0.16 0.09 0.09 0.21 0.25 0.27 0.22 0.13 0.27 0.32 0.55 0.19 0.12 1.0 0.2 0.13 0.11 0.11 0.12 0.11 0.14 0.16
KNA56300 (VCV51_030620)
 0.06 0.42 0.02 0.08 0.02 0.02 0.02 0.01 0.07 0.13 1.0 0.28 0.07 0.39 0.01 0.08 0.08 0.03 0.03 0.06 0.04 0.05 0.06
KNA56301 (VCV51_030621)
 0.03 0.57 0.02 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.06 1.0 0.29 0.03 0.53 0.01 0.06 0.07 0.04 0.04 0.02 0.02 0.02 0.04
KNA56884 (VCV51_030519)
 0.26 0.17 0.13 0.2 1.0 0.57 0.94 0.65 0.26 0.2 0.37 0.37 0.17 0.15 0.33 0.38 0.42 0.53 0.53 0.27 0.27 0.32 0.29
KNA56891 (VCV51_030526)
 0.35 0.06 0.24 0.27 0.82 0.6 0.7 0.64 0.2 0.29 0.16 0.3 0.2 0.06 0.26 0.59 0.7 1.0 0.82 0.19 0.19 0.23 0.59
KNA57842 (VCV51_032812)
 0.23 0.29 0.1 0.16 0.19 0.16 0.17 0.18 0.26 0.17 0.39 1.0 0.14 0.38 0.09 0.29 0.25 0.54 0.57 0.22 0.24 0.26 0.36
KNA57843 (VCV51_032813)
 0.15 0.3 0.07 0.12 0.23 0.18 0.15 0.28 0.29 0.1 0.47 1.0 0.07 0.45 0.04 0.29 0.22 0.41 0.39 0.26 0.27 0.25 0.23
KNA57844 (VCV51_032814)
 0.05 0.19 0.03 0.03 0.52 0.32 0.2 0.62 0.1 0.06 0.52 1.0 0.04 0.31 0.0 0.15 0.1 0.21 0.2 0.09 0.11 0.11 0.24
KNA57845 (VCV51_032815)
 0.03 0.07 0.01 0.02 0.25 0.16 0.09 0.31 0.04 0.04 0.43 1.0 0.02 0.11 0.0 0.14 0.09 0.09 0.09 0.03 0.03 0.04 0.22
KNA57850 (VCV51_032774)
 0.14 0.07 0.09 0.1 0.03 0.03 0.03 0.03 0.3 0.12 1.0 0.38 0.12 0.18 0.2 0.42 0.18 0.05 0.05 0.25 0.19 0.3 0.3
KNA57851 (VCV51_032775)
 0.11 0.07 0.06 0.08 0.03 0.03 0.03 0.03 0.16 0.09 1.0 0.35 0.1 0.14 0.18 0.35 0.15 0.07 0.07 0.15 0.13 0.17 0.17
KNA57852 (VCV51_032776)
 0.25 0.11 0.18 0.21 0.13 0.13 0.13 0.12 0.32 0.17 1.0 0.46 0.17 0.21 0.2 0.66 0.38 0.15 0.17 0.32 0.3 0.32 0.35
KNA58561 (VCV51_032728)
 0.58 0.11 0.24 0.31 0.24 0.22 0.2 0.23 0.5 0.27 1.0 0.41 0.22 0.13 0.3 0.43 0.35 0.27 0.31 0.4 0.46 0.82 0.49
KNA58617 (VCV51_031094)
 0.0 0.57 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.74 1.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.14 0.0 0.0 0.0
KNA59814 (VCV51_032497)
 0.05 0.1 0.02 0.04 0.22 0.19 0.24 0.17 0.06 0.24 0.17 0.25 0.23 0.1 1.0 0.15 0.22 0.07 0.08 0.07 0.06 0.05 0.16
KNA59826 (VCV51_032503)
 1.0 0.0 0.16 0.49 0.48 0.37 0.35 0.54 0.0 0.04 0.92 0.0 0.04 0.0 0.18 0.0 0.0 0.19 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
KNA60692 (VCV51_032131)
 0.62 0.38 0.11 0.54 0.55 0.58 0.62 0.52 0.51 0.83 1.0 0.58 0.51 0.44 0.85 0.25 0.31 0.8 0.63 0.57 0.55 0.61 0.31
KNA60719 (VCV51_032158)
 0.25 0.12 0.16 0.29 0.33 0.29 0.36 0.27 0.41 0.17 0.72 0.38 0.19 0.12 1.0 0.17 0.3 0.31 0.32 0.41 0.4 0.39 0.22
KNA60720 (VCV51_032159)
 0.09 0.04 0.04 0.08 0.19 0.11 0.18 0.16 0.09 0.14 1.0 0.49 0.14 0.04 0.57 0.1 0.15 0.22 0.23 0.1 0.08 0.09 0.08
KNA60721 (VCV51_032160)
 0.11 0.06 0.06 0.08 0.29 0.16 0.24 0.23 0.12 0.14 1.0 0.49 0.13 0.07 0.55 0.13 0.2 0.23 0.23 0.15 0.12 0.13 0.16
KNA60722 (VCV51_032161)
 0.12 0.03 0.06 0.11 0.25 0.15 0.21 0.2 0.13 0.1 1.0 0.48 0.08 0.04 0.6 0.07 0.11 0.16 0.15 0.12 0.11 0.13 0.16
KNA60835 (VCV51_032025)
 0.25 0.05 0.09 0.22 1.0 0.69 0.79 0.86 0.5 0.11 0.1 0.18 0.09 0.06 0.2 0.15 0.26 0.15 0.08 0.33 0.29 0.38 0.21
KNA60900 (VCV51_031874)
 0.19 0.0 0.33 0.0 0.32 0.27 0.65 0.39 0.0 0.11 1.0 0.0 0.26 0.0 0.31 0.0 0.0 0.32 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0
KNA60951 (VCV51_031926)
 0.25 0.26 0.13 0.23 0.96 0.54 0.88 1.0 0.36 0.24 0.63 0.34 0.15 0.27 0.87 0.21 0.3 0.25 0.24 0.36 0.4 0.37 0.28
KNA60978 (VCV51_031953)
 0.08 0.02 0.02 0.07 0.04 0.04 0.04 0.03 0.1 0.15 0.5 0.08 0.07 0.02 1.0 0.03 0.05 0.04 0.04 0.1 0.13 0.11 0.17
KNA60980 (VCV51_031955)
 0.07 0.09 0.03 0.05 0.06 0.06 0.06 0.05 0.1 0.1 0.84 0.12 0.06 0.1 1.0 0.08 0.1 0.25 0.28 0.09 0.09 0.11 0.12
KNA60981 (VCV51_031956)
 0.14 0.09 0.23 0.12 0.12 0.15 0.15 0.1 0.13 0.51 0.67 0.28 0.28 0.08 1.0 0.15 0.18 0.18 0.19 0.14 0.14 0.17 0.33
KNA60992 (NapF)
 0.33 0.05 0.06 0.32 0.07 0.12 0.12 0.08 0.74 0.08 0.52 0.51 0.06 0.05 1.0 0.05 0.04 0.09 0.09 0.41 0.93 0.72 0.1
KNA60993 (VCV51_031968)
 0.39 0.15 0.04 0.27 0.1 0.11 0.12 0.09 0.99 0.08 0.49 0.52 0.07 0.17 0.52 0.11 0.1 0.14 0.13 0.52 1.0 0.86 0.05
KNA60994 (VCV51_031969)
 0.22 0.02 0.04 0.21 0.07 0.13 0.11 0.09 0.37 0.09 1.0 0.51 0.06 0.02 0.45 0.11 0.06 0.07 0.08 0.19 0.39 0.28 0.07
KNA60995 (VCV51_031970)
 0.16 0.03 0.03 0.18 0.06 0.1 0.09 0.08 0.21 0.06 1.0 0.3 0.05 0.03 0.3 0.05 0.06 0.06 0.07 0.15 0.25 0.19 0.03
KNA60996 (VCV51_031971)
 0.28 0.02 0.07 0.38 0.09 0.15 0.13 0.1 0.3 0.08 1.0 0.36 0.06 0.02 0.51 0.15 0.15 0.09 0.11 0.24 0.3 0.23 0.17
KNA61016 (VCV51_031991)
 0.1 0.0 0.0 0.21 0.55 0.25 0.14 0.25 0.0 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)