Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16953 (spoIVB)	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.88	0.01	0.4	0.66	0.56	0.58	0.53	0.01	0.01	0.03	0.18	0.03	1.0	0.01	0.01	0.06	0.67	0.44	0.04	0.0	0.98	0.16	0.43
CCL16954 (BN171_1030004)	0.15	0.12	0.22	0.21	0.16	0.08	0.82	0.12	0.43	0.19	0.34	0.41	0.51	0.11	0.11	0.15	0.24	0.15	1.0	0.12	0.09	0.55	0.63	0.3	0.11	0.05	0.41	0.2	0.43
CCL17792 (BN171_1800015)	0.02	0.36	0.03	0.29	0.02	0.03	0.51	0.04	1.0	0.53	0.35	0.28	0.29	0.02	0.29	0.2	0.09	0.05	0.47	0.03	0.41	0.38	0.03	0.09	0.07	0.02	0.14	0.0	0.32
CCL17793 (BN171_1800016)	0.03	0.64	0.05	0.5	0.04	0.13	0.54	0.08	1.0	0.53	0.43	0.41	0.19	0.04	0.4	0.17	0.17	0.06	0.55	0.05	0.54	0.42	0.09	0.1	0.08	0.05	0.2	0.0	0.25
CCL17874 (BN171_1920001)	0.05	0.05	0.13	0.41	0.2	0.17	0.69	0.02	0.42	0.7	0.62	0.39	0.75	0.03	0.05	0.68	0.84	0.1	1.0	0.13	0.19	0.03	0.47	0.5	0.4	0.12	0.12	0.04	0.35
CCL17875 (BN171_1920002)	0.23	0.29	0.39	1.0	0.6	0.31	0.89	0.16	0.43	0.51	0.62	0.56	0.61	0.23	0.33	0.45	0.95	0.27	1.0	0.47	0.54	0.61	0.48	0.36	0.29	0.3	0.17	0.43	0.7
CCL17876 (BN171_1920003)	0.05	0.02	0.17	0.25	0.17	0.19	0.65	0.02	0.31	1.0	0.57	0.56	0.65	0.04	0.05	0.34	0.54	0.05	0.55	0.08	0.16	0.03	0.32	0.21	0.18	0.05	0.4	0.31	0.5
CCL18291 (BN171_220043)	0.47	0.49	0.5	0.66	0.29	0.32	0.61	0.33	0.68	0.71	0.83	0.65	0.63	0.55	0.52	0.39	0.44	0.41	0.96	0.49	0.48	0.17	0.66	0.31	0.28	0.17	0.16	1.0	0.6
CCL18459 (BN171_2360001)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.11	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.24	0.0	0.89	1.0	0.0
CCL18504 (rbsR)	0.07	0.07	0.2	0.31	0.15	0.08	0.3	0.09	1.0	0.25	0.33	0.29	0.23	0.13	0.17	0.14	0.34	0.16	0.42	0.12	0.18	0.27	0.09	0.06	0.08	0.08	0.26	0.72	0.29
CCL18505 (rbsK)	0.06	0.06	0.21	0.26	0.22	0.39	0.32	0.08	0.46	0.56	0.54	0.66	0.2	0.08	0.19	0.24	0.3	0.16	1.0	0.16	0.14	0.89	0.13	0.09	0.12	0.13	0.31	0.75	0.5
CCL18506 (rbsB)	0.03	0.07	0.05	0.07	0.04	0.1	0.7	0.03	0.23	0.56	0.38	0.52	0.17	0.03	0.11	0.12	0.15	0.1	0.61	0.07	0.11	1.0	0.06	0.06	0.06	0.04	0.45	0.44	0.36
CCL18507 (rbsA)	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	1.0	0.01	0.09	0.87	0.46	0.62	0.2	0.02	0.09	0.13	0.16	0.05	0.73	0.02	0.11	0.89	0.03	0.03	0.04	0.02	0.63	0.48	0.46
CCL18508 (rbsC)	0.02	0.09	0.03	0.07	0.03	0.01	0.48	0.03	0.05	0.4	0.22	0.33	0.11	0.01	0.14	0.09	0.09	0.07	0.43	0.01	0.1	1.0	0.07	0.02	0.02	0.02	0.29	0.31	0.2
CCL18509 (argE)	0.02	0.07	0.02	0.09	0.03	0.02	0.74	0.02	0.04	0.52	0.33	0.42	0.14	0.01	0.11	0.09	0.14	0.05	0.53	0.02	0.12	1.0	0.09	0.03	0.02	0.01	0.47	0.46	0.19
CCL18510 (BN171_240015)	0.04	0.12	0.04	0.12	0.06	0.03	0.41	0.06	0.04	0.3	0.24	0.34	0.11	0.02	0.12	0.12	0.18	0.09	0.41	0.04	0.13	1.0	0.13	0.04	0.04	0.03	0.53	0.52	0.15
CCL18511 (BN171_240016)	0.11	0.15	0.11	0.31	0.15	0.09	0.78	0.09	0.1	0.43	0.33	0.41	0.31	0.08	0.2	0.36	0.22	0.12	0.65	0.15	0.21	1.0	0.34	0.18	0.29	0.11	0.53	0.55	0.35
CCL18787 (buk)	0.05	0.34	0.04	0.54	0.03	0.09	0.75	0.04	0.22	0.31	0.34	0.32	0.48	0.03	0.16	0.11	0.42	0.06	0.51	0.06	1.0	0.18	0.26	0.06	0.05	0.04	0.29	0.17	0.31
CCL18788 (iorB)	0.01	0.17	0.01	0.51	0.0	0.03	0.76	0.01	0.26	0.37	0.35	0.31	0.75	0.01	0.12	0.07	0.5	0.03	0.6	0.01	1.0	0.08	0.32	0.03	0.01	0.0	0.32	0.19	0.35
CCL18789 (iorA)	0.0	0.15	0.01	0.49	0.0	0.02	0.84	0.0	0.27	0.41	0.39	0.36	0.76	0.01	0.11	0.09	0.5	0.03	0.78	0.01	1.0	0.17	0.33	0.03	0.01	0.0	0.41	0.18	0.35
CCL18790 (BN171_2620013)	0.01	0.15	0.01	0.44	0.0	0.05	1.0	0.01	0.26	0.51	0.48	0.46	0.77	0.01	0.1	0.11	0.49	0.03	0.95	0.01	0.81	0.12	0.52	0.05	0.02	0.01	0.45	0.21	0.42
CCL19060 (BN171_2840008)	0.19	0.08	0.16	0.26	0.22	0.04	0.4	0.22	0.11	0.05	0.1	0.05	0.44	0.16	0.09	0.16	0.16	0.22	0.26	0.12	0.21	0.11	0.6	0.04	0.05	0.08	1.0	0.36	0.02
CCL19061 (BN171_2840009)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08	0.02	0.0	0.03	0.04	0.0	0.22	0.12	0.15	0.1	0.66	0.03	0.03	0.09	1.0	0.57	0.0
CCL19086 (BN171_2870016)	0.04	0.58	0.03	0.46	0.03	0.01	0.86	0.01	0.12	0.62	0.31	0.23	0.28	0.03	0.78	0.04	0.05	0.05	0.47	0.03	1.0	0.04	0.03	0.06	0.1	0.02	0.15	0.25	0.15
CCL19138 (thlA)	0.06	0.34	0.07	0.59	0.06	0.01	0.49	0.03	0.59	0.13	0.03	0.04	0.18	0.02	0.12	0.22	0.06	0.04	0.15	0.02	0.25	0.06	0.09	0.14	0.04	0.02	1.0	0.22	0.0
CCL19139 (scoA)	0.07	0.33	0.05	0.53	0.0	0.02	0.53	0.0	0.41	0.16	0.05	0.29	0.21	0.01	0.08	0.33	0.08	0.0	0.2	0.02	0.2	0.05	0.07	0.1	0.02	0.0	1.0	0.54	0.05
CCL19140 (scoB)	0.03	0.26	0.02	0.46	0.06	0.0	0.52	0.01	0.42	0.35	0.1	0.43	0.3	0.01	0.15	0.33	0.06	0.05	0.21	0.03	0.25	0.13	0.03	0.06	0.02	0.01	1.0	0.5	0.14
CCL19141 (bdhA)	0.13	0.57	0.11	0.65	0.17	0.05	1.0	0.1	0.57	0.46	0.39	0.29	0.38	0.11	0.39	0.46	0.28	0.18	0.27	0.13	0.51	0.6	0.31	0.28	0.16	0.09	0.8	0.93	0.23
CCL19447 (BN171_3150010)	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.06	1.0	0.03	0.0	0.45	0.39	0.2	0.01	0.04	0.04	0.0	0.18	0.06	0.37	0.02	0.48	0.0	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.31
CCL19448 (BN171_3150011)	0.02	0.07	0.0	0.01	0.0	0.04	1.0	0.07	0.01	0.37	0.31	0.15	0.01	0.04	0.07	0.0	0.14	0.12	0.47	0.02	0.55	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.07	0.11	0.22
CCL19449 (BN171_3150012)	0.03	0.15	0.0	0.02	0.01	0.04	1.0	0.14	0.01	0.23	0.22	0.12	0.01	0.06	0.1	0.0	0.14	0.23	0.54	0.05	0.86	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.06	0.07	0.2
CCL19450 (BN171_3150013)	0.02	0.06	0.0	0.01	0.0	0.08	1.0	0.05	0.01	0.35	0.26	0.12	0.01	0.04	0.05	0.0	0.11	0.14	0.47	0.02	0.32	0.0	0.06	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.17
CCL19451 (BN171_3150014)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.01	0.0	0.28	0.25	0.11	0.0	0.02	0.01	0.0	0.07	0.03	0.31	0.01	0.24	0.0	0.04	0.01	0.0	0.01	0.1	0.05	0.18
CCL19498 (xylA)	0.46	0.37	0.68	0.9	0.5	0.22	0.62	0.26	0.19	0.87	0.84	0.7	0.6	0.82	0.68	0.49	0.47	0.4	1.0	0.47	0.3	0.39	0.37	0.35	0.24	0.23	0.7	0.67	0.82
CCL19499 (xylB)	0.27	0.14	0.33	0.32	0.23	0.2	0.25	0.13	0.12	0.52	0.5	0.4	0.44	0.36	0.37	0.39	0.31	0.2	1.0	0.16	0.15	0.31	0.32	0.18	0.11	0.12	0.2	0.76	0.67
CCL19545 (BN171_3250005)	0.04	0.41	0.05	0.41	0.05	0.04	0.37	0.04	0.44	0.3	0.18	0.06	0.22	0.04	0.29	0.28	0.12	0.04	0.26	0.05	0.51	0.42	0.07	0.12	0.06	0.04	1.0	0.76	0.11
CCL19546 (BN171_3250006)	0.14	0.21	0.2	0.29	0.19	0.37	0.72	0.09	1.0	0.41	0.39	0.16	0.52	0.15	0.25	0.52	0.2	0.1	0.39	0.25	0.39	0.16	0.27	0.23	0.14	0.14	0.66	0.29	0.12
CCL19563 (BN171_3270001)	0.04	0.09	0.08	0.12	0.05	0.06	0.85	0.1	0.25	1.0	0.56	0.32	0.37	0.08	0.1	0.17	0.09	0.11	0.26	0.05	0.05	0.04	0.19	0.17	0.09	0.04	0.42	0.22	0.61
CCL19579 (BN171_3270017)	0.06	0.23	0.04	0.28	0.03	0.2	1.0	0.04	0.18	0.89	0.81	0.61	0.48	0.06	0.22	0.33	0.18	0.05	0.46	0.06	0.58	0.18	0.22	0.07	0.08	0.03	0.43	0.75	0.54
CCL19580 (BN171_3270018)	0.09	0.25	0.11	0.75	0.19	0.06	0.7	0.13	0.1	0.35	0.29	0.37	0.44	0.07	1.0	0.31	0.17	0.17	0.62	0.07	0.74	0.7	0.45	0.12	0.08	0.06	0.78	0.71	0.23
CCL19581 (BN171_3270019)	0.04	0.19	0.11	0.76	0.16	0.02	0.38	0.1	0.03	0.11	0.15	0.23	0.28	0.06	1.0	0.22	0.07	0.15	0.29	0.05	0.68	0.42	0.1	0.1	0.04	0.02	0.51	0.37	0.12
CCL19628 (BN171_3320002)	0.02	0.14	0.04	0.27	0.03	0.05	1.0	0.0	0.19	0.66	0.5	0.51	0.3	0.02	0.17	0.1	0.13	0.04	0.38	0.02	0.25	0.11	0.13	0.04	0.06	0.01	0.25	0.53	0.33
CCL19629 (BN171_3320003)	0.34	0.51	0.46	0.87	0.23	0.08	0.81	0.06	0.35	0.5	0.5	0.53	0.32	0.43	0.49	0.18	0.19	0.19	0.62	0.37	0.83	0.07	0.36	0.08	0.19	0.18	0.28	1.0	0.21
CCL19848 (BN171_3550001)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.08	0.0	0.51	1.0	0.0
CCL20201 (BN171_3790001)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.72	0.09	0.33	0.05	0.0	0.99	1.0	0.0
CCL20252 (BN171_390006)	0.19	0.35	0.18	0.39	0.07	0.08	1.0	0.05	0.22	0.56	0.42	0.41	0.24	0.14	0.44	0.2	0.17	0.13	0.66	0.19	0.63	0.09	0.23	0.26	0.23	0.05	0.93	0.68	0.35
CCL20329 (BN171_4180004)	0.1	0.05	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.64	0.77	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	1.0	0.11	0.0	0.0	0.27	0.23	0.36	0.0	0.38	0.0	0.0
CCL20339 (BN171_4200001)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.2	0.35	0.0	0.18	0.61	0.13	0.14	1.0	0.59	0.0
CCL20686 (BN171_900006)	0.15	0.18	0.23	0.27	0.2	0.38	1.0	0.12	0.24	0.45	0.35	0.37	0.41	0.15	0.23	0.31	0.1	0.18	0.38	0.24	0.23	0.74	0.24	0.16	0.15	0.13	0.39	0.44	0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)