Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,60min+PMN	FA1090,L-log,from bact	GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept	from N. gon mtr mut mosiac transformant	WT,from L-log cell cultures	from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,0min+PMN	from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept	FA1090cpxR::erm,L-log,from bact	FA1090 GCM77,strain+mut,untreated	GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept	from urethra,test for azithromycin resist	FA1090/H041,60min	WT parent,FA19 WT,from p-log cells	WT,FA19,from p-L-log cells	overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells	FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2	FA1090cpxA::kan,L-log,from bact	from p-cells
AKP14102 (thrC)	0.33	0.53	0.13	0.32	0.25	0.94	0.3	0.57	0.27	0.07	0.53	0.26	0.45	0.7	0.6	0.89	1.0	0.67	0.11	0.39
AKP14133 (pdxH)	0.17	0.12	0.14	0.32	0.16	0.43	0.23	0.07	0.23	0.1	0.12	0.14	0.47	0.25	1.0	0.34	0.56	0.12	0.1	0.67
AKP14145 (clpX)	0.56	0.31	0.3	0.59	0.57	0.57	0.52	0.26	0.59	0.19	0.29	0.54	0.77	0.37	1.0	0.6	0.53	0.35	0.2	0.52
AKP14188 (frmA_1)	0.24	0.3	0.28	0.52	0.36	0.35	0.46	0.34	0.54	0.14	0.37	0.49	0.72	0.38	0.72	0.28	0.45	0.19	0.15	1.0
AKP14196 (clpP)	0.53	0.33	0.32	0.38	0.35	0.64	0.39	0.34	0.42	0.54	0.73	0.36	0.25	0.38	1.0	0.73	0.51	0.49	0.33	0.8
AKP14236 (WX61_00147)	0.45	0.09	0.0	0.95	0.24	0.97	0.74	0.14	1.0	0.0	0.0	0.99	0.39	0.17	0.61	0.96	0.98	0.0	0.0	0.4
AKP14239 (dnaJ_1)	0.53	0.38	0.56	0.65	0.75	0.71	0.49	0.28	0.61	0.41	0.97	0.51	0.97	0.54	0.96	0.67	0.79	1.0	0.44	0.79
AKP14318 (WX61_00229)	0.97	0.06	0.0	0.61	0.0	0.66	0.55	0.11	0.57	0.0	0.0	0.64	0.75	0.06	0.08	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0
AKP14335 (WX61_00247)	0.07	0.06	0.0	0.12	0.11	0.55	0.15	0.07	0.15	0.02	0.04	0.24	0.03	0.11	1.0	0.64	0.42	0.05	0.01	0.21
AKP14371 (rpoZ)	0.14	0.49	0.05	0.16	0.15	0.8	0.13	0.55	0.13	0.06	0.24	0.1	0.15	0.65	1.0	0.83	0.74	0.35	0.03	0.66
AKP14417 (sunS)	0.68	0.39	0.36	0.6	0.71	0.3	0.52	0.53	0.56	0.22	0.4	0.59	0.99	0.34	1.0	0.32	0.28	0.4	0.27	0.25
AKP14422 (thyA)	0.78	0.34	0.15	0.7	0.69	0.98	0.64	0.31	0.62	0.17	0.24	0.56	0.52	0.52	0.94	1.0	0.94	0.3	0.13	0.78
AKP14438 (WX61_00356)	0.2	0.26	0.17	0.27	0.49	0.77	0.2	0.19	0.18	0.38	0.19	0.25	0.38	0.85	0.94	0.62	1.0	0.17	0.23	0.71
AKP14468 (WX61_00386)	0.62	0.32	0.22	0.62	0.63	0.67	0.52	0.37	0.55	0.15	0.28	0.5	1.0	0.52	0.71	0.64	0.73	0.31	0.16	0.39
AKP14477 (WX61_00395)	0.16	0.12	0.03	0.29	0.28	0.3	0.22	0.17	0.23	0.02	0.14	0.31	0.39	0.35	0.56	0.28	0.34	0.06	0.02	1.0
AKP14486 (WX61_00404)	0.62	0.18	0.03	0.41	0.21	0.2	0.5	0.18	0.83	0.0	0.17	0.86	1.0	0.13	0.76	0.17	0.24	0.2	0.02	0.01
AKP14505 (WX61_00423)	0.47	0.22	0.09	0.63	0.35	0.26	0.72	0.28	0.81	0.04	0.13	0.66	1.0	0.27	0.69	0.2	0.36	0.18	0.09	0.17
AKP14507 (cmpB)	0.27	0.21	0.27	0.56	0.28	0.38	0.53	0.17	0.81	0.1	0.02	0.47	1.0	0.21	0.83	0.36	0.4	0.02	0.26	0.41
AKP14588 (tsaC_1)	0.49	0.31	0.26	0.35	0.52	0.55	0.34	0.3	0.29	0.18	0.67	0.32	0.67	0.5	1.0	0.58	0.51	0.8	0.23	0.56
AKP14615 (rsmH)	0.58	0.35	0.27	0.71	0.82	0.69	0.67	0.29	0.66	0.11	0.22	0.61	0.62	0.3	1.0	0.67	0.71	0.33	0.16	0.27
AKP14668 (WX61_00589)	0.18	0.47	0.36	0.51	0.19	0.97	0.22	0.38	0.22	0.29	0.06	0.58	0.89	0.58	0.92	1.0	0.92	0.07	0.32	0.53
AKP14682 (dus)	0.42	0.26	0.07	0.61	0.36	0.46	0.57	0.23	0.48	0.06	0.43	0.53	1.0	0.29	0.65	0.41	0.54	0.43	0.05	0.38
AKP14712 (rusA_2)	0.36	0.19	0.01	0.65	0.08	0.76	0.14	0.12	0.39	0.0	0.07	0.46	0.29	0.13	0.34	0.6	1.0	0.12	0.0	0.0
AKP14720 (WX61_00642)	0.07	0.06	0.0	0.12	0.11	0.55	0.15	0.07	0.15	0.02	0.04	0.24	0.03	0.11	1.0	0.64	0.42	0.05	0.01	0.21
AKP14746 (WX61_00669)	0.07	0.06	0.0	0.12	0.11	0.55	0.15	0.07	0.15	0.02	0.04	0.24	0.03	0.11	1.0	0.64	0.42	0.05	0.01	0.21
AKP14770 (lrgA)	0.29	0.18	0.05	0.51	0.39	0.25	0.34	0.16	0.44	0.05	0.31	0.49	1.0	0.33	0.09	0.19	0.33	0.26	0.04	0.23
AKP14812 (epsE_1)	0.49	0.4	0.6	0.41	0.57	0.68	0.37	0.29	0.34	0.34	0.48	0.31	0.63	0.51	1.0	0.7	0.65	0.51	0.6	0.63
AKP14856 (dsbA_2)	0.5	0.41	0.22	0.47	0.46	0.82	0.39	0.32	0.36	0.27	0.79	0.35	0.66	0.95	0.88	0.73	0.96	1.0	0.22	0.35
AKP14883 (nuoI)	0.2	0.27	0.05	0.3	0.31	0.84	0.24	0.41	0.17	0.7	0.19	0.24	0.13	0.27	1.0	0.8	0.89	0.13	0.03	0.67
AKP14907 (thiB)	0.23	0.4	0.09	0.26	0.24	0.94	0.18	0.27	0.14	0.15	0.48	0.14	0.24	0.79	0.85	0.9	1.0	0.6	0.14	0.39
AKP14990 (pyrH)	1.0	0.35	0.22	0.66	0.41	0.6	0.69	0.31	0.6	0.19	0.44	0.65	0.86	0.45	0.29	0.51	0.73	0.53	0.2	0.28
AKP14991 (mafA1_3)	0.1	0.13	0.0	0.45	0.0	0.21	0.09	0.15	0.11	0.0	0.04	0.32	0.51	0.21	0.24	0.19	0.23	0.05	0.0	1.0
AKP15043 (pgk)	0.28	0.25	0.02	0.17	0.18	0.63	0.17	0.2	0.15	0.07	0.41	0.17	0.09	0.52	1.0	0.57	0.73	0.34	0.03	0.57
AKP15047 (waaA)	0.13	0.22	0.09	0.33	0.39	0.39	0.22	0.21	0.17	0.06	0.12	0.23	1.0	0.19	0.24	0.41	0.38	0.21	0.15	0.2
AKP15060 (dnaJ_2)	0.96	0.31	0.1	0.41	0.49	0.54	0.46	0.36	0.72	0.22	0.29	0.54	0.33	0.45	1.0	0.57	0.51	0.48	0.11	0.14
AKP15102 (rsmD)	0.73	0.22	0.26	0.61	0.37	0.61	0.49	0.16	0.46	0.17	0.08	0.52	0.39	0.28	1.0	0.57	0.67	0.09	0.26	0.47
AKP15299 (gspA)	0.5	0.44	0.05	0.77	0.51	0.75	0.68	0.38	0.67	0.07	0.15	0.53	0.46	0.31	1.0	0.73	0.77	0.15	0.06	0.81
AKP15300 (epsE_3)	0.3	0.15	0.03	0.31	0.18	0.54	0.37	0.12	0.34	0.05	0.07	0.3	0.18	0.1	1.0	0.59	0.48	0.08	0.04	0.99
AKP15338 (pcm)	0.35	0.25	0.19	0.39	0.19	0.62	0.29	0.18	0.24	0.21	0.06	0.27	0.6	0.57	1.0	0.61	0.64	0.08	0.2	0.32
AKP15469 (htrB_2)	0.56	0.32	0.18	0.6	0.45	0.38	0.52	0.45	0.54	0.17	0.28	0.5	0.95	0.25	1.0	0.39	0.36	0.27	0.13	0.12
AKP15485 (rpsP)	0.44	0.52	0.46	0.33	0.34	0.89	0.38	0.42	0.44	0.5	0.23	0.44	0.83	0.42	0.47	0.81	1.0	0.19	0.36	0.39
AKP15494 (tatB)	0.45	0.38	0.18	0.55	0.54	0.55	0.53	0.32	0.4	0.21	0.23	0.42	1.0	0.32	0.56	0.55	0.55	0.24	0.14	0.37
AKP15558 (trpD)	0.52	0.38	0.22	0.66	0.35	0.57	0.62	0.27	0.68	0.11	0.19	0.5	0.74	0.53	0.81	0.51	0.65	0.37	0.18	1.0
AKP15611 (ampD)	0.32	0.28	0.08	0.68	0.42	0.56	0.5	0.26	0.55	0.04	0.5	0.49	1.0	0.46	0.52	0.43	0.76	0.54	0.06	0.32
AKP15612 (WX61_01573)	0.57	0.31	0.15	0.62	0.51	0.42	0.42	0.41	0.46	0.17	0.19	0.53	1.0	0.27	0.86	0.44	0.4	0.23	0.14	0.23
AKP15656 (lptE)	0.4	0.3	0.11	0.47	0.3	0.68	0.37	0.29	0.33	0.17	0.24	0.39	0.19	0.49	1.0	0.63	0.75	0.27	0.1	0.54
AKP15696 (ubiE)	0.84	0.7	0.97	0.65	0.73	0.85	0.58	0.58	0.6	0.48	0.6	0.67	0.92	0.8	1.0	0.84	0.87	0.65	0.87	0.26
AKP15733 (WX61_01698)	0.38	0.34	0.39	0.49	0.43	0.68	0.49	0.42	0.49	0.21	0.09	0.52	0.17	0.42	1.0	0.66	0.71	0.11	0.26	0.29
AKP15796 (WX61_01761)	0.45	0.24	0.21	0.55	0.33	0.75	0.7	0.18	1.0	0.05	0.16	0.58	0.31	0.19	0.45	0.82	0.65	0.15	0.1	0.15
AKP15818 (ilvA)	0.44	0.52	0.51	0.64	0.72	0.56	0.67	0.41	0.68	0.22	0.12	0.58	1.0	0.41	0.78	0.63	0.46	0.13	0.37	0.46
AKP15842 (WX61_01812)	0.97	0.06	0.0	0.61	0.0	0.66	0.55	0.11	0.57	0.0	0.0	0.64	0.75	0.06	0.08	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0
AKP15871 (WX61_01841)	0.5	0.09	0.02	1.0	0.18	0.71	0.53	0.07	0.48	0.02	0.02	0.52	0.71	0.1	0.51	0.6	0.88	0.03	0.01	0.15
AKP15876 (WX61_01846)	0.21	0.26	0.18	1.0	0.11	0.54	0.8	0.17	0.82	0.11	0.06	0.54	0.71	0.55	0.26	0.46	0.67	0.08	0.1	0.37
AKP15928 (WX61_01898)	0.66	0.27	0.21	0.6	0.49	0.57	0.54	0.27	0.54	0.11	0.3	0.48	1.0	0.31	0.72	0.56	0.59	0.45	0.17	0.44
AKP15970 (cas1)	0.58	0.06	0.0	0.57	0.03	0.47	0.6	0.13	0.59	0.0	0.0	0.49	0.4	0.09	1.0	0.45	0.49	0.0	0.0	0.71
AKP15996 (dnaQ)	0.44	0.4	0.38	0.86	0.35	0.9	0.76	0.31	0.98	0.19	0.47	0.83	0.88	0.57	0.61	0.84	1.0	0.53	0.25	0.89
AKP16000 (yhcR)	0.34	0.33	0.29	0.51	0.39	0.49	0.45	0.3	0.66	0.5	0.05	0.55	1.0	0.26	0.44	0.48	0.5	0.05	0.39	0.61
AKP16009 (WX61_01982)	0.22	0.23	0.02	0.27	0.21	0.52	0.24	0.13	0.2	0.04	0.1	0.15	0.3	0.7	0.67	0.45	0.61	0.11	0.02	1.0
AKP16010 (rph)	0.64	0.31	0.08	0.73	0.35	0.8	0.71	0.33	0.72	0.07	0.15	0.7	0.54	0.61	0.88	0.66	1.0	0.13	0.06	0.29
AKP16084 (ngoMIVR)	0.71	0.44	0.04	0.61	0.52	0.94	0.68	0.49	0.78	0.26	0.36	0.65	0.28	0.3	0.91	1.0	0.84	0.34	0.03	0.4
AKP16103 (nudF)	0.42	0.38	0.37	0.87	0.43	0.61	0.73	0.21	0.68	0.11	0.04	0.5	0.98	0.36	0.92	0.43	0.89	0.05	0.39	1.0
AKP16157 (WX61_02133)	0.35	0.24	0.04	0.41	0.23	0.8	0.33	0.18	0.42	0.05	0.0	0.32	0.43	0.3	0.2	0.67	1.0	0.0	0.03	0.53
AKP16187 (ribC)	0.7	0.43	0.37	0.64	0.55	0.78	0.56	0.4	0.55	0.27	0.37	0.57	0.8	0.6	1.0	0.73	0.85	0.38	0.27	0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)