Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	0.02% arabinose,A1552	0.5mM indole,N16961	37C,C6706	arabinose-,A1552	E-exponential,5uM AI-2,C6706	E-exponential,5uM CAI-1,C6706	E-exponential,5uM DPO,C6706	E-exponential,Water,C6706	empty Tn	E-stationary,0.2% L-arabinose,C6706	LB(2% NaCl),30C,N16961	LB,C7258	Log,0.2% L-arabinose,C6706	Methanol,N16961	O395	Polymyxin,C6706	Polymyxin,VC1639	riboflavin-,N16961	riboflavin+,N16961	TnqstR	TntfoY	TntoX-strep	Water,Rich,N16961
KNA46830 (VCV51_033900)	0.35	0.39	0.14	0.24	0.23	0.26	0.29	0.22	0.34	0.45	0.3	0.77	0.65	0.39	0.28	1.0	0.7	0.25	0.29	0.38	0.26	0.33	0.67
KNA49648 (VCV51_030204)	0.33	0.1	0.5	0.14	0.98	0.89	0.94	1.0	0.1	0.42	0.16	0.49	0.39	0.07	0.12	0.85	0.78	0.11	0.13	0.12	0.12	0.13	0.54
KNA49649 (VCV51_030205)	0.26	0.07	0.41	0.12	0.96	0.92	1.0	0.98	0.2	0.35	0.25	0.62	0.36	0.05	0.13	0.38	0.39	0.07	0.1	0.17	0.16	0.22	0.34
KNA50293 (VCV51_031449)	0.18	0.14	0.09	0.07	0.61	0.62	0.65	0.62	0.08	0.67	0.19	0.49	0.82	0.13	0.11	0.73	0.65	0.1	0.1	0.08	0.08	0.15	1.0
KNA50304 (VCV51_033683)	0.3	0.28	0.18	0.2	0.46	0.41	0.42	0.44	0.14	0.61	0.5	1.0	0.89	0.22	0.47	0.73	0.65	0.18	0.19	0.14	0.14	0.15	0.77
KNA51141 (VCV51_033634)	0.23	0.2	0.24	0.18	0.15	0.16	0.16	0.13	0.26	0.25	0.16	0.36	0.3	0.18	0.16	1.0	0.64	0.2	0.24	0.3	0.49	0.26	0.71
KNA51160 (VCV51_033618)	0.61	0.18	0.25	0.28	0.53	0.57	0.57	0.5	0.28	0.67	0.22	0.5	0.57	0.15	0.19	1.0	0.66	0.2	0.2	0.31	0.36	0.48	0.81
KNA51161 (VCV51_033619)	0.62	0.16	0.23	0.32	0.28	0.31	0.27	0.23	0.51	0.54	0.16	0.7	0.41	0.16	0.13	0.89	0.77	0.35	0.37	0.51	0.6	0.66	1.0
KNA51162 (VCV51_031675)	0.69	0.17	0.17	0.61	0.2	0.25	0.26	0.18	0.63	0.71	0.16	0.47	0.45	0.19	0.13	1.0	0.73	0.36	0.34	0.55	0.48	0.54	0.65
KNA51168 (VCV51_031670)	0.27	0.35	0.16	0.18	0.51	0.53	0.56	0.46	0.41	0.7	0.47	0.79	0.82	0.29	0.9	0.9	0.48	0.26	0.33	0.36	0.29	0.41	1.0
KNA51653 (VCV51_031507)	0.28	0.07	0.38	0.24	0.87	0.76	0.72	0.88	0.14	0.57	0.18	0.4	0.6	0.06	0.28	0.62	0.47	0.11	0.12	0.15	0.27	0.14	1.0
KNA51654 (VCV51_031506)	0.1	0.21	0.09	0.09	0.4	0.44	0.45	0.38	0.24	0.39	0.25	0.28	0.36	0.25	0.26	0.53	0.41	0.17	0.18	0.21	0.28	0.2	1.0
KNA51664 (VCV51_031497)	0.18	0.03	0.23	0.09	0.92	0.92	1.0	0.95	0.29	0.17	0.13	0.26	0.22	0.03	0.07	0.44	0.35	0.04	0.05	0.26	0.24	0.29	0.7
KNA51665 (VCV51_031496)	0.16	0.02	0.24	0.09	0.91	0.92	1.0	0.91	0.24	0.15	0.13	0.29	0.21	0.02	0.04	0.24	0.2	0.03	0.03	0.19	0.2	0.24	0.52
KNA51666 (VCV51_031495)	0.12	0.27	0.32	0.09	0.67	0.57	0.61	0.57	0.11	0.79	0.36	0.57	0.77	0.25	0.27	0.47	0.45	0.15	0.19	0.11	0.11	0.1	1.0
KNA51842 (VCV51_030378)	0.15	0.21	0.22	0.09	0.68	0.56	0.56	0.66	0.1	0.29	0.32	0.44	0.3	0.19	0.32	0.4	0.48	0.23	0.22	0.09	0.09	0.1	1.0
KNA52288 (VCV51_033455)	0.4	0.26	0.51	0.47	0.73	0.61	0.57	0.68	0.25	0.25	0.45	0.23	0.21	0.23	0.19	0.29	0.34	0.16	0.15	0.21	0.19	0.19	1.0
KNA52484 (VCV51_030145)	0.18	0.08	0.23	0.14	0.57	0.46	0.42	0.54	0.1	0.16	0.36	0.15	0.24	0.08	0.36	0.14	0.15	0.14	0.19	0.1	0.1	0.09	1.0
KNA52695 (VCV51_031527)	0.14	0.11	0.06	0.07	0.98	0.83	1.0	0.9	0.15	0.32	0.21	0.24	0.47	0.12	0.06	0.24	0.2	0.05	0.05	0.13	0.13	0.19	0.41
KNA52747 (VCV51_033380)	0.4	0.21	0.51	0.31	0.84	0.87	0.88	0.84	0.23	1.0	0.37	0.6	0.94	0.21	0.22	0.97	0.74	0.11	0.1	0.27	0.28	0.26	0.41
KNA53025 (VCV51_033352)	0.53	0.06	0.2	0.36	0.04	0.03	0.04	0.03	0.49	0.06	0.04	0.19	0.12	0.06	0.04	1.0	0.68	0.15	0.16	0.4	0.3	0.32	0.2
KNA53026 (VCV51_031603)	0.52	0.08	0.29	0.29	0.06	0.07	0.08	0.06	0.43	0.22	0.07	0.25	0.29	0.07	0.06	1.0	0.63	0.16	0.17	0.32	0.24	0.24	0.31
KNA53027 (VCV51_031602)	0.3	0.15	0.2	0.21	0.21	0.29	0.32	0.19	0.31	0.41	0.19	0.61	0.35	0.14	0.34	1.0	0.59	0.17	0.21	0.26	0.18	0.22	0.61
KNA53028 (VCV51_031601)	0.16	0.55	0.1	0.12	0.19	0.19	0.22	0.17	0.14	0.35	0.28	0.55	0.34	0.52	0.26	1.0	0.75	0.2	0.23	0.13	0.13	0.16	0.68
KNA53029 (CobD)	0.28	0.49	0.25	0.17	0.2	0.2	0.21	0.18	0.21	0.45	0.4	1.0	0.33	0.45	0.42	0.86	0.56	0.16	0.2	0.19	0.23	0.27	0.83
KNA53038 (VCV51_031591)	0.52	0.24	0.33	0.38	0.32	0.29	0.31	0.29	0.61	0.31	0.36	0.5	0.33	0.23	0.34	1.0	0.6	0.49	0.56	0.58	0.46	0.56	0.7
KNA53288 (FtsQ)	0.4	0.41	0.29	0.26	0.35	0.36	0.34	0.36	0.44	0.29	0.28	0.51	0.36	0.45	0.41	1.0	0.65	0.34	0.32	0.47	0.76	0.55	0.87
KNA53289 (FtsA)	0.52	0.68	0.26	0.32	0.37	0.36	0.37	0.33	0.51	0.41	0.37	0.58	0.43	0.7	0.36	1.0	0.62	0.48	0.53	0.49	0.69	0.61	0.54
KNA53292 (VCV51_033346)	0.29	0.11	0.18	0.22	0.28	0.34	0.35	0.3	0.3	0.41	0.25	0.42	0.43	0.09	0.49	1.0	0.68	0.31	0.32	0.26	0.31	0.32	0.52
KNA53679 (VCV51_030034)	0.28	0.04	0.28	0.13	0.99	0.92	1.0	0.99	0.38	0.28	0.2	0.4	0.38	0.03	0.12	0.52	0.55	0.1	0.12	0.31	0.29	0.37	0.65
KNA53680 (VCV51_033286)	0.15	0.02	0.26	0.08	0.94	0.93	1.0	0.97	0.22	0.23	0.17	0.42	0.3	0.02	0.07	0.46	0.52	0.05	0.06	0.16	0.18	0.24	0.5
KNA53878 (VCV51_030814)	0.36	0.22	0.18	0.22	0.75	0.89	0.92	0.59	0.4	0.37	0.3	0.66	0.43	0.21	0.45	0.64	0.51	0.14	0.17	0.34	0.24	0.37	1.0
KNA53920 (VCV51_033255)	0.56	0.07	0.36	0.36	1.0	0.96	0.95	1.0	0.34	0.71	0.35	0.75	0.54	0.08	0.19	0.9	0.74	0.39	0.4	0.34	0.34	0.31	0.52
KNA54630 (VCV51_030730)	0.36	0.16	0.4	0.23	0.85	1.0	0.89	0.59	0.4	0.66	0.3	0.59	0.68	0.19	0.48	0.86	0.71	0.54	0.56	0.4	0.42	0.44	0.96
KNA54826 (VCV51_031693)	0.11	0.08	0.23	0.09	0.89	0.95	0.94	0.89	0.1	0.52	0.68	0.25	1.0	0.08	0.26	0.17	0.13	0.46	0.58	0.12	0.07	0.1	0.9
KNA54827 (VCV51_031692)	0.1	0.09	0.22	0.09	0.44	0.51	0.53	0.45	0.15	0.29	0.61	0.29	0.52	0.1	0.12	0.18	0.13	0.26	0.35	0.16	0.1	0.16	1.0
KNA54836 (VCV51_031685)	0.42	0.28	0.11	0.32	0.33	0.31	0.37	0.3	0.28	0.42	0.3	0.53	0.35	0.25	0.11	1.0	0.55	0.37	0.38	0.33	0.26	0.37	0.24
KNA54838 (VCV51_031683)	0.58	0.32	0.28	0.41	0.62	0.62	0.62	0.59	0.59	0.41	0.34	0.52	0.44	0.31	0.36	1.0	0.61	0.46	0.47	0.49	0.51	0.52	0.88
KNA54891 (VCV51_031801)	0.32	0.14	0.25	0.26	0.63	0.61	0.71	0.58	0.45	0.75	0.36	0.59	0.74	0.12	0.21	0.27	0.34	0.32	0.31	0.39	0.35	0.47	1.0
KNA54958 (VCV51_031750)	0.22	0.2	0.11	0.16	0.43	0.55	0.55	0.41	0.26	0.41	0.32	0.2	0.52	0.16	0.29	0.22	0.26	0.25	0.28	0.24	0.22	0.24	1.0
KNA55020 (VCV51_033188)	0.56	0.16	0.48	0.46	0.87	0.78	0.74	0.83	0.37	0.39	0.38	0.33	0.45	0.14	0.26	1.0	0.86	0.58	0.53	0.4	0.48	0.42	0.77
KNA55122 (VCV51_031821)	0.06	0.02	0.06	0.04	0.32	0.26	0.31	0.33	0.07	0.1	0.12	0.14	0.21	0.02	0.04	0.1	0.11	0.09	0.09	0.06	0.07	0.07	1.0
KNA55228 (VCV51_031073)	0.77	0.42	0.19	0.67	0.97	0.97	1.0	0.87	0.67	0.81	0.79	0.48	0.72	0.43	0.38	0.86	0.62	0.86	0.79	0.57	0.46	0.72	0.59
KNA55278 (VCV51_033091)	0.45	0.25	0.18	0.45	1.0	0.93	0.95	0.91	0.6	0.47	0.48	0.53	0.35	0.23	0.39	0.68	0.62	0.33	0.31	0.58	0.45	0.6	0.67
KNA55283 (VCV51_033096)	0.37	0.29	0.17	0.25	0.51	0.58	0.62	0.57	0.61	0.72	0.49	1.0	0.71	0.28	0.26	0.76	0.61	0.53	0.52	0.58	0.53	0.62	0.27
KNA55679 (VCV51_033022)	0.56	0.7	0.39	0.6	0.87	0.93	0.98	0.75	0.47	0.57	0.33	0.73	0.53	0.74	0.57	1.0	0.97	0.25	0.26	0.38	0.33	0.38	0.94
KNA56151 (VCV51_030891)	0.42	0.08	0.35	0.27	0.94	0.9	0.92	0.93	0.36	0.88	0.39	0.94	0.8	0.08	0.26	1.0	0.81	0.27	0.3	0.3	0.23	0.38	0.83
KNA56236 (VCV51_032974)	0.29	0.26	0.3	0.2	1.0	0.88	0.95	1.0	0.39	0.27	0.28	0.34	0.29	0.31	0.18	0.45	0.36	0.3	0.32	0.38	0.35	0.4	0.52
KNA56237 (VCV51_030705)	0.22	0.08	0.21	0.14	0.93	0.89	1.0	0.93	0.23	0.48	0.24	0.47	0.53	0.08	0.14	0.53	0.42	0.32	0.38	0.24	0.21	0.25	0.5
KNA56241 (VCV51_032977)	0.15	0.1	0.66	0.13	0.87	0.71	0.92	0.8	0.13	0.19	0.25	0.24	0.26	0.12	0.16	1.0	0.91	0.47	0.29	0.14	0.15	0.13	0.7
KNA56276 (VCV51_032899)	0.22	0.23	0.23	0.18	0.66	0.51	0.55	0.7	0.27	0.17	0.23	0.36	0.38	0.38	0.08	1.0	0.82	0.47	0.5	0.24	0.26	0.25	0.7
KNA56418 (ToxS)	0.66	0.37	0.14	0.44	1.0	0.97	0.95	0.95	0.82	0.77	0.69	0.76	0.59	0.45	0.38	0.99	0.82	0.62	0.7	0.65	0.66	0.71	0.46
KNA56879 (VCV51_030514)	0.33	0.26	0.25	0.28	0.33	0.27	0.31	0.34	0.68	0.33	0.56	0.8	0.45	0.25	0.3	0.58	0.73	0.64	0.78	0.48	0.46	0.57	1.0
KNA56880 (VCV51_030515)	0.3	0.41	0.36	0.21	0.76	0.69	0.73	0.81	0.34	0.49	0.7	0.7	0.64	0.43	0.52	0.59	0.6	0.49	0.63	0.29	0.3	0.34	1.0
KNA56971 (VCV51_030589)	0.41	0.03	0.31	0.17	1.0	0.87	0.94	0.96	0.22	0.39	0.13	0.59	0.59	0.02	0.09	0.63	0.49	0.19	0.24	0.23	0.22	0.35	0.51
KNA57717 (VCV51_032830)	0.15	0.2	0.19	0.1	0.45	0.44	0.43	0.47	0.1	0.17	0.25	0.3	0.17	0.2	0.25	0.18	0.2	0.06	0.07	0.09	0.08	0.11	1.0
KNA58150 (VCV51_032767)	0.42	0.07	0.22	0.27	0.87	0.94	1.0	0.75	0.41	0.66	0.42	0.6	0.54	0.07	0.08	0.87	0.92	0.08	0.08	0.35	0.25	0.51	0.29
KNA58151 (VCV51_032768)	0.32	0.09	0.08	0.18	0.58	0.74	0.79	0.55	0.62	0.52	0.42	0.56	0.43	0.08	0.07	0.96	1.0	0.08	0.09	0.47	0.32	0.74	0.24
KNA59333 (VCV51_031343)	0.41	0.3	0.17	0.24	0.92	0.92	1.0	0.88	0.67	0.68	0.38	0.51	0.83	0.28	0.17	0.66	0.55	0.37	0.39	0.66	0.55	0.66	0.54
KNA59381 (VCV51_031309)	0.25	0.16	0.17	0.14	0.87	0.88	1.0	0.81	0.34	0.45	0.34	0.65	0.55	0.12	0.2	0.39	0.34	0.4	0.44	0.32	0.17	0.33	0.59
KNA59398 (VCV51_032578)	0.49	0.61	0.11	0.34	0.8	1.0	0.94	0.82	0.5	0.71	0.39	0.17	0.58	0.65	0.12	0.19	0.2	0.13	0.11	0.48	0.48	0.52	0.02
KNA59410 (VCV51_032590)	0.07	0.15	0.12	0.06	0.73	0.68	0.7	0.74	0.12	0.52	0.34	0.42	0.52	0.15	0.26	0.52	0.41	0.14	0.17	0.11	0.09	0.11	1.0
KNA59415 (VCV51_032596)	0.48	0.1	0.35	0.31	0.98	0.84	0.76	1.0	0.34	0.25	0.17	0.27	0.32	0.1	0.09	0.62	0.56	0.04	0.04	0.32	0.32	0.35	0.52
KNA60789 (VCV51_032051)	0.28	0.14	0.52	0.2	0.6	0.49	0.44	0.63	0.09	0.42	0.19	0.21	0.39	0.13	0.15	0.64	0.88	0.07	0.08	0.1	0.12	0.12	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)