Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	GCGS0457,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,60min+PMN	FA1090,L-log,from bact	GCGS1095,reduced ceftriaxone suscept	from N. gon mtr mut mosiac transformant	WT,from L-log cell cultures	from lab,SP319,reduced ceftriaxone suscept	FA1090/H041,0min+PMN	from lab,SP316,reduced ceftriaxone suscept	FA1090cpxR::erm,L-log,from bact	FA1090 GCM77,strain+mut,untreated	GCGS1014,reduced ceftriaxone suscept	from urethra,test for azithromycin resist	FA1090/H041,60min	WT parent,FA19 WT,from p-log cells	WT,FA19,from p-L-log cells	overexp mtrCDE,FA19,from p-L-log cells	FA1090 GCM77,strain+mut,H2O2	FA1090cpxA::kan,L-log,from bact	from p-cells
AKP14162 (WX61_00073)	0.51	0.21	0.09	0.53	0.4	0.23	0.52	0.19	0.49	0.07	0.68	0.47	1.0	0.2	0.22	0.21	0.25	0.66	0.06	0.1
AKP14259 (WX61_00170)	0.33	0.27	0.08	0.5	0.44	0.33	0.41	0.28	0.55	0.15	0.58	0.62	1.0	0.24	0.33	0.27	0.43	0.55	0.06	0.06
AKP14281 (WX61_00192)	0.26	0.12	0.07	0.41	0.27	0.27	0.27	0.1	0.17	0.02	0.62	0.24	1.0	0.14	0.27	0.24	0.32	0.69	0.05	0.05
AKP14373 (apt)	0.78	0.35	0.09	0.66	0.58	0.24	0.6	0.4	0.63	0.06	0.63	0.72	1.0	0.41	0.39	0.21	0.29	0.68	0.07	0.22
AKP14393 (trmA)	0.39	0.33	0.34	0.45	0.48	0.34	0.42	0.41	0.56	0.17	0.5	0.52	1.0	0.28	0.38	0.36	0.3	0.46	0.26	0.14
AKP14394 (aroC)	0.34	0.18	0.27	0.32	0.28	0.18	0.33	0.17	0.35	0.11	0.73	0.3	1.0	0.2	0.12	0.16	0.22	0.68	0.17	0.15
AKP14430 (mtrR)	0.66	0.05	0.14	0.48	0.26	0.09	0.55	0.05	0.84	0.06	0.78	0.65	1.0	0.05	0.1	0.1	0.08	0.67	0.17	0.23
AKP14771 (yohK)	0.21	0.1	0.05	0.36	0.18	0.16	0.28	0.08	0.26	0.03	0.54	0.35	1.0	0.13	0.14	0.13	0.19	0.58	0.04	0.21
AKP14775 (hrpB)	0.49	0.13	0.21	0.41	0.21	0.15	0.38	0.14	0.37	0.1	0.58	0.36	1.0	0.16	0.16	0.15	0.15	0.54	0.13	0.1
AKP14840 (WX61_00773)	0.28	0.29	0.18	0.67	0.26	0.22	0.55	0.3	0.48	0.06	0.44	0.52	1.0	0.37	0.09	0.16	0.29	0.38	0.14	0.32
AKP14908 (yieH)	0.48	0.25	0.16	0.49	0.26	0.4	0.34	0.27	0.31	0.1	1.0	0.36	0.85	0.33	0.52	0.41	0.4	0.75	0.13	0.12
AKP14928 (ptsI)	0.38	0.19	0.08	0.39	0.55	0.43	0.4	0.19	0.3	0.06	0.6	0.36	1.0	0.18	0.33	0.4	0.49	0.51	0.07	0.18
AKP15002 (argG)	0.28	0.15	0.15	0.35	0.2	0.37	0.31	0.1	0.28	0.12	0.75	0.27	1.0	0.24	0.29	0.33	0.42	0.71	0.12	0.24
AKP15011 (dtpT)	0.24	0.36	0.07	0.81	0.26	0.1	0.48	0.3	0.38	0.08	0.23	1.0	0.95	0.31	0.1	0.1	0.1	0.26	0.06	0.29
AKP15033 (mutS)	0.42	0.38	0.14	0.49	0.5	0.5	0.41	0.37	0.4	0.11	0.78	0.33	1.0	0.3	0.58	0.53	0.46	0.64	0.14	0.23
AKP15173 (yeeA)	0.32	0.15	0.27	0.51	0.39	0.32	0.49	0.17	0.19	0.07	0.42	0.32	1.0	0.22	0.25	0.3	0.34	0.73	0.16	0.1
AKP15177 (rnhB)	0.54	0.49	0.22	0.56	0.36	0.39	0.66	0.5	0.55	0.21	0.4	0.54	1.0	0.23	0.19	0.46	0.29	0.35	0.19	0.2
AKP15213 (WX61_01164)	0.69	0.19	0.19	0.47	0.27	0.17	0.4	0.17	0.57	0.12	0.52	0.54	1.0	0.19	0.17	0.16	0.19	0.55	0.19	0.12
AKP15217 (mtr)	0.18	0.18	0.06	0.36	0.24	0.15	0.23	0.13	0.22	0.06	0.57	0.31	1.0	0.18	0.14	0.13	0.17	0.49	0.08	0.1
AKP15220 (gntK)	0.28	0.34	0.09	1.0	0.17	0.24	0.64	0.39	0.47	0.07	0.13	0.73	0.88	0.36	0.09	0.23	0.26	0.16	0.08	0.64
AKP15234 (WX61_01185)	0.24	0.36	0.02	0.65	0.32	0.18	0.46	0.28	0.38	0.01	0.11	0.62	1.0	0.38	0.17	0.17	0.2	0.14	0.02	0.04
AKP15268 (fadM)	0.46	0.27	0.12	0.55	0.34	0.31	0.51	0.22	0.37	0.1	0.97	0.35	1.0	0.29	0.23	0.28	0.35	0.75	0.13	0.13
AKP15388 (ppaX)	0.36	0.33	0.5	0.37	0.27	0.37	0.3	0.33	0.33	0.23	0.74	0.22	1.0	0.34	0.22	0.39	0.34	0.78	0.29	0.13
AKP15453 (mucD)	0.44	0.2	0.18	0.57	0.34	0.39	0.5	0.2	0.47	0.2	0.74	0.45	1.0	0.29	0.47	0.34	0.47	0.79	0.11	0.42
AKP15480 (mntB)	0.54	0.12	0.04	0.35	0.51	0.09	0.51	0.05	0.52	0.05	0.59	0.32	1.0	0.12	0.1	0.1	0.08	0.54	0.02	0.12
AKP15481 (znuC)	0.31	0.2	0.03	0.23	0.29	0.08	0.28	0.09	0.29	0.03	0.42	0.2	1.0	0.25	0.1	0.07	0.11	0.41	0.02	0.11
AKP15503 (zraR)	0.27	0.23	0.08	0.57	0.21	0.19	0.42	0.21	0.47	0.09	0.58	0.5	1.0	0.19	0.15	0.17	0.22	0.42	0.05	0.13
AKP15556 (WX61_01516)	0.65	0.64	0.13	0.56	0.74	0.17	0.65	0.32	0.96	0.13	0.93	0.4	1.0	0.38	0.28	0.17	0.16	0.65	0.07	0.2
AKP15588 (cysW_2)	0.51	0.48	0.13	0.62	0.47	0.15	0.59	0.35	0.55	0.09	0.54	0.49	1.0	0.24	0.21	0.14	0.16	0.74	0.09	0.12
AKP15624 (WX61_01586)	0.22	0.2	0.11	0.36	0.2	0.09	0.32	0.11	0.32	0.14	0.55	0.28	1.0	0.33	0.13	0.09	0.1	0.7	0.08	0.13
AKP15648 (WX61_01610)	0.44	0.4	0.4	0.92	0.32	0.44	0.78	0.5	0.78	0.12	0.1	0.94	1.0	0.45	0.43	0.4	0.5	0.15	0.28	0.52
AKP15663 (rpoH)	0.65	0.28	0.09	0.62	0.43	0.18	0.5	0.44	0.43	0.08	0.79	0.5	1.0	0.39	0.26	0.16	0.21	0.92	0.12	0.51
AKP15694 (mnmC)	0.33	0.21	0.37	0.61	0.23	0.11	0.52	0.15	0.49	0.13	0.95	0.34	1.0	0.2	0.11	0.09	0.14	0.85	0.23	0.14
AKP15703 (pbpG)	0.31	0.13	0.27	0.34	0.2	0.11	0.36	0.09	0.37	0.11	0.62	0.26	1.0	0.15	0.13	0.1	0.13	0.5	0.16	0.09
AKP15767 (WX61_01732)	0.55	0.51	0.76	0.5	0.39	0.48	0.45	0.44	0.37	0.32	0.88	0.29	0.9	0.51	0.41	0.42	0.56	1.0	0.42	0.22
AKP15778 (hldD)	0.33	0.27	0.1	0.48	0.4	0.27	0.4	0.23	0.37	0.1	0.62	0.41	1.0	0.25	0.23	0.26	0.28	0.58	0.07	0.41
AKP15915 (nlpD)	0.23	0.14	0.06	0.26	0.33	0.29	0.24	0.11	0.23	0.03	0.53	0.2	1.0	0.19	0.35	0.25	0.36	0.6	0.04	0.23
AKP15979 (WX61_01951)	0.47	0.47	0.22	0.71	0.31	0.38	0.71	0.59	0.64	0.08	0.43	0.87	1.0	0.38	0.37	0.37	0.39	0.44	0.12	0.28
AKP16017 (dapA)	0.58	0.27	0.2	0.51	0.37	0.39	0.65	0.22	0.6	0.14	0.67	0.38	1.0	0.19	0.22	0.38	0.4	0.71	0.12	0.15
AKP16059 (hsrA)	0.86	0.33	0.15	0.78	0.38	0.21	0.68	0.41	0.68	0.08	0.36	0.69	1.0	0.36	0.24	0.18	0.26	0.39	0.11	0.2
AKP16089 (yqjA)	0.92	0.47	0.15	0.83	0.55	0.3	0.84	0.7	0.74	0.06	0.5	0.85	1.0	0.44	0.3	0.28	0.33	0.55	0.08	0.21
AKP16101 (plsY)	0.63	0.22	0.26	0.43	0.56	0.26	0.42	0.22	0.38	0.05	0.67	0.37	0.9	0.23	0.37	0.25	0.27	1.0	0.21	0.11
AKP16156 (lipB)	0.5	0.26	0.2	0.54	0.38	0.47	0.45	0.2	0.74	0.14	0.88	0.74	1.0	0.28	0.3	0.42	0.53	0.99	0.15	0.29
AKP16195 (WX61_02171)	0.33	0.2	0.49	0.25	0.36	0.3	0.24	0.2	0.21	0.14	0.82	0.19	1.0	0.22	0.24	0.29	0.31	0.72	0.35	0.06
AKP16198 (mutL)	0.35	0.25	0.12	0.38	0.16	0.18	0.33	0.22	0.37	0.06	0.62	0.25	1.0	0.17	0.18	0.17	0.2	0.68	0.08	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)